BIODEGRADACIÓN Y

TRANSFORMACIONES BIOLÓGICAS

Dirección de Calidad Educativa

PROPIEDADES BIOLÓGICAS RELACIONADAS

INTENSA ACTIVIDAD BIOLÓGICA EN EL SUELO

VARIEDAD DE ORGANISMOS EN EL SUELO (lombrices, insectos,

hongos, bacterias, actinomicetos, etc.)
DESCOMPOSICIÓN DE RESIDUOS ORGÁNICOS
RESIDUOS ANIMALES Y
VEGETALES EN DIFERENTES
ESTADOS DE
DESCOMPOSICIÓN

Superficie del suelo

Nutrientes
RESIDUOS ORGÁNICOS DE
FÁCIL DESCOMPOSICIÓN
(10 a 20%)

BIOMASA HETEROTRÓFICA
(1 a 8%)

Compuestos orgánicos
Productos microbiales biológicamente resistentes

HUMUS DEL SUELO (50 a 85%)

DESCOMPOSICIÓN DE RESIDUOS ORGÁNICOS

Mineralización Inmovilización
FORMACIÓN DE HUMUS=HUMIFICACIÓN

Favorece la acción depuradora del suelo a

través de:
Facilitar mecanismos de solubilidad de
minerales.
Mejora de características físicas de soporte.
Disminución de toxicidad de contaminantes
Incremento de retención de agua
Mantenimiento de grandes poblaciones de
microorganismos.
MEJORA DE PROPIEDADES FÍSICAS

FORMACIÓN DE ESTRUCTURA

INCREMENTO DE PERMEABILIDAD

MAYOR AIREACIÓN
SOLUBILIZACIÓN DE MINERALES

Los microorganismos intervienen en el

proceso de descomposición del material
parental, y facilitan la acción de otros:
hongos, bacterias.
Los microorganismos solubilizan silicatos y
fosfatos
TRANSFORMACIONES BIOLÓGICAS
• La población microbiológica del suelo es una fascinante variedad de
organismos, con sistemas enzimáticos diversos capaces de obtener
energía a partir de compuestos orgánicos e inorgánicos.
• Los elementos tóxicos que llegan a la superficie terrestre, como
resultado de la actividad agrícola, como productos de desecho, o
accidentalmente, están sujetos a muchas reacciones biológicas que
pueden afectar su persistencia y movilidad en el perfil del suelo.
 REACCIONES MICROBIOLÓGICAS
• La vida microbial está adaptada a la energía disponible y al suministro de nutrientes en
diferentes condiciones ambientales. Los químicos aplicados al suelo, a propósito o por
accidente, puede convertirse en una fuente de energía para la biomasa del suelo.
• Cuando a una población microbial se le ofrece una fuente de energía, una población
específica rápidamente incrementa en número y actividad para utilizar la energía.
• Las fuentes de energía y condiciones ambientales interactúan para determinar la
ecología microbial durante cualquier proceso microbial que induce la transformación de
un compuesto o elemento dado en el suelo.
• La siguiente tabla muestra la clasificación de reacciones microbiales en relación a la
energía.
CLASIFICACIÓN DE PRINCIPALES REACCIONES MICROBIALES EN RELACIÓN A LAS FUENTES DE ENERGÍA QUE INFLUENCIA LA
MOVILIDAD DE ELEMENTOS Y COMPUESTOS EN EL SUELO

ELECTRONES
CLASE PRODUCTOS
DONANTES ACEPTORES
Fotoautrótofos H2O, H2S, H2R CO2 (HCHO)n y otros
compuestos
reducidos
Respiración Compuestos O2 CO2 + H2O
aeróbica orgánicos
Anaeróbica Compuestos Muchos van desde Muchos van desde
orgánicos la misma molécula, compuestos
otra molécula, CO2 oxidados,
o compuestos reducidos, CO2 y
inorgánicos H2O
Quimioautótrofos Compuestos O2 y otros Compuestos
inorgánicos compuestos inorgánicos
inorgánicos oxidados
CLASIFICACIÓN DE PRINCIPALES REACCIONES MICROBIALES EN RELACIÓN A LAS FUENTES DE ENERGÍA QUE INFLUENCIA LA
MOVILIDAD DE ELEMENTOS Y COMPUESTOS EN EL SUELO

REACCIONES

1. Mineralización de iones inorgánicos durante la descomposición de la materia orgánica cuando

la cantidad de elementos presentes está en exceso de la demanda microbial.
2. Inmovilización de iones inorgánicos a formas orgánicas para satisfacer necesidades de
crecimiento microbial.
3. Oxidación de iones inorgánicos, particularmente como fuente de energía por autótrofos
aunque numerosos heterótrofos también oxidan compuestos pero no obtienen energía del
proceso.
4. Reducción de elementos oxidados, particularmente cuando se requiere un aceptor alternativo
de electrones al O2. Sin embargo, algunas reacciones de reducción se presentan en la cual las
especies oxidadas no son necesarias como un aceptor de electrones.
5. Transformaciones indirectas que conducen a cambios en el medioam biente (Ph, disminución
de O2 a bajo Eh, adición de CO2).
6. Producción o degradación de ligantes orgánicos.
7. Metilación para producir más compuestos móviles y volátiles.
DISMINUCION DE TOXICIDAD DE CONTAMINANTES

Los organismos del suelo (biota) juegan un rol decisivo en la

determinación del destino de sustancias agregadas
accidentalmente o deliberadamente al suelo.
Los microorganismos normalmente responden a la adición de
xenobióticos a través de dos tipos principales de reacciones:
1. REACCIONES METABÓLICAS PRIMARIAS (conocido
también como la fase I de la biotransformación), durante
el cual las sustancias foráneas dan sustancias más solubles
en agua por la adición o exposición de grupos funcionales.
2. REACCIONES METABÓLICAS SECUNDARIAS (conocido
también como la segunda fase de la biotransformación),
a través de la cual los productos de la reacción primaria son
conjugados con grupos endógenos para facilitar su
excreción.
REPRESENTACIÓN ESQUEMÁTICA DE LA RESPUESTA DE LA BIOTA DEL
SUELO A SUSTANCIAS EXTRAÑAS
Sustancias extrañas enfrentando al
organismo

Transformación primaria, incrementa la

solubilidad, hidrólisis, oxidación, etc.

Penetración rápida Lenta tasa de penetración

Reacciones metabólicas secundarias por

Acumulación en conjugación con sustancias endógenas
ciertos órganos

Muerte en caso de Transformación a Transformación a

sustancias tóxicas fuentes de energía sustancias que
para sustentar pueden ser
bioactividades fácilmente excretadas
REPRESENTACIÓN ESQUEMÁTICA DE LA RESPUESTA DE LA BIOTA DEL
SUELO A SUSTANCIAS EXTRAÑAS
Del esquema anterior se resalta que:
1. El nivel de metabolismo es el principal factor
en determinar la persistencia o degradación
de la sustancia extraña en el suelo, formando
una de las condiciones más importantes por
las que sucede la biodegradación.
2. La activación de estas reacciones requiere de
alta demanda de energía, o al menos una
fuente de catálisis para asegurar su avance.
Esta catálisis es suministrada en los
organismos por las ENZIMAS.
 TRANSFORMACIONES ENZIMÁTICAS
Las enzimas toman su nombre específico del sustrato, la sustancia
que ellas ayudan a cambiar, agregando el sufijo “asa” al nombre de la
sustancia, ejemplo: proteinasa, lipasa, etc.
Según el tipo de reacción química en que ellas están usualmente
involucradas se clasifican en seis grupos.
 TRANSFORMACIONES ENZIMÁTICAS
Las hidrolasas, aquellas que participan en la hidrólisis.
Las transferasas, aquellas que ayudan a transferir un cierto grupo a
otro sustrato, no usualmente agua.
Las oxidoreductasas, aquellas que transfieren hidrógeno o electrones
entre dos sustratos.
Las liasas, aquellas que remueven grupos de sustratos,
Las ligasas, aquellas que catalizan la unión de dos moléculas al costo
de energía química (sintetizan un enlace C-C).
Las isomerasas, que catalizan arreglos intramoleculares.
ESQUEMA DE CLASIFICACIÓN DE ENZIMAS
ENZIMAS
HIDROLASAS

C-N HIDROLASAS C-O HIDROLASAS

PROTEASAS LIPASAS
DEAMINASAS FOSFATASAS
SULFATASAS
CARBOHIDRASAS

TRANSFERASAS

TRANSFOSFORILASAS TRANSACICLASAS
TRANSAMINASAS TRANSMETILASAS

OXIDOREDUCTASAS

DEHIDROGENASAS OXIDASAS
PEROXIDASAS

LIASAS Y SINTETAZAS

CARBOLIASA Y CARBOSINTETAZA HIDRASAS Y DEHIDRASAS

LIGASAS

ISOMERASAS
 ESTRUCTURA ENZIMÁTICA
Una enzima generalmente consiste de dos fragmentos:
Una porción proteínica, formando un transportador coloidal.
Un fragmento no proteínico, hecho de un compuesto bien definido,
simple, el cual puede ser dializado y es más resistente al calor.
El fragmento no proteínico es conocido como grupo prostético (si
está firmemente unido al transportador coloidal) o como coenzima (si
está débilmente unido al transportador coloidal).
 LAS HIDROLASAS EN LA DEGRADACIÓN DE PESTICIDAS

 Las hidrolasas, si son especializadas en enlaces C-O y C-N, son

capaces, con sus diferentes grupos y enzimas individuales, de
degradar muchos pesticidas conteniendo uniones ester, amida o
fosfato. Ejemplos de tales pesticidas: el grupo de los
organofosforados, los insecticidas carbamatos, o la urea y herbicidas
carbamatos.
La detoxificación del malathion, por la acción de una hidrolasa C-O
(carboxilesterasa), proporciona un ejemplo de la degradación de un
pesticida organofosforado a través del rompimiento de una unión
carboxiletil.
 LAS HIDROLASAS EN LA DEGRADACIÓN DE PESTICIDAS

 La hidrólisis de la unión carboxiletil sigue la siguiente reacción:

R-COO-C2H5 R-COOH+C2H5OH
Hidrolasa (carboxilesterasa)

H2O
 La baja toxicidad de malation para algunos animales superiores
puede ser debido a la eficiencia de este proceso.
 LAS HIDROLASAS EN LA DEGRADACIÓN DE PESTICIDAS

 El propanil, un herbicida órgano clorado, derivado de la anilina, es

hidrolizado por la acción de la hidrolasa C-N (acrilcarboxilamidasa),
encontrada en plantas de arroz, para producir dicloroanilina

C2H5CO-NH C2H5COOH+H2N

Acrilcarboxilamidasa
Cl Cl

Cl
H2O Cl
PROPANIL DICLOROANILINA
LAS TRANSFERASAS EN LA DEGRADACIÓN DE PESTICIDAS Y OTROS CONTAMINANTES

Entre las transferasas, el sistema Glutation-S-transferasa (GST) juega

un rol importante en la detoxificación de contaminantes, catalizando
la conjugación de la sustancia endógena (glutation) a un lugar
electrofílico en el material xenobiótico impuesto.
El glutation es un tripéptido, formado por una combinación de tres
aminoácidos: glicina, cisteina y ácido glutámico.
LAS TRANSFERASAS EN LA DEGRADACIÓN DE PESTICIDAS Y OTROS CONTAMINANTES

La catálisis de conjugación de glutation en xenobióticos por GST

generalmente toma lugar en sustratos que comparten tres caracteres
comunes:
Deben ser hidrofóbicos en algún grado.
Deben contener un átomo de carbono electrofílico.
Deben reaccionar no enzimáticamente con glutation en alguna dosis
medible.
 ROL DE LAS OXIDOREDUCTASAS EN LA BIODEGRADACIÓN DE
CONTAMINANTES

La descomposición de residuos de plantas y otras materias orgánicas

naturales forman una de las principales fuentes de humus; entre otros
procesos involucrados, la biodegradación de ligninas tiene una posición
central. Este proceso de degradación es iniciado por varias
oxidoreductasas excretadas por hongos blancos. Ejemplos de tales
enzimas son:
• peroxidasas ligninas,
• peroxidasas dependientes del Mn,
• así como oxidasa fenol conteniendo cobre.
 ROL DE LAS OXIDOREDUCTASAS EN LA BIODEGRADACIÓN DE
CONTAMINANTES

Posteriores investigaciones han revelado que las enzimas que degradan

lignina, excretadas por hongos blancos son capaces de oxidar
hidrocarburos aromáticos policíclicos de alto peso molecular.
Este descubrimiento dirige la atención a estas enzimas como
potenciales agentes de bioremediación de suelos contaminados.
Varias oxidasas usan NAD (nicotinamida adenina dinucleótido) o NADP
(NAD fosfato) como coenzima.
Se ha encontrado que las reacciones dependientes del NADP, son
importantes para la degradación bioquímica de muchos insecticidas:
carbamatos, metoxiclor.
 TRANSFORMACIONES ASISTIDAS POR ACCIÓN BACTERIAL

Los organismos del suelo, asistidos por sus procesos metabólicos

naturales, crean un ambiente en el suelo que permite desarrollar al
sistema en su totalidad y evitan condiciones de colapso.
Debe recordarse que el principal objetivo de todo proceso
metabólico es asegurar la energía requerida para que un organismo
continúe sus actividades de vida.
La producción energética en plantas es alcanzada a través de la
fotosíntesis.
En animales, lo hacen a través de la quimiosíntesis.
 TRANSFORMACIONES ASISTIDAS POR ACCIÓN BACTERIAL

• Las bacterias y otros organismos utilizan ambos procesos, aún algunas

bacterias son capaces de producir energía a través de
transformaciones químicas de material inorgánico y de esa manera
participan en la descomposición de contaminantes inorgánicos en el
suelo.
• Los cambios en el ambiente suelo por acción bacterial es realizado
principalmente por organismos conocidos como litótrofos. Ellos son
capaces de cubrir sus necesidades energéticas por oxidación de
compuestos inorgánicos.
BACTERIAS LITOTROFICAS

Bacterias litotróficas

Quimiotróficas
Utilizan un químico como
una fuente primaria de
energía
Bacterias quimiolitotróficas
Fototróficas
Utilizan la luz visible como
una fuente de energía
Bacterias fotolitotróficas
 TRANSFORMACIONES ASISTIDAS POR ACCIÓN BACTERIAL

Los principales grupos de bacterias litotróficas que juegan roles

principales en la modificación del ambiente suelo son:
Bacterias azufradas
Bacterias nitrificantes
Bacterias que oxidan hierro
Bacterias que oxidan metano
Bacterias de hidrógeno
 TRANSFORMACIONES ASISTIDAS POR ACCIÓN
BACTERIAL

BACTERIAS AZUFRADAS:
1. Bacterias fotolitróficas que oxidan azufre
El grupo thisopirills, que comprende al subgrupo thiorhodaceans
que utiliza H2S o S como donantes de protones y el subgrupo
athiorhodaceans que utiliza H2, derivado del rompimiento de
sustancias orgánicas como ácidos grasos.
 TRANSFORMACIONES ASISTIDAS POR ACCIÓN BACTERIAL

BACTERIAS AZUFRADAS:
2. Bacterias quimiolitotróficas que oxidan azufre
Las especies Beggiatoa sp. Y Thiobacillus denitrificans:
H2S + 2 O2 SO42- + 2H+
So + 2H2O SO42- + 4H+
Desulfovibrio sp. y Desulfotomaculum sp. Reducen sulfatos para
producir sulfuros.
 TRANSFORMACIONES ASISTIDAS POR ACCIÓN BACTERIAL

BACTERIAS NITRIFICANTES:
1. Nitrosomonas europaea
2. Nitrobacter winogradskyi

2NH4+ + 3 O2 2NO12- + 4H+ + 2H2O

O2
2

2NO3-
 TRANSFORMACIONES ASISTIDAS POR ACCIÓN BACTERIAL

BACTERIAS QUE OXIDAN HIERRO:

Especies del orden Caulibacteriales poseen la capacidad de oxidar Fe(II) en
Fe(III), con especies como Gallionella ferroginea o Siderocapsa treubii.
BACTERIAS QUE OXIDAN METANO:
La bacteria metanogénica Scarina methanica puede producir y oxidar
metano a la vez. Usa el dióxido de carbono como aceptor de protones para
cambiar alcohol a metano:
2CH3CH2OH+CO2 CH4 + 2CH3COOH
El acetato producido sustenta el crecimiento de bacterias que reducen
sulfato, que pueden a su vez, oxidar metano en dióxido de carbono y agua.
 TRANSFORMACIONES ASISTIDAS POR ACCIÓN BACTERIAL

BACTERIAS DE HIDRÓGENO:
Este grupo de bacterias, asistido por el efecto catalítico de la enzima
hidrogenasa, es capaz de oxidar hidrógeno molecular en agua.
Ejemplo: Hydrogenomonas

2H2 + O2 2H2O