Universidad Nacional de San Agustín de

Arequipa
Facultad de Ingeniería de Procesos
Escuela Profesional de Ingeniería Ambiental

Biodegradación y transformaciones
con apoyo biológico de
contaminantes en el Suelo
Mg. Giuliana Romero
gromeroma@unsa.edu.pe
Contenido
1. COMPETENCIA
2. INTRODUCCIÓN
3. TRANSFORMACIONES ENZIMÁTICAS
1. EL PAPEL DE LAS HIDROLASAS EN LA DEGRADACIÓN DE PLAGUICIDAS
2. EL PAPEL DE LAS TRANSFERASAS EN LA DEGRADACIÓN DE PLAGUICIDAS Y
OTROS CONTAMINANTES
3. EL PAPEL DE LAS OXIDORREDUCTASAS EN LA FORMACIÓN DEL SUELO Y LA
BIODEGRADACIÓN DE CONTAMINANTES
4. Transformaciones asistidas por la acción bacteriana
Competencia

COMPRENDE LAS MECANISMOS DE

BIODEGRADACIÓN Y TRANSFORMACIONES
DE CONTAMINANTES EN EL SUELO
INTRODUCCIÓN
• Los organismos (biota del suelo) forman un componente integrador
muy importante del suelo y, como tales, juegan un papel decisivo en
la determinación del destino de las sustancias extrañas añadidas
deliberada o accidentalmente al cuerpo del suelo.
• Normalmente responden a la adición de xenobióticos iniciando dos
tipos principales de reacciones:
• REACCIONES METABÓLICAS PRIMARIAS (biotransformación de fase I),
durante las cuales la sustancia extraña se vuelve más soluble en agua
mediante la adición o exposición de grupos funcionales en ella.
INTRODUCCIÓN
• REACCIONES METABÓLICAS SECUNDARIAS (biotransformación fase II),
mediante las cuales los productos de las reacciones primarias se conjugan
con grupos endógenos para facilitar su excreción.
• Al pasar a la solución, la sustancia extraña será capaz de penetrar en el
organismo con velocidades específicas para los organismos y sus
peculiaridades anatómicas y biológicas. En caso de altas tasas de
penetración, si una sustancia extraña entra en el organismo más rápido
de lo que puede eliminarse, se acumula en algunos de sus órganos, y, si la
sustancia es tóxica, esto continúa hasta alcanzar una concentración
tóxica.
• A tasas normales de penetración, las transformaciones metabólicas
secundarias conducirán, por conjugación con compuestos endógenos, a la
formación de sustancias que pueden ser utilizadas como fuentes de
energía por el organismo, u otras que se eliminan fácilmente por excreción.
 De esta representación
Sustancias externas en el organismo esquemática queda claro que el
nivel de metabolismo es un
factor principal para determinar
La transformación primaria, incrementa la persistencia o degradación de
la solubilidad, hidrolisis, oxidación, etc la sustancia extraña en el suelo,
formando así una de las
condiciones más importantes
Rápida Penetración bajo las cuales la
penetración lenta biodegradación tiene éxito

Acumulación en ciertos Reacciones metabólicas

órganos secundarias

Muerte en caso de Transformación a energía para las

sustancias toxicas actividades biológicas

Transformación a sustancias que no pueden

ser fácilmente excretadas
INTRODUCCIÓN
• Como es de esperar, la activación de estas
reacciones requiere una alta demanda de
energía, o al menos una fuente de catálisis,
para asegurar su avance.
• Esta catálisis es suministrada en los
organismos por enzimas. Estas proteínas de
alto peso molecular catalíticamente activas
permiten la activación de transformaciones
biológicas de sustancias en fuentes Una enzima es un catalizador biológico. Es
energéticas o productos químicos de fácil una proteína que acelera la velocidad de
eliminación. una reacción química específica en la célula.
• A fin de comprender la acción fundamental de La enzima no se destruye durante la
las enzimas en las transformaciones del suelo reacción y se utiliza una y otra vez. Una
asistidas biológicamente, se presentará célula contiene miles de diferentes tipos de
brevemente un resumen de los procesos moléculas de enzimas específicos para cada
químicos involucrados en las acciones reacción química particular.
enzimáticas.
Transformaciones
enzimáticas
• Las enzimas toman sus nombres
específicos del sustrato, la
sustancia que ayudan a cambiar,
agregando el sufijo "-asa" al
nombre de esta sustancia, p.
proteinasa, lipasa, etc.
• Según el tipo de reacciones
químicas en las que suelen
participar, las enzimas se
clasifican en seis grupos
principales. Cada uno de los seis
grupos se clasifica en subgrupos,
como se ve en la Figura
Transformaciones enzimáticas
• Una enzima consta generalmente de dos fragmentos: una porción
proteica, que forma un portador coloidal, y un fragmento no proteico,
formado por un compuesto simple y bien definido, que, a diferencia de la
porción proteica, puede dializarse y es más resistente al calor.
• La actividad catalítica de las enzimas, y específicamente los grupos
especiales de los que depende esta actividad, están sujetos a una intensa
investigación, ya que en muchos casos estos grupos no son completamente
conocidos.
• En algunos casos, los grupos SH juegan el papel principal; en otros casos,
los metales unidos a la proteína pueden ser los principales factores de
catálisis. Sin embargo, para la mayoría de las enzimas, la actividad
catalítica puede rastrearse hasta el fragmento no proteico y puede
depender de ciertas sustancias, sin cuya presencia la actividad catalítica
no puede funcionar. Estos se llaman COFACTORES.
Transformaciones enzimáticas
1. HIDROLASAS
• Estos forman alrededor de un tercio de las enzimas conocidas y
actúan principalmente sobre enlaces peptídicos, ésteres,
glucosídicos, amidas y similares.
• Catalizan la hidrólisis de sus sustratos y pueden clasificarse además en
hidrolasas C-N y C-O según el tipo de enlace que puede ser atacado
bajo su soporte.

Hidrólisis de urea
por ureasa
Transformaciones enzimáticas
EL PAPEL DE LAS HIDROLASAS EN LA DEGRADACIÓN DE PLAGUICIDAS
• Las hidrolasas, ya sea que estén especializadas en el enlace C-N o C-O,
son capaces, de degradar muchos pesticidas que contienen enlaces
éster, amida o fosfato (e.g los plaguicidas organofosforados, los
insecticidas carbamatos, o los herbicidas urea y carbamatos).
• La detoxificación del malatión, por la acción de una C–O hidrolasa
(carboxilesterasa), brinda un ejemplo de la degradación de un
pesticida organofosforado a través de la escisión de un enlace
carboxiletilo:
Transformaciones enzimáticas
EL PAPEL DE LAS HIDROLASAS EN LA DEGRADACIÓN DE
PLAGUICIDAS
• Se descubrió que el propanil, un herbicida organoclorado
derivado de la anilina, se hidroliza por la acción de una hidrolasa
C–N (acrilcarboxilamidasa), que se encuentra en las plantas de
arroz produciendo dicloroanilina.
 Transformaciones enzimáticas
2. LAS TRANSFERASAS
• Derivan sus nombres individuales del grupo
transferido, ya sea con el prefijo "trans-" y el
sufijo "-asa", o seguido de "transferasa".
Entonces uno encuentra nombres como:
trans-fosforil-asa, trans-acil-asa o
dihidroxiacetona transferasa. Los siguientes
grupos son los más importantes entre las
transferasas:
• Transfosforilasas. son enzimas que necesitan
un cofactor para llevar a cabo su tarea, que es
agregar grupos fosfato a su sustrato, utilizan Algunas enzimas necesitan la ayuda de una
ATP como fuente para los grupos fosfato tercera sustancia, llamada cofactor, para
requeridos. cumplir su acción de transformar sus
sustratos en otra constitución química. Un
ejemplo es el trifosfato de adenosina (ATP).
Transformaciones enzimáticas
2. LAS TRANSFERASAS
• Transacilasas son enzimas capaces de transferir un grupo acilo de una
molécula donadora a una aceptora se conocen como transacilasas.
Un ejemplo lo puede dar la transferencia de un grupo acetilo (CH3CO)
unido a una molécula X (donadora) a otra molécula Y (aceptora). Tal
proceso procede a lo largo de la siguiente ruta de reacción:
Transformaciones enzimáticas
2. LAS TRANSFERASAS
• Transaminasas, estas enzimas efectúan un proceso recíproco de
aminación-desaminación entre los cetoácidos, principalmente el ácido
pirúvico, que juega un papel clave en la transaminación, a veces se produce
por la degradación de herbicidas alifáticos como el dalapon.

• Transmetilasas, al igual que las otras transferasas, las transmetilasas

transfieren un grupo (en este caso metilo) de una molécula donadora a una
aceptora.
Transformaciones enzimáticas
PAPEL DE LAS TRANSFERASAS EN LA DEGRADACIÓN DE PLAGUICIDAS
Y OTROS CONTAMINANTES
• Entre las transferasas, el sistema conocido como glutatión-S-
transferasa (GST) juega un papel importante en la desintoxicación de
contaminantes, al catalizar la conjugación de la sustancia endógena a
un sitio electrofílico en el material xenobiótico intruso.
• Los epóxidos pueden formarse durante la fase I de biotransformación
como etapas intermedias en la degradación de numerosos
compuestos insaturados.

Formación de óxido de
alquileno o epóxido
Transformaciones enzimáticas
• Una posterior apertura del anillo, por conjugación de una sustancia endógena
sobre el epóxido, conduce, en la mayoría de los casos, a la formación de
sustancias menos nocivas para la vida. Esto puede ilustrarse mediante la
conjugación de glutatión catalizada por GST en el epóxido intermedio de alil
fenil éter.

Degradación de alil fenil éter por glutatión (GSH)

Transformaciones enzimáticas
3. OXIDORREDUCTASAS
• Estas son enzimas capaces de transferir hidrógeno o electrones entre
sustratos. Son de tres tipos: las deshidrogenasas, las oxidasas y las
peroxidasas.
• Las deshidrogenasas transportan principalmente hidrógeno o
electrones a las enzimas aceptoras o al oxígeno para producir H2O2

Esto se puede representar como se muestra

en las siguientes dos ecuaciones en las que
se representa la enzima por el recuadro con
la letra D.
Transformaciones enzimáticas
3. OXIDORREDUCTASAS
• Las oxidasas reaccionan directamente con el oxígeno para dar agua.
Algunos son compuestos de metaloproteínas que transportan
metales pesados y, por lo tanto, se clasifican en citocromo oxidasas
(proteínas de hierro) y cuproproteína oxidasas.
• Las peroxidasas, catalizan la descomposición del peróxido de
hidrógeno, que tiene un efecto tóxico, en oxígeno y agua. Están
presentes en los órganos animales y en la mayoría de las plantas y
están hechos de compuestos de porfirina de hierro. Las peroxidasas
catalizan reacciones entre el peróxido de hidrógeno y otras sustancias
según la ecuación:
 Transformaciones enzimáticas
EL PAPEL DE LAS OXIDORREDUCTASAS EN LA
FORMACIÓN DEL SUELO Y LA BIODEGRADACIÓN DE
CONTAMINANTES
• La descomposición de la materia orgánica, depende
de la biodegradación de la lignina. Este proceso es
iniciado por varias oxidorreductasas excretadas por
los hongos de la podredumbre blanca.
Investigaciones posteriores revelaron que las
enzimas que degradan la lignina, también son
capaces de oxidar los hidrocarburos aromáticos
policíclicos (HAP) de alto peso molecular.
• Varias oxidasas usan nicotinamida adenina
dinucleótido (NAD) o su derivado de fosfato
nicotinamida adenina dinucleótido fosfato (NADP) Las pudriciones blancas son
ocasionadas por bacterias que
como coenzima. pertenecen a la familia de
Enterobacteriaceae
Transformaciones enzimáticas
• Se encontró que las reacciones dependientes de NADP, son
importantes para la degradación bioquímica de muchos insecticidas.

El insecticida carbamato utilizado para controlar plagas principalmente en

maíz y soja, puede sufrir hidroxilación en anillo por oxidasas asistidas por
NADP para dar una mezcla de 4-hidroxi y 5-hidroxi carbamato.
Transformaciones enzimáticas
4. LAS LIASAS
• Este grupo ayuda principalmente en la escisión de un enlace C-C. Se
subdividen, según el enlace que desdoblan, en carboliasas y deshidratasas.
• Carboliasas. Un miembro importante de este grupo es el aminoácido
descarboxilasa que se encuentra en microorganismos, en animales
superiores y en muchos tejidos vegetales. Desempeña un papel clave en la
putrefacción de las proteínas al catalizar la descarboxilación anaeróbica de
aminoácidos en aminas y dióxido de carbono.

Descarboxilación
anaeróbica de
aminoácidos
Transformaciones enzimáticas
4. LAS LIASAS
• Deshidratasas. Este grupo cataliza la eliminación de agua desempeña un papel
importante en el ciclo del ácido cítrico. Su función puede ilustrarse por la acción
de la enzima aconitasa (isomerasa cítrico-isocitrico) que ayuda a convertir el
ácido cítrico en ácido cis-aconítico.
Transformaciones enzimáticas
5. LIGASAS
• Esta clase de enzimas cataliza la unión de dos moléculas; a veces se
clasifican según el tipo de enlace formado bajo su acción catalítica.
Por lo tanto, podemos tener ligasas formadoras de enlaces carbono-
azufre, formadoras de enlaces carbono-oxígeno o formadoras de
enlaces carbono-carbono.
6. ISOMERASAS
• Esta clase de enzimas cataliza reordenamientos intramoleculares. Un
ejemplo puede ser la D-arabinosa isomerasa, una enzima que cataliza
el reordenamiento intramolecular de D-arabinosa para dar D-ribulosa.
 Transformaciones asistidas por la acción
bacteriana
• Los organismos del suelo, ayudados por sus procesos
metabólicos naturales, crean un entorno en el suelo Las bacterias y otros
que permite que todo el sistema se desarrolle. Sin organismos inferiores
embargo, el objetivo principal de todos los procesos utilizan ambos procesos,
metabólicos es asegurar la energía necesaria para aunque algunas bacterias
que un organismo continúe con sus actividades
vitales. también son capaces de
producir energía a través de
• La producción de energía en las plantas se logra a la transformación química
través de un complejo de procesos bioquímicos
asistidos por luz conocidos colectivamente como de material inorgánico y,
fotosíntesis. por lo tanto, desempeñan un
• En los animales, la escisión (principalmente oxidación) papel en la determinación
de material orgánico complejo cumple el mismo del destino de los
propósito; en este caso, todo el proceso se conoce con contaminantes inorgánicos
el nombre colectivo de quimiosíntesis. en el suelo.
Transformaciones asistidas
por la acción bacteriana
• Los cambios en el medio ambiente del
suelo por la acción de las bacterias son
provocados principalmente por
organismos conocidos como
LITÓTROFOS (comedores de rocas).
• Como su nombre indica, son capaces de
cubrir sus necesidades energéticas
oxidando los compuestos inorgánicos
del suelo. Este proceso puede ser
quimiotrófico puro, como se explicó
antes, o fototrófico, utilizando la luz
visible como fuente de energía.
Los principales grupos de
bacterias litotróficas que juegan
papeles principales en la
modificación del ambiente del
suelo son los siguientes:
• bacterias del azufre
• bacterias nitrificantes
• bacterias oxidantes de hierro
• bacterias oxidantes de metano
• bacterias del hidrógeno
Transformaciones asistidas por la acción
bacteriana
Los organismos
1. BACTERIAS DEL AZUFRE sulfurosos de la
• La comunidad ecológica natural de bacterias del azufre se especie beggiatoa
conoce generalmente bajo el término colectivo sulfuretum. Un utilizan tanto el sulfuro
sulfuretum existe normalmente en ambientes con deficiencia de de hidrógeno como el
oxígeno e incluso puede prosperar en condiciones extremas. azufre elemental (S0)
para sus procesos de
• Los organismos que viven en dicha comunidad no deben seguir oxidación
esencialmente el mismo modo trófico: algunos pueden ser quimiotrófica, según
quimiotróficos, mientras que otros pueden ser fototróficos. las siguientes
Como ejemplos de ambos tipos, podemos mencionar los ecuaciones:
siguientes:
• Bacterias oxidantes de azufre fotolitotróficas (familia Rhodospirillaceae)
• Bacterias oxidantes de azufre quimiolitotróficas (Beggiatoa sp., y
Thiobacillus denitrificans), Thiobacillus denitrificans es capaz de oxidar el
sulfuro de hidrógeno utilizando nitrato (NO3–) como agente oxidante en
lugar de oxígeno.
 Transformaciones asistidas por la acción
bacteriana
2. BACTERIAS NITRIFICANTES
• Estas bacterias están representadas por dos grupos que viven Nitrosomonas europaea
en una comunidad simbiótica: las bacterias de nitrito (p. ej., florece en condiciones
Nitrosomonas europaea) y las bacterias de nitrato (p. ej., aeróbicas en suelos
Nitrobacter agile, Nitrobacter winogradskyi), son habitantes cultivables, donde el
del suelo muy importantes que provocan importantes amoníaco (NH3),
cambios químicos en el entorno del suelo. resultante de la
• El primer grupo transforma NH4+ (amonio) en NO2– (nitrito), descomposición de
mientras que el segundo grupo oxida aún más el nitrito en sustancias orgánicas, se
nitrato (NO3–). oxida continuamente a
nitrito (NO2 – ), bajo la
siguiente ecuación:

El trabajo combinado de
Nitrosomonas y Nitrobacter
Transformaciones asistidas
por la acción bacteriana
3. BACTERIAS OXIDANTES DE HIERRO
• Muchas especies pertenecientes al orden de las caulobacterias
poseen la capacidad de oxidar el Fe(II) a Fe(III), por lo que el producto
de la oxidación se almacenará en sus células mucosas dándoles el
característico color marrón herrumbroso del Fe(III)-OH.
• En algunos casos, esto puede proporcionar una explicación para la
aparición de horizontes oxidados en suelos y sedimentos marinos,
habitados por colonias bacterianas como Gallionella ferroginea o
Siderocapsa treubii.
• El primero de estos aparece cerca de manantiales ricos en hierro y
también puede crecer en ambientes marinos poco profundos.
Transformaciones asistidas por la acción
bacteriana
4. BACTERIAS OXIDANTES DE METANO
• Parece que la oxidación anaeróbica del metano va de la mano con la
reducción del sulfato, ya que muchos autores propusieron que las bacterias
metanogénicas (e.g. Scarina methanica) pueden estar produciendo y
oxidando metano al mismo tiempo.
• Scarina methanica usa dióxido de carbono como aceptor de protones para
cambiar los alcoholes a metano como lo demuestra la ecuación:

• El acetato producido en esta reacción permite y apoya el crecimiento de

bacterias reductoras de sulfato que, a su vez, pueden ayudar a la oxidación
anaeróbica del metano en dióxido de carbono y agua.
Transformaciones asistidas por la acción
bacteriana
5. BACTERIAS DE HIDRÓGENO
• Este grupo, asistido por el efecto catalítico de la enzima hidrogenasa,
es capaz de oxidar el hidrógeno molecular en agua.
• Hydrogenomonas, una especie perteneciente a la familia
Nitrobacteriaceae, es capaz de oxidar hidrógeno molecular para
producir agua de acuerdo con la ecuación:

Hidrogenobacter
thermophilus