Biosntesis de purinas.

Las primeras investigaciones de la biosntesis

de las purinas incluyeron un marcado isotpico.
El cido rico fue la primera purina en ser descubierta. En 1776, Karl W.
Scheele y Torbern Bergman demostraron que este compuesto est presente en la
orina humana y en las piedras de la vejiga. Un siglo despus, se descubri que la
mayor parte del nitrgeno ingerido por las gallinas adultas era excretado como cido
rico. Los qumicos del siglo diecinueve comprobaron que, en los pjaros y en
muchos reptiles, el principal producto final del metabolismo del nitrgeno es el cido
rico, anlogo a la urea en el metabolismo de los mamferos.
En 1936, H. A. Krebs (cuando no!) y sus colegas realizaron experimentos que
sirvieron de base para la comprobacin completa de la va que produce los
nucletidos de purina. Demostraron que en las palomas, la incorporacin de
amoniaco (NH3) en cido rico se hace en dos etapas. Primero el amoniaco es
incorporado en hipoxantina en el hgado. Enseguida, la hipoxantina es oxidada en el
rin a cido rico en una reaccin catalizada por la xantina oxidasa. Hasta los aos
50, muchos qumicos consideraban que las purinas de los cidos nucleicos
provenan de una va diferente a la usada por los pjaros, que forman la hipoxantina
como un intermediario de la excrecin de nitrgeno. No obstante, los experimentos
con molculas precursoras marcadas isotpicamente demostraron que las purinas
de los cidos nucleicos y el cido rico provenan de los mismos precursores y vas.
Entonces, se utilizaron homogenados de hgado de paloma un tejido en el cual se
sintetizan activamente las purinas como una fuente conveniente de enzimas para
el estudio de las etapas en la biosntesis de las purinas. La va encontrada en el
hgado de las aves tambin fue encontrada en otros organismos.
En los aos 40 se utilizaron istopos de carbono y de nitrgeno para marcar
compuestos sencillos como 13CO2, H13COO- (formiato), 13[C]-glicina y 15[N]-glicina,
que fueron incorporados en los estudios metablicos. Estos compuestos se
administraron a palomas y ratas, y despus de su incorporacin y procesamiento
metablico, se aisl el cido rico excretado y se lo degrad qumicamente para
detectar la posicin en el cido rico de los tomos marcados de carbono y de
nitrgeno. As pudo dilucidarse la procedencia de cada uno de los tomos del
esqueleto bsico de las purinas. El carbono del dixido de carbono es incorporado
en C-6, el carbono del formiato en C-2 y C-8, el N-1 provena del aspartato, N-3 y N-
9, del nitrgeno amido de la glutamina y C-4, C-5, y N-7, de la glicina.

Glicina CO 2

7 6
Aspartato
N 5
N
1

8
2
N 4
N
9 3

Glutamina
Formiato
 Como ya dijimos, la biosntesis de purinas se realiza sobre la ribosa-fosfato,
por lo que en la primer reaccin de esta ruta se requiere fosforribosil pirofosfato
(PRPP). Por lo mismo, el producto final de esta ruta biosinttica no es la base
hipoxantina, sino su 5-ribonucletido, denominado inosina 5-monofosfato (IMP o
inosinato). La hipoxantina detectada en el hgado de aves por Krebs y sus colegas
se form por la accin de las enzimas de degradacin que catalizan la remocin de
los grupos azcar y fosfato de los nucletidos. La va de novo de la sntesis de la
purina comprende una serie de intermediarios que contienen el azcar unido a
esqueletos incompletos de lo que finalmente constituir el anillo bsico de las
purinas. Debido a su complejidad e inutilidad prctica nos abstendremos de incluir
los nombres completos de cada uno de los intermediarios en esta ruta de sntesis.
Sin embargo, s nos detendremos en analizar sus estructuras qumicas y las
reacciones en las que intervienen.
En la figura se ilustra la va de novo para el IMP, que es ensamblado en diez
etapas (indicadas con los nmeros en rojo). El orden en el cual los tomos son
adicionados es el siguiente: N-9 de glutamina; C-4, C-5 y N-7 de glicina; C-8 de 10-
formiltetrahidrofolato; N-3 de glutamina; C-6 del CO2, N-1 de aspartato; C-2 de l0-
formiltetrahidrofolato. Ntese que primero se completa el anillo imidazol de 5 tomos
(etapa 5) y despus la estructura del anillo de seis miembros (etapa 10).
Explicaremos con detalle slo algunas pocas etapas.
La va se inicia con el desplazamiento del grupo pirofosforilo de PRPP por el
nitrgeno amdico de la glutamina, reaccin catalizada por la glutamina-PRPP
amidotransferasa (etapa 1 en la figura de ms abajo). El grupo amino del producto
fosforribosilamina, es entonces acilado por la glicina para formar glicinamida
ribonucletido (etapa 2). El mecanismo de esta reaccin, implica la formacin de un
intermediario glicil-fosfato, que finalmente permite incorporar el grupo glicina sobre
el nitrgeno de la fosforribosilamina. Este mecanismo, se asemeja al de la glutamina
sintetasa, la cual tiene al glutamil-fosfato como intermediario, antes de formar el
enlace entre el glutamilo y el nitrgeno.
Enseguida (etapa 3), un grupo formilo aportado por el 10-formiltetrahidrofolato
es incorporado sobre el grupo amino destinado a convertirse en el N-7 del IMP. En
la etapa 4, una amida es convertida en una amina, (R)-HNC=NH, en una reaccin
dependiente de ATP que requiere glutamina como el donador de nitrgeno. La
enzima que cataliza esta etapa, una amidotransferasa, es inhibida irreversiblemente
por los antibiticos que son anlogos de la glutamina, por ejemplo, la azaserina y la
6-diazo-5-oxo-norleucina. Estos compuestos, reaccionan con un grupo sulfhidrilo de
la enzima modificando, por una unin covalente, el sitio activo.
La etapa 5 es una reaccin de deshidratacin que permite cerrar el anillo y
requiere ATP. En la etapa 6, el CO2 es incorporado fijndose en el carbono que se
convertir en el C-5 de la purina. En algunos organismos, esta carboxilacin es
inusual ya que ni la biotina, ni el ATP son necesarios. El C-5 del anillo imidazol es
un nuclefilo activado porque en parte es una enamina (H2NC=C), con el grupo
NH2 que es anlogo al grupo OH de un enol. El mecanismo por el cual este
nuclefilo reacciona con el CO2 electroflico se muestra en la siguiente figura.
En las dos etapas que siguen (7 y 8), el grupo amino del aspartato es
incorporado dentro del sistema anular de la purina en crecimiento. Primero, el
aspartato se une al grupo carboxilo recientemente adicionado para formar una
amida, especficamente una succinilcarboxamida. Entonces, una liasa,
adenilosuccinato liasa, cataliza una reaccin no hidroltica de ruptura que libera
fumarato. Este proceso en dos etapas da como resultado la transferencia de un
grupo amino que contiene el nitrgeno destinado a convertirse en N-1 del IMP.

O OH
C
H2 C
O NH2 O
O Glicina
H O P OH HO P OH
HO P OH H2 N
O Gln 1 O CH2
O O Glu
O 2
CH2 O CH2 O C
O P O P OH CH2 O N O
NH2
OH OH H
H2O
HO OH HO OH
O O HO OH ATP
ADP + Pi
5-fosfo-ribosil-1-pirofosfato HO P O P OH
PRPP
OH OH
10-formil-
O
tetrahidrofolato
H2O
2 HO P OH 3
OH Tetrahidrofolato

O O O
H 4 H
HO P OH HO P OH N HO P OH N
N O C
HO C CH O CH2 Glu
O O C CH2
O Gln
CH2 O H C CH2 O H C CH2 O H C
N NH2 N NH N O
H H H

HO OH HO OH ATP + H2O HO OH
ADP + Pi

ATP

5 O OH
C
H2 N CH
ADP + Pi
O O CH2 O
HO P OH O O O OH
N HO P OH C HO P OH C
N C HO O N C
O CH C C
HC O HC OH Apartato O HC N CH
CH2 O C CH2 O C CH2 O C H CH
N NH2 N NH2 N NH2 2

C
HO O
HO OH HO OH HO OH
ATP ADP + Pi
CO2
6 7

O OH
C
8 CH
CH
C
O HO O
O Fumarato
HO P OH N O
C O
O C NH2
HC HO P OH N
O CH2 O C H C
HO P OH O N N C OH O HC C NH2
N C
CH2 O C
O C NH 10 N NH2
HC HO OH
CH2 O C CH
N N
HO OH
9
HO OH O
H2O O 10-formil-
Inosina-5'-monofosfato HO P OH
IMP N C tetrahidrofolato
O HC C NH2
H Tetrahidrofolato
CH2 O C
N N C O
H
HO OH
 En la etapa 9, la cual se asemeja a la etapa 3, el 10-formiltetrahidrofolato
dona un grupo formilo al grupo amino nuclefilo de la aminoimidazol carboxamida
ribonucletido. En la ltima etapa, 10, el nitrgeno amdico se condensa con el
grupo formilo cerrando el anillo que completa el sistema purina del IMP.
La sntesis de novo de IMP consume considerable energa. El ATP es
convertido en AMP durante la sntesis del PRPP. Tambin las etapas 2, 4, 5 y 7 son
dirigidas por la conversin de ATP en ADP. Si se analiza la sntesis de purinas
desde la etapa inicial de la incorporacin del NH4+, se requiere energa adicional del
ATP para la sntesis de glutamina a partir de glutamato y amoniaco.

Sntesis del AMP y GMP . Estos nucletidos se sintetizan a partir de

IMP, por medio de dos rutas diferentes. Cada una de las rutas, requiere de dos
reacciones enzimticas.
La biosntesis de AMP a partir de IMP comprende dos etapas que se
asemejan estrechamente a las etapas 7 y 8 de la biosntesis de IMP. Primero, el
grupo amino del aspartato se condensa con el grupo ceto de IMP en una reaccin
catalizada por adenilosuccinato sintetasa dependiente de GTP (reaccin 11).
Entonces la eliminacin de fumarato del adenilosuccinato es catalizada por
adenilosuccinato liasa, la misma enzima que cataliza la etapa 8 de la va de
novo(reaccin 12). En la biosntesis de arginina en el ciclo de la urea participan
etapas similares a estas reacciones de transferencia de amino.
O OH
C

O CH
HO O
H NH2
C C C C HC
O HO P OH
H2 C
O N OH C N
HO P OH HO O O C N
O OH C HC
N Fumarato CH2 C CH
C O C NH 12 O N N
HC
H2 N CH CH2 C CH
O N N
CH2
HO OH
C
HO O 11 HO OH Adenosina-5'-monofosfato
AMP
Apartato Kinasas,
O Adenosil-succinato
O Fosforilacin
HO P OH oxidativa
N C GTP
O C NH GDP + Pi
HC
CH2 C CH
O N ATP
N

11'
HO OH NAD+ GTP
NADH + H +
Inosina-5'-monofosfato
IMP Kinasas
H2O O
O O
HO P OH O
N C 12' HO P OH
O C NH N C
HC Glu O C NH
CH2 Gln HC
O C C CH2
N N O O C C
N N NH2
H
ATP+ H 2O
HO OH AMP + PPi
HO OH
Xantosina-5'-monofosfato
Guanosina-5'-monofosfato
XMP
GMP
En la conversin de IMP en GMP, el C-2 es oxidado en una reaccin que
cataliza la IMP deshidrogenasa (reaccin 11). Esta reaccin se efecta por adicin
de una molcula de agua al doble enlace C-2 = N-3 y la oxidacin del hidrato por
NADP+. El producto de la oxidacin es xantosina monofosfato (XMP). En seguida,
en una reaccin dependiente de ATP, catalizada por la GMP sintetasa, el nitrgeno
amdico de la glutamina sustituye al oxgeno del C-2 de XMP (reaccin 12). En esta
etapa, el grupo ceto del C-2 del XMP se tautomeriza a enol antes de la
transaminacin.
La sntesis de los nucletidos de purina es regulada mediante retroinhibicin.
Diversas enzimas que catalizan las etapas de la biosntesis de los nucletidos de
purina presentan, in vitro, un comportamiento cintico alostrico. La PRPP sintetasa
es inhibida por AMP, GMP e IMP. La enzima que cataliza la primera etapa en la ruta
de la sntesis de nucletidos de purina, la glutamina-PRPP amidotransferasa,
tambin es inhibida alostricamente por estos y otros nucletidos purina.
Las vas que van del IMP al AMP y del IMP al GMP tambin son reguladas
por retroinhibicin. La adenilosuccinato sintetasa es inhibida, in vitro, por el AMP o
por ATP, productos finales de esta rama, y la IMP deshidrogenasa es inhibida tanto
por XMP como GMP. Obsrvese que los productos finales inhiben tanto las etapas
iniciales comunes como a las enzimas despus del punto de ramificacin. Adems,
el GTP es sustrato en la sntesis de AMP (etapa 11) y el ATP es sustrato en la
sntesis del GMP (etapa 12), lo que permitira equilibrar las concentraciones de
nucletidos de purina en la clula.

Degradacin de purinas. La degradacin de purinas en primates, aves

y reptiles origina cido rico. Aunque la mayor parte de las molculas libres de
purinas y pirimidinas se economizan, algunas molculas son catabolizadas. Estas
molculas son originadas por un exceso de nucletidos ingeridos o por el recambio
intracelular (sntesis y degradacin continuas), de los cidos nucleicos.
En las aves, los reptiles y los primates (incluyendo a los humanos), los
nucletidos de purina son convertidos en cido rico, el cual es excretado. Para las
aves y los reptiles, el cido rico es tambin el producto de excrecin para la
eliminacin del nitrgeno excedente proveniente del catabolismo de los
aminocidos, una funcin llevada a cabo por la urea en los primates. Las aves y los
reptiles carecen de las enzimas que catalizan la degradacin posterior del cido
rico, pero muchos organismos degradan el cido rico a otros productos.
En la figura de abajo se han resumido aquellas vas que van del AMP y del
GMP al cido rico. La remocin hidroltica de fosfato de AMP y GMP produce
adenosina y guanosina respectivamente. La adenosina es desaminada a inosina por
la accin de la adenosina desaminasa. De modo similar, AMP se desamina a IMP
por la accin de la AMP desaminasa. La hidrlisis de IMP produce inosina, la cual
puede ser convertida en hipoxantina por fosforlisis. La fosforlisis de la guanosina
produce guanina. Ambas reacciones de fosforlisis (as como la fosforlisis de
varios desoxinucletidos) son catalizadas por nucletido de purina fosforilasa y
produce ribosa 1-fosfato (o desoxirribosa 1-fosfato), as como una base. La
adenosina no es un sustrato de la purina nuclesido fosforilasa de mamferos.
La hipoxantina formada a partir de inosina, es oxidada a xantina y la xantina
es oxidada a cido rico, el producto final de esta degradacin. Las dos reacciones
son catalizadas por la misma enzima, en algn caso interviene la xantina oxidasa y
en otro la xantina deshidrogenasa. En la reaccin catalizada por la xantina oxidasa,
los electrones son transferidos al O2 para formar perxido de hidrgeno, H2O2. La
xantina oxidasa, una enzima extracelular en los mamferos, parece ser una forma
alterada de la enzima intracelular xantina deshidrogenasa, la cual genera los
mismos productos que la xantina oxidasa, pero transfiere los electrones al NAD+
para formar NADH. Las actividades de estas dos enzimas se llevan a cabo
ampliamente en la naturaleza y presentan una amplia especificidad de sustratos.
 H2O NH3

AMP IMP GMP XMP

AMP
aminohidrolasa
H 2O H 2O H2O H2O
5'-nucleotidasa

Pi Pi Pi Pi
NH2 O O O

N N N N
N NH H2 NH NH
H2 H2 HC HC H2 HC
HC
HO C CH HO C CH HO C HO C
O N O N O N N NH2 O N
N Adenosina N N O
H
aminohidrolasa

HO OH HO OH HO OH HO OH
Adenosina H2O Inosina Guanosina Xantosina
NH3

Pi Pi Pi
Purina
fosforilasa
Ribosa-1 Ribosa-1 Ribosa-1
fosfato fosfato fosfato
O O

N N
NH NH
HC HC
CH N
N N N NH2
H H
Hipoxantina Guanina
H2O
O2 + H 2O Guanina
aminohidrolasa
Xantina NH 3
oxidasa
H2O2
O

N
NH
HC
N N O
H H
Xantina
O2 + H2O
Xantina
oxidasa
H2O2

O
H
N
NH
O
N N O
H H

cido rico
Sus sitios activos contienen sistemas de transferencia de electrones bastante
complejos, que incluyen un centro de hierro-azufre, una molibdoprotena y FAD.
En la mayora de las clulas, la guanina es desaminada a xantina, en una
reaccin que es catalizada por la enzima guanasa (guanina aminohidrolasa) pero
aquellos animales que no tienen esta enzima excretan guanina como producto de
degradacin de algunas purinas. Por ejemplo, los cerdos excretan guanina, pero en
cambio s metabolizan la adenina hasta alantona, el principal producto del
catabolismo de las purinas en la mayor parte de los mamferos.
La gota es una enfermedad de los humanos causada por la sobreproduccin
o la excrecin inadecuada del cido rico. El cido rico es relativamente insoluble,
y cuando su concentracin en la sangre es elevada, puede cristalizar en el cartlago
 y los tejidos blandos, especialmente en el rin, en los dedos de los pies y en las
articulaciones. La gota tiene varias causas, entre ellas la deficiencia parcial en la
actividad de la hipoxantina-guanina-fosforribosiltransferasa. Esta enzima es la que
permite recuperar las bases pricas que se estn degradando cuando llegan al nivel
de hipoxantina o de xantina, o sea inmediatamente antes de su conversin en el
producto final, el cido rico. As en esta enfermedad se obtiene una recuperacin
menor de las purinas y una mayor produccin catablica de cido rico. La
enfermedad, tambin puede ser causada por una regulacin defectuosa de la
biosntesis de purinas. La gota puede ser tratada por la administracin de alopurinol,
un ismero posicional C-7, N-8, sinttico de la hipoxantina. Debido a que el
alopurinol es un inhibidor potente de la xantina deshidrogenasa, su presencia evita
la formacin de niveles anormalmente elevados de cido rico. La hipoxantina y la
xantina son ms solubles que el cido rico, y por consiguiente pueden ser
excretadas.
En la mayor parte de los organismos, el cido rico puede ser oxidado ms
tarde. La urato oxidasa cataliza la conversin, dependiente de O2, del cido rico a
alantona, H2O, y CO2. En este proceso, se abre el anillo de pirimidina del cido
rico. La alantona es el producto principal de la degradacin de purinas en la mayor
parte de los mamferos (aunque no en los humanos, para quienes el producto final
es el cido rico). Tambin es excretado por las tortugas, algunos insectos, y los
gastrpodos.
La enzima alantoinasa cataliza la apertura hidroltica del anillo imidazol de la
alantoina para producir alantoato, la base conjugada del cido alantoico. Algunos
peces de espina (teleosteos) tienen actividad de alantoinasa, pero no pueden
degradar el alantoato y por lo tanto excretan alantoato como el producto final de la
degradacin de purinas.
O CO2 + H 2O2
H H 2O H2O H2O
H O NH2 COOH
N O2 + H 2O N COOH
NH C NH2 NH2 NH2
O O C
O
C C C C
+ 2 C
CO2 + 2 NH3
N Urato N H N O N H N O
H
N O
oxidasa H H Alantoinasa H H Alantoicasa H O H2N O
H Ureasa
cido rico Alantona cido alantoico Glioxilato Urea

La mayor parte de los peces, los anfibios y las moluscos de agua dulce son
capaces de metabolizar el alantoato en una etapa ms. Estas especies contienen la
enzima alantoicasa, la cual cataliza la hidrlisis del alantoato a una molcula de
glioxilato y dos molculas de urea. As, en estos organismos, la urea es el producto
final del catabolismo de las purinas.
Finalmente, diversos organismos que incluyen plantas, crustceos, y
muchos invertebrados marinos pueden hidrolizar la urea en una reaccin que
cataliza la ureasa. Los productos de esta reaccin son dixido de carbono y
amoniaco. La ureasa se encuentra solamente en organismos en los cuales la
hidrlisis de la urea no trae consigo la toxicidad del amoniaco. Por ejemplo, en las
plantas, el amoniaco generado a partir de la urea, es asimilado con rapidez por la
accin de la glutamina sintetasa.
En 1964, Michael Lesch y William Nyhan, describieron una enfermedad
metablica severa caracterizada por retardo mental, elasticidad semejante a
parlisis, y una rara tendencia hacia la automutilacin. Los individuos que padecen
esta enfermedad, llamada sndrome de Lesch-Nyhan, raramente sobreviven a la
infancia. Las caractersticas bioqumicas prominentes de la enfermedad son la
excrecin de hasta seis veces la cantidad normal del cido rico y una velocidad
muy aumentada para la biosntesis de novo de purinas. La enfermedad es causada
por una deficiencia hereditaria de la enzima hipoxantina-guanina-
fosforribosiltransferasa. Debido a que el gen para esta enzima est en el
cromosoma X, la enfermedad est restringida usualmente a los varones. En lugar de
ser convertidas a IMP y GMP respectivamente, la hipoxantina y la guanina son
degradadas a cido rico. El PRPP utilizado normalmente para economizar la
hipoxantina y la guanina contribuye a la sntesis de novo de cantidades excesivas
de IMP, y el IMP en exceso es degradado a ms cido rico. No se conoce como
este solo defecto enzimtico causa los diversos sntomas de comportamiento. Los
efectos catastrficos de la deficiencia indican que la va de economa de purinas es
ms que el simple ahorro de energa adicional a las vas centrales de metabolismo
de nucletidos de purina.

Degradacin de pirimidina s. Las pirimidinas son catabolizadas a acetil

CoA y succinil CoA. El catabolismo de los nucletidos de pirimidina se inicia con la
hidrlisis a los correspondientes nuclesidos y Pi, catalizada por las 5-nucletido
fosforilasas. Esta reaccin y las reacciones subsiguientes del catabolismo de los
nucletidos de pirimidina se ilustran en la figura siguiente. En el caso de CMP, la
hidrlisis inicial a citidina es seguida de desaminacin a uridina es una reaccin
catalizada por la citidina desaminasa. Los enlaces glucosdicos de la uridina y la
timidina son entonces rotos por fosforlisis en reacciones catalizadas por uridina
fosforilasa y timidina fosforilasa, respectivamente. La desoxiuridina tambin puede
experimentar fosforlisis catalizada por la uridina fosforilasa. Los productos de estas
reacciones fosforolticas son ribosa 1-fosfato o desoxirribosa 1-fosfato adems de
uracilo y timina.
 CMP UMP dUMP dCMP
H2O H2O H2O H2O
NMP
H2O NH3 fosforilasa
Pi Pi Pi Pi
Citidina Uridina 2'deoxiuridina 2'deoxicitidina
aminohidrolasa
Pi Pi

Ribosa-1 O deoxiRibosa
fosfato 1-fosfato
HC NH
HC O
N
NADPH + H+ H
Uracilo
NADP + Dihidrouracil
deshidrogenasa

O
H2O O
OH H2O
C O
H2C NH OH
CH2 NH 2 C
H2C O CH2 + CO2 + NH3
N Dihidrouracil H2C C O -ureido
H hidrasa N propionasa CH2 NH2
H
Dihidrouracilo -ureidopropionato -alanina
El catabolismo de la base de las pirimidinas produce intermedios del
metabolismo central; as, no se forman productos de excrecin distintos. La
degradacin de ambos, uracilo y timina comprende varias etapas. Primero, el anillo
pirimidina es reducido a 5,6-dihidropirimidina en una reaccin catalizada por la
dihidrouracilo deshidrogenasa, una reductasa diferente de las que participan en la
biosntesis de novo. El anillo reducido es abierto por ruptura hidroltica del enlace N-
3-C-4 en una reaccin catalizada por dihidropirimidinasa. El derivado resultante es
un beta aminocido sustituido o un N-carbamoil--aminocido (ureidopropianato o
ureidoisobutirato) que es hidrolizado a NH4+, HCO3- y un -aminocido. La -alanina
y el -aminoisobutirato (proveniente de la timina) se pueden convertir en acetil CoA
y succinil CoA, respectivamente, las cuales pueden entrar en el ciclo del cido
ctrico y ser convertidas en otros productos. En las bacterias, la -alanina se puede
utilizar en la sntesis de pantotenato, un constituyente de la coenzima A.