Departamento de Fisicoquimica Catedra de Fisicoquimica Biologica

Fisicoqumica Biolgica - 2017

Jefe de Ctedra: Prof. Dra. Ftima Yubero, MSc.
Adsc. Prof. BC. Andrs Marquez
JTPA/Adsc: BC. Marcelo Lpez
Adsc. Juan Ayala

Textos Utilizados

1. Morris. Fisicoqumica para bilogos

2. Price. Principios y problemas de qumica fsica para bioqumicos
3. Segel. Clculos de bioqumica
4. Chang. Fisicoqumica
5. Freifleder. Biochemical techniques
6. Vzquez. Biofsica.
7. Ignacio Nuez de Castro. Enzimologa

Al finalizar el curso de Fisicoqumica Biolgica los alumnos sern capaces de:

Objetivo General

Evaluar las propiedades y condiciones fisicoqumicas de preparaciones y reacciones biolgicas

adems de identificar las aplicaciones de instrumentales en la caracterizacin de biomolculas.

Objetivos Cognitivos

1. Analizar los factores que influyen en la interaccin de una biomolcula y su entorno.

2. Analizar los parmetros, ecuaciones y modelos que permiten dilucidar los mecanismos e
intermediarios de reaccin que participan en reacciones bioqumicas.

3. Comprender los desplazamientos de iones, molculas pequeas y agua en los medios

biolgicos y a travs de membranas biolgicas.

Objetivos procedimentales

1. Aplicar los fundamentos de la termodinmica a reacciones bioqumicas.

2. Aplicar los mtodos espectroscpicos e hidrodinmicos al reconocimiento de

biomolculas.

3. Manejar correctamente las representaciones grficas que permitan una interpretacin del
fenmeno estudiado.

4. Elaborar informes respetando el formato proporcionado y que incluyan una discusin

clara de los resultados obtenidos.

Objetivos Actitudinales

1. Cooperar activamente en la realizacin de trabajos de grupo.

2. Asumir una actitud responsable y emprendedora durante el desarrollo de las prcticas.

3. Demostrar inters en el conocimiento de avances que se producen en el estudio de los

sistemas vivos.

Objetivos transversales

1. Seguir a travs de medida y observacin de propiedades qumicas, eventos o cambios y su

recopilacin de forma sistemtica.
2. Aplicar el lenguaje ingls en la lectura e interpretacin de un contenido asignado.
3. Participar en equipos de trabajo.
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III. CONTENIDOS

A. UNIDADES TEMTICAS

1. Termodinmica de los sistemas biolgicos

2. Caracterizacin de macromolculas
3. Equilibrios entre macromolculas y ligandos
4. Tcnicas de separacin de macromolcuas
5. Cintica enzimtica
6. Tcnicas espectroscpicos para el estudio de macromolculas biolgicas
7. Fotoqumica
8. Biomembranas.
9. Equilibrio cido-bsico en los organismos vivos

Cronograma de clases tericas de Fisicoqumica Biolgica

Fecha Contenido Docente
2/08 Presentacin general de la catedra Dra. Yubero
1. Termodinmica de los sistemas biolgicos
1.1 Conceptos fundamentales de la Termodinmica clsica.

3/08 2. Termodinmica de los procesos irreversibles. Flujos y fuerzas. Dra. Yubero

1.3. Estado estacionario y principio de la mnima variacin de entropa.
1.4. Energa libre estndar y energa libre estndar a pH 7,0. Reacciones
endergnicas y exergnicas.
4/08 7. Equilibrio cido-bsico BC. Marquz
7.2. Buffers en sistemas biolgicos con Resolucin de Problemas
9/08 1.5. Acople termodinmico de reacciones biolgicas. Dra. Yubero
1.6.Potenciales redox
1.6.1. Ecuacin de Nernst: su aplicacin a sistemas biolgicos.
11/08 Resolucin de Problemas de buffers biolgicos BC. Marquz
7.4. Equilibrio cido-bsico de los organismos vivos. Protenas.

16/08 1.6.2. .Procesos de xido reduccin acoplados. Dra. Yubero

1.6.3. Transporte de electrones. Transporte de electrones en la cadena
respiratoria. Fuerza protomotriz
17/08 Resolucin de ejercicios A confirmar
18/08 7.1 Punto isoelctrico e isoinico. Resolucin de problemas. BC. Marquz
Electroforetogramas de aminocidos
23/08 Equilibrios mltiples entre macromolculas y ligandos
2.1. Unin de ligandos a macromolculas. Ecuacin para la unin de
ligandos y tratamiento de los datos de unin.
2.2. Equilibrios de centros activos de unin mltiple.
2.3. Centros activos no equivalentes para ligandos sobre una
macromolcula.
2.4. Representacin de Scatchard. Clculo del nmero de sitios de
unin, de las constantes de asociacin y energas de interaccin.
24/08 2.6. . Representacin de Hill. Dra. Yubero
2.5. Modelos de unin concertado Monod, Wyman y
Changeaux. Modelo de KNF.
Introduccin a la catlisis de enzimas
25/08 4. Mtodos espectroscpicos de identificacin de molculas biolgicas. BC. Marquz
4.1. Espectroscopa de absorcin UV-Visible. Aplicaciones al estudio de
biopolmeros.
Con resolucin de problemas de punto isosbstico.
30/08 4.2 Espectroscopia infrarroja. Espectro vibracional de biopolmeros. F.Yubero
4.3. Espectroscopa Raman. Aplicaciones al estudio de biomolculas
31/08 1er. Examen Parcial F. Yubero
1/09 6. Biomembranas BC. Marquez
6.1. Difusin. Leyes de Fick. Coeficiente de difusin. Factores que
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afectan.
6.2. Difusin a travs de membranas. Ecuacin de Nernst-Planck.
6.3. Membranas biolgicas. Caractersticas moleculares. Flujos. Mtodo
del pinzamiento zonal de membrana.
6.4. Potencial de membrana.
Efecto Donnan. Teora y Resolucin de Problemas.
06/09 Cintica enzimtica:
8.1. Cintica de estado pre-estacionario y estacionario.
8.2 Ecuacin de Michaelis-Menten. Deduccin. Significado de Km y
Vmax. Deduccin

7/09 Representaciones lineales de la ecuacin de Michaelis-Menten. Eficacia

cataltica.
Resolucin de Problemas
8/09 4.4. Dicrosmo circular. Elipticidad. Aplicaciones al estudio de N.Caballero
biopolmeros.
4.5. Resonancia de spin electrnico. Aplicaciones.
Qumica seca o computacional: 3.3.2. Estructura electrnica molecular.
Energas de unin. Clculo de las propiedades moleculares. DFT (density
functional theory).
Mtodos de estimacin de la masa molar de macromolculas:

13/09 4.6 Fluorescencia. M. Lpez

4.6.1. Fluorescencia. Espectros de absorcin y emisin. Fluorforos.
Fluorescencia intrnseca y extrnseca. Influencia del medio en la
fluorescencia.
4.6.2. Desactivacin de la fluorescencia. Su aplicacin al estudio
conformacional y sitios de unin de en macromolculas.

14/09 Factores que afectan a la actividad de las enzimas Dra. Yubero

15/09 4.6.3. Quimio y bioluminiscencia. BC. Marquez
5.3. Fotosntesis.
5.4. Fotoqumica de la visin. Sntesis de vitamina D.
Resolucin de problemas sobre fotoqumica
20/09 8.3. Mecanismo multisustrato. Ping-pong, secuenciales y Theorell Dra. Yubero
Chance.
Resolucin de problemas
22/09 6. Biomembranas BC. Marquez
Efecto Donnan. Teora y Resolucin de Problemas.
27/09 8.4. Inhibicin enzimtica. Tipos. Grficas, ecuaciones e importancia de Dra. Yubero
su estudio.
28/09 Problemas de Inhibicin y Tecnologa Enzimtica Dra. Yubero
4/10 2do. Examen Parcial BC, Lopez
5/10 4.6.4. Resonancia magntica nuclear de protenas y polinucleitidos. Ma. Eugenia
Aplicacin a procesos biocatalticos. Flores
5/10 2do. Examen Parcial Dra. Yubero
6/10 6.4. Conceptos de permeabilidad y lipofilicidad. Resolucin de BC. Marquez
ejercicios.
6.6. Transporte a travs de membrana. Tipos de transporte. Pasivo y
activo.
6.7. Distribucin de iones entre la clula y el medio. Funcin de Gibbs de
transferencia a travs de la membrana celular.
11/10 Caracterizacin y separacin de macromolculas biolgicas. Bioq. Lpez
3.1. Estructura de macromolculas biolgicas.
3.3.1. Tipo de fuerzas que determinan su estructura.
3.2. Mtodos separativos de macromolculas biolgicas.
3.2.1. Aislamiento de macromolculas a partir de microorganismos,
clulas vegetales y animales. Salting-out- Salting in.
12/10 Mtodos semi empricos para la determinacin de los pesos Dra. Yubero
moleculares. Difusin de molculas biolgicas. 1rq y 2da leyes de Fick
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13/10 3.2.1. Sedimentacin. Velocidad de sedimentacin. Centrifugas. Dilisis. BC. M.Lopez

Centrifugacin analtica y preparativa. Determinacin del coeficiente de
sedimentacin de una macromolcula. Factores que afectan al
coeficiente de sedimentacin. Medida de la masa molar de una
macromolcula. Equilibrio de sedimentacin.

18/10 3.3.3. Filtracin: tipos de filtros. Ultrafiltracin. Dra. Yubero

3.3.4. Migracin de molculas en un campo elctrico
19/10 . Separacin de molculas por electroforesis. Fundamento. Aplicaciones. Dra. Yubero
Tipos de electroforesis. Electroforetogramas
3.3.2. Factores que afectan a la conformacin. Conformacin nativa y en
solucin de macromolculas.

20/10 Ejercicios sobre Efecto Donnan y Sedimentacin BC. Andres

Marquez
20/10 Desarrollo del Trabajo Practico Especial
25/10 Dra.
26/10 Yubero/Bioq.
27/10 M. Lpez
9/11 3er. Parcial Terico Dra. Yubero
10/11 3er. Parcial Problemas

Libros utilizados para las clases de Resolucin de Textos

Problemas Contenido
Bioenergtica: Aplicacin de la termoqumica y Equilibrio Price, Morris, Segel, Textos
Qumico a la reacciones biolgicas de Bioqumica (Voet, Rawn,
Schawn)
Bioenergtica: Funcin de Gibbs Biolgica Price, Morris, Segel,
Price, Morris, Segel,
7.4.1. Sistemas reguladores de la sangre. Transporte y
funcin del CO2. Diagramas pH/CO2

Reacciones Redox Biolgicas (Aplicacin de la Ecuacin

de Nernst a los sistemas vivos)

.4.1. Sistemas reguladores de la sangre. Transporte y Price, Morris, Segel,

funcin del CO2. Diagramas pH/CO2

Reacciones Redox Biolgicas (Aplicacin de la Ecuacin

de Nernst a los sistemas vivos)

Condicin acido bsica de aminocidos Price, Morris

(zwitterin)
Efecto Donnan
Unin de ligandos a macromolculas Price
Sedimentacin
Espectrofotometra (ley de Beer) con cintica qumica Price

Enzimas Price, Morris, Segel, Textos

Cintica de Enzimas de Bioqumica (Voet, Rawn,
Cintica de Doble Sustrato Schawn)
Inhibicin Enzimtica
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Lista de Trabajos Prcticos Especiales

Estimacin de los niveles de CO2 producidos por la superficie foliar de maz y soja

Prof. Dra. Ftima Yubero

o Perfeccionamiento en el Instituto de Qumica y Fisicoqumica Biolgicas (IQUIFIB).

Universidad de Buenos Aires Argentina. Enzimas transmembranales.
o Perfeccionamiento en la Universidad de Murcia, Espaa. Enzimologa de Alimentos.
o Magster en Ciencias Ambientales (UNA)
o Diplomada en Gestin de la Innovacin (UAA)
o Coordinadora de la carrera de Bioqumica
o Jefe del Dpto. de Fisicoqumica
o Docente de grado en las asignaturas de Fisicoqumica Biolgica y Enzimologa (B) y
Fisicoqumica de Alimentos (CTA)
o Docente de posgrado en la maestra en Qumica Ambiental
o Tutora de trabajos de grado para las carreras de CTA y Bioqumica
o Tutora de tesis de posgrado en las maestras de Qumica Ambiental y Ciencia de los
Alimentos