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Metabolismo Biotecnologia PDF
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Todos los seres vivos llevan a cabo el procesamiento de los nutrientes que los
mantienen vivos. A este conjunto de procesos, se le conoce como metabolismo y
consiste de un gran nmero de reacciones qumicas destinadas a transformar las
molculas nutritivas en elementos que posteriormente sern utilizados para la
sntesis de los componentes estructurales; como pueden ser las protenas. Otra
parte importante del metabolismo es la de transformar y conservar la energa que
est contenida en una reaccin qumica en algn proceso que requiera de energa,
como puede ser el trabajo o el movimiento. Figura N 1.1.
Hoy se conoce que las transformaciones que sufre la glucosa no ocurren en un solo
paso, sino que, por el contrario, se forman varios productos intermedios que en
muchas ocasiones no tienen una funcin especfica a no ser la de formar parte de
lo que se conoce como va metablica. La transformacin de los nutrientes en
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compuestos tiles para la subsistencia de un organismo se lleva a cabo por medio
de las reacciones qumicas que realizan unas protenas conocidas como enzimas.
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La energa liberada en las reacciones catablicas se usa para fosforilar ADP,
generando ATP. La energa almacenada en el ATP se utiliza en la mayora de los
trabajos celulares. Por lo tanto, el ATP acopla los procesos productores de energa
de la clula a los consumidores de energa. Figura N 1.2.
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El metabolismo tiene lugar a travs de secuencias de reacciones catalizadas
enzimticamente, y se divide en anabolismo y catabolismo. El proceso por el cual
la clula bacteriana sintetiza sus propios componentes se conoce como
anabolismo, y como resulta en la produccin de nuevo material celular, tambin se
denomina biosntesis.
La biosntesis es un proceso que requiere energa, por lo tanto las bacterias deben
ser capaces de obtenerla de su entorno para crecer y, eventualmente, multiplicarse.
El conjunto de reacciones degradativas de los nutrientes para obtener energa o
para convertirlos en unidades. Figura N 1.3.
Las bacterias son seres vivos y estn compuestas al igual que las clulas
eucariotas por protenas, polisacridos, lpidos, cidos nucleicos, entre otros. Estas
molculas a su vez forman parte de estructuras celulares ms complejas, como por
ejemplo la pared celular y la membrana citoplasmtica. Una caracterstica de los
seres vivos es la capacidad para sintetizar sus propios constituyentes a partir de
nutrientes que toman del medio externo.
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El crecimiento bacteriano se define como el aumento ordenado de todos los
constituyentes qumicos de la clula. Se trata de un proceso complejo, que supone
la replicacin de todas las estructuras y componentes celulares a partir de los
nutrientes exgenos.
El conocimiento de la fisiologa y del metabolismo bacteriano tiene algunas
aplicaciones prcticas:
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Los distintos tipos de metabolismo microbiano se pueden clasificar segn tres
criterios distintos:
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Segn la forma en la que el organismo obtiene la energa para vivir y crecer:
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Los quimiolitohetertrofos obtienen energa de la oxidacin de
compuestos inorgnicos, pero no pueden fijar el dixido de carbono.
Ejemplos: algunos Nitrobacter spp., Wolinella (con hidrgeno como
equivalente reductor), algunas bacterias oxidantes del hidrgeno.
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Figura N 1.5. Clasificacin de nutricional de los organismos
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1.3. SUMINISTRO ENERGTICO
Las clulas bacterianas, poseen una gran variedad de sustancias como fuente de
energa, ilimitada
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reduccin frecuentemente incluyen no slo la transferencia de electrones sino de
tomos enteros de hidrgeno, por lo que se conocen tambin con el nombre de
reacciones de deshidrogenacin. En reacciones de este tipo hay sustancias que
ceden e- (dadoras) y otras que los aceptan (aceptoras). Figura N 1.7.
Todas las formas de vida estn basadas en prcticamente las mismas reacciones
bioqumicas.
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Figura N 1.7. Visin General del Metabolismo. Se muestran las rutas
metablicas centrales y algunos de los intermediarios claves.
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Hay microorganismos que necesitan que en el medio de cultivo
existan fuentes de carbono orgnico (azcares) y se les denomina
hetertrofos,
Otros microorganismos necesitan que se les suministren adems
otros compuestos orgnicos que ellos no tienen la capacidad de sintetizar (a
estos compuestos se les denomina factores de crecimiento)
Las clulas de los animales necesitan un gran nmero de
compuestos preformados los cuales deben estar en la dieta (se le
denominan vitaminas, aminocidos esenciales o cidos grasos esenciales).
Por ejemplo,
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Figura N 1.8. Metabolismo Intermediario.
Cada reaccin metablica est regulada no slo con respecto a otras reacciones
sino tambin con respecto a la concentracin de nutrientes en el medio. La
regulacin se realiza a diferentes niveles:
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1.4.1. Mecanismos de Regulacin enzimtica
Las protenas alostericas son aquellas cuyas propiedades cambian si se les unen
molculas especficas denominadas efectores. Existen dos clases de protenas
alostericas: las enzimas alostericas cuya actividad se incrementa o se inhibe
cuando se combinan con sus efectores, y las protenas alostericas reguladoras que
modulan la actividad de enzimas especficas.
Las protenas alostericas estudiadas con mayor detalle han sido las enzimas
alostericas, cuyo ejemplo lo constituye la aspartato transcarbamilasas (ATCasa),
que cataliza la primera reaccin de la biosntesis de las pirimidinas y cuya actividad
es inhibida por un producto final, la citidina trifosfato (CTP). concentraciones
elevadas de CTP inhiben el funcionamiento de la ATCasa y, en consecuencia, la
formacin de ms CTP hasta que su concentracin disminuye a un nivel optimo. el
ATP, un segundo efector de la ATCasa, activa la enzima, sirviendo para coordinar
la sntesis de nucletidos de purina y pirimidina. las enzimas alostericas son
siempre protenas de peso molecular relativamente elevado, compuestas por
mltiples subunidades. por regla general estas subunidades son idnticas
poseyendo cada una un lugar cataltico y otro alostrico. no obstante, la ATCasa se
compone de dos clases diferentes de subunidades, una con funcin cataltica y otra
con funciones reguladoras.
En las bacterias anaerobias facultativas la fermentacin (como nica va de
generacin de energa) es bloqueada en presencia de oxgeno, asegurando que el
suministro de energa se produzca por la respiracin, que consume menos glucosa
y acumula menos lactato. En este fenmeno, conocido como efecto Pasteur, la
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enzima fosfofructoquinasa es activada o inhibida segn la relacin ATP/ADP,
regulando as el consumo de glucosa.
Este es un ejemplo de regulacin de la actividad enzimtica por una enzima
alostrica. El ejemplo clsico de regulacin a nivel de la sntesis de enzimas lo
constituye el opern lactosa. Hay 3 enzimas que participan en la utilizacin de la
lactosa (-galactosidasa, galactsido permeasa y galactsido transacetilasa) que
tienen un promotor nico.
En ausencia de lactosa, la transcripcin para estas enzimas est bloqueada por
accin de un represor que se une al promotor inhibiendo la accin de la ARN
polimerasa. Cuando se agrega lactosa al medio, sta se une al represor,
bloqueando de este modo su unin al promotor, permitiendo as la accin de la
ARN polimerasa y la sntesis de las tres enzimas.
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son indispensables. Algunos nutrientes son utilizados slo como precursores de
macromolculas celulares y otros slo como fuente de energa sin ser incorporados
directamente al material celular, mientras que otros cumplen las dos funciones a la
vez. Tambin se pueden clasificar como macro y micronutrientes segn la
cantidad requerida.
MACRONUTRIENTES
La primera est bastante extendida entre las bacterias mientras que la segunda
slo es comn en bacterias anaerobias y anaerobias facultativas. El fsforo es
utilizado para la sntesis de cidos nucleicos y fosfolpidos. La mayora de las
bacterias lo usan en forma inorgnica como PO4=.
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Aunque requeridos en cantidades muy pequeas los micronutrientes son
importantes para la nutricin. Entre estos destacamos, cobalto, cobre y manganeso.
Son sustancias que deben ser aportadas preformadas, ya que la bacteria que las
requiere no las puede sintetizar a partir de los nutrientes ms simples, por falla o
ausencia de una va metablica.
Estas sustancias incluyen vitaminas del complejo B, aminocidos, purinas y
pirimidinas. Las bacterias que no requieren factores de crecimiento de denominan
prototrficas y las que los requieren, auxotrficas para ese factor.
II. Dixido de carbono: Algunas bacterias como Neisseria y Brucella tienen varias
enzimas con baja afinidad por el CO2 y requieren una concentracin ms elevada
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(10%) de la que habitualmente est presente en la atmsfera (0.03%). Estos
requerimientos atmosfricos deben ser tenidos en cuenta cuando se realice el
cultivo de estas bacterias.
- Psicrfilas: -5 a 30 C, ptimo:15C
- Mesfilas: 10 a 45C, ptimo: 30C
- Termfilas: 25 a 80C, ptimo: 55C.
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1.5. METABOLISMO HETERTROFO
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- Las bacterias tienden versatilidad a intercalar fcilmente los nutrientes y
productos metablicos terminales
Hay muchas variaciones en este tema, pues diversos organismos pueden degradar
diversos polmeros y secretar diversos residuos. Algunos organismos pueden
incluso degradar los compuestos ms recalcitrantes tales como pesticidas y
petrleo, realizando su reciclado.
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Figura N 1.9. Metabolismo Intermediario.
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Bioqumicamente, el metabolismo hetertrofo procarionte es mucho ms verstil
que el de los organismos eucariontes, aunque muchos procariontes comparten los
modelos metablicos ms bsicos con los eucariontes, por ejemplo, usando la
glicolisis (tambin llamada ruta EMP) para el metabolismo del azcar y el ciclo del
cido ctrico en la degradacin del acetato, produciendo energa bajo la forma de
ATP y reduciendo energa bajo la forma de NADH o quinona.
Estas rutas metablicas bsicas estn muy extendidas porque tambin estn
implicadas en la biosntesis de muchos componentes necesarios para el
crecimiento de la clula (a veces en la direccin contraria).
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* En Bacterias, ** en Hongos
Esta diversidad y capacidad metablicas de los procariontes que les permite utilizar
una variedad enorme de compuestos orgnicos se debe a una historia y diversidad
evolutivas mucho ms profundas que las de los eucariontes. Es tambin
significativo que las mitocondrias se originaron en los eucariontes por
endosimbiosis de una bacteria relacionada con los parsitos intracelulares
Rickettsia, y tambin los simbiontes de las plantas Rhizobium o Agrobacterium.
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Cuadro N 1.2. Patrones de reacciones de oxido reduccin suministradoras de
energa utilizadas por las bacterias.
Aceptor de H2
O2 NO3=, SO4=, Compuestos
Donador de (Respiracin fumarato orgnicos
H2 anaerobia) (Respiracin (Fermentacin)
anaerobia)
III. Respiracin
anaerobia
I. Respiracin (Ninguno)
de
aerobia de
Sustancias sustancias
sustancias
inorgnicas inorgnicas.
inorgnicas
Ej.:
Ej.:
(Thiobacillus
(Nitrosomonas)
denitrificans)
NH3 NO2=
S SO4=
O2 H2O
NO3= N2
Sustancias
II. Respiracin V.Fermentacin de
orgnicas IV. Respiracin
aerobia de sustancias
anaerobia
sustancias orgnicas
de
orgnicas. Ej.: (Streptococcus)
sustancias
Ej.: (muchos -4
orgnicas.
organismos) Glucosa 2-piruvato
Ej.
Glucosa CO2 +4H
(Desulfovibrio)
O2 H2O 2 cido lctico
cido lctico
CO2
SO4= H2S
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Figura N 1.11. Alternativas del metabolismo microbiano.
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La fosforilacin a nivel de sustrato es un sistema usado por ciertas bacterias
quimiorganotrofas. el sustrato orgnico (donador de electrones) pasa por una ruta
catablica (p.ej., la ruta glucoltica), y uno de los intermediarios de esa ruta es
oxidado por un coenzima (p. ej., NAD+), de manera que se origina un intermediario
no fosforilado con una gran energa de hidrlisis. Dicho intermediario experimenta
enseguida una sustitucin con un fosfato, para dar la correspondiente forma acil-
fosfato (siendo este enlace de alta energa). Finalmente, este acil-fosfato dona su
fosfato de alta energa al ADP, que pasa a ATP. Ejemplo: gliceraldehido-3-p 1,3-
difosfoglicrico 3-fosfoglicrico.
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El flujo de electrones desde el NADH o el FADH2 al O2 a travs de complejos
proteicos localizados en la membrana interna mitocondrial, provoca el bombeo de
protones hacia el exterior de la matriz mitocondrial. Se genera una fuerza
protomotriz que est formada por un gradiente de pH y por un potencial elctrico
transmembranal. Cuando los protones regresan a la matriz mitocondrial a travs de
un complejo enzimtico, se sintetiza ATP (fig. 1). De esta forma, la oxidacin y la
fosforilacin estn acopladas por un gradiente de protones a travs de la membrana
interna mitocondrial. (Figura N 1.13).
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1.5.3. La fermentacin
1. Anaerobios estrictos.
2. Facultativos.
3. Anaerobios aerotolerantes.
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Estos organismos son anaerobios facultativos. Para evitar la superproduccin de
NADH, los organismos fermentantes obligados generalmente no tienen un ciclo
completo del cido ctrico. En vez de usar ATPasas como en la respiracin, el ATP
en organismos fermentantes es producido por la fosforilacin a nivel de substrato
donde un grupo fosfato se transfiere de un compuesto orgnico de gran energa al
ADP para formar el ATP. (Figura N 1.15).
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metablicos producidos por cada especie bacteriana especfica son los
responsables del gusto y caractersticas de cada alimento.
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electroqumico para mover un protn (o sodio) y as realizar la sntesis de ATP.
Ejemplos de estas formas inusuales de fermentacin incluyen la fermentacin del
succinato por el Propionigenium modestum y la fermentacin del oxalato por
Oxalobacter formigenes. Estas reacciones son de rendimiento energtico
extremadamente bajo. Los seres humanos y otros animales tambin utilizan la
fermentacin para consumir el exceso de NADH produciendo lactato, aunque sta
no es la forma principal de metabolismo como en los microorganismos
fermentantes.
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