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02 Propiedades de Las Biomoleculas PDF
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PROPIEDADES DE LA BIOMOLCULAS
2.1 INTRODUCCIN
Ya estudiamos que todos los seres vivos, y solo ellos, estn hechos de clulas. En la
introduccin a la parte Biologa, tambin vimos que las clulas, al igual que los seres
inanimados, se componen de tomos y de molculas. Adems, dejamos establecido que
los procesos vitales se rigen por las mismas leyes que todos los procesos naturales, es
decir, por las leyes de la fsica y de la qumica5.
Nota 1: Es prctico el estudio de la clula partiendo de un estudio preliminar de las
molculas que la componen, especialmente si tenemos en cuenta que la gran diferencia
entre los seres inanimados y los seres vivos es la particular organizacin molecular que
existe en estos ltimos. Es importante destacar que las caractersticas estructurales y
funcionales de las molculas que componen a los seres vivos se conocieron con
posterioridad a la postulacin de la teora celular.
Nota 2: El estudio de las molculas que componen a los seres vivos incluye dos partes:
1. Una adquisicin de algunas nociones elementales de qumica general (fig 2.1) tales
como:
? El tomo (ncleo, electrones).
? Los enlaces qumicos (inicos, covalentes polares y covalentes apolares).
? Diferencia entre molculas polares y apolares; hidroflicas e hidrofbicas.
? La molcula de agua y los puentes de hidrgeno.
? Las propiedades del agua significativas para la vida (elevado calor
especfico, elevado calor de vaporizacin, elevada tensin superficial,
capilaridad, capacidad para disolver sustancias y su menor densidad en
estado slido que en estado lquido)
? El concepto de reaccin qumica (reacciones qumicas de oxidoreduccin)
? Los conceptos de pH y acidez.
2. La comprensin de las propiedades estructurales, funcionales y energticas que
hacen que las biomo lculas sean tan importantes.
5
La corriente de pensamiento que sostiene esto se denomina mecanicismo y vino a reemplazar a la
corriente vitalista, segn la cual la explicacin de la vida estaba en un misterioso impulso no natural.
1
Fig. 2.1: Nociones elementales de qumica.
La digestin de los nutrientes que ingerimos en los alimentos ocurre por hidrlisis,
mientras que muchas de las sntesis6 biolgicas ocurren por deshidratacin; por ejemplo,
la sntesis de protenas a partir de aminocidos.
BIOMOLCULAS
El nmero de elementos qumicos que existe en la naturaleza es cercano a cien. Sin
embargo, no todos participan en la composicin de la materia viva; de hecho, llama la
atencin que tan solo seis de ellos la constituyen casi toda y que estos no son los seis
ms abundantes en la corteza terrestre.
Estos seis elementos son: carbono, hidrgeno, oxgeno, nitrgeno, fsforo y azufre.
Se les ha llamado macroelementos de la materia viva por encontrarse en gran proporcin
en las clulas. A otros, que se encuentran en menor proporcin, se les ha llamado
microelementos . Ejemplos de ellos son el sodio, el potasio, el calcio, el magnesio y el
6
Sntesis de molculas quiere decir formacin de molculas.
2
fierro. A los que se encuentran en la materia viva en cantidades insignificantes se les
llama elementos trazas.
El estudio de este captulo debe partir con una nocin elemental: existe una similitud
notable en la composicin molecular de los diferentes organismos , vale decir, en los
distintos tipos de clulas. Lo que estudiaremos a continuacin es algo que todas las
clulas tienen en comn. Al terminar el captulo resultar evidente que unos pocos
elementos pueden combinarse de muchas maneras diferentes, originando una enorme
diversidad de molculas con distintas funciones y caractersticas .
Dentro de las molculas que componen los seres vivos (biomolculas), distinguiremos
entre las inorgnicas y las orgnicas.
? Las inorgnicas no son formadas slo por los seres vivos, pero son muy importantes
para ellos. Incluyen el agua y las sales minerales.
? Las biomolculas orgnicas, en cambio, son sintetizadas exclusivamente por
organismos vivientes. Se estructuran a base de tomos de carbono, del mismo modo
que otras molculas orgnicas que no forman parte de los seres vivos (bencina,
parafina, etc.). Las molculas orgnicas en general, son objeto de estudio de la
Qumica Orgnica. Las biomolculas orgnicas en particular lo son de la Bioqumica,
aunque esta ciencia no se agota en el estudio de sus propiedades.
3
Fig. 2.3: La molcula de agua y los puentes de hidrgeno.
4
? El agua se mezcla homogneamente con las sustancias polares y con las partculas
cargadas, razn por la cual es extraordinariamente buena como disolvente . Las
sustancias que por ser hidroflicas se disuelven en agua, se llaman hidrosolubles.
Las sustancias que, por el contrario, son apolares o sin carga, son hidrofbicas, es
decir, al ponerse en contacto con el agua quedan agrupadas y no se mezclan con ella.
? El agua tiene,
+
adems, una leve tendencia a ionizarse produciendo -el anin OH- y el+
catin H3O , que se representan, para mayor simplicidad, como OH (hidroxilo) y H
(Protn). Las concentraciones de ambos en el agua pura son iguales y por eso
decimos que el agua es neutra7. Otras sustancias, en cambio, al ionizarse en solucin
acuosa, tienden a desigualar las concentraciones de OH- y H+, ya que liberan o
capturan uno de esos iones. Los cidos causan un aumento de la concentracin de
protones por sobre la de hidroxilos y las bases, lo contrario. El pH del agua es igual a
7. Las soluciones con pH inferior a 7 son cidas y las que tienen pH superior a 7 son
bsicas. Para los seres vivos es extraordinariamente importante mantener el pH de
sus medios internos dentro de ciertos mrgenes. La constancia del pH se asegura por
la presencia de sustancias buffers, tampones, o amortiguadores de pH , que cede
protones cuando stos tienden a disminuir o los captan cuando aumentan (fig. 2.4).
Las sales minerales constituyen una proporcin muy pequea de la masa de los seres
vivos, pero los iones en que se descomponen desempean funciones muy importantes
como, por ejemplo, la de mantener los volmenes de agua en los compartimientos intra y
extra celular 8. Adems participan en variados procesos, como, por ejemplo, los siguientes:
7
Decimos que el agua es neutra en dos sentidos: es elctricamente neutra, por un lado y, por otro, no es
cida ni bsica.
8
Las sales atraen agua hacia los compartimientos donde se encuentran en solucin, por un proceso llamado
osmosis.
9
Nos referimos al cuerpo de los animales.
5
CUESTIONARIO
1. Fundamente en qu radica la gran diferencia entre los seres inanimados y los seres
vivos.
2. Describa brevemente qu entiende por tomo, molculas, enlaces qumicos y
reaccin qumica.
3. Seale la diferencia entre:
? hidrlisis y deshidratacin.
? biomolculas orgnicas e inorgnicas.
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2.3 BIOMOLCULAS ORGNICAS
La mayor parte de la masa de cualquier ser vivo es agua, lo que queda en evidencia al
comparar el peso fresco de un organismo con su peso seco (despus de haber sido
deshidratado). Pero si extraemos el agua y revisamos la composicin de la materia seca,
nos encontramos con que la mayor parte es materia orgnica. Esta se encuentra
representada en las clulas por una gran variedad de molculas que pueden
desempearse formando estructuras (molculas estructurales), sirviendo como
combustible o realizando diversas funciones tales como regulacin de procesos,
transporte, accin enzimtica, comunicacin intercelular, etc.
Los grupos de tomos que estn unidos a una cadena de carbonos e hidrgenos se
llaman grupos funcionales. Las molculas orgnicas reciben diferentes nombres segn
el grupo funcional que poseen. Los grupos que vale la pena recuerdar, para efectos del
estudio de la Biologa, son los siguientes:
Hidroxilo (OH) Hace que las molculas sean hidrosolubles. Lo encontramos en
abundancia en los azcares.
Carboxilo (COOH) Las molculas que lo poseen se llaman cidos, pues puede liberar un
protn. Lo encontramos en los aminocidos y en los cidos grasos.
Amino (NH 2) Lo hallamos en los aminocidos.
Fosfato (H 3PO4) Se encuentra en los fosfolpidos y en los nucletidos. Se representa,
P
7
Ntese la importancia de los elementos oxgeno, nitrgeno y fsforo, como
componentes principales de las biomolculas orgnicas, junto con el carbono y el
hidrgeno.
Estudiaremos cuatro grupos de biomolculas orgnicas; los carbohidratos, los lpidos,
las protenas y las molculas hechas de nucletidos. Antes de revisarlas con detalle
veamos de qu estn hechas (fig. 2.6).
10
A ella se debe el (mal) nombre de hidratos de carbono.
8
2.3.1 CARBOHIDRATOS (fig. 2.7)
Los carbohidratos se clasifican (fig. 2.8.a), segn el nmero de unidades de azcar que
contienen, en monosacridos, disacridos, oligosacridos y polisacridos. Los
monosacridos , a su vez, se clasifican segn el nmero de tomos de carbono que
poseen, en triosas, pentosas y hexosas (esos son los de mayor inters biolgico).
DISACRIDOS
Constan de dos monosacridos unidos entre s por un enlace covalente, llamado
glucosdico, que se forma por condensacin. Tres ejemplos son:
? Sacarosa, formada por una glucosa y una fructosa. La sintetizan las plantas y es la
responsable del sabor dulce de los frutos, lo que lo hace apetecibles para los
animales. Esto es conveniente para las plantas, porque permite la dispersin de sus
semillas (los animales se comen el fruto en un lugar y eliminan las semillas en sus
materias fecales en otro sitio). Para los seres humanos, en cambio, no lo es tanto, ya
que la excesiva apetencia por lo dulce suele conducir a malos hbitos alimenticios.
? Lactosa, formada por una glucosa y una galactosa. Es el azcar de la leche. Algunas
personas carecen de las enzimas digestivas necesarias para digerirla, por lo que no
deben consumir alimentos que la contenga. Se dice de ellas que son intolerantes a la
lactosa.
MONOSACRIDOS TRIOSAS
POLISACRIDOS HEXOSAS
9
Fig. 2.7.b: Esquema de la clasificacin de los carbohidratos.
Gliceraldehdo
10
Fig. 2.7.b: Monosacridos.
Triosas Pentosas
O H H H C O H C O
C H C OH C OH C H
H C OH C O H C OH H C OH
H C OH H C OH
H C OH H C OH
H H H C OH H C OH
Gliceraldehdo Dihidroxiacetona
H H
(C3H6O3) (C3H6O3)
Ribosa (C5H 10O5) Desoxirribosa (C5H10O5)
azcar del ARN azcar del ADN
Hexosas H
H C O H C OH H C O
H C OH C O H C OH
HO C H HO C H HO C H
H C OH H C OH HO C H
H C OH H C OH H C OH
H C OH H C OH H C OH
H H H
Glucosa (C6H12O6) Fructosa (C6H12O6) Galactosa (C 6H 12O6)
Aldehdo Cetona Aldehdo
11
POLISACRIDOS
Son polmeros11 de monosacridos. Los ms conocidos son los polisacridos de glucosa,
como el almidn, el glucgeno y la celulosa.
Las plantas almacenan glucosa como almidn en sus semillas y en otras estructuras (en
el tubrculo de la papa, por ejemplo). El almidn es menos hidrosoluble que la glucosa,
por lo que es ms fcil de almacenar. Nosotros conocemos vulgarmente el almidn con el
nombre de harina. Es la forma saludable, por oposicin a los dulces, de consumir
carbohidratos. Ms adelante veremos que los carbohidratos son la base de una dieta
balanceada.
2.3.2 LPIDOS
Los lpidos constituyen un conjunto de sustancias de naturaleza qumica variada que slo
tienen en comn el hecho de que, en vez de disolverse en agua, se disuelven en
solventes orgnicos apolares tales como alcohol, ac etona, ter, cloroformo y benceno.
Adems, poseen menor proporcin de oxgeno que los carbohidratos. Desde el punto de
vista funcional, tambin son variados. Los ms conocidos son los que se almacenan bajo
11
Poli = mucho, mero = partes. Los polmeros son molculas hechas de muchas unidades que se repiten. La
unidad que se repite, se llama monmero. Los polisacridos son polmeros en que el monmero es un
monosacrido. En las protenas los monmeros son aminocidos y en los cidos nucleicos, nucletidos.
Polimerizacin es el proceso por el cual los monmeros se unen formando polmeros. Despolimerizacin es el
proceso inverso.
12
la piel, en el tejido adiposo. Las vitaminas A, E y K tambin son lpidos. Veamos estos y
otros ejemplos.
En el tejido adiposo, los triglicridos tambin sirven como aislantes trmicos y como
amortiguadores contra golpes. Sus cadenas hidrocarbonadas pueden ser saturadas (sin
enlaces dobles), como en el caso de la mayora de los lpidos animales (grasas); o
insaturadas (con enlaces dobles), como en el caso de los lpidos de origen vegetal
(aceites). Ms adelante se estudiar la diferencia entre unos y otros desde el punto de
vista nutricional.
12
Los cidos grasos ms comunes tienen 16 y 18 tomos de carbono.
13
Fig. 2.10: Fosfolpidos.
Esto determina que los fosfolpidos, puestos en contacto con el agua, tiendan a formar
capas superficiales (en que sus cabezas estn en contacto con el agua) o partculas que
dejan encerradas dentro de s las colas hidrfobas. Pero lo ms significativo desde el
punto de vista biolgico es una tercera posibilidad: la de formar bicapas que dejan en su
interior las colas, y en contacto con el agua las cabezas. Estas bicapas, a su vez, forman
esferas que dejan compartimiento interno separado del lquido del recipiente. En virtud de
esta propiedad es que las membranas celulares, tanto la membrana plasmtica como la
de los compartimientos intercelulares, estn bsicamente estructuradas como bicapas
lipdicas hechas de fosfolpidos. Este es un ejemplo de lpidos con una funcin estructural
y no energtica.
CAROTENOIDES
Tienen consistencia aceitosa y estn presentes en las plantas como pigmentos rojos,
anaranjados y amarillos llamados carotenos. Estos, como otros pigmentos, son muy
importantes para las plantas, pues, adems de ser tiles para la fotosntesis, junto con la
clorofila; confieren a flores y a frutos colores que los hacen atractivos para los animales de
los cuales depende la polinizacin y la dispersin de la semilla. De los carotenos se
deriva, por hidrlisis, el retinol o vitamina A, del que se deriva, a su vez, un pigmento
fotosensible de nuestros ojos llamado retinal.
14
ESTEROIDES (fig. 2.11)
El ms conocido es el colesterol. Sus funciones ms conocidas son dos: desempea,
junto a los glicolpidos, un papel estructural en las membranas celulares de los animales,
y es la materia prima para la sntesis de otros esteroides que actan como mensajeros
qumicos, como por ejemplo las hormonas sexuales (testosterona, estrgeno y
progesterona) y las corticoadrenales (aldosterona, cortisol, etc.)
2.3.3 PROTENAS
Las protenas constituyen el 50% de la masa seca de los seres vivos y son las
responsables de las caractersticas de las clulas. Una clula difiere de otra por el tipo de
protenas que predomina en ella, especialmente en lo que a su funcin se refiere. Por una
parte, son los principales componentes estructurales de las clulas, por lo que el
crecimiento, el desarrollo y la reparacin de tejidos requiere de una gran cantidad de ellas.
Ejemplos de protenas estructurales son el colgeno, la elastina y la queratina. Por otra
parte, desempean funciones muy diversas. Consideremos que prcticamente todas13 las
enzimas son protenas. Nos bastara recordar que las enzimas hacen posible las
reacciones qumicas en los seres vivos; y que este conjunto de reacciones qumicas es el
sustento de la vida, para comprender cuan importantes son las protenas ms all de las
funciones estructurales que muchas tienen. Pero, adems, algunas hormonas y algunos
neurotransmisores son de naturaleza proteica, todos los anticuerpos son protenas, as
como tambin los transportadores del plasma sanguneo y las estructuras encargadas
del transporte de sustancias a travs de la membrana plasmtica (canales
transportadores y bombas). Tambin en la membrana plasmtica, las estructuras
receptoras de seales son protenas. Por ltimo, casi todos los movimientos que
podamos detectar en los seres vivos se deben a la accin de combinaciones de protenas.
Por ejemplo, la actina y la miosina son dos protenas que se asocian formando
filamentos contrctiles en las clulas musculares y la tubulina es la protena de que
estn hechos los microtbulos, filamentos responsables del movimiento de los cilios y
los flagelos 14.
En resumidas cuentas, todo lo que podemos observar en los seres vivos es protena o
est hecho por protena.
13
Se han descubierto unas poqusimas excepciones, por ejemplo, se ha encontrado actividad enzimtica en
ciertos ARN.
14
Cilios y flagelos son apndices celulares que sirven para la locomocin.
15
Habindolas revisado desde un punto de vista funcional, procede profundizar en su
estructura. Las protenas son polmeros de aminocidos en que uno est unido al
adyacente por un enlace covalente formado por deshidratacin, llamado enlace peptdico
(fig. 2.12).
Hay veinte tipos de aminocidos en las protenas15, pero alcanzan para fabricar una
enorme variedad de ellas, debido al distinto orden en que se pueden colocar. Estos
aminocidos son16: alanina, valina, leucina, isoleucina, prolina, fenilalanina, triptofano y
metionina (aminoc idos no polares); glicina, serina, treonina, cistena17, tirosina,
asparagina y glutamina (polares sin carga); cido asprtico y cido glutmico (cidos);
histidina, lisina y arginina (bsicos).
15
Cabe mencionar que, aunque los veinte aminocidos participan en la construccin de las protenas, algunos
cumplen funciones en forma individual. El aminocido tirosina, por ejemplo, unidos a tres o cuatro tomos
de yodo, forma triyodotironina o tetrayodotironina, que son las hormonas secretadas por la tiroides. Otros
actan como neurotransmisores.
16
No es necesario que te aprendas de memoria el nombre de los veinte aminocidos, pero es conveniente que
te familiarices con ellos como para poder reconocerlos.
17
El nico que contiene azufre.
18
Con forma de resorte o hlica.
16
anticuerpo, por ejemplo, no se une al antgeno; si se altera la de un receptor de
membrana, no aceptar la seal que le corresponde; si se altera la de una enzima,
sta no alcanzar con los reactantes a los que debe hacer reaccionar. La alteracin de
esta conformacin tridimensional, es decir, la prdida de la estructura terciaria, que
puede ser por efecto del calor, se conoce como desnaturalizacin.
? Estructura cuaternaria: Siguiendo la lgica de esta secuencia sera tentador pensar
que la estructura cuaternaria corresponde a un plegamiento de una estructura terciaria
sobre si misma, pero no es as. Se dice que una protena tiene una estructura
cuaternaria cuando consta de ms de una cadena polipeptdica (subunidad), cada
una con su estructura terciaria. El ejemplo ms conocido es la hemoglobina19, que
consta de cuatro subunidades20 globulares.
Fig. 2.13: Comparacin de las estructuras proteicas con las de un cable telefnico.
* Cadena de aminocidos.
19
La hemoglobina tambin es un ejemplo de protena conjugada. Se llaman as las protenas que incluyen en
su estructura una parte no peptdica. En el caso de la hemoglobina se trata de un grupo hem que tiene un
tomo de fierro al centro.
20
No es un ejemplo de estructura cuaternaria porque tenga cuatro subunidades sino porque tiene un nivel de
organizacin superior al de la estructura terciaria.
17
Cabe mencionar que los genes, al determinar el orden en que van puestos los aminocidos en
una protena, es decir, su estructura primaria, determina su forma y, por lo tanto, su funcin.
Esto debe resultar evidente si se tiene en cuenta que la forma en que se pliega un polipptido*
para llegar a ser una protena con estructura secundaria y terciaria, depende del orden en que
estn puestos los aminocidos en l, ya que dicho plegamiento se debe a las interacciones
entre los aminocidos no adyacentes.
21
Cuidado: en algunos textos estos tres grupos de molculas aparecen bajo el ttulo de cidos nuclicos.
22
N, A y F significan niacina, adenina y flavina, respectivamente. Son bases nitrogenadas que identifican a
los nucletidos. La D significa dinucletido.
23
En muchos textos aparecen las siglas DNA y RNA, provenientes de los respectivos nombres en ingls.
18
? El cido de soxirribonucleico (ADN) constituye el material hereditario de la clula,
tambin llamado material gnico. Se duplica antes de que una clula se divida en
dos, de modo que cada clula hija hereda una copia. La secuencia de nucletidos en
el ADN determina la secuencia de aminocidos en las protenas. Como primera y
simplificada aproximacin al concepto de gen, podemos decir que es un segmento de
ADN que codifica para una protena. El ADN se encuentra, casi exclusivamente, en el
ncleo de la clula. Consta de dos cadenas polinulceotdicas que estn unidas entre s
mediante puentes de hidrgeno que se forman entre las bases nitrogenadas que se
enfrentan. Adenina se aparea con timina y citosina con guanina.
? El cido ribonucleico (ARN) est hecho de una sola cadena polinucleotdica. Es una
copia de la informacin que existe en el ADN.
19
Fig. 2.16: Estructura del ADN.
20