I. INTRODUCCIN Microbiologa es el estudio de los organismos microscpicos, deriva de 3 palabras griegas: micros (pequeo) bios (vida) y logos (ciencia) que conjuntamente significan el estudio de la vida microscpica. Para mucha gente la palabra microorganismos le trae a la mente un grupo de pequeos criaturas que no se encuadran en ninguna de las categoras de la pregunta clsicas es animal, vegetal o mineral? Los microorganismos son diminutos seres vivos que individualmente son demasiado pequeos como para verlos a simple vista. Los microorganismos del suelo destruyen los productos de desecho e incorporan el gas nitrgeno del aire en compuestos orgnicos as como reciclan los productos qumicos en el suelo agua y aire: ciertas bacterias y algas juegan un papel importante en la fotosntesis ,que es un proceso que genera nutrientes y oxgeno a partir de luz solar y CO2 siendo un proceso crtico para el mantenimiento de la vida sobre la tierra : los hombres y algunos animales dependen de las bacterias que habitan en sus intestinos para realizar la digestin y sntesis de algunas vitaminas como son la K y algunos de complejo B .Los microorganismos tambin tienen aplicaciones industriales ya que se utilizan en la sntesis de productos qumicos como son acetona, cidos orgnicos, enzimas, alcohol y muchos medicamentos. Nosotros podemos hacernos una idea de cmo se han desarrollado nuestros actuales conceptos de microbiologa repasando los acontecimientos histricos que han cambiado nuestras vidas.
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La microbiologa es una ciencia biolgica que estudia la estructura, fisiologa, gentica ecologa y las aplicaciones socioeconmicas de los microorganismos. Es decir, de aquellos seres vivientes comprendidos en los reinos Fung (hongos), Protista y Monera (bacterias), incluyendo a los virus y a otros organismos moleculares. La microbiologa utiliza tcnicas como la esterilizacin, el empleo de medios de cultivo, el anlisis molecular y bioqumica, para el aislamiento y crecimiento de los microorganismos.
Objetivos General 1.1. Determinar la enumeracin de microorganismo del suelo en el bosque reservado de la universidad nacional agraria de la selva (BRUNAS).
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II. REVISION DE LITERATURA Desarrollo histrico de la microbiologa 2.1. Como otras ciencias, la microbiologa actual ha seguido tambin un desarrollo histrico, que por razones didcticas aqu se ha dividido en seis periodos se mencionarn cuatro de ellos.
a. Periodo especulativo (3 millones de aos a.c. 1676)
Este periodo se inicia desde los 3 a 2.5 millones de aos A.C con la evolucin del gnero homo. Al desarrollarse las primeras prcticas agrcolas y el procesamiento emprico de los alimentos (1000-7000 A.C) el hombre inicia inconscientemente su relacin eterna con los microorganismos. Fueron los sumerios, babilonios y, ms exquisitamente, los egipcios los que emplearon directamente a los microorganismos al desarrollar la fabricacin del pan y la cerveza. Otras culturas ms recientes tambin han utilizado los microorganismos particularmente en su alimentacin, bebidas alcohlicas han estado presentes en las culturas asiticas, africanas, europeas y americanas; los alimentos fermentados han sido desde sus orgenes fundamentales en la dieta de los asiticos. Ms tarde, Fracastoro (1546) sugiere que organismos invisibles eran los causantes de las enfermedades. Otros como Robert Hooke (1664) describieron observaciones microscpicas de hongos .Pero fue en octubre de 1676 Anthony Van Leeuwenhoek; (1632-1723) publica en la revista PHILOSOPHICAL TRANSACTIONS OF THE ROYAL SOCIETY, su primer articul sobre observaciones microscpicas y la primera persona en describirlos microorganismos en detalle, a los cuales denomino animculos.
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b. Periodo especulativo (3 millones a.c, 1676)
Aparicin Genero Homo (3 A 2.5 millones A. A. C) Practicas Agrcolas (10,000 7000 A. A. C), Procesamiento Emprico de los Alimentos Egipcios M .O. Pan y Cerveza Otras Culturas: asiticas, Africanas, Europeas, Americanas Bebidas Alcohlicas Alimentos Fermentados Fracastoro (1546) = M .O. Enfermedades Robert Hooke (1664) = Observaciones Microscpicas Hongos
c. Periodo de la observacin (1676-1867)
Despus que las publicaciones de Leewenhoek demostraron la existencia delos microorganismos fue necesario, sin embargo, esperar cerca de 200 aos para que la microbiologa tenga un avance rpido. Esto fue debido principalmente al predominio en aquella poca de la Teora de la Generacin espontnea. Este fue un periodo de duro enfrentamiento filosfico entre los diversos cientficos que termino con tal Teora. Hombres como Francesco Redi (1626 1698) Lzaro Spallanzani (1729-1799), Jhon Tyndall (1820-1893) y. principalmente, Louis Pasteur (1822-1895), dieron la victoria e impulsaron vigorosamente a la microbiologa.
La idea de la generacin espontnea se remonta a la cultura griega, los cuales crean que las ranas y gusanos crecan espontneamente a partir del lodo, incluso existan recetas: llenando una tinaja con trapos y colocndola en un sitio apartado durante semanas al final crecan ratones a partir de trapos. En el siglo XVII el italiano Francesco Redi demostr en 1668 que los gusanos encontrados en la carne podrida eran las larvas que provenan de los huevos que previamente haban depositado en la carne las moscas y no el producto dela generacin espontnea. Sin embargo una cosa eran huevos de moscas y otra los microorganismos que solo se podan ver, con la ayuda del microscpico. En 1745 Jhon Needham hirvi trozos de carne para destruir los organismos preexistentes y los coloco en un recipiente abierto. Al cabo de un tiempo observo colonias de
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microorganismos sobre la superficie y concluyo que se generaban espontneamente a partir de la carne. En 1769, Lzaro Spallanzani repiti el experimento pero tapando los recipientes, no apareciendo las colonias, lo que contradeca la teora de la generacin espontnea. Pero Needham argumento que el aire era esencial para la vida incluida la generacin espontnea de microorganismos y este aire haba sido excluido en los experimentos de Spallazani.
e. El periodo de la gentica microbiana (1941-1970)
A inicios de la dcada de los 40 no estaba plenamente confirmada la participacin de los cidos nucleicos como los agente fundamentales en la transmisin hereditaria de los organismos vivientes. Si bien los trabajos de Mendel haban dado origen a la gentica, no se incluia a los microorganismos y, en todo caso, era un misterio su comportamiento gentico. Fueron G, W. Beadie y E.L Tatum quienes en1941, probaron la relacin entre los genes y las enzimas encontrar mutantes auxotroficos (incapaces de sintetizar un metabolismo y, entonces, dependientes del suministro extenso de este) del hongo Neurospora. En 1943, Max Delbruck y Salvatore Luria encontraron mutaciones espontneas en bacterias. Un ao ms tarde, O.T. Avery, C.M. Macleed y M. Mccarty probaron contundentemente que el DNA era la molcula hereditaria y que las bacterias podan transferir genes mediante la transformacin, J.Lederberg y E.L. Tatum (1946) demostraron que algunas bacterias tambin podan transferir genes mediante contacto clula (conjugacin). En 1952, F.H.C.Crick, J.D. Watson y W.Wilkins propusieron el modelo estructural del DNA. En este periodo, tambin, se inicia la utilizacin de los nuevos conceptos dela gentica de microorganismo para lograr mejorar las caractersticas culturales e incrementar las capacidades metablicas de los microorganismos utilizados en la produccin industrial. Se considera que el uso de la Muta gnesis con estos propsitos es casi inmediato al hallazgo de mutantes de Neurospora. La Muta gnesis con estos propsitos es casi inmediata
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al hallazgo de mutantes Neurospora. La Mutagenesis es aun utilizada en los programas de mejoramiento gentico de microorganismo de uso industrial El periodo anterior fue sin duda muy rico en descubrimiento gentico y molecular los cuales continan actualmente. Sin embargo, en 1973 se public un artculo en el que se demostraba la factibilidad de introducir y expresar genes forneos en bacterias. Particularmente el gen de las omatostaina, una hormona de mamferos, pudo ser expresado en Escherichia coli. Esto dio lugar al resurgimiento y modernizacin de la Biotecnologa, es decir, de la aplicacin de ingeniera de los procesos biolgicos desarrollados por clulas microbianas, vegetales o animales, por sus componentes o partes, con la finalidad de obtener bienes y servicios. Actualmente se produce en forma industrial varias protenas humanas, animales y vegetales empleado microorganismo. La formacin de industrias biotecnolgicas ya ha causado una nueva Revolucin industrial, cuyo mximo nivel e podra alcanzar recin en las primeras dcadas del prximo siglo. Microbiologa y tecnologa 2.2. Como ciencia la microbiologa contribuye no solo descubriendo de la verdad, sino tambin al desarrollo socioeconmico de la humanidad. La aplicacin econmica de la microbiologa depende de un buen balanceentre tres componentes. Materia prima (constante) (MP, Tecnologa (T) ynivel de la microbiologa (M). Dentro de las diferentes sociedades actualmente existentes en el mundo se pueden encontrar cuatro variaciones. La primera corresponde a Japn y varios pases asiticos La segunda a la ex Unin Sovitica La tercera a Europa y EEUU Y la cuarta a los pases del Sur (Tercer Mundo).
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Microbiologa del suelo 2.3. Existe una gran diversidad de microorganismos que viven en el suelo. El nmero y tipos de microorganismos presentes en el suelo dependen de diversos factores ambientales como son los nutrientes, humedad, aireacin, temperatura, pH, prcticas agrcolas, etc. Existen del orden de varios miles de millones de bacterias por gramo de suelo. La mayor parte son hetertrofos, siendo comunes los bacilos esporulados, los actinomicetos que son los responsables del olor a tierra mojada, y en la rizosfera (regin donde el suelo y las races de las plantas entran en contacto) especies de los gneros Rhizobium y Pseudomonas. Ciclos biogeoqumicos 2.3.1. El planeta Tierra acta como un sistema cerrado en el que las cantidades de materia permanecen constantes. Sin embargo, s existen continuos cambios en el estado qumico de la materia producindose formas que van desde un simple compuesto qumico a compuestos complejos construidos a partir de esos elementos. Algunas formas de vida, especialmente las plantas y muchos microorganismos, usan compuestos inorgnicos como nutrientes. Los animales requieren compuestos orgnicos ms complejos para su nutricin. La vida sobre la Tierra depende del ciclo de los elementos qumicos que va desde su estado elemental pasando a compuesto inorgnico y de ah a compuesto orgnico para volver a su estado elemental. Los microorganismos son esenciales en estas transformaciones qumicas Ciclo del nitrgeno La fijacin biolgica de nitrgeno, crucial en el ciclo biogeoqumico del nitrgeno, es considerada, despus de la fotosntesis, como el proceso bioqumico ms importante para el mantenimiento de la vida sobre la Tierra. FIJACIN DE N2 La llevan a cabo las bacterias diazofrficas para su propio crecimiento. Slo cuando mueren se liberan al medio los compuestos orgnicos
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nitrogenados que se transforman en nitrato y amonio, que ya pueden asimilarse por las plantas o por otros microorganismos. Azospirillum basilense Bacteria fijadora de N2 que se encuentra con frecuencia en la rizosfera del maz y otras gramneas. Adems produce fitohormonas que favorecen el desarrollo de las plantas
Fijacin de n2 en simbiosis Las bacterias de la familia Rhizobiaceae, conocidas con el nombre genrico de rizobios, se caracterizan por infectar las clulas de las races de las plantas leguminosas y formar ndulos (Figura 1), estructuras caractersticas de la interaccin bacteria-planta en el interior de las cuales unas clulas especializadas, los bacteroides (Figura 2) reducen el N2 a amonio. La fijacin simbitica de N2 es un proceso no contaminante y respetuoso con el medio ambiente, por lo que debera emplearse para disminuir el empleo excesivo de fertilizantes nitrogenados Caractersticas fsicas del suelo 2.3.2. Hay diferentes tipos de suelo y sus caractersticas varan dependiendo de la localizacin y el clima. Los suelos difieren con profundidad, propiedades fsicas, composicin qumica y origen. Estos pueden clasificarse como suelo. Minerales y orgnicos. Los suelos minerales contienen materia slida mayormente inorgnica. Los suelos orgnicos contienen poca materia inorgnica. Composicin del suelo 2.3.3. El suelo est compuesto de diversas capas. A dichas capas se les llama horizontes y cada una se caracteriza por su composicin abitica y/o bitica.
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Horizonte A Aqu encontramos los minerales y la materia orgnica en distintos estados de descomposicin. En esta capa se localiza el humus. El humus se define como el conjunto de residuos orgnicos, vegetales y animales que se incorporan al suelo y cuya degradacin es difcil de realizar por microorganismos. La importancia de ste, es que mejora la textura y estructura del suelo, aumentando as su capacidad de retener agua y reduciendo los cambios en el pH. Adems sirve como reserva de materiales nutritivos en el suelo. Horizonte B En esta capa encontramos partculas finas y minerales. Horizonte C Este se compone de materia mineral solamente. Horizonte D Esta capa posee roca slida bajo el suelo, es importante para la formacin de acuferos. En Puerto Rico los acuferos se localizan al norte de la isla, siendo stos muy importantes como reserva de agua. Material slido del suelo 2.3.4. El material slido que forma parte del suelo es muy diverso y se divide en dos clases: material orgnico y material inorgnico. Material inorgnico
1. Partculas coloidales: Provienen de la erosin de las rocas subyacentes y estn constituidos por minerales arcillosos. Tienen gran capacidad de adsorcin convirtindose en almacenes de agua y nutrientes para las plantas.
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2. Minerales: Los principales son el cuarzo y diversos silicatos procedentes de la disgregacin de las rocas gneas y metamrficas.
3. xidos: Principalmente los xidos de hierro de ah la tpica coloracin ocre. Y en menor proporcin los xidos de magnesio, titanio, aluminio y cinc.
4. Los carbonatos: El principal es el carbonato clcico, son una gran fuente de carbono con abundante presencia en el suelo.
Material orgnico: Consiste en una mezcla de biomasas, plantas parcialmente degradadas, organismos vivos microscpicos y el humus. El humus es el residuo originado por la accin de hongos y bacterias sobre las plantas y esta compuesto por una fraccin soluble y una fraccin insoluble: la humina. Este componente desempea un papel importante en los procesos fsicos y qumicos que tienen lugar en el suelo. Propiedades caractersticas de los suelos 2.3.5. Cada suelo se caracteriza por sus propiedades fsicas y qumicas. El conocimiento de las caractersticas fsico-qumicas de un suelo, nos permitir prever la dinmica de las sustancias contaminantes: 1. LA POROSIDAD: Condiciona la movilidad de los compuestos solubles y de los voltiles. 2. LA TEMPERATURA: De ella dependen los procesos de alteracin de los materiales originarios o la difusin de los contaminantes 3. LOS PROCESOS CIDO-BASE: Influyen en el grado de descomposicin de la materia orgnica y de los minerales, en la solubilidad de algunos contaminantes y en conjunto, los procesos controlados por el pH del suelo. 4. LAS REACCIONES REDOX: Originados en el metabolismo de los microorganismos del suelo, afectan a elementos naturales y contaminantes.
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5 LAS PROPIEDADES COLOIDALES: Explican los procesos de agregacin e inmovilizacin de partculas. 6. LAS INTERACCIONES SUPERFICIALES: Como por ejemplo la adsorcin entre componentes del suelo y otros compuestos ya sean naturales o contaminantes. 7. LA CAPACIDAD DE INTERCAMBIO INICO: Corresponde a la cantidad de iones metlicos que una determinada cantidad de suelo es capaz de intercambiar. Estos intercambios son vitales para que los iones metlicos puedan acceder a la planta. 8. La modificacin o transformacin por contaminacin, deforestacin, de alguno de los factores que conforman un suelo implica un desequilibrio que afecta al resto de los factores y activa normalmente, procesos de regresin en ese suelo.
Factores que contribuyen al nmero y tipo de microorganismos 2.3.6. en el suelo Composicin del suelo (cantidad y tipo de nutrientes.), Caractersticas fsicas del suelo (grado de aeracin, humedad, temperatura y pH.), Tipo de plantas en el suelo (el sistema de races influye en el nmero y tipo de organismos presentes. Flora Microbiana en el Suelo 2.3.7. En un suelo frtil podemos encontrar races de plantas superiores, diversos animales y una gran cantidad de microorganismos. 2.3.7.1. Bacterias
Estas exceden la poblacin de todos los otros grupos de microorganismos. Encontramos todo tipo de bacterias desde autotrficas, heterotrficas, aerbicas y anaerbicas.
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2.3.7.2. Hongos
Cientos de especies se encuentran en el suelo, generalmente cerca de la superficie donde prevalece una condicin aerbica. Los hongos son los descomponedores de celulosa, lignina y pectina. La importancia del hongo en el suelo es que mejora la estructura fsica mediante la acumulacin de sus micelios en l. Adems los hongos forman unos agregados que ayudan a retener agua. 2.3.7.3. Algas Mayormente encontramos algas verdes y diatomeas en la superficie o cerca de sta ya que necesitan luz para llevar a cabo fotosntesis. Estas juegan un papel importante en suelos erosionados o desrticos, ya que como son fotosintticos inician la acumulacin de materia orgnica en esa rea. 2.3.7.4. Protozoarios Son importantes en la cadena alimentaria, ya que su modo de nutricin es la ingestin de bacterias controlando as la poblacin bacteriana. 2.3.7.5. Virus Este grupo incluye fagos, virus de plantas y virus de animales. 2.3.7.6. La rizsfera Es la capa de suelo que se encuentra adyacente a las races. Esta regin se caracteriza por una alta poblacin microbiana. Las bacterias que crecen en la rizsfera se ven afectadas positivamente por substancias que liberan las plantas como aminocidos, vitaminas y otros. A la vez el crecimiento de las plantas se ve afectado por substancias liberadas por la poblacin microbiana.
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Interaccin entre los microorganismos del suelo 2.3.8. 2.3.8.1. Relaciones simbiticas
Neutralismo Es esta relacin dos especies ocupan el mismo ambiente sin que se afecte una o la otra (neutral.) Mutualismo Es una asociacin donde cada uno de los organismos envueltos se benefician (relacin positiva. Comensalismo Es esta relacin un organismo se beneficia mientras que el otro no se afecta (relacin positiva). Un ejemplo lo observamos en los hongos que degradan celulosa a glucosa y otros compuestos, las bacterias no pueden degradar celulosa, pero s glucosa beneficindose de esta forma. Antagonismo Esto se observa cuando una especie afecta adversamente el ambiente de otra especie, produciendo diferentes substancias inhibidoras o antibiticas (relacin negativa. Un ejemplo lo vemos en la produccin de sustancias inhibidoras como: antibiticos, cianuro (producido por hongos), metano, sulfuros, enzimas lticas (stas rompen la pared celular de las bacterias). Los medios de cultivo en microbiologa 2.3.9. THOMAS. Et al. (1991). Uno de los sistemas ms importantes para la identificacin de microorganismos es observar su crecimiento en sustancias alimenticias artificiales preparadas en el laboratorio. El material alimenticio en el que crecen los microorganismos es el Medio de Cultivo y el crecimiento de los microorganismos es el Cultivo. Se han preparado ms de 10.000 medios de cultivo diferentes.
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Para que las bacterias crezcan adecuadamente en un medio de cultivo artificial debe reunir una serie de condiciones como son: temperatura, grado de humedad y presin de oxgeno adecuado, as como un grado correcto de acidez o alcalinidad. Un medio de cultivo debe contener los nutrientes y factores de crecimiento necesarios y debe estar exento de todo microorganismo contaminante. La mayora de las bacterias patgenas requieren nutrientes complejos similares en composicin a los lquidos orgnicos del cuerpo humano. Por eso, la base de muchos medios de cultivo es una infusin de extractos de carne y Peptona a la que se aadirn otros ingredientes. El agar es un elemento solidificante muy empleado para la preparacin de medios de cultivo. Se lica completamente a la temperatura del agua hirviendo y se solidifica al enfriarse a 40 grados. Con mnimas excepciones no tiene efecto sobre el crecimiento de las bacterias y no es atacado por aquellas que crecen en l. Caractersticas De Las Colonias Bacterianas 2.3.10. Para conocer mejor las caractersticas de los microorganismos es necesario estudiarlas en un medio puro. Un cultivo puro es aquel que contiene una clase de microorganismo, por eso se debe evitar la contaminacin. Para esto se debe cultivar con la cantidad de nutrientes y los medios necesarios. (Brock 1999). La solucin acuosa con los nutrientes necesarios se llaman medio de cultivo. Un medio de cultivo requiere de una fuente de carbono, nitrgeno y otros nutrientes. La clula requiere de dos tipos de nutrientes: macro y micronutrientes. El carbono es muy importante porque a partir de ste la clula fabrica material celular. El siguiente elemento ms abundante es el nitrgeno ya que forma parte de protenas, cidos nuclicos y otros constituyentes celulares. Algunos otros macronutrientes son el fsforo, el azfre, el potasio, magnesio, calcio, sodio y hierro. Entre los micronutrientes son metales que
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forman parte de enzimas. Los factores de crecimiento incluyen vitaminas, aminocidos, purinas y pirimidinas. (Brock 1999) . Los dos grupos de medios de cultivos son los qumicamente definidos y los indefinidos o complejos. Los primeros se preparan aadiendo a agua destilada cantidades precisas de compuestos purificados, por eso se conoce la composicin exacta. A veces no es necesario conocer exactamente la composicin qumica. Los medios complejos usan lisados de sustancias nutritivas. (Brock 1999). Los medios de cultivo pueden ser preparados para usarse en estado lquido o como geles semislidos. Un medio de cultivo lquido puede pasar a semislido agregndole un agente solidificante que normalmente es el agar. En las cajas de Petri, es donde se hacen los medios de cultivos con agar. (Brock 1999). Para evitar contaminantes se debe utilizar la tcnica asptica. Los contaminantes areos son los que presentan el problema ms comn. Las transferencia asptica de un tubo a otro se realiza con un asa o una aguja que ha sido esterilizada por calentamiento. Los cultivos tambin piden ser transferidos a placas. (Brock 1999). Mtodos de aislamiento 2.3.11. THOMAS. Et al. (1991). El aislamiento de bacterias a partir de muestras naturales se realiza, en la mayora de los casos, mediante la produccin de colonias aisladas en cultivos slidos. El crecimiento explosivo de las bacterias permite producir un gran nmero de ellas a partir de una nica clula inicial de forma que, tras un periodo de incubacin en las condiciones ambientales adecuadas, se produce una colonia observable a simple vista y formada por individuos iguales (un clon bacteriano). Sin embargo, no todos los microorganismos presentes en las muestras ambientales son cultivables (microorganismos no cultivables). Esto es debido a dificultades intrnsecas en el cultivo (microorganismos parsitos de
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otros), al desconocimiento de los requerimientos especficos de cultivo, y a la existencia de grupos de microorganismos que deben mantenerse en equilibrio para poder sobrevivir (casos de sintrofa por ejemplo). Se estima que en slo en torno al 1% de las bacterias del suelo al 0,1 - 0,01 % de las bacterias marinas son cultivables. Existen procedimientos de enriquecimiento del nmero de bacterias de ambientes naturales para facilitar su aislamiento. Uno de ellos es la Columna de Winogradski que crea un microcosmos para enriquecer el nmero de ciertos tipos de microorganismos presentes en ambientes naturales con objeto de facilitar su aislamiento. Medida del crecimiento y enumeracin de microorganismos 2.3.12. THOMAS. Et al. (1991). Existen diferentes sistemas para detectar y medir el crecimiento de microorganismos. Los principales, se enumeran a continuacin: 2.3.12.1. Recuento directo Consiste en la observacin al microscopio de volmenes muy pequeos de suspensiones de bacterias. Se usan unos portaobjetos especiales denominados cmaras de Petroff-Hausser. Para que la medida sea correcta es necesario que la densidad de clulas sea del orden de 105 por ml. 2.3.12.2. Medida de la masa de clulas El sistema se basa en que las clulas en suspensin dispersan la luz causando la turbidez del cultivo. La turbidez depende de la masa en suspensin y, por tanto, midiendo esta se puede estimar aquella. Este es el parmetro de medida ms fcil de usar en los cultivos de laboratorio. La densidad de clulas debe ser del orden de 105 por ml. 2.3.12.3. Recuento de viables Consiste en sembrar un volumen determinado de cultivo o muestra sobre el medio de cultivo slido adecuado para estimar el nmero de viables contando el nmero de colonias que se forman puesto que cada una de estas
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deriva de una clula aislada. Para que la medida sea correcta desde el punto de vista estadstico, es necesario contar ms de 300 UFC. En ciertas ocasiones en las que la densidad de microorganismos es demasiado baja, stos se pueden recolectar por filtracin a travs de una membrana (de 0.2 m de tamao de poro) y posterior colocacin de la membrana en un medio de cultivo adecuado para que se formen las colonias. 2.3.12.4. Medida del nmero de partculas Usando contadores electrnicos de partculas. Estos sistemas no nos indican si las partculas corresponden a clulas vivas o muertas; pero nos pueden dar una idea del tamao de las partculas. 2.3.12.5. Medida de parmetros bioqumicos Tales como la cantidad de ADN, ARN, protenas, peptidoglicano, etc. por unidad de volumen de cultivo. 2.3.12.6. Medida de actividad metablica
De las bacterias como que respiran producen una disminucin del potencial redox del medio en que se encuentran como consecuencia del consumo de oxgeno (utilizacin de colorantes sensibles a oxidacin-reduccin tales como el azul de metileno).
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III. MATERIALES Y METODOS Materiales 3.1. Caldo peptonado 1% 90 ml Agar Plate Count + manitol 1% (sal) Tubos con caldo diluyente Matraz Papel filtro Pipetas de 1 a 10 ml Embudo Estufa Placa Petri Metodologa 3.2. Trabajo de campo 3.2.1. Se realiz la ubicacin de la zona para la extraccin de la muestra de suelo
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Trabajo de gabinete 3.2.2. Muestra de suelo desecado o hmedo (250 gr)
Se pes 10 gr de muestra de suelo
Los 10 gramos de suelo se le aadieron al matraz contenido con 90 ml de caldo peptonado al 0.1 %. Agitar bien la solucin.
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Despus de agitar hay q llevar a filtrar la solucin
Despus del filtrado hay que sacar 1 ml de la solucin para agregar al primer tubo de ensayo, y as a cada tubo respectivamente.
1 ml de Solucin Filtrado
1 ml 1 ml 1 ml
10 -2 10 -3 10 -4 10 -5
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Sembrar por profundidad un inoculo de 0.25 1 ml (de las dos ltimas disoluciones), medio Plate Count manitol 1%.
Incubar a temperatura ambiente (28 30c) por 24 a 48 horas.
Despus de los 24 a 48 horas, se procede a realizar el recuento de colonias utilizando un equipo de cuenta colonias, luego se aplic la formula respectiva de enumeracin de M. O. por gramo. Formula: M.O./gr de suelo = # colonias X Inoculo de siembra X Factor de dilucin.
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IV. RESULTADOS Determinacin de microorganismos en la muestra del suelo. 4.1. La prctica de enumeracin de colonias tiene la finalidad de determinar la fertilidad del suelo, debido a que los microorganismos son extremadamente numerosos en un suelo frtil, es decir que un gramo de tierra sana contiene aproximadamente diez mil millones de bacterias. Todos los microorganismos descomponen la materia orgnica y reciclando as los nutrientes, mayormente son organismos aerobios, los cuales tambin pueden pertenecer al grupo de los patgenos.
Del muestreo del suelo del BRUNAS, se utiliz 10 gramos de suelo para inocular utilizamos el mtodo de incorporacin. Utilizamos un factor de dilucin de 10 4 con un inoculo de 1 ml. Se aplicara la siguiente formula, despus del conteo de colonias:
Microorganismos en el suelo = nmero de colonias inoculo de siembra factor de dilucin.
Microorganismos en el suelo = 10 1 ml 10 4 colonias/gr de suelo. Microorganismos en el suelo = 100 000 colonias/gr de suelo.
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V. DISCUSION
Despus de 24 horas de haber hecho la siembra, se observ que no haba habido crecimiento en la placa. Se observ 50 colonias en la placa de agar. Si se tratara de una bacteria, la forma de crecimiento era circular, el borde era entero y no tena elevacin por lo que era plana. El hecho de que no hayan crecido puede deberse a que tal vez se tom muy poco al realizar el raspado de la placa. Podra deberse tambin a que al realizar el raspado para tomar la colonia de la placa previamente sembrada el asa estuviera todava muy caliente, tanto que matara a las bacterias que se tomaron y para el momento de realizar la siembra en la placa hubieran muy pocas o ninguna viva.
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VI. CONCLUSION
El punto blanco observado en la placa podra ser una colonia bacteriana o una burbuja del agar.
El conteo de los microorganismos del muestreo del suelo del BRUNAS dio como resultado un alto ndice de microorganismo en gramos de suelo, concluimos que es un suelo altamente frtil.
El contenido de microorganismos del suelo es de 100 000 colonias/gr de suelo.
Todos los microorganismos descomponen la materia orgnica y reciclando as los nutrientes, mayormente son organismos aerobios.
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VII. REFERNCIAS BIBLIOGRAFICAS BURGES. A. 1960. Introduccin a la microbiologa del suelo. Edit. Acribia. Zaragoza. 84-109 p.
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NDICE
I. INTRODUCCIN ............................................................................................ 2 Objetivos General ................................................................................... 3 1.1. II. REVISION DE LITERATURA.......................................................................... 4 Desarrollo histrico de la microbiologa .................................................. 4 2.1. Microbiologa y tecnologa ...................................................................... 7 2.2. Microbiologa del suelo ........................................................................... 8 2.3. Ciclos biogeoqumicos ......................................................................... 8 2.3.1. Caractersticas fsicas del suelo .......................................................... 9 2.3.2. Composicin del suelo ......................................................................... 9 2.3.3. Material slido del suelo .................................................................... 10 2.3.4. Propiedades caractersticas de los suelos ......................................... 11 2.3.5. Factores que contribuyen al nmero y tipo de microorganismos en el 2.3.6. suelo12 Flora Microbiana en el Suelo ............................................................. 12 2.3.7. 2.3.7.1. Bacterias .................................................................................... 12 2.3.7.2. Hongos ....................................................................................... 13 2.3.7.3. Algas .......................................................................................... 13 2.3.7.4. Protozoarios ............................................................................... 13 2.3.7.5. Virus ........................................................................................... 13 2.3.7.6. La rizsfera ................................................................................ 13 Interaccin entre los microorganismos del suelo ............................... 14 2.3.8. 2.3.8.1. Relaciones simbiticas ............................................................... 14 Los medios de cultivo en microbiologa ............................................. 14 2.3.9. Caractersticas De Las Colonias Bacterianas .................................... 15 2.3.10. Mtodos de aislamiento ..................................................................... 16 2.3.11. Medida del crecimiento y enumeracin de microorganismos ............ 17 2.3.12. 2.3.12.1. Recuento directo ...................................................................... 17 2.3.12.2. Medida de la masa de clulas .................................................. 17 2.3.12.3. Recuento de viables ................................................................. 17 Pg.
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2.3.12.4. Medida del nmero de partculas ............................................. 18 2.3.12.5. Medida de parmetros bioqumicos.......................................... 18 2.3.12.6. Medida de actividad metablica ............................................... 18 III. MATERIALES Y METODOS ......................................................................... 19 Materiales ............................................................................................. 19 3.1. Metodologa .......................................................................................... 19 3.2. Trabajo de campo .............................................................................. 19 3.2.1. Trabajo de gabinete ........................................................................... 20 3.2.2. IV. RESULTADOS .............................................................................................. 23 Determinacin de microorganismos en la muestra del suelo. .............. 23 4.1. V. DISCUSION .................................................................................................. 24 VI. CONCLUSION .............................................................................................. 25 VII. REFERNCIAS BIBLIOGRAFICAS ................................................................ 26
Oviedo L. (2008). Análisis del uso de hábitat del delfín manchado pantropical Stenella attenuata (Cetacea: Delphinidae) en el Golfo Dulce, Costa Rica. Master's Thesis, Universidad Nacional Costa Rica PROCMAR
Centro de Investigación de Cetáceos (CEIC) - Costa Rica