BIOQUIMICA

DR. VICENTE M AYALA PICOAGA

Bioquímica
BIOQUIMICA
 Es la ciencia que estudia la composición de los
seres vivos, las funciones que cumplen y sus
transformaciones metabólicas.

 Los procesos de transformación los estudia a

nivel molecular.

 No solamente vincula estructura y función, sino

también aquellas interrelaciones moleculares
propias de los seres vivos.
 BIOQUIMICA

 La Bioquímica estudia las diversas vías de

transformación metabólica de proteínas, lípidos,
carbohidratos y la base molecular de la herencia.

 Esta ciencia permite el estudio de las diversas

patologías a nivel molecular, el mecanismo de la
memoria, las bases de la diferenciación celular y en
el futuro la terapia genética.
LA CELULA
 Posee sistemas transformadores de la
energía.
 Transforma la energía física y química en
energía biológica.
 La “energía biológica” es convertida en
trabajo osmótico, químico ó mecánico.
 El ATP es la molécula que la célula utiliza para
guardar energía.
SUSTANCIAS NUTRITIVAS

 Los alimentos tienen como componentes

sustancias nutritivas o nutrientes.

 Los nutrientes desde el punto de vista

funcional pueden clasificarse en:
A.- Energéticos
B.- Estructurales
C.- Reguladores
TRANSFORMACION DE LA ENERGIA

 La energía que utilizan los seres vivientes

provienen del sol.
PLANTAS
(Fotosíntesis)
CO2 + H2O + Energía
CO2
H2O
Hombres Energía
Animales
 TRANSFERENCIA DE ENERGIA

 La transferencia de energía puede clasificarse en:

a.- Energía de enlace químico.-

A-B + C B-C + A

b.- Energía calorífica.-

A-B + C B-C + A + calor

c.- Energía para realizar trabajo útil.

A-B + C B-C + A
 TRANSFERENCIA DE ENERGIA

 La energía que se libera cuando una reacción se

aproxima al equilibrio puede utilizarse para realizar
trabajo o transferirse como energía de enlace
químico a componentes de otra reacción.
A-B + C B-C + A
ADP + Pi ATP

 G = -RT ln K + RT ln (`[P]/[R] )
SISTEMAS DE INFORMACION
BIOLOGICA

 Los principios, sistemas y propiedades

bioquímicos son aplicables a todas las formas
de vida.
 Estos sistemas están constituidos por:
a. Receptor
b. Transductor
c. Amplificador
REGULACION BIOLOGICA

 Los sistemas vivientes tienen dos elementos

fundamentales:
a.- Información b.- Acción
 La información lo constituyen los sistemas:
endocrino, nervioso e inmunitario.
“Todos los mecanismos vitales, por variados que sean,
siempre tienen un solo propósito, el de mantener la
unidad de las funciones vitales en el medio interno, la
constancia del medio interno”.
Claude Bernard
VIAS DE SEÑALIZACION

 Permiten que funcionen los mecanismos de

regulación, dirigidos a desarrollar una función
armónica.
a.- AMPc
b.- Factores de transcripción
c.- Inositol fosfatos y Ca2+
En la transducción de la señal participan
1. Proteína cinasas
2. Proteína fosfatasas
VIAS DE SEÑALIZACION

Efector

Receptor Transductor Amplificador

Segundo
Mensajero
VIAS DE SEÑALIZACION
Estimulan la formación de AMPc

ACTH Glucagon
LH Vasopresina
FSH TSH
Hormona paratiroidea
 AMPc
 La adenil ciclasa está ligada a receptores a través de las
proteínas G.
 La interacción hormona receptor activa la s.u.  que se liga a
la adenil ciclasa.
 La adenil ciclasa transforma el ATP en AMPc.
 El AMPc formado activa la PKA mediante la liberación de dos
sub unidades C.
 La s.u. C en el núcleo fosforilan al CREB y éste se une al
potenciador regulado por AMPc denominado CRE.
VIAS DE SEÑALIZACION
Adrenalina

Receptor Transductor Amplificador

(-adrenérgico) Proteínas G Adenil ciclasa
s s
 
ATP AMPc
VIAS DE SEÑALIZACION
Estimula una tirosina cinasa
(Factores de transcripción)

Insulina
EGF
PDGF
 Tirosina cinasa y Factores de
transcripción
 La insulina y varios factores de crecimiento
interaccionan con proteínas receptoras tirosina
cinasas (RPTK).
 Esta interacción induce dimerización u
oligomerización, lo que facilita la
autofosforilación de ciertos residuos de Tyr.
 Los residuos de fosfotirosina interactúan con
proteínas con dominios Src de homología 2 (SH2)
y Src de homología 3 (SH3).
 Tirosina cinasa y Factores de
transcripción
 Se genera un lugar de unión SH2 en el receptor
para Grb2.
 Grb2 atrae a SOS a las inmediaciones de su
sustrato tipo Ras que se activa por reemplazo de
GDP por GTP.
 La proteína Ras activa la proteína cinasa Raf 1, la
que a su vez activa la MAPKK y ésta a la MAPK.
 La MAPK llega al núcleo activando varios factores
de transcripción.
VIAS DE SEÑALIZACION

Efector

Receptor Transductor Amplificador

RPTK Grb2 SOS Ras Raf 1

MAPKK

MAPK
+
Factores de transcripción
VIAS DE SEÑALIZACION
Estimulan formación de Inositol fosfatos
y Ca2+
-catecolaminas
Angiotensina
Acetilcolina
Hormona liberadora de tirotropina
Hormona liberadora de gonadotropina
 Fosfatos de inositol y Ca2+

 Varios factores de crecimiento y hormonas

activan receptores acoplados a las proteínas G o
a los RPTK.
 Los receptores acoplados a la proteína G liberan
IP3 (inositol 1,4,5 trifosfato), por activación de la
FLC, mientras que los RPTK activan la FLC.
 Fosfatos de inositol y Ca2+

 Las fosfolipasas C y C hidrolizan al fosfatidil inositol 4,5

bisfosfato ligado a la membrana plasmática formando IP3 y
DAG.

 El IP3 estimula la liberación de calcio de los depósitos

intracelulares.

 El DAG activa las proteína cinasa C (PKC), enzimas que

tienen la propiedad de fosforilar residuos de Ser y Tyr de
diversas enzimas.
VIAS DE SEÑALIZACION

Hormona

Receptor Transductor Amplificador

RPTK (SH2) PIP2
FLC

Ca2+ IP3 DAG

(+)

Ca2+
 Receptores de hormonas Tiroideas

 Existe una superfamilia de receptores para cada hormona.

 Los receptores se encuentran tanto en el citoplasma como
en el núcleo.
 La unión del ligando al receptor induce la dimerización del
receptor el cual tiene 5 dominios: A/B, C, D, E y F.
 El dominio C es responsable del reconocimiento del ADN
y dimerización del receptor.
 Receptores de hormonas Tiroideas

 El dominio C confiere flexibilidad conformacional entre la

región C y el dominio E.

 El dominio E está implicado en la represión, localización

nuclear y la asociación de la proteína de choque térmico
(HSP).

 Los elementos de respuesta para los receptores de

hormonas esteroideas son frecuentemente repeticiones
invertidas de 5-6 nucleótidos.
METABOLISMO INTERMEDIARIO

 Los organismos vivos mantienen su complejo

orden mediante un dinámico estado estacionario.

 Ellos deben incorporar sustancias alimenticias y

energía de su entorno.

 Los alimentos son transformados a través de una

diversidad de reacciones secuenciales.
METABOLISMO INTERMEDIARIO

 Los procesos anteriores se conocen como

metabolismo, y se realizan gracias a la
participación de las enzimas.

 Las transformaciones químicas permiten liberar

y almacenar energía química, así como, sintetizar
moléculas complejas a partir de compuestos
simples.
METABOLISMO INTERMEDIARIO

 VIA METABOLICA.- Son reacciones secuenciales catalizadas por

enzimas.
 En esta secuencia el producto de una reacción enzimática constituye
el sustrato de la siguiente reacción en la secuencia.
 Los diversos productos de las reacciones anteriores se conocen
como METABOLITOS o INTERMEDIARIOS METABOLICOS.

Sustrato HEXOQUINASA Producto

G-6-P F-6-P F-1,6di P
Sustrato FFK Producto
 METABOLISMO

El metabolismo comprende 2 fases bien diferenciadas el anabolismo y el

catabolismo.
CATABOLISMO:
 Corresponde a los procesos degradativos, en los que, moléculas
complejas son escindidas en compuestos más simples.
 Transforma las moléculas que derivan de los alimentos en sustancias
más simples.
 En los procesos catabólicos se produce liberación de energía libre de
las moléculas complejas.
 Parte de esta energía puede conservarse por reacciones acopladas
enzimáticamente y almacenadas como ATP.
METABOLISMO

ANABOLISMO:
 Constituyen los aspectos biosintéticos del
metabolismo.
 Permiten la síntesis de moléculas complejas que
requiere el organismo.
 Las reacciones anabólicas necesitan de energía la
que se obtiene a partir de:
.- ATP
.- NADPH.
ETAPAS EN EL CATABOLISMO DE
COMBUSTIBLES METABOLICOS

ETAPA 1.-
 Las macromoléculas como las proteínas, triglicéridos y
glucógeno son escindidas en unidades pequeñas.
 En esta etapa se libera muy poca energía.

ETAPA 2.-
 Las moléculas simples (glucosa, ácidos grasos,
aminoácidos) son transformados en un pequeño número de
moléculas para ser oxidadas ulteriormente.
 Parte de la energía libre se atrapa como ATP.
ETAPAS EN EL CATABOLISMO DE
COMBUSTIBLES METABOLICOS

ETAPA 3.-
 Constituye la vía común final, la que está
constituida por: ciclo de Krebs, transporte de
electrones y fosforilación oxidativa.
 Los productos finales son: CO2, H2O y ATP.
 ETAPAS DEL CATABOLISMO

Proteínas Triglicéridos Glucógeno

Etapa 1

Aminoácidos Glicerol + Acidos grasos Glucosa

Etapa 2

AOA, Piruvato, Acetil CoA

Etapa 3
Ciclo de Krebs – CTE – Fosforilación oxidativa
 LOCALIZACION DE LAS VIAS
METABOLICAS
 Las vías metabólicas se encuentran localizadas en
compartimientos celulares específicos.
 Las enzimas que conforman la vía glicolítica se encuentran
localizadas en el citosol.
 Las enzimas que participan en los reacciones de la -
oxidación están localizadas en la mitocondria.
 La distribución intracelular de las enzimas se determina
utilizando la técnica de centrifugación diferencial.
 VENTAJAS DE LA
COMPARTIMENTALIZACION

 Permite separar los procesos metabólicos que se

desarrollan en direcciones opuestas.
1.- Reacciones anabólicas como la biosíntesis de ácidos
grasos se realiza en el citosol.
2.- Las reacciones catabólicas como la oxidación de los
ácidos grasos ocurre en la mitocondria.
 Los procesos catabólicos no interfieren con los
procesos anabólicos.
 REGULACION BIOQUIMICA

 Es necesario mantener constante la velocidad de

las reacciones metabólicas.
 Las sustancias reguladoras son las hormonas y
las enzimas intracelulares.
 Los reguladores emiten señales: efectores u
hormonas.
 Las señales modifican los elementos de mando en
las enzimas.
 REGULACION METABOLICA:
MECANISMOS

 Modificaciones de la saturación enzimática.

a.- Enzimas Michaelianas.
b.- Enzimas Alostéricas.
 Modificaciones de la afinidad enzimática.
 Modificaciones de la actividad enzimática.
 Modificaciones de la concentración enzimática.
 COORDINACION E INTEGRACION
METABOLICA
 Las reacciones metabólicas están coordinadas.
 Las velocidades de formación y utilización de
metabolitos deben ser iguales.
 Las reacciones que proporcionan energía, no
deben ocurrir más rápidamente que aquellas que
producen nuevamente ATP.
 Las reacciones metabólicas deben estar integradas
en el metabolismo total del cuerpo.
REACCIONES ACOPLADAS

En las reacciones metabólicas es posible acoplar

una reacción termodinámicamente desfavorable
a otra termodinámicamente favorable y tornar
posible dicha transformación.
 REACCIONES ACOPLADAS

a.- Las reacciones acopladas son:

Gº (kcal/mol)
Glucosa + Pi G-6-P + H2O + 3.3
ATP + H2 O ADP + Pi - 7.3

b.- La reacción neta es:

Glucosa + ATP G-6-P + ADP - 4.0