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Estructura y replicación

del material genético


Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del


material genético
1
1
Objetivos tema 6:
Estructura y replicación del material
genético
Deberán quedar bien claros los siguientes puntos:

•Cómo se descubrió la naturaleza química del


material hereditario
•La composición química de los ácidos nucleicos
•La estructura 3D del DNA: naturaleza
complementaria y antiparalela de la doble cadena
del ácido desoxirribonucleico (DNA)
•La extraordinaria capacidad explicativa del
modelo del DNA de la función biológica
fundamental de esta molécula
•La replicación semiconservativa
•Enzimología de la replicación
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 2


material genético
2
La transformación bacteriana en
Streptococcus pneumoniae (Griffith 1928)

Rugosa

Muerte por neumonía Cepa resistente

Lisa

Dr. Antonio Barbadilla

No muere Tema 6: Estructura


Muerey replicación del 3
material genético
3
¿Cuál es el Principio transformante?

Principio

Rugosa Lisa

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 4


material genético
4
Colin MacLeod

El elemento transformante Maclyn McCarty

es el DNA (1944)
Oswald
Avery

Ver animación
experimento
tranformación
bacteriana
Dr. Antonio Barbadilla

Sólo DNA produce transformación


Tema 6: Estructura y replicación del
material genético
5
5
Experimento de Alfred Hershey y Martha
Chase con fagos (1952)

Bacteriófago T4

El DNA es el
material
infeccioso
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 6


material genético
6
Componentes de los ácidos nucleicos

adenina

timina
guanina

citosina

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 7


material genético
7
Reglas de Chargaff

1. Proporción de purinas = Proporción de pirimidinas

A+G=C+T

2. A=T
Dr. Antonio Barbadilla

3. G=C Tema 6: Estructura y replicación del 8


material genético
8
1953. Año culminante:
J. Watson y F. Crick resuelven la
estructura tridimensional del DNA
(Nature 171: 737-738)

Watson y yo hemos
encontrado el
secreto de la vida

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 9


material genético
9
1953. Año culminante:

Dos líneas de evidencia:

•Reglas de Chargaff

•Fotografías de difracción de rayos X

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 10


material genético
10
Significado reglas de Chargaff

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Complementariedad de
Temalas bases
6: Estructura y replicación del 11
material genético
11
Difracción de rayos X

Hemoglobina

Linus Pauling
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 12


material genético
12
Interpretación del patrón difracción de rayos X del DNA

Rosalind E.
Franklin

Dr. Antonio Barbadilla

Crickdel
Tema 6: Estructura y replicación 13
material genético
13
Modelo en metal
del DNA

J. Watson y F. Crick
Concluyen: La estructura del DNA es una
doble hélice, formada por cadenas orientadas
en direcciones opuestas (antiparalelas). La
estructura se mantiene gracias a enlaces de
hidrógeno entre las bases nitrogenadas que se
encuentran orientadas hacia
Dr. Antonio Barbadilla
el interior de 14las
Tema 6: Estructura y replicación del
14 cadenas
material genético
Doble hélice, formada La estructura se mantiene gracias
por cadenas orientadas a enlaces de hidrógeno entre las
bases nitrogenadas que se
en direcciones opuestas
encuentran orientadas hacia el
(antiparalelas).
Dr. Antonio Barbadilla

interior
Tema 6: Estructura de las cadenas
y replicación del 15
material genético
15
Desnaturalización del DNA

•Separación de las dos hebras por calor


•Una mayor proporción G-C tiene una mayor
temperatura de desnaturalización (‘fusión’)
100
Porcentaje G + C

80

60

40

20

Dr. Antonio Barbadilla


70 80 90 100 110
Temperatura de fusión (desnaturalización)
Tema 6: Estructura y replicación del 16
material genético
16
Dr. Antonio Barbadilla
Hélices levógiras y dextrógiras
Tema 6: Estructura y replicación del 17
material genético
17
DNA-B dextrógira
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 18


material genético
18
Ver artículo
Nature
1953
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Tema 6: Estructura y replicación del 19


material genético
19
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 20


material genético
20
La estructura del DNA suministra una
explicación asombrosamente
simple del fenómeno de la herencia
La estructura explica:

•La naturaleza de la secuencia lineal de los genes


(información digital cuaternaria en secuencias
unidimensionales de monómeros A,T,G,C)
•El mecanismo de replicación exacta de los
genes
•La naturaleza química de las mutaciones
•Por qué la mutación, la recombinación y la
expresión génica son fenómenos separables a
nivel molecular
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 21


material genético
21
Esencial a la relación
íntima entre estructura
molecular y función
genética del DNA es el
concepto de molde
La complementariedad de las
bases nitrogenadas permite que
la secuencia de una cadena
sencilla de DNA actúe como un
molde para la formación de una
copia complementaria de DNA
(replicación) o de mRNA
(transcripción)
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 22


material genético
22
Y ahora las declaraciones de Watson y
Crick sobre el ADN. Esto es para mí la
prueba verdadera de la existencia de Dios
Salvador Dalí

Antes pensábamos que nuestro futuro


estaba en las estrellas. Ahora sabemos que
está en nuestros genes.
James Watson

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 23


material genético
23
Una estructura
tan bonita tenía,
por fuerza, que
existir
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 24


24
material genético
J. Watson
Una estructura
tan bonita tenía,
por fuerza, que
existir
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del J. Watson


25
material genético
25
El DNA
contiene información
digital cuaternaria en
secuencias unidimensionales
de monómeros A,T,G,C
Dr. Antonio Barbadilla

(cristal
26
aperiódico) Tema 6: Estructura y replicación del
material genético
26
Hay grandeza en esta concepción de la
vida,... que mientras este planeta ha ido
girando según la constante ley de la
gravitación, se han desarrollado y se están
desarrollando, a partir de ununacomienzo
molécula tan
sencillo, infinidad
helicoidal asombrosa,
de formas
infinidad
cada
de vez
formas
más
bellasvez
cada y maravillosas
más bellas y maravillosas
Charles Darwin

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 27


material genético
27
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 28


material genético
28
Replicación del DNA

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Tema 6: Estructura y replicación del 29


material genético
29
25 de Abril 1953

It has not escaped our notice that the


specific pairing we have postulated
immediately suggests a possible
copying mechanism for the genetic
material.

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Tema 6: Estructura y replicación del 30


material genético
30
Posibles modelos de replicación

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Tema 6: Estructura y replicación del 31


material genético
31
Replicación del DNA
•Semiconservativa: una cadena sirve de molde para una
nueva cadena
•El experimento de M. Meselson y F. Stahl (1958)
demuestra que la replicación es semiconservativa

Mathew Meselson Frank Stahl


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Tema 6: Estructura y replicación del 32


material genético
32
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 33


material genético
33
Replicación del DNA
•Enzimas que sintetizan (replican) el DNA
•E. coli
•DNA polimerasa I (rellena huecos y repara)
•DNA polimerasa II y III (función principal en
la síntesis)
•Añade bases en ambas cadenas en la
dirección 5’  3’
•Requiere un 3’ OH final
•Eucariotas
•5 polimerasas
 y  principal en replicación
,  y  exonucleasas
•Corrección de pruebas: actividad 3’  5’
exonucleotídica. Sustituye bases mal emparejadas
(10-5) por correctas (10-7); mecanismos de reparación
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adicionales la reducen hasta 10-10 Tema 6: Estructura y replicación del 34
material genético
34
3’ 5’
Las polimerasas
conocidas añaden
nucleótidos
solamente en la
dirección 5’  3’

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 35


material genético
35
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 36


material genético
36
¿Por qué no hay una enzima que
polimerice en la dirección 3´-> 5?

No funcionaría la corrección de errores por


falta de un trifosfato que suministre la
energía de enlace covalente azúcar-fosfato

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Tema 6: Estructura y replicación del 37


material genético
37
Adición 5’3’

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 38


material genético
38
P

P
OH

OH
P
P

PP

OH
3’

P
5’
PP + H2O
P

P
OH

PP

OH
P
OH

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 39


P

material genético
39
Adición 3’5’
(hipotética)

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 40


material genético
40
P

OH
OH

P PP

PP
OH
3’ 5’

P
PP + H2O
P

OH
PP
P
OH
Adición 3’5’
OH

(hipotética)
P

PP

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Tema 6: Estructura y replicación del 41


P

material genético
41
Corrección de errores

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Tema 6: Estructura y replicación del 42


material genético
42
P

P
OH

POH
P
P

PP

OH
3’

P
5’
PP + H2O
P

P
OH

Adición 5’3’
OH

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 43


P

material genético
43
P

OH
P
OH

PP
OH
3’ 5’

P
Adición 3’5’
(hipotètica)
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 44


material genético
44
Replicación del DNA (2)
•Replicación: continua (cadena adelantada, cebador
sólo inicio) y discontinua (cadena retrasada)

•Discontinua
•Cebador (pequeño RNA 2-60 nucleótidos
añadido por enzima primasa o RNA pol que
provee 3’ OH.
•Fragmento de Okazaki por DNA pol III
(1500 bp en procariotas y 150 en eucariotas)
•Pol I elimina cebador 3’ -> 5’ y llena huecos
(gap)
•Ligación (DNA ligasa, enlace fosfodiéster)
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 45


material genético
45
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 46


material genético
46
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 47


material genético
47
Polimerasa III

Polimerasa I

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Tema 6: Estructura y replicación del 48


material genético
48
¿Por qué el cebador es RNA?

El cebador es más proclive al error, por


lo que debería eliminarse y el RNA
puede detectarse y eliminarse
fácilmente por la DNApol I

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 49


material genético
49
Replicación del DNA (3)
El replisoma: complejo enzimático de la
replicación que coordina la síntesis de las
dos cadenas, maquinaria molecular
•Dímero de la DNA pol III (núcleos
catalíticos)
•Primosoma: formado por dos enzimas
•Primasa
•Helicasa (desenrolla el DNA)
•Proteína de unión a cadena sencilla, ssb
(Unión Y, estabiliza el DNA de cadena
sencilla)
•Topoisomerasas tipo I (rotura una cadena)
y II (rotura de dos cadenas) junto a DNA
ligasa -> Relajación del superenrollamiento
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 50


material genético
50
El replisoma: una maquinaria de replicación extraordinaria

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 51


material genético
51
El replisoma: una maquinaria de replicación extraordinaria

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 52


material genético
52
El replisoma: una maquinaria de replicación extraordinaria

DNA pol III + abrazadera beta -> Enzima procesiva

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 53


material genético
53
El replisoma: una maquinaria de replicación extraordinaria

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 54


material genético
54
Topoisomerasas

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 55


material genético
55
Replicación del DNA (4)
•Origen de replicación:
•Secuencia reconocida (Ori C en E. coli) por
proteínas iniciadoras. Varios orígenes en
eucariotas
•La replicación es bidireccional

Horquilla
replicación

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 56


material genético
56
En el DNA nuclear de eucariotas hay muchos orígenes de
replicación (~500 en levaduras y 60000 en mamíferos). Cada
unidad de replicación es un replicón. La replicación es
bidireccional

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 57


material genético
57
En el DNA nuclear de eucariotas hay muchos orígenes de
replicación (~500 en levaduras y 60000 en mamíferos). Cada
unidad de replicación es un replicón. La replicación es
bidireccional

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 58


material genético
58
Links de interés
Watson-Crick original paper (1953 Nature)
Trabajos estelares del descubrimiento de la doble
hélice
DNA: el secreto de la vida (Animación)
Celebración 50 aniversario descubrimiento de la dobl
e hélice en la UAB
DNA Structure
The Search for DNA - The Birth of Molecular
Biology
Image Library of Biological Macromolecules - DNA
DNA berkeley
DNA Learning Center
Beginner's guide to Molecular Biology
Glosario de Genética molecular
DNA Replication
Animación de la replicación
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 6: Estructura y replicación del 59


material genético
59

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