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ENZIMAS

CONCEPTO DE ENZIMA

 Los enzimas son catalizadores muy potentes y


eficaces, químicamente son proteínas. Como
catalizadores, los enzimas actúan en pequeña
cantidad y se recuperan indefinidamente.
 No llevan a cabo reacciones que sean
energéticamente desfavorables, no modifican el
sentido de los equilibrios químicos, sino que
aceleran su consecución.
Las enzimas son proteínas

 Catalizan reacciones químicas necesarias para la


sobrevivencia celular
 Sin las enzimas los procesos biológicos serían tan
lentos que las células no podrían existir.
 Las enzimas pueden actuar dentro de la célula ,
fuera de ésta, y en el tubo de ensayo.

E + S ESEP  E + P

E E E E
La enzima disminuye la energía
de activación
Sin enzima
Con enzima

• La Ea de la hidrólisis de la urea
baja de 30 a 11 kcal/mol con la
E+S acción de las enzimas, acelerando
la reacción 1014 x
• El aumento de temperatura
necesario para producir la reacción
E+P
no catalizada seria de 529ºC
Tiempo de la reacción
Enzima - Catalizador

 Tanto la enzima como el catalizador aceleran la


velocidad de una reacción química.
 Una enzima puede transformar 1000 moléculas
de sustrato/ segundo
 Las enzimas tienen 3 propiedades que los
catalizadores NO tienen
 Especificidad por el sustrato
 Se inactivan por desnaturación
 Pueden ser reguladas
ASPECTOS GENERALES SOBRE LOS ENZIMAS

Prácticamente todas las reacciones químicas que tienen lugar en los


seres vivos están catalizadas por enzimas. Los enzimas son
catalizadores específicos: cada enzima cataliza un solo tipo de reacción,
y casi siempre actúa sobre un único sustrato o sobre un grupo muy
reducido de ellos. En una reacción catalizada por un enzima:
 La sustancia sobre la que actúa el enzima se llama sustrato.
 El sustrato se une a una región concreta del enzima, llamada centro
activo o sitio activo. El sitio activo comprende (1) un sitio de unión
formado por los aminoácidos que están en contacto directo con el
sustrato y (2) un sitio catalítico, formado por los aminoácidos
directamente implicados en el mecanismo de la reacción

 Una vez formados los productos el enzima puede comenzar un nuevo


ciclo de reacción
 Las enzimas se unen a los reactivos
(sustratos) reduciendo la energía de
activación

 Cada enzima tiene una forma única con


un sitio o centro activo en el que se une
al sustrato

 Después de la reacción, enzimas y


productos se separan.

 Las moléculas enzimáticas no han


cambiado después de participar en la
reacción
Las enzimas cumplen su papel catalítico gracias a:
• Fijación estereoquímicamente complementaria
del substrato
• Transformación catalítica del mismo

En ambas funciones participan:

• Cadenas laterales de los aminoácidos


• Grupos o moléculas no proteicas:
 Grupos prostéticos
 Iones metálicos
 Cofactores
Los siguientes hechos:
 Especificidad de la reacción enzimática
 Carácter heterogéneo de la catálisis enzimática

Nos llevan a postular la existencia de un Centro Activo en la


molécula de enzima, capaz de:

 Fijar específicamente al substrato


 Transformarlo catalíticamente.
Enzima

Sustrato

Sitio activo
La unión del sustrato es muy
específica
 Complementariedad geométrica

 Complementariedad de cargas,
uniones iónicas
 Modelos:
 Encaje inducido
 Llave – cerradura.
 Estado de transición
Teorías de la acción enzimática, 1
Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer)
Substrato y enzima se acoplan de forma
estereospecífica,
de la misma manera que una llave se ajusta a su
cerradura.

Modelo aceptado durante mucho tiempo; hoy se


considera insuficiente al no explicar algunos
fenómenos de la inhibición enzimática
Teorías de la acción enzimática, 2
Modelo de Ajuste Inducido (Koshland)

Tanto la enzima como el substrato sufren


una alteración en su estructura por el
hecho físico de la unión.

Está mucho más de acuerdo con todos


los datos experimentales conocidos hasta
el momento.
Teorías de la acción enzimática, 3
Estabilización del Estado de Transición

La teoría del Ajuste Inducido se amplía en la actualidad

Según lo cual, el Centro Activo enzimático es en realidad


complementario no al substrato o al producto, sino al
estado de transición entre ambos.
Una enzima puede unir dos
sustratos en su sitio activo
Clasificación y nomenclatura
Nombre sistemático:
Grupo transferido

ATP: hexosa fosfotransferasa


Donador Aceptor Tipo de reacción catalizada

Grupos químicos
Número Enzyme Commission:

Enzyme
Comission
EC 2.7.1.1 Enzimas

Grupo Subgrupo

Nombre común (sustrato+”asa”): Hexokinasa


NOMENCLATURA DE LOS ENZIMAS
 Hay varias formas mediante las cuales se
asigna un nombre a un enzima:
 nombres particulares
 nombre sistemático
 código de la comisión enzimática (enzyme
comission)
NOMBRE SISTEMÁTICO
 El nombre sistemático de un enzima consta actualmente de 3 partes:
 el sustrato preferente
 el tipo de reacción realizado
 terminación "asa"
 Un ejemplo sería la glucosa fosfato isomerasa que cataliza la isomerización
de la glucosa-6-fosfato en fructosa-6-fosfato.
 Muchos enzimas catalizan reacciones reversibles. No hay una manera única
para fijar cual de los dos sentidos se utiliza para nombrar al enzima. Así, la
glucosa fosfato isomerasa también podría llamarse fructosa fosfato
isomerasa.
NOMBRES PARTICULARES

 Antiguamente, los enzimas recibían nombres


particulares, asignados por su descubridor. Al ir
aumentando el número de enzimas conocidos,
se hizo necesaria una nomenclatura sistemática
que informara sobre la acción específica de cada
enzima y los sustratos sobre los que actuaba.
NOMENCLATURA DE LA COMISIÓN ENZIMÁTICA
 El nombre de cada enzima puede ser identificado por un
código numérico, encabezado por las letras EC (enzyme
commission), seguidas de cuatro números separados por
puntos. El primer número indica a cual de las seis clases
pertenece la enzima, el segundo se refiere a distintas
subclases dentro de cada grupo, el tercero y el cuarto se
refieren a los grupos químicos específicos que intervienen en
la reacción. .Así, la ATP: glucosa fosfotransferasa
(glucoquinasa) se define como EC 2.7.1.2. El número 2 indica
que es una transferasa, el 7 que es una fosfotransferasa, el 1
indica que el aceptor es un grupo OH, y el último 2 indica que
es un OH de la D-glucosa el que acepta el grupo fosfato.
CLASIFICACIÓN DE LOS ENZIMAS

 En función de su acción catalítica específica, los


enzimas se clasifican en 6 grandes grupos o
clases:
 Clase 1: OXIDORREDUCTASAS
 Clase 2: TRANSFERASAS
 Clase 3: HIDROLASAS
 Clase 4: LIASAS
 Clase 5: ISOMERASAS
 Clase 6: LIGASAS
Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Catalizan reacciones de oxidorreducción, en que átomos de oxigeno ó hidrogeno son
trasladados entre moléculas:

Ared + Box Aox + Bred

AH2 + B A + BH2

En las reacciones redox, siempre tienen que estar presentes a la vez el aceptor y
el dador electrónico.
Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas

Nombre: Dador:Aceptor oxidorreductasa

b-D-Glucosa : O2 1-oxidorreductasa EC 1.1.3.4


Dador Aceptor

Nombre común:
Glucosa oxidasa
Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Nomenclatura del subgrupo en oxidorreductasas:
EC 1.1.x - Deshidrogenasas
EC 1.2.x - Oxidasas
EC 1.3.x - Peroxidasas
EC 1.4.x - Oxigenasas
EC 1.5.x - Hidroxilasas
EC 1.6.x - Reductasas
etc.

Aplicaciones: Ensayos de diagnostico clínico (glucosa oxidasa y colesterol oxidasa


Deslignificación ó Bioblanqueamiento
Clasificación y nomenclatura
Grupo 2: Transferasas
Catalizan reacciones de transferencia de átomos ó grupo de átomos
entre moléculas:

A-X + B A + B-X

Dador: Aceptor Grupo transferido - transferasa

ATP: D-Hexosa Fosfotransferasa EC 2.7.1.1


Nombre común: hexokinasa
Clasificación y nomenclatura
Grupo 2: Transferasas
Clasificación de subgrupo de las transferasas:
EC 2.1.x - Grupos monocarbonados
EC 2.2.x - Grupos aldehido o ceto
EC 2.3.x - Aciltransferasas
EC 2.4.x - Glicosiltransferasas
EC 2.5.x - Alquil- o Ariltransferasas
EC 2.6.x - Grupos nitrogenados
EC 2.7.x - Grupos fosfato
EC 2.8.x - Grupos sulfato
EC 2.9.x - Grupos selenio

Aplicaciones: Síntesis de oligosacáridos


Clasificación y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Catalizan reacciones de hidrólisis y también su reverso. Son las más comunes en
el dominio de la tecnología enzimática:

A-B + H2O A-OH + H-B


No se suelen utilizar nombres sistemáticos en las
hidrolasas. Muchas de ellas conservan el nombre
Primitivo. Ejemplo: Quimosina EC 3.4.23.4.
Clasificación y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Clasificación de las hidrolasas:
3.1.-.- Esterasas (carboxilesterasas, fosfoesterasas, sulfoesterasas)
3.2.-.- Glicosidasas
3.3.-.- Éter hidrolasas
3.4.-.- Péptido hidrolasas
3.5.-.- Acil anhídrido hidrolasas
etc.

Aplicaciones: Lipasas → Síntesis de tensioactivos


Proteasas → Fabrico de quesos
Glicosidasas → Clarificación de jugos; liberación de aromas en los
vinos; aplicaciones textiles
Clasificación y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Caso particular  Péptido hidrolasas: clasificación común (no
sistemática)

I. Según la situación del enlace atacado:


- Exopeptidasas (extremos de la cadena) (Peptidasas)
- Endopeptidasas (interior de la cadena) (Proteinasas)
II. Según el mecanismo catalítico:
- Serin proteinasas
- Tiol proteinasas
- Aspartil proteinasas
- Metaloproteinasas
Clasificación y nomenclatura
Grupo 4: Liasas
Catalizan reacciones reversibles de remoción de grupo de átomos del sustrato
(este grupo no incluye las hidrolasas):

A-B A+B
Ejemplo
Nombre sistemático:
Histidina amonio-liasa (EC 4.3.1.3)

Nombre común:
Histidasa
Clasificación y nomenclatura
Grupo 4: Liasas
Clasificación de las liasas:
4.1.x - Actúan sobre enlaces C-C
4.2.x - Actúan sobre enlaces C-O
4.3.x - Actúan sobre enlaces C-N
4.4.x - Actúan sobre enlaces C-S
4.5.x - Actúan sobre enlaces C-Haluro (S-, Cl-, Br-, I- At-)
4.6.x - Actúan sobre enlaces P-O
4.99.x - Otras liases

Aplicaciones: Pectato liasa – Remueve los compuestos indeseables (ceras,


pectinas, proteínas) en fibras en la industria textil – “bioscouring”
Clasificación y nomenclatura
Grupo 5: Isomerasas
Catalizan reacciones de isomerización moleculares

A B
Ejemplo:
Glucosa isomerasa (EC 5.3.1.5)
Clasificación y nomenclatura
Grupo 5: Isomerasas
Clasificación de las isomerasas:

5.1.x - Rasemasas y Epimerasas


5.2.x - cis-Trans-Isomerasas
5.3.x - Oxidoreductasas Intramolecular
5.4.x - Transferasas Intramoleculares (mutases)
5.5.x - Liasas Intramoleculares
5.99.x - Otras Isomerasas
Clasificación y nomenclatura
Grupo 6: Ligasas
Catalizan la unión de dos grupos químicos a expensas
de la hidrólisis de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc.).

A + B + ATP A-B + ADP + Pi


Ejemplo: Glutationa sintasa (EC 6.2.2.3)

Nombre sistémico:
G-L-glutamilo-L-cisteina:glicina ligase
Clasificación y nomenclatura
Grupo 6: Ligasas
Clasificación de las ligasas:

6.1.x - Forman enlaces C-O


6.2.x - Forman enlaces C-S
6.3.x - Forman enlaces C-N
6.4.x - Forman enlaces C-C
6.5.x - Forman enlaces ésteres fosfóricos
6.6.x - Actúan sobre enlaces N-metal
Cinética Enzimática
Cinética Enzimática
 La cinética enzimática es el análisis cuantitativo del efecto de cada uno de los
factores que intervienen en la actividad enzimática, que se evalúa a través de la
velocidad de la reacción catalizada.
 Las variables más importantes son:
• Concentración de enzima, sustratos y productos (incluyendo
inhibidores y/o activadores)
• pH
• Temperatura
Baja
concentración
de sustrato

ALTA
concentración
de sustrato
SATURACION
. . .
Efecto de la concentración de substrato

v
. .
.
.
.
[s]
Efecto del pH en la ENZIMA

Cada enzima tiene un pH óptimo para su actividad


El pH afecta las interacciones iónicas
Efecto de la temperatura en la ENZIMA

Desnaturación
Aumento de la por calor
velocidad

15º 40º 75º


Temperatura

Cada enzima tiene una temperatura óptima.


Coenzimas
 Las coenzimas son pequeñas moléculas
orgánicas, que se unen a la enzima.
 Las coenzimas colaboran en la reacción
enzimática recibiendo transitoriamente algún
grupo químico: H+ , OH, CH3 .
El NAD es una coenzima aceptora de H

Sustrato
oxidado
Algunas enzimas requieren metales para mejorar su
actividad
Inhibición enzimática
Inhibidor:
Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de
interacciones con el centro activo u otros centros específicos
(alostéricos).

Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a


la enzima a través de desnaturalización de la molécula enzimática

De esta forma, habrá dos tipos de inhibidores:

I. Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo

II. Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la


molécula, causando un cambio conformacional con
repercusión negativa en la actividad enzimática.
Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos:

1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre,


con el complejo enzima-substrato o con ambos:

E+I EI

ES + I ESI

2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima:

E+I E’
Inhibición reversible

(a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre,


impidiendo la fijación del substrato: Inhibición Competitiva

(b) El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo


haga o no el substrato; el inhibidor, por tanto, no impide la
fijación del substrato a la enzima, pero sí impide la acción
catalítica: Inhibición No Competitiva

(c) El inhibidor se fija únicamente al complejo enzima-substrato


una vez formado, impidiendo la acción catalítica; este tipo
se conoce como Inhibición Anticompetitiva
Inhibidores Competitivos
 Compiten con el sustrato por el sitio activo de
la enzima
 Se une solo a la enzima libre
 V máx no se altera y K M cambia
Inhibición competitiva

Al aumentar la cantidad de
SUSTRATO el inhibidor
competitivo es desplazado y se
forma producto
Inhibición No Competitiva
Inhibidor No Competitivo
 Se une a un lugar diferente del sitio activo la
enzima
 Se une a la enzima libre y también al
complejo enzima-sustrato
 Por acción del inhibidor disminuye la Vm pero
el valor de Km no se altera
Inhibición NO competitiva
Inhibidor NO competitivo
El inhibidor NO competitivo se une a la enzima en un sitio diferente del sitio
activo
Inhibidor Incompetitivo
En este tipo de inhibición el inhibidor se enlaza al centro activo
pero solo después de que el sustrato lo haya hecho y, por tanto,
inhibidor y sustrato no compiten. De esta manera, aunque todo el
sustrato esté saturando la enzima y toda la enzima esté como
complejo ES, el inhibidor puede enlazarse produciendo un
complejo inactivo ESI.

Como I solo se une a ES estimula la formación de ES y, por tanto,


incrementa la unión del sustrato a la enzima, disminuyendo Km .
Sin embargo, el complejo ESI no conduce a productos y Vm
disminuye.
Inhibidor Incompetitivo
 Se une a un lugar diferente del sitio activo de
la enzima
 Se une sólo al complejo enzima-sustrato
 Los efectos que tiene: disminuye el valor de
Km y también el de Vmáx
S
E ES E+P
I
Inhibición
Anticompetitiva

ESI

El inhibidor sólo puede fijarse al complejo ES;


el complejo ESI no es productivo
Inhibidores Irreversibles
 Producen inactivación permanente de la
actividad enzimática
 Se interfiere con el normal desarrollo de una
reacción o vía metabólica
 Ejemplos: p-cloromercuribenzoato,
yodoacetato, diisopropilfluorfosfato
Algunos tipos de inhibidores irreversibles

1. Reactivos de grupos -SH

2. Organofosfóricos

3. Ligandos de metales

4. Metales pesados
RESUMEN
 Las enzimas son proteínas que catalizan las
reacciones biológicas
 Presentan especificidad por su sustrato
 Cada enzima presenta dos parámetros
importantes Vmax (saturación de la enzima) y
la Km (medida de la afinidad por el sustrato)
RESUMEN
 La actividad enzimática puede ser inhibida,
por inhibidores competitivos (similares al
sustrato) o por inhibidores no competitivos.
 La temperatura y el pH afectan a la enzima en
su actividad catalítica.
 Algunas enzimas requieren de coenzimas y/o
cofactores para su actividad.

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