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Ribonucleótidos

Dr. Humberto R. Medina


Síntesis de ribonucleótidos pirimidínicos

Tiamina
Base nitrogenada Pirimidina Citocina
Uracilo

Para entender esta biosíntesis se realizaron experimentos de


marcaje isotópico.

N1, C4, C5 y C6 = ácido aspártico, C2 = HCO3, N3 = glutamina.


Síntesis de novo ribonucleótidos pirimidínicos

Pirimidina ácido orotico, un sustituto de citocina y


uracilo en mutantes de Neurospora crassa efectados en
la síntesis de pirimididas.
Síntesis de ribonucleótidos pirimidínicos

Síntesis de Uridina Mono fosfato (UMP)


1. Síntesis de carbamoil fosfato

Esta reacción consume


dos moléculas de ATP,
una proporciona un
grupo fosfato y la otra
energía para la
reacción.
CPS I es una enzima mitocondrial que sintetiza el carbamoil fosfato CPS II es una enzima
para la síntesis de arginina. En procarioontes tienen una enzima citosolica.
para ambas vias.
Mecanismo de la CPS II
Síntesis de ribonucleótidos pirimidínicos

2. Síntesis de carbamoil aspartato


Síntesis de UMP

Esta reacción es el paso generador


de flujo de la vía, ocurre sin
necesidad de ATP, porque el
carbamoil fosfato se encuentra
activado intrínsecamente.
Síntesis de ribonucleótidos pirimidínicos

Síntesis de UMP
3. Cierre del anillo para formar dihidroorato

Es una reacción de condensación


intramolecular

Mutantes afectados en la síntesis de pirimidinas


convierten ácido orotico en dihidroorotato (A. Kornberg, ).
Síntesis de ribonucleótidos pirimidínicos
4. Oxidación del dihidroorotato Síntesis de UMP
Es una reacción irreversible.

En eucariontes, la enzima contiene a


FMN y Fe sin grupo hemo y se asocia
a la membrana mitocondrial interna.

En procariontes, muchas
dihidroorotato deshidrogenasas son
flavoproteinas dependientes de
NAD, que contienen FMN, FAD y Fe,
sin grupo hemo. Esta enzimas
funcionan de orotato a
dihidroorotato.
Síntesis de ribonucleótidos pirimidínicos

5. Adquisición del grupo ribosa fosfato Síntesis de UMP

Esta reacción fija la forma anomérica de


los nucleótidos pirimidínicos en la
configuración β.
Síntesis de ribonucleótidos pirimidínicos
6. Descarboxilación para formar UMP Síntesis de UMP

Es una reacción que no requiere


cofactores
Síntesis de ribonucleótidos pirimidínicos
Síntesis de UTP y
CTP

La síntesis de UTP a partir de UMP


es análoga a la síntesis de
nucleótidos purínicos trifosfatos.
Nucleosido monofosfato quinasa.

El CTP se forma por aminación del UTP.


CTP sintasa. En animales, el grupo amino
proviene de la glutamina y en bacterias,
proviene del amoníaco.
Formación de desoxirribonucleótidos

El DNA difiere químicamente del RNA en dos aspectos principales:


.

1) 2’- desoxirribosa en
lugar de ribosa

2) Contiene la base timina


(5-metiluracilo) en lugar
de uracilo
Formación de desoxirribonucleótidos

Producción de restos de desoxirribosa


Las enzimas que catalizan la formación de desoxirribonucleotidos, se denominan
ribonucleotido reductasas. Se conocen tres tipos de esta enzima:

1. Enzimas que contienen Fe (III), sin


grupo hemo, en sus sitios activos.

2. Enzimas que utilizan un cofactor 5’-


desociadenosilcobalamina.

3. Enzimas dependientes de Mn.

Los tipos 1 y 2 se encuentran mayoritariamente en


procariontes y 1 se encuentra en eucariontes,
principalmente.
Ribonucleotido reductasa de tipo 2 de Escherichia coli.
Formación de desoxirribonucleótidos
Producción de restos de desoxirribosa

Enzima sustituye el
grupo 2’-OH de la ribosa
por H mediante
mecanismo de radical
libre.

La fuente inmediata de
reducción es un par de
grupos sulfihidrilo de la
enzima.

Mecanismo enzimático de la ribonucleótido reductasa


Formación de desoxirribonucleótidos

Síntesis de timina

El dMTP se sintetiza a partir


de dUMP mediante la
timidilato sintetasa.
Formación de desoxirribonucleótidos
Metabolismo de desoxirribonucleotidos en ratas.

Citidina marcada con C14 tanto en la base como en la ribosa.

Misma proporción de citosina y desoxirribosa; los componente spermanecen


unidos.

Experimentos de I. Rose,

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