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Capítulo 6
BJ Smith
Instituto de Investigación del Cáncer, Chester Beatiy
Laboratorios, Royal Cancer Hospital,
Fulham Road, Londres, Estados Unidos
Reino
Introducción
41
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42 Herrero
Los
siguientes iones más grandes se en zonas estrechas en el
concentran en el gel de apilamiento, pero no se separan allí de manera efectiva.
Cuando las zonas en movimiento alcanzan el gel de separación, sus respectivas
movilidades cambian en el pH que prevalece allí y el frente del ion glimato alcanza
las zonas del complejo proteínaSDS para dejarlas en un campo eléctrico
uniformemente amortiguado para separarse entre sí según el tamaño y cargar.
Materiales
Geles SDS 43
44 Herrero
Acrilamida 73
ser acrílico gramos 2 8
registro
droll
Disuelva lo anterior en menos de 250 ml de agua, ajuste el pH a 8,8 con HCl y lleve el
volumen a 250 ml. Esta solución madre
es estable durante meses a 4°C.
Registro
de SDS
Tampón “Trrs” 15 1 g
28 8 gramos
glucemia
Búfer “trrs” 6,0 gramos
Geles SDS 45
0 92
Pmercaptoetanol gramos 2 ml
Tampón
Jog
de glicerol “7 rls”
03i3
bromofenol Azul 2 ml
(0 1% p/v solución en agua)
Metanol 100 ml
Ácido acético glacial 100 mL
Agua 800ml
Método
1 Limpie y seque a fondo las placas de vidrio y los tres espaciadores, luego
móntelos como se muestra en la Fig. 1, con los espaciadores colocados a 12
mm de los bordes del vidrio.
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46 Herrero
platos. Sujete la construcción con clips bulldog. Luego se aplica vaselina blanca
(derretida en un baño de agua hirviendo) alrededor de los bordes de los
espaciadores para mantenerlos en su lugar y sellar la cámara. Sujete la cámara en
una posición vertical y nivelada para separar la mezcla de gel (por ejemplo, 30 ml
para una cámara de aproximadamente 14 X 14 X 0,1
2. Un volumen suficiente cm) y se prepara de la siguiente manera.
Mezcla lo siguiente:
N, N, N', N'tetrametil
etilendiamo (TEMADO) 15PL
3. Pipetee o vierta con cuidado la solución recién mezclada en la cámara sin generar
burbujas de aire. Vierta hasta un nivel de aproximadamente 1 cm por debajo de
donde quedará la parte inferior del peine bien formado cuando esté en su posición.
Cubra
con cuidado la solución de acrilamlde con butan201 sin mezclar (para eliminar
el oxígeno y generar una parte superior plana para el gel). Dejar la mezcla hasta
que cuaje (0,51,5 l4.
Geles SDS 47
48 Herrero
en un pozo de muestra a través del buffer del depósito. La cantidad de muestra cargada
depende del método de detección (ver más abajo). Habiendo cargado todas las muestras sin
demora, inicie la electroforesis encendiendo la alimentación (CC). En un gel de
El
frente del tinte azul de bromofenol tarda aproximadamente 3 h en llegar al fondo del gel. Un
voltaje mayor acelera los electroforesis, pero genera más calor en el gel.
8. Al final de la electroforesis (por ejemplo, cuando el frente del tinte llega al fondo del gel), las
bandas proteicas del gel se pueden visualizar mediante tinción. Retire el gel de entre las
placas de vidrio y sumérjalo en la mancha de proteína inmediatamente (aunque un retraso
de aproximadamente una hora no es notablemente perjudicial para un gel de 15% T). El
gel se deja allí con agitación suave hasta que el tinte haya penetrado en el gel
(aproximadamente 1,5 h para geles al 15% T de 0,5 l mm de espesor). El tinte que no está
unido a proteínas se elimina transfiriendo el gel a una solución decolorante.
Notas
el sulfuro intramolecular para garantizar la máxima reacción con SDS. El glicerol está
presente para aumentar la densidad de la muestra y ayudar encautiverio
la carga. del mismo sobre
el gel. El colorante azul de bromofenol también ayuda a cargar la muestra, haciéndola
visible, y marca la posición del frente de electroforesis en el gel. El tinte también indica
cuándo la solución de muestra está acldlc girando 2 La polimerización
amarillo.
de acrilamlda y blsacrilamida ES
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Geles SDS 49
4. Dado que las proteínas (o más bien, sus complejos con SDS) se resuelven en gran
medida sobre la base de diferencias en sus tamaños, la movilidad electroforética
en geles de SDS puede usarse para estimar el peso molecular de una proteína
comparándola con proteínas de tamaño conocido. [como se describe en (I)]. Sin
embargo, debe recordarse que algunas proteínas tienen propiedades anómalas
de unión a SDS y, por tanto, movilidades anómalas en geles de SDS.
a C
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Geles SDS 51
tabla 1
Algunos problemas que pueden surgir durante la preparación y uso de
Geles SDS
Farlure o una tasa (a) Hay oxígeno presente (a) Desgasificar las
(1)
reducida de (b)
polimerización Las soluciones madre soluciones (b) Renovar las
en gel soluciones madre
(especialmente
acrilamina y persulfato) están envejecidas
poliacrilamida.
(3 Tinción
(continúa)
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52 Herrero
Cuadro 1 (confznuado)
(4 Bandas manchadas debido a que (c) El tinte se ha decoloración (c) Vuelva a teñir el
gel. Reduzca
decolorado y se ha eliminado de la proteína
el tiempo de
decoloración o utilice un
tinte que estampe
las proteínas de forma indeleble, por ejem
Proción Marina
MXRB (ver
Capítulo 14) (d)
(4 El gel está marcado (d) El tinte sólido está presente Asegúrese de que el tinte esté
tiñe de manera en la solución que completamente
no específica mediante la tinción. disuelto o filtre la
solución antes de usarla.
1t
limpiar o renovar
(4 Los contaminantes son (a) El aparato y/o las soluciones (4 CL
(continuado)
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Geles SDS 53
Tabla 1 (continuación)
Falla Causa Recurso
(vi) Las bandas protem no (a) Electroforesis insuficiente (a) Prolongar la carrera
están
suficientemente resueltas
electroforéticos de
las proteínas estándar.
(viii) Bandas de de
distorsión
(4
Las bandas se (a) Las proteínas de la (a) Utilice disolvente de
han manchado muestra son muestra nuevo y/o
o rayado. msolubles o SDS adicional y
permanecen agente reductor
agregadas en el (especialmente
disolvente de para soluciones de
la muestra. muestra concentradas)
Hay materia más Filtre las soluciones madre
soluble o una burbuja antes de usarlas y
en el gel que ha elimine las burbujas
interferido con de las mezclas
la migración de gel.
de las bandas
de proteínas.
(continúa)
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Herrero
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Tabla 1 (continuación)
están en su lugar
movimientos
relativos de las
bandas, de modo
que no interfieran entre
sí.
(contwzu)
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Tabla 1 (continuación)
pocillos (el
“efecto del pozo
final”)
Las bandas no tienen (c) La muestra se cargó (c) Compruebe que los
(4
un tono uniforme. de manera fondos de los pocillos
ness desigual de muestra sean
rectos y
horizontales [ver (m)]
Referencias
1 Deyl, Z (1979) EZectrophoreszs A Survey of fechnques and applzcanons Part A*
Techntques Elesevrer, Amsterdam 2 Laemmh, Reino Unido (1970)
Cleavage of estructural proteínas durante el ensamblaje de la cabeza del bacteriófago
T4 Nature 227, 680685