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ESCUELA DE BIOLOGÍA
ZOOLOGÍA DE INVERTEBRADOS I
Segundo semestre 2021
Objetivos de aprendizaje
Índice
Semana 1 - Introducción a la
sistemática - I parte
Antes de comenzar con detalles sobre la sistemática necesitamos definirla. Así que,
es el estudio de la diversidad de los organismos y de las relaciones entre ellos.
Además, esta disciplina incluye el estudio de la clasificación o taxonomía, y el estudio
de las relaciones entre las especies o análisis filogenético (Eliosa y Navarro, 2005).
Estas tres definiciones son básicas para introducirse en el mundo de la sistemática.
A lo largo de la historia han surgido tres escuelas con concepciones diferentes para
realizar las clasificaciones. Éstas son la sistemática evolutiva, la fenética, y la
cladística o filogenética. En la actualidad, las primeras dos han perdido fuerza porque
investigaciones y datos recientes han refutado sus propuestas de clasificación. Por lo
tanto, la que se encuentra vigente es la filogenética y será de la que profundizaremos
en esta introducción a la sistemática. Pero antes presentaremos de una forma breve
un resumen de cada escuela:
Sistemática evolutiva
Fue desarrollada por Simpson en 1961 y Mayr en 1969. Esta se enfoca en que
la genealogía como tal no es suficiente para crear una clasificación. La
sistemática necesita incluir información sobre ancestros, procesos y grados de
diferencias evolutivas. Sin embargo, esto llevó a obtener información
imprecisa, autoritaria e incapaz de articular un criterio específico (Wheeler,
2012). La forma de hacer sistemática en esta escuela es por medio de la
importancia que da el investigador a los caracteres para medir las relaciones
evolutivas entre los organismos. Debido a esto, las clasificaciones son
artificiales y filogenéticamente incorrectas. Lo que para un investigador es
importante para otro puede no serlo; además, la subjetividad no nos dice si las
características evaluadas tienen un significado evolutivo, lo que lleva a una
clasificación no natural.
Sistemática fenética
En esta escuela se hace un esfuerzo en diseñar un método empírico para
determinar las relaciones taxonómicas. En la práctica, los fenetistas no son
mejores que los sistemáticos tradicionales en determinar las relaciones
evolutivas, debido a que ellos están concentrados en reflejar la similitud total
de los organismos de interés. Debido a que pueden existir grupos que son
similares por eventos de convergencia o paralelismos, y no estar
emparentados evolutivamente, lo que también lleva a una clasificación
artificial.
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La sistemática filogenética es una escuela con uno de los métodos más usados en la
actualidad. Los sistemáticos tratan de construir clasificaciones naturales de los
organismos y describir patrones históricos que exhiban descendencia con
modificación. Para ello, utilizan caracteres derivados. La cladística busca establecer
las relaciones de parentesco entre las especies, bajo el supuesto de que
determinadas similitudes reflejan el parentesco entre ellas. El resultado de la
aplicación de este método es un cladograma o árbol filogenético que muestra la
historia evolutiva del grupo de interés (Eliosa y Navarro, 2006, p2).
La cladística tiene implicaciones más allá del campo de la taxonomía. Otras disciplinas
que trabajan con enfoque cladista son la biogeografía, la ecología, la evolución, la
etología y la conservación. Aunque las relaciones cladísticas son las únicas
consideradas por los sistemáticos filogenéticos o cladistas para establecer
clasificaciones los sistemáticos evolutivos combinan las relaciones fenéticas. Sin
embargo, el concepto de relación cladística es relativo ya que debemos ejecutar
comparaciones. Por ejemplo, decimos que un taxón B está más cercanamente
relacionado con un taxón C que con el tercer taxón A, lo cual se expresa en notación
parentética como (A, (B, C)) (Morrone, 2001, 25-27).
Tipos de árboles
Todos los análisis derivados de los estudios sistemáticos se representan en árboles
(Figura 2). No todos son iguales porque existen diferentes representaciones gráficas y
cada una logra incorporar alguna característica de la evolución del grupo. Los árboles
más básicos son los cladogramas que exhiben las relaciones en término de los
ancestros en común más recientes. Los árboles aditivos, métricos o filogramas
contienen más información que se representa en la longitud de las ramas. Los
números que se asocian a cada rama corresponden a algún atributo en la secuencia,
por ejemplo, la cantidad de cambio evolutivo que los organismos han experimentado.
Por último, los árboles ultramétricos o dendogramas son un caso particular de
árboles aditivos en donde las puntas del árbol son equidistantes de la raíz, así que
proporcionan información del tiempo. En resumen, el árbol a utilizar dependerá de los
criterios que establezca el investigador.
Caracteres
Un carácter es cualquier atributo morfológico, molecular, etológico, ecológico,
biogeográfico, etc., cuyas manifestaciones se denominan estados. Por ejemplo, para
el carácter número de manchas los estados podrían ser dos manchas, cuatro
manchas y seis manchas. Además, para referirse a los estados de un carácter se
utilizan los siguientes términos (Nelson y Platnick, 1981):
Estos términos son relativos porque cuando un estado surge en una especie es una
autapomorfía (Figura 3a), pero si luego se produce un evento de especiación se
convierte en una sinapomorfía (Figura 3b), y si más tarde, con otro evento de
especiación, cambia a otro estado u otra autapomorfía, el estado original de todo el
grupo pasa a ser plesiomórfico (Figura 3c).
Tipos de linajes
Al generar un árbol pueden surgir tres tipos de clados (Figura 4):
Material complementario
Lectura del capítulo 2 del libro de texto con el tema "Systematics, Phylogeny, and
Classification" pg. 35 a 52
Bibliografía
Eliosa, H. y Navarro, M. (2006). La sistemática en México: elementos, 57 (12): 13-19.
Morrone, J. (2001). Sistemática, biogeografía y evolución. México: Las prensas de
Ciencias
Nelson, G. y Platnick, N. (1981) Systematics and Biogeography. Harcourt, Brace and
World.
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Semana 1 - Actividades
a. Glosario ilustrado
A partir de 30 tarjetas de memoria repasa y memoriza los conceptos básicos de la
sistemática biológica, y de la construcción de filogenias y clasificaciones. Para llevarlo
a cabo sigue estos pasos:
b. Resolución de ejercicios
Ejercicio 1
ABCDE
BCDE
BCD
FGHI
CHI
Ejercicio 2
BD
BCD
HGF
BG
EFGH
EFG
Ejercicio 3
Ejercicio 4
Ejercicio 5
Cuadro 1. Ejemplo 1.
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Pulmones 0 + + + 0
Mandíbulas 0 + + + +
Plumas 0 0 + 0 0
Molleja 0 0 + + 0
Pelo 0 + 0 0 0
Cuadro 2. Ejemplo 2.
Especies/caracteres 1 2 3 4 5
A 0 + + + 0
B 0 + + + +
C 0 0 + 0 0
D 0 0 + + 0
E 0 + 0 0 0
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c. Instalar programa
Instala en tu computadora el programa Mr. Bayes que utilizarás para la próxima
semana. El enlace está disponible en la biblioteca del moodle.
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Evaluación
Del glosario que elaboraste serán seleccionadas 2 definiciones al azar y deben
cumplir con los siguientes criterios:
Semana 2 - Introducción a la
sistemática - II parte
Continuamos con el tema de sistemática.
Máxima parsimonia
Es cuando se considera que la mejor hipótesis es aquella que requiere la menor
cantidad de suposiciones.
Análisis bayesiano
Con este método se trata de determinar la probabilidad posterior dada una
probabilidad previa, una función de verosimilitud y ciertos datos para lo que se
utiliza el teorema de Bayes. Se utilizan procedimientos estocásticos para estimar
las probabilidades posteriores como, por ejemplo, las cadenas de Markov
Montecarlo (MCMC).
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Literatura citada
Baum, D., DeWitt, S y Donovan, S. (2005). The Tree-Thinking Challenge. Science 310,
979-980.
Semana 2 - Laboratorio 1
a. Análisis de filogenia
Instrucciones para realizar árboles filogenéticos en Mr. Bayes
execute primates.nex
Luego escribe
Con esto hacemos que Mr. Bayes elija el modelo GTR de sustitución
nucleotídica bajo una curva de distribución tipo gamma.
A continuación escribe
Al terminar escribe:
sump
Sumt
¡Fin!
b. Redacción de informe
El informe de laboratorio lo debes enviar como documento de Word que no pese más
de 8mb debe contar con las siguientes secciones, revisa la rúbrica en el Moodle.
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Más allá de las secciones del informe, lo que debes tener en mente para redactarlo es
lograr un texto coherente y cohesionado. La primera guarda relación con mantener
una relación lógica aceptable entre las ideas y ésta debe ser percibida por el receptor.
La segunda se refiere a la relación entre las oraciones, principalmente en un párrafo,
en donde al inicio debes incluir la idea principal, luego los argumentos y finalizas con la
conclusión. ¡Recuerda usar marcadores textuales para facilitar la lectura ya que
permiten combinaciones de ideas! La coherencia y la cohesión deben guiar tanto la
producción como la revisión del texto para su correcta formulación.
Portada
Introducción: debe ser breve, con sustento teórico referente al tema, con citas
bibliográficas en formato APA y finaliza con el objetivo del ejercicio.
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Discusión: resalta los logros y relaciónalos con los resultados de otros autores.
Intenta explicar el porqué de los resultados obtenidos, haz referencia a
investigaciones reportadas en artículos científicos o libros. En la discusión también
puedes incluir las ventajas y desventajas de la metodología utilizada y referenciar
los antecedentes si estos son comparables con otros autores.
Conclusión: está relacionada con el objetivo, responde a cada objetivo con una
conclusión.
Evaluación
Rúbrica de evaluación de informe
Portada. Con el Si No
formato solicitado.
2.5puntos 0 puntos
Índice automático, el Si No
que genera Word.
2.5puntos 0 puntos
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Conclusión: está Si No
relacionada con el
objetivo, es decir,
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responde a cada
objetivo con una 10puntos 0puntos
conclusión.
5puntos 0puntos