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Árbol filogenético de los seres vivos según análisis ribosómicos recientes. LUCA es la sigla en inglés
para Último antepasado común universal
La filogenética es una disciplina de la biología evolutiva que se ocupa de comprender las relaciones
históricas entre diferentes grupos de organismos a partir de la distribución en un árbol o
cladograma dicotómico de los caracteres derivados (sinapomorfías) de un antecesor común a dos
o más taxones que contiene aquellos caracteres plesiomórficos en común.
Esta necesidad de conocer la historia evolutiva de los seres organismos se inicia con la publicación
de El origen de las especies por Charles Darwin en 1859, aunque existen ideas previas que al
menos desde Aristóteles han intentado explicar la diversidad de las formas de vida y sus
relaciones. No obstante, explicar las relaciones históricas entre especies en función de la evolución
es una tarea interminable y provisoria tal como lo es el conocimiento científico, sujeto a marcos
teóricos y a coyunturas políticas. Uno de los hitos en relación con la justificación de estas
relaciones fueron las contribuciones de Willi Hennig (entomólogo alemán, 1913-1976), Walter
Zimmermann (botánico alemán, 1892-1980), Warren H. Wagner, Jr. (botánico estadounidense,
1920-2000) entre otros por la centralidad de sus aportes, tanto desde el punto de vista teórico
como metodológico.
Índice
1 Técnicas y uso
5 Véase también
6 Notas y referencias
7 Bibliografía
8 Enlaces externos
Técnicas y uso
Filogenética molecular: es la técnica de la filogenia que investiga las relaciones de los seres vivos
mediante análisis moleculares de la secuencia de ADN, ARN y proteínas. La filogenética molecular
es la técnica principal que usan los biólogos evolutivos para inferir las relaciones entre los seres
vivos y es la que se usa únicamente para resolver las relaciones entre los microorganismos. Las
similitudes en la secuencia de nucleótidos y aminoácidos se interpretan como sinapomorfías en el
análisis, no obstante las similitudes en la secuencia pueden ser variadas porque un organismo
puede presentar la misma secuencia con dos o más organismos estrechamente emparentados, lo
que lleva a que se sugieran dos o más relaciones alternativas. La filogenética molecular ha
ayudado establecer más clados evolutivos que la filogenética morfológica y ha corregido muchas
de sus interpretaciones erróneas. La filogenética molecular también puede verse sesgada por la
rápida mutación o evolución de algunos linajes, ya que pueden agruparse incorrectamente en el
árbol filogenético por el artefacto de atracción de ramas largas, cuando no se utilizan mejores
métodos o estrategias.
Filogenética morfológica: es la técnica de la filogenia que investiga las relaciones de los seres vivos
mediante análisis morfológicos como anatomía comparada, homología, embriología, alometría y
fósiles. Las similitudes morfológicas entre organismos pueden ser un indicativo de parentesco,
pero posteriormente se demostró que las similitudes morfológicas pueden evolucionar
convergentemente en linajes. Actualmente, se usan ciertos caracteres morfológicos
(sinapomorfías) que pueden emplearse para determinar las relaciones. La filogenética morfológica
es empleada por los paleontólogos para determinar las relaciones entre los fósiles y los grupos
existentes. También es usada por algunos zoólogos y botánicos evolutivos para determinar ciertos
caracteres morfológicos válidos entre sus grupos de estudio (animales y plantas). Antiguamente,
se usó para estudiar las relaciones entre los microorganismos, pero su uso quedó obsoleto debido
a la ausencia de caracteres morfológicos en estos grupos.
El primer paso para reconstruir la filogenia de los organismos es determinar cuán parecidos son
entre sí en su morfología, anatomía, embriología, biogeografía, moléculas de ADN, ARN y
proteínas, ya que en última instancia estos parecidos son un indicador de su parecido genético, y,
por lo tanto, de sus relaciones evolutivas.
La evolución es un proceso muy lento, y en la gran mayoría de los casos nadie la ha visto suceder.
Lo que se maneja es una serie de hipótesis acerca de cómo ocurrió la diversificación de los
organismos, que desembocó en la aparición de las distintas especies variadamente relacionadas
entre sí. Esas hipótesis son las que determinan cómo deberían analizarse los organismos para
determinar su filogenia. Supongamos una única población ancestral de plantas. Para establecer
que los organismos que componen esta población son morfológicamente similares entre sí
determinamos una serie de caracteres: color de pétalo, leñosidad del tallo, presencia o ausencia
de tricomas en las hojas, cantidad de estambres, fruto seco o carnoso, y rugosidad de la semilla.
Todas las plantas de esta población ancestral comparten los mismos estados del carácter para
cada uno de ellos: los pétalos son blancos, el tallo herbáceo, las hojas sin tricomas, los estambres
son 5, el fruto es seco, y la semilla lisa. Eventualmente, mediante algún mecanismo de aislamiento
reproductivo, la población se divide en dos subpoblaciones que no intercambian material genético
entre sí. Al cabo de algunas generaciones se va haciendo evidente que aparecen mutantes en las
dos subpoblaciones nuevas, algunos de ellos son más exitosos reproductivamente que el resto de
la población y, por lo tanto, después de unas generaciones más, su genotipo se convierte en el
dominante en esa población. Como las mutaciones ocurren al azar en cada subpoblación, y la
probabilidad de que ocurra espontáneamente la misma mutación en cada subpoblación es muy
baja, las dos poblaciones van acumulando diferentes mutaciones exitosas, generando diferentes
genotipos, que se pueden ver reflejados en los cambios que ocurren en los estados de los
caracteres. Así por ejemplo, la subpoblación 1 pasó a poseer el tallo leñoso, y la subpoblación 2
pasó a poseer los pétalos rojos (pero conservando el tallo herbáceo ancestral). Como resultado, la
última generación de plantas corresponde a dos poblaciones muy similares entre sí, con muchos
caracteres compartidos, salvo la leñosidad del tallo y el color de los pétalos. Nosotros en nuestra
corta vida solo vemos este resultado de la evolución, e hipotetizamos que lo que ocurrió fue el
proceso que se indica más arriba. Esta hipótesis se puede reflejar en un árbol filogenético, un
diagrama que resume las relaciones de parentesco entre los ancestros y sus descendientes, como
el siguiente:
Árbol filogenético que muestra cómo después de un evento de aislamiento reproductivo entre dos
poblaciones de la misma especie, apareció una mutación exitosa en cada subpoblación, que
pasaron a diferenciarse entre ellas mediante la observación de los estados de sus caracteres.
En el cladograma, la especie 1 comparte con su ancestro todos los estados de los caracteres salvo
el tallo, que es leñoso. La especie 2 comparte a su vez con su ancestro todos los caracteres salvo el
color de los pétalos, que es rojo. Las dos especies comparten entre sí todos los caracteres salvo la
leñosidad del tallo y el color de los pétalos. En este ejemplo, se han establecido 2 linajes:
secuencias de poblaciones desde el ancestro hasta los descendientes.
En los inicios de la sistemática, los caracteres utilizados para comparar a los grupos entre sí eran
conspicuos, principalmente morfológicos. A medida que se acumuló más conocimiento se empezó
a tomar cada vez más cantidad de caracteres crípticos, como los anatómicos, embriológicos,
serológicos, químicos y finalmente caracteres del cariotipo y los derivados del análisis molecular.
Los caracteres correspondientes al ancestro de un grupo de organismos que son retenidos por el
grupo se dice que son plesiomórficos (ancestrales), mientras que los que fueron adquiridos
exclusivamente por ese grupo (en el ejemplo, el tallo leñoso para la especie 1 o los pétalos rojos
para la especie 2) se dice que son sinapomórficos o derivados ("nuevos"). Nótese que solo la
presencia de sinapomorfías nos indica que se ha formado un nuevo linaje, nótese también que en
árboles filogenéticos más extensos, como el siguiente:
El aspecto del árbol filogenético (su topología) solo está dado por las conexiones entre sus nodos,
y no por el orden en que son diagramados. Así, [[A+B]+C] es el mismo árbol que [C+[A+B]]. La
topología tampoco está dada por la posición en que el árbol es dibujado, a veces se los dibuja
erectos (con el ancestro abajo y los grupos terminales arriba), a veces se los dibuja recostados (con
el ancestro a la izquierda y los grupos terminales a la derecha). Las dos formas de dibujarlos son
igualmente válidas. En los árboles filogenéticos como los aquí expuestos, el largo de las ramas
tampoco da ninguna información acerca de cuánto diverge ese linaje en términos de sus
caracteres ni acerca de en qué momento geológico ocurrió el aislamiento de ese linaje (pero hay
árboles que sí dan esa información).
Un grupo formado por un ancestro y todos sus descendientes se denomina monofilético, también
llamado clado. Al grupo al que se le ha excluido alguno de sus descendientes se lo llama
parafilético. Los grupos formados por los descendientes de más de un ancestro se denominan
polifiléticos.[cita requerida]
Por ejemplo, se cree que las aves y los reptiles descienden de un único ancestro común, luego este
grupo taxonómico (amarillo en el diagrama) es considerado monofilético. Los reptiles actuales
como grupo también tienen un ancestro común a todos ellos, pero ese grupo (reptiles modernos)
no incluye a todos los descendientes de tal ancestro porque se está dejando a las aves fuera (solo
incluye los de color cian en el diagrama), un grupo así decimos[¿quién?] que es parafilético. Un
grupo que incluyera a los vertebrados de sangre caliente contendría solo a los mamíferos y las
aves (rojo/naranja en el diagrama) y sería polifilético, porque entre los miembros de este
agrupamiento no está el más reciente ancestro común de ellos. Los animales de sangre caliente
son todos descendientes de un ancestro de sangre fría. La condición endotérmica ("sangre
caliente") ha aparecido dos veces, independientemente, en el ancestro de los mamíferos, por un
lado, y en el de las aves (y quizá algunos o todos los dinosaurios), por otro.[cita requerida]
Algunos autores sostienen[¿quién?] que la diferencia entre grupos parafiléticos y polifiléticos es
sutil, y prefieren llamar a estos dos tipos de asemblajes como "no monofiléticos". Muchos taxones
largamente reconocidos de plantas y animales resultaron ser no monofiléticos según los análisis
de filogenia hechos en las últimas décadas, por lo que muchos científicos recomendaron
abandonar su uso, ejemplos de estos taxones son Prokaryota, Protista, Pisces, Reptilia, Bryophyta,
Pteridophyta, Dicotyledoneae, y varios otros más. Como su uso está muy extendido por haber sido
tradicionalmente reconocidos, y porque muchos científicos consideran a los taxones parafiléticos
válidos (discusión que aún no está terminada en el ambiente científico, el ejemplo más claro de un
taxón que muchos[¿quién?] desean conservar quizás sean los reptiles), a veces se indica el nombre
del taxón, con la salvedad de que su nombre se pone entre comillas, para indicar que el taxón no
se corresponde con un clado.[cita requerida]
Las sinapomorfías que caracterizan a cada grupo monofilético son estados de los caracteres que se
originaron en el ancestro común a todos los miembros del grupo, pero que no estaban presentes
en los ancestros anteriores a estos, ancestros comunes tanto a los miembros del grupo como a
otros grupos más. Hay que tener en cuenta que si bien una sinapomorfía es un estado del carácter
que se hipotetiza que está presente en el ancestro del grupo, no necesariamente será encontrada
en todos sus descendientes, debido a que la evolución puede modificarla y hasta revertirla a su
estado anterior por azar (proceso que se conoce como reversión). Por lo tanto, no está
garantizado que una lista de sinapomorfías vaya a encontrarse en todos los miembros de un
grupo, y solo mediante un síndrome de caracteres podemos asegurarnos de que cada miembro
pertenece a ese clado.[cita requerida]
El concepto de sinapomorfía fue formalizado por primera vez por Hennig (1966) y Wagner (1980).
Mucho del análisis filogenético actual se basa en la búsqueda de sinapomorfías que permitan
establecer grupos monofiléticos. En ese sentido, son revolucionarios los análisis moleculares de
ADN que se están realizando desde hace algunos años, que entre otras técnicas determinan la
secuencia de bases del mismo trozo de ADN en diferentes taxones, y comparan directamente sus
secuencias de bases. En estos análisis, que se realizan con secuencias conservadas de genes
concretos (como el ARNr), cada base es un carácter, y los posibles estados del carácter son las 4
posibles bases: adenina, timina, guanina y citosina. Si bien las sinapomorfías encontradas a través
de los análisis moleculares de ADN son oscuras y no son útiles para identificar organismos en el
campo o para plantear hipótesis acerca de la adaptación de los organismos a su ambiente, poseen
ventajas (como la cantidad de caracteres medidos con poca cantidad de recursos, el
establecimiento de caracteres menos subjetivos que los basados en fenotipos), que le otorgan a
los análisis filogenéticos una precisión sin precedentes, obligando en muchas ocasiones a
abandonar hipótesis evolutivas largamente reconocidas. Además, según la hipótesis del reloj
molecular, la comparación de secuencias de ADN permite no solo determinar la distancia genética
entre dos especies, sino además estimar el tiempo transcurrido desde el último antecesor común.
[cita requerida]
Sinapomorfías y especies
Véase también
Árbol filogenético
Análisis filogenético
Sistemática filogenética
Taxonomía
Clado
Cladística
Holofilético
Filogenética computacional
Notas y referencias
Crisci, J.V. & López Armegol, F. «Introducción a la Teoría y Práctica de la Taxonomía Numérica».
Morrone, Juan José. «El lenguaje de la Cladística».
Bibliografía
Enlaces externos
El largo viaje de Lucy, la Filogenia en el Museo Virtual sobre genética y ADN "Leyendo el libro de la
vida"
ETE: A Python Environment for Tree Exploration Librería de programación dedicada al análisis,
manipulación y visualización de árboles filogenéticos.
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