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Los métodos tradicionales de detección de Salmonella se basan en preenriquecimiento durante la noche y usan proteinasa K (Soumet et al.
1994), isotiocianato de guanidina (Giesendorf et al. 1992), matrices de
cultivos en medios selectivos y caracterización de colonias sospechosas
unión a ADN (Chevrier et al. 1995), fenolcloroformo (Tsen et al. 1994 ). ),
mediante pruebas bioquímicas y serológicas.
centrifugación y filtración (Oyofo y Rollins 1993), perlas magnéticas
Estos métodos generalmente consumen mucho tiempo. Para superar este
recubiertas con anticuerpos contra Salmonella sp. (Coleman et al. 1995),
inconveniente, se han desarrollado métodos inmunológicos y genéticos.
o sistemas acuosos de dos fases (Lantz et al. 1996). La mayoría de ellos
Entre estos, el PCR ha sido exitosamente
suelen requerir muchas manipulaciones antes de la PCR y, por lo tanto,
son propensos a la contaminación cruzada entre muestras.
Correspondencia a: Dr. C. Soumet, CNEVA Fouge`res Unidad Técnica
de Innovación en Drogas Contaminantes y Desinfectantes Javene´,
35133 Fouge`res, Francia (email: c.soumet@fougeres.cneva.fr). También se ha realizado una PCR específica utilizando Modified
2 C. PRESENTACIONES ET AL.
Medio semisólido Rappaport Vassiliadis (MSRV) como medio selectivo Tabla 1 Evaluación de la especificidad de la mPCR utilizando tres pares de cebadores en diferentes
Salmonella no tifoidea a partir de muestras de heces. Este paso Resultados PCR positivos
por mPCR
selectivo para el cultivo en MSRV es económico, requiere poca
Cepas bacterianas N 429 bpa 550 bpb 312 bpc
manipulación y diluye las sustancias inhibidoras de la PCR. —–––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––– ––––
Aunque el método MSRV es simple de usar, necesita un manejo Salmonella enteritidis 12 12 0 Salm. 12
cuidadoso debido a su composición semisólida.
typhimurium 36 36 36 Salm. indiana 44 0 sal. 0
El objeto de este estudio fue desarrollar un ensayo basado en PCR hadar 66 0 Salm. infantes 33 0 Salm. 0
capaz de detectar Salmonella sp. simultáneamente e identificar Heidelberg 22 0 Salm. Senftenberg 33 0 Salm. 0
rápidamente Salmonella Enteritidis y Salmonella Typhimurium. derbi 11 0 Salm. agona Salm. virchow 22 0 0
9
muy simple y rápido para extraer ADN de hisopos ambientales. Para
0
lograr este objetivo, se agregaron tres conjuntos de cebadores
11 0 0
seleccionados de diferentes secuencias de genes (Joys 1985; Aabo et
0
al. 1993; Turcotte y Woodward 1993) a una MultiplexPCR (mPCR). En
Salmón. bredeney 33 0 Salmón. Panamá 11 0 0
condiciones óptimas, la mPCR se combinó con el medio MSRV y este
Salmón. Newport 22 0 Salmón. Montevideo 22 0
método se comparó con un método bacteriológico para el análisis de
0 0
hisopos ambientales de gallineros. 0
Escherichia coli 60 0 0
Proteo vulgar 20 0 0
MATERIALES Y MÉTODOS
Proteo mirabilis 20 0 0
Providencia stuarti 10 0 0
Cepas bacterianas y medio de cultivo 0
Citrobacter freundii 30 0
Avenida Hafnia 20 0 0
Para este estudio se utilizaron diferentes cepas de laboratorio de
Pseudomonas putida 10 0 0
Salmonella y otras bacterias estrechamente relacionadas con Salmonella
Serratia odorifera 10 0 0
(Tabla 1). Se cultivaron aeróbicamente durante la noche a 37°C en
Enterobacter cloacae 30 0 0
caldo Luria Bertani (Sambrook et al. 1989) con agitación suave (200 Enterobacter sakazaki 20 0 0
rev min1 ). —–––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––– ––––
Las placas de agar se sometieron a ensayos bioquímicos en medio mmol l−1 TrisHCl pH7,5, 50 mmol l−1 KCl, 1,5 mmol l−1 MgCl2, 0,1
Kligler Hajna y luego se serotipificaron mediante pruebas de aglutinación % de gelatina y 5 ml de ADN, utilizando un termociclador GeneAmp
en portaobjetos utilizando antisueros polivalentes O y H de Salmonella 9600 (Perkin Elmer Instruments, Norwalk, CT , EE.UU). Las reacciones
(Sanofi Diagnostics Pasteur, París, Francia). se llevaron a cabo durante 35 ciclos de 30 s para la desnaturalización
a 94 °C, 1 min 30 s para el recocido a 56 °C y 30 s para la extensión
del cebador a 72 °C, seguido de una extensión terminal a 72 °C durante
Preparación de muestras para PCR
10 min. Las muestras se mantuvieron a ¦4°C y se procesaron en 24h.
Para determinar la especificidad de la PCR, se calentaron a 100 °C
durante 10 min 500 ml de un cultivo puro de bacterias durante la noche;
Se usaron 5 ml como plantilla para los experimentos de PCR.
Análisis de gel de agarosa
A partir de un resultado positivo en una placa de agar MSRV, se
añadió un asa del medio a 1 ml de agua ultrapura estéril y se calentó a Los productos amplificados (10 ml) se separaron por electroforesis en
100 °C durante 20 min; Se usaron 5 ml como plantilla para los un gel de agarosa al 1,5 % (Eurobio, Les Ulis, Francia) en tampón TBE
experimentos de PCR. (89 mmol l1 Tris pH 8,3, 89 mmol l1 de borato y 2 mmol l−1 EDTA).
A continuación, este gel se tiñó con solución de bromuro de etidio (0,5
mg ml1 ) y se fotografió bajo luz ultravioleta. Las imágenes se
Experimentos de PCR
analizaron con el software Molec ular Analyst®/PC (Biorad SA, Vitry
Para la PCR multiplex, se probaron tres pares de cebadores. Los sur Seine, Francia) del sistema de generación de imágenes Biorad Gel
cebadores ST11ST15 se seleccionaron de un fragmento cromosómico Doc 1000.
clonado aleatoriamente y se ha demostrado que son específicos para
Salmonella sp. (Aabo et al. 1993). Los cebadores Sef167Sef478 se
RESULTADOS Y DISCUSIÓN
eligieron del antígeno fimbrial SEF14 codificado por el gen sefA
(Turcotte y Woodward 1993) y son específicos para Salmonella
Especificidad de la PCR para la detección de Salmonella
Enteritidis. La aparición de esta secuencia génica entre otros serotipos
Typhimurium y Salmonella Enteritidis
de Salmonella está restringida a los serotipos Enteritidis, Blegdam,
Dublin, Gallinarum, Pullorum, Rostock, Seremban y Typhi (Turcotte y Se evaluaron conjuntos de cebadores elegidos del gen fliC para detectar
Woodward 1993). Para Salmonella Typhimurium, los cebadores Fli15 específicamente Salmonella Typhimurium. El cebador Tym se usó en
Tym se seleccionaron de la secuencia del gen fliC (Joys 1985) que combinación con el cebador Fli15 para el análisis de cultivos puros de
codifica la flagelina H1. Las secuencias del gen fliC obtenidas del (i) serotipos de Salmonella a menudo aislados del entorno de las naves
banco de datos Gene/EMBL se alinearon y compararon para varios avícolas y (ii) bacterias distintas de Salmonella (Tabla 1). Los resultados
serotipos de Salmonella con el software MacDnasis (Hitachi Software obtenidos con Fli15Tym se muestran en la Fig. 1 (A). En las condiciones
Engineering, San Bruno, CA, EE. UU.). Los cebadores Fli15 y Tym se utilizadas, 36 de 36 cepas de Salmonella Typhimurium dieron un
eligieron dentro de regiones variables del gen fliC con el software fragmento amplificado de 559 pb con el conjunto de cebadores Fli15
Oligo. Todas las secuencias de cebadores utilizadas en este estudio se Tym (carril 1). No se encontró ningún producto amplificado del tamaño
dan en la Tabla 2. esperado para otros serotipos de Salmonella (carriles 2 y 3) y bacterias
relacionadas (carril 4). La longitud del cebador Tym (n22) y las
Las amplificaciones se realizaron en un volumen total de 50 ml, que temperaturas de fusión cercanas para todos los cebadores usados
contenía 1U Taq Polimerasa (Boehringer Mannheim), 0,6 mmol l1 de parecían apropiadas para la mPCR (Meng et al. 1997).
cada cebador, 100 mmol l1 de cada dNTP, 10
Tabla 2 Cebadores utilizados en este estudio para la detección de Salmonella por MSRVMultiplex PCR
—–––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––– ––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––– ––––––––––––––
4 C. PRESENTACIONES ET AL.
Fig. 1 Análisis de cultivos puros de Salmonella con los tres conjuntos de cebadores Sef167Sef478 (A), TymFli15 (B) y ST11ST15 (C), y todos
los conjuntos de cebadores (D). Carril 1: Salmonella Typhimurium; Carril 2: Salmonella Enteritidis; Carril 3: Salmonella Infantis; Carril 4: resultado
positivo en medio MSRV pero no confirmado por el método bacteriológico; Carril 5: agua estéril utilizada como control de PCR negativo;
Carril 6: Marcadores de peso molecular (fX174HaeIII, Eurobio)
La especificidad de la PCR para la detección de Salmonella detección de Salmonella sp. (Tabla 3). De estos, 330 resultados
Enter itidis se estimó con los cebadores Sef167Sef478 de cultivos positivos y 701 negativos fueron obtenidos por ambos ensayos,
puros de Salmonella y bacterias relacionadas (Fig. 1B). Bajo las dando una tasa de concordancia del 95,6%. Diecinueve hisopados
condiciones de PCR utilizadas aquí, se encontró que el conjunto resultaron positivos solo por el método bacteriológico. Entre los 19
de cebadores Sef167Sef478 amplificó solo las cepas de resultados considerados falsos negativos por PCR, nueve se
Salmonella Enteritidis que produjeron el fragmento esperado de explicaron por la no migración de Salmonella en una placa de agar
312 pb. Estos resultados confirman que el gen sefA del que se MSRV. Los resultados PCR negativos no pueden explicarse por la
derivó este conjunto de cebadores es un buen candidato para la inhibición de la PCR para las otras 10 muestras, ya que la
detección específica de Salmonella Enteritidis (Woodward y Kirwan 1996).amplificación de 105 Salmonella añadida a cada una de las 10
muestras anteriores dio, en todos los casos, un producto
Especificidad de la PCR multiplex amplificado del tamaño esperado (datos no mostrados). A partir
Para evaluar la especificidad de la mPCR, se utilizaron los de estas consideraciones y de las condiciones experimentales
conjuntos de cebadores previamente demostrados como para el análisis de muestras fecales, no fue importante el desarrollo
específicos para Salmonella Enteritidis (Sef167Sef478) y de un control interno para la reacción. La presencia de un bajo número de Salm
Salmonella Typhimurium (Fli15Tym), junto con los cebadores
ST11ST15 específicos para el género Salmonella, en un tubo de
reacción (Tabla 1, Fig. 1D). En la mPCR se obtuvieron cuatro
Tabla 3 Resultados comparativos de la recuperación de Salmonella
resultados distintos: para Sal monella Typhimurium, dos productos
a partir del análisis de 1078 hisopos ambientales de galpones
amplificados de 429 y 559 pb; para Salmonella Enteritidis, avícolas por el MSRV mPCR y por el método bacteriológico
productos amplificados de 429 y 312 pb; se observó un producto —–––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––– ––––
todas las cepas de Salmonella y produjo un fragmento específico Ensayo basado en PCR ¦ 330 28 358
de 429 pb y un producto amplificado distinto adicional que permitió − 19 701 720
el tubo de reacción por debajo del límite de detección, o la mala encontradas en hisopos ambientales de gallineros.
recuperación de Salmonella de un asa llena de medio MSRV, podrían Se han desarrollado dos conjuntos de cebadores, uno específico para
explicar los resultados negativos. El bajo número de Salmonella Salmonella Typhimurium y otro específico para Salmonella Enteritidis.
podría ocurrir si un crecimiento excesivo de Citrobacter freundii y Estos dos conjuntos de cebadores se usaron ambos con un conjunto
Enterobacter cloacae migrara a una placa de agar MSRV (Dusch y de cebadores específicos para el género Salmonella en una PCR m.
Altwegg 1995), por lo tanto, enmascararía el crecimiento de Salmonella . Para el análisis de hisopos ambientales de gallineros, esta mPCR fue
precedida por un paso de preenriquecimiento y un paso selectivo y
Con respecto a los 28 resultados falsos positivos, 21 de los 28 solo diferencial en un medio MSRV.
se detectaron por PCR porque la Salmonella aislada de estos hisopos Este paso de enriquecimiento permitió inhibir o disminuir el crecimiento
en placas de agar Rambach y XLT4 no se identificó como colonias de la flora competitiva y requería menos mano de obra que los
típicas de Salmonella . Estas 21 cepas eran Salmonella Senftenberg tratamientos clásicos de extracción de ADN a partir de caldos de
con actividad bgalactosidasa y sin producción de sulfito de hidrógeno. preenriquecimiento. El método que utilizaba el enriquecimiento en un
Las siete muestras restantes solo fueron identificadas por mPCR. medio MSRV antes de la PCR era más fiable que los probados
Para verificar que estas muestras fueran realmente positivas para anteriormente (Soumet et al. 1999) y se basaba en una separación
Salmonella, se analizaron mediante PCR con un nuevo conjunto de selectiva mediante perlas inmunomagnéticas o la eliminación de los
cebadores (datos no mostrados) inhibidores de la PCR mediante matrices de unión al ADN. A partir del
(Baumler et al. 1997) que demostraron ser altamente específicos para análisis de 1078 muestras, el ensayo MSRV mPCR mostró una buena
Salmonella sp. Las siete muestras dieron positivo en esta PCR. Por lo sensibilidad (95 %) y especificidad (96,2 %) en comparación con el
tanto, estos resultados deben considerarse como verdaderos positivos. método bacteriológico. Además, la detección de Salmonella Typhi
La sensibilidad relativa de nuestro ensayo basado en PCR fue mejor murium y Salmonella Enteritidis por este ensayo se llevó a cabo dentro
(95%) que la del método bacteriológico utilizado (92,5%). de los 2 días en lugar de 56 días por los métodos bacteriológicos y
serológicos.
Del análisis de 1078 muestras, se aislaron cepas de Salmonella Se llevarán a cabo más experimentos para disminuir el tiempo de
Enteritidis de 42 muestras por el método bacteriológico (Cuadro 4). detección mediante un breve paso de enriquecimiento en un caldo
Dos de los cuatro resultados negativos de la mPCR se explican por suplementado con ferrioxaminaE (Reissbrodt et al. 1996), o mediante
el hecho de que las muestras se puntuaron como negativas en las un paso de concentración de la muestra preenriquecida antes de la PCR.
placas de agar MSRV, mientras que las cepas de Salmonella Enteritidis
solo se aislaron del caldo de tetrationato de Muller Kauffmann.
AGRADECIMIENTOS
De las 39 muestras en las que se aisló Salmonella Typhimurium Los autores agradecen al Consejo Regional de Bretaña por la
por el método bacteriológico, 31 resultaron positivas por mPCR para asistencia financiera.
este serotipo. Estos resultados pueden explicarse por el crecimiento
excesivo de otros serotipos de Salmonella de estas muestras que
enmascararon el crecimiento de Salmonella Typhi murium. REFERENCIAS
Tabla 4 Comparación del ensayo basado en PCR Multiplex y el método bacteriológico para la detección de diferentes Salmonella
serotipos
—–––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––– ––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––– ––––––––––––––
Salmonella enteritidis 42 40 38 0
Salmonella typhimurium 39 36 0 31
Salmonella hadar 102 95 0 0
Salmonella heidelberg 100 100 0 0
Otro (n 16) 141 135 0 0
—–––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––– ––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––– ––––––––––––––
6 C. PRESENTACIONES ET AL.
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