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Conceptos básicos
Teoría de la evolución
El concepto teoría en la ciencia no significa una expectativa o una conjetura sin
fundamento, las teorías científicas son una serie de enunciados que pretenden explicar
los mecanismos por los cuales se produce una determinada pauta observable en el
mundo.
Evolución: significa cambio en los organismos a través de las generaciones, es también
un proceso histórico de transformación de unas especies en otras especies
descendientes e incluye la extinción de la gran mayoría de las especies que han existido.
La evolución depende de los cambios ambientales externos y de cambios genéticos
aleatorios, lo que significa que el curso del futuro de la evolución es impredecible, a
menos que podemos especificar las condiciones.
La evolución de la vida se ha producido en un patrón de ramificación, con un gran
número de especies actuales que descienden de especie ancestral común.
Formas de entender la evolución
1. La evolución como camino: se refiere a las trayectorias particulares que han
experimentado los distintos linajes de organismos desde el origen de la vida a
nuestros días (en forma de árbol). Todos los organismos actuales descendemos en
ultima instancia de un único ancestro común que vivió hace aproximadamente 3.800
millones de años, que se conoce como LUCA.
2. La evolución como hecho: se refiere a la constatación
empírica de que el fenotipo y l genotipo de las
poblaciones de organismos que cambian a lo largo de
las generaciones. Los individuos más adaptados son los
que dejan más descendencia.
3.
4. La evolución como teoría (como un todo): se refiere a los mecanismos por los
cuales funciona la evolución. A nivel macroevolutivo (árbol) y a nivel
microevolutivo (pocas generaciones).
El combustible son las mutaciones que necesitan variaciones para evolucionar
(surge la mutación).
- Mutaciones.
- Migración.
- Selección natura.
- Deriva genética.
Los mecanismos que cambian las frecuencias de los genes son la selección
natural, la deriva genética (aleatorio, depende del tamaño de la población, es
más importante en poblaciones más pequeñas), el flujo génico o la migración. Se
introducen nuevos alelos.
1
Evolució
2
Evolució
- Las adaptaciones entre los virus SARS-CoV-2 más eficientes han aparecido en
distintos países de forma convergente.
Las adaptaciones pueden tener limitaciones o construcciones:
- Los ojos de los vertebrados.
- El cuello de las jirafas, tienen el mismo número de vértebras cervicales (7)
que los otros vertebrados.
- El nervio faríngeo de tetrápodos terrestres que esta limitado a causa de
ciertas constricciones.
Genética de poblaciones
Una población es un grupo de individuos que comparten un conjunto de genes que viven
en la misma área geográfica y que real o potencialmente se cruzan entre sí.
La genética de poblaciones estudia como varia genéticamente una población a través de
las generaciones.
Frecuencias genotípicas
Para un locus de dos alelos tendremos tres frecuencias genotípicas AA, Aa, aa.
3
Evolució
𝑛ú𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑑𝑒 𝑖𝑛𝑑𝑖𝑣𝑖𝑑𝑢𝑜𝑠 𝐴𝐴
𝑃 = 𝑓(𝐴𝐴) =
𝑁
𝑛ú𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑑𝑒 𝑖𝑛𝑑𝑖𝑣𝑖𝑑𝑢𝑜𝑠 𝐴𝑎
𝐻 = 𝑓(𝐴𝑎) =
𝑁
𝑛ú𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑑𝑒 𝑖𝑛𝑑𝑖𝑣𝑖𝑑𝑢𝑜𝑠 𝑎𝑎
𝑄 = 𝑓(𝑎𝑎) =
𝑁
Frecuencias alélicas
También conocidas como frecuencias génicas, los genotipos se forman en cada
generación a partir de los alelos que son lo que tiene continuidad generación tras
generación.
Si para un locus tenemos dos alelos A y a tendremos tres genotipos posibles.
𝑛º 𝐴 2𝑛𝐴𝐴 + 𝑛𝐴𝑎
𝑝 = 𝑓𝑟𝑒𝑐𝑢𝑒𝑛𝑐𝑖𝑎 𝑑𝑒 𝐴 = =
𝑛º 𝑡𝑜𝑑𝑜𝑠 𝑙𝑜𝑠 𝑎𝑙𝑒𝑙𝑜𝑠 2𝑁
𝑛º𝑎 2𝑛𝑎𝑎 + 𝑛𝐴𝑎
𝑞 = 𝑓𝑟𝑒𝑐𝑢𝑒𝑛𝑐𝑖𝑎 𝑑𝑒 𝑎 = =
𝑛º 𝑡𝑜𝑑𝑜𝑠 𝑙𝑜𝑠 𝑎𝑙𝑒𝑙𝑜𝑠 2𝑁
1=p+q
1 1
𝑝 = 𝑃𝐴1𝐴1 + 2 𝐻𝐴1𝐴2 𝑞 = 𝑄𝐴2𝐴2 + 2 𝐻𝐴1𝐴2
No importa que los individuos sean homo o heterocigotos, lo importante son los alelos.
Ejemplo 1.1
Ejemplo 1.2
Las frecuencias genotípicas y alélicas pueden ser diferentes entre distintas poblaciones.
Genes ligados al sexo
Una hembra para un locus ligado al sexo tiene dos alelos mientras que un macho solo
tiene un alelo (generalmente se habla de genes ligados al cromosoma X).
- Hembras: pueden ser homocigotas XAXA o heterocigotas XAXa.
- Machos: son hemicigotos XAY o XaY.
2𝑛𝑋 𝐴 𝑋 𝐴 + 𝑛𝑋 𝐴 𝑋 𝑎 + 𝑛𝑋 𝐴 𝑌
𝑝 = 𝑓𝑟𝑒𝑐(𝑋 𝐴 ) =
2𝑛ℎ𝑒𝑚𝑏𝑟𝑎𝑠 + 𝑛𝑚𝑎𝑐ℎ𝑜𝑠
2𝑛𝑋 𝑎 𝑋 𝑎 + 𝑛𝑋 𝐴 𝑋 𝑎 + 𝑛𝑋 𝑎 𝑌 4
𝑞 = 𝑓𝑟𝑒𝑐(𝑋 𝑎 ) =
2𝑛ℎ𝑒𝑚𝑏𝑟𝑎𝑠 + 𝑛𝑚𝑎𝑐ℎ𝑜𝑠
Evolució
Ejemplo 1.3 Se determina en una población humana la cantidad de varones daltónicos (ligado al
cromosoma X) y de visión normal, así como el número de hembras daltónicas, portadoras y
daltónicas.
Varones normales 8.324, daltónicos 725.
Mujeres normales homocigotas 9.001, heterocigotas 1.330 y daltónicas 55.
¿Frecuencias alélicas de la población?
XA→ normal Xa→ daltónico
En un gen ligado a sexo las frecuencias genotípicas son 5 genotipos distintos. Se suelen
separar entre machos y hembras. En los machos las frecuencias genotípicas y alélicas
coinciden.
El efecto de la reproducción sobre las frecuencias alélicas y genotípicas
Las frecuencias de los alelos de los gametos son iguales a las frecuencias en el conjunto
de la población.
A p AA p2
A p
a q Aa pq
A p Aa pq
a q
a q aa q2
5
Evolució
- F(aa)=q2
6
Evolució
- Hembras: - Machos
o X X →p
A A 2 o XAY→ p
o XAXa→ 2pq o XaY→q
o XaXa→ q2
Cuando un alelo ligado al cromosoma X es poco frecuente, el rasgo producido por este
alelo es mucho más frecuente en los machos (frecuencia p) que en las hembras (p2).
f(A1)=p f(A1A1)=p2
f(X1)=p fh(X1X1)=p2
f(A2)=q f(A1A2)=2pq
f(X2)=q fh(X1X2)=2pq
f(A3)=r f(A2A2)=q2
fh(X2X2)=q2
f(A1A3)=2pr
fm(X1Y)=p
f(A2A3)=2qr
f(A3A3)=r2 fm(X2Y)=q
7
Evolució
1 2 𝑝𝑀 + 2𝑝𝐻
𝑝𝑒 = 𝑝𝑀 + 𝑝𝐻 =
3 3 3
Ejemplo 1.7
Ejemplo 1.8
8
Evolució
Polimorfismo
Un locus se considera polimórfico cuando el alelo más frecuente tiene una frecuencia
igual o menor a 0’95. Este límite es arbitrario y su objetivo es ayudar a identificar
aquellos genes en los que la variación alélica es común.
Proporción de loci polimórficos (P)
𝑛𝑝 El número de loci que son polimórficos respecto al total de los loci.
𝑃= ⁄𝑛𝑡𝑜𝑡𝑎𝑙
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Evolució
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Evolució
4· Selección, desaparece un alelo, y el más favorecido augmenta. Uno sube a costa del otro.
5· Deriva, pero algún motivo la población disminuye y se reduce el número de alelos, los alelos
menos frecuentes son los que se ven más afectados.
Mutación
Es el origen la variación genética. La recombinación en la meiosis puede generar nuevas
combinaciones de alelos, pero es la mutación al azar la que genera en última instancia
la variación genética en una población. Las mutaciones son independientes de la función
del gen, y es la fuente de la evolución.
La tasa de mutación de un gen o de la secuencia de DNA es la frecuencia en la que se
producen las nuevas mutaciones en ese gen o en la secuencia en cada generación.
Una tasa de mutación elevada implica un mayor potencial de adaptación en el caso de
cambio ambiental. Y también augmenta el número de mutaciones perjudiciales o
deletreas en los individuos.
Hay un compromiso entre la estabilidad y el cambio impuesto por el ambiente.
La tasa de mutación depende de los organismos, para cada tipo de organismo es distinta,
los virus de RNA tienen una tasa mucho más elevada que los hongos o los vertebrados.
Virus RNA> Virus DNA> E. coli > Hongos> invertebrados> vertebrados.
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Evolució
A1 u A2
p0+ q0=1
p0 q0
- En la generación siguiente 𝑝1 = 𝑝0 (1 − 𝑢)
- En una generación n 𝑝𝑛 = 𝑝0 (1 − 𝑢)𝑛 .
Ejemplo 2.1
Para calcular cuantas generaciones se necesitarán para llegar a una frecuencia p n
determinada.
𝑝
log 𝑝𝑛 1 𝑝0
0
𝑛= 𝑛 = ( ) ln ( )
log(1 − 𝑢) 𝑢 𝑝𝑛
Ejemplo 2.2
Modelo de mutación bidireccional recurrente
A1 pasa a A2 y A2 pasa a A1, se acaba llegando a unas frecuencias de equilibrio que
dependerán de las tasas de mutación y retromutación.
A1 u A2
P v q
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Evolució
Ejemplo 2.5
La mutación es un proceso crítico en la introducción de nuevos alelos, pero es un
proceso muy lento. Las tasas de mutación de la mayota de los genes son bajas, de forma
que el cambio de frecuencia alélica por mutación en una sola generación es
insignificante y se requieren períodos muy largos para alcanzar el equilibrio mutacional.
Migración
Muchas especies presentan poblaciones localizadas, aunque la mayoría de los
cruzamientos generalmente se dan localmente, se pueden dar una fracción de ellos con
individuos de otras poblaciones, esto permite a los alelos de un locus moverse de un
conjunto genético (población) a otro.
Este desplazamiento de individuos o de sus gametos de una población
que pasan a formar parte del acervo genético de otra población recibe
el nombre de flujo genético.
Cunado una población está geográficamente separada de otra, puede
intercambiar individuos (migrantes) o gametos por lo que se produce
esta transferencia de generes (flujo genético). Las frecuencias alélicas
de una población pueden verse alteradas por el efecto de este flujo
génico.
El flujo génico:
- Evita que las poblaciones se vuelvan genéticamente diferentes entre sí.
- Aumenta la variación genética dentro de las poblaciones.
Modelo de migración
Suponiendo que la migración sea unidireccional desde una población grande
(continente) a otra reducida y aislada (isla).
Índice de migración (m frecuencia de migrantes) constante de la población grande a la
reducida. m se define en términos de intercambio de gametos entre poblaciones locales,
no necesariamente intercambio de individuos.
Supuestos:
- Un locus con dos alelos A1 y A2.
- La frecuencia q0 corresponde al alelo A2 en la población pequeña.
- La frecuencia qm corresponde al alelo A2 en
la población grande.
qm q0
Consideramos la variación de qm es despreciable.
m migración por generación.
qm q1
1-m los individuos de la isla (endémicos), m individuos m
migrantes
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Evolució
Ejemplo 2.8
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Evolució
Selección natural
Selección natural
Los individuos de una población pueden diferir en supervivencia y/o reproducción y, por
lo tanto, cubrir con un número diferente de descendientes (y alelos) a la siguiente
generación.
Hay selección natural cuando los individuos con rasgos adaptativos heredables
producen, más descendientes que los producidos por otros individuos en la población.
Puede ser debido a:
- Supervivencia diferencial.
- Fertilidad/fecundidad diferencial, selección sexual.
- Combinación de ambos factores.
Viabilidad Fecundidad Fertilidad
Media de 10 5 2
descendientes
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Evolució
Contribución
proporcional de los
p2w11 2pqw12 q2w22
genotipos de la
población
Frecuencias genotípicas
relativa después de la p2w11/w(m) 2pqw12/w(m) q2w22/w(m)
selección
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Evolució
Podemos despejar n y saber cuántas generaciones serán necesarias para llegar a una
1 1
determinada q 𝑛 = 𝑞 − 𝑞 .
𝑛
Ejemplo 3.2
Frecuencias genotípicas relativas después de la selección contra un rasgo sin dominancia
W(m)= 1-sq.
1
𝑞−2𝑠𝑞(1−𝑞)
La frecuencia de A2 en la generación siguiente (q1) será 𝑞1 = .
1−𝑠𝑞
1
−2𝑠𝑝𝑞
Y el cambio de q será ∆𝑞 = .
1−𝑠𝑞
Ejemplo 3.3
Frecuencias genotípicas relativas después de la selección contra rasgo dominante
W(m)=1-p2.
𝑞((1−𝑠)
La frecuencia de A2 en q1 será 𝑞1 = 1−𝑠+𝑠𝑝2 .
−𝑠𝑝2 𝑞
Y el cambio de q será ∆𝑞 = .
1−𝑠+𝑠𝑝2
Ejemplo 3.4
GRAFICOOO
Se observa que cuando la frecuencia de partida de A2 es máxima, esta disminuye
rápidamente si la desventaja de A2 es recesiva o in dominancia, pero que si es
desventaja de dominante tarda mas en disminuir. El mayor cambio se produce cuando
la población alcanza la frecuencia máxima de heterocigotos.
Cuando la frecuencia de partida del alelo desventajoso A2 es intermedia el eliminar
tarda muchas generaciones.
Comparamos las generaciones que tardan partiendo de una q0 igual, pero a una qn cada vez más
pequeña.
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Evolució
Los valores de equilibrio (peq y qeq) son independientes de las frecuencias iniciales en la
población, solo dependen de los coeficientes de selección contra los homocigotos (s y
t). Como s y t son constantes el equilibrio es estable. SI por cualquier causa se fuerza el
desequilibro de las frecuencias alélicas, éstas vuelven otra vez a los valores de equilibro.
GRAFICO
Ejemplo 3.5
Ejemplo 3.6
Un ejemplo de este tipo de selección es el caso de la malaria i la anemia falciforme, en
poblaciones donde la malaria es un problema hay una mayoría de heterocigotos, aparta
un cierto grado de inmunidad.
Otros ejemplos de ventaja del heterocigoto
- Gen CFTR: el alelo recesivo produce fibrosis quística, que da una mayor
resistencia al tifus y al asma cuando se encuentra en heterocigotos.
- Gen CCR5: la heterocigosis para este gen parece estar relacionada con un
retraso en el desarrollo de la enfermedad en individuos infectados por HIV-
1.
- Gen PRNP: parece ofrecer resistencia en heterocigotos a la enfermedad
priónica kuru. Complejo mayor de histocompatibilidad.
La heterocigosis ofrece también ventajas selectivas al aumentar la resistencia a
enfermedades infeccionas.
Selección contra el heterocigoto
Se produce infradominancia cuando el genotipo menos favorecido por la selección
natural es el heterocigoto.
En este caso se produce una situación de equilibrio inestable.
Frecuencias genotípicas relativas después de la selección contra el heterocigoto
W(m)=1-2pqs.
𝑝𝑞 − 𝑝𝑞𝑠 + 𝑞2 − 𝑞 + 2𝑝𝑞2 𝑠
𝑞1 =
1 − 2𝑝𝑞𝑠
Resumen
- Selección positiva: favor del un alelo ventajoso, direccional.
- Selección negativa: (purificadora) a favor del heterocigoto (sobredominancia),
estabilizadora.
- Selección contra el heterocigoto: (infradominancia) disruptiva.
- Selección dependiente de frecuencias.
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Evolució
Equilibro selección-mutación
Si ambas fuerzas se oponen pueden llegar a anular sus efectos mutuamente y la oblación
alcanzara una posición de equilibro estable.
Para calcular la frecuencia en equilibrio basta con igualar los valores que expresan los
cambios en las frecuencias alélicas (∆q) en cada caso, cambiando de signo uno de los
valores.
Cambio por mutación bidireccional:
∆q=qv-pv.
∆q=pu-qv=u(1-q)-vq.
Cambio por selección contra un alelo recesivo.
−𝑠𝑝𝑞2 𝑢
∆𝑞 = 𝑞𝑒𝑞 = √
1 − 𝑠𝑞2 𝑠
En un letal recesivo (s=1) y las frecuencias de equilibro son 𝑞𝑒𝑞 = √𝑢.
Ejemplo 3.7
𝑢
Equilibro en selección contra alelo dominante 𝑞𝑒𝑞 ≈ 𝑠 .
2𝑢
Equilibrio en selección sin dominancia 𝑞𝑒𝑞 = .
𝑠
20