Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
______________________________
Manual de prácticas
Institucionales de la
Escuela de Ciencias de la
Salud
— 2018 —
1
Formato Institucional de Prácticas Explícitas de
Formación Clínica y Profesional
-----BIOTECNOLOGÍA-----
2
Presentación
ASIGNATURA: BIOTECNOLOGIA
Observaciones: HORAS DE 2
APRENDIZAJE
INDEPENDIENTE
Aspectos Curriculares
OBJETIVO GENERAL DE LA ASIGNATURA:
Contenido:
Extracción de DNA genómico de suelo .............................................................................. 4
Elaboración de células competentes de E. coli con CaCl2 ................................................ 7
Preparación de soluciones nutritivas utilizadas en biotecnología vegetal ........................... 9
Biotecnología Microbiana: Selección primaria de microorganismos productores de
enzimas ........................................................................................................................... 12
Biotecnología Microbiana: Selección de microrganismos productores de sideroforos ...... 15
3
Práctica Número: 1 Duración (mins/horas): 3 sesiones de 2 h
Materiales
Equipo:
Microcentrífuga
Espectrofotómetro
Celdas de cuarzo
Cámara de electroforesis
Campana de extracción
Sustancias:
Buffer de extracción CTAB
Cloroformo octanol (24:1)
Fenol cloroformo (1:1)
Isopropanol frio
Cloruro de sodio 5 M pH 5.2
Etanol
Solución de lavado 1: 76% de etanol, 0.2 M de acetato de sodio
Solución de lavado 2: 76% de etanol, 10 mM de acetato de amonio
Buffer TE (10mM de Tris-Hcl, 1mM de Na-EDTA pH8)
Buffer de corrimiento TAE 50X ( Tris Base, Ácido acético glacial y Na-EDTA
pH8)
Buffer de carga (Tris, azul de bromofenol y glicerol)
RNAsa
Bromuro de etidio
Marcador de peso molecular
Actividades
4
BRIEFING INICIAL (20 MINUTOS) 1.- Ponerse guantes (esto con el fin de evitar
1. Presentación e ingreso al laboratorio contaminación y degradación del DNA que se va a extraer
2. Diagrama de bloques 2.- pesar de 300 a 400 mg de suelo en un tubo de
3. Socialización del propósito de Aprendizaje y/o centrifuga de propileno de 15 ml
examen rápido 3.-Agregar 9 ml de CTAB precalentado (65 grados
Celsius) al suelo y mezclar suavemente por inversión 10
PREPARACIÓN INICIAL (15 MINUTOS) veces
1. El docente solicita a los auxiliares de laboratorio 4.- Incubar de 60- 90 minutos a 65 grados con agitaciones
con 1 semana de anticipación sus materiales continuas
2. El docente verifica que el alumno ingresó su 5.- Sacar los tubos de la incubadora y esperar a que estos
solicitud de materiales con los auxiliares de laboratorio estén a temperatura ambiente. Inmediatamente colocar
con mínimo 24 h de anticipación 4.5 ml de solución de cloroformo octanol (24:1) y mezclar
3. El docente verifica que los auxiliares de por 5 minutos.
laboratorio entreguen el material a los alumnos contra 6.- Centrifugar por 15 minutos a 3200 rpm (temperatura
vale de solicitud y credencial del responsable del equipo, ambiente)
posterior al briefing 7.- Transferir la fase acuosa a un nuevo tubo de 15 ml.
4. El docente verifica que el alumno revise que Agregar nuevamente 4.5 ml de cloroformo-octanol y
cuenta con el 100% de los materiales solicitados mezclar suavemente de 10 minutos.
5. El docente verifica que el alumno tenga el área 8.- Centrifugar por 10 minutos a 3200 rpm
de trabajo limpia y despejada 9.- Transferir la fase acuosa de nuevo un tubo de 15 ml
que contenga 30 microlitros de RNASA (10mg/ml)
EJECUCIÓN DE LA PRÁCTICA precalentada (60 grados Celsius). Mezclar por inversión e
1. Lleva los tiempos y ayuda a los alumnos a llevar incubar 30 minutos a temperatura ambiente
la cronología. 10.- adicionar 10 ml de isopropanol y mezclar suavemente
2. Provee Feedback descriptivo durante la práctica. 10 veces por inversión.
3. Resuelve dudas durante la ejecución. 11.- Remover el DNA precipitado con una varilla de vidrio
4. Promueve el buen Comportamiento del equipo en forma de gancho o bien centrifugar para obtener una
durante la ejecución de la práctica pastilla de DNA.
5. Verifica la Entrega de material limpio y completo. 12.- Colocar el DNA en un microtubos eppendorf que
6. Utiliza un Modelo de FACILITADOR NO contenga previamente 1 ml de TE y dejar toda la noche
INSTRUCCIONAL. para que el DNA se Re suspenda en la solución de TE.
7. Llenado de bitácora electrónica: 13.- Añadir un volumen de fenol-cloroformo en relación
https://goo.gl/forms/Ep16K5pZtsuutiRE3 1:1 y centrifugar los tubos a 3200 rpm por 10 minutos.
14.- Transferir la fase acuosa a un tubo eppendorf nuevo
DEBRIEFING (10 MINUTOS) estéril de 2 ml. Agregar un volumen de solución de
1. Recapitula con los alumnos los hechos cloroformo-octanol y centrifugar 10 minutos a 3200 rpm.
ocurridos. 15.- Transferir la fase acuosa a un nuevo tubo eppendorf
2. Promueve la reflexión, discusión y resolución de de 2 ml
dudas. 16.- Precipitar el DNA adicionando 50 microlitros dela
3. Verifica si se cumplió el propósito de solución de Cloruro de sodio 5M y después 1 ml de etanol
aprendizaje. absoluto. Mezclar suavemente por inversión.
17.- Centrifugar a 12000 rpm y recuperar la pastilla de
DNA
18.-Anadir 2 ml de la solución de lavado 1 y dejar las
pastilla agitando suavemente por 20 minutos
19.- Centrifugar la pastillas 12000 rpm y decantar el
sobrenadamente
20.- Adicionar 2 ml de la solución de lavado 2 y enjuagar
la pastilla de DNA. Centrifugar con las mismas
condiciones del lavado 1 y decantar el sobrenadamente y
dejar secar la pastilla
21.- Adicionar 300 microlitros de TE hasta que se disuelva
la pastilla y almacenar el DNA a 4 grados centígrados
22.- Correr un gel de agarosa al 1% para verificar la
presencia del DNA
5
Aprendizaje Auto-dirigido (Independiente):
Antes de la práctica:
1.- Descargar, leer y el artículo “PROTOCOLO PARA LA EXTRACCIÓN DE ADN METAGENÓMICO BACTERIANO
DEL LANGOSTINO Macrobrachium carcinus L” de la liga: www.scielo.org.mx/pdf/tsa/v14n3/v14n3a15.pdf
La lectura realizada, será evaluada en la comprensión de los contenidos según rúbrica que se anexa.
2.- Explique
A. Lisis celular
B. Eliminación de proteínas
C. Precipitación y limpieza del ADN
Lectura en casa:
1. Después de la práctica:
2. ¿Qué aplicación ambiental tendría el ADN extraído de bacterias del suelo? 3. ¿Qué carga posee el ADN y a
que se debe?
3. ¿Para qué se usa el buffer de corrimiento TAE?
4. ¿Cuáles son las características del buffer de carga (componentes)?
5. ¿Cómo funciona el Bromuro de etidio?
6. ¿Existen otros colorantes además del Bromuro de etidio para hacer visible el ADN en el gel de agarosa?
7. ¿Por qué́ se utilizan celdas de cuarzo y no de plástico para leer ADN en el espectrofotómetro?
8. ¿Por qué́ se lee el ADN a una absorbancia de 280 para valorar su pureza? 10. ¿Qué es un marcador de
peso molecular?
Método de Evaluación
- Perera J, Tormo A y García JL. 2002. Ingeniería Genética (Vol.1): Preparación, análisis, manipulación y clonaje de
ADN. Ed. Síntesis, S.A. Madrid, España.
- Hoisington D, Khairallah M. y González de León D. 1994. Laboratory Protocols CIMMYT Applied Molecular Genetics
Laboratory. Second edition. México, D.F.:CIMMYT
6
Práctica Número: 2 Duración (mins/horas): 2 sesiones de 2 h
Materiales
Equipo:
Microcentrífuga
Cámara de electroforesis
Campana de extracción
Termobloques
Sustancias:
Medio LB (Luria-Bertani)
50 ml Cloruro de calcio 0.1 M
Actividades
BRIEFING INICIAL (20 MINUTOS) 1.- Incubar células de E.coli por 16 h en placas de agar LB.
1. Presentación e ingreso al laboratorio 2.- Transferir una colonia de E.coli a 5 ml de medio LB e
2. Diagrama de bloques incubar a 37 grados centígrados con agitación a 200 rpm
3. Socialización del propósito de Aprendizaje y/o durante toda la noche
examen rápido 3.- Transferir 0.5 ml de cultivo a 50 ml de medio LB e
incubar a 37 grados centígrados con agitación hasta que la
PREPARACIÓN INICIAL (15 MINUTOS) densidad óptica a 590 nm sea de 0.3 a 0.4 (esto es más o
1. El docente solicita a los auxiliares de laboratorio menos entre 3 y 4 horas de incubación).
con 1 semana de anticipación sus materiales 4.- Transferir 50 ml de células a un tubo de propileno frio y
2. El docente verifica que el alumno ingresó su estéril y mantenerlo pro 10 minutos a 4 grados centígrados.
solicitud de materiales con los auxiliares de 5.- Centrifugar a 6000 rpm por 10 minutos
laboratorio con mínimo 24 h de anticipación 6.- Decantar el sobrenadante
3. El docente verifica que los auxiliares de 7.- Resuspender el paquete celular en 25 ml de CaCl2 0.1
laboratorio entreguen el material a los alumnos M estéril y frio.
contra vale de solicitud y credencial del 8.- Colocar el tubo en hielo durante 10 minutos a 4 grados
responsable del equipo, posterior al briefing centígrados.
4. El docente verifica que el alumno revise que 9.- Centrifugar a 6000 rpm por 10 minutos a 4 grados
7
cuenta con el 100% de los materiales solicitados centígrados
5. El docente verifica que el alumno tenga el área 10.- Decantar el sobrenadante
de trabajo limpia y despejada 11.- Con la ayuda de una pipeta pero con extremo cuidado
resuspender el paquete celular en 2 ml de CaCl2 0.1 M
EJECUCIÓN DE LA PRÁCTICA estéril y frio.
1. Lleva los tiempos y ayuda a los alumnos a llevar 12.- Las células competentes pueden ser usadas
la cronología. inmediatamente o almacenadas por 24 a 48 h a 4 grados.
2. Provee Feedback descriptivo durante la práctica. 13.-Para periodos de almacenamiento más largos, guardar
3. Resuelve dudas durante la ejecución. en alícuotas de 100 μL en tubos estériles de 1.5 mL.
4. Promueve el buen Comportamiento del equipo 14.-Guardar la células competentes a -70oC. Las células se
durante la ejecución de la práctica mantienen viables por aproximadamente 3 meses.
5. Verifica la Entrega de material limpio y
completo.
6. Utiliza un Modelo de FACILITADOR NO
INSTRUCCIONAL.
7. Llenado de bitácora electrónica:
https://goo.gl/forms/Ep16K5pZtsuutiRE3
Antes de la práctica:
1. ¿Qué es una molécula de ADN recombinante?,
2. ¿Qué es un plásmido bacteriano?
3. Explica con qué finalidad se introduce una molécula de ADN recombinante fabricada “in vitro” dentro de un
organismo huésped
4. Indica los pasos necesarios para construir “in vitro” una molécula de ADN recombinante.
5. Referente a la Ingeniería Genética:
a. Explique qué es un ADN recombinante y cuál es la función de las enzimas de restricción
Después de la práctica:
1. Realizar el reporte de la práctica
2. Indicar ¿Para qué sirven las células competentes?, y
3. Mencione que otras sustancias pueden ser utilizadas para crear células competentes
Método de Evaluación
Sambrook, J. y Russell, D. W. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 3a ed. Ed Cold Spring Harbor Laboratories.
Nueva York. USA 2001. 2344 págs.
8
Práctica Número: 3 Duración (mins/horas): 2 sesión de 4 h
Materiales
Investigación previa
Equipo:
Autoclave
Campana microbiológica
Sustancias:
Medio de Murashige Skoog
Phytagel o Agar bacteriológico 17 g/l
macronutrientes
• (NH4NO3) 1,650 mg/l
• (CaCl2 · 2H2O) 440 mg/l
• (MgSO4 · 7H2O) 370 mg/l
• (KH2PO4) 170 mg/l
• (KNO3) 1,900 mg/l
Micronutrientes
• H3BO3) 6.2 mg/l
• (CoCl2 · 6H2O) 0.025 mg/l
• (CuSO4 · 5H2O) 0.025 mg/l
• (FeSO4 · 7H2O) 27.8 mg/l
• (MnSO4 · 4H2O) 22.3 mg/l
• (KI) 0.83 mg/l
• (Na2MoO4 · 2H2O) 0.25 mg/l
• (ZnSO4·7H2O) 8.6 mg/l
• (NaFe-EDTA) constituido en 5 mL/L de una solución madre que contenga
5.57 g FeSO4.7H2O y 7.45 g Na2-EDTA por litro.
Actividades
9
BRIEFING INICIAL (20 MINUTOS) 1. Se preparan soluciones madre (Stock) de las
1. Presentación e ingreso al laboratorio soluciones de micronutrientes y macronutrientes
2. Diagrama de bloques con el fin de que el alumno se familiarice con la
3. Socialización del propósito de Aprendizaje y/o practicidad a concentración 10X y se someterá al
examen rápido proceso de autoclave (121 grados/15 min 15 lb/).
Antes de la práctica:
1. Investigar que es la biotecnología vegetal
2. Que contienen las soluciones nutritivas para plantas
Después de la práctica:
En relación a la preparación de soluciones nutritivas, explique:
1. Importancia de la temperatura de la solución nutritiva
10
2. Investigar el método universal de preparación de soluciones nutritivas
3. Cuáles sin las Unidades de concentración de la solución nutritiva, y por qué?
4. Cuál es la Calidad del agua para la solución nutritiva
Influencia del Contenido de sales disueltas en la preparación de la solución nutritiva
5. ¿Para qué sirven el medio de Murasghige skoog?
Método de Evaluación
MURASHIGE, T. ; SKOOG, F. 1962. A revised medium for rapid growth and bioassays with tobacco tissue cultures.
Physiol. Plant, 15: 473-497.
11
Práctica Número: 4 Duración (mins/horas): 5 sesiones de 2 h
Materiales
Material:
Micropipetas de 1, 20 y 200 microlitros
Puntas para micropipeta de 1, 20 y 200 microlitros
Tubos de plástico de 5 ml estériles
Varillas acodadas
Tubos de 15 ml con solución salina (0.85%NaCl)
Cajas Petri
Morteros y pistilos estériles
Sustratos (suelo erosionado, suelo agrícola, suelo de bosque)
Tween 80
Carboximetilcelulosa
Almidon
KH2PO4
Citrato de amonio dibásico
Extracto de levadura
Carbonato de sodio
Cloruro de sodio
Sulfato de magnesio
100 ml de agar papa dextrosa
100 ml de agar soya tripticaseina
100 ml de agar saboraud
Equipo:
Microcentrífuga
Cámara de electroforesis
Campana de extracción
Termobloques
Sustancias:
Frasco de 50 ml que contengan:
KOH al 40%
100 ml de medio rojo Congo para microorganismo celuloticos
100 ml de medio Castañeda con almidón para microrganismos amiloliticos
100 ml de medio Castañeda con Tween 80 para microrganismos productores
de esterasas
Actividades
12
Para el docente/ Favilitador: Para el Alumno(s):
Tercera sesión
Cuarta sesión
13
claves taxonómicas:
Bacterias: morfología colonial y gram
Levaduras: morfología colonial, observación en
KOH al 40%
Hongos filamentosos: observación de estructuras
en KOH al 40%
Antes de la práctica:
Respecto a la utilización industrial de microbios recombinantes
1-Defina recombinante
2-¿Cómo puede obtenerse un cultivo puro?
3-¿Cómo puedo obtener un microbio genéticamente estable?
4-¿Existen microrganismos que NO sean susceptibles de manipulación genética?. Justifique su respuesta.
Después de la práctica:
1. Realizar el reporte de la práctica
En el reporte::
2. Mencione cuáles son los fundamentos de los medios utilizados para la observación de amilasas, celulasas y
esterasas
3. Mencione que es selección primaria y secundaria de microrganismos de interés biotecnológico
Método de Evaluación
14
Práctica Número: 5 Duración (mins/horas): 4 sesiones de 2 h
Materiales
Equipo:
Sustancias:
Medio CAS (cromoazurol)
Actividades
15
de trabajo limpia y despejada
Tercera sesión
Antes de la práctica:
1. ¿Qué son los sideroforos?
2. ¿Cómo se prepara el medio de CAS para la producción de sideroforos) para esta pregunta revisar el articulo
proporcionado en la bibliografía
3. ¿Cuál es la importancia de que los microrganismos produzcan sideroforos?
4. Mencione 10 aplicaciones industriales de los microorganismos recombinantes
5. ¿Cuáles son los tres tipos de sustancias producidas por las células de los microorganismos recombinantes?
Después de la práctica:
1, Realizar el reporte de la práctica
Método de Evaluación
16
Elaboró Dr. Juan Ramos Garza Contacto: Ext. 08800
17
ANEXOS
2. Ortografía
5% Excelente Bueno Regular Deficiente
-No presenta Presenta entre 1 y Presenta entre 3 y El reporte incluye
errores de 3 errores 6 errores más de 6 errores
ortografía ortográficos ortográficos ortográficos
3. Resumen y
palabras clave Excelente Bueno Regular Deficiente
5% Hubo
-En el resumen incumplimiento en Hubo Hubo
describe con sus uno de los tres incumplimiento en incumplimiento en
propias palabras requisitos: dos de los tres los tres requisitos:
en máximo 1 -En el resumen requisitos: -En el resumen
cuartilla los describe con sus -En el resumen describe con sus
objetivos del propias palabras describe con sus propias palabras
trabajo, la en máximo 1 propias palabras en máximo 1
metodología cuartilla los en máximo 1 cuartilla los
general con los objetivos del cuartilla los objetivos del
resultados más trabajo, la objetivos del trabajo, la
relevantes. metodología trabajo, la metodología
-Redacta los general con los metodología general con los
verbos en pasado resultados más general con los resultados más
-Incluye las relevantes. resultados más relevantes.
palabras claves -Redacta los relevantes. -Redacta los
relacionadas a la verbos en pasado -Redacta los verbos en pasado
práctica -Incluye las verbos en pasado -Incluye las
palabras claves -Incluye las palabras claves
relacionadas a la palabras claves relacionadas a la
práctica relacionadas a la práctica
práctica
4. Introducción
15% Excelente Bueno Regular Deficiente
-Realiza una -Realiza una -Realiza una - La revisión
revisión revisión revisión bibliográfica es
bibliográfica donde bibliográfica bibliográfica incongruente al
plantea completa donde incompleta tema y no se
ordenadamente el plantea - o no incluye las incluyen las
18
tema de desordenadamente referencia referencias
investigación, su el tema de bibliográficas o bibliográficas o
importancia e investigación (no hemerográficas en hemerográficas en
implicaciones se cumple la regla el texto el texto
partiendo de lo de lo general a lo
general a lo particular),
particular. - o no incluye las
-Incluye las referencia
referencia bibliográficas o
bibliográficas o hemerográficas en
hemerográficas en el texto
el texto
10.Resultados
15% Excelente Bueno Regular Deficiente
-Recopila y ordena -Recopila y ordena -Recopila y ordena -No presenta los
los datos los datos los datos resultados
obtenidos obtenidos obtenidos obtenidos
presentándolos en presentándolos en presentándolos en
párrafos, cuadros párrafos, cuadros párrafos, cuadros
o gráficos o gráficos pero no o gráficos pero no
19
claramente los identifica los identifica
identificados. claramente claramente
-Incluye las -O no incluye las -No incluye las
fórmulas y fórmulas y fórmulas y
sustituciones sustituciones sustituciones
empleadas empleadas empleadas
11. Análisis de
resultados Excelente Bueno Regular Deficiente
20%
-Interpreta y -Interpreta y - Interpreta y -No Interpreta y
analiza los analiza los analiza los no analiza los
resultados resultados resultados resultados
obtenidos obtenidos pero no obtenidos pero no obtenidos
comparativamente comparativamente comparativamente -Ni tampoco indica
con la bibliografía con la bibliografía con la bibliografía las aplicaciones
consultada -Indica consultada consultada teóricas
las aplicaciones -O no indica las -No indica las
teóricas aplicaciones aplicaciones
teóricas teóricas
12.Conclusiones
20% Excelente Bueno Regular Deficiente
-Redacta con sus -Redacta con sus -No redacta con -No redacta las
propias palabras si propias palabras si sus propias conclusiones o las
se cumplen o no se cumplen o no palabras si se copia de textos
los objetivos en los objetivos pero cumplen o no los
base al análisis de no considera objetivos
los resultados completamente el -o No considera el
análisis de los análisis de los
resultados resultados
13.Referencias
5% Excelente Bueno Regular Deficiente
-Presenta por lo -Presenta menos -Presenta menos -No presenta
menos 3 de 3 bibliografías de 3 bibliografía bibliografía
bibliografías consultadas consultada, sin
consultadas, en - o no las presenta orden alfabético ,
orden alfabético , en orden alfabético - o no sigue el
siguiendo el - o no sigue el formato APA
formato APA formato APA
20
ANEXO 2: REPORTE DE PRÁCTICA
21
22
23
24
25
26
27
28
ANEXO 3: SOLICTUD DE REACTIVOS Y MATERIALES
29
ANEXO 4: RÚBRICA DE COMPRENSIÓN LECTORA
Identifica
4 Reconoce el contenido del texto, a través de los personajes principales y secundarios, escenario y hechos.
3 Reconoce el contenido del texto, a través de los personajes principales y escenarios
4 Reconoce todos los personajes principales y hechos del texto
1 Tiene dificultades para reconocer el contenido del texto
Interpreta
4 Atribuye significación a hechos, espacios y personajes principales y secundarios en función a contextos
externos
3 Atribuye significación a hechos y espacios y en función a contextos externos que presenta el texto
2 Atribuye significación de lo que representan los personajes en el texto
1 Atribuye con dificultad la totalidad del significado del texto propuesto.
Resume
4 Expresa y sintetiza lo importante y resaltante del texto para poderlo trasmitir
3 Expresa las ideas principales del texto y lo trasmite a través de un cuadro sinóptico utilizando sus propias
palabras
2 Expresa fragmentos del texto copiándolos literalmente.
1 Muestra dificultad para sintetizar el texto dado y expresarlo con sus palabras.
Análisis
4 Disgrega el contenido del texto explicando la relación entre sus componentes y sucesos para emitir un
juicio propio.
3 Disgrega el contenido de un texto explicando la relación entre sus componentes y emite un juicio propio.
2 Disgrega el contenido de un texto explicando la relación entre sus componentes sin emitir juicio propio.
1 Disgrega con dificultad el contenido del texto, así como la relación de componentes entre sí y no emite
juicio propio.
Infiere
4 Emite conclusiones que no están expresados literalmente en el contenido del texto.
3 Emite conclusiones.
2 Emite conclusiones del texto copiándolas literalmente del texto propuesto
1 Emite con dificultad las conclusiones del texto propuesto copiando literalmente partes del texto propuesto.
30