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Termodinámica Termoquímica
Estudia fenómenos inheren se encarga del estudio del
-
Energía capacidad de un
: sist .
=
MOV ,
calor , trabajo
Energía interna / v1
Esta suma de :
Energía potencial +
Energía cinética
[ como la qrauedad [
trabajo
sistema + entorno -
_
universo
•
Adiabática :
No conduce el calor •
No adiabática Diatermia : conduce el calor
Funciones de estado
Presión -
volumen -
Temperatura -
energía interna -
entropía -
Gibbs
AH Entalpía AH -
-
H productos -
H reactantes
AH < O exotérmica
AH > O endotérmica
Si AH es
-
Productos tienen menos energia que reactantes
• ☐
La reacción libera calor A = diferencia
→
Reacción exotérmica
AS Entropía
•
Es el grado de desorden y desconocimiento de un sistema .
•
as > °
A S < O
.
.
"
A S
>
<
°
O
.
¥É☒%
D8 Energía Libre de Gibbs
Permite predecir si una reacción ocurrirá cuando se mezclen los reactivos en condiciones
especiales ( T , presión concentración)
°
, ,
i
'
-
- -
G
- - -
=
- - - - -
-
- - - -
S- -
'
•
Si _
G < O ☐
El proceso es espontáneo reacción exerqónica
•
Si 6=0 ☐
El sistema está en equilibrio estable
•
Si G O ☐
El proceso es NO espontáneo reacción en derqónica
Metabolismo
Metabolismo
MUHARRAM
Es el conjunto de reacciones bioquímicas que están involucradas en
degradación o biosíntesis .
CATABOLISMO •
Es un conjunto de reacciones que van a degradar lo que
consumimos .
•
En el proceso catabólica oxi damos esto quiere decir que . perdemos
electrones .
•
Se obtiene CO2 . Ha 0 . NHZ ( depende del animal )
•
AG < O
ANABOLISMO •
Procesos de reducción esto significa que está ganando electrones
,
•
conjunto de reacciones para construir macromoléculas como :
-
lípidos
-
carbohidratos
-
Ácidos nucleicos
•
NO es espontáneo , AG > O
Bio energética • ☐
Termodinámica
R
p
•
Metabolismo "
Anabolismo F- Catabolismo
Anabolismo
•
Síntesis o construcción de moléculas
•
Se obtienen moléculas grandes a partir de otras más pequeñas .
enderqónico )
•
Moléculas finales son más energéticas que las iniciales
•
El proceso procede con una variación de energía libre positiva (Abt)
•
Por lo general son reacciones de reducción (ganancia de electrones)
energía .
?
¡ RECUERDA !
i-rir-osr-o.io
La hidrólisis del enlace Fosfo anhidro altamente exerqónica / AG -31kg / mol) Parte
"
es =
.
derramada el enlace
-
"
en
,
y que sea asi ayuda a que sea estable y pueda guardar mucha energía .
Entonces en el Metabolismo
El Anabolismo es :
•
Requiere energía , generalmente en Forma de ATP y de mó .
con poder reductor .
"
e- parecida
Kj /no 1) comparación con
en
-
libera mucho
menos
energía
Por cada enlace Fosfoan -
O aproximadamente .
Adenosín monofosfato
se rompen 2 enlaces
Fosroan hidro
Catabolismo
•
Degradación de moléculas
•
Se obtienen moléculas pequeñas a partir de moléculas grandes
•
Disminuye el n° de enlaces , por lo tanto se debe liberar energía ( proceso exerqónico)
•
Moléculas finales menos energéticas que iniciales
•
Proceso procede con una variación de energía libre negativa (AG )
-
del oxigeno, el carbono practicamente perdió sus e- O sea que el carbono tiene E. O = +4 Oxidado .
CÉ
-
H es 1-4 ← reducido
No toda la energía del catabolismo es oxidada, también se libera como calor (es .
calor corporal ,
Entonces en el hretocbolisauo
El Catabolismo es :
Una fase de qradativa del metabolismo en la que las moléculas orgánicas de los nutrientes
( carbohidratos , grasas y proteínas) se convierten en productos finales simples / Es : ácido táctico ,
CO2 ,
NH })
•
Se libera energía la cual , es conservada en Forma de ATP , en correa dores de e- reducidos
( NADH ,
NADPH y FADH a) , y el resto se pierde en calor .
Reducidos Oxidados
- ,
CAT AN A
NADT ☐ NADH ☐ NADT
' AT ANA
FAD is
NADH ☐
FAD
•
son las rutas principales desde el pto de vista cuantitativo ,
o sea ,
las que más producen energía
Reacciones acopladas
Desde el pto de vista metabólico , hay reacciones que necesitan mucha energía para poder
ocurrir .
Un ejemplo es la
Sola requiere mucha energía , por lo tanto se acopla a otra
glucólisis ,
reacción que seria la Fosforilación de la glucosa Esto significa que la molécula se une .
a
"
Para formarse esto necesita energía , así que ocurre rompimiento
de ATP de 1 fosfato lqraf .
reaction 2) y esto ocurre
SÍ , /no , ,
" En el de la glucosa el
caso
•
Cuando ocurre esto ,
los AG se suman .
•
Esto le ocurre a todas las reacciones energéticamente imposibles
1. Los grupos fosfatos a pH 7 están ionizados Como las membranas celulares son .
impermeables a los compuestos con carga los compuestos Fosforilados NO pueden difundir ,
electro estática que permite que dos especies se mantengan unidas formando una Única
especie .
Fase 2 Los .
monómeros son degradados por procesos específicos hasta acetil-CoA .
Se produce
algo de AFP . GWCO lisis ,
b- oxidación transaminación
, .
Fase 3 : El acetil-CoA esoxidado hasta Co2 y Hall , originando gran cantidad de NADH
( poder reductor ) y ATP Ocurre en la mitocondria También se genera ATP en la fosforilación
. .
oxidativa .
Ciclo de Krebs
También llamado ciclo del ácido cítrico o ciclo de los ácidos tri carboxílicos .
Rutas Anfibolitas
Es una ruta que se comporta como catabólica y anabólica .
El ciclo de Krebs se considera anfibolita porque sus primeras reacciones son oxidativas
gluconeogénesis .
-
Gluconeogénesis es anabólica
¿ Qué
•
Se clasifican en anabólicas ,
catabólicas o antibióticas .
Las vias antibióticas pueden funcionar como anabólicas o catabólicas según sus necesidades .
2 .
Casi todas las reacciones del metabolismo son reversibles , que puede ocurrir
o sea , en una
dirección para obtener productos , pero ellos se pueden mover para hacer más .
4 .
Algunas rutas están relacionadas con otras ( entrecruzadas )
Un metabolito es uno de los compuestos que se va produciendo entre medio , este puede
intervenir en una ruta o en otra según necesidades de la célula .
• Control de compartimentación
• Control hormonal
Enzimas
Son catalizadores biológicos ,
También llamados catalizadores positivos
•
Son de alta especificidad
•
Moléculas de RNA catalíticamente activas
•
La catálisis tiene lugar en sitios específicos
•
La mayoría son proteínas
•
Alrededor de la cuarta parte de los genes del genoma humano codifican enzimas
•
La energía catalizadora no depende de Gibbs .
a-
es espontáneo
| pero no rápido
I
Í S → P ocupa
!
alta energía para
hacer producto
p→s mucha t
energía .
S :
sustrato ! →
barrera energética El camino que tiene recorrer una molécula para
P =
Producto Energía de transición ,
llegar a producto se llama mecanismo de
estado de alta energía .
reacción .
dipolo
dipolo-dipolo
→
No son enlaces qcos ,
son más débiles ión -
ión
y sensibles London
-
De Van der Waals
•
Complementariedad geométrica .
→ llave cerradura
-
ajuste inducido
•
Complementariedad electrónica → Deben ser complementarios
tanto geométricamente como
electrónicamente en el
sitio activo
Modelos de especificidad
Ode / o de llave
"
Modelo de ajuste inducido -
cerradura
" "
Fe
"
•
Iones metálicos →
, Mg ,
la ←
tmbn llamados grupos
prostéticos
( orgánicas /C. H )
oenqimas estructuras
• →
,
o
también se •
losustratos
divide en
→
2 qrupos
•
Grupos prostéticos
µ
La enzima toma distinto nombre si está o no con su cofactor .
Ejemplos de coenzimas
coenzima A =
transfiere grupos Acilos (orgánicos) .
Parte de muchos complejos enzimáticos .
centro activo
Todas las enzimas tienen una estructura enorme pero solo Un sector de la enzima es el
,
Nomenclatura de enzimas
El nombre sistemático de una enzima consta de 3 partes :
1. -
El sustrato preferente
2. -
"
Terminación
"
3. asa
-
Ejemplos :
Peptidil -
L camino acido hidrolasa
-
.
→
transformar grupo fosfato con isómeros .
Cada enzima puede ser identificada por un código numérico encabezado , por las letras EC
lenzyme Comission ) seguidas por cuatro números separados por puntos
, .
3. El 3.ro y 4to se refieren a los grupos químicos específicos que intervienen en la reacción .
Ejemplo
✓ ↳ todas encargan
las enzimas que se
todas las enzimas que
de formar nuevos enlaces .
→
transfieren grupos Ht
Man .
de adición
E) EMPLO 1 . Oxidorreductasas E. C 1 .
120 Subclases )
reacciones de oxido reducción .
IÉ
Es
Q
no oxida a
÷
reduce €
EJEMPLO 2 .
Transferasas E. C 2 ( 9 subclases )
transferido al piruvato .
Producto
se llama al arina y el que no tiene
amino se llama alfa
cetoglutarato
grupo
EJEMPLO 3 .
Hidrolasas E. C 3 111 subclases )
§
catalizan reacciones de hidro lisis .
GRUPO 4 .
Liasas El 417 Subunidades)
ce
•
De adición de un grupo a un doble en la
•
De eliminación de un grupo creando un doble enlace .
GRUPO 5 .
IsomerasaS E. ( S ( 6 Subclases)
GRUPO 6 .
Lipasas E. 1 6 15 Subclases )
:
Deshidrogenasas -
Oxidasas -
oxigenasa
-
reductasa s -
per oxidasas
•
Isomerasa
-
.
:-[ pimerasas -
mu tasas
i.
transcarboxilasa transaminasas trans meti tazas
- - •
Lipasas
-
Catalizan Formaciones de enlace entre 2
•
Hidrolasas sustratos , con energía aportada por la
:
Esterasas -
fosfatasas -
peptidasas
unidad de tiempo .
•
Temperatura
La actividad enzimática de una enzima es
• PH del medio estrechamente dependiente de la integridad de la
enzima O sea la enzima mantenga estable
, que.
Basta que la enzima pierda su integridad levemente para que esta deje de funcionar de
manera correcta .
°
•
La integridad de una proteina depende principalmente de la 1- y el pH .
•
La pendiente del gráfico corresponde a la Minimal V0
Cuando hay una cata tisis enzimática la reacción no es lineal A medida que se aumenta el , .
sustrato se llega a una etapa donde esta deja de aumentar y empieza a mantenerse y tener
pendiente cero .
Esto sucede porque llega un momento en el que todas las enzimas están saturadas con tanto
sustrato , por lo cual la P no aumenta más .
Para que una enzima cala Iice y forme producto es necesario que
se forme el complejo encima sustrato -
-
1. -
El completo E S
la concentración
-
E S
se
-
encuentra
([E -
s] ) es
en estado estacionario ,
constante en el tiempo .
o sea , que
| susto la
km
mitad
2 .
-
Ecuación de Michaelis -
brenton
V0 =
Vmax • IS ] Vmax :P máxima
km +157 Vo : Ñ inicial
[S] concentración sustrato
:
[
.
.
la enzima , inmediatamente
después de que se ha puesto Recuerda I .
1 =
km • + 1- → para las enzimas que obedecen a la relación de Michaelis -
- - - -
y
=
m . × t n
por el sustrato
}-
tiene la afinidad
☐ - tiene P Afinidad
Constante catalítica
Tiempo molécula de enzima para que
"
necesario que necesita una
"
recambio una molécula de sustrato
o número de sustrato re cambiada por molécula de enzima por segundo .
Kcat =
Vmax / [ Et]
•
Kurt es también conocida como número de recambio
Temperatura
La temperatura a la cual la actividad
catalítica es máxima se llama temperatura
Optima .
Cant .
de temperatura ya la enzima se desnaturaliza .
Efecto del pH
PH Óptimo
pH en el cual la conformación será la más adecuada
para la actividad catalítica .
} Cuánto se desvía
Yo
1 = recta perfecta KM 1 £
+
0,3025-1-+0,0%1
%
=
.
☒ =
-
Vmax
- - Vm [ S]
KI Y m X t
= .
n
Vmax
[S] Vi
% 0,5 O
luego despejar
¥ ( independiente)
km despejar ecv recta para km
O
= .
0,7
concentración de sustrato
y O
Q 3243 →-
1 013243
¥
Km 3, 083¢
=
0 km + :
0,0981 -0,3243/1 1¢, ÷
→
0,3025 -0,0981
-
= =
.
→ :
0,3025 =
m
Una reacción catalizada por una enzima tiene un Fin de 1m y una Vmax de 5mm S
"
.
Cuál es la velocidad
de la reacción cuando la concentración del sustrato es :( s] )
) 0,25mm
1=1%5 #
1
a →
.
+1
b) 1,5mm Vi " Vmax
c) 10mm
A) 1 =
1mA
5AM
¡ "
• 1- + 1-S = 0,2s
'
• 4mm +
0,2mm = /NMS =
} =
1
✓¡
0,25nA 5mm
B) = 1AM S • 1 + 1- S = 0,2s .
0,66mA 0,2 MMS =
0,332 MMSD 1 :O, 332=3,01
5mm 1,5mm 5mm
c) 1- =
1 MMS • 1- +
1 S = 0,2s
'
0,1+0,2 =
0,22
Vi g- MM 10 MM 5mm
Vmaxxtst
=
V0
→
km +
[ S]
Glucólisis
ftp.ggzgg
Gozosamente
Karmakar
•
Rompimiento de q lúcidos los hidratos de carbono , van a ser metabolizados a través de esta
ruta
>
poder reductor
>
produce intermediarios para otras rutas metabólicas
Los residuos de la glucólisis pueden generar más energía , pero a base de otros mecanismos .
( 6 H 1202
•
Resultado de la glucólisis NADH TLATP
•
Deshecho de la qluwlisis : 2 piruvato s
cada piruvato tiene 3 átomos de C
Cantidad de
.
•
reacciones : 10 reacciones
•
Se producen LATP por glucosa mediante ,
•
Se genera poder reductor
•
Enzima marcapaso : FFQ -1
liberando poco a
poco en estas 10 reacciones , de
•
El piruvato puede seguir siendo degradado Para que haya glucólisis debe haber
NAD + , y el NAD+ se genera a través
En condiciones aeróbicas piruvato : se transforma del metabolismo del piruvato .
1 , 3 y 10 .
alcohólicas)
convierte piruvato a
etanol .
GIUCÓIISIS SE DIVIDE EN 2
Etapa 1 : •
1 eras 5 reacciones Etapa 2: •
Últimas 5 reacciones
•
Fase de inversión de energia
•
Fase de generación de energía
•
Es una reacción de fosforilación C primario
•
•
Es IRREVERSIBLE
C Secundario
¥ c. terciario
-
Es más fácil que reaccione un alcohol primario que un secundario para hacer una reacción de
sustitución OH qr P
→
.
Reacciones irreversibles implican necesariamente que una enzima inhiba y así otra enzima
Al ser una reacción irreversible , la célula la puede regular dependiendo de las necesidades de
esta .
Pide "
prestada
"
energía , por eso es una reacción de inversión .
AÍP →
ADP
}
131K /mol )
ATP ADP Pi
} reacción aclopada
→ +
es una
Pi + Glucosa → Glucosa b - -
pi
Glucosa Fosfato queda cargada negativamente por lo que ayuda a la célula a que no
-
b- ,
pueda difundir a través de la membrana plasmática ( porque también es negativa por los
fosfolípidos ) .
•
Es Reversible Grupo Funcional
grupo
hemiacetal
Al reversible
/ y
nemicelal
•
ser no puede ser una real .
de regulación .
•
Pasa de ser hexosa a celosa
•
También usa de cofactor al Mqzt
•
Enzima que cataliza la reacción
de qlu b pi a fructosa b pi es
- - - - / someros → misma fórmula molecular ,
la Fosfohexosa isomerasa distinta distribución .
-
↳ ¡ g. mamá. . . .. .. . ¡ µ. www.e.aam.m.nawn.ma.u.am .
mediante la presencia de la enzima grupo funcional ,
ocurre en Cr y Cr
FOSFOQIUCO isomerasa ( EC 5. 3. I. 9)
.
(1 C secundario
pasa de ser a uno primario
• AG positivo / esto ayuda que sea reversible )
se forma un alcohol primario para *
Glucosa -
6- Fosfato tiene un alcohol secundario
Un rompimiento de ATP ,
nuevo
• Reacción Irreversible
Fructosa 1,6 -
bifosfato es
•
Se Fosforila CI
4ta reacción Fragmentación aldólica de la Fructosa -1,6 Pi -
Fragmentación aldólica de la
Fructosa 1-6 Fosfato
•
Reacción reversible
• AG positivo
Desde esta reacción hacia adelante todo ocurre ✗ 2 ( por las 2 mó Formadas)
,
.
Es reversible
OF
•
•
Solo reacciona la dihidroxiacetona
fosfato ,
porque la reacción 5 es
donde se transforma la dihidroxiacetona
fosfato en gliceraldehído 3- Fosfato
( se cambia grupo carbonilo del 2 al
1er carbono )
1- auto meros → son 2 isómeros que comparten el mismo grupo funcional (del carbono que está
en el centro -
Carbono 2- al (1)
✗ 2
Gta reacción Generación del primer compuesto de alta energía
inorgánico y nuevamente
otro grupo fosfato
se une a la mó .
) u
energía .
•
Reacción inversa
(
• Reacción tiene AG negativo porque se rompe
un enlace fosfato
•
Grupos que transfieren fosfatos se les llama
quinasas ,
en este caso fosfoglicerato quinasa
Reacción reversible
}
• Reacción Irreversible "
•
Pto de control más importante
•
se usa como cofactor al Mqtz y Fit
• Se transforman 2 ATP
Productos
Se empieza con :
Glucosa + 2 ADP + 2 Pit INAD → 2 piruvato s t 2 ATP + 2 NADH 1-2 H + 2hr0
¥Éa ntes .
Se obtiene : =
AG = -
96,2 K
, 1m01
( condiciones intracelulares )
Enzimas !
Consume ATP
Hexoquinasa y Fosfofructoqvinasa
Produce ATP
Fosfoglicerato quinasa y piruvato quinasa
Produce NADH
Gliceraldehído 3- Fosfato -
deshidrogenasa
-
Hexo quinasa ( paso 1)
-
Recuerda ! -
Se necesita NAD +
para que funcione la qwcolisis ruta anaeróbica
~
lactato genera NADT , en los animales se R .
anaeróbica
cuando hay Falta de oxígeno
genera
Ocurre en el citoplasma
Reacción num .
lo de la gluconeogénesis usa
en el higado
y en el riñon
o ingerida en la dieta se