Teórico 7: Química: Biosíntesis de Ácidos Nucleicos:

¿Qué es lo que nos hace seres humanos?

Desde el punto de vista químico…

● nuestras 4 biomoléculas constituyentes
● como están dispuestas en nuestro organismo
● los cambios que sufren esas biomoléculas — constituyen el metabolismo

…todo esto está determinado por nuestros genes

➔ todas las proteínas que se sintetizan en nuestro cuerpo van a estar determinadas por
nuestros GENES
➔ está codificado en nuestro ADN (el reservorio de l info genética) → las instrucciones
para sintetizar los diferentes organismos

Nuestro GENOMA → todo el ADN

Características:

Tamaño:
● 3Gb ( 3 mil mega bases)
● 3 mil millones de bases
● 6gB de Nucleótidos (para las 2 cadenas, normalmente sólo se hace referencia a 1)

mayor número de genes… mayor complejidad?

NO
❖ nuestro genoma no es el más grande pero si el mayor complejidad

el pez pulmonado australiano tienen 43 Gb

una ameba tiene 200 veces más ADN que nosotros pero mucho MÁS simple

Células Procariotas:
a mayor complejidad + mayor tamaño de ADN

Celulas Eucariotas:
no hay ningún tipo de correlación entre TAMAÑO Y COMPLEJIDAD

Similitud:
➔ 99% similar a genoma del chimpancé
 ◆ 1% – representa 30 millones de diferencias
➔ 99,9% similar entre tros humanos
◆ 0,1% son 3 millones de diferencias (de bases distintas)

Genética Molecular:
“lo que se cumple en E coli se cumple en el Elefante”

¿Qué quiere decir esto?

➔ siempre encontramos cierta similitudes genéticas
➔ osea somos totalmente distintos pero tampoco tanto…

Proyecto Genoma Humano:

el conocimiento de la secuencia de nuestro genomas es algo que se viene investigando por
varias décadas

● con la tecnología hemos podida

desarrollar este estudio
● alrededor de 3000 personas
involucradas

linea del tiempo:

➔ 1944 se demuestra que el ADN es

el material hereditario
➔ 1953 Watson y Creek
➔ 1982 Datos Genbank
➔ 1990 Comienza el proyecto de
Genoma Humano
➔ 1995 Primer genoma de una bacteria (H.INFLUENZAE)
➔ 1997 Genoma de E.Coli
➔ 2001 se publica el borrador del genoma humano (se completó el 90%)
➔ 2022 se publica el genoma humano completo (el otro 10% que faltaba)

Actualmente en National Library of Medicine:

National center of Biotechnology Information:
➔ podemos acceder a los genomas humanos, ya nos presentó varios recursos para
consultar el genoma
➔ los secuenciamientos de ahora son de la nueva generación y lo que puede leer hasta
100 mil pares de bases de una sola vez
➔ mientras que la sotras generación sólo alrededor de 700 pares de bases

Organización el Genoma Humano: ( ser pluricelular)

Cantidad:
● La cantidad de ADN es la misma en cada célula somática → células diploides (2n)
● Las células sexuales → son haploides (1n)

Cromosomas: ahí se almacenan la información

cada cromosoma autosómico tiene su par pero no son idénticos

ADN codificante:
2%: El ADN que comanda el sintesis de proteinas

El ADN no codificantes:
➔ 24%: intrones
➔ 42%: transposones y retrotransposones
➔ regiones intergénicas (reguladores, los que separe un gen de otro)
➔ pseudogenes (no se traducen a proteínas)
➔ secuencias repetitivas → repeticiones en tándem (uno a lado de otro ) y repetición
intercaladas (aleatorio)

El Dogma Central de la Biología:

que es un dogma → algo incuestionable

Creek estableció lo siguiente:

“del ADN de nuestro genoma, una parte del ADN se copia a una molécula de ARNm y esa
molécula de ARNm se traduce a una cadena polipeptídica que presenta una secuencia
primaria de proteína”

1. TRANSCRIPCIÓN: pasar del ADN a ARN

2. TRADUCCIÓN: pasar de ARN a una cadena
polipeptidica
a. pasar del idioma de los nucleótidos a
los aminoácidos

Gracias a este proceso tenemos sintesis de proteinas

como; hormonas, enzimas, canales, estructuras, etc.
→ muchisimas funciones

pero NADA ES INCUESTIONABLE entonces hay casos donde esta regla no se cumple
donde el ARN pasa a ADN o ADN o proteínas.
GEN: porción de ADN que dirige la síntesis de distintas especies de ARN (r,m,t,otros)
● 21.000 en los humanos

Duplicacion de ADN: (solo a nivel del núcleo)

Ciclo celular: regulado por ciclinas y quinasas

dependientes de ciclinas
● las ciclinas comando cuando esta célula se va
activar para poder dar dos células hijas
● las quinasas son enzimas (transferasas) activa
otras enzimas que llevan a cabo funciones que
permite que se lleve a cabo el ciclo celular

G1: preparación para la síntesis de ADN — nucleótidos,

enzimas y factores
◆ CRECIMIENTO CELULAR

S: replicación o duplicación del ADN

( aumentan la cantidad de histonas)
G2: preparación para la mitosis — tubulina, organelas para dar la mitosis
Mitosis: División de ADN
◆ dos células hijas genéticamente iguales y misma cantidad de ADN
G0: Estado no proliferativo
◆ una célula terminalmente diferenciada
◆ o algunas pueden luego de un tiempo volver a G1

vamos a ver que este ciclo está muy regulado… y cuando no… puede ser fuente de tumores
 Duplicacion del ADN:

este procesos involucra la duplicación de TODO EL MATERIAL GENÉTICO

Características:

1. “secuencial y bidireccional desde puntos fijo”

➔ Secuencial: empieza en un punto y avanza hacia una dirección

➔ Bidireccional: va a amabos lados (dos direcciones) a partir del punto de origen (D y I)

Origen de Replicación: lugar del ADN donde comienza el proceso de replicación

en los cromosomas bacterianos tiene un solo origen de replicación
en los cromosomas humanos hay + orígenes de replicación → 30-50 mil y lo hacen de
forma simultánea → para poder acelera el proceso de la replicones y que sea una síntesis
ORDENADA
Secuencias ricas en A-T : esto es así porque es más fácil romper enlaces de hidrógeno entre
A- T ya que son 2 vs. entre los de G-C que son 3

2. complejo de reconocimiento de proteínas

3. complejo de mantenimiento del minicromosomas
○ se forma una burbuja de replicación con 2 horquillas que avanzan a sentido
opuestos
○ las horquillas tiene forma de Y

4. Replisomas:
● Conjunto de Enzimas y Proteínas que llevana cabo de la duplicación del ADN
Enzimas:
➔ Origin Recognition Complex (ORC)
◆ reconoce y se une a la ORI y esté fija a las demás proteínas
➔ Helicasa: separa las hebras de ADN, abren y rompen los puentes de hidrógenos
◆ lo hace con uso de ATP
◆ el fase S se activa por la ciclina quinasa
➔ Topoisomerasas
◆ alivia las tensiones por enrojecimiento al cortar las dos hebras
◆ esa molécula de ADN, al separarse, se va a querer superenrollado lo cual no
ayudaría el proceso
◆ entonces la topirisomes pueden cortar 1 hebra ( tipo I) o las dos (Tipo II
girasas)
➔ SSB/RPA
◆ proteínas que se fijan al ADN monocatenaria para evitar que se rascon
 ◆ los puentes de hidr frenos van a querer unir los puentes de hidrógenos,
entonces estas proteínas lo impide
Proteínas:

➔ ADN polimerasa
◆ catalizan la formación de la nueva hebra de ADN
◆ emplean dNTP (desoxinucleótido trifosfato) como sustrato y como fuente de
energía
◆ actúan sobre una cadena molde, insertando los dNTP por
COMPLEMENTARIEDAD
◆ a partir de una molécula de ADN y entonces tenemos dos cadenas moldes —
dos cadena complementarias — por lo tanto una nueva MOLÉCULA DE
ADN
◆ solo elongan sobre una cadena preexistente
◆ no pueden actuar a partir de un punto cero, si no que necesitan que ya haya un
nucleos previo — elongan
◆ catalizan la formación de la cadena en sentido 5´→ 3´ osea que leen la
cadena de en sentido 3´→ 5´
➔ ARN Polimerasas:
◆ catalizan la formación de una nueva hebra de ARN
◆ emplean NTP como sustrato que también proveen energia
◆ actúan sobre una cadena molde insterant los NTP por complementariedad
◆ usando uraci la, citosina y guanina (del ADN)
◆ calatalinzan de 5 → 3´(leen al reves
◆ NO NECESITAN CADENA PREEXISTENTE

Enzimas que se utilizamos post separación de hebras:

➔ Primasa: ARN POLIMERASA.
◆ sintetiza un primer CEBADOR, es una cadena de 10 nucleótidos
complementaria a la cadena molde – esto permite que el ADN pueda actuar
◆ ADN polimerasa a
◆ Continúa la síntesis de la hebra complementaria de 20 nt.
◆ luego esta se entiende
➔ Factor C de Replicación
◆ expresan el complejo de primasa.pol alfa y el PCNA
➔ el PCNA: antígeno nuclear de celular
◆ es una proteína que tiene la función de fijar la ADN Polimerasa D que
continúa este proceso de duplicas

➔ ADN POLIMERASA;
◆ continúa la síntesis de la hebra complementaria
◆ alta procesividad
 ◆ tiene actividad exonucleasas → si una base esta mal apareada, alguna
polimerasa pueden cortar los fosofidesietar de ambos lados y poner la que
corresponde
◆ vamos a ver que la replicación de adn hay fragmentos de arn por la primasa
◆ entonces tenemos que corregir esos nuelcetios de ARN para que sea purnam
tne ADN
◆ entonces viene la ribonucleasa: hidroliza los enlaces fosfodiester del cebador y
se eliminan así esos nucleótidos
◆ ahora queda un hueco
◆ y entonces viene el ADN polymerase delta o epilsion
◆ que sintetiza la hebra complementaria de ADN para rellenar el “hueco” del
primer

➔ ADN Ligasa:
◆ une el extremo 5´y 3´del fragmento completado con enlaces fosfodiéster
◆ también utiliza ATP
◆ y forma una cadena continua complementante de ADN, igual a la origInal —
precisa

5. “Semidiscontinua”
HEBRA LÍDER VS RETARDADA
vamos a tener dos hebras

líder (sup):
● queda en sentido 3´→ 5´desde el origen de replicion
● usa 1 cebador

retardada (inf)
● queda en sentido 5´→´3, el sentido opuesto al que las ADN polimerasa leen
● entonces cómo se soluciona?
● se leen en pequeños fragmentos de 200 nt y se les llaman fragmentos de Okazaki
● utilizamos muchos cebadores

Fragmentos de Okazaki:
➔ las polímeras solo sintetizan 5´→ 3´ libre entonces necesitan leer de cómo la hebra
inferior se encuentra en sentido 5´→ 3´, se le hace muy difícil a esas polimerasas
poder leer la cadena
➔ entonces se desenrolla hasta 200 nucleótidos y ahí agrega un primer para que
tenga una orientación correcta de 3´→ 5´… es como que se dan vuelta
➔ y ahí entonces la polimerasa pueden leer pero lo hacen en pequeños fragmentos y por
eso se utiliza muchos primeres
 6. Semiconservador:
➔ cada hebra sirve como guía para generar una nueva cadena que será complementaria y
antiparalela
➔ a partir de 1 molécula de ADN género → 2 iguales: cada una contiene una hebra
vieja y una nueva

El problema de los telómeros:

● los cromosomas humanos son lineales
● en el extremo 3´quedará un cebador que será eliminado, sin poder rellenarse con
ADN →acortamiento de los cromosomas
● vamos a ver que esto es un problema especialmente en las células con alta actividad
mitótica

ADN de los telómeros es repetitivo, no codificante: TTAGGG

telomerasas:
● ribonucleoproteínas con función enzimática

➔ la adn polimerasa dependiente de ARN

➔ no está activa en todas las células
➔ parte proteina y parte de arn
◆ la parte de arn: está inserta en la telomerasa y tiene la secuencia
complementaria de la relación y se sitúa en el extremo y es una adn polímeras
que genera una secuencia complementaria del adn, lo cual extiende a esa
cadena a la cual le falta una parte
➔ siempre va a quedar un fragmento desapareado pero no sufre un acortamiento porque
vienen las telomerasas

Reparación del ADN:

● 10-100 mil millones de células

● 3 mil millones de bases
● la replicación del ADN es expediente precisa
 ● además hay mecanismo de reparación

● algunas polimerasa tiene enizma exonucleasa para poder permitir que esta copia sea
lo más precisa posible
● cortan las bases que están mal apareadas y la sacan y luego forman una hebra
complementaria

1/ mil millones → tasa de errores que cometen las polimerasa delta, gamma y epsilon
de todo nuestro genoma sólo pueden cometer 3 errores!!!!

Daño al ADN:
agentes: Luz UV, radiaciones ionizantes, especies respectivas al oxígeno

Transcricpion:

si todas las células del organismo tienen los mismos contenidos genéticos…

¿Cómo es que una neurona sea diferente de un hepatocito?....

porque vamos a ver que cada uno tiene distintas PROTEÍNAS ASOCIADAS…
● cada uno expresan distintos GENES para generar distintas PROTEÍNAS
● de los 21 mil genes que tenemos en nuestro genoma… van a dar origen a ciertas
proteínas → ciertas vías metabólica → así distintas funciones
● una neurona y un hepatocito no codifican los mismos genes ya que esta no cumplen
las misma funciones y entonces requieren distintas PROTEÍNAS

Transcripcion del ADN:

Sintesis de ARN

Similitudes con sintesis de ADN:

1. enzimas: arn polimerasa (dependiente del ADN)
2. lugar: núcleo celular
3. sentidos: de síntesis de 5´→3 entonces se lee la hebra de 3´→5´

Diferencias con sintesis de ADN:

1. sustrato: son nucleótidos trifosforados CTP,GTP,ATP,UTP → proveen la materia
prima u la energia
2. hebra: es un proceso asimétrico
 a. se hace solo 1 copia de la hebra anti densitido o NO CODIFICANTE, la
hebra que no se copia es la codificante !!!!!! → porque como la copia que se
hace este molde es complementaria… entonces esa si sera
CODIFICANTE
3. extensión: se copia solo una región del ADN, la que pertenecía al gen en cuestión
a. grandes parte del ADN no se pueden transcribir
4. dónde comienzo y termina: promotor y terminador
5. proceso mucho más regulado que la duplicación de ADN

Promotor de un Gen:

¿Qué es? → es una secuencia del ADN al cual se unen los factores que indican el comienzo
de la síntesis de ARN
forma parte del gen pero no es transcripto

➔ Ubicación: cerca de l
región codificante
➔ función: se unen la
ARN de polimerasa y
los factores de
transcripción

Bacterias:
➔ (Caja de Pribnow)
TATAAT (-10nt)
➔ Caja TTGACA (-35nt)

Eucaritoas:
➔ Caja TATA (-25 7 nucleótidos A/T)
➔ Caja CAAT (-40nt)
➔ Caja GC (-110nt)

Transcripción en Procariotas:
ARN polimerasa
● oligomérica
○ complejo oligomérico: tiene 5 sub unidades, 2a, B, B y W: Forman el core
○ Subunidad Sigma:
 ■ Factor Sigma al cual se une el 2 “core” y forman la holoenzima
■ necesaria para la transcripción
■ hay 7 distintas

● Cofactores: emplea Mg+2

● Múltiples funciones:
○ Unirse al factor sigma y factores de transcripción
○ unirse al ADN
○ Abrir la doble hebra de ADN
○ Unir a los NTP
○ Sintetizar ARN

Proceso:
1. ARN: Polimerasa: la holoenzima se une al promotor y comienza a desenrollar una
extensión de 17 nt

2. Polimerización: comenzó con el agregado de los NTP complementa a la hebra sin

sentido y la formación de los enlaces fosfodiéster
a. la primera base se conserva a
los 3 fosfatos
b. sintesis en sentido 5´→ 3´ sin
cebador

3. Subunidad Sigma
● luego de que se han unido 10 nts, se
desprende
● puede unirse a otro holoenzima y
promotor
● el core sigue copiando

4. Terminación
● al final del gen está la secuencia de terminación que puede contener GC repetidas
● que son autocomplementarias → horquillas
● factores de terminación de Rho

Transcripción en eucariotas:

ARN polimerasa I
● síntesis de ARN ribosomal 28s, 18S y 5,8s (las más grandes)
● ocurre en el nucleolo
 ● insensible a a-amantina

ARN polimeras II
● síntesis del precursor de ARNm
● nucleoplasma
● muy sensible a la-amantina

ARN polimerasa III

● síntesis de ARN, ARNr 5s y ARN nucleares pequeñas
● nucelo
● sensible a concentraciones altas de a-amantina

ARN polimerasa mitocondrial:

● en mitocondrias
● Similar a bacterias
● transcribe los genes de ADN mitocondrial – fucniones de mitoccondria

Factores asociados:

factores de transcripción:
● de carácter porteica
● función como el de sigma pero no forman parte de la polimerasa
● ubican a la polimerasa en el lugar correcto para comenzar la transcipicon
● son los que van a determinar cuales son los genes que se van a transcribir

FT Basales o generales:
● Para la ARN polimeras II son 6.
● Siempre está la proteína de unión de la caja TATA

Activadores y Represores:
proteínas accesorias que se unen a otro sitio del ADN que no sean los porteros, para activar o
reprimir la expresión de un gen. podemos aumentar la transcripción del gen o disminuirlo

Complejo de Preiniciación
➔ Es un complejo de 100 proteínas que es necesario para la transcripción de genes con
la Pol tipo II.
➔ Este sitúa a la polimerasa al comeinzo del gen
➔ densutlrazia ald ADN y lo posiciona en el sitio activo
 Síntesis del ARNm
sintetizado por ARN pol II

Promotores:
3 módulos:
● -25 caja TATA (flanqueada por secuencias ricas en CG);
● -40 caja CAAT
● -110 caja GC.

Complejo de iniciación:
● Se une el TFIID (holoenzima de la ARN polimerasa) a la caja TATA por la subunidad
TBP.
● Luego se agregan los otros
TFII (A, B, F, E, H) y la
polimerasa
● TFIIH actúa como helicasa y
quinasa, fosforilando la pol.
Pol fosforilada se desprende
del complejo y comienza la
síntesis.
● Se disocian los FT.

Formación del Cap: (el encapuchado)

● en el extremo 5´se le une un GTP en el enlace 5´→ 5´
● luego se metila el N7 de Guanina

Formación de la cola poli A:

● 11 a 30 mts antes del extremo de la secuencia AAUAAA
● indica la inserción en el extremo 3´ de 100-200 nucleótidos de Adenina
● Poli a pilimerasa: sin molde

Sintesis de ARNt:

promotores:
2 cajas situadas corriente abajo: A y B

complejo de iniciación:
➔ Se une el TFIIIC a las cajas A y B.
 ➔ Luego se une el TFIIB a -50 de la caja A (este contiene TBP) que permite la
ubicación y unión de la Pol III.
➔ La polimerasa comienza la síntesis.

modificación:
➔ se adiciona en el extremo 3´del pre-ARNt por el triplete CCA (nucleotidil
transferasas) → AHÍ SE UNE EL AMINO ÁCIDOS
➔ se agregan los grupos radicales: metilo e ispentilis a algunas bases puricas
➔ se metila el OH en pocsion 2´de la risbosia de algnps residudoso
➔ se modifican residuoso de uridian para generarl → hidroxiuridina, pseudouridina o
ribotimidina
➔ se remevuen segmentos de la cadena

Sintesis de ARNr: ( la molecula + grande)

promotores:
-100, largo de 50 nts: elemento de control corriente arriba

complejo de iniciación
2 fatcores:
● factor de unión corrienta arriba (UBF)
● factor 1 de selectividad (TBP)
a estos se les une el pol I y otros factroes

Procesioameinto:
● Se sintetiza 1 sola molécula de 45S: es
cortada para dar origen a:
○ 28 S, 18 S y 5,8 S
● Se agregan grupos metilo al –OH del
C2’ de la ribosa.

Sineteis de ARN 5s:

➔ los sintetiza la pol tipo III
➔ Promontor: Caja A y C corriente abajo
➔ se une a TFIIIA a la caja C, luego se unen TFIIIA y TFIIB (continene TBP)
➔ Se une la Pol tipo III y comienza sintesis