Enhancers en el desarrollo

Oscar Arriagada Castillo

Magister en Ciencias Biomdicas

 Durante la embriognesis, con el fin de formar los tejidos del embrin, los patrones de
expresin de genes deben estar bien dirigidos en el espacio y el tiempo.
Encendido y apagado de genes.
Programacin en la expresin gnica.
Introduccin
Esta funcin diferenciadora est controlada por Elementos cis reguladores
Enhancers, silencers, insulators y promotores
Controlan la expresin espacial y temporal de distintos sets de genes (Buecker et al 2012)
Enhancer

Secuencia nucleotdica especfica

Ubicada en regin no codificante
Tamao aprox 50 a 1500 pb
Contienen 2 o ms sitios de unin para FT
Se ha observado presencia de sitios de unin
a represores.

Alberts. Molecular Biology of the Cell (2008) fifth edition.

 En ocasiones el enhancer se encuentra lejos del sitio de transcripcin.
Se ha observado que el enhancer toma contacto con el aparato de transcripcin.
El loop del DNA acerca al enhancer a la regin promotora.

Nature, academic press

 Ken W.Y. Cho. Enhancers. Rev Dev Biol. 2012 ; 1(4): 469478
 Clark. Molecular Biology. Elsevier Academic Press (2005) 231-267
 La unin del enhancer a su activador es capaz de reclutar a la RNA pol II y toda su
maquinaria de transcripcin hacia la regin promotora.
Esto dirige la transcripcin de genes objetivo
Modelos de Funcin del Enhancer

Enhancerosoma: Depende completamente del complejo proteico al que se une.

Si ste o alguna de sus partes llegase a faltar, el enhancer no funciona. Si se une
un represor, el enhancer tampoco funcionar.

Display/Billboard: La funcin del enhancer no es solo un hacho puntual sino que

una serie de seales que entre todas modulan el grado de expresin. Siempre
que haya una pequea cantidad de activador o represor, el enhancer funcionar.
(Borok, 2010)
Borok M, Tran D, Ho M, Drewell R. Dissecting the regulatory switches of development: lessons from
enhancer evolution in Drosophila. Development (2010) 137; 5-13
Enhancers y desarrollo
Una de las preguntas ms importantes de la biologa del desarrollo es cmo los enhancers son
capaces de relacionarse con los factores de transcripcin en una relacin espacio- temporal de
alta precisin para permitir la expresin de genes en una forma secuencial y programada.
Distintos estudios han postulado que los enhancers son los determinantes primarios de la
expresin de genes tejido- especficos, potenciando el ratio de transcripcin de la RNA pol II. en
el momento y lugar especfico
Lam M T, Li W, Rosenfeld M G, Glass C K. Enhancer RNA and regulated transcriptional programs.
Trends in Biochemical Sciences (2014).39:170-182
La Drosophila
La especificacin del destino celular en el embrin de
Drosophila es controlada por los mecanismos
regulatorios del DNA, primariamente por enhancers
(Paparzenko 2009).
Coordinan tanto la expresin de factores de
transcripcin como de componentes de sealizacin
celular que inciden en las actividades de estos FT
Embriognesis en Drosophila

Borok M, Tran D, Ho M, Drewell R. Dissecting the regulatory switches of development: lessons from enhancer evolution in Drosophila.
Development (2010) 137; 5-13
El gen Even Skipped
El enhancer para el gen even skipped 2 (eve) ha sido uno de los ms estudiados
Controla el bandeado de 7 lneas de parasegmentos
La expresin de eve es modulada por diferentes elementos cis cercanos en 7 lneas diferentes del
embrin en desarrollo.
El patrn de la expresin de eve que controla su enhancer deriva completamente de la
combinacin de sitios de unin al FT que posee
Kruppel (KR), Giant (GT), Bicoid (BCD) y Hunchback (HB)
 La expresin de eve est determinada por la
unin de los factores de transcripcin al
enhancer ByH: activadores KyG: represores

La regin del enhancer que determina la

expresin de eve en St2 tiene 12 sitios de
unin

El embrin en su banda 2, en el enhancer de

su eve hay una alta actividad de KyGy

Levine M. Transcriptional Enhancers in Animal Development and Evolution. Current Biol(2010)20;754-

763.
Alberts. Molecular Biology of the Cell (2008) fifth edition .
Enhancers y evolucin
Un cambio en la actividad de un factor de transcripcin puede aportar un efecto
profundo en procesos de desarrollo como la expresin de bateras de genes diana
en cada tipo de clula donde las funciones de factor de transcripcin pueden ser
alteradas de manera significativa. (Ken et al 2014).
Por otro lado, mutaciones en elementos cis reguladores pueden ser ms sutiles y
especficos e incluso segn autores, contribuir a la innovacin evolutiva y ejercer
cambios incrementales en la variabilidad fenotpica.
El caso de los peces espinosos
Ocenicos en Norteamrica y de agua dulce en Europa del Norte
Desarrollo de la aleta plvica
Mutaciones en el enhancer para el gen Pitx1

Levine M. Transcriptional Enhancers in Animal Development and Evolution. Current Biol(2010)20;754-

763
Enhancers y evolucin
La expresin del gen de Sonic hedgehog (Shh) es importante tanto para el desarrollo del SNC
como de miembros en diferentes especies.
Observacin de zona de actividad de polarizacin (ZPA) donde acta Shh para el desarrollo de los
miembros
Mutacin en Shh de base de los miembros
Relacin con serpientes
 Alteraciones en la secuencia del
enhancer en ocasiones puede generar
alteraciones en la expresin de genes
que modula
Cuando existe una mutacin en el
enhancer de Shh Se asocia con
Polidactilia (Lettice, 2003)

Lettice L A, Heaney S J , Purdie L A, Li L, De Beer P, Oostra B A , Goode D, Elgar G, Hill R E de Graaff E. A

long-range Shh enhancer regulates expression in the developing limb and fin and is associated with
preaxial polydactyly. Human Molecular Genetics (2003) 12; 17251735.
Conclusiones
La diferenciacin y desarrollo tanto de los organismos como de las clulas que lo componen
requieren un control programado y secuenciado de la expresin gnica.
Para ello el DNA posee un sistema de regulacin para que la expresin espacio-temporal sea
exitosa y ordenada.
Los enhancers determinan cundo, dnde y cunto se expresa el gen en determinadas protenas
en cada tejido animal.
Variaciones en la secuencia del enhancer pueden determinar cambios fenotpicos en diferentes
especies, siendo este elemento cis un importante elemento de variabilidad gentica.
Bibliografia
Alberts. Molecular Biology of the Cell (2008) fifth edition.
Barolo M Shadow enhancers: Frequently asked questions about distributed cis-regulatory information and enhancer redundancy. Bioessays.
2012 34(2): 135141.
Borok M, Tran D, Ho M, Drewell R. Dissecting the regulatory switches of development: lessons from enhancer evolution in Drosophila.
Development (2010) 137; 5-13
Bueker C, Wysocka J. Enhancers as information integration hubs in development: lessons from genomics. Trends in Genetics (2012) 28, No.
6
Chin-Tong G, Corces V. Enhancers: emerging roles in cell fate specification. Embo (2012) 13:423-430.
Clark. Molecular Biology. Elsevier Academic Press (2005) 231-267.
Ken W.Y. Cho. Enhancers. Rev Dev Biol. 2012 ; 1(4): 469478.
Lam M T, Li W, Rosenfeld M G, Glass C K. Enhancer RNA and regulated transcriptional programs. Trends in Biochemical Sciences
(2014).39:170-182.
Lettice L A, Heaney S J , Purdie L A, Li L, De Beer P, Oostra B A , Goode D, Elgar G, Hill R E de Graaff E. A long-range Shh enhancer regulates
expression in the developing limb and fin and is associated with preaxial polydactyly. Human Molecular Genetics (2003) 12; 17251735.
Levine M. Transcriptional Enhancers in Animal Development and Evolution. Current Biol(2010)20;754-763.
Sakabe N J, Savic D, Nobrega M. Transcriptional enhancers in development and disease. Genome Biology (2012) 13:238.
Enhancer Grammar
Modelo que propone que los enhancers poseen muchos sitios de unin para FT
Los FT deben unirse en un sitio especfico
Los FT se unen en un momento especfico
El grado de unin espacial y temporal de los FT a los enhancers determina el estado de expresin
de un gen
Variaciones en la secuencia del enhancer pueden alterar la expresin del gen
 Efecto de los aisladores (insulators)

Clark. Molecular Biology. Elsevier Academic Press (2005) 231-267

Shadow enhancers
En el ao 2008 por trabajos de Levigne el 2008 describi la presencia de enhancers secundarios
que:
Manejaran la misma secuencia de transcripcin del promotor
Estaran controlados por los mismos FT
Se ubican en el interior de un intrn o fuera de l y localizado en genes vecinos (Barolo 2012)
Se piensa que robustece la expresin de genes y cuando la expresin de un gen se debe
acelerar sobre la capacidad que otorga un enhancer.
Enhancer y Propiomelanocortina

Rubistein M, de Souza F. Evolution of transcriptional enhancers and animal diversity. Phil. Trans. R. Soc.
B 2013 368
Activacin de un Enhancer
Preparacin para el enhancer
Acetilacin de las histonas
Factores modificadores de nucleosomas