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proteína de una mezcla compleja , es decir , retener la mayor cantidad de proteína funcional
con el menor número de contaminante .Es fundamental para la caracterización de la función,
estructura y interacciones de la proteina ,por ejemplo una enzima ,un receptor celular o un
anticuerpo .Hay varios pasos en el proceso de la purificación ,puede liberar a la proteína de la
matriz que lo confina ,separar las partes proteica y no proteica de la mezcla y finalmente
separar la proteína deseada de las demás .El proceso de purificación de una proteína , se da a
lugar mediante la extracción de extracto proteico que es el aislamiento de una proteína ,lo
cual significa extraerla de la célula e incluirla en una solución ,Para obtener el extracto
proteico se debe romper la membrana celular,sin embargo algunas células requieren que
algún tipo de ruptura mecánica para liberar su contenido.
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Pero porque purificar una proteína , pues por varias cosas que han servido a lo largos de los
años, como para PRECISAR SECUENCIAS DE AMINOÁCIDOS , ESTABLECER RELACIONES
EVOLUTIVA , INVESTIGAR LA FUNCIÓN BIOQUÍMICA, ESTABLECER RELACIONES
ESTRUCTURA-FUNCIÓN Y TAMbien EN APLICACIONES TERAPÉUTICAS O BIOTECNOLÓGICAS
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1-OBTENCIÓN de un extracto crudo de proteínas.
Cuando uno desea purificar una proteína a partir de una célula se debe tener en cuenta que
para preparar un extracto celular, si la proteína en cuestión fue sintetizada para operar en
un ambiente extracelular o si su función la cumple dentro de la célula .
Como vemos aquí , será intracelular , cuando su función sea dentro de la celular y
extracelular cuando sea fuera de la célula.Para realizar estas extracción se realizará
mediante procesos de lisis.Este proceso permitirá Minimizar la desnaturalización de la
proteína,Permite cierta selectividad Y Libera ácido nucleicos
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El primer paso (1) consiste en elegir la muestra biológica de partida, esta puede ser células
en suspensión (cultivo) o tejido total. Después (2) se requiere seleccionar la solución
amortiguadora adecuada para realizar la ruptura del tejido y la extracción de la proteína total
en su forma soluble sin afectar las características estructurales y funcionales de la proteína
de interés. En este paso se recomienda trabajar a 4ºC, de forma rápida y en presencia de
inhibidores de proteasas para proteger a las proteínas de la degradación. Determinar el
método que se empleará para lisar la membrana celular (3). Estos métodos pueden ser
físicos como (A) la homogenización manual o mecanizada, (B) la sonicación o ciclos de
congelación y descongelación (C), o bien ser químicos como el uso de detergentes como el
Tritón X-100 (D) o la lisis por choque osmótico, por ejemplo, los eritrocitos al diluir su medio
con agua y hacer más hipotónica la solución en la que se encuentran hasta generar que se
hinchen y revienten (E). Se puede emplear más de un paso de extracción y la combinación
de métodos químicos y físicos. El aclaramiento (4) consiste en separar fragmentos celulares
de las proteínas solubles mediante centrifugación. Finalmente se cuantifica la cantidad de
proteína en el extracto usando un espectrofotómetro (5). El extracto es la muestra (6) de la
que se parte para aplicar una o varias técnicas de purificación de proteínas. Determinación
de la concentración de proteína, se puede medir directamente, mediante la absorbancia
a 280 nm en un espectrómetro UV, o indirectamente, usando métodos colorimétricos
como ensayos de BCA o Bradford
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Salazón o Salting out , este método es cuando se aumenta la fuerza iónica de una solución
proteica añadiendo sal .La solubilidad disminuye y precipitados de proteína..En la
precipitación por insolubilización se emplean sales disociables.Diferentes tipos de sales
neutras o ligeramente ácidas son utilizadas para la solubilización precipitación o
fraccionamiento de proteínas: están incluidas es NaCL(cloruro de sodio, así como el KCL y
CaCl2 cloruro de calciclo a diferentes concentraciones y combinación de pH, se pueden
usar diversas sales , pero no hay mejor que el Sulfato de amonio , debido a que tiene
ventajas de su alta solubilidad a bajas temperaturas , baja densidad de solución que no
interfiere con la sedimentación por centrifugación de la mayoría de las proteínas
precipitadas, también tiene un bajo costo, ausencia de efectos desnaturalizantes y en
soluciones concentradas previene o limita el desarrollo bacteriano
El sulfato de amonio, tienen efectos generales sobre la estructura del disolvente que
conducen a la disminución de la proteína solubilidad y salting out, en este caso , las
moléculas de proteína tienden a asociarse entre sí porque las interacciones
proteína-proteína con energéticamente más favorable que la proteína-solvente interacción.
IMAGEN DE ABAJO
La mayoría de las proteínas son menos solubles a altas concentraciones un efecto llamado
salting out.
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SI TENEMOS UNA CONCENTRACIÓN PROTEICA
Donde la fuerza iónica no es demasiada alta ,y ha notado que con un aumento leve en la
contratación de sal ,el aumento de la solubilidad , y que no hay precipitación visible en el
tubo, y pues todo es soluble ,
Al segundo se le agrega una solución de sal con fuerza iónica muy alta y es una solución
muy concentrada, en este caso se puede observar que sin aumentar la solubilidad ,la
solubilidad disminuye y que hay un sedimento visible .
Por lo que si se traza una gráfica
DIÁLISIS:
La diálisis es una forma de filtración molecular utilizado para la precipitación , este proceso
se realiza debido a que ,la sal puede interferir en los procesos de purificación y puede
alterar las propiedades biológica de la proteína
Condiciones físicas: Temperatura: entre más alta sea la temperatura, mayor será la
velocidad de diálisis. A temperaturas elevadas, la viscosidad del solvente es menor y la
velocidad de difusión aumenta
En la diálisis como podemos observar en la imagen superior derecha ,se usa una bolsa que
tenga poros lo suficientemente pequeños para impedir el paso de moléculas grandes
(proteínas), pero lo bastante grandes, como para que las moléculas pequeñas puedan
pasar a través de ellos. Dentro de la bolsa se coloca alguna fracción del homogenado y se
cierra herméticamente. El sistema así construido se pone dentro de un recipiente con agua
destilada, que se renueva continuamente.
Bajo estas condiciones se tiene una diferencia de concentraciones, entre el líquido del
interior de la bolsa y el agua destilada, y va a existir una tendencia a igualar las
concentraciones, por lo que las moléculas del interior van a tratar de salir hacia el agua
destilada, pero como las moléculas de proteína no pueden pasar por los poros, solamente lo
harán las moléculas pequeñas, el transporte de materiales seguirá hasta que se igualen las
concentraciones en los dos compartimentos.
En la imagen de abajo ,se tiene como primer paso , colocar la mezcla de proteínas dentro
una membrana de celofán , y después de varios cambios en la solución externa a la bolsa y
varias horas queda en equilibrio
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Las moléculas cuyo rango de tamaño se encuentra entre las muy grandes seran
excluidas del gel y las muy pequeñas . puede penetrar los poros en diferente grado
,de acuerdo a su tamaño .
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Observando nuevamente con las 3 moléculas de diferentes tamaños , las moléculas
más grandes, osea la rojas no pueden entrar a los poros , por lo que no son
retrasadas y salen rápidamente .
(Explica la hoja)
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Los factores que influyen en la separación Además de la diferencia intrínseca esta:
- Longitud de la columna. La capacidad de separación de sustancias de diferente
tamaño aumenta con la longitud de la columna.
Las moléculas pequeñas penetran en los pequeños conductos que presentan las
bolas de gel , donde la velocidad de flujo de solvente es menor.
Las moléculas grandes, incapaces de penetrar en los pequeños conductos de bolas
de gel se mueven entre ellas, donde la velocidad de flujo de solvente es superior.
Como consecuencia , las moléculas de mayor peso molecular son eludidas antes
que las de menor peso molecular.
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Cromatografía de intercambio iónico.
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Un intercambiador iónico es, por lo general, un polímero que tiene grupos cargados
unidos. La mayoría de las proteínas son estables dentro de un margen de pH
determinado (es decir, hay un margen en el que no se desnaturalizan), en el que
están cargadas positiva o negativamente.
La cromatografía de intercambio iónico se usa comúnmente como un paso
intermedio en un esquema de purificación de proteínas, este proceso permite
separar las proteínas en función de su carga neta de superficie a través de
interacciones electrostáticas que ocurren entre las proteínas y la fase estacionaria
cargada
:
Existen dos tipos de cromatografía de intercambio iónico:
Catiónico: Donde las proteínas cargadas positivamente se unen a una fase
estacionario con carga negativa
Aniónico: Aquí las proteínas están cargadas negativamente , se unen a una fase
estacionaria positivaMENTE
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Es importante ,saber que la fase estacionario primero será equilibrada con un buffer
de baja fuerza iónica, cuando el equilibrio se ha logrado ,toda la fase estacionario se
encuentra asociada a iones complementarios
En la parte de la regeneración , por último, se remueven las partículas que aún están
asociadas al intercambiador.se pueden regenerar a su forma inicial para reanudar la
operación de intercambio. Así, el intercambio iónico es un proceso cíclico y no
continuo.
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CROMATOGRAFÍA DE AFINIDAD Y DE ALTA PRESIÓN
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cromatografía de afinidad
Esta técnica de separación y análisis consiste en hacer pasar una muestra líquida o
sólida disuelta en un disolvente adecuado junto con una fase líquida móvil por una
columna cromatográfica.
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Electroforesis e isoelectroenfoque.
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OTROS MÉTODOS DE PURIFICACIÓN
CENTRIFUGACIÓN
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C.DIFERENCIAL
El homogenato es centrifugado repetidas veces a velocidades crecientes
sedimentando progresivamente y realizando un fraccionamiento diferencial de sus
componentes