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La American University Cuestionario de Bioquímica Luis Bravo

BREVE HISTORIA DE LA BIOQUÍMICA: La Bioquímica es una ciencia


relativamente joven. El término Bioquímica fue empleado por primera vez en 1858
por Kletzinsky en su libro Compendium der Biochemie, publicadoen Viena. En
1903, Neuberg fue pionero al crear la primera Cátedra de Bioquímica (en
Holanda). Sin embargo, los orígenes son anteriores, pues era considerada una
rama derivada de la Medicina y de la Química antes de ser aceptada, a finales del
siglo XIX y principios del XX, como una ciencia adulta con sus propios y poderosos
métodos experimentales.

DEFINICIÓN DE BIOQUÍMICA: La bioquímica es una rama o especialidad de las


ciencias médicas bilógicas, que se encarga específicamente del estudio de la
naturaleza química de la materia viva. Así como de las transformaciones químicas
que se llevan a cabo en los organismos vivos.

EL OBJETIVO DE LA BIOQUÍMICA: Consiste actualmente en estudiar la


estructura, la organización y las funciones de los seres vivos desde el punto de
vista molecular.

Según los tratados de bioquímica se puede dividir en tres grandes grupos:

1. BIOQUÍMICA ESTRUCTURAL: Estudia la composición, conformación,


configuración y estructura de las moléculas de la materia viva,
relacionándolas con su función biológica.

2. BIOQUÍMICA METABÓLICA O METABOLISMO: Estudia las


transformaciones, funciones y reacciones químicas que sufren o llevan a
cabo las moléculas de la materia viva, así como los mecanismos de
regulación de esas transformaciones.

3. BIOLOGÍA MOLECULAR O GENÉTICA MOLECULAR: Estudia la química


de los procesos y las estructuras de las moléculas implicadas en el
almacenamiento, la transmisión y la expresión de información genética, así
como los mecanismos que los regulan.

BREVE CRONOLOGÍA DE LA BIOQUÍMICA: La Bioquímica ha progresado paso


a paso. No podía ser de otra forma, dada la propia naturaleza del quehacer
científico, críticamente celoso de la acumulación de pruebas experimentales antes
de dar por establecida alguna teoría. Para tener una visión rápida de los hallazgos
que elevaron a la Bioquímica a ciencia independiente y de su evolución hasta hoy,
a continuación se resaltan cronológicamente algunos de estos descubrimientos.

ORÍGENES DE LA BIOQUÍMICA:
 1747 Margraff descubre la sacarosa en la remolacha
 1770-74 Priestley descubre el oxígeno y demuestra que los animales lo
consumen y las plantas lo producen.
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 1770-86 Scheele aísla la glicerina y los ácidos cítrico, málico, láctico y úrico,
a partir de fuentes naturales.
 1780-89 Lavoisier postula que respiración equivale a oxidación y mide por
primera vez el consumo de oxígeno de un individuo.
 1804 Dalton enuncia la teoría atómica.
 1810 Gay-Lussac deduce la ecuación de la fermentación alcohólica.
 1837 Berzelius sugiere el término proteína para ciertas sustancias
nitrogenadas de células animales y vegetales. Además, propone la
naturaleza catalítica de las fermentaciones.
 1850 Virchow demuestra que toda célula viva deriva de otra.
 1854-64 Pasteur demuestra que la fermentación se debe a los
microorganismos, e introduce los términos de «aerobiosis» y
«anaerobiosis».
 1859 Darwin publica El origen de las especies para plasmar de forma
resumida sus ideas acerca de la evolución por selección natural.
 1866 Mendel publica sus experimentos relativos a la segregación
independiente de los caracteres hereditarios.
 1890 Altmann purifica ADN libre de proteínas, acuña el término de «ácido
nucleico» y, además, describe técnicas de tinción de mitocondrias.
 1897 Bertrand idea el término «coenzima» y descubre la lacasa y
tirosinasa, las primeras enzimas implicadas en una vía biosintética hasta
ese momento.
 1902 Fischer y Hofmeister demuestran que las proteínas son polipéptidos.

LA BIOQUÍMICA ES UNA CIENCIA INTERDISCIPLINARIA QUE SE


RELACIONA CON:
 La física,
 La química,
 Biología celular,
 Evolución,
 La genética,
 La fisiología,
 La farmacología.

LA BIOQUÍMICA COMO CIENCIA INTERDISCIPLINAR:


 Química Orgánica: describe las propiedades de las biomoléculas.
 Biofísica: que aplica el estudio de la física en el estudio de las estructuras
de las biomoléculas.
 Microbiología: que ha demostrado que los organismos unicelulares y los
virus son especialmente adecuados para la determinación de muchas rutas
metabólicas y mecanismos de regulación.
 Fisiología: que investiga los procesos vitales a nivel tisular y del
organismo.
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 Biología celular: describe la división bioquímica del trabajo en el interior de


la célula.
 Genética: describe el mecanismo que proporciona una determinada célula
u organismo y su identidad bioquímica.
 Nutrición: la nutrición que ha aclarado el metabolismo mediante la
descripción de las necesidades alimentarias para el mantenimiento de la
salud.
 Investigación médica: que intenta cada vez más comprender los estados
patológicos en términos moleculares.

Todas las formas de vida desde la célula bacteriana más pequeña, hasta el ser
humano están formadas por los mismos elementos químicos que se utilizan para
elaborar los mismos tipos de moléculas.

La química de la materia viva es similar en todo el mundo biológico.

La vida se basa fundamentalmente en unos pocos elementos:


 Carbono (C),
 Hidrogeno (H),
 Oxigeno (O),
 Nitrógeno (N). Existen otros elementos que se usan en menores
cantidades.

LOS ELEMENTOS QUÍMICOS DE LA VIDA

PRINCIPALES ELEMENTOS ELEMENTOS DE TRAZAS


COMUNES
Carbono, hidrogeno, nitrógeno, fosforo, Manganeso (Mn), Hierro (Fe), Cobalto
azufre (CHON PS) (Co), Cobre (Cu), Zinc (Zn)
Iones esenciales (electrolitos): Elementos de Traza:
Sodio (Na), Potasio (K), Cloro (Cl) y Vanadio (V), Cromo (Cr), Molibdeno
Calcio (Ca). (Mo), Níquel (Ni), Boro (B), Aluminio
(Al), Silicio (Si), Estaño (Sn), Arsénico
(As), Selenio (Se), Flúor (F), Yodo (F)
Yodo (I)

LOS BIOPOLÍMEROS

Proteínas Aminoácidos
Polisacáridos Monosacáridos
Los Biopolímeros Ácidos nucleicos Nucleótidos
Lípidos Estructuras variadas
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La Bioquímica para estudiantes de la salud: Temas centrales de ciencias de la


salud:
1. Compresión y conservación de la salud.
2. Compresión y tratamiento eficaz de la enfermedad.

Su objetivo principal consiste: en la comprensión integral a nivel molecular de


todos los procesos químicos vinculados con las células vivas.
Es fundamental para todas las ciencias de la vida:
Patología, fisiología, farmacología, nutrición, toxicología, genética.

Todas las enfermedades tienen una base bioquímica:

ÁCIDOS NUCLEICOS PROTEÍNAS LÍPIDOS CARBOHIDRATOS

ENFERMEDADES ANEMIA DE ARTERIOSCLEROSIS DIABETES


MELLITUS
GENÉTICAS CÉLULAS
ACIDO
FALCIFORMES
DESOXIRRIBONUCLEICO HEMOGLOBINA COLESTEROL GLUCOSA
MEDICINA

Los estudios bioquímicos contribuyen al diagnóstico, pronóstico y


tratamiento…

Enfermedades por deficiencias de aminoácidos esenciales:

Vitamina C: la deficiencia de vitamina C puede provocar, una condición llamada


escorbuto caracterizada por debilidad, anemia, hematomas, encías sangrantes, y
dientes flojos.

Vitamina D: la deficiencia o incapacidad de utilizar la vitamina D puede ocasionar


el raquitismo, que es el debilitamiento y ablandamiento de los huesos causado por
la pérdida extrema de calcio.

Los estudios bioquímicos contribuyen al diagnóstico, pronóstico y


tratamiento…
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Enfermedades por deficiencias de aminoácidos esenciales:

Malnutrición debilitante por una alimentación deficiente


en proteínas.

APLICACIONES DE LA BIOQUÍMICA RESPECTO A LAS ENFERMEDADES:


 Seguir tratamientos razonados de las enfermedades.
 Evidenciar las causas y los mecanismos básicos de los trastornos.
 Ayudar en los diagnósticos de padecimientos específicos.
 Ayudar en la vigilancia de la evolución de ciertos trastornos.
 Ayudar en la evaluación de las respuestas de las enfermedades a la
terapéutica.

METABOLISMO:
Metabol: Cambio - Ismo: Cualidad.
Se denomina metabolismo al conjunto de reacciones químicas enzimáticamente
catalizadas que tienen lugar en la célula. Organizadas en rutas o vías metabólicas.
Proceso global por el cual los organismos vivientes adquieren y usan la energía
libre para llevar a cabo sus funciones.

Los Bioelementos se clasifican en:


 Primarios: constituyen el 96% son C-H-O-N-P-S ((carbono (C), el
hidrógeno (H), el oxígeno (O), el nitrógeno (N), el fósforo (P) y el azufre
(S)).
 Secundarios: constituyen el 3,3% son Na, K, Ca, Mg, Cl. (Sodio, Potasio,
Calcio, Magnesio, Cloro).
 Oligoelementos: constituyen el 0,1%, son Fe, Cu, Zn, F, I. (Hierro, Cobre,
Zinc, Flúor, Yodo).
 Biomoléculas Orgánicas: Carbohidratos, Proteína, Lípidos.
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Vías del metabolismo: El conjunto de reacciones químicas y enzimáticas se


denomina ruta o vía metabólica.
 Anabolismo o biosíntesis, requiere energía.
 Catabolismo o degradación, libera energía.

ANABOLISMO: Tiene como finalidad la obtención de sustancias orgánicas


complejas a partir de sustancias más simples. Catabolismo Sustancias Complejas

CATABOLISMO: Conjunto de procesos por los que las moléculas complejas


degradadas a moléculas más simples. Se trata de procesos destructivos.
Catabolismo Sustancias simples.

EL CATABOLISMO:
 Degrada biomoléculas.
 Produce y almacena ATP.
 Implica procesos de degradación.
 Sus rutas son convergentes.
Ejemplo: Glucolisis, Ciclo de Krebs, Fermentación, Cadena respiratoria.

EL ANABOLISMO:
 Fabrica biomoléculas.
 Consume y usa ATP.
 Implica procesos de reducción.
 Sus rutas son divergentes.
Ejemplo: Fotosíntesis, Síntesis de proteínas.

TIPOS DE METABOLISMOS:

I. Por la forma de obtener los materiales:


Autótrofo: son aquellos organismos que sintetizan sus compuestos orgánicos
empleado como fuente de materiales sustancias inorgánicas.
Ejemplo: los vegetales verdes y muchas bacterias.

Heterótrofos: son aquellos organismos que sintetizan sus compuestos orgánicos


empleando como fuente de materiales otras sustancias orgánicas.
Ejemplo: los animales, los hongos y muchas bacterias.

II. Por la forma de obtener la energía:


Fotosintéticos: emplean la luz como fuente de energía.
Ejemplo: los vegetales verdes y muchas bacterias.
Quimiosintéticos: obtienen la energía de reacciones químicas.
Ejemplo: muchas bacterias.

REQUERIMIENTOS:
 En las rutas metabólicas se necesitan numerosas y especificas encimas
que van conformando los pasos y productos intermedios de las rutas. Pero
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además son necesarios varios tipos de moléculas indispensables para su


desarrollo final.
 Metabolitos: son moléculas que ingresan en la ruta para su degradación o
para participar en la síntesis de otras sustancias más complejas.
 Nucleótidos: son moléculas que permiten la oxidación y la reducción de los
metabolitos.
 Moléculas energéticas: ATP y GTP o la Coenzima A, que almacenar o
desprender Fosfato de sus moléculas, liberan o almacenan energía.
 Moléculas ambientales: Oxigeno, Agua, Dióxido de Carbono, entre otros,
que se encuentran al final o al comienzo de un proceso metabólico.

CONCEPTO DE ENZIMA:
Las enzimas son, generalmente proteínas o asociaciones de proteínas y otras
moléculas orgánicas o inorgánicas que actúan catalizando procesos químicos que
se dan en los seres vivos.

¿QUÉ ES CATALIZAR?
 Acelerar las reacciones.
 Disminuir la energía de activación necesaria.
 Las enzimas no modifican la constate de equilibrio y se recuperan intactas
al final del proceso.
 Debido a estos se necesitan en pequeñísimas cantidades.

En toda reacción catalizada por una enzima distinguiremos:

A y B ---------- Sustratos.
C y D ---------- Productos de la Reacción.
---------------- Enzima.

En las reacciones catalizadas por enzimas que pueden discurrir tanto en los
sentidos de los productos como de los sustratos, es la misma enzima la que actúa
en ambos sentidos.
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CATABOLISMO DE BIOMOLÉCULAS

El catabolismo aerobio está formado por varias rutas metabólicas que conducen
finalmente a la obtención de moléculas de ATP.

Ruta catabólica inicial:


a) Glúcidos ------ Glucólisis
b) Ácidos --------- Desaminación
c) Grasas -------- Oxidación
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El metabolito intermediario de todas la rutas es el


Ácido Pirúvico.

ESQUEMA DE LA ESTRUCTURA DE UNA ENZIMA:

Centro activo:
Zona de la molécula a la que se une el sustrato y
donde se realiza la catálisis enzimática.

Centro regulador:
Zona en que se une las sustancias que regulan la
actividad de la enzima.

El citrato sintetasa es una de las enzimas del ciclo


de Krebs.

ENERGÍA: Es la capacidad de realizar un trabajo, que es cualquier cambio en el


estado o el movimiento de la materia.

Dos de los sistemas que utilizan las células para llevar a cabo este
almacenamiento y transporte de energía que conecta el catabolismo con el
anabolismo: El sistema ADP/ATP y el sistema de las coenzimas trasportadores de
electrones.
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El ATP es una especie de moneda energética de la célula ya que es la molécula


que almacena y transporta la energía química desde los procesos que la liberan
hasta que la consuman.

COENZIMAS
TRASPORTADORAS DE ELECTRONES:

Muchas reacciones del catabolismo suponen una oxidación de los sustratos


orgánicos que se degradan es decir una pérdida de electrones.

Mientras que la biosíntesis anabólica de moléculas orgánicas altamente


hidrogenadas requiere electrones para reducir a sus precursores relativamente
oxidados.

Puesto que los procesos que liberan electrones y los que lo requieren no tienen
por qué suceder simultáneamente ni en el mismo lugar de la célula, debe existir
algún mecanismo para transportar dichos electrones entre estos dos tipos de
procesos.

Este mecanismo está integrado por una serie de coenzimas transportadoras de


electrones. Se trata de coenzimas cuya particular estructura química les permite
aceptar o ceder electrones es decir reducirse u oxidarse de modo reversible.

Los electrones siempre son aceptados o cedidos por pares, bien en forma de
átomos de hidrógeno, siendo acompañados en este último caso por los
correspondientes protones.

FORMA OXIDADA FORMA REDUCIDA


NICOTINAMIDA ADENINA NAD+ NADH+H
DINUCLEÓTIDO
NICOTINAMIDA ADENINA NADP+ NADPH+H
DINUCLEÓTIDO FOSFATO
DINUCLEÓTIDO DE FLAVINA Y FAD FADH 2
ADENINA
FLAVIN MONONUCLEÓTIDO FMN FMN 2

Muchos de ellos son cedidos por las coenzimas trasportadoras a la cadena de


transporte electrónico mitocondrial con el objeto de obtener ATP mediante el
proceso de fosforilación oxidativa.
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MECANISMOS DE ACCIÓN DE LAS ENCIMAS


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MECANISMO DE LA ACCIÓN ENZIMÁTICA:


1. Se forma un complejo: enzima – coenzima – substrato o substratos.
2. Los restos de los aminoácidos que configuran el centro activo catalizan el
proceso. Para ello debilitan los enlaces necesarios para que la reacción
química se lleve a acabo a baja temperatura y no se necesite una elevada
energía de activación.
3. Los productos de la reacción se separan del centro activo y la enzima se
recupera intacta para nuevas catálisis.
4. Las coenzimas colaboran en el proceso; bien aportando energía (ATP),
electrones (NADH/NADPH) o en otras funciones relacionadas con la
catálisis enzimática.

COENZIMAS: Son sustancias necesarias en el proceso de catálisis enzimática.


Nunca son proteínas.

Transportadoras de electrones:
NAD / NADH +
NADP / NADPH +
FAD / FADH + 2

Transportadoras de energía:
ADP / ATP
GDP / GTP

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