Está en la página 1de 9

Introducción a la biología celular y molecular 2022

Resolución Taller 5b.


Cinética de las reacciones químicas y Bioenergética
I. Cinética de las reacciones químicas

Ejercicio 1.

Considerando la reacción de A → B, en la siguientes tablas se muestran la cantidad de moles de A


y B en el transcurso del tiempo en segundos para 3 casos diferentes. Esos moles de reactivo y
producto se encuentran contenidos en 100 mL de solución.

CASO 1
Tiempo moles de moles de
(s) A B
0 90 0
50 86 4
100 82 8
200 74 16

CASO 2
Tiempo moles de moles de
(s) A B
0 80 0
50 78 2
100 76 4
200 72 8

CASO 3
Tiempo moles de moles de
(s) A B
0 100 0
50 99 1
100 98 2
200 96 4

a) ¿Qué tipo de gráfico se genera al representar la concentración de A o B (M) vs tiempo


(segundos)?

Para graficar concentración de A o B debemos primero pasar los moles a concentración


considerando que se encuentran en 100 ml de solución.
M= número de moles/ V(L)

1
Introducción a la biología celular y molecular 2022

Caso 1 Caso 2 Caso 3


Tiempo moles moles Tiempo moles moles Tiempo moles moles
(s) de A de B (s) de A de B (s) de A de B
0 90 0 0 80 0 0 100 0
50 86 4 50 78 2 50 99 1
100 82 8 100 76 4 100 98 2
200 74 16 200 72 8 200 96 4
Tiempo (A) (B) Tiempo (A) (B) Tiempo (A) (B)
(s) moles/L moles/L (s) moles/L moles/L (s) moles/L moles/L
0 900 0 0 800 0 0 1000 0
50 860 40 50 780 20 50 990 10
100 820 80 100 760 40 100 980 20
200 740 160 200 720 80 200 960 40

Si graficamos concentración de reactivo (A) o el producto (B) en función del tiempo en


segundos, se generan los siguientes gráficos:

2
Introducción a la biología celular y molecular 2022

En cada gráfico se genera una recta de ecuación: y = ax + b (donde a es la pendiente y b la


ordenada en el origen).

b) ¿Cuál es la velocidad de la reacción en cada caso, expresada en M/seg?

La velocidad es la pendiente del gráfico y por tanto para cada caso es:

Caso 1 = 0.8 M/s


Caso 2 = 0.4 M/s
Caso 3 = 0.2 M/s

c) ¿Cuál es la concentración inicial de reactivo en cada caso?

Caso 1 = 900 M
Caso 2 = 800 M
Caso 3 = 1000 M

d) ¿Cuál es la concentración de producto a los 150 segundos en cada caso?

Concentración de reactivo a los 150 seg:

Caso 1= 780 M
Caso 2= 740 M
Caso 3= 970 M

Concentración de producto a los 150 seg:

Caso 1= 120 M
Caso 2= 60 M
Caso 3= 30 M

II. Bioenergética

Ejercicio 2.

La reacción de síntesis de glucosa-6-fosfato es la siguiente:

Glucosa + ATP → Glucosa-6-P + ADP

Esta reacción global se forma a partir de dos reacciones de hidrólisis que se acoplan:

i) ecuación de hidrólisis del ATP:

ATP + H2O → ADP + Pi Keq = 2,21 x 105

ii) ecuación de hidrólisis de la glucosa-6-fosfato:

Glucosa-6-P + H2O → Glucosa + Pi Keq= 261

3
Introducción a la biología celular y molecular 2022

a) Calcule las variaciones de energía libre estándar (ΔG°’) de las dos reacciones de hidrólisis, a
25oC y pH 7.0 a partir de las constantes de equilibrio (Keq). ¿Qué significado tienen estos
valores? ¿Cuál es el signo de ΔG°’ cuando la la Keq es > 1?

La variación de energía libre estándar (ΔG°’) se puede calcular a partir de la siguiente ecuación:

ΔG°’ = − RT Ln(Keq)

i) ATP + H2O → ADP + Pi Keq = 2,21 x 105

ΔG⁰’ = − 2,479 kJ/mol x Ln (2,21 x 105 ) = −30,5 kJ/mol

ii) Glucosa-6-P + H2O → Glucosa + Pi Keq= 261

ΔG°’ = − 2,479 kJ/mol x Ln (261) = − 13,8 kJ/mol

ΔG°’ es la diferencia entre el contenido de energía libre de los productos y el contenido de


energía libre de reactivos en condiciones estándar (temperatura 25 °C, pH 7, concentración 1 M
de productos y reactivos). La variación de energía libre estándar de una reacción química es una
forma matemática alternativa de expresar la constante de equilibrio.

En este caso, el ΔG°’ es negativo, lo cual significa que los productos tienen menos energía libre
que los reactivos (la constante de equilibrio es mayor a 1,0) por lo que la reacción ocurrirá en
forma espontánea en condiciones estándar. Todas las reacciones químicas tienden a ir en la
dirección que da lugar a una disminución de la energía libre del sistema. Cuando el ΔG°’ es
positivo, los productos de la reacción tienen más energía libre que los reactivos (la constante de
equilibrio es menor a 1,0) y por tanto la reacción tiende a transcurrir en la dirección inversa.

b) Plantee la suma de reacciones para obtener la reacción de síntesis Glucosa-6-P.

Si observa, ambas ecuaciones están planteadas como hidrólisis. Por lo tanto, es necesario
invertir la ecuación de hidrólisis de GLUCOSA-6-P para que la suma efectivamente forme la
reacción que deseamos. Al invertir la ecuación, el ΔGo’ mantiene su valor pero cambia el signo.

ATP + H2O → ADP + Pi ΔG°’ = −30,5 kJ/mol

GLUCOSA-P + Pi → GLUCOSA-P + H2O ΔG°’ = 13,8 kJ/mol

GLUCOSA + ATP → GLUCOSA-6-P + ADP ΔG°’ = ΔG°’1 + ΔG°’2

c) Determine la variación de energía libre estándar ΔG°’ para la reacción global de síntesis de
glucosa-6-P. ¿Es esta reacción termodinámicamente favorable en condiciones estándares?
¿Sirve para predecir qué ocurre con esta reacción en una célula? Justifique su respuesta.

Los valores de ΔG°’ de reacciones químicas secuenciales (acopladas) son aditivos. Por lo tanto,
en este caso, el ΔG°’ para la reacción global de síntesis de glucosa-6-P es:

ΔG°’ = – 30,5 kJ/mol +13,8 kJ/mol = –16,7 kJ/mol

El valor de ΔG°’ global es negativo, por lo que la reacción global es exergónica. Notar como una
reacción termodinámicamente desfavorable (endergónica) puede ser impulsada en el sentido
directo acoplándola a una reacción muy exergónica a través de un. Intermediario común.En este
caso, la energía almacenada en el ATP se utiliza para impulsar la síntesis de glucosa-6-P aunque
su formación a partir de glucosa y Pi es endergónica.

4
Introducción a la biología celular y molecular 2022

Es importante recordar que el valor de ΔG°’ no sirve para predecir lo que ocurrirá con las
reacciones dentro de la célula, ya que, como se comentó anteriormente es en condiciones
establecidas estándar que no coinciden con las concentraciones reales a nivel celular. Para
predecir qué ocurre en las células-tejidos hay que calcular el ΔG real, el cual depende de las
concentraciones de reactivos y productos dentro de la célula (real).

d) Determine la constante de equilibrio (Keq) para la reacción de síntesis Glucosa-6-P a partir


del valor calculado de ΔGo’. Observe que sucede con el valor de la Keq cuando el valor de ΔGo’
es negativo.

Conociendo el ΔG⁰’ de una reacción podemos calcular la Keq despejando de la ecuación:

ΔG°’ = – RT Ln(Keq)

Ln(Keq) = - ΔG°’/RT

Keq = e− (ΔG⁰’/ RT)

Keq = e− (−16,7 kJ/mol/2,479kJ/mol) = 842

En este caso, la Keq > 1, por lo que el ΔG°’ es negativo (los productos tienen menos energía libre
que los reactivos) y la reacción ocurrirá en forma espontánea en condiciones estándar en el
sentido de formación del producto glucosa-6-P.

Ejercicio 3.

A continuación se utiliza un gráfico que representa lo que ocurre con la energía libre en el
transcurso de una reacción. Esta representación nos permite comprender por qué la reacción
ocurre hasta alcanzar el equilibrio dado por una determinada relación de productos/reactivos que
es característica de cada reacción.

El siguiente ejercicio se complementa con ejercicios del taller 5a, en este caso se aplica el análisis
en una reacción que ocurre a nivel celular.

Si analizamos la energía libre de la reacción de isomerización de la glucosa-6-fosfato (G-6-P) en


fructosa-6-fosfato (F-6-P) catalizada por la enzima glucosa-fosfato isomerasa:

Glucosa -6-P ⇌ Fructosa-6-P

a) Utilizando los datos del gráfico, calcule


la constante de equilibrio Keq, y ΔG°’ para la
reacción, considerando la temperatura como
25 °C.
b) Si se tienen iguales cantidades de G-6-P y
F-6-P ¿hacia dónde se desplaza la reacción?
c) ¿Cuál será el ∆G real de esta reacción en la
célula si las concentraciones intracelulares
medidas de G- 6-P y F-6-P son 83 y 14 µM
respectivamente?

5
Introducción a la biología celular y molecular 2022

a) Utilizando el gráfico, calcule la constante de equilibrio Keq, y ΔG°’ para la reacción,


considerando la temperatura como 25 °C.

La relación de acción de masas (Q) se define como los múltiplos de la concentración de


productos divididos los múltiplos de la concentración de los reactivos:

Si observamos esa misma definición corresponde a la Keq. La Keq se define para cuando estamos
en equilibrio, es decir: cuando ΔG = 0 y no cambia la concentración de productos y reactivos (la
velocidad de formación y deformación es la misma). NO significa que tengo la misma
concentración de productos y de reactivos, sino que al dividir productos sobre reactivo obtengo
el valor de la Keq.

Cuando al determinar la Q obtengo el valor de la constante de equilibrio (Keq), significa que estoy
en condiciones de equilibrio, si ese valor es diferente a la constante de equilibrio significa que
estoy alejado del mismo.

Observando el gráfico, en el eje de las ordenadas muestra el valor de G. En el único punto en


donde se obtiene el valor de energía libre más bajo es cuando nos encontramos en el equilibrio.
En ese punto se da que el ΔG = 0 (el ΔG real es 0). Los productos y los reactivos no pueden
moverse de ese punto, si hay una pelota en esa rampa sería en el único punto donde no puede
moverse (se encuentra en el equilibrio).

En el gráfico ese punto corresponde cuando tengo 66% de G-6-F y 34% de F-6-F, por lo tanto la
Keq es:

Keq = [FRUCTOSA-6-P]/[GLUCOSA-6-P] = 34/66 = 0,51

Aclaración: Normalmente para determinar la Keq tendremos valores de concentración, pero


matemáticamente que sea concentración o porcentaje para determinar su relación (es decir uno
dividido sobre el otro) da exactamente igual.

Teniendo el valor de la Keq se puede determinar el ΔG°’:

ΔG°’ = − RT Ln (K ) eq

ΔG°’ = − 2,479 Ln (0,51)

ΔG°’ = 1,6 kJ/mol

b) Si se tienen iguales cantidades de G-6-P y F-6-P ¿hacia dónde se desplaza la reacción?

En el gráfico se observa que cuando las cantidades


de G-6-P y F-6-P son iguales (50 % y 50 %) la
reacción no se encuentra en equilibrio, sino
alejada de él. Todos los sistemas tenderán al
equilibrio, donde hay menos energía. Como puede
observarse, el equilibrio no implica que las
concentraciones de G-6-P y F-6-P sean iguales,
sino que lo que ocurre es que se igualan las
velocidades de formación de G-6-P y de F-6-P.

6
Introducción a la biología celular y molecular 2022

Esto también lo podemos ver al calcular el ∆G real cuando las concentraciones de G-6-P y F-6-P
iguales:

ΔG = ΔG°’ + RT Ln [FRUCTOSA-6-P]/[GLUCOSA-6-P]

ΔG = 1,6 kJ/mol + 2,479 kJ/mol x Ln (50/50) = 1,6 kJ/mol + 2,479 kJ/mol x Ln 1

El logaritmo de 1 es igual a 0, por lo tanto se anula el segundo término:

ΔG = 1,6 kJ/mol + 0 = 1,6 kJ/mol

Como el ΔG es positivo, estamos en una situación no favorable hacia los productos (F-6-P) y
podemos ver que la reacción transcurrirá hacia los reactivos (G-6-P).

Una aclaración importante, el parámetro que establece la dirección de la reacción, si ocurre o no,
es el ΔG, que esté presente una enzima o no, no cambia ni la dirección de la reacción ni puede hacer
que ocurra una reacción con un ΔG positivo. Lo único que hacen las enzimas es acelerar la
reacción, aumentar la velocidad, pero de una reacción con ΔG negativo (favorable).

c) ¿Cuál será el ∆G real de esta reacción en la célula si las concentraciones intracelulares


medidas en estado estacionario de G- 6-P y F-6-P son de 83 y 14 µM respectivamente?

ΔG = ΔG°’ + RT Ln Q

Q = [FRUCTOSA-6-P]/[GLUCOSA-6-P]

ΔG = ΔG°’ + RT Ln [FRUCTOSA-6-P]/[GLUCOSA-6-P]

ΔG = 1,6 kJ/mol + 2,479 kJ/mol x Ln (14 x 10-6 M/83 x 10-6 M)

ΔG = − 2,7 kJ/mol

Al tener un valor de ΔG negativo, es indicativo que es favorable la reacción de glucosa-6-P a


Fructosa-6-P. Si en la gráfica marcamos el punto de la reacción para estos valores de
concentraciones intracelulares aproximados de glucosa-6-P y fructosa-6-P podemos observar
que el ΔG es negativo y la formación de fructosa-6-P es favorable.

Ejercicio 4.

En los sistemas biológicos, el ATP es utilizado como el principal donador de energía libre. En las
células, la energía libre obtenida de la hidrólisis del ATP es utilizada para impulsar diferentes
tipos de reacciones que requieren el aporte de energía libre, tales como la síntesis de
intermediarios metabólicos y macromoléculas, contracción muscular y transporte de iones y
pequeñas moléculas, entre otros.

Ecuación de hidrólisis del ATP:

ATP + H2O → ADP + Pi Keq = 2,21 x 105

En la siguiente tabla se indica la concentración total de nucleótidos de adenina y fosfato


inorgánico en células de diferentes tejidos.

7
Introducción a la biología celular y molecular 2022

Tipo celular ATP (mM) ADP (mM) Pi (mM)

Grupo 1 Miocitos 8,0 0,02 3,0

Grupo 2 Eritrocitos 2,25 0,25 1,65

Grupo 3 Hepatocitos 3,4 1,3 4,8

a) ¿Qué tipo de sistema termodinámico es la célula: cerrado, abierto o aislado?

Según su relación con el entorno, los sistemas pueden ser aislados, cerrados o abiertos. Un
sistema aislado es aquel que no intercambia ni materia ni energía con el entorno; un sistema
cerrado es aquel que intercambia energía pero no materia con el entorno, mientras que un
sistema abierto intercambia energía y materia con el entorno.

Las células son sistemas abiertos dado que intercambian energía y materia con el entorno.
Pueden captar combustibles químicos del exterior (obteniendo la energía de su oxidación) y
pueden extraer energía de los compuestos químicos. Además pueden transferir energía al
entorno en forma de calor.

b) ¿El ΔG°’ para la hidrólisis del ATP calculado en el ejercicio 2 se puede aplicar a los 3 tipos
celulares planteados en la tabla?

El valor calculado de ΔG°’ en el ejercicio 2 es: −30,5 kJ/mol

∆G’0 permite predecir qué ocurrirá con una reacción en condiciones estándar (25 ºC, pH 7,
reactivos y productos presentes a 1 M), por lo tanto tiene un valor constante e invariable para
cada reacción. Por lo tanto, el valor de ΔG°’ para esta reacción no varía, es el mismo en miocitos,
eritrocitos, hepatocitos y otros tipos celulares diferentes, puesto que es un valor en condiciones
estándar.

Para determinar la energía libre de esta reacción en las condiciones que existen en las células es
necesario calcular el ∆G real, que depende las concentraciones intracelulares de reactivos y
productos, que pueden ser diferentes entre los tejidos.

c) Parte de la energía libre estándar ΔG°’ obtenida de la hidrólisis del ATP se utiliza para
impulsar diferentes reacciones.
Considerando la siguiente reacción

Glicerol + ATP → Glicerol-3P + ADP

¿Es suficiente la energía de la hidrólisis del ATP para impulsar la fosforilación del glicerol a
glicerol-3-fosfato? Sabiendo que ΔG°’ para la hidrólisis del glicerol-3-fosfato es –9,2 kJ/mol,

Para obtener la ecuación de síntesis de Glicerol-3-P es necesario sumar dos reacciones la


hidrólisis del ATP y la de fosforilación del glicerol. Los datos que tenemos son de las dos
reacciones en el sentido de hidrólisis.

ATP + H O → ADP + Pi ΔG°’ = −30,5 kJ/mol


2

Glicerol-3-P + H2O → Glicerol + Pi ΔG°’ = −9,2 kJ/mol

8
Introducción a la biología celular y molecular 2022

Es necesario invertir la ecuación de hidrólisis de Glicerol-3-P para que la suma efectivamente


forme la reacción que deseamos. Al invertir la ecuación el ΔG°’ mantiene su valor pero cambia el
signo.

Por tanto como en la hidrólisis del ATP se liberan 30,5 kJ/mol y para sintetizar Glicerol-3-P se
necesitan 9,2 kJ/mol, la energía liberada en hidrólisis del ATP alcanza y sobra para sintetizar
Glicerol-3-P.

Si quisiéramos calcular el ΔG°’ de la reacción global sería de la siguiente manera

ATP + H2O → ADP + Pi ΔG°’ = −30,5 kJ/mol

Glicerol + Pi → Glicerol-3P + H2O ΔG°’ = 9,2 kJ/mol

Glicerol + ATP → Glicerol-3P + ADP ΔG°’ = ΔG°’1 + ΔG°’2

ΔG°’ = – 30,5 kJ/mol + 9,2 kJ/mol = –21,3 kJ/mol

El valor de ΔG°’ es negativo, por lo que la reacción global es exergónica. En este caso, la energía
almacenada en el ATP se utiliza para impulsar la síntesis de glicerol-3-P dado que su formación a
partir de glicerol y Pi es endergónica.

d) Calcule el ∆G real de la hidrólisis de ATP en un tipo celular. ¿Espera que el valor de la energía
liberada en esta reacción sea igual o diferente entre los distintos tipos de células? ¿Cómo es
este valor comparado al de ΔG°’?

Para calcular el ΔG en cada uno de los tejidos utilizaremos la ecuación de cálculo de ΔG real.

Importante: las concentraciones deben estar expresadas en M.

ΔG = ΔG°’ + RT Ln ([ADP][Pi]/[ATP])

Miocitos:

ΔG = − 30,5 kJ/mol + 2,479 kJ/mol Ln (0,02 x10-3 x 3,00 x10-3 /8,00 x10-3) = − 59,7 kJ/mol

Eritrocitos:

ΔG = − 30,5 kJ/mol + 2,479 kJ/mol Ln (0,25 x10-3 x 1,65 x10-3 /2,25 x10-3) = − 51,8 kJ/mol

Hepatocitos:

ΔG = − 30,5 kJ/mol + 2,479 kJ/mol Ln (1,3 x10-3 x 4,8 x10-3 /3,4 x10-3) = − 46,12 kJ/mol

Los valores de ΔG difieren del valor de ΔG°’ dado que estamos considerando las concentraciones
intracelulares de reactivos y productos y no las condiciones estándar. A su vez, debido a que las
concentraciones de ATP, ADP y Pi pueden diferir entre los diferentes tipos celulares, el ΔG real
de las reacciones puede variar en el miocito, hepatocito o en el eritrocito.

También podría gustarte