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Resumen
FondoLos factores genéticos humanos son determinantes importantes del riesgo de paludismo. Investigamos las asociaciones entre Hematol de lanceta2018;
5: e333–45
múltiples polimorfismos candidatos, muchos relacionados con la estructura o función de los glóbulos rojos, y el riesgo de enfermedad
grave. Plasmodium falciparumpaludismo y sus fenotipos específicos, incluidos el paludismo cerebral, la anemia palúdica grave y la PublicadoEn línea
19 de julio de 2018
dificultad respiratoria.
http://dx.doi.org/10.1016/
S2352-3026(18)30107-8
MétodosHicimos un estudio de casos y controles en el condado de Kilifi, Kenia. Reclutamos como casos a niños que presentaban malaria VerComentariopágina e322
grave en la sala de alta dependencia del hospital del condado de Kilifi. Incluimos como controles a los bebés nacidos en la comunidad
* Contribuyó por igual
local entre el 1 de agosto de 2006 y el 30 de septiembre de 2010, que formaban parte de un estudio genético. Probamos las asociaciones
†Miembros enumerados en el apéndice
entre una variedad de genes protectores contra la malaria candidatos y el riesgo de malaria grave y sus fenotipos específicos.
KEMRI/Fideicomiso de Bienvenida
Utilizamos un enfoque de permutación para tener en cuenta múltiples comparaciones entre polimorfismos y malaria grave. Programa de Investigación,
Consideramos que los valores de p inferiores a 0,005 son significativos para el análisis primario de la asociación entre los genes Kilifi, Kenia(CM Ndila PhD,
codifica para el raro antígeno del grupo sanguíneo Dantu. La heterocigosis para Dantu se asoció con el riesgo de Reino Unido; Escuela de Higiene y
Medicina Tropical de Londres,
paludismo grave (OR 0,57, IC del 95 % 0,49–0,68; p=3,22 × 10–¹¹), al igual que la homocigosidad (0·26, 0·11–0·62; p=0·002).
Londres, Reino Unido(N Sepúlveda
PhD, Prof. TG Clark PhD); Centro de
InterpretaciónAmbas cosasATP2B4y el antígeno del grupo sanguíneo Dantu están asociados con la estructura y función de los glóbulos Estatística e Aplicações da
rojos.ATP2B4codifica la ATPasa 4 transportadora de calcio de la membrana plasmática (la principal bomba de calcio en los glóbulos Universidade de Lisboa, Lisboa,
Portugal(N Sepúlveda); Instituto
rojos) y las glicoforinas son ligandos para que los parásitos invadan los glóbulos rojos. El trabajo futuro debería apuntar a descubrir los
Wellcome Sanger, Cambridge, Reino
mecanismos por los cuales estos polimorfismos pueden resultar en una protección contra la malaria grave e investigar las Unido(S Kariuki, Prof. DP Kwiatkowski);
implicaciones de estas asociaciones para la salud en general. Departamento de Medicina, Imperial
College, St Mary's Hospital, Londres,
Reino Unido
FondosWellcome Trust, el Consejo de Investigación Médica del Reino Unido, la Unión Europea y la Fundación para los Institutos
Nacionales de Salud como parte de la Iniciativa Bill & Melinda Gates Grand Challenges in Global Health. (Profesor K Maitland,
Profesor TN Williams); e
Derechos de autor© 2018 El(los) autor(es). Publicado por Elsevier Ltd. Este es un artículo de acceso abierto bajo la licencia CC investigador no afiliado
[ResearcherID: L-3155-2013]
BY 4.0.
(M Mackinnon PhD)
Correspondencia a:
Profesor Thomas N. Williams, Investigación en contexto
Investigación de KEMRI/Wellcome Trust
Programa, Centro de Evidencia antes de este estudio densidades de parásitos durante los episodios de malaria, sobre los índices
Medicina Geográfica Realizamos búsquedas en PubMed entre el 1 de enero de 1960 y el 30 de mayo de hematológicos y sobre la muerte durante el ingreso hospitalario. Además, en
Investigación-Costa, Kilifi 80108,
2018, con los términos ("malaria" AND "case-control"), ("malaria" AND "ATP2B4), todos los participantes genotipamos 121 polimorfismos en 70 genes
Kenia
(“malaria” Y “FREM3”) y “Dantú”. No restringimos nuestra búsqueda por idioma. candidatos y pudimos poner asociaciones en contexto con otros genes
tom.williams@im perial.ac.uk
Complementamos nuestra búsqueda con una revisión de las listas de referencias candidatos y cuantificar su efecto general sobre la susceptibilidad a la
VerEn líneapara el apéndice
dentro de los documentos identificados por nuestra búsqueda y aquellos de nuestros enfermedad. La presencia de la mutación de Dantu se asoció con reducciones
registros personales. Nuestra búsqueda recuperó seis artículos que contenían datos en el riesgo de paludismo grave en general: 43 % entre los heterocigotos y 74
sobre malaria yATP2B4 % entre los homocigotos. La protección fue igual para todas las formas de
(cuatro estudios de casos y controles, un estudio de genética poblacional malaria grave y Dantu también protegió contra la muerte relacionada con la
y un artículo de revisión), dos artículos relevantes relacionados con la malaria. Similarmente,ATP2B4fue fuertemente protector contra todas las
malaria yFREM3 (un estudio de casos y controles y un estudio de genética formas de malaria grave pero, además, se asoció con densidades de parásitos
Valor añadido de este estudio la negatividad para el antígeno Duffy del grupo sanguíneo de los glóbulos
Presentamos los resultados de un gran estudio de casos y controles (n=6193) rojos ha llevado directamente al diseño de una vacuna prometedora.
dePlasmodium falciparumpaludismo, llevado a cabo en una población Descubrir los mecanismos por los cualesATP2B4y Dantu protegen contra
cuidadosamente fenotípica. Hemos descrito los efectos de ambos ATP2B4y severasfalciparumla malaria ofrece un potencial similar para el desarrollo de
Dantu sobre fenotipos específicos de malaria grave, sobre fármacos y vacunas en el futuro.
Los episodios de paludismo causan altos niveles de anemia Incluimos como casos a niños (menores de 14 años) que
infantil y desnutrición en áreas endémicas de paludismo, acudieron al hospital con características clínicas de paludismo
mientras que el paludismo grave, que incluye anemia palúdica grave.5–7y posteriormente fueron admitidos en la sala de alta
grave, paludismo cerebral y dificultad respiratoria, se asocia con dependencia del hospital del condado de Kilifi. Se excluyeron los
1
una alta mortalidad aguda. niños que se presentaron antes o después de las fechas de
La malaria ha tenido un efecto importante en el genoma humano a reclutamiento y aquellos sin características específicas de malaria
través de la selección de polimorfismos asociados con una mejor grave. Centramos nuestro estudio en los niños, porque en el
supervivencia.2Algunos de estos polimorfismos incluyen las variantes contexto de la mayoría de los países del África subsahariana, la
clásicas de glóbulos rojos, el rasgo de células falciformes y α.+ malaria grave se limita casi exclusivamente a la infancia.1
-talasemia. Sin embargo, otros polimorfismos también podrían Clasificamos los casos en los principales fenotipos de paludismo
3
brindar protección contra la malaria. cerebral, dificultad respiratoria, anemia palúdica grave y otro
Aquí, describimos el efecto de una amplia gama de candidatos paludismo grave (que incluía evidencia clínica de postración,
genéticos clave, la mayoría de los cuales se relacionan con la hipoglucemia e hiperparasitemia), como se describe en otra
estructura y función de los glóbulos rojos, sobre el riesgo de parte.5–7También clasificamos los casos en función de su estado
malaria infantil grave en la población de Kilifi en Kenia. El objetivo de supervivencia de pacientes hospitalizados. Usamos estas
de nuestro estudio fue verificar la importancia de los candidatos categorías sobre la base de que están asociadas con las tasas
específicos que podrían proporcionar información sobre la más altas de mortalidad7o que probablemente se habrían
fisiopatología de la malaria grave y que podrían usarse de asociado con una alta mortalidad en la era previa al tratamiento
manera plausible para respaldar el desarrollo de nuevos y, como tales, habrían sido fuertes impulsores de la selección
enfoques para la prevención y el tratamiento de esta enfermedad darwiniana.
debilitante. Incluimos como controles a bebés (de 3 a 12 meses de edad) que
nacieron dentro de la misma área de estudio que los casos y que
Métodos fueron reclutados para un estudio de cohortes que investigaba la
8
Diseño del estudio y participantes susceptibilidad genética a una variedad de enfermedades infantiles.
4
Nuestro estudio se llevó a cabo en el condado de Kilifi, en la costa de Reclutamos aproximadamente dos controles para cada caso, una
Kenia. Investigamos el efecto de una gama de genes candidatos sobre proporción a la que llegamos por razones pragmáticas.
el riesgo de paludismo falciparum grave, utilizando un enfoque de Los padres de todos los participantes del estudio proporcionaron el
casos y controles. consentimiento informado individual por escrito. Aprobación ética para
el estudio fue otorgado por el Instituto de Investigación un umbral de p<0·0001 (este umbral incluye una
Médica de Kenia y el Comité Nacional de Revisión Ética en corrección de Bonferroni para el número de
Nairobi, Kenia (SCC1192) y el Comité de Revisión Ética polimorfismos incluidos en este estudio). Así, se
Tropical de Oxford en Oxford, Reino Unido (020-06). analizaron 121 polimorfismos.
Calculamos las razones de probabilidad (OR) para las
Procedimientos asociaciones de polimorfismos con el riesgo de paludismo
Investigamos la asociación entre la malaria grave y 129 grave y sus principales fenotipos, y para los resultados de la
polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) más una deleción enfermedad en términos de mortalidad, comparando las
de 3·7 kb en 70 regiones de genes que habían sido frecuencias de alelos y genotipos entre casos y controles,
identificadas como candidatas a través de estudios previos 9 utilizando un modelo de regresión logística de efectos fijos.
(apéndice pp 2–4). Hicimos el genotipado con la plataforma Ajustamos los análisis para los efectos de confusión de los
Sequenom MassARRAY iPLEX (Agena Biosciences, Hamburgo, antecedentes genéticos (utilizando el origen étnico
Alemania;9apéndice pp 5, 6), usando ADN extraído por autoinformado) y el polimorfismo rs334 en HBB. El rs334
métodos patentados (ABI PRISM, Applied Biosystems, Foster causa tanto el rasgo de células falciformes como la
City, CA, EE. UU.; Qiagen DNA Blood Mini Kit, Qiagen, enfermedad de células falciformes, que son posibles factores
Crawley, Reino Unido) de muestras frescas o congeladas de de confusión importantes en la interpretación de dichos
sangre entera obtenida de los participantes . Genotipamos análisis. El género también es un factor de riesgo conocido
muestras para la forma africana común de α+-talasemia (aunque pequeño) para la malaria, tanto a nivel genético
(deleción de 3·7 kb enHBA1yHBA2 [–α³ como a nivel sociocultural; por lo tanto, usamos el género
·
⁷-talasemia]) por PCR, como se describió anteriormente,10,11 como una covariable en los análisis de polimorfismo
y utilizamos un ensayo de polimorfismo de longitud de fragmentos de autosómico. No observamos específicamente el efecto de
restricción BlpI (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, EE. UU.) para grupos étnicos individuales en Kilifi debido a consideraciones
tipificar el raro polimorfismo del antígeno del grupo sanguíneo Dantu de espacio y poder. En nuestro análisis principal de los
(conocido como DUP4, una variante del número de copias duplicadas), fenotipos de paludismo grave, permitimos que se incluyeran
como se describió anteriormente. 12
casos individuales más de una vez si manifestaban más de
un fenotipo de paludismo grave. En los análisis secundarios,
Resultados clasificamos a los individuos únicamente en función de la
El resultado primario fue la asociación entre polimorfismos mortalidad relativa, utilizando la jerarquía de paludismo
genéticos específicos y el riesgo de falciparumpaludismo cerebral, anemia palúdica grave, dificultad respiratoria y
tanto en general como en términos de fenotipos específicos, otras formas de paludismo grave.G6PD, en el que notamos
expresados como razones de probabilidad (OR) para su efectos opuestos en hombres y mujeres que no fueron
frecuencia en casos en comparación con controles sanos no detectables en análisis combinados.13En todos nuestros
infectados. Los resultados secundarios incluyeron análisis, utilizamos un enfoque metaanalítico estándar que
asociaciones entre polimorfismos y mortalidad de pacientes utilizó efectos fijos (ponderación de varianza inversa) para
hospitalizados, y entre polimorfismos yfalciparumdensidades tener en cuenta la varianza desigual.
de parásitos entre los casos graves de paludismo, a juzgar 14
por los frotis de sangre periférica. Probamos las asociaciones entre los polimorfismos y el riesgo
de paludismo grave utilizando una variedad de diferentes
análisis estadístico modelos genéticos de herencia (incluidos los aditivos,
Determinamos el tamaño de la muestra para este estudio de manera dominantes, heterocigotos, hemicigotos y recesivos) y
pragmática, como el número de niños que se presentaron en el seleccionamos los que eran más significativos para cada
Hospital del Condado de Kilifi durante el período de estudio que eran polimorfismo. Sin embargo, analizamos el SNP rs8176719 solo
elegibles para su inclusión como casos. Incluimos aproximadamente bajo un modelo recesivo, porque este modelo fue el único que
dos controles para cada caso para maximizar la potencia. Hicimos nos permitió probar una asociación entre la malaria grave y el
todos los análisis usando R. grupo sanguíneo O. Hacer más de una prueba estadística puede Para más informaciónRver http://
De los 130 polimorfismos analizados, eliminamos nueve antes conducir a una mayor probabilidad de resultados falsos. www.r-project.org
del análisis después de los procedimientos estándar de control -positivos. Por lo tanto, utilizamos un límite de significancia
de calidad. Eliminamos ocho SNP porque eran monomórficos y, apropiado (p<0·005), que representó la distribución simulada de
por lo tanto, no contribuían al análisis (BCAS3[rs184142841], valores p potenciales, al permutar (reasignar aleatoriamente) el
GRIP1[rs192909543],GUSBP5 [rs148111931],LTBP2[rs74063230], estado de caso o control 1000 veces usando elSNPassocpaquete
OXNAD1[rs200704287, rs75180423 y rs79691057], yRHOG[ en R. Luego usamos el límite inferior del IC del 95% de la
rs138826089]) y se eliminó un SNP porque faltaba más del 10 % distribución del valor de p resultante (p≤0·005) como nuestro
de los genotipos (PLEKHG1[rs144224092]), lo que hace que las nivel de significancia para todos los análisis posteriores.15
llamadas de genotipo no sean confiables (apéndice pp 2–4). Ajustamos los valores de p por género, grupo étnico y genotipo
Todos los polimorfismos restantes pasaron una prueba de rs334. Además, debido a que se ha informado epistasis entre
equilibrio de Hardy-Weinberg en la muestra de control usando varios polimorfismos de resistencia a la malaria,dieciséistambién
usamos una probabilidad
Casos Control S
(n=3949)
Paludismo grave Paludismo cerebral Paludismo severo Dificultad respiratoria Otro paludismo grave
(n=2244) (n=1233) anemia (n=686) (n=686) (n=436)
Edad (meses) 28·0 (15·0–43·0) 28·0 (16·0–43·0) 19·0 (10·0–33·0) 25·0 (12·7–38·0) 32·0 (19·2–54·0) 6·0 (5·0–8·0)
Casos masculinos 1157 (52%) 627 (51%) 357 (52%) 357 (52%) 226 (52%) 1992 (50%)
Casos femeninos 1087 (48%) 606 (49%) 329 (48%) 329 (48%) 210 (48%) 1957 (50%)
Origen étnico
Giriama 1320 (59%) 743 (60%) 385 (56%) 379 (55%) 268 (62%) 1335 (46%)
Chonyi 527 (23%) 264 (21%) 176 (26%) 181 (26%) 97 (22%) 1411 (36%)
VCM (fL) 74·1 (9·4) 74·3 (9·3) 75·4 (10·6) 74·8 (9·8) 73·3 (8·9) N/A
Plaquetas (× 10⁶ por L) 163 (146) 170 (145) 139 (118) 154 (147) 168 (164) N/A
Muerte de paciente hospitalizado 263 (12%) 196 (16%) 82 (12%) 119 (17%) 21 (5%) N/A
Los datos son mediana (RIC), número de participantes (%) o media (DE), a menos que se indique lo contrario. Los casos de paludismo grave se clasificaron como paludismo cerebral, anemia palúdica
grave y dificultad respiratoria; los pacientes que presentan más de un fenotipo de paludismo grave están representados en cada uno de los subgrupos. MCV = volumen celular medio. N/A=no aplicable.
enfoque de proporción 11para probar las interacciones por pares entre Papel de la fuente de financiación
polimorfismos en cromosomas autosómicos para los cuales Los financiadores no tuvieron ningún papel en el diseño del estudio, la
identificamos asociaciones significativas con malaria grave en recopilación de datos, el análisis de datos, la interpretación de datos o
nuestros análisis primarios. la redacción del informe. CMN, MM, KAR y TNW tuvieron acceso a
Evaluamos la proporción de la varianza total en el riesgo datos sin procesar. El autor correspondiente tuvo pleno acceso a
general de desarrollar paludismo grave al menos una vez todos los datos del estudio y tuvo la responsabilidad final de la
antes de los 14 años en el condado de Kilifi que podría decisión de enviar para publicación.
explicarse tanto por polimorfismos individuales como en
general. Analizamos datos en las escalas sin procesar Resultados
(binomial), transformadas logit y transformadas probit bajo Entre el 11 de junio de 1995 y el 12 de junio de 2008, 2244 niños se
modelos lineales generalizados usando elglmfunción en el presentaron en el pabellón de alta dependencia del condado de Kilifi
PLEKHG1(rs55958968)
AJAP1(rs113788643) PLEKHG1(rs79100774)
AJAP1(rs6674631) PLEKHG1(rs114726617)
LPHN2(rs146428334) PLEKHG1(rs2131263)
LPHN2(rs72933304) PLEKHG1(rs76924464)
LPHN2(rs72933310) PLEKHG1(rs151293197)
LPHN2(rs72933350) PLEKHG1(rs142712208)
LPHN2(rs4650365) PLEKHG1(rs15116938)
7 GBP(rs1803632) PLEKHG1(rs141555199)
DARC(rs2814778) N0D1(rs2075820)
ATP2B4(rs55868763) CD36(rs3211938)
ATP2B4(rs1541255) TLR4(rs4986790)
ATP2B4(rs10900585) TLR4(rs4986791)
ATP2B4(rs4951074) ABO(rs8176750)
ATP2B4 (rs3753036) ABO(rs56390333)
IL10(rs3024500) ABO(rs8176746)
IL10(rs1800896) ABO(rs8176719)
IL 10(rs1800890) MKI67(rs11016116)
CR1(rs17047660) MKI67(rs148494166)
CR1(rs17047661) MKI67(rs115947774)
LOC727982 (rs11371478) RRM1(rs116472045)
LOC727982 (rs1371474) HBB(rs334)
LOC727982 (rs10188961) TRIM5(rs7935564)
LAPTM4A(rs973128) RTN3(rs542998)
SDC1(rs11899121) GRIP1(rs1394263)
IL1A(rs17561) CAN1(rs1566830)
IL1B(rs1143634) CAN1(rs12307123)
ZSWIM2(rs4316902) CAN1(rs10459266)
ZSWIM2(rs14478284) IL22(rs2227507)
IL 17RE(rs708567) IL22(rs1012356)
TLR9(rs187084) IL22(rs2227491)
IL17RD(rs6780995) IL22(rs2227485)
ARL14(rs76033371) IL22(rs2227478)
ARL14(rs75731597) TPTE2(rs182873742)
ARL14(rs74954675) SPTB(rs229587)
B3GALNT1(rs12107243) YLPM1(rs101390160)
TLR1(rs4833095) RPS6KL 1(rs3742785)
TLR6(rs5743810) HBA (–α³·⁷-talasemia)
TLR6(rs5743809) ADCY9(rs2230739)
INPP4B(rs77389579) ADCY9(rs10775349)
INPP4B(rs13103597) IL4R(rs1805015)
USP38(rs4266246) IL4(rs2243250)
USP38(RS28459062) ADORA2B(rs2535611)
GAB1(rs7663712) NOS2(rs2297518)
FREM3(rs184908374) NOS2(rs1800482)
FREM3(rs149914432) NOS2(rs9282799)
FREM3(rs186790584) NOS2(rs8078340)
FREM3(rs184895969) TBX2(rs73991577)
FREM3(rs186873296) EMR1(rs373533)
C6(rs1801033) EMR1(rs461645)
IRF1(rs2706384) ICAM(rs5498)
IL13(rs20541) GNAS(rs8316)
GABBR1(rs192151845) DERL3(rs1128127)
HCG4(rs114980857) CD40LG(rs3092945_TODOS)
LTA(rs2239704) CD40LG(rs3092945_F)
LTA(rs909253) CD40LG(rs3092945_M)
TNF(rs1799964) CD40LG(rs1126535_TODOS)
TNF(rs1800750) CD40LG(rs1126535_F)
TNF(rs1800629) CD40LG(rs1126535_M)
TNF(rs361525) G6PD(rs1050829_TODO)
TNF(rs3093662) G6PD(rs1050829_F)
HSPA1B(rs6457452) G6PD(rs1050829_M)
SNORD48(rs116288147) G6PD(rs1050828_TODOS)
CTL4(rs2242665) G6PD(rs1050828_F)
IL20RA(rs1555498) G6PD(rs1050828_M)
0 5 10 15 20 40 60 0 5 10 15 20 40 60
- Iniciar sesión10(pags) - Iniciar sesión10(pags)
Figura 2:Distribución de valores de p para pruebas de asociación con fenotipos de malaria grave
El valor p mínimo (–log10[p]) para cada polimorfismo en los modelos. Ajustamos los valores de p por género, grupo étnico y genotipo rs334. La línea vertical discontinua
representa el umbral significativo de p<0·005, que se determinó mediante pruebas de permutación. Los polimorfismos evaluados se enumeran en orden cromosómico
(apéndice, págs. 2–4).
Frecuencia (%) del alelo Frecuencia (%) del alelo Modelo* sin ajustar Equilibrado†
derivado en controles derivado en casos
(normal/het/hom [n]) (normal/het/hom [n])
ATP2B4(rs1541255, cromosoma 1; A → G)
Paludismo grave 33% (1741/1774/418) 31% (1010/1016/185) R 0·74 (0·62–0·89) 0·001 0·76 (0·63–0·92) 0·001
Paludismo cerebral 33% (1741/1774/418) 30% (581/549/96) R 0·68 (0·54–0·86) 0·001 0·69 (0·54–0·89) 0·001
Anemia palúdica grave 33% (1741/1774/418) 29% (323/293/49) R 0·63 (0·46–0·87) 0·003 0·60 (0·43–0·84) 0·003
Dificultad respiratoria 33% (1741/1774/418) 30% (322/313/49) R 0·62 (0·46–0·85) 0·001 0·64 (0·46–0·88) 0·002
Muerte 33% (1741/1774/418) 31% (119/117/23) R 0·80 (0·51–1·25) 0·31 0·74 (0·46–1·29) 0·25
IL10(rs1800890, cromosoma 1; A→T)
Paludismo grave 24% (2270/1418/257) 23% (1313/821/199) R 0·69 (0·55–0·88) 0·002 0·72 (0·56–0·93) 0·002
Paludismo cerebral 24% (2270/1418/257) 23% (725/443/57) R 0·74 (0·55–0·99) 0·03 0·76 (0·55–0·99) 0·04
Anemia palúdica grave 24% (2270/1418/257) 24% (394/256/37) R 0·83 (0·58–1·19) 0·3 0·89 (0·62–1·30) 0·33
Dificultad respiratoria 24% (2270/1418/257) 23% (400/252/33) R 0·75 (0·51–1·09) 0·12 0·75 (0·51–1·11) 0·12
Muerte 24% (2270/1418/257) 23% (156/86/16) R 0·96 (0·57–1·63) 0·9 0·98 (0·72–1·72) 0·97
LPHN2(también conocido comoADGRL2; rs72933304, cromosoma 1, C→A)
Paludismo grave 8% (3297/619/26) 7% (1912/296/8) A 0·80 (0·69–0·92) 0·001 0·83 (0·72–0·96) 0·002
Paludismo cerebral 8% (3297/619/26) 7% (1057/168/5) A 0·82 (0·69–0·98) 0·02 0·86 (0·71–0·99) 0·03
Anemia palúdica grave 8% (3297/619/26) 7% (570/93/3) A 0·85 (0·68–1·06) 0·15 0·88 (0·70–1·11) 0·17
Dificultad respiratoria 8% (3297/619/26) 7% (587/93/3) A 0·83 (0·66–1·03) 0·09 0·85 (0·68–1·07) 0·11
Muerte 8% (3297/619/26) 6% (228/34/0) A 0·74 (0·51–1·05) 0·08 0·77 (0·53–1·11) 0·12
LOC727982 (rs1371478, cromosoma 2; C→T)
Paludismo grave 26% (2123/1466/320) 29% (1088/958/163) H 1·30 (1·17–1·45) 1·90 × 10⁻⁶ 1·35 (1·20–1·51) 2·31 × 10⁻⁶
Paludismo cerebral 26% (2123/1466/320) 29% (606/536/84) H 1·31 (1·15–1·50) 4·61 × 10⁻⁵ 1·37 (1·19–1·57) 7·19 × 10⁻⁵
Anemia palúdica grave 26% (2123/1466/320) 30% (318/291/154) H 1·31 (1·11–1·55) 0·001 1·45 (1·22–1·74) 0·001
Dificultad respiratoria 26% (2123/1466/320) 29% (331/308/43) H 1·38 (1·17–1·63) 0·0001 1·47 (1·23–1·74) 0·0001
Muerte 26% (2123/1466/320) 29% (126/116/21) H 1·34 (1·04–1·73) 0·02 1·42 (1·09–1·86) 0·02
ARL14(rs75731597, cromosoma 3, A→C)
Paludismo grave 8% (2957/500/34) 10% (1754/401/18) H 1·27 (1·10–1·47) 0·001 1·25 (1·07–1·46) 0·001
Paludismo cerebral 8% (2957/500/34) 10% (975/222/9) H 1·25 (1·05–1·49) 0·01 1·25 (1·04–1·51) 0·01
Anemia palúdica grave 8% (2957/500/34) 10% (520/119/7) H 1·27 (1·02–1·59) 0·03 1·30 (1·07–1·59) 0·04
Dificultad respiratoria 8% (2957/500/34) 12% (546/119/5) H 1·23 (0·98–1·53) 0·06 1·28 (0·99–1·59) 0·08
Muerte 8% (2957/500/34) 10% (1754/401/18) H 1·45 (1·03–2·04) 0·01 1·55 (1·13–2·13) 0·01
FREM3(rs186873296, cromosoma 4, A→G)
Paludismo grave 10% (3216/670/40) 6% (1967/233/6) A 0·57 (0·49–0·66) 4·23 × 10⁻¹⁴ 0·64 (0·53–0·79) 3·18 × 10⁻¹⁴
Paludismo cerebral 10% (3216/670/40) 6% (1087/136/2) A 0·59 (0·49–0·71) 7·16 × 10⁻⁹ 0·63 (0·49–0·79) 1·12 × 10⁻⁸
Anemia palúdica grave 10% (3216/670/40) 5% (593/69/1) A 0·55 (0·43–0·70) 4·56 × 10⁻⁷ 0·67 (0·45–0·81) 8·20 × 10⁻⁷
Dificultad respiratoria 10% (3216/670/40) 5% (611/68/3) A 0·53 (0·41–0·69) 4·67 × 10⁻⁷ 0·61 (0·44–0·83) 2·70 × 10⁻⁷
Muerte 10% (3216/670/40) 6% (228/29/1) A 0·59 (0·40–0·85) 0·003 0·60 (0·31–0·82) 0·004
INPP4B(rs77389579, cromosoma 4, G→T)
Paludismo grave 6% (3407/516/14) 4% (2019/188/2) A 0·61 (0·51–0·72) 4·48 × 10⁻⁹ 0·64 (0·53–0·77) 4·79 × 10⁻⁹
Paludismo cerebral 6% (3407/516/14) 5% (1113/109/1) A 0·63 (0·51–0·78) 1·48 × 10⁻⁵ 0·66 (0·52–0·83) 1·64 × 10⁻⁵
Anemia palúdica grave 6% (3407/516/14) 4% (613/52/1) A 0·56 (0·42–0·75) 3·57 × 10⁻⁵ 0·60 (0·43–0·82) 5·35 × 10⁻⁵
Dificultad respiratoria 6% (3407/516/14) 4% (625/58/0) A 0·58 (0·44–0·78) 8·53 × 10⁻⁵ 0·62 (0·46–0·83) 9·54 × 10⁻⁵
Paludismo grave 26% (256/3632) 31% (198/2032) R 0·73 (0·65–0·81) 3·99 × 10⁻⁹ 0·74 (0·66–0·82) 6·26 × 10⁻⁸
Paludismo cerebral 26% (256/3632) 30% (198/2032) R 0·77 (0·68–0·88) 9·36 × 10⁻⁵ 0·78 (0·69–0·92) 0·0004
Anemia palúdica grave 26% (256/3632) 32% (198/2032) R 0·66 (0·56–0·78) 8·45 × 10⁻⁷ 0·67 (0·78–0·79) 3·68 × 10⁻⁶
Dificultad respiratoria 26% (256/3632) 31% (198/2032) R 0·70 (0·59–0·83) 2·74 × 10⁻⁵ 0·71 (0·60–0·84) 6·45 × 10⁻⁵
Muerte 26% (256/3632) 32% (198/2032) R 0·67 (0·52–0·87) 0·002 0·67 (0·52–0·87) 0·002
(La tabla 2 continúa en la página siguiente)
Frecuencia (%) del alelo Frecuencia (%) del alelo Modelo* sin ajustar Equilibrado†
derivado en controles derivado en casos
(normal/het/hom [n]) (normal/het/hom [n])
Paludismo grave 13% (2970/878/76) 17% (1529/622/76) A 1·37 (1·22–1·55) 9·60 × 10⁻⁹ 1·38 (1·22–1·50) 2·38 × 10⁻⁷
Paludismo cerebral 13% (2970/878/76) 16% (870/317/36) A 1·23 (1·06–1·43) 0·005 1·22 (1·04–1·42) 0·01
Anemia palúdica grave 13% (2970/878/76) 18% (459/196/27) A 1·44 (1·20–1·73) 8·50 × 10⁻⁵ 1·44 (1·19–1·74) 0·0001
Dificultad respiratoria 13% (2970/878/76) 18% (474/178/31) A 2·55 (1·66–3·92) 1·79 × 10⁻⁵ 2·42 (1·56–3·76) 8·04 × 10⁻⁵
Muerte 13% (2970/878/76) 17% (2181/169/8) A 1·28 (0·96–1·71) 0·08 1·29 (0·96–1·72) 0·08
HBB(rs334; cromosoma 11; A→T)
Paludismo grave 8% (3320/596/33) 1% (2159/57/11) H 0·14 (0·12–0·21) 6·81 × 10⁻⁵⁹ 0·15 (0·11–0·20) 2·61 × 10⁻⁵⁸
Paludismo cerebral 8% (3320/596/33) 2% (1185/29/8) H 0·14 (0·09–0·21) 8·64 × 10⁻³⁹ 0·14 (0·09–0·20) 1·67 × 10⁻³⁸
Anemia palúdica grave 8% (3320/596/33) 2% (666/9/8) H 0·07 (0·04–0·15) 2·11 × 10⁻³¹ 0·07 (0·03–0·17) 2·61 × 10⁻³¹
Dificultad respiratoria 8% (3320/596/33) 2% (664/13/7) H 0·11 (0·06–0·19) 8·41 × 10⁻²⁸ 0·11 (0·06–0·20) 1·62 × 10⁻²⁷
Muerte 8% (3320/596/33) 3% (242/11/3) H 0·26 (0·14–0·48) 1·96 × 10⁻⁷ 0·26 (0·14–0·49) 2·41 × 10⁻⁷
Paludismo cerebral 40% (1356/1953/637) 37% (458/590/141) A 0·83 (0·75–0·91) 0·0001 0·83 (0·76–0·92) 0·0001
Anemia palúdica grave 40% (1356/1953/637) 34% (275/299/65) A 0·72 (0·64–0·82) 1·55 × 10⁻⁶ 0·72 (0·65–0·84) 5·45 × 10⁻⁶
Dificultad respiratoria 40% (1356/1953/637) 35% (272/311/79) A 0·78 (0·69–0·89) 0·0001 0·79 (0·70–0·90) 0·0002
Muerte 40% (1356/1953/637) 33% (108/117/24) A 0·70 (0·57–0·85) 0·0003 0·72 (0·59–0·88) 0·0004
Cuando se genotipificó más de un SNP en un locus, mostramos OR para el SNP con el valor de p más bajo para la malaria grave o cualquiera de sus fenotipos. Los individuos con múltiples fenotipos se incluyen en cada uno de esos grupos de
fenotipos para su análisis. het=heterocigoto. hom = homocigoto. OR=razón de posibilidades. SNP = polimorfismo de un solo nucleótido. *Los modelos estadísticos fueron aditivos (A), heterocigotos (H) o recesivos (R). †Ajustado por grupo étnico,
género y rs334. ‡Se presenta el modelo recesivo para rs8176719 y representa el grupo sanguíneo O. §El alelo derivado de rs8176746 identifica el grupo sanguíneo B.
Tabla 2:Polimorfismos con señales significativas de asociación en diferentes fenotipos de malaria grave
Hospital con características de malaria grave por falciparum. CD40LG,FREM3,INPP4B,G6PD,HBA(ambas cosasHBA 1y HBA2
Entre el 1 de agosto de 2006 y el 30 de septiembre de 2010, 3949 ),HBB,IL10,LPHN2(también conocido comoADGRL2),
bebés nacidos en la comunidad local fueron reclutados como LOC727982,RPS6KL1,CAN1, yGNASpara polimorfismos
controles. Las características clínicas, demográficas y de relacionados con autosomas (tabla 2) y relacionados con el
laboratorio de los casos de malaria grave y los controles cromosoma X (tabla 3). Datos pertenecientes a los
comunitarios se resumen en la tabla 1. El flujo de casos a lo largo polimorfismos enCAN1yGNASse presentan en el apéndice
del estudio se muestra en el apéndice (pág. 29). (págs. 7 a 16). Los análisis realizados en términos de grupos
En general, 263 (12%) de 2244 niños con paludismo grave genotípicos se resumen en el apéndice (pág. 17). Las
murieron en el hospital. La mortalidad fue más alta en el asociaciones parecían en su mayoría aditivas y pronunciadas
subgrupo con características clínicas de malaria cerebral (196 de en homocigotos. Sin embargo, se incluyen excepcionesG6PD
1233 [16 %]) y más baja en aquellos que manifestaron otras yRPS6KL1, para el cual se observaron efectos opuestos en
características de malaria grave (21 de 436 [5 %]). 644 (29%) casos niños heterocigotos y homocigotos, yIL10, cuya protección
tenían dos o más fenotipos comunes de malaria severa (figura 1). se restringió a los homocigotos.
Como se anticipó, la asociación más fuerte con el riesgo de malaria
Los resultados de los análisis de asociación entre la malaria grave fue con rs334 enHBB, lo que conduce al rasgo de células
grave en general y todos los polimorfismos bajo investigación se falciformes (OR ajustado 0·15, IC del 95% 0·11–0·20; p=2·61 × 10–⁵⁸),
resumen en la figura 2 y en el apéndice (págs. 7 a 16). Se con tamaños de efecto similares para los tres principales fenotipos de
encontraron asociaciones significativas con la malaria grave en malaria grave (tabla 2; apéndice, págs. 7–16). También se observaron
general, o con al menos uno de sus fenotipos, para fuertes asociaciones con el riesgo de paludismo grave para
polimorfismos en 15 de los 70 genes investigados. Los genes y polimorfismos enABOyHBA, incluyendo rs8176719 enABO(
las ubicaciones fueronABO,ATP2B4,ARL14, representando el grupo sanguíneo O; equilibrado
Frecuencia (%) del alelo Frecuencia (%) del alelo Modelo* sin ajustar Equilibrado†
derivado en controles derivado en casos (normal/
(normal/het/hom [n]) het/ hom[n])
CD40LG(rs3092945; T→C)
Paludismo grave (masculino y femenino) 21% (2760/646/521) 26% (1459/388/379) A 1·14 (1·06–1·22) 0·0002 1·15 (1·06–1·23) 0·0002
Paludismo cerebral (masculino y femenino) 21% (2760/646/521) 25% (815/199/209) A 1·32 (1·10–1·59) 0·003 1·37 (1·13–1·67) 0·003
Anemia palúdica grave (masculina y 21% (2760/646/521) 26% (442/121/120) A 1·17 (1·05–1·31) 0·0001 1·18 (1·05–1·33) 0·003
femenina)
Dificultad respiratoria (masculino y femenino) 21% (2760/646/521) 25% (454/128/98) A 1·28 (1·01–1·63) 0·04 1·27 (1·09–1·64) 0·04
Muerte (masculino y femenino) 21% (2760/646/521) 25% (454/128/98) A 1·30 (0·88–1·92) 0·18 1·32 (0·88–2·00) 0·15
CD40LG(rs3092945; T→C)
Paludismo grave (femenino) 21% (1215/646/81) 25% (614/388/80) A 1·25 (1·10–1·42) 0·0004 1·28 (1·13–1·45) 0·0002
Paludismo cerebral (femenino) 21% (1215/646/81) 26% (355/199/48) A 1·89 (1·30–2·76) 0·001 1·23 (1·05–1·43) 0·007
Anemia palúdica grave (mujer) 21% (1215/646/81) 25% (181/121/26) A 1·33 (1·10–1·62) 0·003 1·36 (1·12–1·64) 0·001
Dificultad respiratoria (mujer) 21% (1215/646/81) 24% (182/128/15) A 1·29 (1·01–1·63) 0·03 1·31 (1·03–1·66) 0·02
Muerte (mujer) 21% (1215/646/81) 24% (182/128/15) A 1·30 (0·88–1·92) 0·18 1·32 (0·90–1·95) 0·15
CD40LG(rs3092945; T→C)
Paludismo grave (masculino) 78% (440/0/1545) 73% (299/0/845) HM 0·83 (0·70–0·99) 0·03 0·80 (0·68–0·95) 0·01
Paludismo cerebral (masculino) 78% (440/0/1545) 76% (161/0/460) HM 0·84 (0·68–1·04) 0·11 0·81 (0·66–1·00) 0·05
Anemia palúdica grave (masculino) 78% (440/0/1545) 73% (94/0/261) HM 0·81 (0·63–1·05) 0·12 0·79 (0·61–1·02) 0·07
Dificultad respiratoria (masculino) 78% (440/0/1545) 75% (83/0/272) HM 0·95 (0·72–1·23) 0·71 0·93 (0·71–1·21) 0·61
Muerte (masculino) 78% (440/0/1545) 75% (83/0/272) HM 0·93 (0·62–1·40) 0·75 0·91 (0·61–1·36) 0·65
G6PD(rs1050828; C→T)
Paludismo grave (masculino y femenino) 19% (2863/639/438) 19% (1643/306/271) H 0·82 (0·70–0·97) 0·01 0·80 (0·68–0·96) 0·01
Paludismo cerebral (masculino y femenino) 19% (2863/639/438) 18% (921/168/131) H 0·80 (0·65–0·98) 0·02 0·79 (0·64–0·97) 0·02
Anemia palúdica grave (masculina y 19% (2863/639/438) 23% (479/90/111) R 1·60 (1·26–2·03) 0·0001 1·72 (1·33–2·22) 0·0001
femenina)
Dificultad respiratoria (masculino y femenino) 19% (2863/639/438) 18% (510/98/72) H 0·90 (0·74–1·09) 0·28 0·91 (0·74–1·11) 0·28
Muerte (masculino y femenino) 19% (2863/639/438) 18% (510/98/72) H 0·64 (0·46–0·89) 0·006 0·64 (0·45–0·90) 0·006
G6PD(rs1050828; C→T)
Paludismo grave (femenino) 19% (1250/639/62) 18% (729/306/39) H 0·82 (0·70–0·97) 0·01 0·81 (0·69–0·96) 0·01
Paludismo cerebral (femenino) 19% (1250/639/62) 18% (410/168/122) H 0·80 (0·65–0·98) 0·03 0·79 (0·65–0·97) 0·02
Anemia palúdica grave (mujer) 19% (1250/639/62) 17% (224/90/11) H 0·79 (0·61–1·03) 0·07 0·78 (0·60–1·02) 0·06
Dificultad respiratoria (mujer) 19% (1250/639/62) 19% (215/198/12) H 0·89 (0·58–1·38) 0·61 0·88 (0·68–1·14) 0·35
Muerte (mujer) 19% (1250/639/62) 19% (215/198/12) H 0·56 (0·37–0·85) 0·004 0·57 (0·38–0·86) 0·005
G6PD(rs1050828; C→T)
Paludismo grave (masculino) 18% (1613/0/376) 20% (914/0/232) HM 1·11 (0·92–1·33) 0·26 1·08 (0·90–1·30) 0·36
Paludismo cerebral (masculino) 18% (1613/0/376) 18% (511/0/109) HM 0·92 (0·72–1·17) 0·48 0·91 (0·72–1·15) 0·45
Anemia palúdica grave (masculino) 18% (1613/0/376) 28% (255/0/100) HM 1·72 (1·32–2·23) 6·98 × 10⁻⁵ 1·68 (1·30–2·17) 0·0001
Dificultad respiratoria (masculino) 18% (1613/0/376) 17% (295/0/60) HM 0·89 (0·66–1·21) 0·89 0·87 (0·64–1·17) 0·36
Muerte (masculino) 18% (1613/0/376) 17% (295/0/60) HM 0·77 (0·48–1·24) 0·28 0·77 (0·48–1·23) 0·26
Los datos provienen de los modelos que fueron más significativos. Los individuos con múltiples fenotipos se incluyen en cada uno de esos grupos de fenotipos para su análisis. Los análisis se realizaron en hombres y mujeres por
separado y combinados, utilizando técnicas estándar de metanálisis. het=heterocigoto. hom = homocigoto. OR=razón de posibilidades. SNP = polimorfismo de un solo nucleótido. *Los modelos estadísticos fueron aditivos (A),
heterocigotos (H), hemicigotos masculinos (HM) o recesivos (R). †Ajustado por grupo étnico, sexo y genotipo rs334.
Tabla 3:SNP del cromosoma X con señales significativas de asociación en diferentes fenotipos de malaria grave
OR 0·74, IC 95% 0·66–0·72; p=6·26 × 10 –⁸), rs8176746 (0·64, 0·53–0·79; p=3·18 × 10 –¹⁴). rs186873296 entre
enABO(identificar el grupo sanguíneo B; 1·38, IC 95% FREM3yGYPEse asoció con niveles similares de protección
1·22–1·50; p=2·38 × 10–⁷), y una deleción de 3·7 kb enHBA contra los tres fenotipos principales de paludismo grave y
(–α³ · ⁷-talasemia; 0·83, 0·76–0·90; p=2·06 × 10–⁶). protegió contra la mortalidad hospitalaria (tabla 2). El efecto
Se observaron otros polimorfismos asociados con la de rs186873296 fue aditivo para el paludismo grave en
malaria grave para rs1541255 enATP2B4(OR ajustado general (heterocigosidad, OR ajustado 0,57, IC del 95 % 0,49–
0·76, IC 95% 0·63–0·92; p=0·001) y rs186873296 0,68; p=3,22 × 10–¹¹; homocigosidad, 0·26, 0·11–0·62; p=0·002;
ubicado en una región intergénica entreFREM3yGYPE apéndice p 17). El rs186873296FREM3
el polimorfismo también se correlacionó estrechamente con el (rs334) representó solo el 2,9% de la varianza total, FREM3(
polimorfismo que es específico del antígeno del grupo sanguíneo rs186873296) para 0,6%, y los diez genes restantes tenían un
Dantu (concordancia 1907 de 1938 [98%]; apéndice p 28). total combinado de 1,7% (apéndice, págs. 26, 27). El origen
Debido a que algunos individuos con más de un fenotipo de étnico contribuyó al 1·9% de la varianza total en
malaria grave se incluyeron en más de un grupo de análisis,
también se realizaron análisis en los que los individuos solo se
Pacientes (n) Densidad de parásitos por µL valor p*
incluyeron en grupos analíticos únicos (apéndice, páginas 18–23,
30). En la inspección visual y la comparación, estos análisis ATP2B4(rs1541255)
coincidieron en gran medida con nuestros análisis generales. normales (AA) 989 43 540 (37 370–50 729) ..
Para excluir la posibilidad de epistasis entre genes individuales Heterocigoto (AG) 1005 40 027 (34 396–46 579) 0·72
asociados con la malaria, que tiene el potencial de ocultar Homocigoto (GG) 181 28 635 (20 033–40 929) 0·04
asociaciones verdaderas en los análisis generales, se realizaron IL10(rs1800890)
análisis por pares para probar las interacciones entre genes y normales (AA) 1294 39 224 (34 329–44 817) ..
genes entre los polimorfismos más significativos (apéndice, págs. Heterocigoto (AT) 808 42 156 (35 612–49 902) 0·78
24, 31). El valor de p más pequeño que encontramos (p=0·02) fue Homocigoto (TT) 95 46 900 (28 675–76 707) 0·77
entre polimorfismos en HBB(rs334) yHBAloci, que dan como LPHN2(también conocido comoADGRL2; rs72933304)
resultado el rasgo de células falciformes o la enfermedad de Normal (CC) 1880 40 179 (35 962–44 890) ..
células falciformes y en –α³·⁷-talasemia, respectivamente. Este Heterocigoto (AC) 292 42 316 (31 939–56 066) 0·93
análisis mostró evidencia de una interacción negativa entre el Homocigoto (AA) 8 36 451 (6660–199 493) 0·99
rasgo de células falciformes y –α³·⁷-talasemia a través de la cual LOC727982 (rs1371478)
los efectos protectores de cada polimorfismo heredado de forma Normal (CC) 1065 40 204 (34 692–46 591) ..
independiente parecían perderse cuando ambos se heredaban Heterocigoto (CT) 946 41 676 (35 640–48 734) 0·94
juntos (apéndice pp 24, 32). Homocigoto (TT) 162 34 272 (23 482–50 019) 0·72
También se investigó el efecto de los polimorfismos asociados ARL14(rs75731597)
con el riesgo de paludismo grave en otras variables del normales (AA) 1726 41 555 (37 009–46 660) ..
paludismo grave, incluidas las densidades de parásitos (la Heterocigoto (AC) 394 34 628 (27 171–44 130) 0·37
cantidad de parásitos en circulación, evaluada mediante el Homocigoto (CC) 18 34 337 (11 042–106 776) 0·94
conteo visual de parásitos en frotis de sangre periférica) o los FREM3(rs186873296)
índices hematológicos. Se observaron tres asociaciones normales (AA) 1933 41 607 (37 305–46 405) ..
significativas entre los polimorfismos candidatos y las
Heterocigoto (AG) 232 32 556 (23 759–44 611) 0·31
densidades de parásitos de la malaria (tabla 4). La parasitemia
Homocigoto (GG) 5 119 644 (13 995–1 022 828) 0·59
fue significativamente menor entre los casos con paludismo
INPP4B(rs77389579)
grave y rasgo drepanocítico en comparación con aquellos con
normal (GG) 1985 39 666 (35 611–44 182) ..
paludismo grave y hemoglobina normal (p=3·66 × 10–⁶), entre
Heterocigoto (GT) 186 48 607 (34 175–69 133) 0·52
homocigotos para el alelo derivado (GG) en rs1541255 deATP2B4
Homocigoto (TT) 2 293 153 (9811–8 759 196) 0·48
en comparación con homocigotos para el alelo ancestral (AA;
ABO(rs8176719)†
p=0,04), y entre niños con grupo sanguíneo O en comparación
Grupo no sanguíneo O 1161 46 170 (40 068–54 455) ..
con casos sin grupo sanguíneo O (p=0,02). También se
grupo sanguíneo O 1026 35 092 (30 220–40 749) 0·02
observaron asociaciones significativas entre polimorfismos e
ABO(rs8176746)‡
índices hematológicos (apéndice p 25). Las concentraciones de
Normal (CC) 1504 38 608 (34 118–43 688) ..
hemoglobina y los recuentos de glóbulos rojos fueron
Heterocigoto (AC) 613 44 829 (36 937–54 406) 0·40
significativamente más altos en los niños con rasgo de células
Homocigoto (AA) 74 46 817 (26 814–81 739) 0·78
falciformes y significativamente más bajos en aquellos con
HBB(rs334)
enfermedad de células falciformes en comparación con los niños
con hemoglobina normal, mientras que las concentraciones de normales (AA) 2125 42 857 (38 648–47 525) ..
hemoglobina fueron más altas en los niños con el SNP Heterocigoto (AT) 56 8649 (4575–16 350) 3·66 × 10⁻⁶
rs186873296 enFREM3 homocigotos para el alelo derivado (GG) Homocigoto (TT) 11 8850 (2103–37 235) 0·08
en comparación con los homocigotos para el alelo ancestral (AA; RPS6KL1(rs3742785)
endotelio vascular, los cuales podrían conducir a una malaria características de la antigua selección de equilibrio. Dantu
De este modo,
12
grave y complicada a través de la oclusión de los vasos también podría estar bajo una selección de equilibrio, en la
sanguíneos en tejidos esenciales, incluido el cerebro.29Como tal, que su selección positiva por la enfermedad de la malaria
varias explicaciones plausibles podrían explicar cómo las podría equilibrarse con la selección negativa de una
mutaciones enATP2B4podría ser relevante para la protección desventaja biológica aún por descubrir. Como tal, también
contra la malaria grave que podría explotarse potencialmente será importante determinar si la homocigosidad para Dantu
para el desarrollo de agentes terapéuticos. Se están realizando está asociada con algún resultado negativo.
más estudios para confirmar la mutación precisa dentro de Las asociaciones entre el rasgo drepanocítico y la
ATP2B4que está asociado con la protección contra la malaria y homocigosidad para rs186873296 enFREM3y los índices
que describe sus efectos tanto en la estructura y función de hematológicos entre los casos graves de malaria son dignos de
PMCA4 específicos de tejido como en los procesos mención. La razón más probable de las altas concentraciones de
fisiopatológicos específicos de malaria. hemoglobina en los casos con estos dos genotipos es que estos
Una segunda asociación, previamente identificada en un estudio de niños están protegidos contra todas las formas de paludismo
asociación del genoma completo de la malaria grave que incluyó un clínico que dan lugar acumulativamente a niveles más altos de
subconjunto de datos y muestras en nuestro estudio,9,12fue visto en anemia en niños sin estos polimorfismos protectores. Aunque
SNP rs186873296 enFREM3. La asociación rs186873296 etiqueta un esta protección es bien reconocida para el rasgo de células
haplotipo para la región vecina que comprendeGYPA, GYPB, yGYPE9y, falciformes,21Se necesitarán más estudios para demostrar que
en particular, un gen híbrido que comprendeGYPAyGYPB,que codifica esto también es cierto paraFREM3. Además, el volumen medio de
un antígeno sanguíneo conocido como Dantu.12En lugar de expresar glóbulos rojos más bajo y el recuento de glóbulos rojos más alto
moléculas normales de GYPA y GYPB, las personas con Dantu que observamos en los casos de rasgo de células falciformes es
producen una molécula híbrida que consta del dominio extracelular consistente con los hallazgos de un estudio anterior realizado en
31
de GYPB y la transmembrana más los dominios intracelulares de la misma población.
GYPA.30En nuestro conjunto de muestra ampliado de casos de malaria Aún no está claro cómo se pueden explotar los
grave de Kenia, encontramos que el rs186873296FREM3 el polimorfismos restantes descritos tanto aquí como en
polimorfismo se correlacionó estrechamente con el polimorfismo que estudios anteriores para obtener una ventaja terapéutica, en
es específico de Dantu.12Una segunda señal de asociación, en INPP4B términos de sus asociaciones con el riesgo general de
dentro de la misma región del gen, también parecía explicar su malaria grave. Por ejemplo, de acuerdo con estudios previos,32,33
estrecha proximidad cromosómica y su fuerte desequilibrio de encontramos que los polimorfismos enCD40LGse asociaron
ligamiento con Dantu. Este hallazgo respalda la conclusión de que la con un riesgo significativamente mayor de paludismo grave,
asociación estadística entre el riesgo de paludismo grave y los SNP en pero a diferencia de los resultados de un estudio de casos y
ambosFREM3—un gen de relevancia biológica desconocida— yINPP4B controles de paludismo infantil grave en Tanzania, no senosotros 20
no son en sí mismos causales con respecto a la susceptibilidad a la encontraron pruebas de que esta asociación fuera específica
malaria, sino que sus asociaciones podrían explicarse por su de un fenotipo de paludismo grave. La ausencia de una
desequilibrio de vinculación estrecha con Dantu, que podría asociación entreCD40LGy un fenotipo específico de malaria
proporcionar de manera más plausible un mecanismo de protección grave en nuestro estudio actual presumiblemente refleja el
contra la malaria sobre la base de la teoría biológica. Sin embargo, en mayor poder de nuestro estudio en relación con estudios
contraste con el rasgo drepanocítico,ATP2B4, y el grupo sanguíneo O, anteriores, porque los estudios pequeños son propensos a
no vimos ningún efecto perceptible de rs186873296 en las densidades resultados falsos positivos como resultado del azar
de parásitos en casos de malaria grave dentro de nuestro estudio. estadístico. Asimismo, aunque se observaron asociaciones
significativas entre la malaria grave y polimorfismos en siete
genes adicionales (IL10,LPHN2[ADGRL2], LOC727982,ARL14,
Por un lado, aunque el polimorfismo de Dantu no parece RPS6KL1,CAN1, yGNAS), sin más datos, su potencial de
ofrecer protección al reducir la invasión de parásitos de glóbulos traducción sigue siendo esquivo.
rojos, la ausencia de cualquier efecto aparente sobre las A pesar de las fuertes asociaciones entre la malaria grave y
densidades de parásitos podría simplemente mostrar que los varios polimorfismos candidatos, nuestros análisis sugieren que
pacientes tienen malaria grave y no excluye la posibilidad de que juntos solo representaron una pequeña proporción (5,2 %) de la
la malaria El efecto protector de Dantu podría estar restringido a variación total en el riesgo de contraer malaria grave en general
la invasión de glóbulos rojos a través de una vía específica de en el condado de Kilifi, solo una cuarta parte del total.
glicoforina por un subconjunto defalciparumparásitos Por otro heredabilidad atribuida en un estudio anterior.3Tal vez quedan
lado, el mecanismo por el cual Dantu protege contra la malaria por descubrir asociaciones genéticas adicionales, nuestro
grave podría no estar mediado en absoluto por una invasión de enfoque de modelado fue inadecuado, o la proporción de
parásitos reducida, sino que se relaciona con la fisiopatología de varianza que atribuimos a la heredabilidad en nuestro estudio
la malaria de manera más amplia. Será necesario seguir anterior fue sobreestimada por el método basado en el pedigrí
trabajando para dilucidar los mecanismos definitivamente. informado verbalmente que usamos,3debido a la confusión entre
El análisis genético comparativo de chimpancés y seres las familias y los factores ambientales relacionados con el hogar
humanos ha demostrado que laGYPA,GYPB, y GYPElos que no fueron capturados completamente al ajustar ambos
loci se encuentran en un área del genoma que tiene términos en nuestro modelo. La baja varianza
atribuible a genes con fuertes efectos protectores individuales [a TGC]). La investigación que condujo a estos resultados recibió financiación del
podría deberse en parte a las bajas frecuencias de población de Séptimo Programa Marco de la Comunidad Europea (FP7/2007-2013, en virtud
del acuerdo de subvención 242095) y del Consejo de Investigación Médica
algunos de estos alelos. Por ejemplo, la mutación rs334 enHBB
(subvención G0600718). MalariaGEN cuenta con el apoyo de Wellcome Trust
contribuye solo en un 2,9 % a la variación total en el riesgo de (WT077383/Z/05/Z) y de la Fundación para los Institutos Nacionales de Salud
paludismo grave a pesar de su gran tamaño del efecto porque (subvención 566) como parte de la
solo se brinda protección a una pequeña proporción (alrededor Iniciativa de los Grandes Desafíos en la Salud Global de Bill y Melinda Gates. El
Centro de recursos para la epidemiología genómica de la malaria cuenta con el
del 15 %) de la población.
apoyo de Wellcome Trust (subvención 090770/Z/09/Z). El Consejo de Investigación
En un estudio anterior,32una mayor proporción de la varianza Médica también brindó apoyo (subvención G0600718). Wellcome Trust también
fue explicada por ambosHBB(6·3%) y otros polimorfismos en otorga premios principales al Wellcome Trust Center for Human Genetics
(subvención 090532/Z/09/Z) y al Wellcome Trust Sanger Institute (subvención
comparación con las proporciones que reportamos en nuestro
098051). Este trabajo forma parte de una colaboración más amplia con el
estudio. Sin embargo, las estimaciones en ese estudio anterior
Consorcio MalariaGEN, cuyos miembros se enumeran en http://
no se ajustaron por el sesgo de verificación que habrá resultado www.malariagen.net/projects/host/consortium-members. Este artículo se publica
del diseño de casos y controles del estudio. Tampoco está claro si con el permiso del Director del Instituto de Investigación Médica de Kenia (KEMRI).
grave. 12 Leffler EM, Banda G, Busby GBJ, et al. Resistencia a la malaria a través de la variación
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estudio. NP, MS, NM, BT y TNW contribuyeron a la recopilación de datos. AWM, SU, palúdica grave.eLife2017;6:e15085.
KOA, KR, CH, AJ y KAR contribuyeron al análisis de muestras. CMN, GN, JO, NS, TGC, 14 Clayton D. Pruebas de asociación en el cromosoma X.
GB, GC, MM, KAR, SK y TNW contribuyeron al análisis de datos. CMN, KAR y TNW Bioestadística2008;9:593–600.
escribieron el primer borrador y prepararon las tablas y figuras. Todos los autores 15 Sham PC, Purcell SM. Pruebas de poder estadístico y significación en
contribuyeron a la búsqueda bibliográfica y la interpretación de datos y aprobaron estudios genéticos a gran escala.Nat Rev. Genet2014;15:335–46.
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Declaración de intereses paludismo grave en los niños de Kenia.Sangre2014;123:2008–16.
No declaramos intereses contrapuestos. 17 Lee SH, Wray NR, Goddard ME, Visscher PM. Estimación de la heredabilidad faltante
para la enfermedad a partir de estudios de asociación de todo el genoma.
Expresiones de gratitud
Soy J Hum Genet2011;88:294–305.
Damos las gracias a Johnstone Makale, Emily Nyatichi y Metrine Tendwa de
apoyo de laboratorio; el personal del Hospital del Condado de Kilifi y el Programa 18 Snow RW, Omumbo JA, Lowe B, et al. Relación entre la morbilidad
por malaria severa en niños y el nivel dePlasmodium falciparum
de Investigación KEMRI-Wellcome Trust, Kilifi, por su ayuda con la recopilación de
transmisión en África.Lanceta1997;349:1650–54.
datos y muestras; ya los participantes del estudio y sus padres por aceptar
participar en este estudio. TNW y MM se financian mediante subvenciones de
19 Maitland K, Marsh K. Fisiopatología del paludismo grave en
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Wellcome Trust (subvenciones 091758 y 202800 [a TNW] y subvención 088634 [a
20 Williams TN. Genética del huésped. En: Gaur D, Chitnis CE, Chauhan VS, eds.
MM]) y DPK y TGC reciben apoyo del Medical Research Council (subvención G19/9
Avances en la investigación de la malaria (Serie Wiley-IUBMB sobre
[a DPK] y subvenciones MR/K000551/1, MR/M01360X/1, MR/N010469/1 y
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