Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
r:
00,1
UNIVERSIDAD DE ALICANTE
FACULTAD DE CIENCIAS
i 9 8 9
~~k w r
~ <I
~sr~Cñl~ldt
UDF n~
V.1lu<
FACULTAD DE
CIENCIAS-BIBLIOTECA
UNIVERSIDAD DE
ALICANTE
REGISTRO.......
lis
Tesis doctoral de la Universidad de Alicante. Tesi doctoral de la Universitat d'Alacant. 1989.
Caracterizacion de dos glutamato deshidrogenasas de Halobacterium. Monica Camacho Carrasco.
cr;
INFORMA
rr
Página
Página
Pá ina
Página
4 .2 .7 .3 . Estabilida d frente a la
concentración salina . . . . . . . . . . . . . 149
4 .2 .7 .4 . Estabilida d frente al tiempo de
almacenamiento . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157
4 .2 .8 . Efecto de la disminución de la concentra-
ción salina en el espectro de fluorescen -
cia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 159
4 .3 . Estudio del mecanismo cinético . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171
4 .3 .1 . Estudio de velocidades iniciales . . . . . . . . . .171
4 .3 .2 . Estudios de inhibición por producto . . . . . . .175
4 .3 .3 . Estudios de inhibición por análogos de
sustrato . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 185
4 .4 . Efecto del pH, temperatura y concentración sali-
na en los parámetros cinéticos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 196
4 .4 .1 . Efecto del pH en los parámetros
cinéticos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 196
4 .4 .2 . Efecto de la temperatura en los parámetros
cinéticos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 209
4 .4 .3 . Efecto de las sales en los parámetros
cinéticos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 215
5 . CONCLUSIONES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 228
6. BIBLIOGRAFIA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 231
7 . APENDICES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 273
I . Lista de abreviaturas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 274
II . Lista de tablas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 275
III . Lista de figuras . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 278
2. PARTE TEDRICA.
2. PARTE TEORICA .
2 .i .i .- Arqueobacterias . Filogenia .
ARCHAEBACTERIA
i MrtMnospüüáwn MO*i
Sull~ 0Jl1triun
M«MnoDactuiwn lan~icicwn
Tlra~tfa troto N
. wtMwcocw vtmiNwi
~naco~ calar
EUBACTERIA
EUKARYOTES
rt
~ iisi~ifii,i~
t N
12
13
14
Proteínas halofílicas .
15
16
17
18
19
20
o iLl-PC~ C~
i
2 .1 .5 .2 . - Requisit os salinos . Actividad .
21
22
23
2 .2 .1 . - Generalidades .
(Dalziel, 1975) .
sustrato:
24
25
26
27
28
29
30
2 .3 .1 .- Función .
31
32
y col ., 1978) .
33
34
TABLA i
37
38
39
40
La utilización de L - a-amino-y-nitraminobut¡rato y
L-treo-y-metilglutamato en lugar del sustrato normal de
GDH bovina en la desaminación oxidativa por Hornby y col .
(1985) representa un estudio similar al de Engel y Dalziel
(1969) con norvalina . Sin embargo, los análogos utilizados
por Hornby y col. comparten más características que los ami-
noácidos monocarboxílicos incluyendo norvalina (Struck y
Sizer, 1960) . Todos son utilizados por GDH a una velocidad
más baja que el sistema glutamato-2-oxoglutarato . Además,
las reacciones que utilizan sustratos monocarboxilatos
presentan un pH óptimo 1-1,5 unidades más elevado que el
observado para la desaminación del L-glutamato, y los
valores de Km son mucho más elevados . Sin embargo, los
valores de Vm áx para estos sustratos son tan altos como los
de L-glutamato, medidos ambos a su pH óptimo respectivo
(Fisher, 1985) .
41
2 .3 .5 .- Propiedades moleculares .
2 .3 .5 .1 .- Agregación .
42
43
44
45
46
6.0 y 8 .0. Estas dos últimas enzimas citadas son de las más
47
Triptófano
48
Arginina
49
Cisteina
Histidina
50
Lisina
Tirosina
51
52
Lisina
27/126
0 -;,-0 H H +
0
~:_ /C " -.O-H---N H
Ni _ ---H-0~ + q H 2
0
Lisina
N-H---O ,H H
NH 3
0 H
126/27
0 NADPH
E E
complejo complejo intermedio
Enzima-Sustratos Enzima-Carbinolamina
0
0, _ í0 0,_ ..0
/O-H-NH 2
C ' ,CH~H ~C% CCH
2 ~C \ 0
0
NH2 NH 2 H " NH 2
0 H 20
H
I
H H
NADPH NADP + 0
0~ % 0kC
C
E
complejo
complejo
Enzima-Iminoglutarato
Enzima-Producto
54
55
2 .4 . MECANISMOS CINÉTICOS .
56
57
58
tres sustratos
A B C Productos
E
T E
(EABC)
59
60
61
62
S u .s t r a t o V a r i a b l e
Producto A B C
Mecanismo Saturado Insaturado Saturado Saturado Insaturado Saturado Saturado
Insaturado Saturado
Inhibidor con C con A con C con A con B
con B
Ordenado Ter Bi P MT UC UC MT MT UC MT MT MT
Q C C C MT -- MT MT -- UC
Ordenado Bi Ter P MT UC MT MT
Q UC UC UC UC
R C C UC --
64
65
66
T A B L A 3
Inhibidor competitivo
Mecanismo 1/A 1/B 1/C
para el sustrato
b,c
Ordenado Ter Ter A C N N
d f
y Ter Bi B U C N
C U U C
Random Ter Ter A C N N
y Ter Bi B N C N
C N N C
Random AB A C N Cg
B N C C
C U U C
Random BC A C N N
B U C N
C U N C
Random AC A C N N
B N C N
C N N C
Hexa Un¡ Ping Pong A C U U
B U C U
C U U C
Ordenado Bi Un¡ A C Ni U
Un¡ Bi Ping Pong B U C U
C U U C
Ordenado Un¡ Un¡ A C U U .
Bi Bi Ping Pong B U C Ni
C U U C
Random Bi Un¡ A C N U
Un¡ Bi Ping Pong B N C U
C U U C
Random Un¡ Un¡ A C U U
Bi Bi Ping Pong B U C N
C U N C
68
69
c) MECANISMOS PING-PONG:
d) MECANISMOS ORDENADOS :
70
71
72
73
Tris - acetato .
ESPECIFICIDAD
FUENTE DE COENZ IM.A MECANISMO Referencia
75
76
RADP+ y L-glutamato .
77
3, PARTE EXPERIMENTAL,
79
3. PARTE EXPERIMENTAL .
3 .1 . MATERIALES .
3 .1 .1 . - Reactivos .
60
3 .1 .2 .- Material biológico .-
81
3 .2 . ME7©Dos .
3 .2 .1 . - Medio de cultivo .
82
83
84
te forma:
de NaOH 1N .
85
NADH es de 6.2x103 M -1 ) .
también a 402C .
86
2 .5M.
87
88
89
9C)
TABLA 5
Acrilamida - bisacrilamida 7 . 5 12 .5 2 .5
SDS 0 .3 0 .3 CI .2
Persulfato amónico 1 .5 1 .5 1 .0
ó 6 6 ó
Riboflavina --- --- 2 .5
92
93
100 100
TRP TYR
80 1 80
60 60
z
w 40 40
20 20
0 1-' . 1 1 1 1 ( 0
300 420 300 420
A (nm)
100 100
TRP TYR
80 80
60 60
0
Q
0
z 40 40
w
z
20 20
0 1- I I I a a 1 0
280 420 280 420
A (nm)
96
80 80
0 60 60
a 0
0 a
v
z
w z
>_ 40 w 40
z
z
0 0
300 420 280 420
0
Jv PD O' \
8/61/OT144 c
~~
98
99
100
v = VA / [K (i + I/Kis) + A] (3)
y a (1 + X/Ki n) / (1 + X/Kid)
la de Cleland (1979) .
4. RESULTADOS Y DISOUSION .
103
9, RESULTADOS Y DISCUSION .
104
2 .4 6 .0 :3
a
N U
rd
.0
0.8
a
400 800 1200 1600 2000
Volumen (ml)
106
10 7
4 .1 .2 . - Purificación de la actividad-__glutamato
deshidrogenasa H ADP - dependiente . -
6 . Hidroxiapatito 15 1 .0 12 .60 1 26 . 0 5
8 w
w
w
w
w Abs 280 nm
w
w
a w
w - - - Act. (U/ml)
0 w
00 w
N w
Volumen (mi)
Figura 8 : Purificación de la actividad NADP-GDH de H .halobium mediante una cromato-
grafía de tamizado molecular en Sepharosa-4B . Se realizó a una velocidad
de flujo de 30 ml/h y se recogieron fracciones de 3 ml, empleando tampón
fosfato sódico 0 .05M de pH 7 .3 con NaCl 4M para la elución.
Caracterizacion de dos glutamato deshidrogenasas de Halobacterium. Monica Camacho Carrasco.
las etapas .
1 .50
1 .20
Abs 280 rm
0.90
0 Act.(U/ml)
Ñ 0.60
N
0.30
Volumen (rrú)
Figura 9 : Cromatografia de tamizado molecular en Sephadex G-100, para NADP-GDH
de H .halobium . Se realizó a una velocidad de flujo de 35 ml/h y
se recogieron fracciones de 3 ml, empleando tampón fosfato sódico
0 .05M de pH 7 .3 con NaCl 4M para la elución .
Cromatografla en Hidroaiapatito
NADP-GDH
0 .50
0 .40
0 .10
0
0 100 200 300 400 500
Volumen Cm1Í
Figura 10 : Purificación de la actividad NADP-GDH por medio de una cromatografía
en hidroxiapatito, utilizando un gradiente discontínuo creciente
de tampón fosfato sódico a concentraciones desde 0 .05M a 0 .3M,
todas a pH 7 .3 y conteniendo NaCI 4M (salvo el 0 .3M) . Velocidad
empleada : 20 ml/h . Volúmen de las fracciones- 3 ml .
TABLA 7
120 120
a a
r
!6 !6
á
w
72r 72 ^~dón
w
b w
M Caesemineción
w 43 41
e
ae
w0
24 e 24
o f
-_°
lo 11 5 6 7 a 9 10 11
L
Figura 11 : Efecto del pH en las dos enzimas de H .halobium , a 40°- C . Las condiciones de medida en
ambas direcciones de la NAD-GDH y en la aminación de la NADP-GDH se expresan en Materiales
y Métodos . La mezcla de reacción para la desaminación oxidativa de NADP-GDH contenía NADP +
O .1mM y L-glutamato 50mM, en el tampón correspondiente O.1M y con NaCl 4M .
Caracterizacion de dos glutamato deshidrogenasas de Halobacterium. Monica Camacho Carrasco.
pH óptimo
FUENTE ESPFCIF .
COENZIMA AMINACIC)N DFSAMINACION
a
a
1 .60
e A~tp~lia
e AaLsdK
o De/v/~ay¡a Ma 0.80
e
1- 0.40
0
0
25 33 45 55 6S 75 as 20 30 40 50 60 70 10 90
12 2
12 3
(Kushner, 1986) .
3 0 ." 0
0
w a
w
A
P 1 .50
v 0 .60
1 o Haci o NsO
Ó
Y Y
1 .50 0.40
LCl LCl
a e
w 1
a a 0 .10
0 .50 0
b Y
0
!
4
NADP-GDH. A=iaacióa
w
¡ .se Figura 13
o nací
Y Efecto del NaCl (o) y del KC1 (9) sobre
=Cl la actividad enzimática en condiciones
estándar . La NAD-GDH se presenta en
los dos sentidos de la reacción, y la
ó NADP-GDH en la dirección de aminación .
125
126
I M _ (tt?M l_
FUENTE: 2 - KG AMt-INIO NADH NAI) * 1.. - 111.I
I tp_ 1
130
P~u
J~~
OF~
ti
B~BE~~jF~A
C,1 N T %
Tesis doctoral de la Universidad de Alicante. Tesi doctoral de la Universitat d'Alacant. 1989.
Caracterizacion de dos glutamato deshidrogenasas de Halobacterium. Monica Camacho Carrasco.
0 .30
0 .60
0 .40
0 .20
4 .40 4 .60 4 .31 5 .01 5 .22 5 .42
133
col ., 1984) .
E . c. n.11 (SaRamoto y col ., 1975) Equil . sedim . y filtr . en gel 3C) 00( :)0
96
137
TABLA 12
Citrato 5.0 75
Piruvato 5.0 75
Malato 5.0 51 7 3
Oxalacetato 5.0 34 6 1
PEP 5.0 92
138
139
14 0
TABLA 13
Desaminación A rn i n a c i ó n
Aminoácido vaaiv0 v aa /v 0
L -Metionina 2 .8 18 . 6
L -Valina 3.7 1 6 . 5
L -Alanina 3.0 12 . 6
L -Leucina 2 .8 1 2 . 3
L -Isoleucina 3 .2 18 .7
L -Lisina 1.4 1 . 9
L- Histidina 3 .5 2 3,7
L-Arginina 1.0 1 . 0
Glicina 1.5 1 . 6
L-Acido aspártico 1.0 1 . 0
L -Cisteina 2.0 8 . 3
L- Frolina 1.0 1 . 0
L -Serina 1.0 1 . 0
L -Fenilalanina 4.1 17 . 4
L- Triptófano 1 .9 1 5 . 5
L- Tirosina 2.7 1 2 . 2
L- Treonina 1 .5 2 . 4
Fenilalanina Metionina
2 1 .60
1 .60
1 .20
1 .20
0 .80
0 .30
0 .40
0 .40
0 0
0 3 6 9 12 15
Histidina
1 .30
1 .44
Figura 15
3 6 9 1 ,2 1 ,5
IHistidinal (mM)
Fenilalanina Metionina
0 .60 0 .40
.~ 0 .43 ..
á 0 .30
é
0 .36
b b 0.20
M b
0 .24 i
M
n n 0 .10
0 .121
1 2 3 4 5
Valiaa
0 .60
0 .43
Figura 16
0
0 3 6 ! 12 15
[Valiaa] (MM)
144
145
4 .40
q 3.30
v
V
M
N
2.10
"rl
N
A
1
M
r 1 .10
V
t
pH
PR
147
w
b
a
O
b
w
b
56 74 92
Temperatura ( 4 C)
-e NADP-GDH --A- NAD-GDH
14 9
150
120
w
b 96
(NaCI)
0 0 .5 M
a 72
b
b 0 1 .5 m
48
v 2.0 M
24
aR
0
0 14 28 42 56 70
Tiempo (min)
2 .10 0 0 .5x
[NaCI)
B
p 1 .98
b
.., 1 .0 x
w
1 .86 .-
0 1 .5 m
1 .74
ó 1 .62 2 .0 M
1 .50
0 14 28 42 56 70
Tiempo (minutos)
120 (NaCI )
,oes 96
0 0 .50
w " 0.625 H
0
72
O 0 .75 M
b
O-
b
48 1 .0 m
t 1 .6 m
24
22 44 66 88 110
Tiempo (min)
2 .10
B
n 0 .5 m
b 1 .94
[Ntcil
w
0
0.625 x
1 .78
O 9.75 N
v
1 .62
1 .46
1 .30
0 46 92 138 184 230
Tiempo (minutos)
153
-0 .90 -0 .70
-1 .33 -1 .45
-1 .75 m -2.20
O
-2 .13 -2.95
155
156
157
de almacenamiento .
[NaCI ] (M) Kj (min -1 ) t1/2 (min . ) [NaCl ] (M) Ki (min -1 ) t 1,, 2 (min . )
159
160
100 100
NAD- GDH NADP-GOH
80 80
0
a 60 60
0
40
20 -I 20
0 1 a I I , U0
300 420 300 420
A (nm)
163
100 100
NAD-GDH NADP- GDH
80 A 80
60 -( 60
z
w 40 440
20 A20
ou L. L-J o
280 '420280 420
(nm)
100 100
NAD-GDH NADP-GDH
80 4 80
a 60 a 60
0
z
W
z 40 -4 40
20 -I 20
0 1 1 1 I 1 0
300 420 300 420
A (nm)
100
NAD-GDH NADP-GDH
ao 1 80
60 A60
0
a
0
z
w 40 A40
z
20 A20
0 1 I I I I 1 Uo
280 420 280 420
(nm)
16 7
TABLA 15
169
17 0
pE. CIF~...
9 r~<<.
\~tiCP~
Tesis doctoral de la Universidad de Alicante. Tesi doctoral de la Universitat d'Alacant. 1989.
Caracterizacion de dos glutamato deshidrogenasas de Halobacterium. Monica Camacho Carrasco.
12
A
10
0
0 1 2 3 4 S
1 /[NAD) (mM)
1 .90 4 .50
1 .44 . 3 .60
C
1 .09 f ¡ 2 .70
q
0 .72t a " 1 b
w
1 .90
0 .3 o 0
0 0
0 0 .06 0 .12 0 .19 0 .24 0 .30 0 0 .06 0 .12 0 .19 0 .34 0 .30
1 /[L-GLUTAMATO] raM
174
estar por encima dei eje horizontal, por lo que la unión del
175
que no hay etapas de equilibrio rápido (Segel, 1975) . Todos los datos se obtuvieron a pH
dead - end y
tampón Tris - HC1 0 .1M conteniendo NaCI 3M, a 40ºC . Los sustratos fijos se mantuvieron
9 .0 en
insaturados . Reacción de desaminación .
o a =M 20 o a MM
12
1S o
16 MM 16 MM
4
0 O
n 3 2 mM 3 2 aM
-4 -S
-4 -2 0 2 4 6 -0 .12 -0 .06 0 0.06 0 .12 0 .11 0 .24
0 i
los =M 200 mM
10 -101 .l
-0 .10 0 0 .10 0 .20 0 .30 -4 -2 0
n Coatrol
[NADSI
40
a 3 3 PM
-0 .10 0 0 .10 0 .20 0 .30
1 /W-0LUTAMATO1 (=M)
Caracterizacion de dos glutamato deshidrogenasas de Halobacterium. Monica Camacho Carrasco.
24 Control
A
a 20
0 11 FM
16
u 12
O " 22 pM
3 3 pM
1 /[NADI (mM)
Figura 30
180
Constantes cinéticas y de inhibición aparentes para NAD - GDH de Halobacter" ium Palobium, determinadas
partir de los datos de inhibición por producto . Patrones observados y predichos de las inhibiciones
por producto para un mecanismo BI-TER estrictamente ordenado, suponiendo que no se forman complejos
dead - end y que no hay etapas de equilibrio rápido (Segel, 1975) . Las condiciones experimentales fueron
las mismas que las de la Tabla 16 . Reaccí6n de aminación .
NADH = 2 3 pM
1s i
a0
.34
9
.r A 71 Km
10 4
S o t.4eat 0 134 .u
0 -4
-20 0 20 40 60 a0 100 110 -120 -30 -40 0 40 i0 110
Figura 31 : Inhibición por NAD+ (A) y por L-glutamato (B) en la aminación reductiva frente al
sustrato NADH . Las concentraciones de los otros sustratos fijos fueron 2-oxogl_u
tarato 7 .5mM y amonio 115mM .
A a~*~ 15 A C~
1NAD1 Q.-01*1
0 ".i 7MM 0 77 mm
A ".! 4mm
_ 0
0.04 0.09 0 .13 0.19 0.22 0 0 .04 0.09 0 .13 0.19 0 .22
cs-1) (B-1)
Figura 32 : Inhibición por NAD+ (A) y por L-glutamato (B) en la aminación reductiva frente al
sustrato amonio . Las concentraciones de los otros sustratos fijos fueron 2-oxoglut_a
rato 15mM y NADH 0 .023mM .
o catsel
14
(NAD) IL-Mal
12
B
o 0.2TMM u tislt
10
i
t s 4.y
4
3"*MM
2
0
0.03 0.16 0 .24 0.32 0.40 -0.10 0 0 .10 0 .20 0 .30 0 .40
Figura 33 : Inhibición por NAD + (A) y por L-glutamato (B) en la aminación reductiva frente al
sustrato 2-oxoglutarato . Las concentraciones de los otros sustratos fijos fueron
amonio 230mM y NADH 0 .023mM .
Caracterizacion de dos glutamato deshidrogenasas de Halobacterium. Monica Camacho Carrasco.
185
1-11-14 + = 1. 3 4ral-1
n Contrd e Control
[01ztarato) (Ointaratol
S
B
a 2.50 a 10 MM a
M <> 40 MM
M
O 1 .50 O
2 0 MM a 10 MM
0
01 1
1
O.SB 0
40 ,M a 120 mMt
0
0 0 .07 0 .14 0.21 0 .21 0 .35 -0 .14 -0 .07 0 0.07 0 .14 0 .21
(E-1)
1 /[2-o:oslutatatol (mM) 1 /[amoni01 (MM)
n Csatrol
[Ohtaratol
2 .20
a 0 40 .M
1 .76
Figura 34 : Inhibición por glutarato en la aminación
120 =M
0
0 20 40 t0 10 100
1 /[NADH) (mM)
c Costra¡
(NEZ OH'l
7 2.20 n Control
(NH2 OAl
11
B
o s .M M 1 .10
n 3 MM
1 .40
O O
" 1 e =M b
d.
2 0 edil
0 .60
2 " Km
0 0 .20 _-J
0 0.04 0 .0 : 0 .12 0.16 0.20 0 20 40 60 lo 100
(E-1)
1 /Iamoniol (mM) 1 /INADHI (mM)
o Ooatrol
INSy 0161
3.50
1 /[2-ozoalataratol (=M)
Caracterizacion de dos glutamato deshidrogenasas de Halobacterium. Monica Camacho Carrasco.
189
E E
E-NAD+ E-KAD+- GLU E -NADH- KG E-KADH
E-KADH-KG-KH4+
(esquema I)
190
" té
4
2 " s .r
0
-6.14 -0 .07 0 0 .07 0 .14 0.21 0 .22
19 2
no competitivos .
193
E E
19 4
E
E-NAD+ E -NAD+-GLU E-NADH - KG E-NADH
<- KG E-NADH-KG-NH4+
E- KG
(esquema III)
19 5
196
19 7
Valores
y de Km Vm á x para los tres sustratos de NAD - glutamato deshidrogenasa de
10 .0 12 .3 ± 1 .5 C) . 2 1 6 ± C) . 012
-".! "
PR P8
Saatrato . Aaoa1o
-6 .10
Figura 37
pa
200
1 .7 "
-1 .40 1 .40
-1 .f0
9 .30
-2
PH PH
S>astrato : Amoaio
-2 .3 "
-2 .34
Figura 38
-1 .73 Perfil del log Vmax/Km frente al pH
para los tres sustratos de la reac-
ción de aminación reductiva catal_i
-3 ." 2
zada por NAD-GDH de H .halobium ,
en condiciones estándar de medida .
-3 .26
-3 .3 "
PA
202
Los valores de K= para 2-nznglotarato y amonlo están expresados en unidades mM¡ en Cambio, loo
de 0ADPB están en ^ La actividad catalítica está dada en U/oul .
Caracterizacion de dos glutamato deshidrogenasas de Halobacterium. Monica Camacho Carrasco.
o 9.20
-0 .10
-0 .20 -0 .10
- ".30
-e .3o
-o.o"
PR
Ss"trato: Acodo
"
-".10
-".2 "
Figura 39
-0 .3 "
Dependencia del log Vmax con el pH
para los tres sustratos de la reac
- "."" ción de aminación reductiva cataliz_a
da por NADP-glutamato deshidrogenasa
-".3 de H .halobium , en condiciones están_
dar de medida .
-".f0
f 7 i ! 1" 11
PH
-9 .69
-9 .39
-1 .a0
-2
-1 .20
-2 .20
-1 .40
-2 .40
PR PA
Szitrato : Asocio
-0 .20
-0 .a0
Figura 40
I~Í
Perfil del log Vmax/Km frente al pH
e -1 .40 para los tres sustratos de la reac
ción de aminación reductiva catal_i
r
O zada por NADP-GDH de H .halobium ,
en condiciones estándar de medida .
-2
-2 .i0
PR
TABLA 21
FIAD -GDH
Parámetro pK a ± S .E . pKb ± S .E .
NADP -GDH
Parámetro pK a ± S .E . pKb t S .E .
208
encima de 10 en E-HADPH .
209
210
k A e - E a /RT
Ss"trato : Am9Aio
0.20
-0.04
Figura 41
-0.7#
67 ± 36 e) . 1 6 ± C) . 03 28 * 4 C) . .1 IR 9 C) e) C) C-11
30 8 . 3 ± 1 . 1 0 .201 ± 0 .010
Los valores de Km del 2-oxoglut .arato y amonio están expresados en mM; los de NADE, en )im . La
21 4
AH * = E a - RT
AG* = RT [ In KBT/h - In K
TOS * = AH * - AG*
215
Variación de los parámetros cinéticos xm y Vmáx de los tres sustratos de la reacción cate aminación
concentración de NaCI .
Unidades de R:m : mM para 2-oxoglut.arato y amonio, pM para NADH . Unidades de Vmáx : i1/rnl . Unidades
de [HaCl] : M .
Caracterizacion de dos glutamato deshidrogenasas de Halobacterium. Monica Camacho Carrasco.
"TABLA 2 4A
7a1
11 C7b1 um al var1ar la concentr'ac lón de KC1 .
[KC1 ] (M) Km ± AK m ±
Vmáx ~Vmáx
Ci . 7 5 4 . 8 ± 1 . 2 01 . 8 8 ± 0 . 09
1 .50 5 .4 ± 0 . 9 1 . 04 ± 0 . 07
2 . 00 3 . 5 ± 1,1 C) . 66 ± C) . 06
2 . 5 C> 2,4 ± C) . 4 C) . 6 6 ± 0 .02
3 . 0C) 2 . 3 + C) . 3 0 .543 ± 0 .014
,: .50 4 .0 ± 0 .3 0 .482 ± 0 .012
4 .00 2 .5 ± 0 .3 0 .497 ± 0 .014
TABLA 2 4B
TABLA 24C
220
BIBLIOTECA
A
Tesis doctoral de la Universidad de Alicante. Tesi doctoral de la Universitat d'Alacant. 1989.
l/CAN
Caracterizacion de dos glutamato deshidrogenasas de Halobacterium. Monica Camacho Carrasco.
(B Cl] - 1 M [LCI] - ZM
f"
33
46
G1
t
z
39
32
23
" .36 0 .34 1 .12 1 .4 " 0 " .14 " .43 0 .72 ".!f 1 .20
(LCI) " 3 M
Figura 42
(YC1) - 0 .2 Set
Suwtrato variable " NADH
223
L - glutamat o PIAD+
226
22 7
5. CONCLUSIONES.
22 9
S. CONCLUSIONES ,
* Temperatura :
Aminación 70ºC 7 0ó C
Desaminación 70ºC - -
230
G. BIBLIOGRAFIA .
232
á, BIBLIOGRAFIA ,
AITKEN, D.M. y BROWN, A .D . (1969) Citrate and
glyoxylate cyc1es in the halophil, Halol)acterlum salinarium .
Blochem . Biop17 y, s . Acta 177, 351 - 354 .
AITKEN, D .M . y BROWN,A .D. (1972) Properties of halophil
nicotinamide - adenine dinucleotide phosphate - specific isoci-
trate dehydrogenase . True Michaelis constants, reaction
mechanisms and molecular weights . Blochem . J, 130, 645 - 662 .
AITKEN, D . M ., WICKEH, A .J . y BROWK, A .D . (1970)
Properties of a halophil HADP - specific isocitrate dehydroge -
nase . Blochem . J. 116, 125 -134 .
ALBERTY, R .A . (1958) On the determination of rate cons-
tants for coenzyme mechanisms . J. Am . Chem.Soc . 80,1777 - 1782
ALEX, S. y BELL, J .E. (1980) Dual coenzyme specificity
of bovine glutamate dehydrogenase . The role of negative coo -
perativity . Blochem . J. 191, 299 - 304 .
ARAKAWA, T. y TIMASHEFF, S. M. (1984) Mechanism of
protein salting - in and salting-out by divalent cations
salts : balance between hydration and salt binding .
Blochemlstry 23, 5912 - 5923 .
ASHBY, B., WOOTTON, J.C. y FIHCHAM, J .R .S. (1974) Slow
conformational changes of a 1Yeuro spora glutamate dehydroge -
nase studied by protein fluorescence . Blochem . J. 143, 317 -
329 .
ATKINSON, D. (1960) Regulation of enzyme activity . Ann .
Pev . Blochem . 35, 85 - 124 .
AUER, H .E. y DOTY, P. (1966) The conformational
stability of a - helical nonpolar polypeptides in solution .
Blocl7emistry 5, 1716 - 1725.
AUSTEN, B.M., HABERLARD, M .E., MYC, J .F. y SMITH, E .L .
(1977) NAD - specific glutamate dehydrogenase of 1Yeurospora .
IV . The COOH-terminal 669 residues of the peptide chain ;
comparison with other glut amate dehydrogenases . J, B1ol .
Chem . 252, 8142 - 8149 .
23 3
1647 .
BANERJEE, A ., LEVY, H.R., LEVY, G.C ., LIMUTI, C.,
23 4
23 5
23 6
246, 1834-1840 .
Doctoral .
de Licenciatura,
237
238
23 9
24 0
ZEMUS,
D AMIELS, L. 1, J .G . (1978) One carbori metabolism
165
M .z o b ~z o -i' - P ."7 1, s z 0 1 . 29 1 - 231.-
120 - 124 .
Binchem . 3a 76 - 82 .
E ío C he m - 8, 2 9 L' -30?
.
241
24 2
131.
151 1 305-318 .
24 3
103~1í5 .
f
drogenase reaction . L The molecularity of the, irsis comolesx
24 4
A i7 t a 65, 175_177 .
463,
245
24 6
Interscience Publication .
24 7
GORE,
0,7t
. M. G. (",.`?R1) L - gi.u tamic
, a c i. d dehydrogenasa
.J
J
. (1985) Anchaebacterial malate dehydrogenases . The enzy -
248
356.
24 9
DE
P
,rJ
~ iFd,
n
w BIBLIOTECA
25 0
2385 - ?3941 .
17 . 851-854,
5315-5322-
HUANG, C .Y . y FRIEDEN, C. (1972) The mechanism oí
Pa c t e r 1 o 1 - 160, 478-479 .
251
17 . RacterioL ¡Síp .
82E-830
JALLON, J M,
- y IWATSUBO, M. (1971) Evidence íor twn,
nicot Inarnide
, binding sites on Uglutamate dehydrogenase,
E?,iochirr . Acta 45, 964 - 971-
JALLON I J M.
- y IWATSUBO, M. (1973) Spectral properties
oí giutamate dehydrogenase complexes involving substrate
analogues, FEPS Letters 33, 97 ¡00-
-
203 .
JAVOR, B .J . (1984) Growth potencial os halophilic
bacteria isolated Trorn solar salt environments : carbon
3162 .
JOANMOU, C .L ., BROWN, P.R . y TATA, R. (1988) Mutations
afiecting che synthesis oí nicotinamide adenine dinueleotide
pliosplial,e glutarnate
- dehydrogenase in Pseudomonas aeruginosa,
25 2
25 3
5 r}5 4 _c
. 11 r
, I? «
128, 55 - G2-
Comparison I~f
~f experimental binding data and theorical Modeis
226 - 234 .
KUBO, 14. ., IWATSUBO, H ., WATARI, H. y SOYAMA, T. (1959)
254
25 5
.A110 VIO RT H Y,
1 T. A. (1985) Lipida of a r- c h a e 1) a e t e Y, i a . En :
T i7 .? :7 t e i~1 D, A 7 r ea t .,, .cz e? on st r uct ure ?°7 :! fu n r t ¡o n, Vol .
viii . Arch a e b a nt e r ¡a - (Eds . (Si . W 9 ese y R . S - W , ) 1 fe) pp- 4 59 -
497 . Academ ,,.c Press, New YorR.
Dahiem Konferenzen,
20)
4010 .
molecular model lor the enzyme, J. Biol, C1`? em. 243, 3447 -
3157 .
25 7
? 1~ . 3 1
r.EVIñI : 0. (1962) C~~lt:mn ,rror^atography of ~rote1.ns :
216.
Licenei-3tura .
25 8
25 9
15 i, 15 5 l. 9
210
IC11 .,e
:-fue
ce os chicken livpr glutamate debydrogenase .
11 C) 0 le,
SMITH, ir . y, E.L . (1973) Sequence Df bovine ti. ver
i6i'
COOK, P. F. (198 1 1, K r et ic
, mechan sm , a i?(l o :- a t i o n 9S rate
23,
p 1 rC h9 m 1S t r y , 5168-5175 .
8~11-85Ej
Df0o C heT . 202 1 .
7J
- 0 .
11 10 1 . IL 365-373,
( ,984)
1 Kinetic mechanism. in t he direction oí oxidative de
Sor
carboxylation El A D - m a 1 i c enzyme irom Ascaris s u u Z?
26 2
84 7 29 - 30 .
26 3
11 u .
:mate dehydrogpnaun lientification os ar; amino group
W-1-
dependen
.ce, PÍOP '177s' -7 . 32, 993 - 1006 .
369- 380
RODRIGUEZ - VALERA, F ., RUIZ - BERRAQUERO, F. y RAMOS -
26 4
populations
bacteria ) in hypersabne e n v i "- c r nn e r, t .. diíf e -
314 .
ROSS, .N
H
.
.M y GRANT, W .D . (1985) Nucleic asid . Sti,idies
17,1
26 5
26 6
26 7
268
269
27 0
339.
WEIBIING, S. y NICHOLAS, D.J .D . (1987) Purification and
2151 - 2153 .
447 -456.
27 1
London .
WOESE, C .R . (1987) Bacteria] evolution . Microbio] . Fev .
51, 221 - 271 .
WOESE, C .R . y FOX, G.E. (1977) Phylogenetic structure
27c
I. LISTA DE ABREVIATURAS .
2-KG 2-oxoglutarato
PEP Fosfoeno1p1ruvato
II . LISTA DE TABLAS .
TABLA Nó Página
TA BLA NL P ágina
sustratos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 203
TABLA N2 Página
FIGURA MQ Página
FIGURA N Página
FIGURA Ng F á ina
FIGURA NQ Página