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MICROBIOLOGIA 1er PARCIAL

Ubicuidad

La microbiología es la ciencia que estudia los microorganismos en todos los aspectos, la


microbiología básica estudia la naturaleza de los procesos vitales y la microbiología aplicada
problemas prácticos con aplicaciones industriales

Impacto de los microrganismos

 Ayuda a mantener el equilibrio de los microrganismos vivos y productos químicos del


ambiente
 Son la base de la cadena alimenticia en océanos, lagos y ríos
 Reciclan los productos químicos en el suelo, aire y agua
 Algunas bacterias y algas juegan un papel importante en la fotosíntesis
 Los microorganismos del suelo destruyen los productos de desecho e incorporan el gas
nitrógeno del aire en compuestos orgánicos.

La ubicuidad de los microorganismo se basa principalmente en que estos pueden vivir casi en la
totalidad de ambientes debido a:

 Tamaño
 Variabilidad y flexibilidad metabólica
 Plasticidad genética o transferencia de genes horizontal

Vida microbiana

Procariotas

Tienen mayor proporción de masa en la tierra y son reservorios claves de nutrientes esenciales

Ecosistema (microbiota)

Suelos, ambientes acuáticos, animales y plantas, humanos (tracto respiratorio, intestinos, boca)

Los extremófilos viven en hábitats extremos donde hace años se veía imposible la existencia de
seres vivos en estos lugares debido a sus grandes limitaciones de oxígeno nutrientes etc

Microrganismo en ambientes naturales

 Nutrientes limitados
 Condiciones que pueden cambiar con el tiempo
 Bajas tasas de crecimiento
 Los microorganismos no están solos, hay competencia entre ellos

Generación espontánea: abiogénesis

La biogénesis contradice la generación espontanea

La biogénesis es el proceso fundamental de la producción de nuevos organismos vivos a partir de


otros ya existentes del mismo tipo.
Microscopia de luz

Magnificación:

Se calcula multiplicando la magnificación de los lentes del objetivo (10x, 40x o 100x) por la
magnificación del lente ocular (10x).

(1000x) (1µm) =1mm

Magnificación: producto del aumento de las lentes.

Resolución: es la habilidad para distinguir dos objetos que están juntos. La resolución límite para el
microscopio de luz es ~0.2 nm aprox.

Distancia de trabajo: es la distancia entre el frente de superficie del lente y la superficie del
cubreobjetos o la muestra.

Apertura numérica: Capacidad de captación de luz por la lente.

Microscopio de campo claro

Produce una imagen oscura frente a un fondo claro

Para focal: el microscopio mantiene la imagen enfocada, aunque se cambie el objetivo.

Tinción

Incrementa la visibilidad de la muestra, Acentúa características morfológicas específicas,


Preservación de muestras.
Microscopio de campo oscuro

Produce una imagen clara en un campo oscuro, El microscopio de campo oscuro ofrece mayor
resolución que el microscopio de campo claro.

Microscopio de contraste de fases

Incrementa el contraste entre el índice de refracción de las estructuras intracelulares que tienen
poca diferencia (anillo de fase). Excelente forma para observar células vivas

Microscopio de Fluorescencia

Expone la muestra a luz ultravioleta, violeta o azul y forma una imagen del objeto con la luz
fluorescente emitida.

La muestra se tiñe usualmente con fluorocromos que brillan intensamente bajo la exposición a la
luz de una longitud de onda específica.

Algunos organismos poseen dichas moléculas por lo que son auto fluorescentes.

Microscopía electrónica

Un haz de electrones es usado para producir imágenes La longitud de onda del haz de electrones
es más pequeña que la de la luz, dando como resultado mayor resolución

Microscopía electrónica de transmisión (TEM)

Microscopía electrónica de barrido (SEM)

Microorganismos Eucariotes vs Procariotes

Bacterias

No tiene, histonas/nucleosomas, intrones, proteínas unión a la caja TATA, organelas, núcleo

Poseen, 1cromosoma, 1 polimerasa, el aminoácido iniciador es el N-formil metionina,


peptidoglucanos

Archeas

No tiene, nucleosomas/histonas, intrones, organelas, peptidoglucanos, núcleo

Posee, proteínas unión a la caja tata, 1 cromosoma, aminoácido iniciador es la metionina,


polimerasa complejo

Eucariotes

No tiene péptido glucanos

posee, nucleosomas/histonas, intrones, proteínas unión a la caja tata, organelas, +1cromosomas,


polimerasas complejo, aminoácidos iniciador metionina, tienen un núcleo limitado por membrana
Nucleosoma

Un nucleosoma se compone de alrededor de 150 pares de bases de ADN enrolladas alrededor de


un núcleo de histonas. Los nucleosomas se organizan como cuentas de un collar las cuales, a su
vez, son plegadas sobre sí mismas repetidas veces para formar un cromosoma.

Intrones

Un intrón es una parte del gen que no codifica ningún aminoácido. En las células vegetales y
animales, la mayoría de las secuencias que codifican para los genes están partidas por uno o más
intrones.

Proteínas unión a la caja tata

La proteína de unión a TATA (TBP) es un factor de transcripción que se une específicamente a la


secuencia de ADN denominada caja TATA

Organelas

Un organelo u orgánulo es una estructura subcelular que lleva a cabo uno o más trabajos
específicos en la célula, al igual que un órgano lo hace en el cuerpo.

Cromosomas

Los cromosomas son estructuras que se encuentran en el centro (núcleo) de las células que
transportan fragmentos largos de ADN. El ADN es el material que contiene los genes y es el pilar
fundamental del cuerpo humano. Los cromosomas también contienen proteínas que ayudan al
ADN a existir en la forma apropiada.

Polimerasas

La polimerasa es una enzima capaz de transcribir o replicar ácidos nucleicos, que resultan cruciales
en la división celular (ADN polimerasa) y en la transcripción del ADN (ARN polimerasa).

Morfología
Pared Celular

• Resiste la presión del medio

• Evita la lisis celular (La lisis celular consiste en la rotura de membrana celular de bacterias o
células que provoca la salida de material biológico)

• Da forma y rigidez a la célula

Paredes de las bacterias

•Gram-positivas se encuentra rodeada por una matriz aniónica de polímeros azucarados

•Gram-negativas está rodeada por una membrana externa, e inmersa en un espacio periplásmico.

•Las Gram-positivas se tiñen de cristal violeta

Función en el peptidoglicano

El peptidoglucano o mureína es un copolímero formado por una secuencia alternante de N-acetil-


glucosamina y el Ácido N-acetilmurámico unidos mediante enlaces β-1,4

•Gran rigidez - aguanta las fuerzas osmóticas:

•El grado de entrecruzamiento, el enlace β(1-4) es muy compacto.

•La alternancia de NAM y NAG - uno de los polisacáridos más estables que existen

•La alternancia de aa en L y en D - estabilidad adicional (cadenas laterales al mismo lado, ptes H)

Pared archeas

•Pseudomureína

•Pseudopeptidoglicano

Capa S

• Compuesta por proteína o glicoproteínas


• Estructura para cristalina que puede presentar varias simetrías: hexagonal, tetragonal y
Trimétrico

Metanógenas: Paredes ricas en polisacáridos: sacarosa, galactosamina y acetato

Halo bacterias: Paredes ricas en sulfatos, ácido urónico, glucosa, galactosa, N-Acetil glucosamina,
N- Acetil glusaminurónico, manosa

Membrana externa Gram negativas

Bicapa proteo lipídica muy asimétrica:

En la lámina externa:

60% de proteínas, 40% de lipopolisacárido (exclusivo de Gram-)

En la lámina interna:

No hay lipopolisacárido

Existen: Fosfolípidos, Lipoproteínas y Otras proteínas

Proteínas de la membrana externa

Porinas: forman trímeros, con canales interiores que atraviesan la membrana externa

• Solo dejan pasar moléculas por debajo de cierto tamaño (<500-700 Da)

• En enterobacterias: protección frente a sales biliares

Canales específicos

• Para ciertos nutrientes

• Para quelatos de Fe

• Para vitamina B12

Papeles y funciones del LPS

El lipopolisacárido (LPS) o endotoxina es el mayor componente de la membrana externa de las


bacterias Gram negativas, desempeñan una importante función en la activación del sistema
inmune al constituir el antígeno superficial más importante de este tipo de bacterias.

 Papel estructural
 Más resistente a detergentes y solventes
 Menor fluidez de esta membrana
 Menos permeable a moléculas hidrofóbicas (Ej.: resisten mejor muchos antibióticos)
 Condiciona virulencia en bacterias patógenas

Membranas en arqueas

Tienen una membrana que presentan glicerol unidos a hidrocarburos de cadenas ramificadas por
enlaces éteres, dieteres (C20) o tetraeteres(C40):fitanil y bifitanil
la membrana citoplásmica bacteriana es una barrera osmótica (que mantiene constante el medio
interno), permite selectivamente el paso de sustancias entre el exterior y el interior

las células de archaea tienen una membrana externa que sirve como barrera entre la célula y su
ambiente. Dentro de la membrana se encuentra el citoplasma, donde ocurren las funciones típicas
de una célula y donde se localiza el DNA.

Citoplasma

Se sitúa entre la membrana plasmática y el nucleoide

se compone fundamentalmente de agua

carece de orgánulos limitados por membranos unitarias

proteínas especificas situadas en lugares particulares (polo celular y el punto de división)

El polo celular son los extremos de la célula hacia donde migran los cromosomas de cada célula
durante la mitosis, la cual es una de las formas de división celular

Protoplasto: membrana plasmática y todo el contenido interior.

Inclusiones celulares

Gránulos de material orgánico o inorgánico matriz citoplasmática algunos son de naturaleza


proteica y otros contiene lípidos.

El almacenamiento de carbono es en los polímeros y glucógeno PHA y PHB

Taxias o tactismos

En un gradiente de un estímulo, el movimiento originalmente aleatorio se modifica: Aumenta la


frecuencia de corridas hacia la fuente de estímulo positivo

Se denomina taxia, o taxismo al movimiento o desplazamiento orientado de un organismo, o


parte de él, como respuesta a la percepción de un estímulo o de un gradiente de la intensidad del
mismo.
disminuye la frecuencia de corridas hacia la fuente de estímulo negativo Fototaxia, quimiotaxia,
aerotaxia

Cápsulas

Capa mucosa, protección contra el ambiente y otros microorganismos, Actúa como reserva de
agua y alimento, importante en la virulencia de patógenos

Endosporas

• Son estructuras de resistencia: protección del material genético

– Radiación

– temperatura

– Deshidratación

– Cambios ambientales

• Bacillus y Clostridium
Germinación

• Activación; reversible, condiciones ambientales

• Germinación: irreversible, infla la espora, se pierde la cubierta

• Crecimiento: síntesis de componentes, célula vegetativa

Flujo molecular de la información y procesamiento de proteínas

Mecanismos por los cuales los caracteres se transmiten de un microorganismo a otro, mediante la
replicación del material genético.

DNA, se conforma por dos cadenas de polímeros de nucleótidos (secuencia lineal) los nucleótidos
se conforman de una base nitrogenada, un grupo fosfato y una pentosa.

 Doble cadena (hélice)


 Igual distancia entre cadenas
 Cadenas de nucleótidos
 Antiparalelas, están al contrario una de la otra porque las bases de deben unir entre ellas
 Se unen a través de cadenas complementarias de puentes de hidrogeno
A-T ADENINA-TIMINA
G-C GUANINA-CITOCINA

Complementariedad
Las cadenas de DNA se enrollan sobre si mismas en forma de espiral, este enrollamiento es muy
estable.

Hendidura mayor, cuando el material genético interactúa con las proteínas es en ese punto donde
se da esa interacción (1nm)

Superenrollamiento, para disminuir su longitud, se unen unas proteínas que su única función es
mantener el superenrollamiento

Topoisomerasas, hacen cortes controlados para disminuir la presión en el enrollamiento del


material genético y evita que el material genético se rompa

Cromosomas

Estructuras celular que lleva la información

 Compuesto de genes (unidades que codifican la estructura de un polipéptido o una


proteína)
 Una circular en la mayoría de las bacterias 1mn
Kb=kpb=1000 pares de bases

Operón, un grupo de genes transcripto en un RNA mensajero que codifica para diferentes
proteínas y es regulado como una unidad, si se expresa todos los genes

Plásmidos, fragmentos pequeños de material genético, tienen genes que cumplen diferentes
funciones, como los ori que sirven para replicarse autónomamente

Rasgos conferidos por plásmidos


Replicación

Es el proceso a través del cual se hace una copia del material genético dentro de la misma célula,
es semiconservativa.

Cada cadena hace una copia de si misma al final de esta se tiene cuatro cadenas, una hebra
antigua con una nueva

3´5

C:G

T:A

A:T

G:C

5´3’

Cadena Antigua

Cadena Nueva

Replisoma, En la replicación de DNA, se denomina replisoma o complejo de replicación al conjunto


de proteínas de una horquilla de replicación

Las helicasas son una parte crítica del proceso de replicación del ADN porque desenrollan al ADN
de doble cadena para crear cadenas individuales que pueden ser copiadas por la maquinaria de
replicación.
La ADN girasa es una de las topoisomerasas de ADN que actúa durante la replicación del ADN para
reducir la tensión molecular causada por el superenrollamiento

Se unen por el extremo OH 3’(prima)

Primasas, va pegando los primeros fragmentos de ARN y luego es la polimerasa la continua y va


formando las cadenas y la primasa ayuda intermitentemente. En la cadena rezagada

En la cadena líder la primasa pega el fragmento iniciador del ADN y luego la polimerasa continua
de forma constante hasta terminar

La cadena que se forma de a pedazos es la cadena rezagada. De 3´ a 5´

La cadena líder es la cadena que va adelante. 5´ a 3´

Punto de terminación de la replicación y origen de replicación

Corrección de errores (exonucleasa)

A medida que ella pega va haciendo la prueba y fijándose si se pega el nucleótido correcto, en la
exonucleasa es cuando ocurre un error saca el nucleótido que esta mal y lo corrige con uno nuevo.

Transcripción

Una cadena de DNA usa como molde para hacer una cadena de mRNA complementaria.

Clases de RNA

 Mensajero genético (RNAm): codones


 Transportador de aminoácidos (RNAt)
 Componente de ribosomas (RNAr)
Catalizan reacciones como ribozimas

Incido, terminación promotor

Terminación, La RNA polimerasa seguirá transcribiendo hasta que reciba la señala para parar. El
proceso de finalizar la transcripción se conoce como terminación, y sucede una vez que la
polimerasa transcribe una secuencia de ADN llamada terminador, en las secuencias de DNA hay
repeticiones invertidas y ellas permiten hacer una estructura que se vuelven complementarias
Promotores son los que hacen el reconocimiento para empezar la transcripción, En -35 esta la
región que reconoce el factor sigma (para bacterias) y se empieza el proceso de transcripción

Iniciador, Un iniciador o cebador es una secuencia corta de ADN de cadena simple que se utiliza en
una reacción en cadena de la polimerasa

La transcripción de la información genética es el primer paso de la expresión genética. La


transcripción es el proceso por el cual el ADN se utiliza como plantilla para fabricar ARNm. Este
proceso se divide en 3 etapas: iniciación, elongación y terminación. La transcripción comienza en
una región conocida como el promotor. Una enzima llamada ARN polimerasa «lee» la cadena
molde de ADN y crea el ARNm. Para que la ARN polimerasa se una a la secuencia promotora en los
eucariotas se necesitan otras proteínas, conocidas como factores de transcripción. Tras iniciar la
transcripción, la ARN polimerasa alarga el ARNm recién formado hasta alcanzar una secuencia de
terminación.

¿Qué es Monocistronico y Policistronico?

Todos los ARNm eucarióticos son monocistrónicos, es decir, contienen información para una sola
cadena polipeptídica, mientras que en los procariotas los ARNm son con frecuencia Policistronico,
es decir, codifican más de una proteína.

Transcripción en archea

 Polimerasa similar a la de los Eucariotes


 Señal mas importante es la caja tata

La caja tata, se unen las proteínas de la caja tata y elemento de reconocimiento B, se une el factor
de transcripción B la reconoce las proteínas de unión a la caja tata

Traducción del mRNA síntesis de proteínas

Aminoácidos, polipéptidos y proteínas

Diversidad y estructuras de proteínas


 Estructura primaria, traducción RNAm a proteína
 Estructura secundaria, puentes de hidrogeno para la formación de una estructura
determinada que pueden ser las, alfa hélix beta sheet
 La estructura terciara son interacciones hidrofóbicas
 Estructura cuaternaria necesitan de dos o más polipéptidos

RNA de transferencia

Anticodón, es una región de 3 nucleótidos que se encuentra en el RNAt, y se une a un codón


también de 3 nucleótidos peor que se encuentra en el RNAm ellos son complementarios

Aminoacil de RNA sintetasa (?)

Código genético

 Codones: incorporación de un aa especifico


 22 aminoácidos
 Código de generador
 Es universal para todos los organismos
 64 codones
 Son de terminación o sin sentido
 Codón de inicio AUG para N-formilmetionina

Bamboleo de bases(¿)

Síntesis de proteínas

Orf (marco de lectura abierta) se encuentra un codón de inicio seguido por otros codón de inicio
seguido por otros codones y finalmente

Pasa el sitio p lee el siguiente codón Cuando encuentra el primer codón

Chaperonas

 Plegamiento
 Re-plegamiento
 Ensamblaje de complejos miltiproteicos
 Incorporación de cofactores en enzimas

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