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Una vez que los ácidos grasos entran a la célula, son transportados al interior de las mitocondrias para ser
metabolizados y obtener energía a través de ellos, pero antes necesitan ser activados. Esta activación consiste
en la unión a la Coenzima A para formar un Acil-CoA, esta reacción es catalizada por diversos tipos de Acil-CoA
Sintasas especializadas en unir ácidos grasos de diferentes tamaños.
La degradación de los ácidos grasos en el interior de la matríz mitocondrial se lleva a cabo a través de una
serie de reacciones oxidativas en el carbono β, de ahí el nombre de la ruta. Al final de estas reacciones se
separan una unidad de dos carbonos en forma de Acetil-CoA y un Acil-CoA que ahora tiene dos átomos de
carbono menos. Este Acil-CoA sufre otro ciclo de β-Oxidación y así sicesivamente hasta consumir todos los
átomos de carbono. Por cada ciclo se forman un FADH2 y un NADH. Veamos como ocurre este proceso con
más detalle.
Recordemos que el FADH2 es una coenzima estrechamente unida a su enzima, así que para poder dejar sus
electrones en la Cadena de Transporte de Electrones necesita de una proteína adaptadora, en este caso se
llama ETF (del inglés Electron Transfer Flavoprotein) que se encuentra unida a la membrana interna de la
mitocondria. La Acil-CoA Deshidrogenasa se acopla a la ETF y le cede sus electrones, luego la ETF puede
transferirlos a la Ubiquinona que a su vez los lleva al Complejo III de la Cadena de Transporte de Electrones.
Recordemos que el NADH es una coenzima que no está unida fuertemente a su enzima, por lo tanto puede
difundir libremente. El NADH lleva sus electrones al Complejo I de la Cadena de Transporte de Electrones.
Esta ruptura está acoplada a la unión de otra Coenzima A al ácido graso, formando un nuevo Acil-CoA que
ahora tiene dos átomos de carbono menos de los que tenía el Acil-CoA que ingresó al ciclo de la β-Oxidación.
De esta manera tenemos la liberación de una molécula de Acetil-CoA (que entrará en el Ciclo de Krebs) y la
formación de un nuevo Acil-CoA que reanudará un nuevo ciclo de β-Oxidación.