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ARTÍCULO ORIGINAL
Editado por
Juan Carlos Salcedo-Reyes Abstracto
salcedo.juan@javeriana.edu.co
Productor de toxina ShigaEscherichia coli(STEC) es un patógeno bacteriano que causa diarrea y
1. Grupo de Inmunología Molecular enfermedades humanas graves como HUS; su principal factor de virulencia son las toxinas Shiga (Stx1 y
(GYMOL), Centro de Investigaciones
Stx2). Se han identificado algunos subtipos de Stx2 y se han asociado con el riesgo de desarrollar una
Biomédicas, Universidad del Quindío.
Armenia, Quindio, Colombia. enfermedad grave. Las toxinas Stx se codifican en bacteriófagos templados que controlan su expresión a
través del ciclo lítico que está regulado por los genes tardíos y la proteína Q antiterminadora. El objetivo
* bsarangog@uqvirtual.edu.co
de este trabajo fue caracterizar seis cepas STEC portadoras de fagos Stx2 para proporcionar información
Recibió:10-11-2020 preliminar y comprensión sobre las cepas Stx2 de Colombia con respecto a la producción de Stx, la
Aceptado:01-08-2022 inducción del ciclo lítico y la subtipificación de Stx2. Se observaron dos cepas destacadas con mayores
Publicado en línea:26-08-2022
niveles de producción de Stx e inducción del ciclo lítico. Todas las cepas evaluadas portaban los subtipos
Citación:Arango-Gil B, Peña-Buitrago S, Stx2a, Stx2c o Stx2d. Además,qO111alelo, y sólo una cepa mostró diferencias en elNingregión. Se
Castaño-Osorio JC, observaron diferencias en las características evaluadas de las cepas, lo que podría indicar la variabilidad
Granobles-Velandia C. Caracterización de de estas seis cepas STEC portadoras de fagos Stx2.
seis cepas de Escherichia coli productoras
de toxina Shiga (STEC) portadoras de fagos
Stx2 de Colombia,Universidad científica,
27(2): 187–202, 2022. Palabras clave:STEC; bacteriófagos; toxina Shiga; Ganado; SUH
doi: 10.11144/Javeriana.SC272.coss
El principal factor de virulencia de STEC asociado al SUH son las toxinas Shiga (Stx). Las toxinas Shiga
pertenecen a la AB5familia de toxinas proteicas, con una fracción A enzimáticamente activa y una fracción B no
tóxica responsable de unirse a los receptores celulares en las células diana, como las células renales, el tracto
gastrointestinal y las células del sistema nervioso central. Hay dos tipos de Stx: Stx1 y Stx2, que comparten
aproximadamente56 %de la homología en su secuencia de aminoácidos. Sin embargo, Stx2
Universidad científica, Revista de la Facultad de Ciencias, Pontificia Universidad Javeriana, tiene licencia Creative Commons Attribution 4.0 International Public License
188 Caracterización de seis productores de toxina ShigaEscherichia coli(STEC) cepas portadoras de fagos Stx2 de Colombia
se ha relacionado epidemiológicamente con el desarrollo de enfermedades graves, como el SUH [3]. Los estudios
sobre las células endoteliales microvasculares del cerebro humano (HBMC) han demostrado que son hasta 1000 veces
más susceptibles a Stx2 que a Stx1 [4], en este sentido, Stx2 ha recibido una mayor atención de investigación.
Se han identificado siete subtipos de Stx2: Stx2a, Stx2b, Stx2c, Stx2d, Stx2e, Stx2f, Stx2g. Los subtipos
más frecuentes identificados hasta el momento en cepas de origen humano y bovino son Stx2a, Stx2c y
Stx2d; estos tres subtipos han mostrado alta toxicidadin vitroya menudo se asocian con el desarrollo de
colitis hemorrágica (HC) y HUS. A diferencia de los subtipos Stx2b, Stx2e, Stx2f y Stx2g que rara vez se
asocian con enfermedades graves en humanos, y con frecuencia se aíslan de reservorios animales
diferentes al ganado. [5, 6]. Las secuencias de aminoácidos de los subtipos Stx2a, Stx2c y Stx2d
mostraron estar estrechamente relacionadas y compartidas entre97 %y99 %identidad; sin embargo,
debido a sus diferencias biológicas y toxicidad, se clasifican en diferentes subtipos [7].
genes de la toxina Shiga (stx) son codificadas por bacteriófagos templados insertados en el cromosoma
bacteriano, fagos que codificanstx(Stx-fagos) pueden ser inducidos por agentes que dañan el ADN como
la mitomicina C. La expresión de Stx está ligada al ciclo lítico del bacteriófago y su liberación depende de
la lisis de la bacteria. Como resultado del proceso de inducción, los fagos Stx juegan un papel importante
en la patogénesis de STEC debido a la regulación de la expresión de Stx y su contribución a la
propagación de lastxgenes en otras bacterias [8]. Elstxlos genes se localizan en la región tardía de los
fagos Stx donde se encuentran los genes implicados en el ciclo lítico. Asimismo, los genes tardíos están
regulados por una proteína Q antiterminadora de la transcripción. En ausencia de la proteína Q, los
fagos no pueden realizar su ciclo lítico, lo que implica que no producirán Stx [9]. Tres variantes alélicas:
q933,q21, yqO111,han sido identificados para el gen de la proteína Q. los cuales están relacionados con
diferencias en los niveles de expresión de las Stx y la virulencia de las cepas que las portan [10, 11].
En Colombia, el conocimiento sobre STEC aún es limitado. Los pocos estudios se han centrado en la
detección del serotipo O157:H7 de diferentes fuentes sin el uso de técnicas moleculares [12, 13];
además, actualmente no existe una caracterización de las cepas nativas aisladas. El objetivo de este
estudio es caracterizar seis cepas STEC portadoras de fagos Stx2 para proporcionar información
preliminar y comprensión sobre la producción de Stx2, la inducción del ciclo lítico y la subtipificación de
Stx2 en cepas STEC de Colombia.
2. Materiales y métodos
Este estudio fue descriptivo de corte transversal. Se seleccionaron seis cepas STEC bovinas (102, 10610, 600,
5052, 615 y N108) portadoras de fagos Stx2, pertenecientes a la colección de cepas del Centro de
Investigaciones Biomédicas de la Universidad del Quindío. Quiguanas et al. [14] caracterizaron previamente
estas cepas según la presencia-ausencia de genes de virulencia STEC (stx2,eee,sáa, ymuy bienA). En resumen,
se recolectaron muestras de heces mediante hisopado rectal de bovinos en la finca El Cofre, ubicada en Ulloa-
Valle del Cauca, Colombia. Cada muestra fue transportada en tubos de ensayo con agua peptonada a
temperatura ambiente al Centro de Investigaciones Biomédicas (CIBM) de la Universidad del Quindío para su
procesamiento. Por PCR multiplex,stx1,stx2o se detectaron ambos genes. Las muestras positivas para uno o
ambos genes de la toxina se consideraron positivas para STEC. Las cepas se aislaron en agar MacConkey. Las
colonias individuales se caracterizaron por PCR multiplex para la detección de genes, que codifican diferentes
factores de virulencia (eee,sáa, ymuy bienA). Sin embargo, aún se desconoce el serotipo de estas cepas (tabla 1
). Para este estudio, seleccionamos solo cepas STEC portadoras de fagos Stx2 debido a
su importancia epidemiológica a nivel mundial, ya que es el tipo predominante en las infecciones por
STEC en humanos, y se asocia con una mayor severidad de la enfermedad. La cepa de referencia STEC
EDL933 se utilizó como control positivo y laE. coliSe utilizó la cepa DH5̨ como control negativo por su
gran capacidad para hospedar fagos Stx.
Las seis cepas se cultivaron individualmente en LB Broth Base (Lennox, polvo, L Broth Base) durante la
noche a37iC,100rpm. Estos cultivos se refrescaron en medio LB a37iC,180rpm, cuando el cultivo alcanzó
la fase de crecimiento exponencial (densidad óptica OD600D0:2nanómetro a0:3Nuevo Méjico); se dividió
en dos subcultivos y se añadió Mitomicina C (MMC) a una fracción a una concentración final de0:5µg ml1(
inductor del ciclo lítico) [15]. el OD600de los cultivos con y sin MMC se monitorearon en diferentes
momentos (0 h, 1 h, 2 h, 3 h, 4 h y 5 h) para construir curvas de crecimiento/lisis; el crecimiento se midió
con un espectrofotómetro de microplaca Epoch™ (BioTek). Todos los ensayos se realizaron al menos tres
veces e independientemente para cada cepa.
Para comparar los títulos de Stx2, después de la incubación durante la noche (37iC,180rpm) los cultivos
con y sin MMC se centrifugaron a11:500rpm,4iC durante 10 min y se evaluó la presencia de Stx2 en los
sobrenadantes mediante el uso de un inmunoensayo enzimático (Ridascreen®Verotoxin, R-Biopharm)
según las instrucciones del fabricante. Las placas ELISA se leyeron en el espectrofotómetro de
microplacas Epoch™ (BioTek) a OD650. Sin embargo, cuando el OD650valores excedieron el límite
permitido por el Epoch™ (BioTek), se realizaron diluciones seriadas para obtener un valor dentro del
rango de lectura del equipo. Los títulos de toxina se expresaron como resultado de la multiplicación
entre la DO650y el recíproco del factor de dilución; todos los ensayos se realizaron al menos tres veces.
La región aguas arriba de lastx2El gen se analizó mediante PCR en Veriti 96-Well Thermal Cycler
(Applied Biosystems™). La proximidad de laNinggen constx2se evaluó utilizando NinG/526 y 595
cebadores[16], la variabilidad en este gen se evaluó comparando los tamaños de los
Figura 1.Esquema de la última región de Stx-fagos. Las flechas de colores muestran los genes evaluados. Las líneas punteadas
muestran la región amplificada por elcebadores. Tomado y adaptado de: Burgan et al. (39).
La identificación de los subtipos Stx2 se realizó mediante análisis de secuencias con el método
propuesto por Persson et al. [19] y Scheutz et al. [7]. Una secuencia parcial destx2El gen se obtuvo
usando la secuenciación F4 y R1cebadores(Tabla 2), estoscebadoresamplificando un fragmento de
491 pb que se tradujo a 159 aminoácidos, cubriendo 95 residuos de la región C-terminal de la
subunidad A y 64 residuos de la región N-terminal de la subunidad B, donde las secuencias de las
toxinas tienen mayor variabilidad. Las PCR se realizaron con el kit Platinum™ Taq DNA Polymerase
High Fidelity (Invitrogen™) con las siguientes condiciones:95iC durante 15 min, seguido de 35 ciclos
a94iC durante 50 s,56iC durante 40 s, y72iC durante 1 min, y una temperatura final de72iC durante
3 min. Los amplicones obtenidos con cebadores de PCR directa e inversa fueron secuenciados por
el método de Sanger en un ABI3500 (Applied Biosystems™). El ADN utilizado para las diferentes
PCR se purificó utilizando el Asistente®Kit de Genómica (Promega).
Tabla 2.imprimacionesutilizado para evaluar la región tardía y secuenciar lastx2gen de los fagos Stx.
Ning/526 CACAAGCAATGCGTGGTGTGC
Unkmeir y Schmidt, 2000
595 CCGAAGAAAAACCCAGTAACAG
QATG5' ATGTTCTTATGGTTCACCG
Smith et al. 2007
Q3' TTACGATCGTAAACTATTTTT
Q-stx-f CGGAGGGGATTGTTGAAGGC Unkmeir y Schmidt, 2000
SF1-F ATACCGTGGCATTTGAAGAGAAGT
Haugum et al. 2012
SF1-R TTTTTAGCAGCCAGTCGTCCA
Q21 GAAATCCTCAATGCCTCGTTG Lejeune et al. 2004
F4 GGCACTGTCTGAAACTGCTCCTGT
Scheutz et al. 2012
R1 ATTAAACTGCACTTCAGCAAATCC
Las secuencias consenso se obtuvieron con los cromatogramas directo e inverso utilizando el software
Uniprot UGENE RRID: SCR_005579. Para identificar los subtipos, las regiones intergénicas entre las
subunidades A y B destx2Se compararon las secuencias de todas las cepas. Las secuencias de nucleótidos
se tradujeron en aminoácidos con el ORF establecido para Stx2 (excluyendo la región intergénica). Se
realizó un alineamiento múltiple con las secuencias de aminoácidos obtenidas y las secuencias de
referencia para los subtipos Stx2 empleando el software MEGA7 RRID:SCR_- 000667 y el algoritmo
Muscle. Las posiciones conservadas descritas en la literatura [7, 19] para cada subtipo se examinaron en
la alineación múltiple; los códigos de acceso para las secuencias de referencia utilizadas en la alineación
fueron: Stx2a (GenBank ID: Z37725) Stx2c (GenBank ID: L11079) Stx2d (GenBank ID: DQ059012).
3. Resultados
El análisis de las curvas de crecimiento mostró que todos los cultivos sin MMC tuvieron un crecimiento
exponencial con OD600valores de aproximadamente 1,4; el mismo comportamiento se observó con los
cultivos control positivo y negativo: EDL933 y DH5˛. Sin embargo, al inducir los fagos con MMC,
observamos diferentes cinéticas en la inducción de los fagos stx2 (Figura 2). Dos cepas (10610 y 600)
mostraron una alta inducción con OD600valores inferiores a 0,2 (5 h después de la inducción de MMC) y
los demás (102, 5052, 615 y N108) mostraron una inducción más reducida con OD600valores de
aproximadamente 0,7 (5 h después de la inducción de MMC).
Todas las cepas evaluadas mostraron producción de Stx2; sin embargo, los títulos obtenidos fueron diferentes
entre sí. La cepa 10610 mostró una mayor producción de Stx, presentando títulos similares a la cepa de control
positivo. Las cepas 5052, 600 y N108 mostraron títulos más bajos que la cepa control, pero con una producción
moderada de Stx. Las cepas 102 y 615 produjeron los títulos más bajos en comparación con las otras cepas (
figura 3). En general, todas las cepas mostraron un aumento en los títulos de toxina cuando los cultivos fueron
inducidos con MMC. Observamos que Stx también se detectó en condiciones de no inducción, pero siempre
con títulos bajos, demostrando una producción de toxina basal en todas las cepas. Los resultados de
absorbancia y diluciones realizadas se muestran en el material complementario:Tabla S1.
Figura 3.Producción de toxina Shiga de cepas STEC evaluadas en presencia/ausencia de mitomicina C (MMC).
La proximidad de laNinggen con elstx2se confirmó el gen en todas las cepas, donde se amplificó
1700se observó un fragmento de pb, a excepción de la cepa N108 que obtuvo un fragmento de
1200bp, lo que sugiere que existen diferencias en la región reguladora de estos fagos. Con
respecto aqalelos del gen, elq933se detectó el alelo en todas las cepas; sin embargo, al evaluar su
cercanía con elstx2gen, no se obtuvo el amplicón. En cuanto aqO111alelo, su presencia y cercanía
con elstx2gen fueron confirmados en cinco cepas. Ninguna de las cepas estudiadas llevó laq21
alelo, los resultados se muestran en la Tabla 1.
En algunas cepas, los cromatogramas mostraron picos dobles en posiciones específicas que correspondían a
diferentes nucleótidos, en estos casos se utilizó la nomenclatura de nucleótidos de la IUPAC para resolver estas
ambigüedades. Una vez obtenida la secuencia consenso y traducida a aminoácidos, observamos que en la
mayoría de los casos las ambigüedades no alteraban las secuencias de aminoácidos (mutaciones sinónimas);
solo en dos cepas (10610 y 600) observamos un cambio de codón en la posición 137 y podría traducirse a dos
aminoácidos diferentes: alanina o ácido aspártico (Figura 4A).
El análisis de la región intergénica entre los genes de las subunidades A y B de Stx2 mostró que todas las cepas
tenían la misma secuencia (AGGAGTTAAGT); esta secuencia ha sido reportada para los subtipos Stx2a, Stx2c y
Stx2d. Al analizar la alineación, observamos que todas las secuencias de los subtipos estaban altamente
conservadas y solo diferían en algunas posiciones (Figura 4A). La combinación de estas posiciones se utilizó
para clasificar los subtipos, obteniendo los siguientes resultados: subtipo Stx2a; una cepa, subtipo Stx2c; tres
cepas y subtipo Stx2d; dos cepas Se observaron cambios específicos en los residuos de aminoácidos en algunas
secuencias; sin embargo, estos no están estrictamente restringidos a un subtipo. En el dendrograma tanto la
secuencia estudiada como la de referencia formaron grupos separados, confirmando lo observado en el
alineamiento (Figura 4B).
Figura 4.A) Alineamiento múltiple con secuencias de referencia parciales de subtipos de Stx2 y secuencias de Stx2 obtenidas en este
estudio. Los colores muestran sitios conservados para cada subtipo. * En esa posición, pueden estar presentes tanto el ácido aspártico
como la alanina. B) El dendrograma muestra los grupos formados por las secuencias de referencia y las secuencias de Stx2 obtenidas
en este estudio.
4. Discusión
La presencia de fagos inducibles en las cepas estudiadas se evaluó mediante el análisis de las curvas de
crecimiento/lisis; dos cepas (10610 y 600) mostraron bacteriólisis por inducción de fagos con MMC.
Asimismo, sus cultivos presentaron los títulos más altos de Stx junto con la cepa 5052 en condiciones
inducidas. Demostrando que estas cepas presentan fagos inducibles capaces de producir Stx2. Diversos
estudios demostraron que las cepas STEC con Stx-fagos inducibles aumentan sustancialmente la
producción de Stx, cuando los cultivos fueron tratados con MMC, evidenciando una relación directa entre
la inducción y la producción de Stx [20, 21]. Además, Ogura et al. [22] han propuesto que la variabilidad
en la producción de Stx entre las cepas de STEC puede estar relacionada con las características genéticas
de los fagos que las portan.
Analizando las curvas de crecimiento/lisis bacteriana construidas, dos cepas (102 y 615) mostraron un
comportamiento diferente; ambos tuvieron baja respuesta a la inducción y bajos títulos de Stx, incluso bajo
condiciones inducidas. De hecho, hay estudios que demuestran que las bacterias pueden tener una alta
frecuencia de profagos defectuosos [20, 21, 22, 23, 24], que no son capaces de llevar a cabo su ciclo lítico, lo
que limita su capacidad para matar a la célula bacteriana huésped; por lo tanto, esto evitaría (en el caso de
Stxphages) la producción de Stx. Aunque Johansen et al. [25] sugieren que el nivel de producción de Stx en
bacterias portadoras de fagos aparentemente defectuosos es menor que en bacterias portadoras de fagos
inducibles. En este sentido, la baja producción de Stx en las cepas 102 y 615 puede explicarse por la falta de
inducción del fago Stx2 observada a través de la OD600cinética, que podría deberse a la presencia de un fago
Stx2 defectuoso.
En este estudio detectamos la producción de Stx en cultivos sin MMC, lo que sugiere que los genes stx2 son
transportados por profagos con inducción espontánea, lo que conduce a una alta liberación de Stx
independientemente del sistema SOS bacteriano, involucrado en la activación del ciclo lítico [21]. De acuerdo con
nuestros resultados, Gamage et al. [26] mediante el análisis de sobrenadantes puros, también informaron que todos
stx2cepas produjeron altos niveles de Stx tanto en presencia como en ausencia de inductores del ciclo lítico. Shimizu et
al. [27] también informaron que algunos fagos Stx tienen una inducción espontánea relativamente alta, detectando la
presencia de Stx2 en la fracción extracelular en ausencia de cualquier inducción aplicada.
Se han descrito tres alelos que codifican la proteína Q (q933, qO111yq21), todos ellos difieren en su
actividad como antiterminadores [10, 11]. ElqO111El alelo se detectó en cinco cepas (102, 10610, 5052,
615 y N108), que se describió recientemente en cepas STEC fermentadoras de sorbitol aisladas de
pacientes con enfermedades diarreicas y SUH en varios países europeos [28, 29, 11] y relacionados con
alta progresión a SUH [30]. En este estudio no fue posible demostrar la cercanía de laq933alelo con elstx
2genes Tal vez, Stx2 está codificado en un fago Stx defectuoso o algunos fagos codificados en estas
cepas no llevan elstx2gene. Con respecto aq21alelo, no se encontraron cepas portadoras de este alelo,
identificadas principalmente en cepas STEC con baja o nula producción de Stx y frecuentemente aisladas
de carne bovina, de origen animal o del medio ambiente en países asiáticos, donde están ampliamente
distribuidas [31, 32, 33, 10].
La subtipificación de las cepas STEC permitió identificar tres subtipos de Stx2: una cepa positiva para Stx2a, tres
cepas positivas para Stx2c y dos cepas positivas para Stx2d. Según la literatura, las cepas de STEC portadoras
de estos tres subtipos son frecuentemente aisladas de pacientes con SUH [5, 34], lo que ha llevado a que se
relacionen fuertemente con esta enfermedad. Los subtipos más relevantes identificados en este estudio
fueron: el Stx2a; según la literatura ha demostrado ser el más potente y activo sobre las células endoteliales [4,
6] y la Stx2d, debido a una “cola activable” que provoca un aumento de hasta 25 veces su toxicidad sobre las
células Vero cuando se incuba previamente con elastasas [35].
Aunque los tres subtipos comparten un alto porcentaje de identidad en cuanto a su secuencia de
aminoácidos, se encontraron diferencias en las posiciones 89, 95 al final del C-terminal de la
subunidad A, y en el motivo END o EDD de la subunidad B. El motivo END de la subunidad B juega
un papel importante en la interacción de la toxina con su receptor; por tanto, mutaciones en estas
posiciones provocarían cambios en la afinidad de la toxina con su receptor [6], lo que podría
explicar las diferencias en la toxicidad de estos subtipos de Stx2. Finalmente, en las cepas
evaluadas no se identificaron los subtipos Stx2b, Stx2e, Stx2g y Stx2f; estos subtipos rara vez se
asocian con enfermedades humanas y, a diferencia de los otros subtipos, se han aislado de cerdos
y palomas. En este estudio, estos subtipos no fueron detectados,
5. Conclusión
Los resultados obtenidos en este estudio muestran que las seis cepas STEC nativas evaluadas tuvieron
diferencias en los títulos Stx2, inducción del ciclo lítico del fago, subtipos Stx2 y región tardía de los fagos Stx2.
Las características de las cepas STEC encontradas en este estudio ayudarán a mejorar la comprensión de STEC
de Colombia, ya que estas cepas son similares a las cepas STEC que causan enfermedades en humanos
reportadas en la literatura. Sin embargo, son necesarios más estudios con muestras más amplias que permitan
determinar su virulencia.
6. Agradecimientos
Los autores agradecen el apoyo financiero a través de la Universidad del Quindío con el interno
denominado N°5; proyecto N° 890.
7. Conflicto de intereses
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Bióloga de la Universidad del Quindío, Colombia con experiencia en investigación sobre Escherichia coli
productora de toxina Shiga (STEC) desde 2016. Doctoranda en Ciencias Biomédicas de la Universidad
Nacional de Rosario, Argentina. Investigación enfocada en biotecnología de fagos, optimización genética y
determinación de condiciones de producción de una mezcla de fagos, activa sobre cepas locales de
Staphylococcus aureus en el Laboratorio de Microbiología Molecular de la Facultad de Ciencias Médicas,
Universidad Nacional de Rosario, Argentina.
ORCID: 0000-0003-0311-3433
ORCID: 0000-0002-4657-4232
Doctorado en la Universidad del Quindío, Colombia. Doctora en Ciencias Biomédicas del Instituto de
Medicina Tropical Pedro Kourí, Ciudad de La Habana, Cuba con 25 años de experiencia investigando sobre
enfermedades inmunitarias e infecciosas. Profesor de Inmunología y Biología Celular desde 2001 y
miembro del Grupo de Inmunología Molecular (GYMOL) de la Universidad del Quindío, Colombia.
ORCID: 0000-0002-7639-3053
ORCID: 0000-0002-0742-6181