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El origen de los metazoos: una perspectiva unicelular

ArtículoenNature Reviews Genética · Mayo 2017

DOI: 10.1038/nrg.2017.21

CITAS LEE
173 5,542

3 autores, incluyendo:

Arnau Sebé-Pedrós Iñaki Ruiz-Trillo

Centro de Regulación Genómica Instituto de Biología Evolutiva
109PUBLICACIONES2,215CITAS 199PUBLICACIONES5,114CITAS

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 RESEÑAS
El origen de los metazoos: una
perspectiva unicelular
Arnau Sebé‑Pedrós1, Bernard M. Degnan2e Iñaki Ruiz‑Trillo3–5
Resumen | Los primeros animales evolucionaron a partir de un ancestro unicelular desconocido en el período
Precámbrico. Recientemente, la identificación y caracterización de los rasgos genómicos y celulares de los
protistas más estrechamente relacionados con los animales ha arrojado luz sobre el origen de los animales. Las
comparaciones de animales con estos parientes unicelulares nos permiten reconstruir los primeros pasos
evolutivos hacia la pluricelularidad animal. Aquí, revisamos los resultados de estas investigaciones y discutimos
sus implicaciones para comprender las primeras etapas de la evolución animal, incluido el origen de los genes
metazoarios y la función del genoma.

protista
Un nombre informal que se le da a
los eucariotas (usualmente
eucariotas unicelulares) que no están
incluidos en los linajes de hongos,
animales o plantas.
Los protistas no forman
un clado monofilético.
1 Departamento de Informática y
Ciencias Aplicadas
Matemáticas, Weizmann
Instituto de Ciencias,
Calle Hertzl 234,
Rejovot 7610001, Israel.
2Escuela de Ciencias
Biológicas, Universidad de
Queensland, Brisbane,
QLD 4072, Australia.
3Institut de Biologia Evolutiva
(Consejo Superior de
Investigaciones Científicas–
Universitat Pompeu Fabra),
Passeig Marítim de la
Barceloneta 37-49,
08003 Barcelona, España.
4ICREA, Pg Lluís Companys 23,
08010 Barcelona, España.
5Departamento de Genética,
Microbiología y Estadística,
Universitat de Barcelona,
Avinguda Diagonal 643,
08028 Barcelona, España.
Correspondencia a AS‑P. e
IR‑T.
arnau.sebe‑ pedros@
weizmann.ac.il ;
inaki.ruiz@ibe.upf-csic.es _
hacer:10.1038/nrg.2017.21 Publicado en
“No existe ninguna prueba directa del origen de los metazoos a partir
de los protozoos, pero tal [un] origen además de ser necesario por el
principio de evolución está fuertemente indicado por los hechos del
desarrollo embrionario, en el que cada metazoo pasa de un estado
acelular a otro celular. condición”, escribió Libbie H. Hyman en su libro
de 1940,Los invertebrados: protozoos a través de Ctenophora1. Más de
75 años después de las palabras de Hyman, ahora tenemos pruebas
directas de que los animales evolucionaron a partir de un antepasado.
protista. No solo eso, sino que ahora también sabemos que la
multicelularidad se ha adquirido varias veces de forma independiente
dentro del árbol de los eucariotas, incluidos los hongos, las plantas, los
diferentes tipos de algas y los mohos mucilaginosos.(RECUADRO 1; HIGO.
1). Los organismos multicelulares no solo crecen más que los
organismos unicelulares, sino que también tienen la capacidad de
realizar diferentes funciones celulares al mismo tiempo debido a la
división del trabajo espacialmente organizada y regulada.2–4. Por lo
tanto, la pregunta ahora no es si los animales evolucionaron a partir de
un ancestro protista, sino cuándo y si este ancestro unicelular poseía
características que sabemos que son importantes en la formación y el
funcionamiento de los tipos de células animales y planes corporales
existentes.
La mayor parte del trabajo sobre el origen de los animales se
ha centrado en determinar la naturaleza del ancestro compartido
de todos los animales contemporáneos. Aunque los estudios
comparativos entreanimales bilateralesy animales no bilaterales
(esponjas, ctenóforos, placozoos y cnidarios) han proporcionado
información importante sobre las características del último
ancestro común de los metazoos (Urmetazoa)5–10, este enfoque es
insuficiente como medio para mejorar nuestra comprensión de
los orígenes animales. Para descifrar cómo se produjo esta
transición, también necesitamos dilucidar la naturaleza del
antepasado unicelular de los animales. Solo teniendo algún
conocimiento de la naturaleza tanto del ancestro unicelular como
No hay registro fósil ni del ancestro unicelular ni de los pasos
iniciales en la evolución de la multicelularidad animal, la única
forma en que podemos hacer esto es estudiando los parientes
unicelulares más cercanos de los animales y comparándolos con
animales.
En esta revisión, examinamos cómo los estudios
comparativos de los parientes unicelulares más cercanos de
Metazoa han revolucionado nuestra comprensión del ancestro
unicelular de los animales y, en consecuencia, de la transición de
unicelular a multicelular. Primero, describimos las relaciones
filogenéticas entre animales y otros eucariotas. A continuación,
explicamos cómo los estudios de genómica comparativa han
proporcionado una reconstrucción detallada del repertorio de
genes del ancestro protista de los animales. Luego revisamos
cómo los estudios que abordan la biología celular y reguladora
de los parientes animales nos han permitido inferir algunos de
los rasgos biológicos de este ancestro unicelular. Sobre la base
de estas últimas reconstrucciones, desarrollamos aún más la
hipótesis propuesta por Zakhvatkin11, que ha sido ampliado más
recientemente por Mikhailovet al.12, quien sugirió que la
diferenciación celular regulada temporalmente existía en el
ancestro unicelular de los animales y que los animales se
originaron a través de la integración espaciotemporal de estos
tipos de células preexistentes. Finalmente, discutimos cómo estos
resultados plantean preguntas nuevas y emocionantes, y
proponemos vías de investigación para abordarlas.
Los animales entre los eucariotas
Un marco filogenético fuertemente respaldado es clave para
abordar cualquier pregunta evolutiva. Por lo tanto, el primer
paso hacia la comprensión del ancestro unicelular de los
animales fue la identificación de los parientes unicelulares
existentes de los animales. Hasta hace una década, sabíamos
muy poco sobre las relaciones filogenéticas entre animales y

línea el 8 de mayo de 2017; corregido el 10

del primer animal podemos entender completamente la otros eucariotas. Basado únicamente en la similitud
de mayo de 2017 transición de unicelular a multicelular. Dado que hay morfológica, fue difícil identificar unicelulares

RESEÑAS DE LA NATURALEZA |GENÉTICA PUBLICACIÓN EN LÍNEA AVANZADA |1

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REVISIONES

Caja 1 |Multicelularidad: un tema común entre los eucariotas

La multicelularidad ha evolucionado repetidamente dentro del árbol de la vida eucariótico hasta el punto de que algunos autores han considerado que se
trata de una transición evolutiva importante "menor".2. La transición a la multicelularidad ha ocurrido dentro de los eucariotas entre 16 (ÁRBITRO. 3)y 22 (
ÁRBITRO. 4)veces. Además, encontramos ejemplos de multicelularidad en todos los principales linajes eucariotas. Algunos linajes son completamente

multicelulares (como Metazoa y Embryophyta), mientras que otros solo tienen una o unas pocas especies multicelulares. De manera similar, en algunos
linajes, como los hongos, ha habido varias reversiones al estado unicelular.
La pluricelularidad se puede adquirir a través de dos mecanismos principales: por división clonal y por agregación celular. En la
multicelularidad clonal, todas las células del organismo surgen de una célula fundadora que se somete a rondas sucesivas de división, lo que
da como resultado la formación de un grupo de células genéticamente idénticas. Por el contrario, la multicelularidad agregativa se desarrolla
a través de la unión, entre sí, de células genéticamente distintas para formar una entidad multicelular. En este último escenario, la
competencia intraorganismo plantea fuertes desafíos de aptitud y, por lo tanto, se predice que el agregado será evolutivamente inestable.114.
De hecho, la multicelularidad agregativa se encuentra solo como una etapa transitoria de la vida. Entre los linajes con multicelularidad clonal,
los que resultan del desarrollo embrionario se asocian con planes corporales más complejos. El desarrollo embrionario multicelular está bien
descrito en muchos embriofitos (plantas terrestres) y metazoos. Este no es el caso de las algas pardas y rojas, que siguen estando poco
estudiadas, aunque también hay evidencia de desarrollo embrionario en estos linajes.115–117. Finalmente, a pesar de que los hongos son un
grupo relativamente bien caracterizado, la multicelularidad en los hongos no se comprende bien y es bastante problemática de categorizar.

La multicelularidad no solo ha evolucionado de forma independiente varias veces en los eucariotas, sino que cada una de estas
transiciones también se produjo en diferentes momentos de la historia de la vida. Se han descrito fósiles de supuestos organismos
multicelulares macroscópicos de rocas de 2.100 millones de años en Gabón.118, pero es discutible si estos fósiles representan verdaderos
organismos multicelulares o colonias, si son eucariotas o procariotas, o incluso si representan estructuras biológicas o abióticas.4. Los
eucariotas multicelulares inequívocos más antiguos son losbangiomorfaspp. algas rojas, que aparecieron hace unos 1.200 millones de
años, y tienen células de sujeción y reproductoras diferenciadas119. Sin embargo, la mayoría de los principales linajes multicelulares
existentes aparecieron más tarde en la evolución. Estos incluyen algas verdes macrófitas (Coleochaetales, Zygnematales y Charales), que
surgieron hace 750 millones de años.120,121; metazoos, que surgieron hace ~650 millones de años122–124; embriofitos, que surgieron hace ~
450 millones de años125; hongos multicelulares, que surgieron hace ~300 millones de años126; y feofitas, que surgieron hace ~130 millones
de años127(HIGO. 1).
Finalmente, diferentes sistemas moleculares han evolucionado para cumplir funciones similares en diferentes linajes multicelulares.
Un caso interesante es la adhesión celular, que está mediada por diferentes moléculas en diferentes taxones multicelulares. Por ejemplo, mientras que la
adhesión celular en las plantas está mediada en gran medida por "pegamentos" extracelulares como las pectinas y las hemicelulosas, en los hongos
intervienen glicoproteínas extracelulares, en los animales intervienen proteínas transmembrana como las cadherinas y las integrinas, y en las algas pardas
intervienen los florotaninos. y alginatos (que son polímeros de ácido d-manurónico y ácido l-gulurónico)128,129. De manera similar, las vías de señalización
son muy distintas en diferentes linajes multicelulares y, aunque en muchos de ellos se observa una expansión en los genes que codifican el factor de
transcripción (TF, por sus siglas en inglés),67, en cada caso se han ampliado diferentes familias estructurales de TF. De hecho, la 'inercia filogenética'
determina en gran medida el conjunto de herramientas de multicelularidad en cada grupo. Es decir, cada uno de los linajes multicelulares es más similar
en términos de sus TF o sus repertorios de señalización a sus parientes unicelulares que a otros grupos multicelulares. Por lo tanto, a pesar de algunas
tendencias comunes, no existe un conjunto de herramientas genéticas universales para la pluricelularidad.

En resumen, la imagen paneucariótica general de la multicelularidad se caracteriza por múltiples transiciones independientes, en momentos muy
diferentes, y por el uso de conjuntos de herramientas moleculares muy diferentes.

animales bilaterales
Un grupo monofilético que se
define por la simetría bilateral
del plano corporal y tres capas
germinales, y que
comprende la mayoría de los filos animales.
coanocito
Un tipo de célula especializada en
alimentación por filtración que es
característica de las esponjas. La celda básica
estructura, con un flagelo
central rodeado por un collar
de microvellosidades, hasta
cierto punto se asemeja a la de
las células coanoflageladas.
protistas que potencialmente podrían ser parientes cercanos de
los animales y que, por lo tanto, podrían arrojar luz sobre los
orígenes animales. La excepción son los coanoflagelados, que se
han considerado parientes cercanos de los animales durante más
de un siglo debido a su gran parecido con un tipo específico de
célula esponjosa llamadacoanocito3,13–15. Sin embargo, incluso en el
caso de los coanoflagelados, no fue hasta el advenimiento de la
filogenética molecular que se confirmaron como los parientes
más cercanos de los animales.
Los estudios filogenómicos han cambiado considerablemente
nuestra comprensión del árbol de la vida.(RECUADRO 1; HIGO. 1).
Además de confirmar la posición de los coanoflagelados como el
grupo hermano unicelular de animales, los estudios realizados en
la última década han revelado que dos linajes independientes
adicionales, los filastereos y los ictiosporeos, también están
estrechamente relacionados con los metazoos.16–19. En
consecuencia, tres linajes unicelulares (coanoflagelados,
filastereos e ictiosporeos) forman un clado con Metazoa(HIGO. 2).
Este clado, llamado Holozoa20, constituye así el punto de
referencia para los estudios sobre el origen de los animales. Ha
habido hipótesis alternativas con respecto a las relaciones
filogenéticas específicas entre unicelulares
holozoos. Por ejemplo, algunos análisis anteriores indicaron que
los filastereos y los ictiosporeos formaban un clado monofilético
dieciséis , mientras que otros demostraron que los filastereos eran el
grupo hermano de los coanoflagelados y los animales17. La
posición de otro holozoo candidato, el enigmático
Corallochytrium limacisporum, también siguió siendo
controvertido, ya que solo se disponía de unas pocas secuencias
de genes21–24. Sin embargo, los análisis filogenómicos más
recientes, que utilizan decenas de marcadores filogenéticos, han
demostrado que el clado formado porC. limacisporumademás,
Ichthyosporea es el linaje de holozoos que se ramificó más
temprano, y que Filasterea es el grupo hermano de
Choanoflagellatea y Metazoa18,19(HIGO. 2). Vale la pena enfatizar
que ninguna de estas posibles topologías alternativas dentro de
Holozoa tiene un impacto en las conclusiones y reconstrucciones
revisadas aquí.
Curiosamente, los tres linajes unicelulares incluidos en el
clado Holozoa tienen morfologías y estilos de vida muy
diferentes. Los coanoflagelados, que son el grupo más
relacionado con los animales, son flagelados unicelulares y
coloniales de vida libre que se alimentan de bacterias. Se
dividen en dos grandes grupos (Craspedida y

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 REVISIONES

a
Archaeplastida Multicelularidad clonal

ae
Zygnematophyceae

ce
Amoebozoa

tophy
Multicelularidad agregativa

Embriofita
Arch

ae
a
a

pa sinop phyce
ceas
Charophyt
stigm
tubulina
Solo algunas especies pluricelulares

ae
Pr

Disco
amo

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oto
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Var

ro lmo hyce
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o
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Di

les
sté

ebae

u xi
oph
Multicelularidad embriogénica

sea
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holomicota

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a

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p. cr ptof lida
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r ha trohe
holozoos
spp cen fora
cilió nemida
Filas .
coan tere o
oflag
elado
a colp xa
mple
a apico
metazo da
os cromeri alveolada
Apusozoa
Perkinsidae
Breviatea oxirraspp.
spp. Syndiniales
Malawimonas
ida dinofla
mon da gelado
Ancyro fitom
n s pp. ixea
icció
colod sea Vam
piro
obo
erol a Gro llida
Het ozo mía
len da
Ac spp
Eug i
ob ia
an
tar .
Po
Jak l lic ea
sa Fo ist
ba da
a ra i Ta ram ina Rizaria
P ad ila um inífe
Excavata on ost
m x at ros
Eu rco chn spp.
s

lo a om
so lido

p e
Di
gl mo
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Pr
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on
ifo na phy
id
tú

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a
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ra
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La

Pela

ino
diatom
ae
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Bi

Pinguiofi
Dictyophyceae
ist

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di
Chrysophyceae
e

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da
icot

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c

gop
phyc

s
sto

tofi
Feo

sis

e
ryid
Rafidófito

eas
atoph

hyce
a
Bla

Xan
mnio

ta
ae
tas

ae
m
otha
Eustig
Phae

Stramenopila

B Explosión cámbrica (542 Mya)

verde multicelular
Origen de la vida (3900 millones de años) Algas rojas multicelulares (1200 millones de años) algas (750 millones de años) Hongos multicelulares (300 Mya)

4600 millones de años 3.900 millones de años 2.100 millones de años 1200 millones de años 300 millones de años Regalo

Origen de la Tierra (4.600 millones de años) Célula eucariota Eucariotas heterótrofos (800 Mya) marrón multicelular
(2100 millones de años) algas (130 millones de años)

Primera evidencia de Metazoa (635 Mya)

Embriofita (450 millones de años)

Fauna de Ediacara (575 millones de años)

Figura 1 |Los múltiples orígenes de la pluricelularidad. a|La distribución evolucionó de forma independiente varias veces, aunque solo en cuatro linajes esta
filogenética de la multicelularidad entre los eucariotas. Formas multicelulares multicelularidad está vinculada al desarrollo embrionario y planes corporales complejos.
(clonales o agregativas; verCAJA 1) están presentes en varios linajes eucariotas. El árbol es un compuesto de consenso basado en varios estudios filogenómicos
Algunos linajes, como los animales (Metazoa; resaltado en negrita) y las plantas recientes.19,130–138.B|Una cronología de los orígenes de los principales clados eucariotas
(Embryophyta; resaltado en negrita), son completamente multicelulares (es decir, multicelulares que muestra que las transiciones a la multicelularidad han ocurrido en
todas las especies son multicelulares), mientras que otros linajes tienen solo unas momentos muy diferentes en la historia de la vida. Las estimaciones se basan en
pocas especies multicelulares, siendo la mayoría unicelular. De esta amplia registros fósiles y estimaciones de relojes moleculares.4,119–123,125–127,139. Las unidades de
distribución, se puede inferir que la pluricelularidad ha tiempo son hace millones de años (Mya).

RESEÑAS DE LA NATURALEZA |GENÉTICA PUBLICACIÓN EN LÍNEA AVANZADA |3

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REVISIONES

y es probable que la información biológica celular sobre los miembros

Bilatería representativos de los diversos grupos proporcione información sobre
Último
la transición de la unicelularidad a la multicelularidad de los metazoos.
metazoario
común cnidarios
Unicelular antepasado
metazoario
común placozoos
El genoma unicelular de los urmetazoos
antepasado
Comprender la transición de la unicelularidad a la
multicelularidad requiere conocer los tipos y el
Porifera alcance de la innovación genómica que precedió y
acompañó a esta transición. Por ejemplo, si el
holozoos ancestro unicelular de los animales contenía
Ctenófora
pocos genes involucrados en procesos
Último

holozoario
común
antepasado
coanoflageladoa
Filasterea
ictiosporea
hongos
Figura 2 |Relaciones filogenéticas de animales y holozoos unicelulares.Hay tres linajes de
holozoos unicelulares independientes que están estrechamente relacionados con los animales:
a saber, Ichthyosporea, Filasterea y Choanoflagellatea. El árbol filogenético esquemático se
basa en los estudios filogenómicos más recientes y taxonómicamente ricos.18,19. La posición de
Ctenophora y Porifera se indica como una politomía dado el debate actual sobre el orden de
ramificación de estos dos linajes.7,140,141.
Acanthoecida) y comprende más de 250 especies conocidas23,25.
Los coanoflagelados habitan ambientes marinos y de agua dulce,
y están ampliamente distribuidos en todo el mundo. Por el
contrario, los filastereos son protistas ameboides que tienen
filopodios. Solo hay dos especies filasterianas descritas hasta
el momento: la especie marina de vida libreministerio
vibrans17,26; yCapsaspora owczarzaki, que fue aislado de un
caracol de agua dulce de Puerto Rico y Brasil27–29.
Originalmente se sugirió queC. owczarzakiproporcionaría al
caracol resistencia aEsquistosoma mansoniinfecciones al
destruir los esporocistos de este parásito. Sin embargo,
nuevos intentos de aislarC. owczarzaki desdeS. mansoniLos
caracoles resistentes no tuvieron éxito, y la interacción
exacta deC. owczarzaki, en su caso, con este huésped
Filopodios
Proyecciones celulares delgadas basadas
potencial sigue sin estar claro27,30. Finalmente, los
en actina que se utilizan en la detección ictiosporeos comprenden aproximadamente 40 especies
ambiental y la motilidad celular. descritas, y son los parásitos o comensales de una gran
diversidad de animales, incluidos los humanos y muchos
invertebrados marinos.31,32. Sin embargo,metabarcodelos
Metacódigo de barras
multicelulares, se podría inferir que un evento
clave en la evolución de la multicelularidad de los
metazoos sería la evolución de genes específicos
de animales. Por el contrario, si el ancestro
unicelular tenía muchos de los genes implicados
en el desarrollo y la fisiología multicelular, es
probable que la evolución de la multicelularidad
haya implicado la cooptación de genes existentes
para realizar nuevas funciones. Sin embargo, para
distinguir entre estas posibilidades, necesitamos
dilucidar el contenido genético del ancestro
unicelular.
Ahora tenemos las secuencias genómicas completas de
cuatro holozoos unicelulares, que representan cada uno de
los tres linajes unicelulares que están más estrechamente
relacionados con los animales. Estos incluyen los genomas
de dos coanoflagelados (Monosiga brevicollisySalpingoeca
roseta), una filasteriana (C. owczarzaki) y una ictiosporea (
Creolimax fragrantissima)36–39(HIGO. 3a). Este rico conjunto de
datos nos permite reconstruir el contenido genético del
ancestro unicelular de los animales con un nivel de detalle
sin precedentes. Los resultados han sido bastante
sorprendentes. Aunque hubo innovación genética al inicio de
Metazoa, el ancestro unicelular de los animales ya tenía un
rico repertorio de genes que se requieren para la adhesión
celular, la señalización celular y la regulación transcripcional
en los animales modernos.(HIGO. 3b).
El primer ejemplo es el de los genes que codifican proteínas
de adhesión celular, que son necesarias para las interacciones
célula-célula y célula-matriz en la formación de capas celulares,
tejidos y matriz extracelular (ECM) en animales. El análisis de la
secuencia del genoma de los holozoos unicelulares indica que el
ancestro unicelular de los animales ya tenía varios mecanismos
de adhesión celular, tanto para la adhesión célula-célula como
célula-MEC(HIGO. 3b). Por ejemplo, hay aproximadamente 20 a 30
dominios de cadherina predichos que contienen proteínas
codificadas en los genomas de los coanoflagelados.40. Sin
embargo, las cadherinas animales clásicas, que están reguladas

Análisis de la diversidad de
especies o linajes en grupos
muestras ambientales mediante la
secuenciación de una región común
estandarizada de ADN,
generalmente el gen que codifica el
análisis sugieren la presencia de especies de ictiosporas de
vida libre33. La mayoría de las ictiosporas se reproducen a
través de multinucleadascoenocitocolonias y tienen una
amplia diversidad de etapas de dispersión, incluidas formas
flageladas y ameboides34,35.
por la β-catenina y están implicadas en la adhesión célula-célula,
parecen ser específicas de los metazoos. Es más,
C. owczarzakitiene un adhesoma de integrina completo, que es un
importante sistema de adhesión célula-MEC en animales41. Otras
proteínas relacionadas con la ECM están presentes en los holozoos

ARN ribosomal 18S. Según nuestra última visión del marco filogenético de unicelulares e incluyen varios componentes del complejo de
los animales dentro del clado eucariota, está claro que al glicoproteínas asociadas a la distrofina y múltiples dominios de
Coenocito investigar el origen de los animales, se deben tener en proteínas relacionadas con la ECM, como lamininas, colágenos y
Una célula multinucleada resultante
cuenta los tres parientes más cercanos de los animales: fibronectinas.39. Finalmente, las lectinas tipo C, que están implicadas
de sucesivas nucleares
divisiones (cariocinesis) sin coanoflagelados, filastereos e ictiosporeos. Obtención de en la adhesión célula-célula, están presentes en los coanoflagelados.36.
citocinesis asociada. datos genómicos, regulatorios En general, la presencia de células animales

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 REVISIONES

a holozoos

metazoos

coanoflageladoa
ictiosporea

Ctenófora

Bilatería
Filasterea

placozoos

cnidarios
Porifera
hongos

Scer Cfra vacac Sros Mmbre Mlei Aque Tadh Nvec Dmel Hsap
Tamaño del genoma (Mb) 12.10 45 28 55.40 41.60 155,90 166,70 98 356,60 168,70 3.095
Número de genes predichos 6,692 8,694 8,657 11,629 9,171 16.548 40.122 11.520 27.273 26.951 22.447
Densidad de genes (genes por Mb) 553 193 309 210 220 106 241 118 76 160 7
Tamaño intergénico medio (pb) 544 1,563 738 885 1,596 3,561 2,481 5,093 6,959 5,542 111,359
% secuencia codificante en el genoma 74.58 30.34 58.70 41.69 39.56 14.17 20.98 15.88 6.94 13.23 1.20
Número medio de intrones por gen 0.10 6.50 4.00 7.50 6.60 4.50 4.20 7.40 4.30 4.90 6.30
Tamaño medio del intrón (pb) 271 303 157 252 171 891 326 283 798 1,509 5,923
% contenido de GC 38.10 40.30 53.80 56.00 54.90 38.90 35.80 32.70 40.60 41.70 40.90

Receptores de adhesión
B cadherinas,
lectinas tipo C
La matriz extracelular
colágeno, laminina,
fibronectina
Reguladores del citoesqueleto
Fascin, VAV1, DIA, ERM, MYOX,
distroglicano, vinculina, talina,
EPS8, sintrofina

Adherencia a la
la matriz extracelular
α-integrinas,
β-integrinas, TF
sarcoglicano MYC, sujetador, CSL,
RUNX, ESTADÍSTICAS,

NF-κB, HD TALE y
no-TALES, p53,
MEF2, RFX
Transducción de señales
SRC, CSK, vía del hipopótamo,
Receptores de señalización
PI3K, GSK3, GAB1,
GPCR, RTK, mTOR, MAGUK, MAPK
Hedgling, teneurinas

Figura 3 |Genómica comparativa de Holozoa. a|Las características genómicas de los
animales y sus parientes unicelulares. Los genomas animales contienen una mayor
proporción de secuencias no codificantes que los genomas de otros holozoos, lo que
podría estar relacionado con la cantidad de información reguladora codificada. Otras
diferencias son el mayor tamaño y el mayor número de genes predichos en los genomas
animales en relación con los genomas de otros holozoos, aunque ambas características
muestran una gran variabilidad entre especies. Datos deREFS 38,39,142. B|Un repertorio
de genes inferido del ancestro unicelular de los animales. Muchos genes que son
importantes para las funciones relacionadas con la multicelularidad de los metazoos,
como la adhesión, la señalización y la regulación transcripcional, evolucionaron en un
contexto unicelular y estaban presentes en el ancestro unicelular de los animales. La
inferencia se basa en la presencia de homólogos de estos genes de metazoos en los
genomas de parientes unicelulares de animales. El origen del repertorio de genes
animales se describe exhaustivamente en otra parte39,105. Aque, Anfimedón
queenslandica(Porifera); BRA, braquiuria; Cfra,Creolimax
fragrantissima(ictiosporea); vaca,Capsaspora owczarzaki(Filasterea); DIA,
diáfano; Dmel,Drosophila melanogaster(bilateral); EPS8, sustrato 8 de la
cinasa del receptor del factor de crecimiento epidérmico; GAB, proteína de
unión asociada a GRB2; GPCR, receptores acoplados a proteína G; GSK3,
glucógeno sintasa quinasa 3; HD, homeodominio; Hsap,Homo sapiens(
bilateral); MAGUK, cinasas tardías de guany asociadas a la membrana;
MAPK, proteínas quinasas activadas por mitógenos; mbre,Monosiga
brevicollis (Coanoflageladoa); MEF2, factor potenciador 2 específico de
miocitos; mlei, Mnemiopsis leidyi(Ctenófora); mTOR, blanco mecanicista de
la rapamicina; MYOX, miosina X; NF-κB, factor nuclear-κB; nvec,
Nematostella vectensis (Cnidarios); PI3K, fosfatidilinositol 3-quinasa; RTK,
tirosina quinasas receptoras; Scer,Saccharomyces cerevisiae(hongos); Sros,
Salpingoeca roseta (Coanoflageladoa); STAT, transductor de señales y
activador de la transcripción; tadh,Trichoplax adhaerens(placozoos); TALE,
tres extensiones de bucle de aminoácidos; TF, factor de transcripción.

RESEÑAS DE LA NATURALEZA |GENÉTICA PUBLICACIÓN EN LÍNEA AVANZADA |5

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REVISIONES
ortólogos
Genes en diferentes especies que
descienden de un gen ancestral
común a través de
un evento de divergencia de especiación.
6|PUBLICACIÓN EN LÍNEA AVANZADA
Las proteínas de adhesión, incluidas las integrinas, las lectinas de
tipo C y las cadherinas, en los holozoos unicelulares existentes
indican que estos mecanismos de adhesión no fueron
innovaciones animales.
La transducción de señales es otro requisito clave para la
multicelularidad de los metazoos. Varias vías clave de
señalización del desarrollo, como Hedgehog, WNT, el factor de
crecimiento transformante β (TGFβ), JAK-STAT y Notch, están muy
conservadas en los metazoos (con la posible excepción de la
mayoría de los componentes de las vías Notch y Hedgehog, que
están ausentes). en ctenóforos6,7) y no se encuentran en los no
metazoos8,36,39,42. En otros casos, los receptores de señalización
similares están presentes en los genomas de los holozoos
unicelulares.(HIGO. 3b). El caso mejor estudiado es el de los
receptores tirosina quinasas (RTK). Los coanoflagelados,
filastereos e ictiosporeos tienen docenas de RTK evolucionados
de forma independiente, ninguno de los cuales parece ser
homólogo a los RTK de los demás ni a los RTK de metazoos (es
decir, los RTK de metazoos son una cuarta expansión
independiente de RTK en holozoos)43–45. Por el contrario, algunos
ortólogosde tirosina quinasas citoplasmáticas, como SRC, quinasa
de adhesión focal (FAK) y CSK, están presentes tanto en animales
como en holozoos unicelulares. Otro mecanismo de señalización
premetazoario conservado es la vía de señalización del
hipopótamo, que está presente enC. owczarzaki46. En este caso,
una vez más, los componentes intracelulares de la vía se
conservan, mientras que los receptores aguas arriba de los
metazoos conocidos, Crumbs y Fat, están ausentes. Por lo tanto,
parece que aunque algunos componentes de señalización
intracelular de metazoos estaban presentes en el ancestro
unicelular de los animales, en la mayoría de los casos sus
receptores y ligandos aguas arriba evolucionaron después de que
los metazoos se separaran de los holozoos unicelulares.
Finalmente, los estudios de genómica comparativa
también han demostrado que una proporción considerable
del repertorio de factores de transcripción (TF) de los
animales ya estaba presente en el ancestro unicelular del
holozoo.(HIGO. 3b). Esto incluye algunas clases de TF que
anteriormente se pensaba que eran específicas de los
metazoos (como el factor nuclear-κB (NF-κB), p53, RUNX y T-
box)47,48. Nuevas clases de TF, como ETS, SMAD, receptor
nuclear, Doublesex y las familias del factor regulador del
interferón (IRF), evolucionaron en la raíz de Metazoa, y
aparecieron muchas familias nuevas dentro de clases
específicas de TF, incluidas T-box, SOX, homeobox y familias
basic helix-loop-helix (bHLH) (revisadas enÁRBITRO. 49).
Algunos de estos TF, junto con el adhesoma de integrina41, se
perdieron secundariamente en los coanoflagelados47. Estos son
dos ejemplos de advertencia de la limitación de reconstruir el
contenido de genes ancestrales sobre la base de muy pocas
especies y linajes. Por lo tanto, no podemos descartar que la
pérdida secundaria no esté ocultando orígenes evolutivos más
antiguos para algunas familias de genes.
El hallazgo de que muchos genes clave involucrados en la
multicelularidad y el desarrollo animal ya estaban presentes en el
ancestro unicelular de los animales sugiere que la cooptación de
genes ancestrales en nuevas funciones fue un mecanismo
importante en la evolución de la multicelularidad animal. Es decir,
muchos de los genes que actualmente funcionan dentro de los
animales multicelulares evolucionaron dentro de
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un contexto unicelular y posteriormente fueron reutilizados para
la multicelularidad. Esta cooptación del repertorio de genes
ancestrales, junto con la evolución de nuevos genes animales
(por ejemplo, ligandos y receptores), y una expansión y
diversificación sustanciales de algunas familias de genes
ancestrales, configuraron el conjunto de herramientas genéticas
para la multicelularidad animal.
Tipos de células holozoarias unicelulares
Aunque la reconstrucción del contenido genético del ancestro
protista de los animales es un paso importante para comprender
la aparición de los animales, el contenido genético por sí solo no
es suficiente para proporcionar información sobre la biología
celular, el ciclo de vida y las capacidades de regulación del
ancestro unicelular. Esto requiere un análisis de la biología de los
parientes unicelulares existentes de los animales. Con este fin,
algunas especies de holozoos unicelulares se están estudiando
intensamente y están emergiendo como sistemas modelo
candidatos para abordar el origen de los animales.
Etapas de vida de los coanoflagelados.s. rosettaes la especie de
coanoflagelado mejor estudiada. Análisis de las. rosetta ciclo de
vida ha revelado que este coanoflagelado forma colonias por
división celular clonal50y que las células dentro de la colonia están
unidas por puentes celulares51(HIGO. 4A). Curiosamente, la
formación de colonias ens. rosettaes provocado por
Figura 4 |Ciclos de vida de los holozoos unicelulares.Cada panel ▶
muestra el ciclo de vida y las transiciones de tipos de células
temporales en una especie de holozoo unicelular. Para cada
organismo, el ciclo de vida se muestra esquemáticamente a la
izquierda y las imágenes de microscopía de las etapas
correspondientes se muestran a la derecha. A|El ciclo de vida del
coanoflagelado colonialSalpingoeca roseta. El ciclo incluye una etapa
de teca sésil unicelular, etapas unicelulares de natación lenta y rápida,
y dos tipos de etapa colonial (colonias en cadena y en roseta) en las
que las células están unidas por puentes intercelulares (indicados por
una flecha blanca en el microscopio electrónico). imagen en el panel
derecho de la parteD). El hambre desencadena las. rosettaciclo sexual,
en el que las células diploides experimentan meiosis y recombinación,
y las células haploides resultantes (que también pueden dividirse
asexualmente) se aparean de forma anisógama. Las barras de escala
representan 5 μm, excepto en el panel derecho de la parteDdonde la
barra de escala representa 1 μm.B|El ciclo de vida de las ictiosporas
Creolimax fragrantissima. Las amebas de un solo núcleo se dispersan
hasta que encuentran un lugar para asentarse y enquistarse. Luego, la
célula se somete a múltiples rondas de división nuclear sincrónica sin
que intervenga la división citoplasmática. Los núcleos se colocan en la
periferia a medida que crece una gran vacuola central. Finalmente, el
cenocito se celulariza y se liberan nuevas amebas. Las barras de escala
representan 10 μm, excepto en parteCdonde la barra de escala
representa 50 μm.C|El ciclo de vida de la ameba filastereaCapsaspora
owczarzaki. La etapa proliferativa trófica es una ameba con filopodios
largos y delgados basados en actina. Estas amebas pueden agregarse
y producir una matriz extracelular que las une. Además, las células
agregadas y las amebas pueden transformarse en una forma de
resistencia quística. Las barras de escala representan 1 μm, excepto en
parteDdonde la barra de escala representa 200nm. Parte Aestá
adaptado con permiso deÁRBITRO. 51, Elsevier. ParteBestá adaptado con
permiso deÁRBITRO. 38, Publicaciones de Ciencias eLife. ParteCestá
adaptado con permiso deÁRBITRO. 57, Publicaciones de Ciencias eLife.
www.nature.com/nrg
 REVISIONES

A colonia de cadena colonia de rosetas

a B C
C D

Sexo nadador lento

D
2norte

B
nadador rapido
gametos Mitosis
norte

a
Celda de teca

B sincrónico Coenocito a B
nuclear
división B

celularización
enquistamiento

Dispersivo
a ameba C

C B a B
C

Multicelular quistes
agregar

D
Amebas filopodadas

Etapas proliferativas Direccionalidad de las transiciones de tipo celular

RESEÑAS DE LA NATURALEZA |GENÉTICA PUBLICACIÓN EN LÍNEA AVANZADA |7

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REVISIONES
Gen efector
Un gen que está relacionado con
funciones celulares estructurales y
metabólicas (por ejemplo, enzimas o
citoesqueléticos).
proteínas), a diferencia de
un gen regulador.
8|PUBLICACIÓN EN LÍNEA AVANZADA
la presencia de su presa bacteriana,Algoriphagus
machipongonensis, y más concretamente, por una molécula de
sulfolípido producida por esta bacteria52. Esta observación
sugiere un vínculo evolutivo profundo entre la captura de presas
bacterianas y la multicelularidad animal temprana. Etapas de vida
adicionales des. rosettaincluyen una forma tecate sésil y etapas
de nadador lentas y rápidas51(HIGO. 4A).s. rosettatambién tiene un
ciclo de vida sexual que se desencadena por la falta de nutrientes
e involucra gametos morfológicamente diferenciados53. La
presencia de reproducción sexual y gametogénesis en
coanoflagelados sugiere que estos procesos estaban presentes
en el ancestro unicelular de los animales.
Análisis de secuenciación de ARN (RNA-seq) des. rosettaha
revelado perfiles transcriptómicos altamente específicos que están
asociados con las diferentes etapas de la vida37. Los genes
sobrerregulados diferencialmente incluyen aquellos que codifican
septinas en la etapa colonial y aquellos que codifican diferentes
proteínas que contienen dominios de cadherina en las etapas colonial
y sésil. En una pantalla de mutagénesis aleatoria reciente54, una lectina
tipo C fue identificada como esencial para la formación de colonias en
s. rosetta, proporcionando el primer enlace directo de gen a
fenotipo en un holozoo unicelular.
Investigación de otro coanoflagelado,M.brevicollis, ha
proporcionado información sobre la función premetazoa de las
cadherinas. DosM.brevicollisLas cadherinas se localizan en el collar de
alimentación de las microvellosidades y se colocalizan con el
citoesqueleto de actina.55.M.brevicollises una especie de
coanoflagelado estrictamente solitaria, lo que sugiere un papel de las
cadherinas de coanoflagelado en la captura de presas. En línea con
esto, ninguno de los estudios en el coanoflagelado colonials. rosettaha
relacionado las cadherinas con la formación de colonias, lo que
respalda aún más la idea de un papel de adhesión no celular para las
cadherinas en los coanoflagelados existentes y, potencialmente, en el
ancestro unicelular de los animales.
Etapas de vida de las ictiosporas.C. fragrantissimaes un sistema modelo de
ictiosporas prometedor en el que las herramientas están disponibles para la
transformación genética transitoria56. El ciclo de vida de
C. fragrantissima(y otras ictiosporas) es muy diferente de la de los
coanoflagelados(HIGO. 4B). Comienza con una célula
mononucleada que se somete a múltiples rondas de división
nuclear sincrónica, lo que da como resultado un gran cenocito
multinucleado sésil (con un diámetro de 70 a 80 μm) que tiene
una pared celular, núcleos localizados en la periferia de la célula y
una gran vacuola central.35,56. La rápida celularización del cenocito
va seguida de la liberación de células ameboides mononucleadas,
que son muy móviles y no se dividen. Las amebas se dispersan
hasta encontrar un lugar despejado donde asentarse, donde se
enquistan y comienzan un nuevo ciclo.(HIGO. 4B). Un análisis
reciente de dos etapas de la vida deC. fragrantissima(
multinucleado y ameba) ha mostrado perfiles transcriptómicos
específicos para cada etapa que involucran cientos de genes
expresados diferencialmente38. Por ejemplo, el adhesoma de
integrina y el TF Brachyury están significativamente regulados al
alza en la etapa de ameba, mientras que los genes relacionados
con la replicación y la traducción del ADN están regulados al alza
en la etapa colonial.
Etapas de la vida filasteriana.Entre Filasterea, sólo el ciclo
de vida deC. owczarzakiha sido descrito57(HIGO. 4C). AunqueC.
owczarzakioriginalmente fue reportado como un
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Endosimbionte de un caracol de agua dulce, observaciones
recientes sugieren que esta ameba puede ser capaz de fagocitar
bacterias y crecer como un bacterivoro, de manera similar a sus
especies hermanas.M. vibrans(IR-T. y colegas, observaciones no
publicadas). losC. owczarzakiEl ciclo de vida incluye tres etapas
celulares diferentes: una etapa ameboidea, una etapa quística y
una etapa multicelular agregativa. En la etapa ameboidea, las
células tienen filopodios largos y delgados basados en actina.58,
y la ameba representa la etapa trófica proliferativa y fagocítica. Al
morir de hambre,C. owczarzakilas células retraen sus filopodios y
se encapsulan, formando una forma de resistencia quística.
Finalmente, las células ameboides pueden unirse y formar
agregados multicelulares, en los que las células producen una
matriz extracelular que las mantiene unidas sin necesidad de
contacto directo entre células. Esto representa el único caso
conocido de multicelularidad agregativa en Holozoa.(HIGO. 1).
Análisis transcriptómico de laC. owczarzakiciclo de vida
mostró que la diferenciación celular regulada temporalmente
está vinculada a perfiles transcripcionales específicos57. Esta
regulación génica diferencial involucra a cientos de genes, y entre
ellos hay muchosC. owczarzakihomólogos de genes que son
esenciales para la multicelularidad animal. Por ejemplo, las
células en etapa agregada coexpresan fuertemente genes de
integrina adhesoma, así como proteínas ECM, incluidas proteínas
que contienen dominios de fibronectina y dominios de laminina;
por el contrario, en la etapa filopodial, los genes relacionados con
el citoesqueleto de actina, la formación de filopodios y la
señalización de tirosina quinasa están sobreexpresados. Además,
el empalme alternativo regulado diferencialmente está
relacionado con las transiciones de tipo celular enC. owczarzakiy
además contribuye a la expresión génica regulada
temporalmente. Un estudio más reciente analizó el proteoma y la
dinámica de señalización de fósforo durante elC. owczarzakiciclo
de vida utilizando proteómica de alto rendimiento59. Este estudio
mostró que la remodelación extensiva del proteoma y cientos de
eventos dinámicos de fosfoseñalización subyacen a la
diferenciación celular regulada temporalmente enC. owczarzaki.
Curiosamente, se demostró que docenas de tirosina quinasas,
incluidos ortólogos de varias tirosina quinasas citoplasmáticas
(como SRC, ABL y TEC), así como RTK estructuralmente diversas,
se fosfoactivan de una manera específica del tipo de célula.
Además, múltiples TF parecían estar fosforregulados y la vía
Hippo se activó específicamente durante la etapa de agregación.
Estos resultados respaldan aún más la idea de que ya existía una
regulación transcripcional, postranscripcional y mediada por
fosfoseñalización elaborada en el ancestro protista de los
animales.
En general, la diversidad de morfologías y comportamientos
celulares en los holozoos unicelulares existentes sugiere que el
ancestro unicelular de los metazoos era un bacterivoro que
mostraba reproducción sexual y múltiples tipos de células
diferenciadas temporalmente.12. Lo más probable es que estas
transiciones entre los diferentes estados celulares estuvieran
estrictamente reguladas por la expresión diferencial de TF
conservados, como Brachyury, y desencadenadas por
condiciones ambientales como la falta de nutrientes y la
presencia de presas bacterianas.
Innovación regulatoria de origen animal Específicogen
efectorLos módulos y sus reguladores aguas arriba
inmediatos definen la especificidad funcional de un
www.nature.com/nrg

cis-elemento regulador
Un segmento genómico que
regula la transcripción de
genes (generalmente vecinos)
en el mismo cromosoma.
Bucle de cromatina
Plegamiento físico de la fibra
nucleoproteica de la cromatina. A
menudo se asocia con eventos
regulatorios que involucran la
proximidad física entre los
elementos potenciadores distales y
los promotores de genes.
RESEÑAS DE LA NATURALEZA |GENÉTICA
tipo celular dado60y, como hemos descrito, muchos de los
componentes de estos módulos de genes evolucionaron en
linajes de premetazoos. Sin embargo, como afirmó Eric H.
Davidson en su libro de 2006El genoma regulador61“Las baterías
de genes de diferenciación no hacen planes corporales”. De
hecho, el desarrollo animal depende en última instancia del
despliegue espaciotemporal finamente regulado de estas
baterías de genes efectores para generar fenotipos celulares
individuales y estructuras multicelulares colectivas. Esta
definición dinámica de estados reguladores está orquestada por
grandes redes reguladoras de genes (GRN) jerárquicas y
mecanismos epigenéticos de memoria celular. La pregunta clave
aquí es si estos GRN y mecanismos epigenéticos ya estaban
presentes en el ancestro unicelular de los animales.
Señalización de novedades en la raíz de los Metazoos.Los genes de
señalización son elementos esenciales de los metazoos GRN. En los
organismos unicelulares que muestran una diferenciación de tipos de
células regulada temporalmente, las señales ambientales, como la
privación de nutrientes y la hipoxia, desencadenan transformaciones
de tipos de células.62,63. Podría decirse que el control de la
diferenciación a través del metabolismo o los gradientes químicos es
mucho menos prominente en los metazoos modernos que en los
organismos unicelulares. En cambio, los mecanismos de señalización
de largo alcance y de célula a célula son los determinantes más
importantes del destino celular en los metazoos modernos.
Curiosamente, la mayoría de estas vías de señalización se originaron
en la raíz de Metazoa (ver arriba)8,36,39y son esenciales para el patrón
corporal en animales de ramificación temprana10,64. Por lo tanto, estas
vías de señalización del desarrollo parecen haber sido importantes
para la evolución de la determinación del tipo celular y la morfogénesis
en animales.
El surgimiento de un conjunto de herramientas TF de metazoos.Los
TF son los otros jugadores importantes en los GRN del desarrollo
animal. Los datos disponibles sugieren que el establecimiento del
conjunto de herramientas reguladoras del TF de metazoos fue el
resultado de una combinación de cinco procesos. Primero, las clases
antiguas de TF, en particular aquellas con especificidades de unión al
ADN altamente variables, como homeoboxes y dedos de zinc.65,66- se
expandieron enormemente por la duplicación de genes al inicio de
Metazoa, originando docenas de nuevas familias67. En segundo lugar,
las clases TF preexistentes se incorporaron a nuevas funciones. Esto
sucedió con muchos TF de origen holozoario, como T-box TF, RUNX TF,
p53 y NF-κB. En tercer lugar, las nuevas clases de TF, como ETS, SMAD,
IRF y familias de receptores nucleares, se originaron en la raíz de los
animales. En cuarto lugar, los cambios en las interacciones TF-TF y TF-
cofactor ampliaron el número de especificidades de unión reguladora
combinatoria. Por ejemplo, las preferencias de dimerización de la
cremallera básica de leucina (bZIP) de varias especies, incluido el
coanoflageladoM.brevicollis, han sido analizadosin vitro68. Este estudio
encontró que la proporción de interacciones bZIP heterodiméricas (es
decir, interacciones entre TF bZIP que pertenecen a diferentes familias)
aumentó considerablemente en especies multicelulares en relación
con sus parientes unicelulares. Esto indica que la remodelación de las
redes de dimerización de TF es una forma potencial de aumentar la
cantidad de salidas regulatorias de un conjunto limitado de TF.
Finalmente, las redes reguladoras aguas abajo específicas de TF
antiguas probablemente fueron cooptadas y modificadas.
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REVISIONES
Mientras quecis-elemento reguladorla conservación de la secuencia se
erosiona rápidamente durante la evolución, las conexiones
reguladoras específicas tienden a conservarse más69.
Lo que no está claro es hasta qué punto se pueden inferir
tales conexiones reguladoras de TF al comparar parientes
unicelulares existentes con animales de ramificación
temprana. Un estudio reciente sugiere que, al menos para
algunos TF, tal inferencia podría ser posible. en el filastereo
C. owczarzaki, se demostró que los ortólogos de Brachyury y MYC
regulan los genes involucrados en la motilidad celular y la
proliferación celular, respectivamente, lo que indica que
funcionan de manera similar a sus ortólogos de metazoos70.
Además, MYC del coanoflageladoM.brevicollistiene compañeros
de interacción similares (el bHLH TF MAX) a los del metazoo MYC
y utiliza los mismos sitios de unión al ADN a través de los cuales
actúan las proteínas del metazoo MYC (sitios llamados E-boxes)71.
Estos hallazgos refuerzan aún más la idea de una red reguladora
de MYC de premetazoos altamente conservada involucrada en el
control de la proliferación celular.70. En resumen, los datos
sugieren que el conjunto de herramientas reguladoras de
metazoos TF evolucionó a través de cambios tanto en el
repertorio de genes TF como en elcis-regulatorio y trans
-Interacciones reguladoras. Estos cambios finalmente dieron
como resultado capacidades regulatorias muy ampliadas de los
metazoos TF.
Regulación del potenciador distal en metazoos tempranos.Los TF
se unen a secuencias específicas ubicadas en promotores de genes y,
al menos en animales bilaterales, elementos potenciadores distales.
Los potenciadores son grupos de sitios de unión de TF que tienen
características de cromatina específicas, como el agotamiento de los
nucleosomas (sitios de cromatina abiertos) y marcas de histonas
particulares (monometilación de histona 3 lisina 4 (H3K4me1) y
acetilación de histona 3 lisina 27 (H3K27ac)) en los nucleosomas
flanqueantes72–76. La presencia de p300 (también conocida como
EP300), una histona acetiltransferasa de origen holozoario47, también
se ha utilizado para predecir las regiones potenciadoras y la actividad77
. Los enfoques de alto rendimiento para identificar y validar candidatos
a potenciadores y probar sus funciones han demostrado que la
mayoría de los elementos potenciadores en animales bilaterales están
distantes (desde kilobases hasta megabases) de los promotores
genéticos que regulan, y que actúan a través del bucle físico de la
cromatina.78–80. Estabucle de cromatinaestá mediada por CTCF, cohesina y
otras proteínas estructurales81,82. Los elementos potenciadores
generalmente residen en regiones intergénicas y, en genomas más
compactos, en intrones; estos elementos potenciadores intrónicos a
menudo se encuentran en genes vecinos a los genes que regulan. El
número estimado de potenciadores es del orden de miles en animales
comoDrosophila melanogaster83y humanos76(TABLA 1). Además, enD.
melanogasterla gran mayoría de los potenciadores muestran una
actividad espacial y temporal muy restringida durante el desarrollo83,84,
enfatizando la importancia de los elementos potenciadores en la
orquestación de estados regulatorios complejos. Otra característica
definitoria de cis-elementos potenciadores reguladores es su
naturaleza combinatoria y modularidad: se producen múltiples sitios
de unión en cada potenciador85, y los estados regulatorios son
generados por la acción combinada de múltiples potenciadores en el
mismo gen, particularmente en genes que codifican TF y otros
PUBLICACIÓN EN LÍNEA AVANZADA |9
REVISIONES

microsintético
Describe pequeñas regiones
genómicas en las que la
colocalización física de loci es
conservada entre diferentes
especies.
reguladores del desarrollo86,87. En general, la acción combinada
de los potenciadores distales y, en menor medida, del promotor
proximalcis-Los elementos reguladores subyacen a los complejos
patrones de expresión espaciotemporal observados durante el
desarrollo bilateral.
Aunque la dinámica evolutiva de los potenciadores se ha
estudiado ampliamente en algunos bilaterales88, la existencia
de tales elementos reguladores en otros linajes de metazoos
o premetazoos sigue siendo un misterio. Un indicio indirecto
de la posible existencia de regulación distal en todos los
metazoos es la profunda conservación evolutiva de
microsintéticobloques a través de metazoos89,90. Estos bloques
comprenden un gen (generalmente un gen del desarrollo,
como uno que codifica un TF o una proteína de señalización)
que está vinculado a otro gen espectador vecino
funcionalmente no relacionado. Este vínculo a menudo se
debe a la presencia de elementos reguladores en el gen
espectador. Curiosamente, no se han encontrado bloques
microsintéticos conservados entre los animales y sus
parientes unicelulares.89, lo que sugiere que la regulación
distal evolucionó en la raíz de Metazoa.
La primera evidencia experimental directa de la
conservación evolutiva del paisaje regulador epigenético
más allá de Bilateria provino de un estudio histórico en
el cnidario.Nematostella vectensis91
(TABLA 1). Se predijeron aproximadamente 6.000
potenciadores enN.vectensis, y mostraron firmas de
cromatina similares (H3K4me1, K3K27ac y la presencia de la
histona acetiltransferasa p300) a las de los potenciadores
bilaterales. Confirmando estas predicciones, 12 de estos
N.vectensiselementos potenciadores mostraron actividad en
en vivoensayos de reportero. Es más,
N.vectensisSe encontró que los potenciadores estaban particularmente
enriquecidos cerca de los genes que codifican TF, lo que
sugiere la existencia de redes reguladoras combinatorias
complejas de TF. Sin embargo, lo que se desconoce es si
estosN.vectensisLos potenciadores funcionan a través de
bucles de cromatina o mediante mecanismos de proximidad
sin bucles. Esto último es sugerido por la ausencia de CTCF,
una proteína clave para el bucle de cromatina, enN.vectensis
y otros animales no bilaterales92. Sin embargo, un
mecanismo de proximidad sin bucle es inconsistente con la
falta de dependencia de la actividad del potenciador en la
orientación del potenciador o la posición del potenciador en
relación con el promotor enN.vectensis ensayos de reportero
91. Además, el complejo de cohesina más antiguo (que está
presente en todos los animales y en la mayoría de los
eucariotas) parece ser clave para el bucle potenciador.81,82, y
recientemente se ha demostrado que varias proteínas
estructurales diferentes, pero notablemente no CTCF, están
asociadas con bucles de cromatina potenciadores-
promotores enD. melanogaster93,94. Por lo tanto, es posible
que el bucle potenciador-promotor enN.vectensisocurre,
incluso en ausencia de CTCF, a través de bucles mediados
por cohesina y/u otras proteínas estructurales.
Multicelularidad y arquitectura cromosómica.Aunque el
panorama de la regulación genética deN.vectensises similar
a la de Bilateria, no está claro si la organización global del
genoma puede diferir entre bilaterales y no bilaterales. En
particular, no está claro si el genoma de los no bilaterales
está organizado en territorios de cromatina estructural,
como los dominios de asociación topológica (TAD), que se
encuentran en los genomas bilaterales.95–98. La discretización
del genoma en dominios estructurales amplios, como los
TAD, permite la existencia de bloques reguladores
autónomos, que tienen características de cromatina
prevalentes similares (por ejemplo, activos

Tabla 1 |Características reguladoras del genoma en animales y parientes unicelulares

Saccharomyces Capsaspora Nematostela drosófila Homo sapiens

cerevisias owczarzaki vectensis melanogaster

clado hongos Filasterea cnidarios Bilatería Bilatería

multicelularidad Unicelular Unicelular Multicelular Multicelular Multicelular

% genoma no codificante 25.4 58.7 93.1 86.8 98.8
Número de desiertos de genes (50kb) 0 1 474 1,033 45,248
Distancia intergénica media (pb) 544 738 6,959 5,542 111,359
Número de factores de transcripción 95 143 544 497 1,012
H3K27me3/PRC2 − /− − /− ?/+ + /+ + /+
Estructuras de cromatina de alto orden – ? ? + +
(TAD y compartimentos)

Bucles de cromatina/CTCF − /− ?/– ?/– + /+ + /+

metilación del ADN – – + – +
Tipos de promotores yo? Yo ? I, II y III I, II y III
Número de sitios abiertos de cromatina 4,897 11,927 ? 35,507–45,825 2,890,742

Número de elementos potenciadores 0 0 5,747 50,000–100,000 41,011–399,124

Número de miARN 0 0 87 147 677

Número de loci de lincRNA 63 652 ? 1,119 8,195
+ , presente; –, ausente;?, desconocido; H3K27me3, histona H3 lisina 27 trimetilación; lincRNAs, RNAs no codificantes intergénicos largos;
miARN, microARN; PRC2, complejo represivo 2 de Polycomb; TADs, topológicamente asociando dominios. Los datos se derivan de
REFS 39,67,75,76,83,143–151.

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Estados de cromatina
combinaciones únicas de
modificaciones postraduccionales
de histonas y proteínas asociadas
a la cromatina que definen
diferentes actividades
bioquímicas del genoma.
RESEÑAS DE LA NATURALEZA |GENÉTICA
o TAD represivos) y dentro de los cuales pueden ocurrir
interacciones regulatorias en bucle99,100. CTCF se considera un
factor esencial para la formación de TAD y, por lo tanto, el origen
de CTCF en Bilateria podría estar relacionado con una
compartimentación estructural del genoma específica de
Bilateria. Por el contrario, las proteínas estructurales alternativas
podrían estar contribuyendo a la formación de TAD o estructuras
similares enN.vectensisy metazoos de ramificación temprana. Por
lo tanto, descifrar y comparar las arquitecturas del genoma 3D de
animales no bilaterales será clave para resolver el vínculo
evolutivo, si lo hay, entre el origen de los metazoos y la aparición
de mecanismos específicos para la compartimentación y el
plegamiento del genoma.
Genomas reguladores de holozoos unicelulares.Una vez que se
observaron las características reguladoras genómicas de los
bilaterales en animales no bilaterales, la pregunta obvia era si
esto podría extenderse aún más a los linajes premetazoos. el
filasterianoC. owczarzakies un candidato ideal para investigar
esto, dado que tiene un patrón bien descrito de diferenciación
celular regulada temporalmente y que tiene el repertorio más
rico de TF similares a metazoos (ver arriba) entre los parientes
unicelulares de los animales. Análisis de laC. owczarzakiEl
genoma regulador mostró que los tipos de células diferenciadas
temporalmente enC. owczarzakise asocian con cambios enestados
de la cromatinay también con miles de dinámicas cis-elementos
reguladores (según lo definido por el perfil de cromatina
accesible)70. Estascis-Los elementos reguladores son en su
mayoría próximos al sitio de inicio de la transcripción (en
regiones promotoras y primeros intrones). Son pequeños e,
incluso cuando son distales, carecen de cualquiera de las
características de la cromatina asociadas con los potenciadores
animales. Por lo tanto, estos resultados sugieren que los
elementos potenciadores distales podrían ser una innovación
animal. Ahora se requieren estudios similares en esponjas,
ctenóforos y otros holozoos unicelulares para definir con
precisión cuándo ocurrió esta innovación.
Otro hallazgo importante es la ausencia de marcas
represivas como la trimetilación de la histona H3 lisina 9
(H3K9me3; que marca la heterocromatina constitutiva) y
H3K27me3 (que marca los potenciadores y promotores del
desarrollo inducibles) enC. owczarzaki70. Aunque quedan por
explorar en los no bilaterales, estas marcas son comunes en
los bilaterales. Por el contrario, las firmas de cromatina del
promotor activo (como H3K4me3 y H3K27ac) que se
encuentran enC. owczarzakison similares a los observados
enN.vectensis, bilaterales y también otros eucariotas.
Aunque no identificadoC. owczarzaki- podrían existir marcas
represivas específicas, estos resultados sugieren que los
estados epigenéticos represivos podrían ser una condición
previa importante de la multicelularidad animal, ya que
restringirían progresivamente el potencial de diferenciación
y mantendrían el estado celular diferenciado al 'bloquear'
regiones genómicas o genes específicos.
En resumen, una gran innovación en la transición a la
multicelularidad animal fue la aparición de mecanismos (señales
inductivas y regulación del genoma) que permitieron el
despliegue espaciotemporal de baterías de genes efectores,
muchos de los cuales ya existían en el ancestro unicelular. La
naturaleza específica de estos mecanismos aún no se ha resuelto
por completo, pero los candidatos probables
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REVISIONES
incluyen el desacoplamiento de la diferenciación celular de las
señales ambientales, la expansión de las capacidades
reguladoras de TF, la aparición de un léxico regulador
combinatorio mediado por elementos potenciadores distales, la
evolución de estados represivos de cromatina y la evolución de
una arquitectura cromosómica organizada jerárquicamente.
Urmetazoa: ¿un mosaico de tipos de células
premetazoan? Los datos generados en los últimos años nos
han permitido reconstruir con cierto detalle la naturaleza del
ancestro unicelular de los animales. Con base en esto, ahora
podemos revisar la cuestión de cómo evolucionó este antepasado
hasta convertirse en el primer animal. Una de las teorías
evolutivas más antiguas y perdurables sobre el origen de los
animales es la teoría Gastrea de Ernst Haeckel.101. Haeckel
propuso que el primer paso en la evolución de la multicelularidad
animal era una bola hueca de células flageladas idénticas, a la
que llamó blastea. Con algunas adaptaciones modernas, como la
teoría de la 'coanoblastea' (que enfatiza el parecido de la blastea
de Haeckel con una colonia de coanoflagelados)102, el modelo de
Haeckel sigue siendo la explicación más aceptada del surgimiento
de la multicelularidad animal103–105. Una suposición importante
del modelo de Gastrea es que la diferenciación celular apareció
después del origen de la multicelularidad y, por lo tanto, que
hubo un único tipo de célula fundadora en los animales (una
célula similar a un coanoflagelado, según muchos autores).
Algunas de estas interpretaciones surgen de la posible
homología entre los coanocitos de esponja y los coanoflagelados.
106 , mientras que otros simplemente asumen que la ontogenia
recapitula la filogenia103; es decir, que las sucesivas etapas de
desarrollo en una ontogenia animal se parecen a la historia
evolutiva de esa especie en particular (por ejemplo, las primeras
etapas se parecerían al ancestro urmetazoo).
Los descubrimientos recientes revisados aquí proporcionan
evidencia de un posible escenario alternativo. Primero, muchos genes
que son esenciales para la multicelularidad animal se originaron en un
contexto unicelular. En segundo lugar, varios parientes animales
unicelulares cercanos tienen ciclos de vida complejos que incluyen
diferentes tipos de células y comportamientos multicelulares
regulados temporalmente.37,56,57. Además, la diferenciación de tipos de
células regulada temporalmente de parientes animales está asociada
con perfiles transcripcionales específicos.37,38,57que son compatibles
con los estados cambiantes de la cromatina70y una amplia
remodelación de los estados de señalización, como las redes de
fosfoseñalización59. Todos estos hallazgos indican que los estados
celulares de los premetazoos son el resultado de procesos de
diferenciación genuinos que implican cambios en la morfología, la
motilidad, etc., en lugar de ser simplemente ejemplos de plasticidad
fenotípica temporal o estados metabólicos cambiantes. También es
importante enfatizar que estas transiciones celulares reguladas
temporalmente en holozoos unicelulares son direccionales (es decir,
no todos los tipos de células pueden dar lugar a todos los tipos de
células) y que solo tipos de células específicos son proliferativos (por
ejemplo, solo la etapa filopodial enC. owczarzaki). Finalmente, hay
evidencia de que ocurrieron cambios importantes en la regulación del
genoma en la raíz de Metazoa, lo que plantea la posibilidad de una
mayor expansión y elaboración de la capacidad reguladora.
Con base en la evidencia obtenida en los últimos años,
podemos proponer una hipótesis para explicar el origen de
Metazoa que tiene sus raíces en la hipótesis Synzoospore
PUBLICACIÓN EN LÍNEA AVANZADA |11
REVISIONES

a B Ambiental C
señales

Ambiental
señales
Nuevo tipo de célula

B B A A j B A tu
A
célula-célula

Proto-ontogenia
señalización
C A A

ontogenia
C Unicelular
ciclo vital
célula-célula
señalización
B A C
B

A
Célula fundadora o cigoto Célula fundadora o cigoto

Direccionalidad de
Etapa proliferativa Señalización célula-célula
transiciones de tipo celular

simétrica y
Etapa de desarrollo
división celular asimétrica

Figura 5 |Un modelo del origen de la multicelularidad: una transición de la diferenciación celular temporal a la espaciotemporal. a|El
complejo ciclo de vida del ancestro unicelular de los animales. Un tipo de célula (etiquetado como 'A') tenía capacidad proliferativa, y tanto esta
proliferación como las transiciones de tipo de célula direccional estaban controladas por estímulos ambientales.B|Los tipos de células regulados
temporalmente preexistentes se integraron en una protoontogenia, en la que las polaridades de diferenciación celular (por ejemplo, A se
diferencia en B, B en C, etc.) eran las mismas, y un tipo de célula (en este caso A ) fue proliferativo y dio origen a todos los demás. Las señales
ambientales controlan la transdiferenciación del tipo de célula terminal (A, B y C).C|En una etapa posterior, una ontogenia celular cerrada
controlada por señalización endógena célula-célula generó tipos celulares establemente diferenciados, cuyo destino celular se mantiene por
mecanismos de memoria celular y, por tanto, no existió transdiferenciación o transdiferenciación muy limitada. Algunos tipos de células (U)
conservaron la capacidad de proliferar y diferenciarse en otros tipos de células (flechas negras discontinuas), pero solo en condiciones reguladas
endógenamente. Evolucionaron progresivamente nuevos tipos de células (J).

que fue propuesto originalmente por Zakhvatkin en 1949
(REFERENCIA 11)y más tarde fue desarrollado por Mikhailov et al.12.
En este escenario, Metazoa surgió de un protista ancestral con un
ciclo de vida complejo que involucraba múltiples estados
celulares regulados temporalmente(HIGO. 5a). Este ciclo de vida
dependía de estímulos ambientales y probablemente comprendía
una o más etapas de vida multicelulares (clonal y/o agregativa) y
reproducción sexual, como se observa en algunos holozoos
unicelulares existentes. Estos tipos de células reguladas
temporalmente se integrarían espacialmente en los primeros
metazoos(HIGO. 5b), concomitante con la evolución de mecanismos
adicionales para la regulación génica compleja. Es probable que
la innovación en las vías de señalización, la expansión del
repertorio de TF y la evolución de nuevos mecanismos
reguladores del genoma hayan sido clave para proporcionar un
control adicional sobre la integración espacial de los módulos de
genes específicos del tipo de célula preexistentes.
La coexistencia inicial de diversos tipos de células en
Urmetazoa se asoció con programas morfogenéticos limitados
(por ejemplo, estratificación simple por expresión diferencial de
moléculas de adhesión o la creación de espacios internos para la
difusión de nutrientes) y, probablemente, destinos celulares
lábiles; dicha organización multicelular se observa en esponjas
existentes, en las que existen altas tasas de transdiferenciación
celular107(HIGO. 5b). Además, estas células probablemente se
mantuvieron juntas dentro de una MEC que fue producida por
uno o más de estos tipos de células. En esta protoontogenia
inicial, la diferenciación del tipo celular
las polaridades eran probablemente similares a las del
ancestro unicelular (es decir, no todos los tipos de células
serían proliferativos y no todas las transiciones de tipos de
células serían posibles), y existía una memoria celular
limitada. El tamaño del organismo y el número total de
células podrían controlarse mediante mecanismos de
proliferación celular preexistentes que habían sido
cooptados, como los mediados por MYC, p53 o la vía Hippo.
Progresivamente, la diferenciación celular se independizaría de los
estímulos ambientales y, en cambio, la identidad celular podría
establecerse y mantenerse mediante programas reguladores del
desarrollo iniciados por vías de comunicación célula-célula que
evolucionaron en los linajes de tallo animal.(HIGO. 5c). Estas trayectorias
celulares ontogenéticas cerradas procederían a través de estados
celulares indiferenciados, y los mecanismos epigenómicos de la
memoria celular serían esenciales para mantener destinos celulares
diferenciados, mientras que algunos tipos de células podrían conservar
un amplio potencial celular.(HIGO. 5c). Es probable que el acoplamiento
de estas trayectorias de diferenciación ontogenética con la
morfogénesis (por ejemplo, durante la gastrulación y la especificación
del mesodermo en algunos bilaterales) condujera a la aparición de los
primeros planes corporales y programas de desarrollo animal.108.
Nuevos tipos de células evolucionarían continuamente en los primeros
linajes animales.(HIGO. 5c), al menos en parte por un proceso de
subfuncionalización más innovaciones que generaron tipos de células
hermanas durante la evolución60,109. Esta innovación de tipo celular fue
concomitante con la evolución de nuevos módulos genéticos y TF.110,

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 REVISIONES

y con la cooptación de módulos habitualmente desplegados
en otros tipos de células (a través del reclutamiento de su
red reguladora).
En resumen, postulamos que los resultados recientes de
holozoos unicelulares son consistentes con la diferenciación
celular regulada existente antes del advenimiento de la
multicelularidad animal. Por lo tanto, los primeros animales
probablemente evolucionaron a partir de un ancestro unicelular
que tenía un ciclo de vida complejo, a través de una transición de
diferenciación de tipo celular regulada temporalmente a regulada
espaciotemporalmente.12. Esta transición implicó la cooptación de
múltiples módulos de genes ancestrales, así como la evolución de
nuevas familias de genes y mecanismos reguladores del genoma.
Conclusiones y perspectivas de futuro
En los últimos años, el descubrimiento y la ubicación
filogenética de nuevos parientes unicelulares de animales, y
el estudio de su contenido genómico y biología celular, han
proporcionado información importante sobre la naturaleza
del ancestro unicelular de Metazoa. Sin embargo, aún
quedan preguntas vitales por responder, y los nuevos
enfoques metodológicos pueden ayudar a abordarlas.
El desarrollo de herramientas para el suministro de ácidos
nucleicos (como la electroporación, la transfección liposomal, los
vectores virales y el bombardeo de partículas) y la edición del
genoma en holozoos unicelulares será un avance crucial si
queremos comprender la función de los genes relacionados con
la multicelularidad en un contexto unicelular. Un primer paso en
esa dirección ha sido el desarrollo de pantallas genéticas
avanzadas en coanoflagelados.54, que identificó un gen crucial
para la formación de colonias ens. rosetta, y el desarrollo de
herramientas de transformación en las ictiosporasC.
fragrantissima56.Los futuros enfoques de perturbaciones
genéticas dirigidas junto con pantallas fenotípicas sistemáticas
(morfológicas y conductuales, pero también moleculares, como la
unión a proteínas de ADN o el perfil de expresión génica)
ayudarán a dilucidar la función de genes candidatos específicos.
Más información sobre el genoma regulador de las especies
de holozoos unicelulares y metazoos de ramificación temprana
será clave para identificar los orígenes evolutivos de los
mecanismos que son responsables de la diferenciación celular y
la memoria celular. De particular interés será el estudio de los
estados represivos de la cromatina y el análisis de los elementos
potenciadores. Además, el estudio sistemático y comparativo de
la arquitectura del genoma de estos linajes (mediante captura de
conformación cromosómica (3C)
técnicas) pueden ayudar a determinar cuándo evolucionó por
primera vez la regulación distal a través de bucles de cromatina y
la compartimentación jerárquica del genoma. Con la mejora
constante de las técnicas de perfilado de cromatina y las
herramientas analíticas, prevemos que estos problemas se
aborden en un futuro no muy lejano.
El desarrollo de técnicas de perfilado epigenómico de una
sola célula superará los problemas de los enfoques basados en
poblaciones que requieren poblaciones de células homogéneas y
sincronizadas. Estos enfoques también proporcionarán una
comprensión más refinada de la regulación epigenómica y su
vínculo con la expresión génica en holozoos.111,112. Será más difícil
descifrar redes reguladoras específicas de TF y redes de
interacción proteína-proteína a través de técnicas de
inmunoprecipitación directa debido a la fuerte limitación
impuesta por el desarrollo de anticuerpos en organismos no
modelo. Varias alternativas pueden ayudar a eludir esta
limitación, como el perfilado de cromatina abierta junto conin
vitroDeterminación de preferencia de unión de TF70,113, inferencia
de redes de coexpresión a través de RNA-seq de una sola célula y,
si se dispone de manipulación genética, etiquetado de proteínas
seguido de inmunoprecipitación y eliminación de genes seguida
de perfiles de expresión. Finalmente, la caracterización
sistemática e imparcial de los primeros tipos de células de
metazoos a través de la transcriptómica unicelular de alto
rendimiento.112puede proporcionar los primeros atisbos de la
complejidad del tipo de célula multicelular temprana y los
principios reguladores que la organizan, incluidos los reguladores
maestros de TF y los módulos de genes coexpresados.
Finalmente, es importante reconocer que nuestro
conocimiento actual de los linajes de premetazoos se limita a
unas pocas especies que por casualidad se convirtieron en
sistemas modelo candidatos. Sin embargo, los estudios
ambientales han revelado que existen otros linajes que están
estrechamente relacionados con los animales y que estos linajes
prosperan en ambientes marinos y de agua dulce.33. Dado que
estos linajes podrían proporcionar información adicional sobre la
cuestión de los orígenes de los animales, deben continuar los
esfuerzos para caracterizar y aislar nuevas especies de holozoos.
En general, más de una década de intensa investigación en
parientes animales unicelulares no solo ha arrojado nuevos e
importantes conocimientos sobre la cuestión de los orígenes animales,
sino que también ha abierto nuevas vías de investigación. Esperamos
que estos nuevos enfoques nos ayuden a reconstruir aún más el
camino evolutivo que condujo desde los humildes comienzos de los
protistas hasta la complejidad de la vida animal.

1. Hyman, LHLos invertebrados: protozoos a través de
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Las referencias 5 a 9 informan sobre la secuenciación del genoma
y el análisis de los primeros linajes de animales (Cnidaria,
Placozoa, Ctenophora y Porifera). Estos estudios revelan la
existencia de un extenso conjunto de herramientas genéticas que
comparten todos los animales y que está involucrado en la
señalización, la adhesión y el control transcripcional.
10Leininger, S.et al.La expresión génica del desarrollo
proporciona pistas sobre las relaciones entre los planes
corporales de las esponjas y los eumetazoos.Nat. común5,
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diferenciación celular temporal a la espacial.bioensayos31,
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brindan una amplia perspectiva histórica sobre las
hipótesis sobre los orígenes animales y, en particular,
respaldan y amplían aún más la hipótesis original de
Synzoospore de Zakhvatkin.
13James-Clark, H. Nota sobre elInfusoria flagellatay el
Spongiae ciliatae.Soy. J. Ciencia.1, 113–114 (1866).
14Saville-Kent, W.Un manual de los infusorios, que incluye
una descripción de todos los protozoos flagelados,
ciliados y tentaculíferos conocidos, británicos y
extranjeros, y un relato de la organización y afinidades
de las esponjasvol. 1–3 (David Bogué, 1880).
15.Mah, JL, Christensen-Dalsgaard, KK & Leys, SP
Choanoflagellate and choanocyte collar-flagelar
systems and the supuesto of homology.Evol. desarrollo
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RESEÑAS DE LA NATURALEZA |GENÉTICA PUBLICACIÓN EN LÍNEA AVANZADA |13

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REVISIONES
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19Torruella, G.et al.La filogenómica revela la evolución convergente
de estilos de vida en parientes cercanos de animales y
hongos.actual Biol.25, 2404–2410 (2015). Este es el estudio
filogenómico más completo sobre el clado de holozoos
publicado hasta la fecha, tanto en términos de muestreo
de taxones como en la cantidad de datos generados.
Proporciona un fuerte apoyo para el escenario de tres
linajes unicelulares independientes cerca de Metazoa.
20Lang, BF, O'Kelly, C., Nerad, T., Gray, MW y Burger, G. Los
parientes unicelulares más cercanos de los animales.
actual Biol.12, 1773–1778 (2002).
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27Hertel, LA, Bayne, CJ & Loker, ES El simbionte Capsaspora
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29Owczarzak, A., Stibbs, HH & Bayne, CJ La destrucción
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34.Marshall, WL & Berbee, ML Enfrentando lo desconocido: culturas
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invertebrados representan un clado no descrito dentro del
linaje unicelular Opisthokont Ichthyosporea
(Mesomycetozoea).protista162, 33–57 (2011).
35.Marshall, WL, Celio, G., McLaughlin, DJ y Berbee, ML
Múltiples aislamientos de una ictiospora móvil y
cultivable (Mesomycetozoa,
opistokonta),Creolimax fragrantissimanorte. gen., n.
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protista 159, 415–433 (2008).
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brevicollisy el origen de los metazoos. Naturaleza
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Este documento representa la base de los enfoques
de genómica comparativa para animales
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orígenes. Reporta la secuenciación del primer genoma de una
especie de holozoo unicelular: el coanoflageladoM. brevicollis.
Es el primer estudio que muestra ampliamente que muchos
genes que antes se consideraban específicos de los animales y
estrechamente relacionados con la multicelularidad
evolucionaron en
un contexto unicelular.
37.Fairclough, SRet al.Evolución del genoma de premetazoos y
regulación de la diferenciación celular en el
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38.de Mendoza, A., Suga, H., Permanyer, J., Irimia, M. & Ruiz-Trillo, I.
Regulación transcripcional compleja y evolución
independiente de rasgos similares a hongos en un pariente
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compleja prehistoria unicelular de animales.Nat.
común4, 2325 (2013).
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y 51 describen por primera vez en detalle el ciclo de
vida de una especie de coanoflagelado y la regulación
transcripcional asociada.
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desarrollo multicelular en los parientes vivos más cercanos de
los animales.eLife1, e00013 (2012).
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en el coanoflageladoSalpingoeca roseta.actual Biol.
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gen controla el desarrollo en el coanoflagelados.
rosetta.eLife3, e04070 (2014). Este es un estudio
cuidadoso que, a través de
una pantalla de genética directa proporciona la primera
evidencia directa de la función de un gen (que codifica
una lectina de tipo C) en un holozoo unicelular.
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las cadherinas.Ciencia319, 946–948 (2008).
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sobre el origen de la multicelularidad de los metazoos.
desarrollo Biol.377, 284–292 (2013). Este es el primer reporte
de la transformación genética de un holozoo unicelular.
También proporciona una descripción detallada del ciclo
de vida de una especie de ictiosporas, cuya regulación
transcripcional asociada se describe en la referencia 38.
57.Sebé-Pedrós, A.et al.Multicelularidad agregada
regulada en un pariente unicelular cercano de
Metazoa.eLife2, e01287 (2013).
Este artículo proporciona la primera descripción del
ciclo de vida de un filastereo y la regulación
transcripcional asociada, que involucra múltiples
genes que están relacionados con la multicelularidad
animal.
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biología reguladora del genoma de holozoos unicelulares
y metazoos tempranos, respectivamente. Revelan una
amplia conservación de las características epigenómicas
dentro de los linajes animales e importantes diferencias
entre los animales y sus parientes unicelulares.
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Agradecimientos
Los autores agradecen a X. Grau-Bové y D. Lara-Astiaso por los comentarios
críticos sobre el manuscrito, ya G. Torruella y A. de Mendoza por la discusión
y las ideas. ÁSPID. cuenta con el apoyo de una beca a largo plazo de la
Organización Europea de Biología Molecular (ALTF 841-2014). La
investigación de BMD cuenta con el apoyo de una subvención del Australian
Research Council. Investigación por IR-T. cuenta con el apoyo de un contrato
de la Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats (ICREA), una
subvención inicial del Consejo Europeo de Investigación (ERC-2007-
StG-206883), una subvención de consolidación del Consejo Europeo de
Investigación (ERC-2012-Co
- subvención 616960), y una subvención (BFU2014-57779-P) del
Ministerio de Economía y Competitividad (MINECO); su última
investigación está cofinanciada por el Fondo Europeo de
Desarrollo Regional (fondos FEDER). IR-T. reconoce también el
apoyo financiero de la Secretaria d'Universitats i Recerca del
Departament d'Economia i Coneixement de la Generalitat de
Catalunya (proyecto 2014SGR 619).
Declaración de intereses contrapuestos
Los autores declaran no tener conflictos de intereses.
nota del editor
Springer Nature se mantiene neutral con respecto a los reclamos
jurisdiccionales en mapas publicados y afiliaciones institucionales.
PUBLICACIÓN EN LÍNEA AVANZADA |15
Corrección
En la Figura 1a de la versión original de este artículo, a la rama Choanoflagellatea
le faltaba un círculo dividido amarillo-negro que simboliza que la multicelularidad
clonal ocurre en algunas especies de Choanoflagellatea. El símbolo se eliminó
inadvertidamente antes de la publicación y ahora se ha restablecido en el artículo
corregido. Los editores se disculpan por este error.

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