UNIDAD I

FUNDAMENTOS DE LA
BIOQUÍMICA

•Sistemas acuosos compatibles

con la vida
•Fosforilación en las reacciones
bioquímicas
•Los alumnos explicarán el papel del agua en los
sistemas biológicos en las células.
•El alumno comprenderá el papel de las reacciones
de fosforilación en la célula.
El agua es la
sustancia
más
abundante
en los
sistemas
vivos y
constituye el
70% o más
del peso de
la mayoría
de
organismos.
En el ser
humano:
 Agua extracelular
1/3 (15-16 L) y se distribuye en plasma sanguíneo y el líquido
intersticial.

Agua intracelular
2/3 partes del agua total (26-28 L) sitio de reacciones de
procesos metabólicos ejecutados por enzimas disueltas cuya
actividad depende de la presión osmótica, [H+], [iones], coloides
(proteínas, lipoproteínas, monómeros), flujo de nutrimentos para
energía y reparación de la célula, eliminación de productos de
desecho y temperatura.
Las propiedades del agua afectan la estructura y la función de
todos los constituyentes celulares.

La molécula del agua y sus productos de

ionización H+ y OH- influyen sobre la estructura,
autoensamblaje, y propiedades de los
componentes celulares incluidos proteínas,
ácidos nucleicos y lípidos.
Las interacciones no covalentes responsables de la fuerza y de
la especificidad de reconocimiento entre las biomoléculas están
influidas de por las propiedades disolventes del agua, entre las
que se incluyen su capacidad de formar enlaces de hidrógeno
entre las mismas moléculas y con los solutos.
 Todas las células contienen 4 tipos de
macromoléculas construidas a partir
de las mismas subunidades
monoméricas.
• LÍPIDOS
• CARBOHIDRATOS
• PROTEÍNAS
• ÁCIDOS NUCLEICOS: ADN Y ARN

Las macromoléculas que participan en la

matriz estructural y funcional de la vida son
estructuras grandes que se mantienen unidas
mediante enlaces covalentes.
Lípidos: ácidos grasos y glicerol
Carbohidratos:
monosacáridos
Proteínas: aminoácidos
Ácidos nucleicos: nucleótidos
 Las macromoléculas se mantienen
unidas mediante enlaces covalentes.
El enlace covalente por sí solo no
puede describir la complejidad de la
estructura molecular en biología. Las
interacciones mucho más débiles
son responsables de la mayor parte
de la arquitectura celular.
 Los enlaces covalentes más importantes en
biología (como C — C y C — H) tienen energías
de enlace que oscilan entre 300 y 400 kJ/mol.
Los enlaces no covalentes relevantes son
débiles, esto permite romper y formarse
continuamente en la interacción molecular
dinámica que es la vida. Esta interacción
depende de los rápidos intercambios de parejas
moleculares, que podrían no producirse si las
fuerzas intermoleculares fueran tan fuertes que
bloquearán las moléculas en una conformación
y en una localización.
 ¿Qué es lo
que hace
que las
interacciones
no
covalentes
sean tan
importantes
en Biología y
en
Bioquímica?
 Las interacciones no covalentes,
también denominadas fuerzas no
covalentes o enlaces no covalentes,
que se producen entre iones,
moléculas y partes de las moléculas
son responsables de la mayor parte
de la arquitectura celular.
 Hydrogen Bonds. These interactions are
fundamentally electrostatic interactions.

The hydrogen atom in a

hydrogen bond
is partially shared by two
electronegative atoms such as
nitrogen or oxygen. The
hydrogen-bond donor is the
group that includes both the
atom to which the hydrogen
atom is more tightly linked and
the hydrogen atom
itself, whereas the hydrogen-
bond acceptor is the atom less
tightly linked to the hydrogen
atom
Los puentes de hidrógeno son enlaces débiles (en
relación a los enlaces covalentes) tienen energías entre
4 a 20 kJ/mol. La longitud de enlace (es más larga que
los enlaces covalentes) es de 1.5 a 2.6 Å (medidas
desde el átomo de hidrogeno) separando los átomos de
2.4 a 3.5 Å. El átomo donador del H, el átomo de H y el
átomo aceptor del enlace H están en el mismo plano.

Lehninger. Principios de Bioquímica. DL. Nelson, MM. Cox. 5a. Edición. Ed.
Omega.
Lehninger. Principios de Bioquímica. DL. Nelson, MM. Cox. 5a. Edición.
Ed. Omega.
Lehninger. Principios de Bioquímica. DL. Nelson, MM. Cox. 5a. Edición.
Ed. Omega.
 PAPEL DEL AGUA EN LOS
PROCESOS BIOLÓGICOS
Desplazamiento de
moléculas
Procesos físicos y químicos de la vida:
Encuentro entre las
moléculas

Entorno fluido movilidad molecular

 El agua es un
disolvente en el
rango de
temperaturas y
presiones mas
compatible con las
formas de vida.
 El agua es el disolvente en el que tienen lugar la mayoría de las
reacciones bioquímicas, y sus propiedades son esenciales para la
formación de estructuras macromoleculares y el progreso de las
reacciones químicas. Dos propiedades del agua son especialmente
relevantes:
El agua
(H2O)
monóxido
de
dihidrógeno
PM de
18.016 g
 El átomo electronegativo al que el átomo
de hidrógeno está unido covalentemente
aleja la densidad de los electrones del
átomo de hidrógeno desarrollando una
carga positiva parcial (+). El átomo de
hidrógeno puede interactuar con un
átomo que tiene una carga negativa
parcial (−) a través de una interacción
electrostática.

1. El agua es una
molécula polar. La 2. El agua es muy
molécula de agua no cohesiva. Las moléculas
es lineal, la de agua interactúan
distribución de la fuertemente con una
carga es asimétrica. otra a través de enlaces
de hidrógeno.
 La geometría de la molécula
de agua deriva de los
orbitales electrónicos externos
del átomo de oxígeno que
son similares a los orbitales de
enlace sp3 que forman un
tetrahedro con un átomo de
hidrógeno en dos vértices y
electrones sin compartir en los
otros dos.

Lehninger. Principios de Bioquímica. DL. Nelson, MM. Cox. 5a. Edición.

Ed. Omega.
https://agua.org.mx/que-es/
 El momento dipolar
permanente de la
molécula de agua tiene
implicaciones relevantes:

La geometría que
adopta la molécula de
agua permite establecer
hasta cuatro
puentes de hidrógeno
con otras tantas
moléculas de agua (3.6
en promedio en estado
líquido) favoreciendo una
fuerte atracción entre las
moléculas de agua.
La polaridad de la molécula
de agua permite la
formación de hasta 4 P de H
con moleculas
circundantes,lo que
conduce a una fuerte
atracción entre las
moléculas de agua
promoviendo la elevada
cohesión, elevada tensión
superficial. Elevado punto de
fusión, ebullición y
capacidad calorífica (4.2
J/g/K).
 Las moléculas de agua
interactúan fuertemente por
P de H. La energía para
romper un P de H es de 23
kJ/mol

Los puentes de
hidrógeno entre las
moléculas de agua
proporcionan las
fuerzas de cohesión
que hacen que el
agua sea líquida.

Biochemistry. Berg. 7th. Edition. W. H. Freeman and Company. NY.

USA. 2012.
 En el agua líquida,
las moléculas de
agua se unen por
P de H con tiempo
de vida media es
de 1 a 20 ps (10-12
s), se rompen y se
forman enlaces
con diferentes
moléculas en
“agrupaciones
fluctuantes”
(flickering
clusters).

Lehninger. Principios de Bioquímica. DL. Nelson, MM. Cox. 5a. Edición.

Ed. Omega.
 A la temperatura y presión
ambientales, el agua se mantiene
mayoritariamente líquida. El agua
alcanza su máxima densidad (1.00
g/mL) a 3.98 °C, en su forma sólida
(hielo), la densidad es menor
(0.917 g/cm3), razón por la que el
hielo flota.

Lehninger. Principios de Bioquímica. DL. Nelson, MM. Cox. 5a. Edición.

Ed. Omega.
Lehninger. Principios de Bioquímica. DL. Nelson, MM. Cox. 5a. Edición.
Ed. Omega.
 Conductividad
térmica
La conductividad es
la capacidad de
conducir o transmitir
calor, electricidad o
sonido. El agua influye
en la
termorregulación
corporal, ya que se
iguala con rapidez la
temperatura del
medio interno.
 El agua es altamente cohesiva

Tensión superficial
de un líquido es la cantidad de energía necesaria para
aumentar su superficie por unidad de área. La tensión
superficial y las interacciones entre los líquidos y las
superficies sólidas que entran en contacto con ellos, da
lugar a la capilaridad como resultado hay elevación o
depresión de la superficie de un líquido en la zona de
contacto con un sólido.
La naturaleza
polar del
agua es
responsable
de la
constante
dieléctrica
de 80.
 Calor específico del agua
Se requiere mucha energía para elevar su
temperatura, el agua en un buen aislante
térmico, una propiedad permite al citoplasma
acuoso servir de protección frente a cambios
bruscos de temperatura actuando como
termorregulador; amortigua y regula los cambios
térmicos ambientales y corporales.

Por sus altos valores de calor específico (1 cal/g

°C) y calor de vaporización (539.6 cal/g a
temperatura de ebullición) almacena y absorbe
gran cantidad de calor que tarda en liberar.
 La cohesión entre las moléculas de agua
por puentes de hidrógeno mantienen a
las moléculas fuertemente unidas,
formando una estructura compacta que la
convierte en un líquido que no puede
comprimirse.
El agua es el líquido que más sustancias disuelve por su
carácter polar mediante puentes de hidrógeno
interacciona con moléculas iónicas con cargas
definidas y moléculas polares (carbohidratos, alcoholes,
aldehídos, cetonas).

Una biología
basada en
agua implica
que la gran
mayoría de los
componentes
celulares
deben ser
hidrosolubles.
Interacción de solutos con el agua
 Debido a la
polaridad
del água
puede
disolver una
gran
cantidad de
solutos.

Lehninger. Principios de Bioquímica. DL. Nelson, MM. Cox. 5a. Edición.

Ed. Omega.
El agua interacciona con compuestos polares o cargados

Lehninger. Principios de Bioquímica. DL. Nelson, MM. Cox. 5a. Edición.

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Lehninger. Principios de Bioquímica. DL. Nelson, MM. Cox. 5a. Edición.
Ed. Omega.
 Las moléculas
en solución
acuosa
interactúan
con moléculas
de agua a
través de la
formación de
puentes de H
y por
interacciones
iónicas.

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 Moléculas anfipáticas en solución acuosa

*ácidos grasos y detergentes. *pueden formar monocapas, micelas,

vesículas bicapa, membranas
Lehninger. Principios de Bioquímica. DL.
Nelson, MM. Cox. 5a. Edición. Ed. Omega.
 PROPIEDAD FUNCIÓN BIOLÓGICA DEL AGUA

• Alta cohesión entre moléculas: puntos de fusión y ebullición

muy altos
Mantiene líquida el agua en las condiciones de temperatura
de nuestro planeta.

•Gran capacidad calorífica y gran conductividad térmica.

Facilitan la regulación térmica de los organismos.
Reducen la amplitud de los cambios de temperatura en zonas
próximas al agua.
Permiten que los océanos actúen como reguladores térmicos
(corrientes oceánicas).

•Gran capacidad de hidratación (rodear a otras moléculas,

aproximándose mucho a sus átomos).
La hidratación de las macromoléculas biológicas determina
su estructura y su función.
Permiten transiciones de fase sol-gel que hacen posibles
muchos procesos metabólicos.
•Elevada tensión superficial, cohesión y adhesión: Hacen
posible el ascenso de la savia a lo largo de los tallos de las
plantas.

Ionización del agua: facilita el intercambio de protones entre

moléculas. Permite una gran variedad de interacciones iónicas
en los seres vivos.