UNIVERSIDAD POPULAR AUTÓNOMA DEL ESTADO DE PUEBLA

Universidad Popular Autónoma del Estado de Puebla (UPAEP)

MODALIDAD:Presencial

DEPARTAMENTO DE MATEMÁTICAS

CÁLCULO DE VARIAS VARIABLES 01-130-02

Afinidad de la glucoquinasa ante diferentes sustratos

27370007 Brandon Altamirano Burián Ingeniería en Biotecnología

26320005 Horacio López Crisanto Ingeniería Aeroespacial

26320075 José Julián Ferrer Téuatl Ingeniería Aeroespacial

27370266 Elit Noé Peñaloza Martínez Ingeniería en Biotecnología

Profesor: Julio Alberto Villavicencio Díaz

Periodo: Otoño 2022

Fecha de Entrega: 01 de Diciembre de 2022

Introducción
El cálculo multivariable es una rama de la matemática que permite resolver diversos
problemas donde el cambio de las variables se puede modelar en un continuo numérico para
determinar, a partir de ello, la variación de estos elementos en un instante o intervalo
específico (UNAM, 2016), es decir se define como la matemática del cambio, ya que se basa
en estudiar los fenómenos que están en constante cambio con respecto a las variables y el
espacio.
Ejemplos cotidianos de la aplicación del cálculo:
- Determinar el momento en que se da una tendencia al alza o a la baja del mercado a
partir de los datos del índice bursátil.
- Determinar las velocidades de diversos fenómenos mediante el estudio de sus
variables.
- El comportamiento que puede mostrar a largo plazo la concentración de un proceso
biológico.

Objetivos del proyecto

Por medio de este proyecto se buscará aplicar los conocimientos aprendidos en clase sobre el
cálculo multivariable, haciendo énfasis en la modelación de una problemática utilizando el
cálculo vectorial para encontrar la Vmax de 2 sustratos (galactosa y glucosa) en cierto punto
de una reacción, siguiendo los principios de la cinética enzimática.
- Como primera instancia se aplicará la parametrización de funciones, es decir, traducir
los datos obtenidos experimentalmente a una función vectorial con parámetros.
- Aplicar los temas vistos para obtener la velocidad y aceleración de la enzima con
ambos sustratos.
- Usando la longitud de curva, conocer la concentración de sustrato a la que la enzima
alcanza su saturación, aplicándolo a la Glucosa y Galactosa.
- Calcular la curvatura de cada función para poder comparar el alcance de su saturación
- Mediante derivadas parciales comprobar la [S] y Saturación α a base de la ecuación
de Michaelis -Menten
Conceptos clave
- Cinética enzimática: Rama de la cinética que estudia los cambios en la concentración
de sustrato al interactuar con un agente catalizador, con respecto al tiempo.
- Enzima: Catalizador biológico que actúan acelerando o desacelerando reacciones
químico- biológicas.
- Sustrato: Medio con el que interactúa una enzima para la formación de productos.
- Vmax: Velocidad máxima de reacción que se alcanza cuando todos los sitios activos
de la enzima están saturados.
- Km: Constante de Michaelis - Menten, se define como una constante de disociación
aparente, es decir, como un valor para el cual el sistema se encuentra a mitad de
saturación con respecto al sustrato .

Problemática Planteada

Actualmente, uno de los principales retos para las ciencias biológicas médicas, además de la
producción de fármacos capaces de mejorar notablemente la calidad y esperanza de vida,
también es entender el funcionamiento metabólico y su modificación, entendiendo como
actúan y se regulan diversas enzimas, con base en ello se ha estudiado mucho el campo de la
bioquímica, farmacocinética y farmacodinámica, las cuales basan sus principios en la
asimilación metabólica de ciertos compuestos y también la modificación enzimática para
mejorar el mismo.

En este proyecto se relacionarán los principios de aplicación de la cinética enzimática con la

bioquímica, teniendo como finalidad el cálculo de velocidades instantáneas para determinar
con qué concentración y naturaleza del sustrato , la enzima glucoquinasa, puede trabajar con
mayor eficiencia.

La importancia que tiene lo anterior radica en la posibilidad de estudiar, sobre el grado de

afinidad que esta enzima presenta por su sustrato, ya que su papel es fundamental para el
metabolismo de los carbohidratos y que podría ser de interés para enfermedades relacionadas
con el metabolismo de los mismos, al igual que la modificación de vías metabólicas.
Cinética enzimática:
La cinética enzimática se define como la rama químico-biológica que estudia los cambios de
concentración del sustrato al interactuar con una enzima en un determinado tiempo, es decir,
también mide ese equilibrio entre la formación de productos y la disponibilidad de sustrato y
enzima.

Esta basa su principio en constantes de equilibrio expresadas por la ecuación de Michaelis -

Menten, en donde se relacionan los conceptos antes mencionados como son Km, Vmax, Vo
(velocidad inicial) y la concentración del sustrato [S].

𝑉𝑚𝑎𝑥* [𝑆]
Vmax= 𝐾𝑚+ [𝑆]

Representación gráfica.

Figura 1: Ejemplificación gráfica de la ecuación de Michaelis-Menten.

Enzimas.

Las enzimas son catalogadas como catalizadores biológicos de reacciones metabólicas, estas
son sumamente específicas a sus sustratos con los cuales interactúan en un modelo de llave
cerradura (cada enzima interactúa con su propio sustrato en un complejo específico).

Las enzimas cuentan con un sitio activo sumamente específico cuya función principal es el
acercamiento y orientación de los sustratos para que acontezca una reacción química, por lo
que termodinámicamente hablando no alteran la reacción (∆𝐺) sino que más bien reducen la
energía de activación de la reacción.

Glucoquinasa

La glucoquinasa es una enzima altamente específica que se encuentra principalmente en

tejidos con una enorme disponibilidad a la glucosa como el hígado cuya actividad regula el
ritmo de acumulación de glucógeno y la producción de glucosa hepática, así mismo también
en células β-pancreáticas, su principal función es la fosforilación de la glucosa como su
sustrato principal en glucosa 6-F, este cambio de conformación impide que la misma salga de
la célula, debido a su importancia en la homeostasis de glucosa esta enzima es objeto de
estudio para el desarrollo de terapias antidiabéticas (García, 2012).

Figura 2: Glucoquinasa
Base de datos obtenidos

Tabla 1. Datos obtenidos de la experimentación (Glucosa y Galactosa)

Figura 3. Comportamiento de la Galactosa y Glucosa en contacto

La anterior gráfica representa las comparaciones en las velocidades de reacción que presenta
la enzima glucoquinasa con la glucosa (azul) y la galactosa (gris). Matemáticamente, se ha
corroborado que la enzima glucoquinasa presenta una mayor afinidad y por ende una mayor
velocidad de reacción al interactuar con la glucosa, puesto que la función vectorial para la
determinación de su velocidad de reacción es mayor.

Lo anterior se puede corroborar si recurrimos a la bibliografía, ya que la glucoquinasa se

presenta como una enzima específica de regulación alostérica, puesto que las cargas de los
residuos de aminoácidos presentes en su sitio activo entablan interacciones casi perfectas con
la distribución ciclada (piranosa) de la glucosa, cuando se utiliza otro monosacárido como es
la galactosa, esta especificidad se pierde un poco, conllevando a una disminución en la
velocidad de reacción.

Metabólicamente lo anterior mencionado, es de suma importancia, puesto que los tiempos

entre reacciones son vitales para el correcto funcionamiento celular, ya que de reducirse la
velocidad de reacción en tejidos con un papel metabólico oxidativo, como lo es el hígado
(principal tejido con la enzima glucoquinasa) por presencia de otro monosacárido, como la
galactosa, se generaría el suficiente estrés metabólico como para producir daño o el
deslizamiento de las membranas

Planteamiento Matemático

● Parametrización

Parametrización de los vectores - Galactosa

A(1,0.077) B(300,0.818) AB(299,0.741)

𝑥 = 1 + 299 𝑡 𝑦 = 0. 077 + 0. 741 𝑡

𝑟(𝑡) = (1 + 299𝑡) 𝑖 + (0. 077 + 0. 741𝑡)𝑗

Parametrización de los vectores - Glucosa

A(1,0.008) B(300,0.977) AB(299,0.969)

𝑥 = 1 + 299 𝑡 𝑦 = 0. 008 + 0. 969 𝑡

2 2
𝑟(𝑡) = (1 + 299𝑡) 𝑖 + (0. 008 + 0. 969𝑡)𝑗

● Ecuaciones paramétricas: Velocidad y aceleración

Obtención de la velocidad y aceleración del vector (Galactosa)

Velocidad r'(t)= (299)i+(0.741)j

Aceleración r''(t)= (0)i+(0)j

Obtención de la velocidad y aceleración del vector (Glucosa)

Velocidad 𝑟'(𝑡) = (299) 𝑖 + (0. 969)𝑗

Aceleración 𝑟''(𝑡) = (0) 𝑖 + (0)𝑗

Con las velocidades de reacción se puede enfatizar su importancia para la formación del
complejo enzima sustrato en el área de la farmacocinética, con la intención de promover la
creación de fármacos dianas que respeten el principio de afinidad y especificidad enzimática
(datos interpretados al analizar el gráfico), para aumentar la eficiencia de su uso, la
aplicabilidad de ello con el cálculo multivariable radica en que el comportamiento enzimático
es descrito por vectores de movimiento Browniano.

Por otro lado en el caso de la aceleración, se obtuvo el valor de cero dado que para que exista
una aceleración de sustratos necesita un regulador alostérico o un metabolito que estimule
esta potenciación, en el caso de la glucoquinasa no cuenta con este sitio alostérico como su
isoforma la cual es la hexoquinasa, la cual se encuentra en otros tejidos.
 ● Longitud de curva

A través de esta longitud hallada logramos determinar la cantidad de sustrato necesario para
que la enzima de glucosa y galactosa alcancen su saturación, a continuación se muestra el
procedimiento:

Galactosa

300
2 2
∫ 299 + 0. 741 = 299. 009(300) − 0 = 89700. 275
0

Glucosa

300
2 2
∫ 299 + 0. 969 = 299. 0015(300) − 0 = 89700. 47
0

Como podemos observar existe una diferencia en los resultados, lo cual demuestra la
variación en la cantidad de sustrato, que aunque sea pequeña, a nivel metabólico
representaría grandes fallas en vías metabólicas, debido a que de no saturarse por completo
en un determinado tiempo algunas vías metabólicas anapleróticas terminarían por optar hacia
su activación, es decir ralentizar la vía de interés para activar una vía secundaria con mayor
gasto energético.

● Ecuaciones paramétricas:Curvatura

Galactosa

Método 1

|𝑟(𝑡)𝑥𝑟´´(𝑡)|
𝑘= 3
|𝑟´´(𝑡)|

𝑟´(𝑡) = 299𝑖 + 0. 741𝑗 + 0𝑘

𝑟´´(𝑡) = 0𝑖 + 0𝑗 + 0𝑘

2 2
|𝑟´(𝑡)| = (299) + (0. 741) = 299

𝑘=0

Método 2

𝑟(𝑡) = (1 + 299)𝑖 + (0. 077 + 0. 741𝑡)𝑗

|𝑇´(𝑡)|
𝑘= 𝑟´(𝑡)

𝑟(𝑡) 299𝑖+0.741𝑗 0.741

𝑇= |𝑟´(𝑡)|
= 299
=𝑖+ 299
𝑗

2 2
|𝑟´(𝑡)| = (299) + (0. 741) = 299

𝑇(𝑡) = 0

𝑘=0

Glucosa

Método 1

|𝑟(𝑡)𝑥𝑟´´(𝑡)|
𝑘= 3
|𝑟´´(𝑡)|

𝑟´(𝑡) = 299𝑖 + 0. 969𝑗 + 0𝑘

𝑟´´(𝑡) = 0𝑖 + 0𝑗 + 0𝑘

2 2
|𝑟´(𝑡)| = (299) + (0. 969) = 299. 0015443

𝑘=0

Método 2

𝑟(𝑡) = (1 + 299)𝑖 + (0. 077 + 0. 741𝑡)𝑗

 |𝑇´(𝑡)|
𝑘= 𝑟´(𝑡)

𝑟(𝑡) 299𝑖+0.969𝑗 0.969

𝑇= |𝑟´(𝑡)|
= 299.0015443
=𝑖+ 299.0015
𝑗

2 2
|𝑟´(𝑡)| = (299) + (0. 969) = 299. 0015

𝑇(𝑡) = 0

𝑘=0

Con este planteamiento podemos conocer qué tan pronunciada se encuentran las curvaturas
de ambas funciones, y sabiendo que:

𝑘 ≥ 0. 1 = 𝐶𝑢𝑟𝑣𝑎𝑡𝑢𝑟𝑎 𝑔𝑟𝑎𝑛𝑑𝑒 𝑦 𝑘 < 0. 1 = 𝐶𝑢𝑟𝑣𝑎𝑡𝑢𝑟𝑎 𝑝𝑒𝑞𝑢𝑒ñ𝑎

Se llega al resultado que las curvaturas tienen un valor de cero, demostrando así ser
curvaturas pequeñas, esto debido a que cuando se saturan los sitios activos de una enzima, el
comportamiento de la gráfica es constante, representando una meseta y no una curvatura,
véase Figura 3.

● Derivada parcial

En esta aplicación se puede inferir que la Km es igual a [α]/ 2, por definición al ser una
constante de disociación aparente.

𝑉𝑚𝑎𝑥
𝑣𝑜 = 𝐾𝑚+[𝑠]

α[𝑠]
0= α , Vo=0
2
+[𝑠]

0 = α[𝑠]

𝑓α = α[𝑠]

𝑓α = [𝑠]
𝑓[𝑠] = α = 1

Mediante esta derivada parcial, si suponemos que tenemos un punto de partida justo en el
momento donde se está produciendo la saturación máxima, mediante la ecuación de
Michaelis - Menten, se considera la velocidad inicial cero, debido a que en ese punto la
pendiente de la recta es 0, por ende la velocidad es 0; el objetivo es saber la velocidad
máxima, por lo que se despeja para fines de simplicidad la derivada parcial que demuestra el
grado de saturación máxima (es decir, la derivada parcial con respecto al [S]), demostrando
así su saturación por ocupamiento de sitio activo =1 en el caso de la glucosa. Otra aplicación
podría ser la derivación de la otra variable, en donde el resultado de la derivada parcial de [α
], nos indicaría la cantidad de sustrato [S] en el que se satura completamente la enzima
[S]=300.

Conclusiones

Brandon Altamirano Burián

Como hemos visto anteriormente en el documento, la glucoquinasa es una enzima de suma

importancia en la ruta glucolítica, glucogénica, gluconeogénica y de las pentosas fosfato, la
cual debido a sus características cinéticas y funcionales es un sensor de la glucosa sanguínea
en los tejidos donde ésta es expresada (Hígado y Corteza Renal), el papel que ésta juega en el
mantenimiento de la homeostasis de la glucosa es muy importante tanto que mutaciones en el
gen codificantes de la enzima glucoquinasa o cambio de afinidad por otro sustrato (galactosa)
resultan en cuadros patológicos, que abarcan desde la diabetes mellitus neonatal permanente
la cual necesita tratamiento insulínico inmediato, hasta hipoglucemia hiperinsulinémica
familiar de carácter grave, que requiere intervención médica (Hospimédica, 2011)

Los activadores alostéricos de la glucoquinasa demuestran que esta enzima puede ser un
objeto de investigación adecuado para los compuestos que actúan sobre ella, así como su
funcionalidad para el tratamiento de las diferentes enfermedades antes presentadas, es por eso
que mediante este proyecto quisimos dar a conocer cómo trabajaba la enzima en cuanto a
eficacia con galactosa, teniendo de referencia la glucosa que es el sustrato con el cual es más
afín, pero no solo demostrarlo con un gráfico, si no también usando modelos matemáticos
que nos demostraran esto de manera numérica, por lo cual con la base de datos, y la gráfica
generada por el programa Excel utilizamos ecuaciones paramétricas ya que por medio de
estas teníamos más herramientas para nuestra investigación, primero obtuvimos la
aceleración y velocidad de ambos sustratos en la enzima para conocer cual hacía que esta se
saturara antes, y determinar cuál es más eficiente en l enzima, y como se puede ver y
comprobar científicamente, la glucosa alcanzaba una mayor saturación a mayor velocidad.

Mediante la longitud de curva obtuvimos la diferente cantidad de sustrato necesaria para que
los diferentes sustratos saturaran la enzima, y pudimos determinar que la glucosa ocupa
mayor cantidad de sustrato, posterior a esto comprobamos la curvatura de la gráfica para
conocer qué tan pronunciada es esta curva, el resultado que obtuvimos fue tendiente a 0 ya
que representa una curvatura pequeña debido a que al saturarse los sitios activos de una
enzima el comportamiento de la gráfica es constante.

Por último usamos la ecuación de Michaelis Mendel junto con derivadas parciales, tomando
en cuenta que se inicia con el mismo punto de partida que es cuando la velocidad es 0, y al
ser despejada con la derivada parcial respecto a s pudimos saber cuál es el grado de
saturación máxima, conociendo así su saturación al ocupar el sitio activo, así mismo se
pueden derivar otra variable en la cual el resultado fuera α para que así se nos indicará la
cantidad de sustrato que satura completamente la enzima.

Elit Noé Peñaloza Martínez

A lo largo del anterior proyecto pudimos comprobar mediante la aplicación del cálculo
multivariable y de manera gráfica, los distintos grados de afinidad que tiene la enzima
glucoquinasa frente a los sustratos empleados (glucosa y galactosa), siendo ésta última quien
presentó mayores rangos de afinidad y esto se debe a que “la glucoquinasa es una enzima
altamente específica a diferencia de su iso-enzima hexoquinasa, por la glucosa, puesto que su
especificidad en forma tridimensional de su sitio activo y las cargas de los residuos de
aminoácidos de sus grupos funcionales, se complementan perfectamente con las cargas
parciales de los hidroxilos de la glucosa y su forma ciclada” (Feduchi, 2019).

Nosotros quisimos comprobar de manera matemática lo que dictaba la tarea, con la finalidad
de demostrarlo, además de deducir y relacionar nuestros resultados obtenidos con la
bioquímica de la enzima. Decidimos usar funciones vectoriales, ya que como sabemos, las
enzimas y sus sustratos se encuentran en constante movimiento browniano en el citoplasma
celular (en matemáticas el espacio).
Además, también enfocamos el proyecto en remarcar las diferencias de saturación y
velocidades respecto a los sustratos empleados, con eso queremos promover el estudio
farmacodinámico de medicamentos dianas en el metabolismo celular, que puedan actuar de
una manera similar a la glucosa con esta enzima, así como poder modificar el metabolismo.
Para denotar lo anterior empleamos el cálculo de la longitud de curva, curvatura e incluso una
deducción matemática de la ecuación de Michaelis - Menten.

Horacio López Crisanto

A través de de esta práctica pudimos comprobar la variación que presentan la Glucosa y la

Galactosa al contacto con un sustrato, que como se observó no representan una gran
diferencia numérica, si lo hacen a nivel metabólico, con los procedimientos llevados a cabo
nos dimos cuenta que la Glucosa se satura con mayor velocidad que la Galactosa.

Entre los nuevos términos para mí que se trataron, se encuentra la ecuación de Michaelis
Mendel con la cual se pudo comprobar el grado de saturación máxima a través de su
deducción matemática.

En adición a lo anterior, al tratarse de un área de estudio ajena a la mía, aprendí términos,

procedimientos y razones nuevas, lo que también me hizo recordar clases previas respecto a
esta área. Resulta interesante como lo comprobado mediante la práctica es aplicable al área
farmacéutica para mejorar los resultados y el tiempo de respuesta de los medicamentos en el
cuerpo humano.

José Julián Ferrer Técuatl

En base a nuestra experimentación, los datos base dieron apertura a una esquematización
matemática la cual nos permite generar una gráfica por cada sustancia analizada, y que a
través de poner en práctica nuestros conocimientos obtenidos durante el curso, llegamos a los
resultados esperados, cumpliendo satisfactoriamente los objetivos planteados inicialmente.
Referencias

García Carmen (2012) Análisis de la regulación de la glucoquinasa humana a partir del

estudio de mutaciones asociadas a hipoglucemia y diabetes monogénica. Datos recopilados
de:https://eprints.ucm.es/id/eprint/16338/

Stewart, J. (2017). Cálculo de varias variables. Trascendentes tempranas. Cengage Learning.

HospiMedica (2011) El metabolismo de glucosa por la glucoquinasa regula regeneración de

células beta. Datos recopilados de:

https://www.hospimedica.es/bio-investigaciones/articles/294737856/el-metabolismo-de-gluco

sa-por-la-glucoquinasa-regula-regeneracion-de-celulas-beta.html

Carlos H. (2022). Defectos genéticos de la glucoquinasa y alteraciones del metabolismo

hidrocarbonado. Datos recopilados de:

https://www.elsevier.es/es-revista-endocrinologia-nutricion-12-articulo-defectos-geneticos-gl

ucocinasa-alteraciones-metabolismo-hidrocarbonado-13066002#:~:text=La%20glucocinasa%

20es%20una%20enzima,limitante%20reacci%C3%B3n%20de%20la%20gluc%C3%B3lisis.

Maritza M., María D., Carlos C. (2021) MODELOS MATEMÁTICOS EN LA CINÉTICA

ENZIMATICA.Datos sustraidos de:

http://scielo.sld.cu/pdf/caz/v49n1/2223-4861-caz-49-01-115.pdf
Anexos

Anexo 1. Aplicación de sustrato a Galactosa

Anexo 2. Aplicación de sustrato a Glucosa

Anexo 3.

Anexo 4.

Anexo 5.