Genoma Humano

El 14 de abril de, 2003, el Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano (NHGRI), el
Departamento de Energía (DOE) y sus socios del Consorcio Internacional para la Secuenciación
del Genoma Humano, anunciaron la terminación exitosa del Proyecto Genoma Humano.

Genoma:

Un genoma es una colección completa de ácido desoxirribonucleico (ADN) de un organismo, o sea

un compuesto químico que contiene las instrucciones genéticas necesarias para desarrollar y dirigir
las actividades de todo organismo. Las moléculas del ADN están conformadas por dos hélices
torcidas y emparejadas. Cada hélice está formada por cuatro unidades químicas, denominadas
bases nucleótidas. Las bases son adenina (A), timina (T), guanina (G) y citosina (C). Las bases en
las hélices opuestas se emparejan específicamente; una A siempre se empareja con una T, y una
C siempre con una G.

El genoma humano contiene aproximadamente 3.000 millones de estos pares de bases, los cuales
se encuentran en los 23 pares de cromosomas dentro del núcleo de todas nuestras células. Cada
cromosoma contiene cientos de miles de genes, los cuales tienen las instrucciones para hacer
proteínas. Cada uno de los 30.000 genes estimados en el genoma humano produce un promedio
de tres proteínas.

Secuencia de un genoma:

Secuenciar significa determinar el orden exacto de los pares de bases en un segmento de ADN.
Los cromosomas humanos tienen entre 50.000.000 a 300.000.000 pares de bases. Debido a que
las bases existen en pares, y la identidad de una de las bases en el par determina el otro miembro
del par, los científicos no tienen que presentar las dos bases del par.

El principal método utilizado por el PGH para producir la versión final del código genético humano
se basa en un mapa, o en una secuencia basada en BAC, que es el acrónimo en inglés de
"cromosoma artificial bacteriano". El ADN humano es fragmentado en piezas relativamente
grandes, pero de un tamaño manejable (entre 150.000 y 200.000 pares de bases). Los fragmentos
son clonados en bacterias, las cuales almacenan y replican el ADN humano para que así pueda ser
preparado en cantidades lo suficientemente grandes como para secuenciarlo. Si se los escoge
cuidadosamente para minimizar las superposiciones, se necesita unos 20.000 clones BAC
diferentes para abarcar los 3.000 millones de pares de bases del genoma humano. A la colección
de clones BAC que contienen todo el genoma humano se la denomina una "biblioteca BAC".

En el método basado en BAC, se hace un "mapeo" de cada clon BAC para determinar el lugar de
donde proviene el ADN del genoma humano en los clones BAC. El uso de este enfoque garantiza
que los científicos puedan conocer la ubicación exacta de las letras del ADN que son secuenciadas
en cada clon y su relación espacial con el ADN humano secuenciado en otros clones BAC.

Para la secuenciación, se corta a cada clon BAC en fragmentos todavía más pequeños que tienen
una longitud de cerca de 2.000 bases. Estas piezas se denominan "subclones". En estos subclones
se lleva a cabo una "reacción en secuencia". Después, los productos de la reacción en secuencia
son introducidos en la máquina secuenciadora (secuenciador). El secuenciador genera de 500 a
800 pares de bases de A, T, C y G en cada reacción en secuencia, por lo que cada base es
secuenciada unas diez veces. Luego una computadora juntas estas secuencias cortas para formar
tramos continuos de secuencia que representan el ADN humano en el clon BAC.

¿De quién fue el ADN secuenciado en el Proyecto Genoma Humano?

Esto se mantiene intencionalmente en secreto para proteger a los voluntarios que proporcionaron
las muestras de ADN para su secuenciación. La secuencia se deriva del ADN de varios voluntarios.
Para garantizar que no sean reveladas las identidades de los voluntarios, se desarrolló un proceso
muy cuidadoso para contratar a los voluntarios y para reunir y mantener las muestras de sangre
que fueron la fuente del ADN.

Los voluntarios respondieron a los anuncios públicos locales colocados cerca de los laboratorios
donde fueron preparadas las "bibliotecas" de ADN. Los candidatos fueron contratados entre una
población diversa. Los voluntarios proporcionaron muestras de sangre después de haber sido
aconsejados extensamente y luego dieron su consentimiento informado. De 5 a 10 veces los
voluntarios donaron sangre y ésta fue eventualmente usada en la misma proporción, por lo cual ni
siquiera los voluntarios podían conocer si su muestra fue utilizada. Se quitaron todas las etiquetas
antes de elegir las muestras reales.

El objetivo principal del Proyecto Genoma Humano fue definido por primera vez en 1988 por una
comisión especial de la Academia Nacional de Ciencias (NAS) de EE.UU., y fue adoptado más
tarde mediante una serie detallada de planes quinquenales escritos conjuntamente por los
Institutos Nacionales de la Salud y el Departamento de Energía. En este momento, los objetivos
principales trazados por la Academia Nacional de Ciencias han sido logrados, incluyendo la
terminación esencial de una versión de alta calidad de la secuencia humana. Otros objetivos
incluían la creación de mapas físicos y genéticos del genoma humano, los cuales se lograron a
mediados de la década de 1990, así como también el mapeo y secuenciación de un juego de cinco
organismos modelo, incluyendo el ratón. Todos estos objetivos fueron logrados dentro del tiempo y
el presupuesto estimados primeramente por la comisión de la NAS.

De forma notable, un gran número adicional de objetivos que no se consideraban posibles en 1988
fueron añadidos durante el camino y se los logró con éxito. Los ejemplos incluyen bosquejos
avanzados de las secuencias de los genomas del ratón y la rata, y también un catálogo de bases
variables en el genoma humano.

¿El genoma humano ha sido secuenciado completamente?

Sí - dentro de los límites de la tecnología de hoy, el genoma humano está tan completo como debe
estarlo. Permanecen pequeños vacíos que son irrecuperables en cualquier método actual de
secuenciación, y totalizan alrededor del 1 por ciento de la porción del genoma que contiene los
genes, o eucromatina. Se deben inventar nuevas tecnologías para obtener la secuencia de esas
regiones.

Sin embargo, la porción del genoma que contiene los genes está completa en casi todas las formas
funcionales para propósitos de investigación científica y está disponible de manera pública y
gratuita. Aunque ahora esté terminado el Proyecto Genoma Humano, los científicos continuarán
desarrollando y aplicando nuevas tecnologías para los pocos problemas difíciles que restan. Por su
parte, NHGRI continuará apoyando una amplia variedad de investigaciones para desarrollar nuevas
tecnologías de secuenciación, para interpretar la secuencia humana y utilizar la nueva comprensión
del genoma humano para mejorar la salud humana.

El 26 de junio de 2000, el Consorcio Internacional para la Secuenciación del Genoma Humano

anunció la producción de un borrador de la secuencia del genoma humano. En abril de 2003, este
consorcio anunció una versión esencial terminada de la secuencia del genoma humano. Esta
versión, que está disponible para el público, proporciona casi toda la información necesaria para
hacer investigaciones utilizando el genoma completo.

La diferencia entre el borrador y las versiones finales está definida por la cobertura, el número de
vacíos y el índice de error. El borrador de la secuencia cubría el 90 por ciento del genoma con un
índice de error de uno en 1.000 pares de bases, pero había más de 150.000 vacíos y sólo el 28 por
ciento del genoma había alcanzado el criterio de terminado. En la versión de abril de 2003, existen
menos de 400 vacíos y el 99 por ciento del genoma está terminado con un índice de exactitud de
menos de un error por cada 10.000 pares de bases. Las diferencias entre las dos versiones son
significativas para los científicos que utilizan la secuencia para realizar investigaciones.

También es importante considerar que el Proyecto Genoma Humano probablemente se pagará

económicamente por sí solo muchas veces - si se considera que la investigación basada en el
genoma jugará un papel importante en la implantación de industrias biotecnológicas y de desarrollo
de medicamentos, sin mencionar el mejoramiento de la salud humana.

Tener la secuencia esencial completa del genoma humano es similar a tener todas las páginas de
un manual que se necesita para hacer el cuerpo humano. Ahora, el desafío para los investigadores
y científicos es determinar la forma de leer el contenido de todas esas páginas, luego entender
cómo trabajan todas las partes juntas y descubrir la base genética de la salud y la patología de las
enfermedades humanas. A este respecto, la investigación basada en el genoma permitirá
eventualmente a la ciencia médica el desarrollar unas herramientas de diagnóstico altamente
eficaces, para entender mejor las necesidades de salud de la gente sobre la base de su
composición genética individual, y para diseñar tratamientos nuevos y altamente eficaces para las
enfermedades.

Los análisis individualizados, basados en el genoma de cada persona, conducirán a una forma muy
poderosa de medicina preventiva. Seremos capaces de aprender sobre los riesgos de
enfermedades futuras en base al análisis del ADN. Médicos, enfermeras, consejeros genéticos y
otros profesionales del cuidado de la salud podrán trabajar con las personas para concentrar los
esfuerzos en las cosas que son más probables que mantengan la salud de un individuo en
particular. Esto podría significar una dieta o un cambio en el estilo de vida, o podría significar
vigilancia médica. Pero habrá un aspecto personalizado sobre lo que haremos para mantenernos
sanos. Luego, a través de nuestra comprensión a nivel molecular sobre la forma en que aparecen
cosas como la diabetes, las enfermedades cardíacas o la esquizofrenia, podremos ver toda una
nueva generación de intervenciones, muchas de las cuales serán medicinas bastante más eficaces
y precisas que aquellas que están disponibles hoy en día.
Es importante ser cuidadoso en cuanto a la creación de expectativas. La mayor parte de las nuevas
medicinas basadas en el genoma completo aparecerán quizás en unos 10 a 15 años, aunque más
de 350 productos biotécnicos - muchos basados en la investigación genética - se encuentran
actualmente en ensayos clínicos, según la Organización de la Industria Biotecnológica. Por lo
general toma más de una década para que una compañía realice la clase de estudios clínicos
necesarios para obtener la aprobación de mercadeo de parte de la Administración de Alimentos y
Medicinas.

Los exámenes, sin embargo, llegarán más rápidamente, especialmente la capacidad de predecir
los riesgos futuros de salud para un individuo, y la capacidad para implementar un método mejor en
medicina preventiva. En la próxima década, también estaremos mejor capacitados para determinar
las medicinas que funcionan mejor para los individuos, sobre la base de su composición genética.

La investigación biológica ha sido tradicionalmente una empresa bastante individualista, con los
investigadores realizando sus búsquedas médicas más o menos independientemente. La magnitud
de los desafíos tecnológicos y la inversión financiera necesaria impulsó al Proyecto Genoma
Humano a reunir equipos interdisciplinarios, que abarcaban desde ingeniería, informática, así como
también biología; procedimientos automáticos siempre que sean posibles; e investigación
concentrada en los centros principales para maximizar las economías de escala.

Como resultado, la investigación que involucra a otros proyectos relacionados con el genoma (por
ejemplo, el Proyecto Internacional HapMap para estudiar la variación genética humana y la
Enciclopedia de Elementos de ADN, o Proyecto ENCODE) se caracteriza ahora por esfuerzos a
gran escala y cooperativos que abarcan a muchas instituciones, a menudo de muchos países
diferentes, trabajando en colaboración. La era de la investigación en equipos ya está aquí.

Además, para introducir enfoques a gran escala en biología, el Proyecto Genoma Humano produjo
toda clase de nuevas herramientas y tecnologías que pueden ser utilizadas por científicos
individuales para llevar a cabo investigaciones a menor escala de una forma mucho más eficaz.

El NHGRI se enfocará particularmente en las oportunidades para aplicar los resultados del
Proyecto Genoma Humano en avances en medicina, incluyendo proyectos que se elaborarán sobre
la secuencia completa del genoma humano. Esto es particularmente verdadero para proyectos de
gran alcance internacional que requieren de una extensa coordinación e inversión pública para
garantizar que los resultados y los descubrimientos permanezcan disponibles gratuitamente en el
dominio público.

Un ejemplo es el proyecto del NHGRI de hacer un mapa de la variación genética, o HapMap, el

cual acelerará el descubrimiento de genes relacionados con enfermedades comunes como el
asma, cáncer, diabetes y enfermedades cardíacas. El HapMap también podría ser un recurso
poderoso para el estudio de los factores genéticos que contribuyen a la variación en respuesta a
las influencias medioambientales, en la susceptibilidad a las infecciones y en la eficacia de los
medicamentos y vacunas. Otro ejemplo es el proyecto ENCODE, que se propone crear una
enciclopedia total de los elementos funcionales codificados en la secuencia del ADN, catalogando
la identidad y la ubicación precisa de todos los genes codificantes o no codificantes de proteínas
dentro del genoma.