TALLER N°2

EL PROYECTO GENOMA HUMANO y Anemia

El Proyecto del genoma humano (PGH) fue un programa de investigación colaborativo

e internacional cuya meta era la del mapeo (cartografía) y entendimiento completo de
todos los genes de los seres humanos. Todos nuestros genes juntos se conocen como
nuestro "genoma".
El PGH fue la culminación natural de la historia de la investigación de la genética. En
1911, Alfred Sturtevant, en aquel entonces investigador como estudiante universitario
en el laboratorio de Thomas Hunt Morgan, se dio cuenta de que él podía - y que tenía
que, para poder gestionar sus datos - mapear las ubicaciones de los genes de la mosca de
la fruta (Drosophila melanogaster) cuyas mutaciones estaban siendo estudiadas por el
laboratorio de Morgan a lo largo de varias generaciones. El primer mapa génico de
Sturtevant puede ser comparado con el primer vuelo de los hermanos Wright en Kitty
Hawk. A su vez, el Proyecto del genoma humano puede ser comparado con el programa
Apollo que llevó a los seres humanos a la luna.
El material hereditario de todos los organismos multicelulares es la famosa doble hélice
de ácido desoxirribonucleico (ADN), que contiene todos nuestros genes. El ADN, a su
vez, está elaborado de cuatro bases químicas, cuyos pares forman los "peldaños" de las
moléculas de ADN que serpentean en forma de una escalera de caracol. Todos los genes
están formados por tramos de estas cuatro bases, ordenados de distintas maneras y en
diferentes longitudes. Los investigadores del PGH han descifrado el genoma humano de
tres maneras principales; han: determinado el orden, o "secuencia", de todas las bases en
el ADN de nuestro genoma; elaborado mapas que muestran las ubicaciones de los genes
para las principales secciones de todos nuestros cromosomas; y producido lo que se
conoce como mapas de ligamiento, versiones complejas del tipo originado en las
investigaciones iniciales de Drosophila, a través de los cuales puede darse seguimiento
a características heredadas (tales como aquellas para enfermedades genéticas) a lo largo
de varias generaciones.
El PGH ha revelado que existen probablemente alrededor de 20,500 genes humanos. La
secuencia humana completa ahora puede identificar sus ubicaciones. Este producto final
del PGH ha dado al mundo un recurso de información detallada sobre la estructura,
organización y función del conjunto completo de genes humanos. Esta información
puede considerarse como el conjunto básico de "instrucciones" hereditarias para el
desarrollo y función de un ser humano.
El Consorcio Internacional de Secuenciación del Genoma Humano (International
Human Genome Sequencing Consortium) publicó la primera versión preliminar del
genoma humano en la revista Nature en febrero de 2001, con el 90 por ciento de la
secuencia de los tres mil millones de pares de bases del genoma completo. Un dato
sorprendente de esta primera versión preliminar fue que el número de genes humanos
parecía ser significativamente menor que las estimaciones anteriores, que variaron
desde 50,000 genes hasta tantos como 140,000. La secuencia completa fue terminada y
publicada en abril de 2003.
Tras la publicación de la mayor parte del genoma en febrero de 2001, Francis Collins, el
director del Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano (National Human
Genome Research Institute, NHGRI), señaló que podría pensarse del genoma como un
libro con múltiples usos: "Es un libro de historia - una narrativa de la travesía de nuestra
especie al paso del tiempo. Es un manual de taller, con un plano increíblemente
detallado para construir cada célula humana. Y es un libro de texto transformativo de
medicina, con entendimiento que dará a los proveedores de atención de la salud
inmensos poderes nuevos para tratar, prevenir y curar enfermedades".
Las herramientas creadas a través del PGH también continúan informando trabajos para
caracterizar los genomas completos de otra variedad de organismos utilizados
extensamente en investigaciones biológicas, tales como ratones, moscas de la fruta y
platelmintos. Estos trabajos se respaldan entre sí porque la mayoría de los organismos
tienen muchos genes similares, u "homólogos", con funciones similares. Por lo tanto, la
identificación de la secuencia o función de un gen en un organismo modelo, por
ejemplo, en el nematodo C. elegans, tiene el potencial de explicar un gen homólogo en
los seres humanos o en uno de los otros organismos modelo. Estas ambiciosas metas
requirieron y continuarán exigiendo una variedad de nuevas tecnologías que han hecho
posible construir relativamente rápido una primera versión preliminar del genoma
humano y a continuar refinando dicha versión. Estas técnicas incluyen:

 Secuenciación del ADN

 El empleo de polimorfismos de longitud de los fragmentos de restricción (RFLP)

 Cromosomas artificiales de levaduras (YAC)

 Cromosomas artificiales bacterianos (BAC)

 La reacción en cadena de la polimerasa (RCP)

 Electroforesis

Claro que, la información es tan buena como la capacidad para usarla. Por consiguiente,
se necesitan métodos avanzados para la amplia difusión de la información generada por
el PGH a los científicos, médicos y otros profesionales, a fin de asegurar la aplicación
más rápida de los resultados de las investigaciones para el beneficio de la humanidad.
La tecnología y la investigación biomédica son beneficiarios específicos del PGH.
No obstante, las implicaciones trascendentales para individuos y la sociedad del
procesamiento de la detallada información genética hecha posible por el PGH fueron
reconocidas desde un principio. Otro componente importante del PGH - un componente
en curso del NHGRI - está dedicado, por consiguiente, al análisis de las implicaciones
éticas, legales y sociales (ethical, legal and social implications, ELSI) de nuestros
conocimientos genéticos recientemente descubiertos, y el desarrollo posterior de
opciones de políticas para la consideración pública.
Tomado de https://www.genome.gov/

El proyecto de secuenciación del genoma humano ha sido el mayor proyecto de

investigación biomédica de la historia. Con una presupuesto inicial de 3 mil millones de
dólares y la participación de un Consorcio Público Internacional, formado por EEUU,
Reino Unido, Japón, Francia, Alemania, China y otros países, tenía como objetivo
último la consecución de la secuencia completa del genoma humano, es decir, el texto
lineal constituido por la secuencia de las cuatros bases químicas del ADN que contiene
las instrucciones para construir un ser humano. Iniciado en 1990, el proyecto se dio por
concluido en el 2003, dos años antes de lo previsto. Otros objetivos del proyecto eran la
secuenciación de genomas de otros organismos modelos de los que había un amplio
conocimiento previo, como la bacteria Escherichia coli, la levadura Saccaromyces
cerevisiae, el gusano Caenorhabditis elegans, o la mosca del vinagre Drosophila
melanogaster. También tuvo un papel destacado el estudio de las implicaciones éticas,
legales y sociales que se derivarían de los resultados del proyecto. Ocho años después
del inicio del proyecto público apareció en escena una empresa privada, Celera
genomics, presidida por el brillante y revolucionario científico Craig J. Venter, que
lanzó el reto de conseguir la secuencia humana en un tiempo récord, antes del previsto
por el Consorcio Público. Proponía una estrategia de secuenciación alternativa a la
secuenciación jerárquica que seguía el Consorcio, la secuenciación aleatoria (shotgun),
con la que ya se había conseguido secuenciar el primer genoma celular en 1995, el de la
bacteria Haemophilus influenzae. Empieza a partir de ese momento una carrera
apasionante por la conquista del genoma humano, que acabaría finalmente en tablas. El
26 de Junio de 2000, en un acto auspiciado por el presidente Bill Clinton y que tuvo
como escenario la Casa Blanca, se encontraron los dos máximos representantes de las
partes en competición, Craig Venter por Celera, y el director del Consorcio Público,
Francis Collins. Se anunció de forma conjunta la consecución de dos borradores de la
secuencia completa del genoma humano. Las publicaciones correspondientes de ambas
secuencias no aparecieron hasta Febrero de 2001. El Consorcio Público publicó su
secuencia en la revista Nature, mientras que Celera lo hizo en Science. Tres años
después, en 2004, el Consorcio publica la versión final o completa del genoma humano.
El proyecto genoma humano había concluido con un éxito rotundo y, en palabras de F.
Collins, se iniciaba una nueva era en la investigación biomédica basada en la genómica
que afectaría crucialmente a la biología, a la salud y a la sociedad.
 Portadas de las publicaciones de la secuencia borrador del genoma humano
en las revistas Nature y Science en Febrero de 2001

Tomado de http://bioinformatica.uab.es
ACTIVIDADES.

La anemia microcítica es la anemia más frecuentemente observada en la práctica médica

general. La deficiencia nutricional de hierro y el rasgo de la talasemia beta son las
principales causas en pediatría, mientras que los trastornos de la coagulación y la
anemia de las enfermedades crónicas son comunes en la edad adulta. La anemia
hipocrómica microcítica puede ser resultado de un defecto en los genes de las globinas,
de la síntesis del grupo hemo, de la disponibilidad de hierro o de la adquisición de
hierro por los precursores eritroides. Nuestro laboratorio realiza diagnósticos genéticos
de anemias microcíticas hereditarias debidas a defectos en la síntesis del grupo hemo o
defectos del metabolismo del hierro.

El profesor explicara como ubicamos el gen ceruloplasmina (CP), usando la seccion

“Gene” del NCBI, anotar las caracteristicas mas importantes y completar el cuadro:

Repita el mismo procedimiento para los otros genes listados en la tabla

Tabla 1. Ubicación de los genes asociados a Anemia, en el genoma y caracteristicas

genetico moleculares

Nombre del gen locus Inicio/fin Tamaño RNAm Numero CDS Tejido
del gen intrones (tamaño) donde
(tamaño) se
expresa
ceruloplasmina (CP)
Transferrina (TF)
transportador de metales
divalentes 1 (DMT1)
SLC11A2
matriptase-2
(TMPRSS6)
STEAP3/TSAP6
ATP4A
ACVR1
ATP7B

CUESTIONARIO PARA CASA.

 Puede la secuenciación del ADN identificar las mismas afecciones de la salud al

nacer con la misma eficacia y velocidad que los métodos tradicionales?
 ¿Es útil tener la secuencia del genoma desde el nacimiento para la atención clínica
de ese individuo?
 ¿Qué sucede si la secuencia del genoma revela información sobre enfermedades
incurables, o incluso afecciones de la salud que no se presentarán sino hasta la vida
adulta?
 ¿Qué riesgo representa para los recién nacidos que la identificación de variantes
genéticas específicas, tales como la predisposición a una enfermedad, pudiera dar
pie a discriminación en el futuro?
 ¿Cómo pudiera el uso de la secuenciación del genoma afectar al apoyo público para
los programas de pruebas de detección sistemática para recién nacidos?
 ¿Qué tan factible sería para los estados realizar la secuenciación del genoma
además de, o en vez de, los programas de pruebas existentes?
 ¿Hay consideraciones adicionales para la obtención y el almacenamiento de las
secuencias del genoma de recién nacidos frente a muestras sanguíneas de recién
nacidos?
 En forma breve, usando la seccion OMIM de NCBI, escriba la funcion de cada uno
de los genes listados en la tabla1.
 Cuales son las nuevas mutaciones encontradas en pacientes con anemia y estan
asociadas al metabolismo del hierro
 Que es factor de impacto y cual es para la revista Nature y cual para Science.