TRABAJO PRÁCTICO N° 6

Sistemática Filogenética I

Material a tener en cuenta. Material didáctico, soportes audio-visuales de

teóricos y prácticos correspondientes al TP6 (AulasVirtuales), Libro Sistemática
Biológica: Fundamentos teóricos y ejercitaciones (Capítulos 8 y 10).

Consideraciones generales.
Realizar los siguientes ejercicios: 1 a 4
Ejercicios opcionales: 5 y 6

Ejercicio 1. Reconocimiento de caracteres, estados y construcción manual de un

cladograma

En la figura 1 se ilustran ocho especies hipotéticas de turbelarios comensales (Platyhelminthes). Las

especies constituyen un grupo monofilético.

Figura 1. Turbelarios hipotéticos comensales de crustáceos dulciacuícolas. Se trata de organismos hermafroditas, con
un intestino en forma de bolsa.
 Figura 2. Diagrama explicativo de los turbelarios hipotéticos.

a. Utilizando la lista de caracteres morfológicos que se le brinda a continuación establezca los estados de
carácter utilizando el taxón A para establecer la polaridad de los caracteres y vuelque la información en una
matriz de datos.

Lista de caracteres y estados

1. AMPOLLA EXCRETORA: Ausente/Presente

2. FORMA DE LA FARINGE: Angosta (sin musculatura) / Ancha (con musculatura)

3. GLÁNDULAS: Ausente/Presente

4. NEFRIDIOS: Ausente/Presente

5. OJOS: Presente/Ausente

6. TIPO DE OVARIO: simple/multiloculado

7. TIPO DE PARED DEL CUERPO: simple/doble

8. NÚMERO DE TENTÁCULOS: cinco/siete

9. NÚMERO DE TESTÍCULOS: dos/tres/cuatro

10. VENTOSA: ausente/ presente

11. VITELARIOS: ausentes/presentes

12. VESÍCULA SEMINAL: presente en contacto con el intestino/presente no en contacto con el intestino/ausente

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

A 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0

B 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 1 1

C 0 1 1 0 1 0 1 0 2 0 0 0

D 1 1 0 1 0 1 1 1 0 0 1 1
 E 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 0

F 0 1 1 0 0 0 1 0 2 1 0 0

G 1 1 0 1 0 1 1 1 1 0 1 1

H 0 1 0 0 1 0 1 0 2 0 0 2

b. Obtenga un cladograma aplicando la regla de inclusión/exclusión.

c. Describa el cladograma y reconozca los grupos monofiléticos.

d. Señale las homoplasias, autapomorfías y sinapomorfías del árbol.

Homoplasias: En B(10) y F (10) paralelismo. En E reversión

Autapomorfías: En G (9.1)

Sinapomorfias: En CH, en FCHEBDG, FCH, EDBG, BDG.

Ejercicio 2 (Para realizar este ejercicio siga el ejemplo del capítulo 8, figura 2, página 126 del libro de la cátedra
“Sistemática Biológica: fundamentos teóricos y ejercitaciones”)
Cladogramas para tres taxones
Sobre la base de la siguiente matriz de datos de tres taxones (A, B y C) por seis caracteres:
a. Plantee todas las hipótesis de relaciones genealógicas posibles

1 2 3 4 5 6

A 0 0 0 0 0 0

B 0 0 1 1 1 1

C 0 1 1 0 0 0
 1 2 3 4 5 6

A 0 0 0 0 1 0

B 0 0 0 0 0 0

C 0 1 1 0 1 0

1 2 3 4 5 6

A 0 0 0 0 1 0

B 0 0 1 1 0 1

C 0 0 0 0 0 0

b. Vuelque los caracteres en las mismas.

 C B C B A B C
A)
2
4,5,6
3

C A C B A C
B)
2,3
5

B A C A B
C)
3,4,6 5

c. Señale qué caracteres producen homoplasias y elija la hipótesis de mayor simplicidad.

Los carácter que producen homoplasia: 4, 6, 2.

La hipotesis de mayor simplicidad es la C.

Ejercicio 3 (Transformar los árboles en notación parentética a cladogramas como se explica en el video TP N6
Sistemática filogenética)
Taxones mono, para y polifiléticos
Sobre la base de los siguientes árboles escritos en notación parentética
A - ( A ( ( (B C) D ) (E ( F ( G H ) ) ) ) )
B- (A(((BG)D)(E(F(CH)))))
C - ( A ( ( ( ( B C ) D )E ) ( F( G H ) ) ) )
a. Dibuje los cladogramas.

b. Complete el siguiente cuadro:

Grupo Monofilético Parafilético Polifilético

BD A, B y C

BCD AYC B

HGF AYC B

BG B AYC

EF A,B Y C
 CHF B AYC

BGH A,B Y C

BDEFG A, B Y C

Ejercicio 4
Alineación manual de secuencias de ADN
A partir de las siguientes secuencias de nucleótidos:
Taxon 1 T G G T T G A C A A C C A T G A A
Taxon4 T T G A C A A C C G T
Taxon5 T C G A C T C A A T T G T G
a. Proponga tres alineamientos alternativos de las secuencias correspondientes a los taxones 4 y 5, con
respecto a la secuencia del taxón 1.

Taxón 4: T- - - T G A C A - C C - - G T-

A - - - A G T C A - C C - - GT -

T- - - T G A C A- G G - - C A -

Taxón 5

b. Aplique distintos criterios para la asignación de costos a las sustituciones y gaps, y elija una de las
opciones de alineamiento. Justifique su elección.

Ejercicios complementarios
Ejercicio 5
En las profundidades del mar argentino se colectaron seis especies hipotéticas las cuales se ilustran en la
figura 8. Con el objetivo de realizar un análisis filogenético se hizo un relevamiento de los caracteres y se
consideró como grupo externo a la especie X.
a. Para codificar correctamente los estados de los caracteres se debe primero establecer su homología ¿Qué
criterios seguiría para establecer la homología primaria?
b. Uno de los caracteres seleccionados es el tipo de antena. ¿Qué estados de carácter podría reconocer para
el tipo de antena? ¿Qué tipo de carácter es?
 Figura 8. Seis especies hipotéticas X-E (X corresponde al grupo externo). La flecha indica las antenas.
En una reciente expedición se colectó un conjunto de ejemplares adultos, donde algunos individuos (Figura
9) exhibían una condición diferente a la hasta ahora conocida. Tras este hallazgo se mantuvieron vivos a los
ejemplares en laboratorio y se realizó un estudio del desarrollo embrionario observando que las antenas
filiformes y las antenas capitadas tienen orígenes embrionarios distintos.

Figura 9. Nueva especie F. La flecha indica los dos tipos de antenas presentes en la especie.
c. La evidencia aportada por la nueva especie, ¿modifica las conclusiones a las que se había llegado en
relación con los estados de carácter de la antena? ¿Considera que la homología primaria del carácter
estaba correctamente establecida? Justifique.

Ejercicio 6
A partir de los cladogramas A al D representados en la figura 10:
a. Identifique cuales muestran las mismas relaciones filogenéticas entre los taxones y represente dichas
relaciones en forma de notación parentética.
b. ¿Cuál es el grupo hermano de F en cada uno de los cladogramas? ¿Y cuál es el grupo hermano del clado
formado por los taxones BC? ¿Es posible identificar el grupo hermano del clado formado por los taxones
ED en todos los cladogramas? Justifique su respuesta.
c. Señale la raíz en cada uno de los cladogramas.
d. Los taxones G y H comparten, de modo exclusivo, el estado 1 del carácter binario X. Mapee el estado 1
en todos los cladogramas e indique si dicho carácter supera el test de congruencia en cada caso. En caso
de comportarse como una homoplasia, indique de qué tipo se trata.
Figura 10. Cladogramas de diez taxones hipotéticos A-J.