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Unidad 2
𝑆→𝑃
𝑑𝐸𝑆 𝐸𝑆 𝑘−1 + 𝑘2 = 𝑘1 ∗ 𝐸 ∗ 𝑆
𝑣= = 𝑘1 ∗ 𝐸 ∗ 𝑆 − 𝑘−1 ∗ 𝐸𝑆 − 𝑘2 ∗ 𝐸𝑆
𝑑𝑡
𝑘1 ∗ 𝐸 ∗ 𝑆 𝐸∗𝑆
𝐸𝑆 = =
𝐸 = 𝐶𝑜𝑛𝑐𝑒𝑛𝑡𝑟𝑎𝑐𝑖𝑜𝑛 𝑑𝑒 𝑒𝑛𝑧𝑖𝑚𝑎 𝑙𝑖𝑏𝑟𝑒 𝑘−1 + 𝑘2 𝑘−1 + 𝑘2
𝑘1
Con:
𝑑𝐸𝑆
=0 𝑘−1 + 𝑘2
𝑑𝑡 𝑘𝑚 =
𝑘1
• Como la enzima no se consume, ni se • Despejando ES:
produce, se puede establecer la
siguiente relación de conservación de ES ∗ 𝑘𝑚 = 𝐸0 ∗ 𝑆 − 𝐸𝑆 ∗ 𝑆
la enzima: ES ∗ 𝑘𝑚 + 𝐸𝑆 ∗ 𝑆 = 𝐸0 ∗ 𝑆
ES ∗ (𝑘𝑚 + 𝑆) = 𝐸0 ∗ 𝑆
𝐸0 = 𝐸 + 𝐸𝑆
𝐸0 ∗ 𝑆
ES =
𝑘𝑚 + 𝑆
𝐸 = 𝐸0 − 𝐸𝑆
• Reemplazando para v:
• Reemplazando en la expresión de ES:
𝑑𝑃 𝐸0 ∗ 𝑆
(𝐸0 − 𝐸𝑆) ∗ 𝑆 𝑣= = 𝑘2 ∗
ES = 𝑑𝑡 𝑘𝑚 + 𝑆
𝑘𝑚
𝑘2 ∗ 𝐸0 ∗ 𝑆 • A diferencia del modelo de Monod para
𝑣= MO, acá la vm puede cambiar
𝑘𝑚 + 𝑆
dependiendo de la E0.
• km nos da una idea de la afinidad de la
𝑣𝑚 ∗ 𝑆
𝑣= enzima con el sustrato. A menor km mas
𝑘𝑚 + 𝑆 afinidad.
modelo de Michaelis-Menten
Con:
𝑣𝑚 = 𝑘2 ∗ 𝐸0 = 𝑣𝑒𝑙𝑜𝑐𝑖𝑑𝑎𝑑 𝑚𝑎𝑥𝑖𝑚𝑎
𝑘−1 + 𝑘2
𝑘𝑚 = = 𝐶𝑡𝑒 𝑑𝑒 𝑀𝑀
𝑘1
Estimación de parámetros cinéticos de M-M
𝑣𝑚 ∗ 𝑆
𝑣=
𝑘𝑚 + 𝑆
• El tiempo de cambio de S en una
reacción enzimática en batch
• El modelo de M-M, puede ser
puede ser determinado de:
linealizado a la expresión:
𝑑𝑆 𝑣𝑚 ∗ 𝑆
1 𝑘𝑚 1 1 𝑣=− =
= ∗ + 𝑑𝑡 𝑘𝑚 + 𝑆
𝑣 𝑣𝑚 𝑆 𝑣𝑚
𝑆0
𝑆0 − 𝑆 + 𝑘𝑚 ∗ ln
𝑆
𝑡=
𝑣𝑚
Ejercicio
• Se midió la velocidad inicial de una reacción
enzimática para diferentes concentraciones iniciales
de sustrato y se obtuvieron los siguientes datos:
S [g/L] v [g/L*s]
a) Calcule vm y km
3 10,4 b) Si la concentración alimentada de
5 14,5 enzima fue 1,785 g/L, cual es el valor
10 22,5 de k2?
30 33,8 c) Si se tiene otra enzima con km=12 g/L,
90 40,5 cual enzima recomendaría usar para
catalizar el proceso?
Ajuste a la estimación de parámetros
cinéticos de M-M
• La linealización que venimos • Se recomienda entonces trabajar el
manejando se conoce como: siguiente ajuste a la linealización:
𝐸 + 𝑆 ↔ 𝐸𝑆 + 𝑆 ↔ 𝐸𝑆2 + 𝑆 ↔ ⋯ ↔ 𝐸𝑆𝑛
• Son enzimas con mas de un sitio 𝐸 + 𝑛𝑆 ↔ 𝐸𝑆𝑛 → 𝐸 + 𝑛𝑃
activo • Haciendo el mismo análisis que para la
reacción simple:
• El enlace de un sustrato a la 𝑑𝑃
enzima vuelve aun mas afín a la 𝑣=
𝑑𝑡
= 𝑘2 ∗ 𝐸𝑆𝑛
enzima, lo que permite mayor 𝑑𝐸𝑆
𝑣= = 𝑘1 ∗ 𝐸 ∗ 𝑆 𝑛 − 𝑘−1 ∗ 𝐸𝑆𝑛 − 𝑘2 ∗ 𝐸𝑆𝑛
facilidad para enlazar otra 𝑑𝑡
molécula de sustrato • Asumiendo que la enzima se encuentra
saturada, en estado estable:
• Esto se conoce como enlace 𝑑𝐸𝑆
=0
cooperativo, y se produce de 𝑑𝑡
manera común en enzimas • Despejando 𝐸𝑆𝑛 :
reguladoras de metabolismo. 𝐸 ∗ 𝑆𝑛
𝐸𝑆𝑛 =
𝑘𝑚
Enzimas alostéricas
𝑣𝑚 ∗ 𝑆 𝑛
𝑣=
𝑘𝑚 + 𝑆 𝑛
• El coeficiente de cooperatividad (n)
puede ser determinado de la siguiente
linealización:
𝑣
𝑙𝑛 = 𝑛 ∗ 𝑙𝑛𝑆 − 𝑙𝑛𝑘𝑚
𝑣𝑚 − 𝑣
• con n<1 se dice que hay cooperatividad
negativa, la unión del sustrato a un nuevo
sitio activo es mas difícil entre mas
moléculas de sustrato estén unidas a la
enzima
Cinética de inhibición enzimática
• Inhibidores enzimáticos:
Compuestos que se pueden unir a
Irreversibles
las enzimas y disminuir su actividad.
• Inhibidores irreversibles: forman Inhibidores
enzimáticos
complejos muy estables con la Competitivo
𝑑𝐸𝑆
0= = 𝑘1 ∗ 𝐸 ∗ 𝑆 − 𝑘−1 ∗ 𝐸𝑆 − 𝑘2 ∗ 𝐸𝑆
𝑑𝑡
𝐸∗𝑆
𝐸S =
𝑘𝑚
𝑑𝐸𝐼
0= = 𝑘3 ∗ 𝐸 ∗ 𝐼 − 𝑘−3 ∗ 𝐸𝐼
𝑑𝑡
𝐸∗𝐼
𝐸I =
𝑘𝐼
𝐸 = 𝐸0 − 𝐸𝑆 − 𝐸𝐼
𝐼
𝐸S ∗ 𝑘𝑚 1 + = 𝐸0 ∗ 𝑆 − 𝐸𝑆 ∗ 𝑆
𝐸∗𝐼 𝑘𝐼
𝐸 = 𝐸0 − 𝐸𝑆 −
𝑘𝐼 𝐼
𝐼 𝐸S(𝑘𝑚 1 + + 𝑆) = 𝐸0 ∗ 𝑆
𝐸 1+ = 𝐸0 − 𝐸𝑆 𝑘𝐼
𝑘𝐼
𝐸0 − 𝐸𝑆 𝐸0 ∗ 𝑆
𝐸= 𝐸S =
𝐼 𝐼
1+ 𝑘𝑚 1 + +𝑆
𝑘𝐼 𝑘𝐼
Inhibición competitiva
𝐸∗𝐼
𝐸I =
𝑘𝐼
𝐸∗𝑆∗𝐼
𝐸SI =
𝑘𝑚 ∗ 𝑘𝐼
Inhibición competitiva
• Reemplazando en v:
𝐸0 ∗ 𝑆 • El efecto neto de la inhibición no
𝑣 = 𝑘2 ∗ competitiva es una disminución en el valor
𝐼
1+
𝑘𝐼
∗ (𝑘𝑚 + 𝑆) de 𝑣𝑚𝑎𝑝 , lo que reduce la velocidad de rxn
𝑣𝑚 ∗ 𝑆 • Este efecto no se puede combatir con
𝑣=
𝐼 altas concentraciones de S
1+ ∗ (𝑘𝑚 + 𝑆)
𝑘𝐼
𝑣𝑚𝑎𝑝 ∗ 𝑆
𝑣=
𝑘𝑚 + 𝑆
Con:
𝑣𝑚
𝑣𝑚𝑎𝑝 =
𝐼
1+
𝑘𝐼
Inhibición acompetitiva
𝐸∗𝑆
𝐸S =
𝑘𝑚
𝐸𝑆 ∗ 𝐼
𝐸SI =
𝑘𝐼
Inhibición acompetitiva
• Reemplazando en v:
𝑣 = 𝑘2 ∗
𝐸0 ∗ 𝑆 • El efecto neto de la inhibición
𝑘𝑚 + 1 +
𝐼
𝑆 acompetitiva es una disminución tanto en
𝑘𝐼
𝑣𝑚 el valor de 𝑣𝑚𝑎𝑝 , como de 𝑘𝑚𝑎𝑝 , lo que
𝐼 ∗𝑆 reduce la velocidad de rxn
𝑣𝑚 ∗ 𝑆 1+
𝑘𝐼
𝑣= =
𝐼 𝑘𝑚
𝑘𝑚 + 1 + 𝑆
𝑘𝐼 𝐼 +𝑆
1+
𝑘𝐼
𝑣𝑚𝑎𝑝 ∗ 𝑆
𝑣=
𝑘𝑚𝑎𝑝 + 𝑆
Con:
𝑣𝑚 𝑘𝑚
𝑣𝑚𝑎𝑝 = 𝑦 𝑘𝑚𝑎𝑝 =
𝐼 𝐼
1+ 1+
𝑘𝐼 𝑘𝐼
Inhibición por sustrato
𝐸S ∗ 𝑆
𝐸𝑆2 =
𝑘𝑆𝐼
• Con:
• 𝐸𝑆2 = concentración del complejo enzima-doble
sustrato
• 𝑘𝑆𝐼 = cte de inhibición por sustrato
Inhibición por sustrato
𝑆2
• 𝑆𝑖 ≪ 1 → 𝑛𝑜 ℎ𝑎𝑦 𝑖𝑛ℎ𝑖𝑏𝑖𝑐𝑖ó𝑛
𝑘𝑆𝐼
• Reemplazando en v: • Se puede calcular la concentración de
sustrato que da la máxima velocidad
𝐸0 ∗ 𝑆 cuando hay inhibición
𝑣 = 𝑘2 ∗
𝑆2
𝑘𝑚 + 𝑆 + 𝑑𝑣
𝑘𝑆𝐼
=0
𝑑𝑡
𝑣𝑚 ∗ 𝑆
𝑣=
𝑆2 𝑆𝑚 = 𝑘𝑚 ∗ 𝑘𝑆𝐼
𝑘𝑚 + 𝑆 +
𝑘𝑆𝐼
Inhibición por sustrato
𝑣𝑚 ∗ 𝑆
𝑣=
𝑆2 • En el caso de inhibición por sustrato
𝑘𝑚 + 𝑆 +
𝑘𝑆𝐼 los parámetros cinéticos se hallan
utilizando regresión cuadrática en la
• Para calcular los parámetros cinéticos, se grafica de Hanes-Woolf
debe buscar la linealización:
1 𝑘𝑚 1 1 1
= ∗ + + ∗𝑆
𝑣 𝑣𝑚 𝑆 𝑣𝑚 𝑣𝑚 ∗ 𝑘𝑆𝐼
𝑆 𝑘𝑚 1 1
= + ∗𝑆+ ∗ 𝑆2
𝑣 𝑣𝑚 𝑣𝑚 𝑣𝑚 ∗ 𝑘𝑆𝐼
𝑣𝑚 ∗𝑆
• 𝑣= 𝑆𝑣2= 𝑣𝑚 ∗ 𝑆 𝑣𝑚𝑎𝑝 ∗ 𝑆
𝑘𝑚 +𝑆+ 𝑣=
𝑘𝑆𝐼 𝑘𝑚𝑎𝑝 + 𝑆 𝑘𝑚𝑎𝑝 + 𝑆
𝑣𝑚𝑎𝑝 ∗ 𝑆 𝑣𝑚 ∗ 𝑆
𝑣=
𝑣= 𝑆2
𝑘𝑚 + 𝑆 𝑘𝑚 + 𝑆 +
𝑘𝑆𝐼
Ejercicio
La hidrolisis de la urea mediante ureasa es una reacción que
puede mostrar inhibición. Datos experimentales para diferentes
concentraciones de inhibidor se presentan en la siguiente tabla:
S
0,2 M 0,02 M a)Determine la constante de M-M
1/v I 1/v I y la velocidad máxima para esta
0,22 0 0,68 0 reacción
0,33 0,001 1,02 0,001 b)Que tipo de inhibidor se utilizo en
0,51 0,0027 1,5 0,0022 el experimento? Justifique su
0,76 0,005 1,83 0,0032 respuesta.
0,88 0,0061 2,04 0,0037
c) Cual es el valor de kI?
1,1 0,008 2,35 0,005
1,15 0,0093 2,74 0,0059
Enzimas inmovilizadas
• Es la restricción de movilidad de una • Principio: imita la unión de algunas
enzima en un lugar fijo enzimas a la membrana intracelular
Ventajas: • Principales métodos de inmovilización:
• Reutilización de la enzima: No se atrapamiento e inmovilización
necesitan procesos de recuperación y superficial
purificación de enzima
• Mejor ambiente para su actividad
enzimática >estabilidad
• La purificación del producto es más
sencilla
• Se puede usar en un amplio rango de
reactores
• La reacción se puede parar rápidamente
Atrapamiento
• Es el confinamiento físico de una
enzima en un espacio pequeño
• Puede ser en una membrana o
en una matriz
• Matrices: pueden ser dispuestas
en una fibra o una membrana
• Matrices blandas: usan alginato,
agar, carrageninas, colágeno,
poliacrilamida, como material de
soporte
• Matrices sólidas usan carbón
activado, cerámicos porosos,
tierras diatomeas como material
de soporte
Atrapamiento
Microencapsulación
• Se forman esferas huecas
microscópicas
• Las esferas contienen la enzima
y están sujetas a una
membrana porosa polimérica
Atrapamiento en membranas:
• Membranas de fibra hueca de
nylon, polisulfona y poliacrilato
son las más usadas
Desventajas Atrapamiento
Ejemplos • Filtración de la enzima a la
• Leche * Pruebas de glucosa solución, se mejora a menor
deslactosada para la diabetes tamaño de poro
• Limitaciones difusionales, se
mejoran disminuyendo el
tamaño de partícula de las
capsulas/matrices
• Reducción de la actividad
enzimática o estabilidad
Glucosa oxidasa • Bajo control de las
microcondiciones ambientales,
se disminuye con la
optimización del proceso
Inmovilización superficial
• Adsorción: Retención de la enzima en la • Materiales Orgánicos: Celulosa (CMC,
superficie de una partícula de soporte DEAE-celulosa), almidón, carbón
por fuerzas débiles (Van der Waals, activado y resinas de intercambio
fuerzas de dispersión) iónico.
• El sitio activo de la enzima adsorbida, • Las superficies deben ser pretratadas
generalmente conserva su actividad. La física o químicamente para hacer una
adsorción se estabiliza con inmovilización efectiva
glutaraldehído
Materiales usados:
• Materiales inorgánicos: alúmina, sílica,
vidrio poroso, cerámicas, bentonita,
arcilla, tierras diatomeas
Inmovilización superficial
• Unión covalente: Retención de la enzima Criterios para seleccionar el material de
en la superficie de una partícula de soporte:
soporte por enlaces covalentes • Capacidad de unión: es función de su
• Las enzimas se unen gracias a sus grupos densidad de carga, porosidad, grupos
funcionales (amino, carboxilo, hidroxilo..) funcionales, hidrofobicidad
que no están en el sitio activo • Estabilidad y retención de la actividad
• Proceso: inhibir la enzima con un inhibidor enzimática
competitivo, realizar la reacción que
permite la unión covalente
Comparación entre los métodos
Enzimas inmovilizadas uso
industrial