Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
PLANTAS
2008
Declaración de propiedad
Primero y antes que nada gracias Dios por ser mi mejor amigo ,
mi fortaleza, darme todo lo que tengo y nunca dejarme caer.
Por permitirme llegar hasta este momento tan importante de mi
vida y lograr otra meta más en mi carrera.
iv
DEDICATORIA
Enseñarás a volar,
pero no volarán tu vuelo.
Enseñarás a soñar,
pero no soñarán tu sueño.
Enseñarás a vivir,
pero no vivirán tu vida.
V
vi
ÍNDICE GENERAL
RESUMEN 1
ABSTRACT 3
INTRODUCCIÓN 5
CAPÍTULO 1 ANTECEDENTES 7
1.1. Argemone mexicana 7
1.1.1. DESCRIPCIÓN BOTÁNICA 8
1.1.2. USOS TRADICIONALES 8
1.1.3. COMPOSICIÓN QUÍMICA 9
1.2. ALCALOIDES BENCILISOQUINOlÍNICOS 1O
(ABis)
1.2.1. RUTA DE SÍNTESIS DE LOS ABis 11
1.2.2. Formación de norcoclaurina 12
1.2.3. Formación de reticulina a partir de norcoclaurina 12
1.2.4. Formación de benzofenantridinas y 13
protoberberinas
1.2.5. Síntesis de alcaloides morfinanos 16
1.3. REGULACIÓN Y LOCALIZACIÓN TEJIDO- 18
ESPECIFICA DE LOS ABis
1.4. COMPARTAMENTALIZACIÓN SUBCELULAR 20
DE LAS ENZIMAS DE LA SÍNTESIS DE LOS
A Bis
1.5. TRANSPORTE INTERCELULAR DE LAS 22
ENZIMAS BIOSÍNTETICAS DE LOS ABis
1.6. SÍNTESIS DE ABis EN CULTIVOS DE CÉLULAS 23
in vitro
1. 7. TRANSDUCCIÓN DE SEÑALES EN LA 27
SÍNTESIS DE ABis EN RESPUESTA A LA
INDUCCIÓN
1.8. ANÁLISIS DE LA ACUMULACIÓN DE ABis EN 30
CULTIVOS in vitro DE Argemone mexicana
1.9. RECAPITULACIÓN DE LOS ANTECEDENTES 31
1.1 O. REFERENCIAS 32
vii
CAPITULO 2 MATERIALES Y MÉTODOS 47
2.1 . OBJETIVOS 47
2.2. HIPÓTESIS 48
2.3. ESTRATEGIA EXPERIMENTAL 48
2.4. MATERIAL BIOLÓGICO 49
2.6. REFERENCIAS 50
CAPÍTULO 4 CARACTERIZACIÓN 73
MOLECULAR DE LA NORCOCLAURINA
SINTASA (NCS) Y LA ENZIMA FORMADORA
DEL PUENTE DE LA BERBERINA {BBE) EN
Argemone mexicana
4.1. INTRODUCCIÓN 75
4.2. MATERIALES Y MÉTODOS 76
4.3. RESULTADOS Y DISCUSIÓN 83
4.4. CONCLUSIONES 116
4.5 REFERENCIAS 117
ix
X
ÍNDICE DE FIGURAS
xi
FIGURA 3. 7. Amplificación de los extremos 5' y 3, 66
correspondientes a los ADNcs de la
NCS y BBE por RACE
FIGURA 3.8. Empalme de las secuencias de la 67
NCSAm1 y de la NCSAm2
FIGURA 3.9. Comparación de las secuencias de 68
nucleótidos de NCSAm1 y NCSAm2 de
Argemone mexicana
FIGURA 3.10. Empalme de las secuencias de la 69
BBEAm1 y de la BBEAm2
FIGURA 3.11. Comparación de las secuencias de 70
nucleótidos de BBEAm1 y BBEAm2 de
Argemone mexicana
FIGURA 4.1. Comparación de la secuencia de 84
aminoácidos deducidos a partir de
NCSAm1 y NCSAm2 de Argemone
mexicana
FIGURA 4.2. Alineación de las secuencias de 87
aminoácidos deducidos de la NCSAm1
y NCSAm2 con secuencias reportadas
para la norcoclaurina sintasa (NCS)
FIGURA 4.3. Comparación de la secuencia de 90
aminoácidos deducidos a partir de
BBEAm1 y BBEAm2 de Argemone
mexicana
FIGURA 4.4. Alineación de las secuencias de 91
aminoácidos deducidos de la BBEAm1 y
BBEAm2 con secuencias reportadas
para la enzima formadora del puente de
la berberina
FIGURA 4.5. Árbol filogenético obtenido mediante la 94
aplicación del método neighbor-joining
(método del vecino más próximo)
utilizando la secuencia de nucleótidos
codificantes de la NCSAm1 y NCSAm2
de Argemone mexicana
xii
FIGURA 4.6. Árbol filogenético obtenido mediante la 96
aplicación del método neighbor-joining
(método del vecino más próximo)
utilizando las secuencia de nucleótidos
codificantes de la BBEAm1 y BBEAm2
de Argemone mexicana
FIGURA 4.7. Análisis de restricción de los ADNcs de 97
la NCS y BBE de Argemone mexicana
FIGURA 4.8. Análisis tipo Southern blot de la NCS de 99
Argemone mexicana
FIGURA 4.9. Análisis tipo Southern blot de la BBE de 101
Argemone mexicana
FIGURA 4.1 O. Acumulación de ABis y análisis de 105
expresión de la NCS y BBE en plantas
maduras de Argemone mexicana
FIGURA 4.11. Acumulación de ABis y análisis de 112
expresión de la NCS y BBE después de
la germinación de semillas de
Argemone mexicana
FIGURA 4.12 Acumulación de ABis y análisis de 115
expresión de la NCS y BBE en plantas
en desarrollo de Argemone mexicana
(post-emergencia)
FIGURA 5.1. Curva de crecimiento y acumulación de 133
sanguinarina de la suspensión celular
AmMiF de Argemone mexicana durante
un ciclo de cultivo
FIGURA 5.2. Acumulación de sanguinarina en 135
suspensiones celulares de Argemone
mexicana expuestas a jasmonato de
metilo y ácido salicílico
FIGURA 5.3. Acumulación de sanguinarina y análisis 136
de expresión de la NCS y BBE en
suspensiones celulares de Argemone
mexicana
FIGURA 6.1 Esquema de la acumulación de 151
xiii
alcaloides de tipo benzofenantridina y
protoberberina durante el desarrollo de
plantas de Argemone mexicana
FIGURA6.2 Modelo hipotético de la cascada de 155
señales en respuestas a jasmonato de
metilo y acido salicílico en suspensiones
celulares de Argemone mexicana
xiv
ÍNDICE DE CUADROS
xvi
ABREVIATU RAS
4-HPAA 4-hidroxifenilacetaldehído
4'0MT 3 •-hidroxi-N-metilcoclaurina 0-metiltrasferasa
6'0MT 6-0-metiltransferasa
A Bis Alcaloides bencilisoquinolínicos
ADN Ácido desoxirribonucleico
ADNc Ácido desoxirribonucleico complementario
ANA Ácido naftalénacetico
ARN Ácido ribonucleico
ARNm Ácido ribonucleico mensajero
BAP 6-bencilaminopurina
BBE Enzima formadora del puente de la berberina
CFS ( S)-chelantiofolia sintasa
CNMT Coclaurina N-metiltransferasa
COR Codeinona reductasa
CTAB Bromuro de hexadeciltrimetil amonio
DBOX Dihidobenzofenantridina oxidasa
DRR 1,2-dehidroreticulina reductasa
EDTA Ácido etilendiaminotetraacético
ETOH Etanol
FAD Flavín adenina dinucleotido
IPTG lsopropil ~-D-1-thiogalactopiranósido
JA Ácido jasmonico
LPC Lisofosfatidilcolina
MES Material electrónicamente-denso
MEJA Jasmonato de metilo
MOPS Ácido 3-( morfolino )propanosulfónico
MSH ( S)-cis-N-metilestilopina 14-hidroxilasa
NCS Norcoclaurina sintasa
NMCH N-metilcoclaurina 3'hidroxilasa
P6H Protopina-6-hidroxilasa
PF Peso fresco
PS Peso seco
PVPP Polivinilpolipirrolidona
PCR Reacción en cadena de la polimerasa
RE Retículo endoplásmico
RT-PCR Reacción de la polimerasa del ARN retrotranscrito
SA Ácido salicílico
xvii
SAT Acetil coenzima A: salutaridinol-7-0-acetiltransferasa
SDS Dodecil sulfato de sodio
SPS ( S)-estilopina sintasa
SOMT Escoulerina-9-0-metiltransferasa
SOR Salutaridina: NADPH 7-oxidoreductasa
STS Salutaridina sintasa
TNMT Tetrahidroprotoberberina-cis-N-metiltransferasa
Tm Temperatura de desnaturalización
Tris Hidroximetil aminometano clorhidrato
TYDC Tirosina/dopa descarboxilasa
X-GAL 5-bromo-4-cloro-3-indolii-~-D-galactopiranosido
xviii
RESUMEN
1
acumulación de sanguinarina y este efecto fue posterior al
aumento en el nivel de los transcritos.
2
ABSTRACT
3
Taken together, these results suggest that alkaloid biosynthesis
in A. mexicana present important differences, in comparison
with other plants.
4
INTRODUCCIÓN
6
CAPÍTULO 1
ANTECEDENTES
1.1. Argemone mexicana
7.
1.1.1. DESCRIPCIÓN BOTÁNICA
Existen datos de que esta planta era utilizada por las culturas
prehispánicas con fines curativos (Emmart, 1940; Willcox et al.,
2007). Se empleaba para el tratamiento de nubes o cataratas,
aplicando directamente el látex sobre los ojos. También era
usada para aliviar la fiebre, para curar úlceras sexuales, la
sarna, como purgante y en ciertas enfermedades cutáneas.
Entre los usos medicinales también aparece el que se hace de
sus flores para preparar infusiones consideradas sedantes,
narcóticas y antitusivas. De igual forma, el aceite obtenido de
las semillas se ha utilizado para aliviar los cólicos ya que
desvanece el dolor, produciendo un efecto hipnótico notable.
Hay que señalar que tales usos medicinales fueron adquiridos
a lo largo de su historia y que la presencia de alcaloides en
diferentes partes de la planta puede explicar las propiedades
que se le atribuyen (Lozoya y Lozoya, 1982).
8
1.1.3. COMPOSICIÓN QUÍMICA
9
Figura 1.1. Argemone mexicana . A) Cápsula en desarrollo; B) cápsula
dehiscente; C) tallo con espinas perpendiculares; D) flor (amaril la); E) hoja
lateral.
10
alcaloides son usados como fármacos, incluyendo la morfina, la
codeína, la papaverina, la berberina, la sanguinarina y la (+)-
tubocurarina, entre otros (Fig. 1.2). La función de los ABis en
plantas incluye protección contra herbívoros y agentes
patógenos. La actividad farmacológica de algunos de estos
alcaloides los hace útiles en el tratamiento de diversas
afecciones y nos permite tener una idea de su función biológica
en la planta (Facchini, 2001; Zieg¡ler y Facchini, 2008). Por
ejemplo , la morfina tiene eficacia como analgésico, la
colchicina provoca la disrupción de los microtúbulos y la ( +)-
tubocurarina es un bloqueador neuromuscular. Esto sugiere
que los alcaloides también podrían funcionar en plantas como
protección en contra del ataque de herbívoros. Por otro lado,
las propiedades antimicrobianas de la sanguinarina y la
berberina sugieren que estos alcaloides confieren protección
contra patógenos (Schmeller et al., 1997; García et al., 2006).
Muchas plantas, tales como las Papaveraceas, invierten
considerables recursos para la producción de estos alcaloides,
lo que sugiere que estos componentes juegan un papel
relevante en la fisiología de la planta (Schmeller et al., 1997;
Wink et al. , 1998).
HaCO
HatO
...-! HH
H,co PapawrN
-
H ~ OOH
HO~ Ñ~t!
l -OOP A 1
1
1
o%• +c...,
N
-
.)
o
12
el precursor central de todos los ABis (Samanani et al., 2004;
Liscombe et al., 2005).
1.2.3. Formación de reticulina a partir de norcoclaurina
13
( S)-cis-N-metilestilopina 14-hidroxilasa (MSH) conduce a la
formación de protopina (Rueffer y Zenk, 1987) (Fig. 1.3).
14
~oy
H~O~CH,
HOJ ) '
1
HO
S-3'Hidroxl·
N- metllcoclaurma
H~ NC~
HO~ H,co~
HO: V XOOH
·----. E)
Benzo f enantndmas
Pro toberbermas
(Berbenna)
¡
1
~::~:
"" OH
S.Escoulenna "'
\~
H" N Ho <:Q?')
Protop1na
1 )
o ~
S·CIO·N· Metrleslrloprna ~
~ 'Cr:> .
S-Estrlopma
15
Columbamina '~ • +
STO~ N
OCHJ
OCHJ
Berberina
Protoberberlnas
Vesiculas
16
citosólica salutaridina: NADPH 7-oxidoreductasa (SOR), reduce
la salutaridina a (7S)-salutaridinol (Gerardy y Zenk, 1993a),
mientras que la transformación de (7S)-salutaridinol en tebaína
involucra una acetilación llevada a cabo por la salutaridinol-7-
0-acetiltransferasa (SAT) que utiliza acetiiCoA como donador.
SOR y SAT han sido detectados sólo en P. somniferum y P.
bracteatum. Las últimas etapas de la transformación de tebaína
en morfina consisten en una serie de reacciones, en las que la
tebaína se convierte en codeinona, que se reduce a codeína
(Lenz y Zenk, 1995), para finalmente ser desmetilada y
producir morfina (Fig. 1.5). Solo la codeinona reductasa (COR),
una enzima citosolica dependiente de NADPH cataliza la
reducción de codeinona a codeína (Lenz y Zenk, 1995;
Unterlinner et al., 1999).
H~,·NCHDRR H~
H 5 ? : N C H , STS
H-
H,CC~o SO~H~>COo HO
H HO HO H NCH, H NCH::o
H H, H H
o OH
S-Reticulina R·Reticulina Salutadirina (7S) -Salutaridinol
JsAT
"~•e•, C~~.c~-"~c.~.--H-=~c•,
~ Codeína
~ Cod@inona
~ Neopinona
~~ Tebalna
·~~
H~
..'
Morfina
COR
Morfinona
'
HO~
H»FNCH,
Oripavina
17
1.3. REGULACIÓN Y LOCALIZACIÓN TEJIDO-ESPECIFICA
DE LOSABis
20
vesículas (Amman et al, 1986), que terminan por fusionarse
con la vacuola central , donde se acumula la sanguinarina
(Amman et al, 1986; Liscombe y Facchini, 2008).
21
1.5. TRANSPORTE INTERCELULAR DE LAS ENZIMAS
BIOSÍNTETICAS DE LOS ABis
23
diversos inductores sobre la actividad transcripcional (Cuadro
1.1 ).
24
obstante, dicho alcaloide no logra acumularse, aun en
condiciones en que se induce la activación del metabolismo
secundario, como el tratamiento con jasmonatos (JA) y
homogenados fúngicos (Lenz y Zenk, 1995; Facchini y Bird ,
1998). Estos tratamientos, por otra parte, logran inducir la
síntesis de sanguinarina, no solo en P. somniferum, sino
también en cultivos de E. californica (Ditrich y Kutchan, 1991 ).
Los cultivos de diferentes especies de Papaveraceas que
producen estos alcaloides, son capaces de sintetizarlos cuando
se exponen a inductores del metabolismo secundario. Por
ejemplo, en cultivos de P. somniferum, E. californica y S.
canadensis, solamente se detectan trazas de sanguinarina en
condiciones normales de mantenimiento. Sin embargo, al ser
expuestas a un inductor este alcaloide se acumula en
contenidos de hasta el 4% peso seco (PS) (lkuta, 1998; Zulak
et al., 2008).
26
El estudio de los promotores de genes involucrados en la
síntesis de los ABis permite explorar aspectos en el control de
la formación de éstos. El análisis de expresión temporal de
construcciones hechas uniendo promotores de los genes Tydcl
y Bbe1 de P. somniferum, con el gen reportero GUS, ha
permitido la identificación de las regiones necesarias para la
funcionalidad de dichos promotores (Park et al. , 1999).
Además, se han logrado identificar dominios de entre 100 y 150
nucleótidos que son necesarios para la inducción por heridas
en estos dos genes (Park et al., 1999). Por su parte, el análisis
funcional del promotor de la Bbe1 de E. ca/ifornica reveló una
secuencia de 150 nucleótidos, que comparte un 55% de
identidad con la región equivalente en el promotor para este
mismo gen en P. somniferum (Hauschild et al. , 1998). Esto
sugiere que dichas secuencias podrían participar en la
activación de este gen a los inductores u otros estímulos
comunes (Facchini, 2001; Ziegler y Facchini, 2008).
Na; ____ __ __
Áctdo linoléntco
--
\ / H' /Na'
Incremento del
jasmona to
:~ (citoplasma) :::::::::;::::::: ..:.~)
L'lp H
_ --------- Inducción de las
Acttvacton e nzimas biosintéticas
Respuesta transcrip tona l
hlpersensible deA Bis
30
las condiciones ambientales en las que la planta se desarrolla,
ya que prefiere los suelos alcalinos (Ramakrishnan y Gupta,
1972). En esta suspensión, como en los callos, se identificó la
presencia de sanguinarina, pero no la de berberina. No
obstante, a diferencia de los callos, las suspensiones
sometidas a diferentes condiciones de iluminación no
mostraron un cambio significativo en el contenido de
sanguinarina, aunque el perfil cualitativo presentó algunas
variaciones. Además de los efectos de la luz mencionados
previamente, se pudo observar que los cultivos in vitro fueron
susceptibles a la aplicación de inductores químicos, como el
jasmonato de metilo (MEJA) (Carrillo-Pech, 2006).
1:1O. REFERENCIAS
32
· response of sanguinarine for cancer cells versus normal cells.
Clinical Cancer Research, 6, 1524-1528.
33
for the regulation of secondary pathways. The Proceedings of
the National Academy of Scien ces USA, 92, 4099-4105.
34
Eirlert, U., and V. De Luca, (1994) Elicitor mediated induction of
tryptophan decarboxilase and estrictosidene sinthase activities
in cell suspension cultures of Caharanthus roseus. Archives of
Biochemistry and Biophysics, 254, 26684-26690.
35
Facchini , P.J. , and S.U. Park, (2003) Developmental and
inducible accumulation of gene transcripts involved in alkaloid
biosynthesis in opium poppy. Phytochemistry, 64, 177-186.
Hagel, J.M., E.C. Yeung, P.J. Facchini (2008). Got milk? The
secret life of laticifers. Trends in Plant Science, 13, 631-639.
37
Huang, F.C. , and T.M . Kutchan, (2000) Distribution of
morphinan and benzo(C)phenanthridine alkaloid gene transcript
accumulation in Papaver somniferum. Phytochemistry, 53, 555-
564.
38
Lenz, R. , and M.H. Zenk, (1995) Purification and properties of
codeinone resductase (NADPH) from Papaver somniferum cell
cultures and differentiated plants. European Journal of
Biochemistry, 233, 132-139.
39
transfer enzymes of alkaloid biosynthesis in opium poppy. The
Plant Journal, 36, 808-819.
40
cultured cells of Eschscholzia ca/ifornica. Plant Physiology, 118,
349-364.
41
Samanani , N. , E.C. Yeung, and P.J. Facchini, (2002) Cell type-
specific protoberberine alkaloid accumulation in Thalictrum
flavum. Journal of Plant Physiology, 159, 1189-1196.
Samanani, N., S.U. Park, and P.J. Facchini, (2005) Cell Type-
specific localization of transcripts encoding nine consecutive
enzymes involved in protoberberine alkaloid biosynthesis. The
Plant Cell, 17, 915-926.
42
Schumacher, H.M., and M.H. Zenk, (1988) Partial purification
and characterization of dihydrobenzophenanthridine oxidasa
from Eschscho/zia californica cell suspension cultures. Plant
Cell, 6, 410-413.
43
Unterlinner, B., R. Lenz, and T.M. Kutchan, (1999) Molecular
cloning and functional expression of codeinone reductasa: the
penultime enzyme in morphine biosynthesis in the opium poppy
Papaver somníferum. The Plant Journal, 18, 465-475.
44
opium poppy, Papaver somniferum. The Proceedings of the
National Academy of Sciences USA, 101, 13957-13962.
Zulak, K.G., A.M. Weljie, H.J. Vogel, and P.J. Facchini (2008)
Quantitative 1H NMR metabolomics reveals extensive
metabolic reprogramming of primary and secondary metabolism
in elicitor-treated opium poppy cell cultures. BMC Plant Biology,
8, 1-19.
45
46
CAPÍTULO 2
MATERIALES Y MÉTODOS
2.1. OBJETIVOS
Objetivo general
Objetivos particulares
47
2.2. HIPÓTESIS
48
Aislamiento de los ADNc de NCS y BBE 1
1 de A. mexicana
1
1 RT·RCP 1
L Obtención de sondas 1
1
l Análisis molecular 1
1
.¡.
1 Redundancia genética 1
1
Análisis de expresión
1
r
Expresión tejido Suspensiones celulares
específica en plantas
1 1
de campo 1 Inducción JA, SA 1
1 Ralz 11 Hoja 11 Tallo 11 Cápsula 1 l
Curso temporal de la 1
activación transcripcional
1
2.6. REFERENCIAS
50
CAPITULO 3
3.1 . INTRODUCCIÓN
53
3.2.3. Amplificación de los fragmentos de ADNc de la NCS
y BBE a partir de retrotranscritos (RT-PCR}
La síntesis de ADNc se realizó por transcripción reversa
utilizando como molde 5l-Jg de ARN total de diferentes tejidos
(ver resultados), 1O l-JM de oligo-d(T) y (1 O U/l-JI) de
transcriptasa reversa (M-MLV; lnvitrogen), de acuerdo a las
instrucciones del proveedor. El ADN de cadena sencilla así
formado fue sometido a la reacción en cadena de la polimerasa
(PCR) para el aislamiento de los ADNcs parciales
correspondientes a la NCS y la BBE. Se utilizaron 1O l-JM de
cebadores específicos (Cuadro 3.1) y (0.5 U/l-JI) de Taq ADN
polimerasa (lnvitrogen). El producto esperado para la NCS
correspondía a un fragmento de 305 pb utilizando los
cebadores NCSF y NCSR (Cuadro 3.1 ). El programa consistió
en 30 ciclos con etapas de 30s cada una a 94 y 50°C, y de 1
min a 72°C, para la desnaturalización, alineamiento y
amplificación, respectivamente, precedidos por una etapa de 3
oc
m in a 94 y finalizado con otra de 1O m in a 72°C.
54
Cuadro 3.1. Cebadores empleados para la amplificación de los ADNc
parciales de la NCS y de la BBE en Argemone mexicana.
B
Amplificac ión del extremo 6'
--
Cebador 6 · Gene Racer
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - T T TTTTT-(Nhe
Primera cadena de ADNc - - Cebador especifico NCS, BBE
56
Cuadro 3.2. Cebadores empleados para la amplificación de los extremos 5"
y 3" de la NCS y la BBE en Argemone mexicana .
58
A
... ...
... ...
[::::J NCS P.o ... ...
-NCSAm
B BBE
P . sorm iferum E!WTIRLRSGGH
E.califomica G,; WTI RLRSGGH
B .stolonifera G,WTIRLRSGGH
T .flavum G WTIRLRSGGH
Consensus GSWT 1 RLRSGGH '
a.a.
99 a .a. 475a.a .
NCS BBE
A B
1000pb
300pb
60
~ ~
. 1 1
A NCSAm1 GDGGVGTVLD 1VFPPGAVPRCYKEKF 1Ñ 1 NKKRLKEV 1M 1EGGYLOMGCT 51
NCSAm2 GDGGVGTVLDIVFPPGAVPR~YKEKFVKINN~KRLKEVIMIEGGYLOMGCT 51
Coo~n~ sGOGGVGTV L DIVFPPGAVPR'YKEKF''I'N"KRLKEVIMIEGGYLOMGCT
60 80 ·100
1 1 1
NCS.Ail\1 Y DR 1HV 1~KTPNSCV 1kss 1 1YDVK~EYAE~MSKL 1TT 1 PLKSMAEV 1 101
NCSAm2 SYriDR 1HV'LEKTPNSCV 1ESS 1 1YEVK~EYADEMSKL 1TT PLKSMAEV 1 101
Coo~nsu s ' Y' DRIHV' 'KTPNSCVI'SSIIY'VK'EYA' 'MSKLITT'PLKSMAEVI
20
1
B BBEAm1 WTIRLRSGGHSYEGLSYTADTPFVLIDLMNLNRISIOI
40 60
1 1
BBEAm1 DSETAWVESGA TLGELYYA 1TEL TDSLGFTAGWCPTVG
80 100
1 1
BBEAm1 SGGHISGGGFGMMSRKYGLAAONVEDVILIOSRGAILD
m 1~
1 1
BBEAm1 RKLMGEDVFWAVRGGGGGVWGAIYAWKIKLLPVPKKVT
1ro RO
1 1
BBEAm1 VFRVTKNVNIEEASFLIHKWQYVADELDDDFTVSILGG
~o m
1 1
BBEAm1 ANGNEVWVIFLGLHLGCKTVAKSI IDKKFPELGLIEEE
2co 2ro
1 1
BBEAm1 FLEMNWGESFAYLSGLKTVKELNNRFLKFODRAFKTKV
280 300
1 1
BBEAm1 DFTKETLPLEAIOGLLEILSKEPRGFIALNGFGGKMSK
no ~o
1 1
BBEAm1 ISNDFTPFPHRKGTKLMVEYIVAWSKDEESRSDEFFDW
360
1
BBEAm1 LRNIYDYMEMFVSKNPRVGYVNHIDLDLGRIDW
NCSAm1 77 81 60
NCSAm2 86 87 58
NCS1 P.s, NCS2P.s (P. somniferum); NCSC.j (C. japonica) ; NCST.f (T.
flavum)
62
1111 1211 uo 1!0
1 1 1 1
NCSaml • • •GOGGVGTV LO 1VFPPGAVPRQyKEKF ltl ONK_KRL KEV Ul l EGGYLP.,GCUYLOR 1Hy 1~KT PNSCV 1KS S11 YDYK EY 81
NCS.A.rn~ • • • • GOGGVGTV LO 1VFPPGAVPR~YKEKFV 1HNEKRLKEV 1M 1EGGYLOMGCTSYMOR 1HHEKTPNSCV 15SS 11 YEVKi EY 81
P.somNCS~ OV I'E,GÑGGVGTV LO 1VFPPGAVpR.YKEKFVff 1~HEK~LKEV 1M 1EGGYLOMGC T~YMOR 1H FEKT PNSCV 1ES S11 YEVK EY 166
P.sornNCS1 OVI'AG~GGVGTVLOI,FP GAVPR~YK EKFVKIÍIHEKRLKEVVMI EGGYLOMGCTfYMORIH FEKTPNSC Yi'ESS IIY EVK EY 166
HavuroNCS E11 •GOGGVGT 1LDIITFXPGEFPHEYKEKF f LVONEHRL K~V QMI EGGYLOLGV T YMO I 1HVVPTGkDSCV 1KSSTEY~VKPEf 167
P.somPRIO DVVEG~GGLGTV L~~YY,P~GSVPLSYKEKFVTIIONHKRLKEVRQ 1EGG YL EMGCTF YMOSFQ 1LKKTHOSC T1RS 1TK YEVSAEL 127
CjapNCS Ell· GOGGEGS LOIITF PPGQFPH~ Y REKFVFFOHKNRYKLV EQ 1DGJ!.FFOLGV T~YMO T1RVYA GPDSC V1KSTTEYHVKfEf 163
Conseosus OV 1• GOGGVGTV LO 1VF PPGAVPR ' YKEKFV ' 1ONEKRLKEV 1M 1EGGYLOMGCT ' YMOR 1HV' EKT PNSCV 1' SS11 YEVK ' EY
%identidad
BBEAm 79 77 67 65
64
"r ~f 'tr
9!16Aml •••••! . ••• •••Wflll
SOOHSYfOLS r'AO·f,,\1 IDLMNLNitiSliO '3*
~ 'AKPllfiKI'SPIV~POSK!I!li!ITVHCCTIIISWTIIt SOOHSYfOLS TAOTffV VDUMNLNltiSIDV 134
e 1r>0 'QttUIII(PS~IIVOSKIILII(TIIlCIIt~OSWflll ' SOOI.SYI!Ols TIOTP,ILIOU~NLNit~SIOL ~~
8~ l'ltra HIIPKtPIIPS~III.PQ.IK!fi.AAIVVCIMIIOLWTIIt SOO.HSYI!Oll . IIAIHffYVIOl,loiNLNitiSIO\ 1:'8
""" r'I'IICfr OP8VIILPIISIIOQ~AI! 1 CCTitOSWTIIl J·OOHSUOL ·S AOjfPrYIID~MNtNOISiO\ 1~
Cctlw<~M Hit' t• 'Kt$ " 11 LPOSKUl'!IT" ·CCT"'9SWYllt S<lqfiS.VIOL 'S 'fAPTPP'V ' 1 OUÍNLNitl SI DL
~lil' •
1 ' 1 1
tnj ~S!TAWVI!SCIATLOI!LYYA I Tfi:~DlLOPTAOWcP'rVOSOOHI SOOCIPOMNSilWYOLUONY:lD l'i. 1OÍ IDil
P lilm>l•~m UITAWVI$0ATI.OIIL V'tA IAQSiJOJi.Oflll>AOWCPTVOSOOHI SOOOPOMN$1ti(YOUAO!IVYDA: 1L 1OS ~05
E . 1M:1 IS!TAWYI!SOiTLOI!L.Y'rA 111!¡SSII(LG,fAOWCP 'ÍVOlOOHI SOOOfOii!MlRII'tOUADNYVOA ILIDA 2ó2
!l •slic TAWVUGA TLOI! hCA IUnOTLGPJGGYCpTVO. SOOH 1SOOOfOMNSRKYGUAONY DA_ ~ 1~DA 1
T~ OTOf,l.,-yUOATLOI! YHAIIIISSGJNA,I.AOJCPT.fGSOOHI AP.OGfOMJoo!SIU<YOLAADIIVVOA!oilYOA
COn.xi\SII'i • IITo\WYtU&TLOI!L VYAO!!S$0TLOPTAOWCI'TVOSOOHI $00010WISIU!,YOLAAONVVDo\ lll 011
IIEJ;ml ~
~ I' I.:IQII~t,;li4~DVP'WAVIIGOGOÓVWOArvAW!<
\ '
1Kt LPVPKI(Y TY''IIVTKNV J)'U tCASPL HKWOVVAD1 111
P.- ~ lfOA 1~ORI!IQtGOOYrVJ~ IR04~04YW~ 1 't:AWKIKUJIIVI'Ifl< YV.fltVTKNV ·OIIDASIUH)(WQ'tvAO 21S
NOAILOR.CWoiQI!DYfÓWAI R04004VWO•I YAWII J Klí.,VPIKYJV'RYTI(NY · 11 1QUTI .lLHI<WOfWIII ,7,1
JI·• • NOA'VLORI$1¡101!DV 1WA 'llt04000VWO'-I YA~LOU PV 'Kit YJVI lCLMI<NUNI tU SICIIL HKWOVYAP. ~
tN\'1 NOVVL01t.fSii41!0YfWA IIIOOOOOVWOA '(AWI(L~I. PY,.(NYT 'IILM!<Iiii•VI!DASI(I.LH!CWOI.VAP 14'
Ql.\itA HOA 1 LOIU!SMQI!OV:FWA 1AOOOOOVWQA 1'I'AWK 1KlVVPKKY tYrltYTKNV ·N ti!US• HHKWO'I'VA '
• »>
1 1 1
S&eAi'!ll I:LbDOflQS LO GANO NI .Wf HOLIHt.OCKJUICS liOICK~'ILGl ii!IIP:LI~OIS,·A'VL.JGl. l(f .~
,. 4'11111 flDIOf T~SVL· OOJNOND··WliiHOLI!I:.GaK_OA4Klii · QlKfPI! • LOl VDIII,Q!IolhiOU ... :PL(OLOT ..J4~
' !l'IQ lLUOftlSVL·OOAOIIS'O • WwL Tli!LO:PHI!GLIIU'AI<UPOJ,L;p.LGLYeiOrLI!MSWOUFAYLAOI,.'ff Q
8s~~~ ALI!OOFTLSYLAOAOTNO · JWPIFLOL~LG'KILAISIVOQNf'I!LNLYMI!OCIII!MSWYI!SFAIILAOLNI l~
l ~LI!OOfiL YLAG~HKOIIIWLTfLOLYLOI'KIL:AISJ'"KKfJIIILNLlLI!OCIII!MSWYI!ATAILAOLKI 3n
(01!1:1' IL I!DOnLS'Y l ·GOANGH • • 'WL. TtlOLH~GPK" 'Al(f•tOKK,I!LOL'YI!fO• LIMSWOUFA YLAOLI(T
'f . . f . ' .
80EAI'JII YKI!LNNRfll(fOO~fKfKVD,_TK~I llU~' G U UI(E,PROF IALHOfOOKIIISK i SNOf fpf.PifAK ll&
. 1
P ~-111'1 ' SILNNitfLKPDIIlMKTKYOHI(JI i'LN-PIHAUI!IL$10)0Gf' IAL!IOF'OGICMSII'STOffPU!Hiti< ~~q
eo/ló(I'Í(i YS!OLNNRfLK,Ot:IIAfKTKVO TKI!PI.\Pti(AP.YOj.l.•l!lt,LSKI!PIIOF IIUNOf'OOQMSK I :SIIi' TPrPHIII ~ l O
9 ...~~ V,IIWHNIIFli<.OOIIA'I<TKVOf!IKIP 1 PLIIII 0Allllt TKfLitGf~1NOQ041.N,SIII UOITPPPHAK >107
IMI VULIIDIIP LIUDOIIA rKTIIVO,I<E~Jr ,U8140AU 1L'ICI<fOilOf.,YMHOQOOIIaQIII t S'fD~Ii P f PHAI ~Oil
-
télt1 M>1t YSI!LNNitrLKfOOIIA,I<fKV:OfTKI!P" Pll!' 1 •.o .cu·• LSKI!PAGf IALNOfOOICMS • 1s• OfT,PHAK
1 ~1
89EAml OT~L~Ve\'1 'liiWIICOIIS8S01''DWI.IIIW. YOYMINfVSiCN.,_.'IOYVIiiU OL.OLOA ~
~1
• • • • • • • d1$
P lilitllltll.ttl OTICLMf.I!Y 1 fAWJIOOUSK fffiiWL"KHDYLIPrV$.KI'ItVG't'YNilfOL_ Ot OfiDWANKIIU,H·AV ~83
~ OT!iLM~IY 1VAwNQ,I!Q~I(I,C~e,I,OWLIK\iYI!,MK!'IVIICN,ALlOYYNHIO~OJ.O!I I OWONK111VtfN•~ 1 ~7P
9 !'lttll OTLIIMtl Y1VAWOIIDU~KS'tf' I~LIH.fTNY,MOQfj.I!I.P'R'IAYYNHII:DLOLORLDVÚNIT 1UN •.A 1 ~lB
l .tMI OT,L.MYI!Y 1YAwOKiti!ÍILttS•!if IIMLHQI,.PDY.IIOI(fVSNNPIIVOYVNHVDLOLORI DW NKT 115011¡\ 1 ~lB
<l<lnwmm GT 'LMYU 1YAW•' '01!.' SKI' U:~OWLHK.PYOYM•PPVSKNPAVGYYNHI DLDL"OR l OW' NICTI 'SN•A 1
A 5' 3'
NCS
300pb
B
BBE
600pb
-
Figura 3.7. Amplificación de los extremos s· y 3' correspondientes a los
ADNcs de la NCS (A) y BBE (B) por RACE.
66
extremos 5' y 3' respectivamente (Fig. 3.78). Estos fragmentos
clonados se denominaron p88EAm-5 y p88EAm-3.
La identificación de nucleótidos en los extremos y las
secuencias previamente aisladas permitieron la asignación de
la identidad de la NCSAm1 y NCSAm2 (Fig. 3.8 A y 8).
-
301 310 320 330 340 350
55
1--------+---------·---------·---------+---------l
CRTTGTTTTCCCTCCAGGTGCGGTGCCCgRRGRCRAGGAGRRRTTTG
25Jun CRTTGTTTTCCCTCCRGGTGCCGT
26Jun CRTTGTTTTCCCTCCRGGTGCCGT
26Hay TTTTCCCTCCRGGTGCTGTGCCC RGR CRRGGRGRRRTTTG
27Hay TTTTCCCTCCRGGTGCTGTGCCC RRGR CRAGGRGRRRTTTG
67
,. ..
:
1 1 1
..
NCSAm2
Co nsens us ATCAAATCATCTATCAT • TACOACOTOAAAAAAOAOTATQ • COA • ocTATOTCTAAA • TA
1 1 1
NCSAm1 AT ~ ACAACCA~ACC~TTOAAATC ~ATOTC ~ OAAO ~ CATCOCTAATTACOTTCTTAAOAA~ 120
NCSAm2 AT m ACAACCPCACC.TTGAAATCCATOTCQCAAOACATCOCTAATTACOTTCTTAAOAA~ 119
Conse1s us AT•ACAAcc •• AcC • TTOAAATC•ATOTC•oAAO•cATCOCTAATTACOTTCTTAAOAA•
'"" 1 1 1
~::~~~~~~~::~:::~~~:~~~:6:~:i~::~i~~::~i:~6::~:i6:~6i~:ii6:
NCSAm1 160
NCSAm2 179
Consensus CAATCTOT•ATAAQ • AAOQ • AOTTACATATOAATTOOAAOTACCA • CATCAOCTOATTCA
200
1 1 1
NCSAm1 ATTTOOOCAOTTTAtiAGTTCACCCAACATTCCTACACTTCTAAOAOATGTTCTACTTCCT ~O
NCSAm2 ATTTOOOCAOTTTA~AGTTCACCCAACATTCCTACACTTCTAAOAOATGTTCTACTTCCT ~9
...
Consensus ATTTGOOC AOT TTA * AOTTCAC CCAA CATTC CT A CA CTTCT AA CA OATOTTCT AC TTC CT
1 1 1
~~~~~~~~~~::::~o~:~:~~~~:~~~:~~~~::~~~~~~~~~~~~::~~~~~~~ ~~:~
NCSAm 1 300
NCSAm2 299
Consensus OOTOTTTTTOAAAAO . TAOATOTOAT • oAOOOCAATOOTOOTOTTOOAACTOTTCT '"' OAC
NCSAm1 360
NCSAm2 359
Consens us
1 """1 1
1 1
NCSAm1 TCJ:TCTAT jfATTTACOA l:; OTOAAA'A;AAOACTATCCQ:OA O;li:TATOTCTAA-. -TAATCACA !540
NCSAm2 TCOTC0ATTATTTACOA40TOAAA AAAOAOTATCC ~ OA ~ O·MATOTCTAA~ TAATCACA ~9
Consens us TC • TC .. AT • ATTTACOA · OTOAAA "'AAOAOTATOC • cA ... O .... ATOTCTAA • • TAATCACA
000
1 1 1
NCSAm1 ACC ~ TACCTTTOAAATCCATOTC ~OAAOT ~ATCOCTAATTACOTTCT 6 AAOAA m cAAT ~ 000
NCSAm2 AC C0,TACCATTOAAATCCATCTCACAAOT ¡T'ATCOCTAATTACOTTCT AAOAA~CAATTC 599
Consensus ACC*TACC"'TTOAAATCCATOTC .. OAAOT"'ATCOCTAATTACOTTCT*AAOAA • cAAT"" ..
NCSAm1
1 ""1
CICAciTTT ATACTTCACCCAACATTCCTACAA TT CT CAO'iio~ T'iiT \"¡ CT OC:TTCC Í'i OOTOT T 720
1
NCSAm1 780
NCSAm2 73~
Consensus
NCSAmt 840
NCSAm2 780
1 1
...
Consensus TCCCATCCAOOTA.ATTC '"'A ... o• A"' '"'A"' TA .. TT '"' TTT • CA'"' T"' TA •"' "' T • .. '"'TT"' • AT "' ""'
1
NCSAm1
NCSAm2 :~CAOCATACTAO~::~~:~~:~o::~~ É ~:;ATAOT~~~~O~~::~:~~~:::~~~~~~ 900
02e
Con sens us ATCACCATACTA . TAAC•ATOQ••AATT•c•"'ATAOTTC"'O*T ••• To • T • A•A."'•TTC •
NCSAm1 960
NCSAm2 864
Co nsens us
NCSAm1
1 1
dAAT ~ TAOXTT C AA ~ AATAA ~A~ATAA ~ TAA ~ACTATAe T o ~ AT TTT T TTO TTOCAA 1020
....
1
6"
3"
- ,..,
(
(
481
1
490 500 510 520
B8E8ft CTTGGIIGAACTCTRTTRTGCTRTCACTGRGTTGRCTGATTCRi
2Rll!l CTTGGAGIIACTCTRTTRTGCTRTCRCTGIIGllGRCTGATTCR TRG
37"11!1 CTTGGAGARCTCTRTTRTGCTRTCRCTGIIGTTGRCTGATTCII T
1abr
...
TTCR T
TTCR
530· 540
TlCRCfiGCRGGT
rrTCRCRGCRGG'T
TTCACRGCAGG'T
TTCRCAGCfiGGT
TTCRCRGCRGGl
1
-
550 560 570 580 590 &00
- - - -·- - - - - - 1
BBEatt GTCRTRTRRC¡l'GG TGGTGGTtTCGGTATGRlGTCG
2ttay GGGTCAlliTARGTGGTGGTGGTTTCGGTA TGRTG TCG
6"
[ 37itay
1abl-
TCRTRTAAGTGGTGGTGGTTTCGGTATGRTGTCG
TCAlATAAGTGGTGGTGGTTTCGGTRTGATGTCG
3"
[ 9abr """"._,......-TCRTRTARGTGGTGGTGGTTTCGGTATGATGTCG
B
481 490 500 510 520 530 540
3"
( 16abr
20.
TTCR TRG lTCACfiGCfiGGT
TT TTCACfiGCAGGl
6"
3"
- ( 4~
BBEatt
.._
[ 2o.br
16abr
-=~*
550 560 570
-·
580 5SO
TCRTRTRAGTGGTGGTGGTTTCGGTRTGRTG 1
TCG
RTRTAAGTGGTGGTGGTTTCGGTRTGRTGTCG
600
;r,GTCATATAACTr.GTGr.Tr.r.TTTr.r.r.TATr.ATr.Tr.r.
TCRTRTIIAGJ'GGTGGTGGTTTCGGTRTGRTGTCG
TCRlRTRRGTGGTGGTGGTTTCGGTRTGRTGTCG
1 1 "'
1 1
BBEAm1 ACCGTTAGA TG TTGCACAAGAGGA TC' TGGACCATT AGATT AAGAAGTGGTGC TCA T AGT T ATGAAGGA TT A TC{t T A T ACCGCAGAT ACAeCAT T TGTTC 3~
1
BBEAtn:l A eCO T T AGA TO TTGCACAAGAGGA TC TGGACCAT T AGATT AAGAAGTGGTGG TCAT AGT 1 ATGAAGGA TT A Te T A T ACCGeAGA T ACAeeAT TTGTTe 385
...
ACCGTTAOATO TTGCACAAGAGGATC • TGGACCATT AGA TT AAGAAGTGOTQOTCAT AOTT ATOAAOOA TT A TC • T A T ACCGCAOAT ACAeCATT TOTTC
1 1 1 1 1
BBEAm1
BBEAtn:l +:
~ ~: ~ :~: ~~~!: ~~:: +~~~:: ~~~~: +~ i~~: ii~: ~:~:~+~:~:::~:~~ ~+~~~+~~:: i~~~~~~g::~::++~~:~::g~gi: ii:~~g¡: ~ :::
1
...
1
...
TTATAGATTT • ATOAATTTGAATCGGATTTCTATTOATAT "GA • TCAGAAACAGCTTGOOTTGAATC"OGTOCAACA" TTGOAGAACTCTATTA • oc· AT
1 1 1
BBEAml CA'CTGAG TflACTGA T TCATT AGOA T TCACAGCAGGT TGGToeec T AeTOT TOO TA. TGGGGG TCA T AT AAGTGGTGG TGG T T TCGG T A TGA TG T CGAGA 589
BBEAtn:l CAQTGAG T ACTGA TTCAT T,GGGA TTCACAGCAGGT TGGTG CC T ACTGT TGG TA:C:TGGGGGTCA T A T AAGTGOTOOTGGT T TCGG 1 A TOA TG T CGAOA 585
ConltiiSUI CA • TOAG T • • AC TOA TTCAT T • OGA TTCACAGeAGGT TGGTO • CC T ACTOT TGG TA • TGGOGG TCA T A T AAOTGGTGOTGGT TTCGG TATG A TG T CGAGA
1 1 •1 *1 m1
BBEAtnl AAA T ACGGTCTCOCAGeeGA T AAeGTCGAAGA TGTÓAT TCT T A T ,_GA T AGT AAiGGTGCIATTC T AGA TCGT AAA ~ T AA TGGG TGAAOACGT TT T TTGGG M9
BBEAtn:l AAAT ACGGTeTCGCAGCeGAT AAeGTeGAAGATGTJ:A T TCT T A TAGA TAGT AA~OGTGCW,A TTC T AGA TeOT AAA, T AATGGGTGAAGACO T T T T T TGOG 685
AAA T ACGGTe TCGCAGCCOA TAACGTCGAAOATOT • A TTCTT ATAGATAOT AA • GGTOC • ATTCT AGA TCGT AAA • T AA TGGOTGAAOACGT TTT T TGGG
"'
1 1 1 "'
1
88EAm1 CGO T TeGCGO TOO TGGAGOTGO TG TTTGGGGTGeAA T T TACGCO TGGAAAA TCAAA TT AT T AeCeG TTCeAAAAAAGGTGAeGG T TT TTCGCGT AA i: GAA 791
BBEAtn:l CGGT TeGJjGG TGGTGGAGG TGG TG TT TGGGGTGCAAT TT lCGCG TGGAAAA TCAAATT Al TACCCG rteCAAAAAAGGTGACGGT TT T TCG CG T AAfrGAA 7a.5
..1
COOT reo· GGTGO TGGAGOTGG TG TTTGGOGTGeAAT TT AeGCOTGGAAAATCAAATT AT T ACCCO TTeCAAAAAAOGTGAeGGTTT TTCGCGT AA • GAA
"'
1 ...
1 1 1
BSEAm1 AAAeO T AAAT ATeGAAGAAGC T TeA TTT T T AATTCACAAATGOCAA TA TOT TGeAGA TOAACT AOA TGA TGA T T TJ ACtGT Af. CGA T TCTCGG:fGO TOCe 8~
1
BBEAtn:l AAAeG T AAAT ATCOAAGAAGC T T CATTT T T AAT T eACAAA TGOCAA TATGT TGCAOATGAA T T AGA TOA TOA T T T:G_AC GT A.:CGA T TCTCGGCGG TOCC 885
AAACG T AAAT ATCGAAGAAGCTTCATTT T T AA T TCACAAATGGCAA TATGT TGCAGATGAA • T AOA TOA TOA 1 T T • AC • Gl A • COA T TeTCGG • GG TGCC
~ 1~
1 1 1 1 1
SBEAm1 AA CGOAAACGIAGTGTGGlt ATATTCTT AGGTTTAeA TTTAGGATGTAAAACCGTTGCGAAATCTATAAT~GATAAAAA:GTTCCCGGAAT TAGGG TTAA m
- -
BBEAtn:l AACGGAAACGJlAGgATGGiiTAGTATTCTTAGGTTTACA TTTAGGA TGTAAAACCGTTGCGAAATeTAT AATIGATAAAA tGTTCCCGGAAT TAG GG TTAA 085
AACGGAAAeG • AG • • TOO • T • • T A TTeTT AGGTTTAeA TTT AGGA TGT AAAACCG TTGCGAAA TCT Al AA T • GAT AAAA • OT TeeCGO,.ATT AGGOTT AA
1 1 1 1
BSEAtn1 l(!OAGGAAGAATTT TTGGAAA TGAATT GGGOTGAA TC TTTGCTT ACTT ATCAGGATT AAAAAeAOTT AAOOAA TTOAA-eAA T AG O T T TTTGAAA[T TTOA 11m
BBEAtn:l T 'OA~GAAOAA TTT TTGGAAA TOAATTGGGGTGAA Te TTTGCTT ACTT A TCAGGATT AAAAACAG TT AAGGAA TTGAAJAA T AGO T T TTTGAAA ~ T TOA 1015
T • OA • GAAGAATT T TTGGAAA TGAATTOGGGTOAATe • TTTGeTT AeTT ATCAGOATT AAAAAeAOTT AAGOAA TTOAA • AA T AOO T T TTTOAAA • TTGA
~1
1 1 1 ""1
8SEAm1 T GAT AiAGCT T TT AAGACAAAAGT TOA TT TT AC T AAAGAAAeATT ACCA. TT A8AAGi:OATT8A TGGTTT AlTA GAGA T TTT A T CGAAAOAGCCACG TGGII 11tt
1
BBEAtn:l T GAT A@AOC T T TTAAGACAAAAO T TOA T T TT AC T AAAOAAACAT T ACCA T T A AAO OATT AA TOO TI T AT T AGAOA T TTT A TCOAAAOAGCCACO TOO~ 1185
TOAT A • AGCT T T T AAGACAAAAGT TGAT T TT ACT AAAGAAACATT ACCATT A • AAG • GATT • A TGOT • TAl T AOAGA TTTT A TCGAA~OAGCCACO TOO •
1220 1)40
1 1 1 1 1
88EAtn1 T TTATC GTTAAATiGT TT~GGAOGAAAAATGAGTAAAAT T AGTAA GATTTTAeTCCITTTeeTCATCGTA ~'QGGTA.CCAAATT A. TGGT GAATATA 129i
BBEAtn:l T TTATC GT TAAAT GTTTfGGAGGAAAAATGAGTAAAAT T AG T AA GATTTTAerccinreCTCATCGTAAJ¡GG T ACCAAATT~ATGG T GAATATA 1285
T T TATe • • GTT AAA T • GTT T • GGAGOAAAAATGAGTAAAATT AGT AA • OA TT TT ACTCe • TT TCC TCATCG T AA • GGT AeCAAATT • A TOGT • OAA TATA
1 ""
1 1 1
88EAm1 T AG T TGCTTGOAO T AAAGA TGAAGAA TCAAAGAGCGACGA.ATTCT T TGAT TGGT T ACOT AAT A T T T A OAT TATA TGOAA f.G T TCO T ATCGAAAAACCC 1Jtt
1
BBEAtn:l T AOT TfeTTGOAG T AAAGATGAAOAA TCAAAGAOCGACGAATTCT T TGAT TGG T T ACOT AAT A T T T A GAT TATA TOGAAG~G TTCG T A TCGAAAA A CCC 1385
T AOTT • CTTGQAG T AAAGATOAAOAATCAAAGAOCOACGAATTCTT TOA. T TGOT T AeOT AAT A T TT A • GATT A T ATOGAA • • GTTCO TATeGAAAAACCC
8BEAm1
1 1 1 1 1 ""
AGAG TGGGT TATO TT AAT,dA T A T TGATC TTGA TCTCGGAOGAA T AGAT TGGAG TIA f •AAAAA T AGTTCT AACAA ro ceA TTGAGA T TGC ~,A GAAA TTGG 1-49V
- - - - -
BBEAtn:l AGAG TGGGT TATO TT AA TAA T A T TGATC TTGA TCTCGOAOG.U T AGAT TGGAG TAAgAAAAA T AGTTeT AA AATOe i'AT TGAGA T TGC GAAA TTGG 1415
• AOAO TGGGT TATO TT AAT • Al AT TOA TC TTGATCTCGGAGOAAT AOATTGGAOT • A • AAAAA TAO TTeTAA • AATGC • A T TGAGA T TGC • AGAAA TTGO
1 1 1 1 1
BSEAm1 GG TGAAAAA T A T TT T T TATe AAA T T A TGAACOT TT AA TT AOGGC T AAAACAT TOA T TGATCCT AA T AA TITT T T T AA TCA TCCACAfJ'AGT A T AC C TC CAA 159V
BBEAm2 GOTGAAAAATATT T TTT ATCAAA T TATGAACG TT TAATTAGGGCTAAAACATTOA TTGATCCT AATAAT TTTTTAATCA T CCACA l AGT ATAC C TCCAA 1585
Consensus GO TOAAAAAT ATT T TTT ATeAAAT T ATGAACGTT T AA T T AGGGC T AAAACATTGA TTOATCCT AA T AA T • Tl 1 T T AA TeA tecA.eA • AGT A T ACCTCCAA
1CO 10«:1 •• ll'OO
1 1 1 1 1
BBEAm1 T GA TGAAA T~T T,A T AA TGT TGA TOA TGAGAAAA,TTTGAAG T TAC A TG~TGA TeAAOGAAATGT AAT T T TT T ~A • ••• TTG T AATT T AAT AAAT T ATTA 16DS
BBEAtn:l TGA TGAAATTiT,IATAATGTTGATGATGAG .... • TTTGAAOTTA • TG.fiTGATCAAGGAAATOTACTTTTTT AAT1ATTGT AATTTAATAAATTAT& G.I 187i
Conttnws TGA TGAAAT • T • ATAATG TT GATOATGAO" AAAATTTOAAGTTACATG" TGA TC AAGOAAATGTA • TTTTTT • AATTATTGTAATTTAATAAATTAJ• • •
1"'
88EAm1
BBEAtn:l
Con&ttl lü&
3.5. REFERENCIAS
71
Facchini, P.J., C. Penzes, A.G. Johnson, and D. Bull, (1996)
Molecular characterization of berberine bridge enzyme genes
from opium poppy. Plant Physiology, 112, 1669-1677.
72
benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis. The Plant Journal. 40,
302-313.
Samanani, N., S.U. Park, and P.J. Facchini (2005) Cell type-
specific localization of transcripts encoding nine consecutive
enzymes involved in protoberberine alkaloid biosynthesis. The
Plant Cell, 17,915-926.
73
74
CAPITULO 4
CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE LA
NORCOCLAURINA SINTASA (NCS) Y LA ENZIMA
FORMADORA DEL PUENTE DE LA BERBERINA
(BBE) EN Argemone mexicana
4.1. INTRODUCCIÓN
76
cajas Petri, sobre papel toalla saturado con una solución de
100 mg/L de ácido giberélico (Sigma Chemical Co, USA), en
condiciones de oscuridad y a temperatura ambiente (Karlsson
et al., 2003). Después de aproximadamente cuatro semanas,
se detectó la emergencia de la radícula y dos semanas
después, las plántulas, de entre 1.0 y 1.5 cm, fueron
transferidas, a medio PC (Phillips y Collins, 1979), pH 7,
suplementado con 25 g/L de sacarosa, a 25°C y bajo luz
continua entre 40 y 50 ¡Jmol m·2 s·1, suministrado por lámparas
fluorescentes de 39 W.
78
4.2.5. Determinación del número de copias de la NCS y
BBE por hibridación tipo Southern
79
paquete BLAST (Basic Local Alignmnent and Search Tool;
www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST). Para el análisis de dominios se
utilizó el paquete SMART (Simple Modular Architecture
Research Tool; http://smart.embl-heidelberg.de/), mientras que
para la comparación múltiple de las secuencias de ADN, se
utilizaron los programas Multialin
(http://bioinfo.genotoul.fr/multalin/multalin.html) y CLC Main
Workbench (CLCBio Software).
El análisis filogenético se realizó con el programa CLC Main
Workbench (CLCBio Software). La búsqueda del árbol se
realizó utilizando el método de neighbor joining, y se evaluó la
robustez con el método bootstrap, utilizando 1000 repeticiones.
Las secuencias utilizadas para los alineamientos, comparación
y análisis filogenético se presentan en el Cuadro 4.2 .
81
Cuadro 4.2. Relación de secuencias utilizadas en los análisis de
comparación y filogenéticos.
20 40
1
NCSAm-1 MSKL I TTIP L KSMSE IANYVLK SVIRK IIVTYELEVPTSADSIWAVYS 50
NCSAm-2 MSKL 1 TT AP L KSMSE 1AN YVLK SV 1RK VTYE!LEVPASADS IWAVYS 50
NCSAm-1
NCSAm-2 L..::.:...:..:....:..:.....:..::...:.:..:..:....:...:.:.::...;:;;.::...:..::~.:...:....:....:..::==-:..;:...:...:-=..:...:..;:..:...:.-=.:~=~~
85
Cuadro 4.3. Porcentaje de identidad de las secuencias de aminoácidos
deducidos de la NCSAm1 y NCSAm2 con secuencias reportadas para la
norcoclaurina sintasa (NCS) de P. somniferum (Ps) y T. flavum (Tf),
proteínas de patogénesis (PR1 0), proteínas con unión a citocininas (CSBP)
y proteínas alergénicas Bet V1 (MAP).
Proteína 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
1. NCSAm1 61 50 50 30 31 27 25 14 13 14 12
2. NCSAm2 75 74 39 39 33 30 17 16 16 14
3. PsNCS1 89 38 37 31 28 15 15 17 15
4. PsNCS2 38 38 34 27 16 16 16 15
5. PsPR10-1 30 28 37 19 20 16 15
6. TfNCS 59 28 18 17 19 17
7. CjPR10 25 15 15 16 15
8. PsPR10-2 23 22 18 17
9. VrCSBP 62 22 22
10. LICSBP 22 21
11. VpMAP 91
12. BpMAP
NCSAm.1
•
AOS IWAVYSS PA PTI.I.RDVLI.PGVFEKLOV 1 E 'ILO•I VFPPG - AVPR«:¡YKE'KF
• 100
NCSAI!r>-':! A0$1WAVY$SPNlPTLI.RDVLLPGVFEKLDV 1 E VI. DI VFPPG · AVPRRYKEKF 100
PsNC$1 AOS IWÑVYSSPDI PRI.I.RDVI.I.PGVFEKLOV 1 V L 'O·I FPLG - AVPRRYKEKF 111
PsloiCS2 AOSI~VYSQPOIPRI.I.RDVI.I.PGVF .QKLOV 1 E · VI.OIVFPPG - AVPR YKEKF 1 11
P.-10.1 AODVWAVYS&POL PRI. 1 V& •'- L PGVF"·KKI OV E VLHLVIWI Pt1G • • VP 'L .YKEKF 72
TrNCS AORIWTVYSWPOLAKHLPD L~ • GAF"EKL&I 1 • 1 L OMTFVPG - &~PH&YKEKF 11a
CU'\R10 AO&VW8VIiiQSP&LOLHLPOilLP ... G F"JU(F& 1 T• 1 L IOMTFPPQ - QFPHHYREKF 108
Ps~lO..~ AO&IWAVYfjiSI<DLPt!iL 1 1 • LAPGVFEKI OY 1' E 1 L'RI VIIAQG .. &PR~EKF 74
V.CSBP L&AC:WAVLS·KD~ITVVPKVL·PHlVKDVO lE 1 IFNn.; P V8~·-YORE&I 71
L.JCSSP J.&ILwdJlMS-KDLNYITj:il( ·PNIVKDVICV I E IL ·L TFD.DV8PV.YQREKI 72
e.~ AARL~KAFIL&O ~ DTLIPKVA·POAI88V&NIE II( KI FP&G-~P-KYVKERY 72
~ AARL~KAF LDG DKLYPKVA·POAI&&V&NtE
. -:o ·r 1 Kl FP&G~~F-KYVKQRY
,., n
A DNKKRLKE"fl M 1 EGG LOMGCTYY O . 1 H\1 A.KTPNSCV 1 K 'S S· 1 1 Y'QVKREYA.E.I(M 100
VI(INNEKRLKEV~M I EGGYLOMGCT&YMORIH~&KTPNSCVI SSIIY•EVKQEY... D&M 1(10
HC$Ann.1
NCSAm-2
PsNC$1
PsNCS2
p·-·~·
1TNCS 2-10
Qf'R10 1
P.-\~ 161
V.CSBP
L.JCSBP ·~
158
e.~ 160
6I:¡MAP 160
87
Análisis de las secuencias de las BBE de Argemone
mexicana
La secuencia de la BBEAm1 mostró un marco de lectura
abierto de 1665 pb, que corresponde a un polipéptido de 554
residuos con una masa molecular de 62.5 kDa. Por su parte, la
BBEAm2 tiene un marco de lectura abierto de 1611 pb, que
corresponde a un péptido de 536 residuos, con una masa
molecular de 60.1 kDa. Se debe hacer notar que A. mexicana
es la primera especie productora de ABis de la que se logran
aislar dos isoformas para la BBE. Si bien en P. somniferum se
han detectado al menos tres genes, aparentemente sola la
(bbe1) logra producir una proteína funcional (Facchini et al. ,
1996).
Proteína 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13
1. BBEAm1 90 72 71 61 59 41 38 40 32 31 35 35
2. BBEAm2 71 71 31 32 36
3. EcBBE 66
4. PsBBE 60 57 42 42 33 36 36
5. BsBBE 68 43 32 34 36
6. TfBBE 42 40 43 31 35 37
7. NtBBE 46 45 31 34 38
8. OsFAD2 45 33 33 32 36
9. OsFAD1 35 37 36 39
10. AtFAD1 53 42 44
11. AtFAD2 39 40
12. CsCBDAS 45
13. NICOX
Las abreviaturas y la lista de accesión se encuentran en el cuadro 4.2.
89
4
~ 1° vvv ~
BBE.Am-1 ML TTVTMETKI TKNkYSSLF 111 FFFFFSVL TCALSDOI LSCL TSNGVHNYTTPSSDSNS 60
BBE.Am-2 ML IIYTMETK 1 TKNfXSSL F 1 • .... ffSYLTCALSPO 1LSC L TSNGVHNYTTPSSOSNS 55
~ 100
1 l
BBE.Am-1 OYLRL . HLS l QN PL FEKST 1SKPSL 1VL PJINKEELSN'TVRCCTRGSWTI R LR 20
BBE.Am-2 OYLRL HLS QNPLFKKSTI SKPSL IVLPgNKEELSNiTVRCCTRGSWTI RLR 15
~ ~ ~
1 . 1 1
BBE.Am-1 fi:SYTADTPFVL 1OLMNLNR 1SI O OSETAWVESGAT GELYYAI E TOS GFTAGWCPT 180
*
BBE.Am-2 ~YTAOTPFVLIOLMNLNRISIO OSETAWVESGAT GELYYAI E TOS GFTAGWCPT 175
~ m ~
1 1 1
BBE.Am-1 VGSGGH 1SGGGFGMMSRKYGLAAONVEOVI L 1DSKGAI LDRKLMGEOVFWAVRGGGGGVW 240
BBE.Am-2 VGTGGH 1SGGGFGMMSRKYGLAAONVEOV 1L 1DSNGA 1 L DRKLMGEOVFWAVRGGGGGVW 235
~ ~ ~
1 1 1
BBE.Am-1 GAIYAWKIKLLPVPKKVTVFRV KNVNIEEASFLIHKWQYVAOELODOFTVSILGGANGN 300
BBE.Am-2 GA 1YAWK 1K L L PVPKKVTVFRV KNVN 1EEASF L 1HKWQYVADELDOOF TV 1LGGANGN 295
m ~ ~
1 1 1
BBE.Am-1 EVWYI FLGLHLGCKTVAKS I I DKRFPELGL 1EEEFLEMNWGESFAYLSGLKTVKELN.NRF 360
BBE.Am-2 gAW FLGLHLGCKTV'AKSIMDKMFPELGL 1EEEFLEMNWGESFAYLSGLKTVKELNNRF 355
400 420
1 1
BBE.Am-1 LE ILSKEPRGF 1!LNGF.GGKMSK 1SNDFTPF PH 420
BBE.Am-2 LEILSKEPRGFI LN GGKMSK I SNOFTPFPH415
"0 400 400
1 1 , ..................................... ,
BBE.Am-1 Rl<GTKLMVEY 1V'AWSKOEESKSDEFFDWLRN 1YDYMENFVSKNPRVPYVN~ 1OLOLGG 1oj 480
BBE.Am-2 R,.GTKLMVEY 1VSWSKDEESKSDEFFDWLRN 1YDYME'~FVSKNPRVi3YVNN 1Ol DLGG 1o¡ 475
500 S20 '···································s;¡o
.l..........................
, ........................................................ .l.. ..................................................... 1
BBE.Atn-1¡ WSOKNSSNNA 1E 1ARNWGEKYFL SNY ERLI RAKTL 1OPNNVF NHPQS.I ~PMMK'II'lNVOOE 540
. '.
BBE.Am-21_.~~.~.~.~~.~.~.~.~.! ..~.!.~.~.~~.~~.~.r..~.~.~ .r..~.~.~ ~.~.~ .'!:.~..'..~.~.~.~.!.~.~.~.~.~.~ .!.~ PMM K NVo o E 535
90
B B EAm- 1 8 • eL TSNOVH
..
' 49
BBEAm_2 8 eLTSNOVH 44
EcBBE S .. eL T {e NOV.ft 37
P&B B E a l e LÑS'HOVH 41
TfBBE ~ ·eLT HOVH 33
B sBBE aaeLTSNOVJI 33
NtBBE CL c;:if:tÑVH 40
BBEAm-1
BBEAm_2
EcBBE
P e BBE
TfBBE
BsSBE
NtBBE
,..
BBEAm- 1 DSETAWVE80 ATLOELVVAI ' 164
BBEAm_2 DSETAWVESO AT OELVVAI 15 9
EcBBE SETAWVESO !JI TLOELYVAI 152
PeS BE SETAWVESO ATLOELVYA 1 1~
T fBBE D;"rCI TAWVESO ATLOE V'RAI 149
BaBBE
N tBBE
...' ...'
BaBBE OHISOOOFOM M&RKYOLAAD
N tBBE OHISOOOFO SRK OL.AAD A Oft LDRK ~ M 2 20
..
320
'
~~~ ~t:~=~
BBEAm- 1 &LbDDFT g a L --- ------ OCKTVAKSI DKKFPiiiLOL 3 31
BBEAm_2 E L'DDDFT &Ct.Jl L-- . - -- - - - OCKTVAKSIM DKMFPEL.OL. 3 26
~:~;~~~~=~
E c BBE EL • • DFTLSV L · • ••• ---- OLKTVAKS ,. DLL!FPELOL.V 3 19
PaBBE ELD.DFT st av
ML.DDF · L ~ V
L-- -.--.-- IWLT,.LOLrtJ L ~~~:~:; ~
D,.KFPELOLV
ti KKFPEL'NL
323
...'
TIBBE L -. - •• ---- 317
L- ---- - •- •
BaBBE A!L.DDFTLSV
NtBBE ~ L v;DDFTL - V
BBEAm- 1 E S P'AVLSOL -
...'
L j:.J!~lii> Q, _ J!~Q
IWPaFLOL~L
1
OPK.LlAfiia- ~
1!!;1FN<!!; L1!1l L OPKT. \11 \J SI .,
DFTKE\'I) L.PLE
31 6
339
362
B B EAm_ 2 ESP'AYLSOL · K•LNNRFLK DDitAF - KTKV OFTKE[lj LPL)t 377
E c BBE ESP'AYL ~ OL atiLNNR~LK~ o•JIÍi.AP-KTKV D TK&PL.- [¡I K 370
PoS BE E&MAJIL&OL - a•LNNRFLKF o•RAF - KTKV DFTK 1U~I PL.J!!I 374
TIBBE B~ A-· L~OL SIEL B QRI'L ll'i< DDfltAF ~ KTKV DP :P. KE~IPLE 368
DF~KEPIPLii
BeBBE
NtBBE
~lliO C LEILS
ESP'AHLA:OL -
ESA~ '!._fi· S·L ~
KE.-ROFIALN
.....,
' OPOOKMSKIS
t••MNNRFLKVi
&IIL.K.RVIII
...' DDRAF - KTKV
DCIK"P K Qi K
442
~~=~:=~~=;
BBEAm- 1
BBEAm _ 2 VINOVLEIL& KE.-ROFI LN . QQKMSK 1 S OTKLMVEYIV {j(WJI KDE.SKS 437
Ec BBE APYO L: L&kLa KI!.-NOFIALN O,.OOc:iMSKIS - D~TPFPHR. OT"LMVEVIV AWNQ.EQKKM 430
PsBBE V.II!RHALEMLS IIQ .. CIGFIALN OFOOKM&. IS TDIE"TPFPHRK OTKLM)!; EYI AWNQDE.SK 434
TIBBE OIQOAL.ILK KliQRG~MV:MN OQOOIIMDit18 "'iD'X8PFPHR. OTLaMVIiVIV AWI:iKH&D 8 &428
BeBBE
NtBBE
BBEAm- 1
OIKOALTML
oML :T.~ LV·L·
DEF li'DWLRN1
KE.LROFMA~N
...'
KNPKOV_..Ll V. II! D
YDYMEiíiFVSK NPRVOVVNHI
OQOOLMSI!,IS
Y.OO~M'bK 1'D' ~~~ I p~~~=~
DLDLO - OID-
...
1
~~~t:~~:~ 1 ~
AWDIItDEDAKS 427
awN••aa ~ Ka 4!57
~~~:::==~V~=
T IBBE NEFIHVVLHQ NPRVOYVNHO DLDL0 - 1( 1 0 -
BsBBE
N lB BE
BBEA.m-1
iVj EFIQWL~OP
DV M.W R~P:
IARNWGEKYF
YNTM Gf. P'FVS ~
LSNYERL
...,
fltA'
DPR . ~ VVNH
.Pft.G8V
KTLIDPNNVF
N L:
DLDL0 - :.0 D -
DMDLO ftMDD
NHPQSIPPMM
...'
BBEAm_2 IARNWOEKYF LSNYERLIRA KTL I DPNN F NH~QSIPPMM
E c BBE I :Jl R.WOE8YF L S N Y ERL RA KTL I DPNNVF Nt-tPQSIPPM "'
PaBBE IARNWOERY fl' jji SNYI!RLV A KTLID~NNV~ NH,.QSIPPMM
TfBBE IAR'i"WoEKYP IIIBNVQRLVRA KT~IDP:kNVF NHPQSIPP
LSNVERLVR.A KTLIDP NVF J"l! t-t~QSI,.~M !\
} :=~~=;~=
BsSBE
NtBBE L ,8 NYQRLV :8; A KTi;i iDP NVF l!jH.QSIPPML:
91
Recientemente se ha determinado que la BBE pertenece a una
nueva familia de flavoproteínas, la cual presenta un sitio de
unión bi-covalente del cofactor FAD formando un enlace 8a-
histidii-6-S-cisteinii-FAD, que aumenta el potencial oxido-
reductor de la enzima. Estos sitios de unión alFAD se localizan
en los residuos H1o4 y e1 66 , (tomando la de E. californica como
referencia) embebidos en dos dominios característicos (Winkler
et al., 2006; 2007). En este sentido, las secuencias
SGGHSYEGLS, con residuos H en las posiciones 116 y 111, y
AGWePTV, con residuos e en las posiciones 178 y 173, en
BBEAm1 y BBEAm2 respectivamente, corresponden a dichos
sitios de unión (Fig. 4.3). Esto confirma la naturaleza de los
ADNc aislados de A. mexicana como flavín-oxidoreductasas
con el enlace bi-covalente, típico de las BBE (Dittrich y
Kutchan, 1991; Facchini et al., 1996; Winkler et al., 2006;
2007). Los residuos H y e de los dominios de unión al FAD
son semi-conservados en otras flavoproteínas y
oxidoreductasas (Fig. 4.4) y se han descubierto en otras
oxidasas, como la hexosa oxidasa de Chondrus crispus (Rand
et al., 2006), aclacinomicina oxidoreductasa (AknOx) de
Streptomyces gali/aeus (Aiexeev et al., 2007),
glucooligosacárido oxidasa (GOOX) de Acremonium strictum
(Huang et al., 2005) y quito-oligosacárido oxidasa (ChitO) de
Fusarium graminearum (Heuts et al., 2008). Aunque estas
enzimas están involucradas en diferentes procesos
metabólicos, comparten las propiedades comunes de las
flavoproteínas bi-covalentes, en las que este tipo de enlace no
sólo participa en la modulación del poder oxidativo del FAD,
sino que favorece la estabilidad de la estructura proteica,
facilita la transferencia de electrones y previene la pérdida del
FAD oxidado (Leferink et al., 2008; Heuts et al., 2008; Huang et
al., 2008). En la BBE, el enlace 8a-histidii-6-S-cisteinii-FAD es
crítico para generar el potencial de redox necesario para llevar
a cabo la transformación de la reticulina (el sustrato de la
enzima; Fig. 1.3), ya que al afectarlo se observó una drástica
disminución en la eficiencia catalítica de ésta (Winkler et al.,
2007).
92
Además de estos dominios, cercano al extremo e-terminal,
entre los residuos 467 al 529 y del 462 al 524 para BBEAm1 y
BBEAm2 respectivamente, se identificaron los presuntos
dominios catalíticos, de acuerdo con lo reportado en P.
somniferum, E. ca/ifornica y B. stolonifera (Dittrich y Kutchan,
1991 ; Facchini et al. , 1996; Chou y Kutchan, 1998) (Fig. 4.3).
93
CbMAP
' - - - - - - - - AtMAP
LICSBP
VrCSBP
PsNCS1
.-------"''::.:.¡' PsNCS2
NCSAm2
NCSAm1
50S
TfNCS
CjPR10
PsPR10-1
PsPR10-2
40
' - - - - AoPR10
LePR10
CaPR10
StPR10
AgMAP
DcPR10
PcPR1
VqPR10
PcMAP
FsPR1
BpMAP
BvMAP
CaMAP
95
CsTAS
CsCBDAS
AtFAD4
AtFAD1
' - - - - - - - - AtFAD2
' - - - - - - - - - - AtCE
•nM i r - - - - - BsBBE
' - - - - - - TfBBE
BBEAm2
BBEAm1
' - - - - - EcBBE
' - - - - -- PsBBE
L---======-- NtBBE
' - - - - - - - - - - - - OsFAO
' - - - - - - - - - - - - CdFAD
' - - - - - - - - - - - - HaCOX
.----- AtFAD9
.----"'=i ' - - - - AtFAD6
2C1 ' - - - - AtFAD10
' - - - - - - - AtFAD3
GmFAD1
GmFAD2
' - - - - - -- - NICOX
1000 AtFAD7
AtFAD6
r - - - - AtFAD12
' - - - - - AtFAD11
' - - - - - - AtFADS
Figura 4.6. Árbol filogenético obtenido mediante la aplicación del método
neighbor-joining (método del vecino más próximo) utilizando la secuencia de
nucleótidos codificantes de la BBEAm1 y BBEAm2 de A. mexicana y de 28
proteínas relacionadas (las abreviaturas y la lista de accesión se encuentran
en el cuadro 4.2). Los números internos indican el soporte Bootstrap de
cada ciado.
Bam HI Eco RI
1 1
ú NCSAml L----!
' l~.--------------~~ •
BamHl
1
~ NCSAm2
pBBEAml-3
- -lSOpb
97
(Fig. 4.8). Este patrón sugiere la presencia de más de una
copia para este gen, ya que la sonda utilizada abarca un
segmento corto (menos de 400 pb) y si bien el gen
correspondiente a la NCS P. somniferum (ncs1; Acc.
FJ2000359 GenBank) tiene un intrón en la región cercana al
extremo 5,, éste es de solamente 160 pb. No es raro que
genes para enzimas relacionadas presenten una estructura
similar. Por ejemplo, dioxigenasas dependientes de 2-
oxoglutarato involucradas en el metabolismo de secundario en
Atropa, Catharanthus y Hyosciamus tienen la misma estructura
génica en cuanto al número y posición de intrones (Kanegae et
al. , 1994; Vázquez-Fiota y De Luca. , 1997). De este modo, es
posible que el gen de la ncs de A. mexicana presente un intrón
en la misma posición y tamaño similar que el de P. somniferum.
De ser así, sería poco probable la ocurrencia de más de dos
bandas de hibridación de EcoRI con una sonda que cubre una
región corta.
98
Extremo 5' Extre mo 3'
12
7.0
6.0
5.0
3.0
2.0
1.6
1.0
0.6
0.5
100
Extremos· Extremo 3'
12
7.0
6.0
5.0
3.0
2.0
1.6
1.0
0.6
0.5
101
4.3.4.1 Análisis de la expresión de la NCS y BBE en
Argemone mexicana
La sanguinarina y berberina son los alcaloides mayoritarios en
esta planta. La sanguinarina se detectó en la raíz y en la
semilla madura, en cantidades de 1.0 y 1. 7 mg g-1 de PS ,
respectivamente (Fig . 4.1 OA). En las cápsulas completas, sin
semillas, sólo se observaron algunas trazas de sanguinarina.
La berberina, por su parte, se detectó en todos los tejidos
analizados, a excepción de la semilla madura, siendo el brote
floral y la raíz los que mostraron mayores cantidades (2 y 3 mg .
g-1 PS ; respectivamente) (Fig . 4.1 OA). Estos resultados son
similares a reportes previos (Lozoya y Lozoya, 1982; Willcox et
al. , 2007). Un aspecto importante de resaltar es la distribución
de estos alcaloides durante la maduración de la semilla, ya que
en este proceso se observa un cambio de berberina a
sanguinarina. La capacidad de A. mexicana para acumular
sanguinarina (benzofenatridina) en dos tejidos diferentes (raíz y
semilla madura) y berberina
- .. (protoberb!3JjoaLen.
, .., ' .- '\ .-- - --
hoja, raíz, semilla inmadura y brote floral de plantas maduras
de A. mexicana. En este estudio no se incluyeron semillas
maduras debido a que no se pudo obtener el ARNm.
En los diferentes tejidos, los transcritos para la NCS y 88E
mostraron, en general, un patrón de expresión relacionado con
la acumulación de los alcaloides. Sin embargo, también se
observaron algunas diferencias (Fig. 4.1 08). La NCSAm1 se
expresó en menor medida en hojas, en comparación con los
demás tejidos. En contraste, la NCSAm2 se detectó con la
misma intensidad en todos los tejidos analizados (Fig. 4.1 08).
Por su parte, el nivel de expresión de los genes representados
por 88EAm1 fue menor en hojas, raíces y no se detectó en la
semilla inmadura mientras que la BBEAm2 se detectó en todos
los tejidos, con niveles bajos en raíz y semilla inmadura (Fig.
4.108). De esta manera, ncs y bbe se expresan
diferencialmente en los tejidos, siendo abundantes en cápsula,
tallo y brote floral , mientras que en hoja, raíz y semilla
inmadura se detectó una expresión variable. Esto puede
relacionarse con la participación de las distintas isoformas de la
NCS (NCSAm1 y NCSAm2) y 88E (88EAm1 y 88EAm2) en la
síntesis de alcaloides de los diferentes grupos. En este sentido,
tanto la NCS y como la 88E son enzimas involucradas en la
formación de intermediarios comunes para la síntesis de tanto
benzofenantridinas (sanguinarina) como protoberberinas
(berberina) (Sánchez-Mendoza et al., 2008; Schwarzbach y
Kadereit, 1999; Fig 4.1 OA). Esto sugiere la existencia de un
grado de coordinación que permite la síntesis de ambos
alcaloides. En este momento, no es posible discernir si las
diferentes isoformas aisladas de la NCS y la 88E participan de
manera específica en la formación de alguno de los alcaloides
en los diferentes tejidos de A, mexicana. No obstante, esta
posibilidad existe ya que la distribución tejido específica de
transcritos correspondientes a diferentes isoformas de la
TYDC, SOMT y COR en P. somniferum, sugiere que puede
estar relacionada con los diversos tipos de alcaloides
103
producidos en los distintos tejidos (Facchini y De Luca, 1995;
Unterlinner et al. , 1999; Ounaroon et al. , 2003).
Comparando los patrones de expresión de ncs (NCSAm1 y
NCSAm2) y bbe (88EAm1 y 88EAm2) de A. mexicana con los
observados en T. flavum, y P. somniferum, se notan diferencias
con la primera y similitudes con última. Por ejemplo, la 88E de
P. somniferum se expresa principalmente en el tallo , hoja,
capsula con en niveles bajos en la raíz (Facchini y Park, 2003;
Sama na ni et al. , 2005,) al igual que en Argemone (Fig. 4.1 08).
Por otro lado, la expresión de NCS de T. flavum es abundante
en el rizoma (tallo modificado) (Huang y Kutchan, 2000), en
contraste con lo que sucede en A. mexicana donde hay otros
tejidos con una acumulación abundante del transcrito además
del tallo (Fig. 4.1 08).
104
A d
c=J Sanr:ulnarina
- Berberina
2..5
11'1 2.0
o.
bo
ti.O 1.5
E
1.0
0.5
0.0
e T H R SI B Sm
Teji dos
B
e T H R SI B
NCSAm1
~-- -- --
_____..... -- .,..,
NCSAm2
BBEAm1
BBEAm2
Actlna
105
Es interesante hacer notar que en algunos casos se
observaron diferencias entre el nivel de acumulación de
alcaloides (Fig. 4.1 OA) y el nivel de expresión tanto ncs como
de la bbe. Por ejemplo, las cápsulas, que mostraron el menor
contenido de alcaloides (solamente bajas cantidades de
berberina; Fig. 4.1 OA), tuvieron un alto nivel de expresión de
ambos genes (Fig. 4.108). Por otra parte, las raíces, que
acumulan la mayor cantidad de alcaloides (Fig. 4.1 OA), fue el
tejido con la menor expresión de bbe (Fig. 4.1 08). De este
modo, aunque la raíz parece ser el principal productor de
alcaloides, es posible que los intermediarios hasta (S)-
escoulerina, el producto de la 88E (Fig . 1.3), no sean formados
únicamente en este tejido, sino que también se importen de
otros, como sucede en P. somniferum (Steffens et al., 1985;
Facchini et al. , 1996). Por otro lado, también es posible que en
el estado de desarrollo en que se encontraban las raíces
analizadas no fuera el de mayor expresión de estos genes
(Huang y Kutchan , 2000; Facchini, 2001 ). Es importante tener
presente que las rutas biosintéticas tanto de la sanguinarina,
como de la berberina involucran numerosos pasos enzimáticos
(alrededor de seis reacciones) que aún faltan por ser
analizados (Fig. 1.3; 1.4 ).
Los diferentes niveles de regulación (bioquímicos, moleculares
y celulares) pueden afectar la síntesis de los alcaloides y
explicar las diferencias observadas entre la expresión génica y
la acumulación de A81s en algunos tejidos (Fig. 4.1 O).
Complejos mecanismos regulatorios operan sobre la síntesis
de alcaloides en las diferentes especies productoras de estos
compuestos. Por ejemplo, en P. somniferum y T. flavum la NCS
despliega una cooperatividad positiva en la que la unión de la
dopamina facilita la unión del 4-HPAA (Samanani y Facchini,
2001, 2002). Sin embargo, estos resultados no concuerdan con
el análisis estructural del sitio catalítico, por lo que es necesario
un mayor estudio (llari et al. , 2008; 8erkner et al. , 2008). Por su
parte, los factores ambientales y de desarrollo también pueden
modificar el contenido de alcaloides. En dos cultivares de P.
106
somniferum, productores de ABis, se observó una expresión
diferencial de bbe1 en los tejidos analizados (Facchini y Park,
2003).
Estas diferencias en los patrones de expresión no solo ocurren
a nivel tisular, sino también celular. En T. flavum, la expresión
máxima de la ncs se encuentra en el rizoma y el peciolo, pero
estos tejidos no corresponden a los sitios de la actividad
enzimática que se han localizado en la raíz, seguido del rizoma
y por último en peciolo. Estos datos sugieren que la proteína
con actividad de NCS es trasportada entre los diferentes tejidos
(Samanani y Facchini , 2002). En este sentido , la NCS de T.
favum presenta un péptido señal que podría funcionar como un
péptido de tránsito (Samanani et al. , 2004).
La expresión y actividad de la BBE en la raíz, tallo y brotes de
P. somniferum sugiere que intermediarios de la síntesis de
sanguinarina pueden ser transportados desde la parte aérea a
la raíz (Facchini, 2001 , Facchini y Park, 2003). De igual modo,
la propia enzima puede ser transportada entre diferentes
compartimentos celulares. Esto ha sido demostrado con la
fusión del péptido señal de la BBE de P. somniferum con una
proteína reportera, observando el trasporte de la misma al
retículo endoplasmático y la vacuola (Bird y Facchi, 2001 ).
La complejidad celular involucrada en la síntesis de ABis ha
quedado demostrada en los últimos años y se ha descrito que
los. sitio de síntesis y el lugar de acumulación de los ABis
puede variar en diferentes especies. Por ejemplo, en P.
somniferum los alcaloides morfinanos y benzofenantridinas
(morfina y sanguinarina) se localizan en las células laticíferas
adyacentes a los tubos cribosos, mientras que los transcritos
involucrados (6'0MT, CNMT, NMCH, 4'0MT, BBE, SAT, COR;
Fig. 1.3) y las enzimas correspondientes se encuentran en la
células acompañantes y en los tubos cribosos del floema,
respectivamente (Samanani et al., 2006). Estos resultados
sugieren que las proteínas con actividad enzimática son
ensambladas en las células acompañantes y que
posteriormente son transportadas a los tubos cribosos para la
107
síntesis de los alcaloides, que por último son acumulados en
las células laticíferas (Samanani et al. , 2006). Por otro lado, en
T. flavum los alcaloides de tipo protoberberina (berberina) se
localizan en la endodermis de la raíz y en la corteza y medula
del tallo, mientras que los transcritos para TYDC, NCS, 6'0MT,
CNMT, 4 ' 0MT, BBE, SOMT se encuentran en la endodermis
inmadura de la raíz y en la protodermis de los primordios
florales del rizoma (Samanani et al., 2005).
En A. mexicana, la localización por fluorescencia de los
alcaloides de tipo benzofenantridina y protoberberinas en la
raíz y tallo, muestra que estos compuestos se acumulan en el
periciclo y en la endodermis de la raíz, mientras que en el tallo
se observan principalmente en el tejido vascular, seguido de
células en la corteza y en la endodermis (Fig. S3, datos
complementarios). Ahora bien, PCR in situ de los mensajeros
correspondientes a la NCS (NCSAm1 y NCSAm2) y BBE
(BBEAm1 y BBEAm2) sugieren que los transcritos se
encuentran en el periciclo de la raíz y en floema del tejido
vascular del tallo (Rubio-Piña y Vázquez-Fiota, datos en
preparación). Estos resultados en conjunto sugieren que los
sitios de síntesis y acumulación de alcaloides están temporal y
espacialmente separados y apuntan hacia una organización
que implica un transporte intra e inter-celular de intermediarios,
productos y enzimas biosintéticas.
De esta manera, considerando la estrecha relación filogenética
encontrada entre las enzimas biosintéticas de los ABis en las
diferentes especies analizada, (Fig 4.5; 4.6), la localización de
estas mismas enzimas en diferentes tipos celulares en estas
especies, sugiere que las rutas biosintéticas pudieron migrar
completas, pero que adquirieron características regulatorias
propias en las diferentes especies (Facchini y De Luca, 2008).
Finalmente, es interesante hacer notar el alto contenido de
sanguinarina en la semilla madura. La presencia de este
alcaloide podría explicarse como el trasporte de la raíz hacia
las partes aéreas, a través del tejido vascular. No obstante, la
síntesis de este alcaloide también podría ocurrir en otros
108
tejidos, como la propia cápsula o en la semilla durante su
maduración. En este sentido, trabajos previos de nuestro
laboratorio han reportado la ausencia de sanguinarina en el
látex y en tallos de A. mexicana (Carrillo-Pech, 2006) al igual
que en dos cultivares de P. somniferum (Frick et al., 2005). De
este modo, es probable que los alcaloides detectados en la
semilla no hayan sido transportados desde la raíz, sino que la
cápsula haya participado en su formación, para que
posteriormente, se acumulen en la semilla. La presencia de
niveles importantes de los transcritos de NCS y BBE en las
semillas inmaduras (Fig. 4.1 0), sugiere que este tejido tiene la
capacidad de participar en la síntesis, al menos parcialmente,
de este alcaloide. Como alternativa, intermediarios posteriores
a la acción de la BBE, podrían ser transportados de la semilla
inmadura hasta la cápsula en los que se llevarían los pasos
subsiguientes. Es interesante notar que las enzimas, tanto
anteriores como posteriores a la acción de la BBE, (4'0MT y
SAT; Fig. 1.3 y 1.4), se han inmunolocalizado en los carpelos
de cápsulas de P. somniferum, lo que indica que este tejido
tiene una capacidad biosintética (Weid et al., 2004).
111
A c:::J s~neu in;or in~
-lle rber ín ~
4.0
1Z 15 18
Días después de la cerminación
---
3 6 9 12 15 18
NCSAm1
- --
NCSAm2
----- -..---
BBEAm1
--·-·- - -· .
BBEAm2
Actlna
--- ---
-------
Figura 4.11. Acumulación de ABis y análisis de expresión de la NCS y BBE
después de la germinación de semillas de Argemone mexicana. A)
acumulación de sanguinarina y berberina. Las barras representan las
medias ± DE de tres experimentos independientes. Las letras (minúsculas :
sanguinarina) señalan diferencias significativas entre medias (ANOVA P <
0.001 ). El análisis se realizó de 1 a 18 días después que la radícula
emergió. B) expresión de mensajeros de la NCS y BBE por RT-PCR. La
actina se utilizó como control de carga y amplificación .
112
En estas plántulas, los transcritos correspondientes a la NCS y
88E mostraron un comportamiento similar al previamente
detectado (Fig. 4.11 8). Se mantuvieron elevados durante los
primeros 7 días, disminuyendo al día 14, para aumentar de
nuevo más tarde (Fig. 4.128). La amplificación de la actina fue
utilizada como control de carga y amplificación , lo que sugiere
que estos resultados no son producto de un artefacto, como se
comentó anteriormente (complementarios Fig. S4 y 4.11 8).
Cabe mencionar que solamente la NCSAm2 se logró detectar
al día 14. De este modo, entre los transcritos analizados,
solamente la NCSAm2 parece mantener sus niveles de
expresión constantes, independientemente del estado de
desarrollo de las plántulas (Fig. 4.11 8 y 4.128). No obstante, el
posible significado fisiológico de este comportamiento aún no
puede ser establecido. La síntesis de alcaloides en otras
especies, como la de vindolina en plántulas en desarrollo de C.
roseus muestra un comportamiento similar, ya que la actividad
de la triptófano descarboxilasa (TDC) alcanza su máximo
dentro de los primeros cinco días de germinación, desaparece
para después volver a ser detectada, una vez que el primer par
de hojas verdaderas ha emergido (Vázquez-Fiota y Miranda-
Ham, 2006). Es de notar que al día 14 del análisis el primer par
de hojas verdaderas está surgiendo (Fig. 4.12).
114
A
~ 3
......
";'
E 2
o
4 7 14 21
4 7 14 21
NCSAm1
1
NCSAm2
~-- --
BBEAm1 --- -. -·
BBEAm2
Actlna
1
1
--__ --__ -
, .....,_ __ . .........,.
Figura 4.12. Acumulación de ABis y análisis de expresión de la NCS y BBE
en plantas en desarrollo de Argemone mexicana (post-emergencia). A)
acumulación de sanguinarina y berberina. Las barras representan las
medias ± DE de tres experimentos independientes. Las letras (mayúsculas:
sanguinarina; minúsculas: berberina) señalan diferencias significativas entre
medias (ANO VA P < 0.001 ). El análisis se realizó de 1 a 21 días después
que las plántulas emergen 8) expresión de mensajeros de la NCS y BBE
por RT-PCR. La actina se utilizó como control de carga y amplificación.
115
Trabajos previos de nuestro laboratorio han reportado niveles
altos de berberina en el látex de A. mexicana alrededor del 6
mg g-1 PS (Carrillo-Pech , 2006). En este sentido, la localización
de los ABis en el látex de las células laticíferas asociadas al
tejido vascular de plantas y plántulas de P somniferum sugiere
que estos alcaloides son transportados atreves del floema
durante el desarrollo de la planta (Samanani et al., 2006). La
localización de los alcaloides de tipo protoberberina en el haz
vascular de los tallos y en el periciclo de la raíz en A. mexicana
sugiere que la berberina es transportada a través del tejido
vascular (Fig. S3, datos complementarios). De esta forma, es
posible que la síntesis de la berberina en A. mexicana ocurra,
al menos parcialmente en las partes aéreas, de donde podría
movilizarse a la raíz. En este sentido, los sitios finales de
síntesis y acumulación de este alcaloide en C. japónica y T.
flavum pueden diferir, indicando la participación de sistemas de
transporte (Yazaki et al. 2008). Más aún, los sitios de
biosíntesis y de acumulación de los alcaloides de tipo
protoberberina, están temporal y espacialmente separados en
la raíz y el rizoma de C. japonica y T. f/avum (Fujiwara et al.,
1993; Samanani et al., 2002).
4.4. CONCLUSIONES
116
El análisis de plántulas y plantas maduras mostró que las
benzofenantridinas (sanguinarina) y protoberberinas
(berberina) son los alcaloides mayoritarios y que se acumulan
desde etapas muy tempranas. Además, se observaron cambios
en el contenido de alcaloides conforme aumenta el desarrollo
de la planta. Un considerable grado de coordinación de los
transcritos correspondientes a las enzimas biosintéticas (NCS y
BBE) y la acumulación de los alcaloides (sanguinarina y
berberina) fue observado en plántulas y plantas maduras de A.
mexicana. Así, la expresión de la NCS y BBE mostró una
relación en general con la acumulación de los alcaloides. No
obstante, también se observaron algunas discrepancias. Por
ejemplo, la acumulación elevada de los alcaloides en la raíz
difiere de los los niveles bajos de expresión detectados para la
BBE (BBEAm1 y BBEAm2). Esto puede deberse a que existen
diferentes niveles de regulación (moleculares, bioquímicos y
celulares). En este sentido, la localización de las
benzofenantridinas y protoberberinas, así como de los
transcritos correspondientes a la NCS y BBE en distintos tipos
celulares en la raíz y tallo, sugiere el transporte intra e ínter
celular de intermediarios, productos y enzimas biosintéticas.
Más aún, la diferencia temporal y espacial de los transcritos y
alcaloides de A. mexicana indica la participación de
mecanismos parcialmente conservados con respecto a otras
especies (Papaveraceas y Ranunculaceas).
4.5. REFERENCIAS
117
un usual flavoenzyme with a dual active site. Proceedings of the
National Academy of Sciences, USA, 104, 6170-6175.
118
Dittrich, H. , and T.M. Kutchan, (1991) Molecular cloning,
expression , and induction of berberine bridge enzyme, an
enzyme essential to the formation of benzophenanthridine
alkaloids in the response of plants to pathogenic attack.
Proceedings of the National Academy of Sciences,USA, 88,
9969-9973.
120
llari, A., S. Franceschini, A. Bonamore, F. Arenghi, B. Botta, A.
Macone, A. Pasquo, L. Bellucci, and A. Boffi, (2008) Structural
basis of (s)- norcoclaurine biosynthesis. The Journal of
Biological Chemistry, 284, 897-904.
121
Lozoya, X. , y M. Lozoya, (1982) Flora medicinal de México.
Plantas indígenas. Primera parte. Instituto Mexicano del Seguro
Social. México, D.F, México. IMSS. pp. 148-173.
122
Pasternak, 0., J. Biesiadka, R. Dolot, L. Handschuh, G.
Bujacz, M.M. Sikorski, and M. Jaskolski (2005) Structure of a
yellow lupin pathogenesis-related PR-1 O protein belonging to a
novel subclass. Biological Crystallography, 061, 99-107.
Samanani, N., S-U. Park and P.J. Facchini (2005) Cell Type-
specific localization of transcripts encoding nine consecutive
enzymes involved in protoberberine alkaloid biosynthesis. The
Plant Cell, 17, 915-926.
126
CAPÍTULO 5
128
biosintéticas (lgnatov et al., 1996; Cho et al., 2007), lo que
sugiere podría actuar como molécula señal incrementando la
expresión génica de estas enzimas. En general, la capacidad
del SA para inducir la síntesis de los ABis es menor de lo
reportado para los JAS, sugiriendo que estos dos compuestos
actúan mediante mecanismos diferentes (Cho et al., 2008). Por
su parte, la aplicación de JAS a cultivos de P. somniferum no
conduce a la acumulación de sanguinarina, aunque sí activa la
transcripción de algunos genes biosintéticos, proponiendo que
esta molécula actúa como señal solamente para algunos de los
pasos biosintéticos (Facchini et al., 1996a; 1996b).
El objetivo de este capítulo es evaluar el efecto del jasmonato
de metilo (MEJA) y del ácido salicílico (SA) sobre la síntesis de
sanguinarina y la expresión génica de la norcoclaurina sintasa
(NCS) y la enzima formadora def puente de la berberina (BBE)
que son dos de las enzimas propuestas como puntos
regulatorios para la síntesis de ABis (Fig. 1.3).
129
Trizol, de acuerdo a las modificaciones publicadas por Rubio-
Piña y Vázquez-Fiota, (2008).
130
de metilo (MEJA) como ácido salicílico (SA) (ambos de Sigma-
Aidrich Chemical Co). Para esto, se utilizaron cultivos de 10
días después del sub-cultivo que fueron expuestos a
tratamientos con O (testigo), 100, 250 y 500 IJM de cada
inductor. Los testigos recibieron los disolventes
correspondientes (HzO y ETOH para SA y MEJA,
respectivamente). Una vez transcurrido el tiempo del
tratamiento, los cultivos fueron cosechados por filtración y
almacenados a -aooc hasta su análisis. Estos experimentos
permitirían definir la concentración óptima para la inducción. La
segunda etapa consistió en utilizar la concentración a la cual el
inductor produjo el aumento máximo en la acumulación de
alcaloides. En este caso, se realizó un curso temporal
aplicando dicha concentración a cultivos de la misma edad
durante un periodo máximo de 120 h. Las muestras se
colectaron a las O, 6, 12, 24, 48, 72, 96 y 120 h. Los cultivos
fueron cosechados por filtración y almacenados a -aooc hasta
su análisis.
131
realizó por densitometría in situ sobre placas cromatográficas,
utilizando el método de estándar externo y un densitómetro
Shimadzu CS-930 equipado con un graficador (DR-2). Las
lecturas en el densitómetro se hicieron por barrido lineal de
cada carril y la concentración se determinó comparando el área
del pico de las muestras contra el área de los picos obtenida
aplicando concentraciones conocidas de los estándares. Los
alcaloides fueron detectados por fluorescencia a una longitud
de onda (,\) de 300 nm (Carrillo-Pech , 2006).
132
1.0 , - - - - - - - - - - - - - - ,
1 • PSAWWif 1
0.8
1.5
K'
~ o.e
~
"
rJJ .E 1.0
~
a.
0.4 ~
·s
"'
~ 0.5
02
0 .0 +----.---..--~----.-------.-.,.----,---..-----l
o 8 tl ~ ~ ~ ~ ~ ~
10 15 20 30
Usmpo (días)
Tiempo (dlas)
A b
B
2.5 a
u
(/)
Q. ~ 2.0
":' •.,.
"' Ir u
.f1.0 ~
..
e
'1:;
e ~1.0
lo.s 1!'
e
.
(/)
.:1 0.5
0.0 o.o
o 1~ 2~ ~ o 1~ 2~ 5~
MEJAIOM SAIOM
134
Con el fin de confirmar esto, se analizaron diferentes tiempos
de exposición, hasta las 120 h, utili:z;ando 100 ~M de ambos
inductores (Fig . 5.3). Las condiciones fueron similares a las
anteriores y se incluyeron cultivos expuestos a etanol (ETOH) y
agua (H 2 0) como testigos. En estas condiciones se observaron
efectos mínimos sobre el crecimiento de los cultivos (datos no
mostrados). No obstante, la exposición a 100 ~M de MEJA
produjo la inducción de sanguinarina, alcanzando una
acumulación máxima de 2.15 mg g·1 PS después de las 48 h
(Fig. 5.3A). Estos valores son aproximadamente el doble del
contenido de los cultivos, antes de ser expuestos al inductor.
Estas cantidades se encuentran entre las max1mas
concentraciones reportadas para cultivos inducidos de E.
californica, P. somniferum y S. canadensis (Gundlach et al.,
1992; Eilert et al., 1985; Mahady et al. , 1998). Por el contrario,
los cultivos expuestos a 100 ~M de SA presentaron cambios en
la acumulación de sanguinarina sólo después de las 72 h con
respecto a los testigos (Fig. 5.3A) y en menor medida que en
los cultivos expuestos a MEJA. Esto es similar a lo encontrado
en cultivos de E. californica y S. canadienses (lgnatov et al. ,
1996, Cho et al., 2007). El bajo nivel de inducción producido
por este compuesto, sugiere que posiblemente se deba a un
efecto indirecto.
135
B Curso temporal MEJA (h)
o 6 12 24 48 72 96
Ncal
A
111
_, 1 J J 1 J J J ]
2 .5 Cuf!O tempora.l SA (h)
o 6 12 24 48 72 96 120
2.0 Nca l
V) P=================~
-- -
Q,.
111
":'
...
-----------
'"'1 .5
.E
e: Curso tempora.l ETOH (h)
~--
·~ 1.0 o 6 12 24 48 72 96
...
·:;
e:
~ 0.5
0.0
o 20 40 eo ao 100 120
Tlempo(h) o 6 120
NCa l
~==============9
- ----·-----
111
5.4. CONCLUSIONES
5.5. REFERENCIAS
139
Campos-Tamayo, F.O., (2002) Efectos de los procesos de
diferenciación celular sobre la síntesis de alcaloides en cultivos
in vitro de Argemone mexicana y Catharanthus roseus. Tesis
de licenciatura. Químico Farmacéutico Biólogo. Facultad de
Química. UADY. Mérida, Yucatán, México.
140
Eilert, U. , W.G. Kurz, and F. Constabel, (1986) Elicitor-lnduction
of Sanguinarine Formation in Papaver somniferum Cell
Cultures and Semicontinuous Sanguinarine Production by Re-
Eiicitation. Planta Medica, 52 , 417-418.
141
Hauschild, K. , H.H. Pauili, and T.M. Kutchan, (1998) lsolation
and analysis of gene bbe1 encoding the berberine bridge
enzyme from the California poppy Eschscholzia californica.
Plant Molecular Biology, 36 , 473-478.
lgnatov, A., W.G . Clark, S.D. Cline, M. Psenak, R.J. and C.J.
Coscia, (1996) Elicitation of dihydrobenzophenanthridine
oxidase in Sanguinaria canadensis cell cultures.
Phytochemistry, 43, 1141-1144.
143
Eschscholzia californica. Journal of Plant Physiology, 163, 369-
381.
144
CAPÍTULO 6
146
de estos alcaloides (Fig. 1.3; 3.2). El empleo de la metodología
de RT-PCR utilizando ARNm de raíz, nos permitió aislar
fragmentos de ADNcs de 305 y 1125 pb correspondientes a la
NCS y BBE respectivamente (Fig 3.4; 3.6). Estas secuencias,
tuvieron una identidad alta con las reportadas para otras
especies productoras de ABis, en base a estas se diseñaron
cebadores que permitieron la amplificación de los ADNcs
completos (extremos 5, y 3 ') de la NCS y BBE utilizando la
metodología RACE (Fig. 3. 7). Con las secuencias de A.
mexicana, se lograron identificar dos isoformas de la NCS de
1035 y 927 pb llamadas NCSAm1 y NCSAm2,
respectivamente. El marco de lectura abierta correspondiente
es de 275 y 220 residuos (Fig. 3.9; Capitulo 4). De igual modo,
se aislaron dos isoformas de la BBE de 1771 y 1718 pb
denominadas BBEAm1 y BBEAm2, respectivamente. El marco
de lectura abierta correspondiente es de 554 y 536 residuos
(Fig. 3.11; Capítulo 4).
147
Un origen monofilético para la NCS y la BBE de Argemone
mexicana
149
Expresión tejido específica de NCS y BBE
150
0
Bcrbcrina
San¡uinarina
Sanguinarina
151
6.1 C). Las plántulas en desarrollo tienen la capacidad de
producir sanguinarina, desde etapas muy tempranas. Sin
embargo, la berberina solo fue detectada a partir del día 18,
relacionándose con el desarrollo del tallo y los cotiledones (Fig.
4.11 ). Por su parte, las plántulas post-emergencia acumularon
sanguinarina y berberina. El contenido de los alcaloides
aumentó conforme al desarrollo de los tejidos de las plántulas
(Fig. 4.12; 6.1A; 6.1C). Estos resultados se encuentran
asociados con la presencia de los transcritos relacionados
(NCS y BBE), los cuales se coordinan con la acumulación de
los alcaloides.
152
participación en el flujo de intermediarios a través de la ruta de
síntesis, ausente en los cultivos.
153
--·
In ducció n de las
enzimas biosintéticas
de ABi s
•
Acumula ci ón d e
Sanguinarina
Recapitulación final
Perspectivas
6.1. REFERENCIAS
159
Buchanan, B., W. Gruissem, and R.E. Jones (2000)
Biochemistry and Molecular Biology of Plants. American
Society of Plant Physiologists, Rockville, MD, U.S.A.
160
engineering application. Annual Review of Plant Physiology and
Plant Molecular Biology, 52, 29-66.
164
DATOS COMPLEMENTARIOS
NCSAm1 ' '
TCAAA T CATCT .AT' CAT'1lTACOACOTOAA .AAAAOAOTA TO:ii'COA. OCTAT OT CTA AAC,TA 60
..'
NCSAm2' TCAAAT CATCTATC·ATQTA.COACOTCAAAAA.AOAOTA. TOiaC:OA OCTAT OT C TA.AA ~·TA $.9
Consensus ATCAAATCATCTATCAT • TAC·OACOTOAAAAAAOAOT'ATO'" COA '" OC:TATOTCTA,AA. ,. TA
-
Con8MS~
NCSAm1
NCSAm2'
'
'
' '
~g=~· :·~c:~::~~~o:~~.:~~::::. ~~~:~· ~~:~~~:· :~~~:~~:~::;::~~:~~~~~~~::~:!~ ~~
AT • ACAACC '"• Acc•TTOAAATC - ATOTC • OAAO • CATCOCTAATTACOTTCTTAAOAA •
..'.,
CAA,TC TCT0A.T A.AO ~_:¡ AAOO:;EIAOTTACAT ATOA.ATTOOAAOTACCAá¡CA TCA ·OCTOATT CA 1SO
CAA.TC TO'T AT A .AO~AAOO :rJ AO'TTACATATOAATTOOAAOTACCAjJCATCAOCTO· AT 'T CA 179
- '
Contensus· CAATCTOT •ATA .AO .. AAOO "" AOTTAC'ATATOAATTOOAAOTACC·A .. CATCAOC•TOATTCA
....
NCSAml ' '
ATTTOOO.CAOT TTA 'a:AOTTCACCCAA CATTC CTACA.CTTCT AA GA OATOTTCTAC,TT C CT '340 '
- ...'
NCSAm 2 A ''rTTOOOCAOT TTA XJ AOTTCAC CCA.A CATTCCTA 1CACTTCT AA Q.A OATO,TTCTAC' TT ·C CT 239'
Con.tensus A 'T T.TOOOCAOT TTA. • AOTTCACCCAA,CATTC C•TA CACTT CTAA O!A OATO'TTCTACtTTC CT
NCSAm1 OOTOT TTTTOAA .A.AOl:T AOAT OTOAT ' ~OAOOOCA:A TOOTOOTOTT O ltoCTOTTC' TT.OAC 300
-
NCSAm2' OOTOTTT 'TTOAA .AAO TAOATO'TOAT OAOOOCAA 1" 00TCO T OTTC AC TOTTC,TC O.AC 29.9
Con.tensus. OOTOTTTTTOAA .AA,O '"' T AOATO'TOAT OAOOOCAATOOTOOTOTT O AC TOTTC:T .. O .AC
'
NCSAm1 AACAAOAAO ofJT TAAAAOAAOTCJATTA'TOATCOA.AOO '
OOOOA ,C j TTAOACATOOO_ATOrt' 4 20 '
NCSAm2' AACflAOA.AOOOOTT' A.AAAOAAO'T~ATT ATOATCOA.AOO
-
OO.,TAm TT A.OAC ATOOOATOJ: 41.$
oon:~.enaua1 AA~ · AOAAG·G ~ TTAAAAOAAOT ~ ATTATOATCOAAOO•oo •• A • TTAOACATOOOATO •
NCSAm1
...'
Consens us, ACAT '"TTAC• T •OOA • AOOAT'CCATOT .. "'T "' O '"' OAAA.AC ., CCTAA • TC ... T 'OTOT - ·A .T .. '"' AA
'
TC TCT~T'ifATTTACOAbOT· OAAA AAOAOTATOCa;oA.i{OCTATOTCTAAáCTA.A. TCACA. $:10 '
NCSA.m2
Con•ensus
NCSAm• -
T •CQTCdATJ':AT TTA COA~OTOAAA}I~A, AOAGT A,TOCX:OA QO~#JA TOTCTAA O _l'.TAA. TCA CA 639
TC '"' T 'C •A 'T ""' ATTTACOA '•OTCAAA .., A.AOAGT'A ,TOC .., OA"' 0 ''"' '"' ATOTCTAA • '"' TAA.TCACA
'
ACCATACCTTTOAAA,TCCATOTC OAAOT'bATCOCTAA.TTACOTTCTdAAOAA . C ' AATC:T 600 ' '
-
NC$Am2' ACCgTAC ·C TTOAAA.TCCATOTC OAAOT ATCO ·CTAATTACOTTCT AAOA.AA,CA.AT .;_ $9:9
Con~ens-vs
NC-SAm1
NC~ 2
O
Consenaus, • ,.... •
DATA
~OCQTAT
OAAAOOAAiiTT r i TA.TOA
TTgD.TATOA@~TY6AA••
-
ACC"" TACC • TTO.AA.A.TCCATOTC ""' OAAOT • ATCOCTAATTACOTTCT .. AA OAA '"' CAAT • ..
NCSAmt 72-0
NCSArn2'
Con:rensus
NCSAnit
NCSArn'2. pa •AOTO.TAAOT
...'
TTÓéJA.ACTOTT'é:TTiaJiC TT TT '780
TT::tTAAOTOTT~TT1:,7T1;TA.,TiTT 73.5
- '
'701
NCSAm1
NCSAm2
consensua
NCSAm1
NCSAm~
Consenaus
NCSAm1
NCSAm2
consensuSJ
c.o iODO '11»0
NCSAml
NCSA.m2'
OAA.Tii!TA
A.ATAT.A
' '
¡i¡Titcf"OAAACA'AIIIfirAC'ATATAAiiTAAC·A · T ir TA¡<)'I"O:i'IAi"TTTTTTOTTOCAA 1020
Ta&,OCAATOAP,ATTAAAATAAATA.AaA T;JITA:T'CO:AAA • • • •
'
• • • • • .,AA 9 12
Consenii.IS OAAT • TA. ,. ... T'" • • • AA • • A .. • .... "A .. ATAA .. TAA "A -T ~ T/4 • • O "A •• TTTTTTOTTOCAA
165
1 1
. '
~
1
88EMI\ TAACA TGCOCACT AlOTO A TOA TATCT TA TCA TGTTT AACTTCAAA. TCOAOT TCA TAACT A TAC TACACCA TCA TCCCATTCAAA T TCTCATT ACCTTAO 1"
.. 1
88E.Am2 T.U.CA TGCGCACT AAGTOA TGA TA TCTTA TCA TOT TT AACTTCAAA TGQAOTTCA TAACT A TAC TACACCA TCA TC,JOA T TCAAA TTCTGA TT ACCTT AO IU
eo...ttu TAACA TOC GCACT AAOTOA TOA TATCTTA TCA TOTTTAACTTC.UA TOGAOT TCA TlACTA TAC TACACCA TCA TC • GA T TCAAA TTCTQA TTACC TTAG
= D1 1 *1
:~~:~a~~:~~~~~~~:~:~::::~~~:~~: ~i::::::: !~e:~::~: ~~::::~~~~~=~~::~g~~: ~~:~~~::~ ::~:::::~::~+:~~~::~
-1
CoMMtw ATTA T • TC ACCTCTCCA T •tAAAACCCA TT AT T • • AAA AAre· ACAA TA TCAAAACCOTC "CTAA TCCTA TTACCC "OTA.ACAUOAAOAOTTUC • AA •
*1
::
-1 ~1 *t -1 •1
88EAMI ACCOTTAGA TOTTGCACAAOAGOA TC~ TGGACCA T TACA T T.U .G.U.O TOOTGOTCA TAOTT ATGAAGGAT TA TCfiTA TACCGCAGATACA.CCA ffTO ffC M
~ ACCOT TAGATGTTOCACAAGAGGA TCtTGGACCATTAGA TT AAG.UGTG010GTCAT AGTTA TGAAGGA TTA 1C4 TA TACCGCAGATACACCA TT1GTTC 315
~ ACCOT TAOATOT10CACAAGACQATC• TGOACCA TTAGA TT AAQAAOTOOTGOTCATAGTTATOAAGGATT AfC • TATACCOCAGATACACCA T T10TTC
á1 ~
1
•• -1 •1
-
88EAm1 T TATACA TT T8ATGAA TTTGAA TCGGA. TTTCT ATTOA TATCGA.,fTCAGAAA.CAGCT TGGGTTGAA TCeGGTGCAACA,CT TGGAGAACTC TATT'~TGCT AT Att
- . -
l8fAtn2 l TATAGA TT T4A TG.AA T TTGAA TCGGAl TTCT ATTGA lo\ TIOo\,C1CAGAAACAGC TTGGGTTGU, lCTGGlGCA.ACA.QT TCOAGAACTC TATT~GCAAT 4J$
Coftwftu T TATAQATT f• ATOAA T TTOAATCGOA TTTCT ATTOA lA t• OA • TCAOAAACAOCTTOGGT TOAA TC • GOTOCAACA • TTOGAGAAC TC TATTA •oc • Al
1 ~1 1 1 1
-
NEArnl CACTGAGT TI.AC TGAT TCA. TT ~GGA TTCACAGCAGGT TGGTGCCCT ACTGTTGGTA.,ITGGGGGTCA TATAAGTGGTGGTGCT TTCGGT ATGATGTCGAGA NI
18E.Am2 CAITGAGT CAACTGATTCA 1 T~GGATTCACAGCA.GG TTGGTGtCCTAC TOTTGGTA.CTGOGGGTCA TATAAGTGGTOGTGGTT TCGG1A1GA1GTCGAGA $1$
~ CA • TGAGT • • ACTO ATlCA TT •QOA TTCACAGCAGOT TOGlG • CCTACTOTTOOTA. • TGGGGGlCA TA TAAGTGGTGGlGGTTTCOGTA lOA TG TCGAOA
=~ ::: 1 1 1
~:~~~ ~~i~~g:~~~~:i :~:ig~::~: i:i:~ ~igi~:i:~: i::~::=~:i~~~: i~~~:~: ~g:i~:; ~:: ~~:~i:::~:~~i~iii~:::
.. :::
1
-1 -
C...ut AAATA.CGGTClCGCAGCCOAT AC01CG AAGATG1 • ATTClTA. TAGA TAGT AA • OGTQC • ATTC TAGA lCG TAAA • T AA TGGGTO.U.GACG1Tl TTTGGG
1 ~1 1
18EAml CGO 1'TCG~GG1GCJ TGOA.GG1GG TG T1' TGGOOTGCAA T TT ACGCOTGOAAAATCAAA. T1A TTACCCOTTCCAAAAAAOO TGACGG T1' TTTCGCGTAACGA.A 1'tt
I8EMQ CGO TTCG T001GOTGGAGOTGOTGT TTGOOGTGCA.A TTT ACGCGlGGAAAATCAAA. TT AfTACCCGT TCCAAA.AA.AOGTGACOOT TTTTCGCGTA..,GAA l iS
~ CGG fTCO • GG1GGTGGAGGTGG1GT TTGGOGTGCAAT TTACGCG l OOAAAATCA.AATT Af TACCCG1TCCA AA.AA AGOTGACGGT TTlTCGCOTAA "GA.A
- 1
-• M1 -1 -1 -1
88EMI1 .U.ACCT AAA. TATCOAAOA.AGC TTCATT1 TfAA 1 TCACAA.A TGOCAA fA TGTTGCAGA TGA.ACTAOA TOA TGATTTTAC CG 1' ATCOA TTCTCGGTGOTGCC ...
88EMQ AAACGT AA A. fA, fCGAAGAAGC TTCA TTT TTAA T TCACAA.ATOOCA.A fA lGT TGCAOA TGA.A l¡JA.OA TOA. TOA TTT ,CAC TG TA.ACGA. T TCTCGGCGGTGCC liS
CoftMnu AAACGTAAA TATCGAAOAAGC TTCA TT1TT A.A. T TCACAA.A TGOCAA TA. TGT TG CAOA TGA.A • TAOA1GA. TOA TTT • AC•O TA. • COA. T TC:TCGG" OOTGCC
1 1 1 1
....
1
li8EMI1 AACOGAAACG&AG TOTOGe t'r~ TA T1CT TAOOT TT ACAT TTAOOATOT AAAA.CCOTTOCQAAA.1CT A. TAA 1CGA TAA.AA AGT lCCCOGAATT AGGO l TAA. 999
-1 - 1 -
UeM\2 AACGGAAACG0AGC4lOOCTAJlT AT1CT TA.OOT T TACAT TT AOOA TOTAAAACCGTTOCOAAA. TCT A TAA liGA. TAAAA TGT TCCCOOAA. TTACGO TTAA tl5
CoftMftu A.ACOGA.AACQ• AO" • TOO" T • • TATTCTTAOOTTTACAT TTAGOATGTAAAACCOTTGCGAAA TCTA.TA.A T "OA.TAA.AA "CTTCCCGGAA.TTAGGGTTA.A
1 1 ~1
-
T t'OA I GAAGU. Tl Tl TGOA.AA TOAA l TGGOGTGA.A. TCATTTCCTTACTT ATCAGGA. T f AAAAACAOT TAAOGAA TTOAAbAATAGG TT TT TGAA.A..l TTOA 10M
tCOA AOAAGAA Tl TTTOGAAATGAA TTOOGGTGAA TCI TTTGCTTACT TATCAGGA. TT AA.AAACAOTT A.AGGAATTOA.A TAA TAOGTT r TTGAAA.C TTOA totS
T • OA "GA.AOAA TTTT100AAA TGAA TTGGGOTGAA TC: • TlTOCTTACTTATCA.OGA. TTA"-AAA.CAGT TA.AGGAA TTGAA • AA TACO TTTTTGAA.A • TTOA
~
1 1
~
~
~
1
~1
TOA TA..e AOCT1 t TAAOACAAAAOT TGA1 TTTACT AA.AGAAACA TTACCA. T1AIAAGCGA TTIATGGT TT Al TA.GAGAT TT TATCGAAACAGCCACGTGGe ftM
~ ~ ~: ~~;;:i~
-j 1 1 -
TGAT AA.AGC:TT TT AAGACA.AAAOT TOAT TTTACTAAAOAAACA TTACCA. TTA.~AO GATT AA TOG1e TA.1 TAGAOA TTT TA TCOA.AAOAOCCACOTOGA 11t$
TOA TA • AOCTT TT AAGACAAA.AOT TG.AT TTTACT AAAOAAACA. TT ACCA TTA • AAG "OA TT • ATGO T • U TTAOAOA,Tl TTATCOAAAG AGCCACOTGO •
~ ~ 1
::: ~:~i~ i:~~:~:::::: ~~:~i::~: ~i ::~:~;:: ~~~~ :~~~~'~ !~~¿~~: ~~:i ~:~~~:~~:::~~~ ~:~~~~:: ~: ~: ::
- 1
- '
-
TTT ATC • "01 TAA..A T •Qfl T • GOA.GOAA.AAA TOAGTA.AA.ATT A.GTAA. *GATTllACTCC • 11 TCCTCo\ TCO TAA • 00 TACCAAAT1 • ATOGT "OA.A 1 ATA
1
~1 1
88ENn1 TAO f TeCT1GOAGTAAAGATGA.AGAA TCAA.AGAGCGACGAA T TCTTTCA l TGG TTACGT A.A TA TTT ACGA. TTA. TATGGAAAI OT TCG TATCGAA.AAACCC 1M
81E.Am2 TAGT Tl CTTGOAG TAAAGA TGAAGAA. TCAAAGAGCGACGA.A TTC: TT TOA l TGOTTA.CGTAAlA T TT AlOA 1 TA TATGGAAII Ol TCGTA TCGAAAAACCC UaS
Conttn.M TAOT T "CT1GOAG TAAAGA TG.UOAATCAAAGAGCGACOAA TTCl TTOA l TOGTTACOTAATAl TlA • GA TTATA TGGAA • • GT TCG TA1CGU.AlACCC
1
10 ,. . 111:10
1 1 1 1 1
81EAmt AA.GAG TGGGT TATGlT AA TéAT ATTOA lCT TOA TC1CGOAOOAA TAG.A. TTOGAG TIATAA.A.AA TA.G 1 TCT AACAA. TGCC,A TTOAGA TTOC AAOAAAT TGG 14"
-1 -
88ENn2 TA.GAG TGGGT TA TGTTAA TAAT A. TTOA TC TTGATC1CGGAGOAA TACA TTGGAG TI.A~AAA.A fAG1 TCTAAT AA TOCA.A. TTGAGA TlOC tAGUA. TTGG 1-45
CotMnM • AOA.GTGGGTT ATOT UA T • ATA 1 TGATC1 TOA TCTCGGAGGA.AlAGA TTOOAGT • A • AA.AAAlAGTTCTAA • AATQC • ATTGAOA TTOC • AGAAA TTOG
1 ~1 1
BeE.Mit GG TCAAAAA. TA TT TTTT ATCAAA. TT ATGAACOl TT AA TT AGOOCTUAACA TTOA TTOATCCTAA. TAA JI TTT11 AA TCA. TCCACA.O,AGTA. TACCTCCAA 15tl
- 1
- -
eetAw.2 GG TOAAA.AA TA TTT TTT A. TCAAAl TATOAA.COT TT A.A T UGGGCTAA.AACA TTOA TTGA tcC TAATA.ATA T TT JT AA TCA. TCCAC:o\l-\0 TA TACC TC:CAA 1$15
CotMftM GG TGAAAAA TATTTTT TA TCAA.A TTATGAACGTTT AA TT AGOOCTAA.AACA. TTOA TTGA TCCTAAT A.AT • T TTT TAA TCA. TCCACA. • AG U TACC TCCA.A
1 1 1 1 1
ME.Am1 TOA TOAAA U TIA TAA. TGlTGA TOATOAG~AAA TT TGAAOT TACATG1TOA TCAAOGAA.ATGTAAT TT TT TA¡.\ • • • .ITTG TAA TT TU TAAA TTA TTAT tft5
BIENn2 TGATGA.AA1 10ATAA1GTTGA1GATGAGC • TTTGA.AOTTA •TGITOATCAAGOAA.ATOTA~TTTTTT AAT ATTGTAATTTAATAA.ATTATCt;A 117t
~ TOA TGAAA T • T • ATA A. TGT TOA TGATGA.G • AA.Ao\ T T TGAAGT TACA tO• TOA TCAAGOAA.ATGT A • TT TT TT • AATT AT1GT AA TTTAA TAAA TT AT • • •
= IDO
'
ne1
'
~!~~:~!~ ~~,c~~n~•··~·~~~~~~·g:~::;;~~~:i~'''~!~'·~uu:::::~::::::::::: !~
fM
1
167
A M 1 3 6 9 12 15 18
BBEAm2
549pb
Actina
467pb
B M 1 3 6 9 12 15 18
lBS
187pb
168
Anexo 1
Electronic Joumal of Biotechnology ISSN: 0717·3458 Vo1.11 No.4, lssue of October 15, 2008
Q 2008 by Pontificia Universidad Católica de Valparolso Chile ReceNed March 11. 2008 ' Accepted May 22 , 2008
OOJ · 10 V.2f)fvol1 1-is.!lue-1-fulnext~ 13 TECHNICAL NOTES
Felipe A. Vázquez-Fiota•
Unidad ck Bioquúruca y Biotogí;a Mole-eubr de Planlas
Cmtnl dc- lD\'Hhgación C1e:utif•ca de YucMin
Calle43 No. 130, ColomaChubwni de Hidalgo
Mérida 97200, Yuc.alin. Mb.ic:o
Tel: 999 9<42 8330
:Fa~~: : 999 981 3900
E:·tuail: fcbpc@dcy.mx
Fla aadal suppon: Nariou:d Council for Sciew:e and Technolo¡y (CONACYT), Mt_xico.
RNA tl:ft'a<'.tlon Ct·om recalc.ltrant plant tlssues ts cytotoxic :\Jld a.nümicrobial prope11ies (Villinski et al. 2003;
rrequr.ntly co mplica t~d by tbt prtSf ll('f':. or st rondary Beuria et al. 200S). The wide rauge of potential medicinal
metabollt~s. polysarchal'ldes and p olyp h~ nob. T hen uses of this plant is oue of the reasons for the ~Will$
co m¡lonnds may co pnrfp it at~ \\ith Rl~A. ofita attention it is receiving. However, molecular investigations
n n d~ t1 n g tt uusuttablt tor t-Uber cDNA syntbests or on tbis plant are limited.
l•~· brt dlzat1on tu no•·tht l·n blot analysts a nd tberdol'tt
tutu te1·lug wtth the gt nt aualysts t l:presstou In sur b A pre-requísite to conduct. sucb researcb is obfailting high
tlssuts. \V~ luwe dr.vrloped au effidtnt R~A extt·auttou quality uucleic acids. espi!<ially RNA (cardillo et al. 2006).
mttbod from A. mtxlcntrn ttssues. Tbt procedurt However, this may be complicated in cettain risS\1es due to
loclud<s l b< USt of pol)•\•lu)·JpoJyp )TrOlldout (PVPP), lo RNA susceptibility to deg.ration by RNAses. Plant tissues
nmovt- secondary m~ tab olltts, pt·ottins aud are cbo.racterized for a highly variable cowposition, rutd
}lolyp11tnols, and a m·o -step p rrctpitatio n wil b LjCl, to some tissttes may probe especially difficult for RNA
tllmtna te poJyu rcbaridf's, au d t bus tnn"f'astn g Rl""A extraction (Geuna et al. 1998). Tissues of A. . mexicana
yteld. Tite quallty of tbe nsu ltin& RNA was t\l'aluart d contain high ruuounts of yellow latex. which on exposure to
sprru·opbo tomt.tt1rally aud b ~~ agar ost gtl Rir, rapidly nm.ts browu due to oxidation of pheuolic
tltc ll·o¡Jbonsb. l.\1o t•e.O\'tl·, th t RNA obtatned by this compotmds aud otber secondi\J'}' metnboHtes that interfere
mttbod, could be ustd dtrutly for bo th RT-PCR and with any RNA e:o<trnction procedtu·e . Furthenuore. Wgh
uo t·tbt i'D blot analysts, w lth out •uy tur tb tt' puriflratlon. awoWlts of polysaec:harides ofteu co· p!'edpitale wíth R.>.JA,
thereby affectiug the yield and quality of tite isolated RNA
Argeurone me:ricnun (Papaveraceae). commonly known as (\Vang et al. 2007). These substances bind to Rl"JA and
priekly poppy is used in rural arens of Meotieo as a render it tmsuitable for either cONA synthe~is or
medicinal plant. The occl.UTeuce of diverse alkaloids, bybridizatiou in northeru blot analysis.
flavonoids aud fatty acids in its tissues may explain these
prope11ies (Sbaukat et al. 2002; Chaug et al. 2003). In fae t, Different merhods for RNA isolalion hnve been desctibed.
berbedne aud sanguinarine, t\\'O of tite maiu alkaloids lu nt.'UlY C3ses: these iuvolve borh the use of detergents
is;olated fi:om .A.rgemoue tisúes . display significant (CT AB, soS) and hot. phenol. or density gmdient
Thls p41 per ls :t~ V :t~ llable on lln• at http:l/www.ej blot ec hno logy.ln foleontent/vo l11/luu..Uful l/13/
169
Rublo·Pifta, J.A. and Vhqu ez..floto1, F.A.
e S L R Ce
-- 28SrRNA
18SrRNA
Flgure 1. Elec:trophoretlc: ana lysls of RHA lsolated from Arvemon• mexkano1 d ssues . The arrows indicate the 28S and 185 units of
rRNA. C: capsule, S: stem, l : leat1 R: root, Ce: cell culture. Total RNA samples were analyzed on an 1.5% agarose gel stained with
ethidium brornide
ceutrifugariou (Logemauu et nl 1987). However the anunouinm flúocyauate, 0. 1 :vi sodium acerare (pH
efficiency of such melhods vnries depending ou the 5). 5o/o glycerol 0.1 o/o phenol red.
composilion of lhe employed tissues and had been
inadequate in reducing polysaccbarides contamiuation. The CWoroform: isoamylic alcohol {24:1; v/v).
addi tion of acidic gnanidiniluu thiocyannte or TRizotTv (In
Vin'O Life Teclurologies, Carlsbad CA) is widely employed 3 M aud 8 M LiCl solutious.
to inhibit Rl\Ase ncliviiy (Chomczyusld and Saccbi. 1987;
3 M sodilun aceta te (pH 5.2).
Va leuzuela-A,·eodar)o et al 2005). O~anic solvents ill:e
phenol and chlorofom1 are utilized ro separare RNA from
70%, 100% etbanol.
proreins into two different phases. Tire use of lithium
cbloride to precipitare RNA at certaio coucentrations is au Pol)"oinylpolyp)'ITOlidone {PVPP).
effective approach for selective precipitatioo. However.
standard procednres that mnke use of these reagents Dietbyl p}Tocarbonate (DEPC) ·treated water.
seldomly resu1ts in RNA with enough integrily or puriry
when applied ro lissues witlr high contents of latex aud Atl solutious were prepnred wilh DEPC· treated wnrer.
sec:oodaty me tabol.ites. such as those of A.. me.,icmta.
FurtltellllOre. tbese procedures are frequeu rly modified ro RNA extractlon protocol
suit specific tissues and conditions . Here, we present a
reproducible method for !he isolatiou of total RNA from Trnnsfer 1 g of frozeo tissue to a mortar containing
differeut lissues of A . me.ricmra. TI1e yield and qualiry of liquid uitrogen aud 250 m~ PVPP. pulverize tl1e
the RNA so obtaiued were consistently hi!lh, as coufumed tissue usin!' a pestle uutil a fure powder is
both by spectropbotometric nua lysis aod sepRrntiou on obtained.
agarose gel. and w•s suitnble for RT·PCR.
Add 5 ml extrnctiou buffer nud homogeuize with
MATERlALS ANO MI!THOOS cold peslle uuril rissue has thawed. Trnnsfer
samples to sterile ceotrifuge tubes aud incubare at
Plant material
room temperarure for 10 miu.
P1auts of -~· me.r/cana were collected from wild
Remove insoluble material from the bomogeuale
popnlations. '" ·apped in polyethylene bags aud kept in ice
upoo transfer ro the laborn tory. On arriva l, plauts were. by centriftrgatiou Rt 14.000 g for 10 miu ar room
thoroughly washed with cold tap water, dissected imo iemperanrre.
leaves. stems, roots nud capsules, nud theu slored at ·SO'C
uutil RNA extraction. Tmnsfer the resulting supenlatam to uew sterile
mbes nnd add 1 m.l of n mi.xntre chlorofom1:
Solutlons requlred isonmylic alcohol (24:1}.
Extraction buffer: 38% pheuol SRtllrated buffer Shake the tube vigorously with a vot1e..x for lS sec.
(vtv), 0.8 M guauidine thiocyanare, 0.4 M and incubare nt room tempet·antre for 2 miu. After
170
lso l;¡tfon of funetlonal total RNA from Argemone mexlc~n ;¡ tfn uu
Transfc:r tbe aqueous phase- to a uew tt1be. and Tite recovered RNA was qnautified by 00 (Lewiuso1w et
repea1 the cllJorofonn: isoamylic alcohol ttl . 1994), by tl..ic scandard p~cdlu"C. COucaw.inn cion due to
exrrnction. pheooVcarbohydrates or proteins was detemtined by
recording the OD ratios; A¡6t/Am aud Auo/Au•.
Trarufer tite aqueo os phase to a uew nlbe. and mix respectively. In order to verify RNA iotegricy, extrncts were
with 0.625 vohunes of 8 M LiCI aod incubare ar subjected to 1o/o agarose electrophoresis. Oels were stained
4°C for 3 lu-s (if RNA yield is 1ow. incubare with etltidium brootide, and \~sualized under UV light
ovemight).
Reverse transcrlptlon PCR
Separare RNA precipitated total RNA by
ceotrifugio¡¡ at 17,000 g for 30 min at 4•c. Single-stranded cONA was prepared from 2 .5 1'~ total
Eliminare !he supemataut. theu carefully wash the RNA using AMV reYerse traoscript:Jse lllld oligo (dD,
pellet, fit!.t wilh 3 mi of 3 M LiCI and titen, widt 1 following the mauufacrurer's instructious (lnvitrogeu). The
ml of 70% ethauol. Centrifugo samp1es at 17,000 g syuthesized cONA was used for PCR in order lo estimale
at 4'C for 10 min. tite expressiou level of actin gene. Actin-specific ptimers
were used F (5'CACL.O.CTACTOCTAAACOOOAAA3)
Discard !he supemaraut aod dry up the pellet at and R ( S'ACATCTOCTOOAACiOTOCT03 '). PCR
room temperature. The pelle! is resuspeoded in sequence was as foUows : DNA denamring at 94'C for 3
300 ¡t1 OEPC-water. min, followed by 35 cydes of 1 min at 94°C for ONA
denanuiug, 1 min at 55•c for primer alUlealiog, aod 1 mio
RNA pmified by precipitatiou once 0.1 volumes of at 7:ZOC for extensiou. The pro¡¡ram was tenninated with a
3 M sodüuu aceta te aud 2 volnmes of 100% 10 min exlensioo at 720C. The amplified products were
ethano1 are added aod incuba red at -SO'C for 1 hr. separaled on a !.So/o agnrose ¡td aud vi""'lized after
ethidituu bromide stailling.
Centrifuge samples at 17,000 g al 4'C for 20 mio.
Eliminare supematant and then wash !he pelle! Northern blot analysls
twice with 1 nd 70% ethaool at -20'C.
Samples coutai.ttiug 1~ ~g total RNA were lteat deuatured.
Ory rhe pellet ar room iemperantre and suspend io separated by e lectrophoresis in an 1.5% agarose gel
SO· 100 ¡t1 OEPC· water. coutaining 1So/o fonnaldehyde. and trnnsferred by
capillariry to a nylon membrane (Hybond N+, Amersbam
(If RNA is to be used for PCR methods, perfonn a ONAse I Biosciences; Piscatay NJ) using standard procedures
Table 1. RNA. yltld from dltrerent tissues of A. m•xle• na, uslng the dtscrl btd e x tr ;~~ c tlon proctdu re.
2
TleltiiM oc' r8lloe Total RNA
llaJIIFW
2601230 260/280
171
Rublo.Pifta, J.A. and Vbquoz.flota, F.A.
a e S L R Ce
1
1
......... -· .................. ---
b
Figure 2. RT ·PCR and northern blot Nsults showlng the lntegrlty of RNA i so l ~ted . C: capsule , S: stem , L:
leaf, R: root, Ce: cell culture .
(a) Agarose electrophoresis anatys1s of the RT-PCR assay with actin primers.
(b) Northern blot analysis of tlle actin gene expression usi09 a specific DIG-Iabele<l probes.
(Sambrook and Russel, 1989). The blot was bybridized by 2003). This method was developed after uusuccessful
iucubating the membrane witb a DNA probe corresponding attempls witb otber RNA isolation protocols for
to tbe actiu gene labelled witb digoxigenin (Di~ easy hyb polysaccbaride-ricb tissues (Valeuzuela-Avendaiío et al.
solutiou; Rocbe Applied Science, Indianapolis IN) at 42'C 200S). We noticed that tbe resulted after tissue griuding in
ovemigbt. TI1e probe was prepared usiug tlle PCR DIO !he presence of buffer, rapidly tumed bro\\11 perhaps, as a
Probe Synthesis kit (Roche Applied Science), following the consequeuce of polysaccharide binding oxidized pheuol.
mrumfacturer's iustructions. ..t\fter incubation, the This darkening effect was reduced but not completely
membrane was washed tv.-i ce at room temperanue in 2X avoided. adding 250 mg of PVPP per gran1 of fresb tissue.
ssc with 0.1% SDS S min each, and twice with O. LX SSC RNA precipitation with LiCl, followed by washing the
with 0.1% SDS for 20 min at 65"C (20X SSC is 3 M resollting pellet with an etbanoi/LiClmi.xture produced uot
sodiUlll cWoride with 0.3 M sodium citrate, pH 7). just a cleM, wªter soluble precipitate. b1ot also siguificantly
Hybridized probes were detected usiug the Dig increased RNA yielding.
Luminescent Detection kit (Roche Applied Science) and
exposing membranes to chemilul.lliuescence seusitive films In conclusion, we llave developed a method for Rl'IA
(Kodak Eastman. Rochester NY). extractiou from tissues presenting high contents of both
polysacchalides aud polyphenols, sucll as tbose from A.
RESULTS ANO DlSCUSSlON me:ricmw. RNA obtained by this method can be utilized for
01e detection of specific &'IA's, as showu in Figure 2.
Most A. mexicana tissues contain high amounts of latex, Altl!ough yields can be in1proved by precipitating Rl'IA
which besides being rich in polysacchatides, represen! a witl! LiCl overui~t , sllorter incubation periods (3 lu'S) also
source of polypbenols (Chaug et al. 2003), that rapidly resulted in good RNA recoveries, which allowed
oxidize during gti uding. This method produced a white, perfonning tbe extraction procedure of 8 samples withiu a 6
water soluble &'lA precipitare wilh a significan! yield (en hrs period. It. is wortb noticing lhat, RNA yields are similar.
150 ¡og per gram o.f fresb weight, (Table 1). OD ratios despite tbe tissues being extracied: Jeaves. roots, stems, or
(260/230 and 2601280) were 1.9 and 1.8, rebpect.ively capsules. This point to an importan! difference witb respect
sug~es ting Low quamities of polysaccharides, polyphenols to ofuer reponed metbods, which are frequently designed
and proteins. RNA int.egtity, as observed in agarose gels for specific tissues.
(Figtu·e 1), and yield (Table 1) were comparable to
previous1y reponed methods for tissues wilh high coutents REFERENCES
of polysacchatides and secoudary metabolites (Chao et al.
2004; Waug et al. 200~). Tbe. absence of most BEURIA, T.K.: SANTR-'1., M.K. and PAl'IDA, D.
polysaccbarides. polypbeuols and pi~ment s in tbe RNA Sanguinarine blocks cytokinesis in bacteria by inhibing
extrncts from tissues of A. mc:ricana avoided interfereuc.es FtsZ assembly and bundling. Biochemishy, November
iu iwo differeni metbods employed for fue detection o.f 200S, vol. 44. no. 50, p. 16584-16593.
specific u·ansclipts: nortbem blot (Figtore 2a) and
semiquantitative RT-PCR (Figure 2b). Moreover, fue CARDILLO, A.B.; GIULIETTI. A.M. and MARCONI.
method can a1so be applied to A . mexicaua cell cultures, P.L. Analysis and sequencing of h6hmRNA, 1ast euzyme in
which also aJ"e ric:h in pheuols and sugars (Chang et al. the tropane alknloids pathway from anthers and haity root
172
lsolatlon of functional tot;al RNA from Argemont mexlc;tn3 tlssues
culhu-es of Brugmansfa candida (Solauaceae). Elech'Ouic WANO, T.; ZHANG, N. aud DU, L. Isolntion ofRNA of
Joumal ofBiorecfmology, June 2006, \'Oi. 9, no. 3. high quality and yield from Ginkgo biloba leaves.
Bioteclmology Letters, May 2005. vol. 27, no. 9, p. ó29·
CHAN, C.X.; TEO, S.S.; HO, C.L.; OTHMAN, R.Y. and 633 .
PHANO. S.M. Optimisation of RNA extraction from
Gmci/a11a cflangii (Oracilariales, Rllodopltyta). Joumal of WANG, X.; TIAl , W. an.d Ll 1 Y. Development of an
App/ie11 Pltycology. August 2004, vol, 16 no. 4, p. 297- effic:ieut protocol of RNA isolation from recalcitrant tree
301. tissues. Molecular Bioreclmology. January 2007, vol. 38,
no. 1, p. 57-64.
CHANG, Y.C. ; HSIEH, P.W.; CHA..'IO, F.R.; WU, R.R.;
LIAW, C.C.; LEE, K.H. and WU, Y.C. Two new
protopines argewexicaines A and B and the anti HIV
alkaloid 6-acetonyldihydrochelerytrine from fonnosan
Argemone mexicana. Planta .Medica, Febmary 2003, vol.
69, no. 6, p. 148-152.
173