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12.5/21 x 2 = 1.19 Bioquímica

Segundo parcial
Examen a libro abierto

1. Calcule la carga neta de los siguientes tripéptidos a pH de 7:

a) Asp-Glu-Ser b) Ser-Gly-Thr c) Gly-Lys-Arg

2. La estructura de la morfina se muestra abajo, junto con la fórmula del

pentapéptido metionina encefalina.
La morfina tiene una potente actividad fisiológica que imita a la de la
encefalina. Sugiera una posible razón para esta propiedad.

Morfina
Metionina encefalina: Tyr-Gly-Gly-Phe-Met
Difieren sólo en el aminoácido C-terminal. Además de tratarse de un opioide y un
péptido opioide.
Inhibe las acciones de los neurotransmisores del dolor a nivel, además de aumentar
el umbral de descarga de las neuronas que transportan el estímulo doloroso,
reduciendo así las descargas de impulsos dolorosos y la percepción del dolor a nivel
de la circunvolución poscentral.
3. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es cierta con relación a la composición
de aminoácidos de las proteínas? a) Las proteínas con la misma masa
molecular tienen la misma composición de aminoácidos. b) Todas las
proteínas conocidas contienen siempre al menos uno, de cada uno los 20
aminoácidos diferentes. c) Las proteínas voluminosas tienen una distribución
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de aminoácidos más uniforme que las proteínas pequeñas. d) Por lo general

las proteínas con función diferente difieren significativamente en su
composición de aminoácidos. e) La masa molecular media de un aminoácido
en una proteína aumenta con el tamaño de la proteína. Justifique sus
respuestas.
Las proteínas con función diferente difieren significativamente en su composición
de aminoácidos: Todas las proteínas poseen una misma estructura química central,
que consiste en una cadena lineal de aminoácidos.
La secuencia de aminoácidos de que está hecha difiere a una proteína de otra, a tal
secuencia se conoce como estructura primaria de la proteína. La estructura primaria
de una proteína es determinante en la función que cumplirá después.
4. Un estudiante de Bioquímica aisló una hormona peptídica del monstruo de
Gila. Encontró que su composición de aminoácidos es Ala, Asp2, Gln2, Ile,
Lys, Met3, Phe2, Trp. La ruptura de una muestra del péptido con quimotripsina
y llevando a cabo el procedimiento de degradación de Edman en los
fragmentos resultantes, produce los siguientes péptidos: Phe, Asp-Met-Gln-
Phe, Lys-Gln-Met-Asp, IleAla-Met-Trp. Tratando otra muestra del péptido con
BrCN, el estudiante obtuvo los siguientes péptidos: Asp-HSL, Gln-Phe-Ile-Ala-
HSL, Trp-Phe-Lys-Gln-HSL. Use esta información para deducir la secuencia de
la hormona del monstruo de Gila.
Asp-Met-Gin-Phe-Ile-Ala-Met-Trp-Phe-Lys-Gin-Met-Asp-Phe
5. La leche se pasteuriza calentándola a 143 ° F (61.7 °C) durante 30 segundos
¿Cuál es la razón de que este proceso resulte eficaz para evitar la
contaminación con microorganismos?
La presencia de las micobacterias que desnaturalizan las proteínas de su pared
celular mediante la exposición al calor aplicado con el tiempo adecuado. Con la
temperatura dada se requiere más tiempo, alrededor de 30 minutos.
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6. El siguiente diagrama muestra los resultados de la electroforesis en gel de

poliacrilamida con SDS (SDS-PAGE). Identifique la proteína de cada carril
utilizando la siguiente
lista:
Hemoglobina [4]
Mioglobina [1]
Glucosa oxidasa [3]
Bacteriorodopsina [2]

Justificación de la respuesta

7. La agencia de protección Ambiental (EPA, por sus siglas en inglés) nos

advierte que debemos evitar ingerir sustancias que contengan plomo. Este
metal puede estar presente en el agua potable y en las capas de pintura viejas.
¿Qué efectos bioquímicos nocivos puede producir el plomo?
Se une a las proteínas, particularmente a aquellas de los grupos del sulfhidrilo, de
tal manera que puede alterar su estructura y su función, o bien competir con otros
metales en los sitios de enlace.
El plomo es químicamente similar al calcio, interfiere con diversos procesos
dependientes de éste. Activa la proteína C quinasa, la cual es una enzima
dependiente del calcio, vinculada con el crecimiento y la diferenciación celular, la
conservación de la barrera hematoencefálica, y la potenciación a largo plazo que se
sospecha tiene que ver con la memoria.
8. Estudiando a la enzima ribonucleasa A. Ud. obtiene los datos de actividad
para la enzima wild-type (nativa, sin modificar) y una ribonucleasa A mutante.
Las dos enzimas difieren en la posición de un aminoácido en la proteína. De
los datos de actividad Usted calcula los siguientes parámetros cinéticos:
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a) ¿Cuál enzima tiene una afinidad más alta por el sustrato? Mutante
b) ¿Cuál es la velocidad inicial de la reacción catalizada por la enzima wild-
type a una concentración de sustrato de 10 mM? 50 umol/min
c) ¿Cuál enzima desplaza más la constante de equilibrio de la reacción, Keq,
hacia la formación de su producto? Las enzimas no cambian la constante de
equilibrio de una reacción. Keq depende sólo de la diferencia entre los niveles de
energía de los reactivos y los productos (DG).
9. A partir de los siguientes datos obtenidos de una reacción catalizada por
una enzima calcule: KM, Vmax y Ki ¿Qué tipo de inhibición presenta?

S (mM) V sin inhibidor V con inhibidor

3 0.3333 4.58 0.2183 3.66 0.2732
5 0.2 6.40 0.1562 5.12 0.1953
7 0.1423 7.72 0.1295 6.18 0.1618
9 0.1111 8.72 0.1146 6.98 0.1432
11 0.0909 9.50 0.1052 9.50 0.1052

INHIBICIÓN NO COMPETITIVA
1 1
𝑏= ∴ 𝑉𝑚𝑎𝑥 = = 15.9235
𝑉𝑚𝑎𝑥 0.0628
𝐾𝑀 𝑦2 − 𝑦1 0.2101 − 0.1367 0.0734
𝑚= ∴𝑚= = = = 0.6648
𝑉𝑚𝑎𝑥 𝑥2 − 𝑥1 0.2253 − 0.1199 0.1104
𝐾𝑀 = (𝑚)(𝑉𝑚𝑎𝑥 ) = (0.6648)(15.9235)
𝐾𝑀 = 10.5859
𝑏𝐼 = 0.0778
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1 [𝐼]
𝑏𝐼 = (1 + )
𝑉𝑚𝑎𝑥 𝐾𝐼
1 [5 𝑚𝑀]
0.778 = (1 + )
15.9235 𝐾𝐼
[5 𝑚𝑀]
0.778 = 0.0628 (1 + )
𝐾𝐼
0.778 [5 𝑚𝑀]
= 0.0628 (1 + )
0.0628 𝐾𝐼
[5 𝑚𝑀]
1.2388 − 1 =
𝐾𝐼
[5 𝑚𝑀]
0.2388 =
𝐾𝐼
5
𝐾𝐼 = = 20.93
0.2388

10. Las manzanas que se recogen antes de que hayan madurado totalmente,
se pueden almacenar a bajas temperaturas en una atmosfera de nitrógeno con
el fin de mantenerlas frescas varios meses. Explique la razón por la que estas
condiciones de almacenamiento retardan el proceso de maduración.
Las bajas temperaturas retrasan el proceso de maduración, ya que “alentan” los
procesos bioquímicos en la manzana.
Las manzanas contienen hormonas, una de estas es el etileno, el cual es un
desencadenador de la maduración del fruto. Esta hormona es regulada por la
enzima Pectin metilesterasa (PME), y, de la misma forma que el aumento sirve para
aumentar la velocidad de reacciones bioquímicas, las bajas temperaturas ayudan a
retrasarlas.
11. Suponga que una compañía farmacéutica lo contrató para trabajar en el
desarrollo de medicamentos para tratar el SIDA ¿Qué información sobre lo
que usted sabe de enzimas le será de utilidad?
Hay que saber que el virus del VIH posee en su interior enzimas esenciales como
la integrasa, la transcriptasa y la proteasa, las cuales son vitales para producir
nuevas generaciones del virus. Estas enzimas esenciales se encuentran rodeadas
por una cubierta proteica contenida en una envoltura viral.
Ya que estas son vitales para la replicación del virus, una manera de intentar tratar
al SIDA es precisamente atacar a sus enzimas. Esto es posible si bloqueamos o
cambiamos las enzimas vitales, y los encargados de este trabajo son los inhibidores.