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4º Bioquímica
Comunicación e Integración Celular
Los miARN regulan la expresión génica y también se pueden liberar por las cé-
lulas en exosomas que pueden ser captadas por otras células vecinas (se pueden
considerar como hormonas).
Para introducir en el tema, vemos que el premio nobel de fisiología o medicina se les
otorgó a estos hombres por el tráfico vesicular. Los de la derecha, descubrieron con
técnicas de fraccionamiento celular que hay compartimentos celulares. La cuestión
es que estos compartimentos no están incomunicados sino comunicados entre sí, mu-
chos de ellos, no entre mitocondrias y RE, por transporte intracelular de membrana.
Este transporte describe el tráfico realizado por intermediarios de transporte esféricos
o tubulares que transportan proteínas solubles y de membrana, lo que se denomina
el cargo, de un compartimento donador a otro compartimento aceptor. El cargo en-
tonces no es solo es el material soluble sino también las proteínas de la membrana,
es todo lo que se transporta. La respuesta c) es mitad correcta luego es incorrecta.
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Paola Moyano Gómez
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− Ruta biosintética o secretora. Consiste en el transporte vesicular del RE, a través de las ERES, al Golgi (al ERGIC,
que es por donde entran al Golgi), atraviesan el Golgi y son empaquetados en vesículas que emergen del TGN (red trans
del Golgi) que se dirigen a endosomas o lisosomas o bien pueden empaquetarse en vesículas de secreción constitutivas o
bien pueden empaquetarse en vesículas que se almacenan en el citosol hasta que la célula reciba el estímulo adecuado para
dirigirse a la membrana y liberar su contenido por exocitosis (secreción regulada). Las vesículas de reguladas y constitu-
tivas se diferencian en que las primeras emergen del TGN rodeadas por una cubierta de clatrina.
− Ruta endocítica. Se inicia con la formación de vesículas que geman de la membrana plasmática y se transportan hacia
el sistema endolisosomal. Entre el sistema lisosomal y el TGN, que manda las enzimas lisosomales a los lisosomas.
Sea cual sea el origen o el destino del transporte, este transporte ocurre a través de una serie de etapas comunes:
1-Formación y gemación de la vesícula conteniendo el cargo
del compartimento donador.
2-Transporte de la vesícula gracias a los elementos del citoes-
queleto (microtúbulos a distancias largas y filamentos de actina
para distancias cortas).
3-Amarraje y anclaje de la vesícula al compartimento aceptor.
4-Fusión de la vesícula con su compartimento de destino, de
manera que se incorpora a este compartimento.
Todos los procesos de tráfico entre un compartimento u otro comparten las mismas fases: gemación de la vesícula que
transporta el cargo desde el compartimento donador, transporte de la vesícula gracias a los elementos del citoesqueleto
hasta el compartimento aceptor, la vesícula se ancla en el compartimento aceptor y se fusiona incorporándose el cargo en
el compartimento aceptor. Tanto proteínas de membrana como solubles.
El transporte tiene tres características generales: tiene que haber una selección específica del cargo a transportar, tiene
que haber una direccionalidad específica en el tráfico de la vesícula y en tercer lugar, el transporte debe de estar compen-
sado por un transporte en dirección contraria que permita mantener la identidad de los compartimentos. Como el del Golgi
y RE, es un transporte retrógrado, es un ejemplo típico que permite mantener los dos compartimentos entre tal. No es ruta
endofítica, esa es desde membrana al sistema endosoma-lisosomas. Los gránulos de secreción, como los que llevan insu-
lina, salen del Golgi y normalmente manda vesículas a la red trans del Golgi para que lo recupere. Luego también hay
tráfico retrógrado en la ruta secretora. En la ruta endofítica en parte también hay, hay parte que vuelve a ir al contrario.
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Las vesículas salen del RE por los ERES (Endoplasmatic retículo exit sites).
Existen proteínas como la SEC12, que son proteínas transmembrana del RE que
catalizan el intercambio de GDP por GTP de una proteína soluble que se deno-
mina SAR-1 (GTPasa que cuando está unida a GDP es soluble), por tanto, SEC12
es una GEF de SAR-1. Este intercambio provoca la exposición de una cola hi-
drofóbica del extremo N terminal en SAR-1, resultado de un cambio conforma-
cional, que facilita la inserción de SAR-1 en la membrana del RE. SAR- 1 es el
sitio de anclaje para reclutar proteínas.
Una vez unida, SAR-1- GTP sirve para reclutar el complejo formado por las pro-
teínas Sec23 y Sec24. Sec24 interacciona con proteínas transmembrana que se
van a transportar o que actúan como receptores de cargo que reclutan y acumulan
el cargo a transportar en esa zona del RE. Este complejo sirve para reclutar un
segundo complejo formado por las proteínas Sec13 y Sec31. Estas últimas se
ensamblan formando una red de figuras poligonales (normalmente triángulos)
que facilitan la formación de una maya en la zona de formación de la vesícula
que permite su curvatura y su gemación.
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Por una parte, Sec24 se une a proteínas de membrana que se vayan a transportar o que sirven de receptores para cargos
solubles. Es decir, que o bien sean ellos mismos que están en la membrana o bien sea un receptor transmembrana que esté
unido a cargos solubles. Al mismo tiempo, ese dímero (sec23-sec24) sirven para reclutar otros complejos, Sec13/31, que
tienen estructura fibrilar y que se ensamblan formando una red más o menos triangular que forman una malla que permitirá
la curvatura y gemación de la vesícula. Una vez que la vesícula se ha formado, tiene que liberarse de la cubierta. Las
vesículas llevan señales de destino. Tienen que liberar esa cubierta. En la vesícula actúan las GAP de Sar1 que desensam-
blan el complejo. Hay veces que las moléculas a transportar son muy grandes, por ejemplo, el colágeno, que no entran en
esas vesículas. En estas situaciones ocurre que el procolágeno, que interacciona con el complejo Sec23/24 promoviendo
la incorporación de más SAc1, que se ensamblen más complejos. Sec31 se monoubiquitina y cambia su ensamblaje. Se
ensamblan formando láminas de diamantes que permite la formación de intermediarios tubulares. Esto ya sí puede favo-
recer el transporte de esas moléculas tan grandes.
Se ve ejemplos de enfermedades que se relacionan con fallos en el sistema COPII como una displasia debida a la falta en
la secreción de colágeno porque Sec23 está mutada. Se ve un marcador del RE y el procolágeno y se ve que el procolágeno
está atascado en el RE. No tiene colágeno en la matriz extracelular. Sin embargo, tan malo es tener mal Sec23 como Sec24.
Este otro experimento demuestra la importancia de Sec24 como selección de cargo. Se ve que cuando está mutado no se
transporta esa proteína (Vangl2) y no se produce el cierre del tubo neural. No se selecciona pues no se secreta.
GEF: Sec12 (COPII), GBF1 (COPI); Sar1 (COPII)-RE; Arf1 (COPI)-Golgi. Coatómeros: Proteínas Sec (COPII); Coató-
meros (alfa, beta, gamma, …) Heterotetrátemos (COPI)
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Los dos tipos de subunidades son importantes: las pequeñas interaccionan con el citoesqueleto de actina y generan la
fuerza necesaria para la gemación o curvatura, mientras que las subunidades grandes en uno de sus extremos hacen como
una especie de Protrusión hacia adentro (esto es para nota: examen) y como está hacia dentro interacciona con proteínas
adaptadoras o proteínas CLASP (clatrin associated Shorting proteinas) que son las que interaccionan con el cargo (capta-
ción del cargo), es decir, que hay un intermediario por debajo de la clatrina. Una vez invaginada, la vesícula de clatrina se
separa por la acción de una proteína llamada dinamina, que ayuda a estrangular la invaginación y a separar la vesícula (es
la que ejerce la fuerza para separar la vesícula de la membrana).
Hay varios tipos de complejos adaptadores en estas vesículas: adaptinas. Son las proteinas CLASP:
− Monoméricos, como, por ejemplo, CGA, que interacciona con receptores manosa-6-P por lo que
permite la formación de vesículas que transportan enzimas lisosomales (todas las enzimas lisosoma-
les en el Golgi se marcan con un grupo manosa 6-P). Se encuentran en la red trans del Golgi.
− Heterotetraméricos, es decir, tienen cuatro subunidades. Se llaman de AP1 a AP4, que se asocian
a diferentes tipos de membrana e interaccionan con distintos tipos de cargos. AP1 y AP3 transportan
enzimas lisosomales, se asocian al TGN y hacen lo mismo que la CGA. AP2. Se encuentra en las
vesículas de clatrina que se encuentran en la membrana plasmática por lo que se encuentran en la
endocitosis mediada por clatrina.
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Una vez se separa la vesícula rodeada de clatrina, está cubierta se pierde porque hay PI fosfatasas que cambian los fosfo-
lípidos de la membrana de manera que las adaptinas pierden afinidad y se suelta. Clatrina media transporte en diferentes
rutas, pero ¿cómo se coordinan? Cada membrana celular tiene una composición determinada en fosfáticos de inositol que,
además, puede variar en función de las fosfatidil-inositol quinasas y fosfatasas que hay en esa membrana en particular. A
partir del PIP2 se pueden formar 5 formas distintas.
En este proceso intervienen tres grupos de proteínas: − Proteínas Rab; − Factores y complejos de amarraje (tethering); −
Proteínas Snare; − Proteínas motoras.
Una vez que la vesícula se ha invaginado, se ha empezado a formar, la vesícula rodeada de clatrina se separa por la acción
de una proteína (dinamina) ayuda a la estrangulación y separación de la vesícula, es decir, es la que realiza la fuerza para
separarla de la membrana. La clatrina interacciona a través de sus subunidades pequeñas con el citoesqueleto de actina
generando la fuerza que facilita la curvatura.
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Además, la clatrina también interacciona con complejos adaptadores que lo que permiten es la captación del cargo, como
ocurría con COPI y COPII. De hecho, estos complejos adaptadores son denominados proteínas CLASP (Casthrin associa-
ted sorting proteins). Hay de dos tipos de CLASP principales: monoméricas y heterotetraméricas. Entre las monoméricas
encontramos a GGA, quien se encuentra en la red trans del Golgi. Las enzimas lisosomales (enzimas hidrolíticas) en el
Golgi, se marcan con un grupo P en manosa, formando un grupo manosa 6P. En la cara trans del Golgi hay receptores de
manosa 6 P que los reconoce, condensan las enzimas lisosomales y emergen en forma de vesícula rodeada de clatrina.
GGA interacciona con estos receptores de manosa 6P, reconoce al receptor por un lado y por otro lado, a la clatrina,
permitiendo que se forme una vesícula, rodeada de clatrina, que arrastra las enzimas lisosomales. GGA sirve para el
transporte de enzimas lisosomas desde el TGN (red trans) a los lisosomas.
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4. Proteínas Rab
Intervienen en todos los pasos descritos desde gemación a fusión
y junto con las Snare determinan la direccionalidad de la vesícula
de transporte.
Las Rab son GTPasas que alternan entre dos estados de actividad:
están inactivas y normalmente citosólicas cuando están unidas a GDP y cuando se produce la sustitución de GDP por GTP
se asocian a la membrana diana o a complejos proteicos diana donde interaccionan con diferentes tipos de proteínas (qui-
nasas, fosfatasas, factores de amarraje, proteínas Snare…) que son las que ejecutan la acción de la proteína Rab, son sus
efectores. Una vez que han cumplido su función, las proteínas Rab son inactivadas por GAPs y se pueden disociar de la
membrana aceptora y son secuestradas en el citosol por las proteínas GDI que impiden que se cambie el GDP por GTP y
tiene que volver un nuevo estímulo para que el GDI se disocie y forma un nuevo ciclo.
Una de las funciones más importantes de las Rab es interaccionar con elementos del citoesqueleto, y es que las vesículas
en las células se pueden mover por difusión simple, pero viajan normalmente a través del citoesqueleto, concretamente
mediante los microtúbulos para recorrer distancias largas o los filamentos de actina para las distancias cortas (acercamiento
de las vesículas sinápticas una vez ancladas a la membrana plasmática). Las proteínas Rab interaccionan con las proteínas
motoras asociadas a esos elementos del citoesqueleto, no interaccionan directamente con microtúbulos. Hay dos tipos de
movimiento dependiendo de la distancia que recorren las vesículas.
Las distancias cortas ocurren mediante el desplazamiento de las vesículas sobre filamentos de actina, mediado por miosi-
nas; el movimiento de distancias largas se encuentra mediado por microtúbulos. Estos motores asociados a actina son la
miosina, como por ejemplo Rab27a que la producen los melanosomas que son exocitados, van a la membrana, van al
exterior y lo captan las células epiteliales.
En los microtúbulos se encuentran las dineínas (-) (transporte retrogrado) que es hacia dentro y las kinesinas (+) hacia
afuera (transporte anterógrado) … porque los microtúbulos en el centro están el extremo negativo en el centro y el positivo
hacia el córtex.
Por ejemplo: Rab5-GDP se encuentra inhibida por GDI, pero cuando reacciona con Rab5-GEP se disocia el GDI y se
produce posteriormente la asociación de distintas proteínas, incluyendo la Rab5-GTP activa, determinando que el endo-
soma temprano pueda capturar distintas vesículas procedentes del exterior o membrana y que se unan en un endosoma
temprano.
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Una vez que han cumplido su función, son desactivadas por GAPs provocando su disociación de la membrana y son
secuestradas en el citosol por las proteínas GDIs (GDI Rab GDP Dissociation inhibitor) en forma ya de RAB-GDP. GDIs
impiden que se cambie el GDP por GTP: Debe de llegar un nuevo estímulo para que se separe, actúe GEF y otra vez un
nuevo ciclo. *Se asocian a miosinas, kinesinas y dineínas.
5.1. Kinesinas
Respecto a los motores moleculares asociados a los microtúbulos encontramos a las
kinesinas, de las que hay más de 45 tipos distintos, constituidos por dos cadenas pesa-
das y dos cadenas ligeras (khc y KLC).
El prototipo es la kinesina 1: hetero tetrámero que consta de dos cadenas pesadas y dos
cadenas ligeras. Las cadenas pesadas en su dominio N-terminal presentan el dominio
motor que son cabezas globulares con actividad ATPasa y también en esta zona pre-
sentan el sitio de unión a microtúbulos (al ser el dominio motor, al estar conservado),
también poseen una cola.
Este dominio motor se encuentra muy conservado en las kinesinas. Sin embargo, las
kinesinas divergen mucho en sus dominios de reconocimiento del cargo, que reside
exactamente en las cadenas ligeras, que se unen en el extremo C-terminal de las pesa-
das.
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5.2. Dineínas
Se encargan del transporte retrogrado y poseen una estructura de cadenas pesadas-ligeras
que interaccionan de manera similar con los microtúbulos y con las vesículas que las ki-
nesinas.
Hay un subtipo que son las dineínas citoplasmáticas u hay otra que son las dineínas ciliares,
se asocia a cilios. Las citoplasmáticas son las únicas que están relacionadas con el transporte
vesicular. Es similar que las kinesinas porque tiene un dominio motor y un dominio de re-
conocimiento del cargo. Las proteínas motoras por sí solas no son suficientes para producir
el movimiento, sino que interaccionan con otras proteínas formando complejos motores, que
no se sabe muy bien como sucede.
Relación espacial de Rab18 con la red de microtúbulos: Las proteínas Rab determinan la afinidad con las proteínas mo-
toras que interaccionan con las proteínas del complejo motor y por otra parte con las proteínas motoras en sí y hacen que
las vesículas se mueven en una dirección u otra. Ejemplo Rab18, lo verde son la red de microtúbulos de esa célula marcado
con ac antiglobulina y en rojo vesículas de secreción. La imagen de la derecha es una ampliación. La grafica es una
superposición de las señales rojas y verdes, define donde contactan las vesículas con la red de microtúbulos. Si se graba
un video se ve que las vesículas se mueven por los microtúbulos lo que quiere decir que Rab se ancla a los microtúbulos.
Si se les añade cloruro potásico a las células, se acelera la secreción de la vesícula (el cloruro potásico causa despolariza-
ción). Se ve que las vesículas que llevan Rab, al introducir cloruro potásico, dejan de moverse por lo que Rab estabiliza la
vesícula. El modelo propuesto es que Rab se suelta de huntingtina, se une a quinesina y detiene el movimiento cuando se
produce estimulación con el objetivo de recuperar elementos de la vesícula que vuelven al Golgi.
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Hay una familia de Long coiled-coil que están en el Golgi y se llaman gigantinas. Por el otro extremo interaccionan con
proteínas Rab asociadas a vesículas o presentan dominios de reconocimiento de la membrana vesicular. Tipos: P115 (ER-
GIC y Cis Golgi-Rab1); EEA1 (endosoma-Rab5); Gigantina (Transmembrana Golgi-Rab1); GMAP120 (Cis Golgi-Arf1);
y GCC185 (Golgi-Rab9).
Mientras que las distancias largas se encuentran guiado por microtúbulos (RE al Golgi, Golgi-mb, etc) donde participan
proteínas membranas. Los microtúbulos tienen polaridad. Tenemos en la célula el centro organizador de microtúbulos en
el centro a partir del cual van los microtúbulos a la membrana. Debemos tener en cuenta que más hacia la membrana está
el extremo +. Las dineínas van de + a -, hacia el núcleo, es un transporte retrógrado. Mientras que el transporte de – a +,
está mediado por quinesinas, es un transporte anterógrado, va de núcleo a membrana.
Hay hasta 45 quinesinas diferentes en las células constituidas por dos cadenas pesadas (KHC) y dos cadenas ligeras (KLC).
Las cadenas pesadas tienen un dominio común y una larga cola que permite enrollarse a las dos cadenas pesadas. Mientras
que las ligeras se unen en el extremo C-terminal de las pesadas. El dominio motor es conservado y unido a microtúbulos.
El dominio N-terminal es el dominio motor de las quinesinas y este está muy conservado y se une a microtúbulos. Mientras
que las cadenas ligeras son variables, según el tipo de quinesina, y son las que interaccionan con las vesículas. Como
consecuencia, el dominio C-terminal que interacciona con las ligeras también es más variable. Las proteínas motoras, por
sí solas, no son suficientes para producir el movimiento, sino que tienen que interaccionar con otras proteínas formando
los denominados complejos motores.
Por su parte, las dineínas, que median el transporte retrógrado (de + a -, de membrana hacia núcleo), presentan una estruc-
tura también de cadenas pesadas y cadenas ligeras que interaccionan de manera similar a las quinesinas con microtúbulos
y vesículas, respectivamente. El motor siempre hacia el microtúbulo y conservado. Ni quinesinas ni dineínas funcionan
solas, sino que tienen que interaccionar con proteínas formando complejos motores. No se sabe muy bien como esto
ocurre, se ve un complejo motor de neuronas. Es un ejemplo. Hay que imaginar que hay una vesícula y un microtúbulo.
Es necesario proteínas como el complejo de la dinectina que permite la unión de vesícula con microtúbulos, que se ancle.
Son proteínas motoras que forman el complejo motor que no es fijo, sino que recluta de manera dinámica diferentes
proteínas que determinan a donde vana. Ahí es donde interviene las proteínas RAB que interaccionan con las proteínas
del complejo motor y con las proteínas motoras en sí haciendo que las vesículas se muevan hacia una dirección u otra.
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Uno de los efectores que tienen las proteínas Rab son los factores de
tethering o amarraje. Estos factores forman un puente entre la vesícula
y la membrana diana antes de que ocurra el ensamblaje del complejo
SNARE y la fusión de la vesícula con la membrana aceptora. Nos ima-
ginamos una sopa de vesículas viajando, se tiene que aproximar a la
membrana, en la membrana debe de haber algo que coja a la vesícula,
básicamente es esto. Hay dos tipos de factores de tethering: proteínas con
largos dominios coiled-coil y los complejos multiméricos (varias proteí-
nas).
Las proteínas con largos dominios coiled-coil lo que presentan son ho-
modímeros que presentan regiones largas en los que las correspondientes
alfa-hélices de cada monómero se enrollan formando una superhélice.
De esta forma, las proteínas tienen estructuras largas de tipo bastón, lla-
madas rod-like, con regiones bisagras entre las regiones coiled-coil que
le da una cierta flexibilidad, a diferencia de los dominios coiled-coil rí-
gidos que dan rigidez. Estas proteínas pueden tener una longitud de 50-
600 nm y actúan como lazos, capturando a las vesículas que están cerca-
nas a la membrana aceptora. Hay muchas en el Golgi. Se anclan en la
membrana aceptora mediante dominios transmembrana.
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Por ejemplo, la gigantina que está anclada en el Golgi. O bien mediante pro-
teíans Rab, Arf u otras GTPasas. Por otro extremo, interaccionan con proteí-
nas Rab asociadas a vesículas o presentan dominios de reconocimiento de la
membrana vesicular.
7. Proteínas SNARE
Una vez acercada y unida la vesícula a la membrana del compartimento
aceptor se produce la fusión de ambos compartimentos, lo que implica
que se acerquen a una distancia de 1,5 nm y que no haya agua en dicho
espacio. (sino no se fusionan los lípidos)
Entre el primer grupo están la sinaptobrevina (vesículas sinápticas) o VAMP (proteínas transmembranas asociadas a
vesículas), que son cadenas polipeptídicas simples y se incorporan a la vesícula cuando emergen del compartimento do-
nador; mientras que en el segundo grupo se presentan las sintaxinas (transmembrana) y SNAP25 (es periférica y participa
en todos los procesos de fusión, se une por lípidos del tipo palmitoil a la membrana). Ambos tipos de proteínas tienen
dominios helicoidales y cuando estos se están aproximando se enrollan unos con otros para formar un complejo estable
de 4 hélices.
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Cuando la vesícula está anclada se forma un complejo constituido por las SNARE de la vesícula, 1 molécula de SNARE
vesicular, 2 SNAp25 y una sintaxina y se asocian porque todas tienen dominios helicoidales, dando lugar a la generación
de la fuerza que permite que las membranas se acerquen hasta 1,5 nm excluyendo el agua en la zona de fusión y facilitando
la fusión de las membranas. Una vez producida la fusión y la vesícula se ha integrado en el compartimento aceptor, llega
una ATPasa, NSF, que desorganiza el complejo y permite su reciclaje para un nuevo ciclo. (Hay que eliminar el agua para
que se produzca la funsión)
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