EL ATP

Adenosina trifosfato. Funciona como el método para transferir energía entre organelos
celulares, importante para muchos procesos metabólicos, sean de síntesis o catabolismo.
La molécula tiene una base nitrogenada (adenina) que se pega a un carbono de una
pentose (azúcar de carbonos) y a 3 grupos fosfato.

Se forma a nivel de membrana gracias a una enzima llamada sintetasa de ATP o ATP
sintasa, resultado del proceso de fosforilación oxidativa. En este proceso de vibraciond e
la membrana mitocondrial proveniente del flujo de iones H incurso en la cadena
transportadora de electrones. Ese bombeo de protones o hidrogeniones desde la matriz
mitocondrial hacia el espacio intermembranal activa la enzima ATP sintasa la cual toma
moléculas de adenosina difosfaato y le adiciona un grupo fosfato para formar ATP.

El procso de bombeo de iones hidrogeno que se lleva a cabo durante la fosforilacion

oxidativa permite un paso de dichos eectrones a través de algunas proteínas de
membrana llamados citocromos que permiten su traslado continuo (entre dichas
proteínas y el citoplasma de la celula) en forma de cadena.

Otra forma de generar ATP es por medio de la fosforilación por sustrato, resultado del
rompimiento de sustratos grandes (Almidón p.e) a moléculas pequeñas. En todo proceso
de rompimiento de estructuras se produce ATP. En este proceso se genera el ATP a
partir de los grupos fosfatos donados por los sustratos catabolizados.

COFACTORES

Un cofactor o coenzima es un átomo, ion o molécula que participa en el proceso de una

enzima. Sin ser enzima ni substrato. Los cofactores se unen fuertemente a enzima
(proteína) y después de la reacción no son modificados o bien se unen como un segundo
substrato donde si son modificados y requieren otra enzima para volver al estado
original.

Los cofactores son moléculas complejas y no pueden ser sintetizados (animales y

vegetales), muchos de ellos deben ser total o parcialmente ingresados con la dieta
(muchos de ellos son, por lo tanto, vitaminas). No todos los cofactores son vitamínicos
(algunos de ellos son por ejemplo iones metálicos divalentes, es decir, minerales) ni
todas las vitaminas son cofactores enzimáticos. Aunque el cofactor no sea como tal la
vitamina, su estructura si se deriva de una vitamina.

Adicionalmente algunos de los cofactores sirven como moléculas portadoras de energía.

Cuando el cofactor se presenta en su forma reducida presenta carga positiva (NADH,
NADPH, FADH) y está cargado de energía y cuando cumple su función en la reacción
en la que interviene, se genera un proceso de oxidación, en el cual pasa a ser negativo y
no está acompañado de ningún ión (NAD, NADP, FAD), a la cuál se denomina la forma
oxidada del cofactor.

CAPACIDAD DE INTERCAMBIO CATIÓNICO

El suelo tiene a manera general tres fases a saber, fase sólida, líquida y gaseosa. En la
fase sólida se encuentran distribuídas partículas de suelo de diferente tamaño, pero cuya
composición y sobre todo carga eléctrica, es vital para determinar la posibilidad de
adaptarse a cambios de pH o posibilidad de absorber mas o menos fertilizantes. Los
suelos tienen la capacidad de absorber muchas sustancias en forma de iones o
moléculas, como por ejemplo el agua, los nutrientes pequeños (minerales), los metales
pesados y los fungicidas. La absorción, ocurre en la fase sólidad del suelo
específicamente en la superficie de las partículas sólidas del suelo, y esta determinada
por la alta superficie específica que tienen estas partículas, la cual a su vez está
determinada por el tamaño de los coloides del suelo. Existen diferentes formas en las
que se intercambian iones entre el suelo y las raíces de una planta o entre una sustancia
tipo fertilizante y las partículas del suelo, como la capacidad de intercambio aniónico
(CIA), capacidad de intercambio catiónico (CIC), absorción específica, Absorción
selectiva, Absorción específica catiónica, Absorción específica aniónica, la doble capa
difusa, entre otras.

La CIC a pesar de no ser la única forma de intercambiar iones, es la capacidad mas

importante de cambio de un suelo, en esta, las partícula del suelo absorben cationes de
la fase acuosa del suelo y liberaan otros cationes que ya tenían, estableciendo un
equilibrio en los suelos. La CIC se puede medir teniendo en cuenta la acidez cambiable
del suelo, formado por iones como el Hidrógeno (H-), el Aluminio (Al-) o el
Manganeso (Mn-) y las bases intercambiables de la fase acuosa del suelo representada
por el Ca (++), Potasio (K+), Magnesio (Mg++) y Sodio (Na+).
Una alta CIC indica que una muestra de suelo puede contener buenas reservas de Ca,
Mg y K. Estas bases pueden ser una importante fuente nutritiva de minerales para a
síntesis de biomoléculas al interior de las plantas, luego que las raíces absorban estos
minerales. Así mismo una alta CIC significa que las partículas del suelo pueden
apropiarse de mejor forma de elementos como Ca, P, K, Mg, Na, los cuales son
necesarios para el crecimiento de las plantas y los tejidos.

La CIC de una muestra indica la capacidad que posee un suelo para adsorber cationes,
siendo esto quivalente a la carga negativa del suelo. Los cationes que son sometidos a
esta retención quedan protegidos contra los procesos de lixiviación.

La CIC se expresa en cmol/Kg de suelo o en miliquivalentes/100 g de suelo. Esta

característica depende de la cantidad y tipo de coloides que tiene el suelo, es decir, la
suma de la CIC que tegan las arcillas del suelo y la CIC que tenga la materia orgánica
del suelo.

FOSFORILACIÓN OXIDATIVA

En todo proceso de rompimiento de moléculas como la vía glicólisis y posteriormente el

ciclo de Krebs, genera como subproductos moléculas energéticas, básicamente ATP y
cofactores reducidos (FADH y NADH). La energía de estas moléculas que se
encuentran de manera reducida, será utilizada por la célula en el proceso de fosfoiación
oxidativa.

El proceso de fosforilación oxidativa, también denominado cadena de electrones, se

genera una combustión continua u oxidación de los cafactores reducidos que provienen
de las fases anteriores del proceso de respiración celular (glicólisis y ciclo de Krebs) los
cuales donan electrones – que entran a una estructura de proteínas denominada
citocromos. A lo largo de este complejo de proteínas se generan reacciones eléctricas,
donde los electrones atren protones (H) que salen desde el interior de la mitocondria,
hacia el espacio intermembranal.

Este paso continuo de protones genera una vibración a lo largo de la membrana

mitocondrial, lo cual genera a su vez una activación de otra proteína ligada a la
membrana que se denomina ATP sintetasa. Como su nombre lo indica, esta enzima
tiene la capacidad de tomar moléculas de adenosina difosfto y pegar una molécula de
fosfto para formar ATP.
ENZIMAS Y CINÉTICA ENZIMÁTICA

Las enzimas son moléculas con estructuras de proteínas principalmente y están

presentes en todos los tejidos animales y vegetales. Su principal función es catalizar una
reacción en la que un sustrato A se convierte en un producto B. Para ello las enzimas
tienen un lugar dentro de su estructura que se llama sitio activo al cual se une el sustrato
generando una reacción óptima. Aunque existen algunos sustratos que no requieren de
enzimas para cambiar de estado, son mucho mas comunes en las vías metabólicas del
eje SPA los sutratos que son alterados por medio de la presencia de una enzima.
Generalmente este tipo de reacciones necesita una menor cantidad de energía de
activación ya que están mediadas por sustancias diferentes al sustrato. Existen diferentes
factores que afectan la actividad de una enzima, dicha velocidad en la que sucede la
reacción se denomina cinética. Entre estos factores se relacionan; el pH, la temperatura,
la concentración de la enzima y la concentración del sustrato. De tal manera que, bajo
las condiciones óptimas de dichos factores, las enzimas presentan su mayor actividad.

El pH al que mayor funcionan las enximas depende de cada enzima, enzimas gástricas
funcionan con pH menor a 2, mientras que enzimas relacionadas con el metabolismo de
aminoácidos funcionan con pH alcalinos. A modo general la temperatura ideal de
actividad de una enzima debe estar por debajo de 60º C, aunque las enzimas de algunos
microorganismos pueden funcionar en temperaturas extremas. Si en una reacción se
tiene pH y temperatura constante, es posible que al aumentar la concentración de la
enzima se genere mayor cantidad de producto, es decir, una mayor potencia en la
reacción.

La ecuación de Michaelis-Menten grosso modo trata de explicar la relación de que

manera en una reacción que contiene un máximo de sustrato se alcanza una máxima
velocidad de dicha reacción. Es decir, como la cinética de una reacción depende de l
máaxima concentración del sustrato.

A nivel de laboratorio, la actividad y cinética de una reacción puede ser medida de

muchas maneras, por ejemplo la actividad de la enzima puede medirse como la cantidad
de moles de sustrto convrtidos por unidad de tiempo exprsados como mmol/min,
también conocido como UI

Otra medida de la actividad catalítica de una enzima se da en catales (Ktal) que en el

sistema internacional de unidades correponde a 60 x 106 UI.
HOMEOSTASIS MECANISMO EQUILIBRIO ACIDO BASE

En cualquier proceso enzimático intervienen concentraciones eléctrica y se desprende o

se consume energía y temperatura. Estos cambios de masa y energía hacia y desde el
citoplasma están regulados por la velocidd de las reacciones y disponibilidad de
sustratos y enzimas en cualquier víaa, anabólica o catabólica.

En la naturaleza existen sustancias que pueden controlar en buena parte los cambios
bruscos en medios áacidos o básicos, también se les deomina soluciones buffer o
tampón y son aquellas que se oponen a los cambos de pH, cuando se les adicionan
ácidos o álcalis. Su acción se basa principalmente en la absorción de hidrogeniones
(H+) o iones hidroxilo (OH). En forma general una solución amortiguadora esta
conformada por una mezcla binaria de un ácido débil y una sal del mismo ácido
proveniente de base fuerte o también, una base y una sal de esta base proveniente de un
ácido fuerte.

Ejemplo, Mezcla de ácido acético y acetato de Sodio

Hidroxido de Amonio y cloruro de Amonio

El uso mas importante de este tipo de soluciones es el estudio de la regulación del

equilibrio ácido base de diversos sistemas biológicos, de tal manera qye este tipo de
oluciones son utilizadas para controlar cambios drásticos en la concentración de iones H
u OH en estudios in vivo de medios biológicos. En la naturaleza un ejemplo perfecto de
amortiguador biológico es el plasma sanguíneo, que controla cambios drásticos de pH
en sangre, manteniéndolo alrededor de 7,2 , ya que cambios incluso de un tercio de
unidad porcentual pueden ocasionar daños irreversibles en tejidos animales y vegetales.

Las principales propiedades de las soluciones Buffer son:

Regular el pH, Absorber en un medio líquido exceso de iones H+ y de iones OH,

Controlar el metabolismo ácido base en células vegetales y regular la homeostasis de la
célula vegetal y animal (Manteneindo el equilibrio entre iones con carga positiva y
negativa)

SOLUCIONES BUFFER Y SISTEMA DE AMORTIGUACIÓN

Las soluciones buffer son sustancias que tienen capacidades diferentes para evitar
cambios bruscos en el pH de una solución, esta cpacidad se denomina capacidad
amortiguadora y se mide como la cantidad de miliequivalentes de ácido o base fuerte
que puede neutralizar la solución amortiguadora, sufriendo un cambio de pH en una
unidad.

El equilibrio ácido base de las células está condicionado por un conjunto de sistemas
amortiguadores, que funcionan dentro de límites estrechos de pH a causa de su
metabolismo. Los factores de amortiguación mas imporantes en los organimso vivos
por su elevada actividad y control elevado de pH son:

a) Sistema Bicarbonato
b) Sistema Fosfto
c) Hemoglobina
d) Proteínas del plasma

Las sustancias o sistemas de amortiguación en los fluídos corporales sirven como un

sistema de defensa contra el cambio de pH. Cada compartiminto de fluído contiene tipos
y características de sustancias disueltas, algunas que son amortiguadores a un pH
fisiológico. Por eso, el pH es estabilizado por la capacidad amortigudora de los fluidos
corporales. Aparte de los sistemas de amoniaco en la orina y la hemoglobina en la
sangre, los amortiguadores en los compartimientos son idénticos. En consecuencia, el
conocer como estas solucones disueltas tienen la capacidad de amortiguar es esencial
para poder entender al equilibrio ácido base.

SISTEMAS DE AMORTIGUACIÓN MAS IMPORTANTES EN SITEMAS

ANIMALES

Sistema Bicarbonato (Anhídrido carbónico/bicarbonato)

Principal amortiguador en el fluído extracelular, pero en el caso de la célula roja de la

sangre funciona como buffer intracelular. En este sistema el dióxido de carbono CO2 se
comport como ácido voltil y su concentración puede ser controlada por medio de la tasa
de respiración del animal. Normalmente el co2 que circula en un sistema animal
reacciona con el agua del cuerpo para producir una sustancia bufferiante por naturaleza
que es el BicarbonatoH2CO3 que se puede convertir en su forma iónica H2CO - + H+ ,
dependiendo de la tasa respiratoria del animal.

A medida que un animal respira mas rápido, se acumula CO2 y se genera algo llamado
alcalosis respirtoria. Por otro lado, cuando el animal tiene una tasa respiratoria baja, el
co2 que hay en el medio es mayor al o2 consumido, por tanto se genera una amyor
cntidad de bicarbonato en su forma ionica h2co- +h+ y precisamente ese aumento de
iones H hace que el ph disminuya, generando un problema denominado acidosis
respiratoria.

Sistema fosfato

Todos los fosfatos en el animal vienen de la dieta, a un ph de 7.40, la mayoría del

fosfato en los compartimientos fluidos exite en la forma de las espeies ionicas H2PO4
-1 y HPO4 -2, cuaando el ph en los fluios corporales comienza a decaer , la espeie
HPO4 -2 se vuelve importante como unaceptate de protones y se convierte en la especie
H2PO4 -1 así, cuando el pH se eleva por encima de 7.40, la especie H2PO4 -1 dona un
protón al fluido y se convierte de nuevo en la especie HPO4 -2

Este sietma es el mas importante en fluidos biológicos como la orina, debido a los
elementos que contiene dicho fluido (sobretodo los fosfatos) . en cuadros clínicos como
la acidosis metabólica este sistema es muy importante utilizando fosfatos filtrados de
sangre e incluso huesos. Normalmente en algunso animales que movilizan importante
cantidad de calcio para producción de huevo o leche en los cuales el fosfto (cálcico) se
divide y libera el Ca y el fosfato para cumplir su función, jalonando cambios de la
acidez a la neutralidad.

Hemoglobina

Este es un sietma único pata los eritrocitos, se encuentra en alta concentración en la

sangre y present alto contendio de histidina, el cual por contener imidazol en su cadena
carbonada es capaz de ligar iones H o bien donar protones a los fluídos corporales,
permitiendo mantener el pH de los mismos cercaos a 7. Dentro de este sietama existe
otra proteína, la albúmina, que ayuda a mantener el pH al interior de lqs células. En
condiciones metabólicas la Hb se comporta como un ácido débil y la oxihemoglobina
como un ácido mas fuerte que la Hb reducida (es decir, aquella que lleva un hidrogenión
HHb) es importante anotar qye la Hb incide sobre el transporte de CO2 por la sangre,

CICLOS BIOGEOQUÍMICOS

CICLO DEL CARBONO

Las principales biomoléculas del eje suelo-plata –animal están compuestas por
C,H,O,N,P y S, a modo general los procesos de ciclaje de los principales elementos
químicos del eje SPA incluyen el ciclo de C,N,P y S. Con respeto al ciclo del C se
enmarca en la relación con el hombre, animales, suelo, plantas y atmósfera, incluso la
litósfera. Cuando los animales y los humanos ingieren oxígeno de la atmósfera, exhalan
CO2 y METANO (CH4) como resultante de los procesos metabólicos internos, el CO2
pasa a acumularse a la atmósfera o bien puede ser captado por los cloroplastos de las
plantas para que lo incluyan en la vía de la fotosíntesis. En el caso del CH4 los
rumiantes presentan un alto aporte de etse gas que se acumula en la atmósfera y se
considera uno de los principales gases de efecto invernadero.

CICLO DEL NITRÓGENO

El nitrógeno es un gas presente en el aaire disponible en la atmósfera (en forma de N

puro), y también está presente en los aminoácidos que componen las proteínas
disponibles en los vegetales y animales. Algunos compuestos que contienen nitrógeno
en forma de oxidos provienen de quemas, de fertilizantes e incluso de desechos a partir
de los cuales se volatilizan compuestos nitrogenados. El ciclo del N tiene de manera
genral tres partes, una fijación, una nitrificación y una desnitrificación. Su orden
depende del momento del ciclo que sea analizado. De tal manera que el nitrógeno
atmósferico puede ser fijado única y exclusivamente por microorganismos como
bacterias (cianobacterias) hongos, que convierten ese nitrógeno y lo convierten en NO3
(Nitrato) Este nitrato es la forma en la cual el nitrógeno está totalmente disponible para
ñas plantas y por lo tanto para os animales que consuman esas pantas. En el paso
siguiente del ciclo, los animales que consumieron esas plantas, por sus procesos
digestivos y metabólicos generan desechos, excretas y orina, los cuales continen
nitrógeno que es convertido por nitrosomas a nitritos (NO2) o bien por acetobacterias
que lo convierten en amoniaco (NH3, especialmente en orina). El NH3 se puede
volatilizar a la atmósfera, pero el NO2 puede ser convertido a NO3 por parte de
nitrobacterias, de tal manera que estará nuevamente como NO3 puede ser absorbido por
las plantas. Sin ebargo, si los desechos están expuestos a la atmósfera mucho tiempo,
son atacados por bacilos y pseudomonas que facilan su transformación a N2 el cual
retorna al aire, constituyéndose en potencialmente tóxico para al atmósfera.

Ciclo del fosforo

El P es un elemnto supremamente importante para los procesos bioquímicos y
metabólicos ya que hace parte de la molécula energética que se genera al interior de los
mismos, el ATP. Este elemnto quimico no se encuentra libre y tampoco hace parte de la
atmósfera, se encuentra mayoritariamente en rocas (denominadas fofóricas) que hacen
parte de la litofera y de materiales parentaes qe dan orígenes al suelo. En el sueñ por
,edio de proceso de meteorización se solubiliza y forma iones como el fosfato que al
unirse con clcio y otros elementos similares, hace parte de la solución del suelo, para
que las raíces de las plantas puedan absorver en forma de fosfatos y fitatos dicho elemn
to. Una vez presente y fijado en la planta el P es consumido por herbívoros quienes
pueden retornar P al suelo en sus excrementos. Una menor parte del fosforo presnte en
rocas puede lixiviarse a aguas profundas y dirigirse a ríos y mares donde se sedimenta,
alimentando planats marinas y algas que son consumidas por peces queines a su vez
pueden ser consumidos por aves. Estos animales al hacer su proceso digestivo expulsan
heces guano que es depositado en material rocoso y se inicia el ciclo nuevamente.

Ciclo del azufre

El azufre es un elemto importante en la formación de proteínas en el eje SPA y está

presente en numerosos lugares de la atmosfera, litósfera e hidrósfera. Por ejemplo, las
excrtas de los animales presentes en el eje depositan S en el suelo en forma de
sulfatos(SO4) y oxidos de azufre (SO). Al ser atacado por bacterias ambientales, estos
desechos biológicos de los animaales e incluso de pantas puede ser transformado en
acido sulfhídrico (H2S) (aunque ese gas también es produco de la digestión de
animales)

Normalmente el ion sulfato es la forma mas común en que el S se moviliza en el eje

SPA, especialmente en el suelo para ser disponible y absorbido por las raíces de las
panats. El S hace parte igualmehet del lecho marino proveniente de proceso volcánico o
bien hacer parte de algunos suelos en dosnde el material parental proviene de rocs
ígneas. El S cumple una importante función al hacer parte de los aminoácidos que
componen las proteínas en plantas y animales y formar puentes disulfuro entre las
cadenas de aminoácido y permitir la formación de estructura secundaria y terciaria de
las proteínas.

MINERALES Y SU CLASIFICACION
Los minerales son los resultados a la meteorización de material parental, proceso que
permite q elementos quimiosn estén en una forma química (sales y en solución del
suelo) biodisponibles para las raíces de las plantas del eje SPA. En este sentido los
minerales son los ladrillos o componentes básios pata componr lasbiomoleculas como
carbohidratos, lípidos y proteínas al interior de las plantas, únicos organismos autótrofos
en el eje SPA. Estos elemtos del eje SPA son inorgánicos y deben ser incluidos al
momento de fertilizar plntas o alimentar animales ya que no son producidos por
ninguno de estos organismos, sino que son transformados y excretados en forma de
iones y sales.

Dependiendo de la presencia de los minerales en los tejidos de las plantas, o en los

tejidos de los animaes los minerales se clasificn en maccro y micro minerales. Esto
coincide con los requerimientos de los minerales por parte de las plantas dado ue todos
los macrominerales se requieren en myor cantidad en pntas y en animales, todo lo
contrario ocurre con los minerales micro.

Los minerales cumplen importantes funciones en animales y vegetales, tal es el caso del
Na y el K que regulan la presión osmótica a nivel celular, así mismo, elementos como el
Mg, Ca y el mismo Na ayudan a repolarizar las membranas celulares para permitir el
impulso nervioso en neuronas y células musculares.

CARBOHIDRATOS, ESTRUCTURALES Y NO ESTRUCTURALES

Esta biomoécula también recibe otros nombres como glúcidos, azúcares (menos de 10
carbonos) e hidratos de carbono. Son moeculas vitales de energía viva en la tierra y son
sintetizados a través de fotosíntesis (fijando CO2 inorgánico), noralmete continen
C,O,H y tiene la formula aproximada (CH20)n. Las hexosas son el grupo mas
importante dentro de los azucares.

Son compuestos orgánicos (es decir, sintetizados por elementos vivos como las plantas)
aunque algunos son también formdos en tejidos animales. Exiten carbohidratos de
diferente tamaño, algunos menores de 12 carbonos (glucosa, fructosa, sacarosa) y otros
con miles de átomos de Crbono (Almidón, glicógeno, quitina y celulosa) con diversas
funciones como de reserva (almidón en vegetales y glicógeno en animales), estructura
(celulosa en planats, quitina en crustáceos), como precursores (para lípidos, prteínas e
incluso vitaminas) o como señales de reconocimiento celular (glicoproteínas)

Existen numerosas clasificaciones para os carbohidratos, existen carbohidratos que

tienen una sola unidad de azúcares, éstos se denominan monosacáridos (Glucosa,
fructosa, galactosa) los que tienen dos unidades del mismo azúcar o disacáridos (lactosa,
sacarosa, maltosa), los que tienen más de dos unidades de diferentes tipos de azúcares
(arabinosa, xilosa) los que tienen cientos o miles de unidades del mismo azúcar (homo-
poli-sacárido) o cientos o miles de diferentes unidades de azúcar (hetero-poli-sacáridos)

Otra clasificación de los carbohidratos se asocia a su presencia y ubicación en las

células de los tejidos vegetales, de tal manera que aquellos carbohidratos presentes en el
citoplasma de la célula vegetal se denominan carbohidratos no estructurales (CNE), tal
es el caso de la glucosa, la maltosa, la xilosa, la arabinosa, la fructosa, la sacarosa.
Mientras que los carbohridatos presentes en la pared celular de las plantas se denominan
estructurales (CE) ya que de hecho le dan estructura y rigidez no solo a la célula sino a
todos los tejidos de la planta, lo cual le permite de hecho, mantenerse erecta, tal es el
caso de la hemicelulosa y celulosa. Generalmente los CNE presentes en un vegetal
(tallo, hoja, fruto) son mas digeribles, mientras que los CE son menos digeribles y
solamente algunas bacterias (como las del rúmen de las vacas, ovejas y cabras) en la
naturaleza tienen enzimas caapaces de degradar la celulosa de la pared celular, presente
en las partes mas fibrosas de las plantas. Así mismo, los CE están presentes en todo
material fibroso pueden ser digeridos parcialmente por bcterias presentes en porciones
del intestino grueso de monogástricos como aves y cerdos.

LÍPIDOS

Los lípidos son biomoléculas compuestas por C,H,O y otros elementos como P, N y
otros minerales que tienen una estructura basada en ácidos grasos y glicerol como
moléculas fundamentales. Por ejemplo, una estructura muy común en los lípidos es la
estructura básica de una molécula de glicerol (de 3 carbonos) a las que se unen 3
moléculas de ácidos grasos (cadenas de carbonos unidos entre sí), siendo la disposición
de un tri acil glicrol o triglicérido. Sin embargo, existen lípidos que no siguen esta
estructura y pueden tener anillos bencénicos o estructuras no afines con esta
descripción.
Las funciones de los lípidos som variadas y van desde la protección y aislamiento
celular (gracias a la doble capa de fosfolípidos que tienen las membranas) a ser una
reserva de energía para plantas (en forma de fosfolípidos y triglicéridos en las semillas,
frutos y en forma de cutícula en el exterior de las hojas), y animales (en forma de
colestrol, triglicéridos y glicolípidos en celula de tejido adiposo)

Todos los lípidos son insolubles en agua, pero son solubles en solventes orgánicos (o no
polares, como el éter, el benceno o el alcohol. En el caso de los ácidos grasos,
únicamente se componen por C, H y tienen pocos grupos funcionales (únicamente el
grupo carboxilo o ácido). La gran mayoría de los lípidos entran en la clasificación de
saponificables (triglicéridos, glicolípidos, fosfoglicéridos, esfingolípidos) eso quiere
decir que por su composición química y los grupos funcionales que unen su estructura,
es posible separar la parte grasa de la no grasa, este proceso se denomina
saponificación. Dicho proceso utiliza una solución salina de Ph alcalino que ataca
enlaces esteres (que son los que unen al glicerol con los acidos grasos) y permite la
liberación de la parte grasa (ácidos grasos) y polares (glcerol), esta reacción forma
finalmente un jabón y glicerina.

Otros lípidos sin embargo, no son saponificables (o lípidos simples) , dentro de los
cuales se encuentran algunos lípidos que no son ta comunes dentro del eje SPA, no
contienen ácidos grasos y a modo general se pueden incluir en este grupo a las
prostaglandnas, los terpenos y los esteroides. Ellos por no contener acidos grasos no
pueden realizar el proceso de saponificación. Aquí se evidencia el papel importante de
los ácidos grasos ya que por su composición pueden cambiar la función de un lípdo. En
células vegeaes se encuentran predominantemente acidos grasos de entre 16 y 18
carbonos. Los ácios grasos mas allá de ser uniones lineales de C ( de ntre 3 y 22
carbonos), pueden presentar alteraciones en su disposición espacial, resultado de la
presencia o ausencia de dobles o triples enlaces. En este sentido existen acidos grasos
que pueden tenr dobles enlaces entre dos de sus carbonos, estos se denominan ácidos
grasos insaturados (AGI). Si el ácido graso está conformado por una cadena de carbonos
en las que todos están unidos por enlaces sencillos, este se denomina ácido graso
saturado (AGS). En la naturaleza existen AGI que tienen mas de un sitio donde dos
carbonos se unen con un doble enlace, a ellos se les denomina acido graso poli
insaturado (AGPI). Cada insaturación o doble enlace, genera un cambio en la
disposición espacial del ácido graso, lo cual al tiempo hace que sus propiedades físicas
cambien y también sus funciones. Por ejemplo, en las ultimas décadas se ha descubierto
que la de carne de peces de río presenta un alto contenido de AGPI, y su consumo se ha
asociado con una reducción del colesterol malo (VLDL) en humanos.

PROTEINAS, COMPOSICIÓN, UBICACIÓN Y FUNCIONES

Estas biomoléculas son estructuras complejas formadas por los elementos C,H,O,N,S y
en algunos casos P y en menor proporción, Fe, Cu, Mg, I, entre otros elementos.
Presentan estructuras diferenciadas de alto peso molecular, formando dispersiones
coloidales y están compuestas por L-alfa-aminoácidos en enlace peptídico, arreglados
en secuencia lineal que se enrrolla después para constituir cuatro niveles estructurales.

La unidad funcional de una proteína es el aminoácido, el cual presenta dos grupos

funcionales en una misma molecula, el grupo amino y el grupo carboxilo ( o ácido) , la
unión entre dos o mas aminoácidos forma una molécula denominada péptido, y al
mismo tiempo la unión de dos o mas péptidos forma di- tri péptidos y una cadena de
péptidos forma una estructura proteica primaria.

Una cadena primaria de proteína que se pliega en forma helicoidal da origen a la

estructura secundaria de la proteína, lo cual es resultado de la atracción electrostática
entre aminoacdos de la misma cadena lineal de péptidos, resultando es disposición
helicoidal alfa (hélice) o beta (pliegues en forma de zigzag) . cuando esa estructura
helicoidal gira sobre su propio eje y adquiere carácter tridimensional forma un nudo, la
estructura terciaaria de la proteína formada gracias a las fuerzas como puentes
disulfuros, puentes de hidrógeo e interacciones hidrofóbicas. Cuando se unen por enlacs
sencillos (no covalentes) varias estructuras terciarias de la protein.

A pesar de que muchas proteínas comparten las unidades funcionales de los

aminoácidos pueden presentar estructuras diferenciales (globulares, lineales,
compuestas, mixtas, plegadas) y también funciones diferentes.

Entro de las proteínas mas comunes están las enzimas, que sirven dentro del
metabolismo animal y vegetl para acelerar o ctalizar reacciones a nivel celular y tisular,
tal es el caso e las lipasas, proteasa y amilasas producidas en el páncreas de los animales
o la rubbisco en el caso de las pantas.

La acción de las enzimas en su gran mayoría depende de la producción o inhibición de

hormonas, que son otro tipo de proteínas y tienen la función de comandar cascdas de
reacciones y activar o desactivar enzimas, existen hormonas importantes como la
prolactina, la oxitocia, la insulina y el glucagón.

Las proteínas también cumplen otras funciones vitales parav los seres vivos dentro del
eje SPA como de transporte de sustancias en la sangre (hemoglobina, lipoproteínas)
pero al mismo tiempo ser catalizadores (como las enzimas) o servir como moléculas de
sostén o de estructura para el cuerpo de los animales (miosina, colágeno, elastina)

ALGUNAS ENZIMAS DE IMPORTANCIA EN EL SUELO Y EJE SPS

Las enzimas son proteínas que catalizan la transformación de diferentes sustratos en

absolutamente todos los eslabones del eje SPA. Exsten numerosas enzimas con
funciones importantes en los procesos metabólicas de plantas, animales e incluso al
interiro del suelo. A continuación, de realiza una descripción de algunas enzimas de
importancia pata el sueo y los vegetales.

La enzima ribulosa 1, bifosfato carboxilasa /oxigenasa o Rubisco es la encargada de

mediar el primer paso de fijación dentro del ciclo de Calvin, proceso también
denominado como fotosíntesis oscura. En este proceso de fijación, en el estroma del
tilacoide del cloroplasto de las plantas, es posible fijar moléculas de carbono inorgánico
en forma de C02 y adicionarlo a una molécula de pentosa (ribosa), este primer paso
permite que en este ciclo se generen molécula de 3 carbonnos (gliceraldehido 3 fosfato
o G3P) que a la postre se convertirán en glucosa, producto final de la fotosíntesis. Es la
enzima mas difundida en la naturaleza ya que representa cerca del 20% de la proteína
dd cualquier planta y está presente incluso en tejido vegetal muerto ya que factores
como tempertura y pH no afectan significtivamente su actividad.

Las proteínas con carácter catalítico presentes en el suelo mas estudiadas son las
oxidoreductasas (deshidrogenasas, catalasas y peroxidasas) y las hidrolasas (sobre todo
fosfatasas, proteasas y ureasa). La gran mayoría de estas enzimas tienen origen
bacteriano presentes en los agregados del suelo. Alguna de estas enzimas son
extracelulares, siendo liberadas durante el metabolismo y muerte celular. Sin embargo,
también hay algunas enzimas que hacen parte de la biomasa microbiana. Otro grupo de
enzimas están de manera inactiva y son independientes al numero de microorganismos y
de las formas de regulación de su formación y secreción de enzimas.
Las principales oxidoreductasas son la catalasa, glucosa oxidasa, deshidrogensas y
peroxidasa. Las principales enzimas del eje SPA denominadas como transferasas son la
transaminasa. Asi mismo existen otras enzimas que para funcionar como catalizadores
requieren de agua y se denominan hidrolasas, tal es el caso de la celulasa, lipasa, b-
glucosidasa, fosfatasa y ureasa.

Las enzimas fosfatasa, ureasa, deshidrogenasa y b-glucosidasa han sido estudiadas en

investigaciones donde se ha medido el efecto del anejo agronómico sobre características
de calidad o estado de sanidad del suelo. Estas enzimas median el proceso metabolico
que resultan en la liberación de P, N y C, elementos importantes en la nutrición de ls
plantas.

PRINCIPIOS GENERALES DE METABOLISMO, RESPIRACION Y

FERMENTACION

Organismo fotolitotrofos: plantas, bacterias y arqueas fotosintéticas

Quimiolitótrofos: Bacteriaas arqueas

Fotoorganotrófos: bacteris arqueas

Quimioorganótrofos: Bacterias, arqueas, hongos y animales

MECANISMO DE GENERACION DE ENERGÍA

Fotofosforilación: fotosíntesis

Fosorilacion oxidtiva

Fosforilacion a nivel de susbtrato

METABOLITOS PRIMARIOS Y SECUNDARIOS

Los metabolitos primarios se producen en el curso de las reacciones metabólicas

anbolicas o catabólicas que tienen lugar durante las fases de crecimiento y que
contribuyen a la producción de biomasa o energía por las células. Se producen
principalmente en la trofofse o fase de crecimiento.

Los metabolitos secundarios se producen por rutas anabólicas especializadas cuaando

no hay crecimiento.
Significado evolutivo controvertido por ser imprescindibles. Pueden ser una estrategia
para mantener en funcionamiento los sistemas metabólicos cuando no hay crecimiento
son indicativos de diferenciación y se producen durante la idiofase de los cultivos.

CATABOLISMO DE LA GLUCOSA

Ruta de las pentosas fosfato

Presente en muchas bacterias y en la mayoría de los eucariontes. Puede ser simultanea a

la ruta EM. Funciona en condiciones aerobias y anaerobias. Importancia en catabolismo
y anabolismo.

Ruta de la fosfocetolasa

Es la ruta que siguen ciertas bacterias lácticas (especialmente lactobacillus y

leuconostoc). Se puede considerar una variante de la ruta de la PF puesto que se forma
un azúcar C5 y, por consiguiente, tiene lugar una descarboxilación.sin embargo, en la
ruta WD la enzima fosfocetolasa rompe el azúcar C5 y da lugar a dos rams que
coinciden a la formación de lactato y etanol en un proceso de fomacion heteroláctica

DIVERSIDAD DE FERMENTACIONES

Alcohólica, hemoláctica, heteroláctica, ácido-mixta, butanodiólica, propióncia y

acetona-butanol

En la fermentación alcohólica se reduce para formar etanol y C02. Es el proceso de

fermetacion que lleva a cabo Saccharomycees crevisiae

HEMOLÁCTICA: Su úncio producto final es el ácido láctico. Estas bacterias producen

el piruvato por catabolismo de la glucosa siguiendo la ruta de Embden-Meyerhof.
Proceso presente en muchas bacterias lácticas Streptococcus, Pediococcus y varios
grupos de Lactobacillus

HETEROLÁCTICA: Su producto final no es exclusivamente ácido láctico. El proceso

tiene un rendimiento menor que la fermentación hemoláctica. El piruvato de esta ruta
procede de la vía de las pentosas. Este proceso lo llevan a cabo bacterias del grupo
láctico pertenecientes a los géneros Leuconostoc y Lactobacillus

ÁCIDO-MIXTA: Producen ácido acético, etanol, H2, CO2 y proporciones diferentes de

ácido láctico o propióncio (fórmico) según las especies.
La llevan a cabo las enterobacterias. En esta ruta de fermentación se produce ATP
además de la reoxidación del NADH+H.

BUTANODIÓLICA: Variante de la fermentación ácido mixta. Presente en algunas

enterobacterias como Klebsiella, Serratia y Erwinia

En esta ruta se producen acetoína que se detecta mediante la reacción de Voges-

Proskaauer.

ÁCIDO PROPIÓNCIO: proceso complejo en el que se genera acetato, CO2 y ácido

propióncio como rpductos finales. Ruta fementativa la presentan las bacterias del tipo
Propinobacterium y otras anaerobias estrictas prsentes en el rúmen de herbívoros.

ACETONA-BUTANOL

Tipo de fermentación llevado a cabo por bacterias anaerobias estrictas del género
Clostridium. Se producen compuestos orgánicos. Se producen compuestos org´nicos
disolventes de gran importancia industrial.

CARACTERISTICAS COMUNES DE LOS METABOLITOS SECUNDARIOS

Tinden a producirse cuando el crecimiento está limitado. Se foman por enzimas

especficos a partir del metabolismo central. No son esenciales para el crecimiento o para
el metabolismo central. Son específicos para cada especie, y a veces, de cada cepa.

POLIQUÉTIDOS

Está presnte en bacterias, hongos y plantas. Srve unicamnte para a producción de

metbolitos secundarios

TERPENOS

Se inician a partir del Acetil Co A. producen tanto metabolitos primaarios como

secundarios.

ESTRUCTURA DE LAS PROTEINAS

Las proteínas son biopolímeros de levado peso molecular, constituidas básicamente por
Carbono, H,O y N, aunque pueden contener también S y P, y en menor proporción Fe,
Cu, Mg, I, entre otros elementos.
Si el número de aminoácidos que forma la molécula no es mayor de 10, se denomina
oligopéptido; si es superior a 10 se llama oligopéptido y si el número es superior a 50 aa
se habla ya de proteína.

Se clasifican en haloproteinas y heteroproteinas según estén formadas, respectivmente,

solo por aminoácidos o bien por aminoácidos mas otras moléculas o elementos
adiconales no aminoacidicos. La organización de una proteína viene definida por cuatro
niveles estructurales denominados: estructura primaria, structura secundaria, estructur
terciaria y estructura cuaternaria.

ESTRUCTURA PRIMARIA

Es la secuencia de aa de la proteína. Nos indica que aa componen la cdena polipetidica

y el orden en que dichos aa se encuentran. La funciond e una proteína depende de su
secuencia y de la forma que esta adopte.

ESTRUCTURA SECUNDARIA

Es la disposición de la secuncia de aa en el espacio. Los aa a medida quee van siendo

enlazados durante la síntesis de proteínas y gracias a la capacidad de giro de sus enlaces,
adquieren una disposición espacial estable. Existen dos tipos

La alfa-helice: Se forma al enrrollarse helicoidalmente sobre si misma la estructura

primaria

Se debe a la formación de enlaces de hidrogeno entre el –C=O de un aa y el –NH- del

cuarto aa que le sigue

La conformación beta

Los aminoácidos no forman una hélice sino ua cadena en forma de zigzag denominada
disposición en lámina plegada. Presentan esta estructura secundaria la quertina de la
seda o fibroína.

ESTRUCTURA TERCIAARIA

Informa sobre la disposición de las estructura secundaria de un polipeptido al plegarse

sobre si mismo originando una conformación globular. Esta condormacion globular
facilita la solubilidad del agua y así realizar funciones de transporte, enximáticas,
hormonales, etc
Esta conformación gobular se mantiene estable gracias a la exstencia de enlaces entre
los radicales R de los aminoácidos. Aparecen varios tipos de enlace:

El puente disulfuro entre los puentes de aminoácidos que tienen azufre; los puentes de
hidrogeno, los puentes eléctricos; las interacciones hidrófobas

ESTRUCTURA CUATERNAIA

Informa de la unión, mediante enlaces débiles ( no covalentes) de varias cadenas

polipeeptídicas con estructura terciaria, para formar un complejo proteico. Cada una de
estas cadenas polipeptidicas recibe el nombre de protómero.

El número de protomeros varia desde dos, como en la hexoquinasa, cuatro como en la

hemoglobina, o muchas como la capside del virus de poliomieliti que cosnta de 60
unidades proteicas.

FUNCIONES Y EJEMPLOS DE PROTEINAS

Las proteínas determinan la forma y la estructura de las células y dirigen casi todos los
procesos vitales. Las funciones de las proteínas son especificas de cada una de ellas y
permiten a las células mantener su integridad, defenderse de agentes externos, reparar
daños, controlar y regulr funciones.

Todas las proteínas realizan su función de la misma manera: por unión selectiva a
moléculas. Las proteínas estructurales se unen a otras moléculas de la misma proteína
para originar una estructura mayor. Sin embargo, otras proteínas se unen a moléculas
distintas: los anticuerpos a los antígenos específicos; la hemoglobina, al oxigeno; las
enzimas a los sustratos; los reguladores de la expresión genñetoca a l ADN. Las
hormonas a sus recptores específicos.