FACULTAD DE CIENCIAS

DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGÍA
GENÉTICA MICROBIANA
TALLER

REPASO REPLICACIÓN, TRANSCRIPCIÓN Y TRADUCCIÓN

PRIMERA PARTE
Resuelvan los siguientes ejercicios.

1. La hebra molde de una región de ADN procariótico que se transcribe para sintetizar ARNm se conoce como no codificante (NC), no-informativa, antisentido
o cadena (-). Teniendo en cuenta esta información, completen el cuadro a continuación con las secuencias de ADN codificante (C), ARNm, anticodones y
aminoácidos (péptido).

ADN C

ADN NC 3’ T A C G A T C A G G G G C C G T T A A G G C T C G G C C A G A T C 5’

ARNm

ARNt

Péptido

2. A continuación, se presenta la secuencia de una de las hebras de un fragmento de ADN.

5'-GTAGCCTACCCATAGG-3'
A partir de esta secuencia se transcribe un ARNm, usando como molde la hebra complementaria a la mostrada. ¿Cuál es la secuencia del péptido,
suponiendo que no se requiere codón de iniciación y la traducción inicia en el extremo 5'?

Teniendo en cuenta todos los posibles marcos de lectura, ¿cuántos péptidos diferentes están codificados en este ARNm?
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3. Transcriban la hebra de ADN a ARN teniendo en cuenta que la ARNpol tiene movimiento izquierdo → derecha.

3’ A C A A C T A A G T A C A A A C A C G C T T C A C T A A C T A G A G G G C T 5’

Elijan el marco de lectura apropiado, reconociendo las señales de inicio y terminación, para traducir a péptido el ARNm anteriormente transcrito.

SEGUNDA PARTE
Ahora trabajarán con dos herramientas virtuales para resolver nuevamente los ejercicios del taller de manera automatizada y, así, corroborar lo que hicieron
manualmente. Las dos herramientas son: Translate del servidor Expasy y la plataforma DNA to mRNA to Protein Converter.

Sección 1: Instrucciones para resolver la segunda parte del taller.

En esta segunda sección encontrarán tres preguntas de la primera parte del taller. En esta oportunidad deberán resolver nuevamente estas preguntas utilizando
las dos herramientas presentadas anteriormente y teniendo en cuenta las siguientes indicaciones:

a) Deben solucionar al menos un ejercicio con cada una de las herramientas virtuales (Ej. si desarrollan el punto 1 y 2 con DNA to mRNA to Protein
Converter, deben resolver el punto 3 con Translate)

b) Se solicita que anexen el material gráfico de los resultados que obtuvieron en las plataformas al resolver cada ejercicio (Ej. pantallazos). El pantallazo por
sí solo no es una respuesta aceptada, deben argumentar sus respuestas teniendo en cuenta los resultados de las plataformas utilizadas.

c) Deben revisar previamente las instrucciones para el uso de cada herramienta que encontrarán en la sección 2 de esta segunda parte.

Sección 2: Explicación sobre el uso de cada herramienta

- Translate

Esta herramienta permite convertir secuencias de ADN codificante (ADN C) o ARN en sus respectivas secuencias de aminoácidos (péptidos o proteínas). A esta
herramienta se accede de manera gratuita por medio del siguiente link: https://web.expasy.org/translate/

Cuando accedan al link, se abrirá la siguiente página:

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1. DNA or RNA sequence, deben colocar la secuencia de nucleótidos que traducirán a su respectiva cadena de aminoácidos.
2. En Output format seleccionan la opción Compact
3. En DNA strands seleccionen forward y reverse
4. En Genetic codes seleccionen Standart
5. Por último, dan click en TRANSLATE!
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A continuación, observarán un ejemplo del output para una secuencia correspondiente al ADN C de un gen:

Cada uno de los recuadros obtenidos contienen las secuencias de aminoácidos correspondientes a la traducción de las secuencias input en los seis marcos de
lectura, si la secuencia proviene de una cadena sencilla, solo deben considerarse los primeros tres marcos de lectura. Las regiones rojas corresponden a la
secuencia de aminoácidos codificadas por los marcos abiertos de lectura u ORFs (del inglés Open Reading Frame) presentes en cada marco de lectura. Tengan
en cuenta que un marco de lectura y un marco abierto de lectura son dos conceptos diferentes.

- DNA to mRNA to Protein Converter

Esta herramienta permite convertir secuencias de ADN No Codificante (ADN NC) o ARN en sus respectivas secuencias de ARN y aminoácidos (péptidos o
proteínas). Pueden ingresar a la página de esta herramienta a través del siguiente link: https://skaminsky115.github.io/nac/DNA-mRNA-Protein_Converter.html

Cuando accedan al link, se abrirá la siguiente página:

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Esta página es más sencilla que la anterior, pues solo hay que ingresar dos datos:

1. Seleccionan el tipo si la secuencia es de ADN o ARN en Go to Output

2. Ingresan la secuencia que van a analizar en la casilla INPUT STRAND
3. Por último, dan click en Convert

A continuación, observarán un ejemplo del output para una secuencia correspondiente al ADN NC de un gen:

Como resultado solo se obtiene la secuencia de ADN ingresada, y su respectiva secuencia de ARN, ordenados por tripletas de nucleótidos (codones), así como
el aminoácido de cada codón. Para tener en cuenta: a diferencia de Translate, los resultados de DNA to mRNA to Protein Converter corresponden únicamente
a la transcripción y traducción del primer marco de lectura.