Interacciones génicas

Herencia Mendeliana

• El Patrón de herencia Mendeliana puede estar influído por

– Ligamiento
– Relaciones de dominancia / recesividad
– Interacciones alélicas
– Interacciones génicas
– Sexo
– Medio ambiente

• Otros genes (o sus fenotipos resultantes) tampoco siguen un

comportamiento Mendeliano debido a distintos motivos.

• No confundir herencia no Mendeliana de GENOTIPOS con

herencia no Mendeliana de FENOTIPOS
Interacciones Muchos genes colaboran en la
elaboración de fenotipos complejos.
génicas Se establecen interacciones génicas

Epístasis: tipo de interacción génica en la cual un gen altera o ejerce influencia sobre
la expresión de otro. Generalmente ambos genes se encuentran en una misma ruta
metabólica.
Caso reverso: Un gen – muchos fenotipos

Genes pleiotrópicos
 (Duplicación génica recesiva)

(Duplicación génica dominante)

Imp!! La observación de proporciones mendelianas alteradas revelan que un

carácter está determinado por la interacción compleja de distintos genes.
Complementación: dos alelos dominantes wild-type
se unen para producir un fenotipo específico,
revirtiendo el fenotipo dado por dos alelos mutantes
recesivos.
Interacciones génicas
Gen B. alelo B: negro
alelo b: marrón
Gen C. alelo C: color
Ej. Epístasis recesiva: color de pelo del ratón
alelo c: ausencia de color
(albino)
P BBcc (albino) x bbCC (marrón)
o
BBCC (negro) x bbcc (albino)

F1 Todos BbCc (negro)

F2 9 B-C- (negro) 9
3 bbC- (marrón) 3
3 B-cc (albino)
4
1 bbcc (albino)
Interacciones génicas
Ej. Color de la piel de las víboras del maiz

camuflado negro

naranja albino

Albino parece rosa

por el color de la Hb
de la sangre
 Ej. Epístasis recesiva en ruta metabólica

Permite identificar la secuencia

de pasos de una ruta bioquímica
Genes duplicados: la presencia de al menos un alelo dominante de cualquiera de los
dos genes es suficiente para expresar el fenotipo dominante.

Ej. Forma del fruto en la planta
bolsa del pastor
Alelo A1: dominante, frutos redondeados
Alelo a1: frutos redondeados
Alelo A2: dominante, frutos redondeados
Alelo a2: frutos redondeados

P A1A1A2A2 x a1a1a2a2

F1 A1a1A2a2

F2 9 A1-A2- (redondeados) En complementación

3 A1-a2a2 (redondeados)
3 a1a1A2- (redondeados)
1 a1a1a2a2 (estrechos)
15 (9:7) son necesarios
ambos genes
1 dominantes para
producir el fenotipo
Supresión: alelo de un gen que anula la expresión de otro gen. El gen supresor puede
llevar asociado su propio fenotipo o no tener otro efecto detectable mas que el de la
supresión.

Ej. Producción de malvidina Gen K: producción de malvidina.

en plantas Alelo K, dominante.
Gen D: supresor no alélico en forma
dominante (alelo D).

P KKdd (malvidina) x kkDD (no malvidina)

F1 todas KkDd (no malvidina)

F2 9 K-D- (no malvidina)

3 kkD- (no malvidina) 13
1 kkdd (no malvidina)
3 K-dd (malvidina) 3
Interacciones génicas
Plantee genotipo y fenotipo
de la F2 de un cruce
di-hibrido (r+r+ .aa x rr.a+a+)
Se cruzaron dos cepas de guisante de jardín con flores blancas y se
obtuvo una F1 homogénea con flores moradas. El cruzamiento al azar
entre individuos de la F1 produjo 96 plantas, de las cuales 53 presentaron
flores moradas y 43 blancas.
a) ¿A qué proporción fenotípica se aproxima a la F2?

b) ¿Qué tipo de interacción génica participa?

c) ¿Cómo podría demostrar si la hipótesis es correcta?

d) Imagine la base molecular de esta hipótesis

e) ¿Cuáles serían los genotipos probables de las cepas progenitoras?

f) ¿Y los genotipos de las gametas?

R: a) 16.53/96= 8.8, 16.43/96= 7.2. Proporción fenotípica: 9moradas:7blancas

b) Acción génica complementaria c) Chi cuadrado d) Via metabólica con dos
enzimas involucradas, ambas codificadas por genes haplosuficientes.
e) AAbb (blanca) x aaBB (blanca) = AaBb (moradas). F) AB, Ab, aB, ab (1:1:1:1)
.
GENOMICA FUNCIONAL
Secuenciacion masiva de organismos y generacion de bibliotecas de mutantes por
delecion genica (KO, RNAi, otros)
~25% genes son esenciales
Compensacion x genes estructural o funcionalmente relacionados
Compensacion x genes no homologos que actuan en pathways
alternativos
Robustez del sistema (mecanismos de buffereo contra perturbaciones)
IDENTIFICACION DE INTERACCIONES GENICAS A NIVEL GENOMICO

Aproximacion: genes relacionados tienden

a expresarse al mismo tiempo y en respuesta
a determinadas condiciones.

ANALISIS TRANSCRIPTOMICOS/
PROTEOMICOS
ANOTACION DE GENES DE PLASMODIUM BASADO EN PERFIL DE EXPRESION
IDENTIFICACION DE INTERACCIONES
GENICAS A NIVEL GENOMICO
Epistasis: efecto de un alelo de un gen que causa el enmascaramiento del fenotipo
causado por otro gen.

Gen X
(RNAi)

Fenotipos estudiados (cuantitativos):

-fertilidad
-crecimiento en medios definidos
Gen A Gen B Genes A y
B -sensibilidad a drogas o toxinas
(RNAi) (RNAi)
(RNAi) -etc., etc.
 RNA-based gene silencing (RNAi)
MicroRNAs

Descubiertos y mejor estudiados en en C. elegans

Silenciamiento transcripcional
Silenciamiento post-transcripcional
Interferencia con traducción proteica
Mecanismos generales muy conservados en eucariotes multicelulares

Muchas vías de aplicación exógena

Es probable que haya evolucionado como una estrategia de inmunidad
innata contra virus y trasposones
•18-24 bp tamaño del duplex
•Elección de cadena por RISC
determinado por secuencia
primaria
•Mecanismo de silenciamiento
dictado por la
complementaridad del miRNA
–Plantas > complementaridad
–Mamíferos <
complementaridad, por lo que es
más difícil identificar los targets
•Core de RISC constituido por
Argonautas conteniendo un
dominio Piwi tipo RNAsa II
•miRNA unen generalmente
zonas 3’UTR del target
•miRNAs involucrados en
desarrollo embrionario,
morfogénesis, diferenciación
celular (linfocitos T, etc.), etc.
•miRNA puede activar
silenciamiento transcripcional
por metilación de DNA
 Diseño experimental

Gusanos sincronizados
en estadio L1

Incubación a TP
hasta estadio L4
+ Fotografías /
Shift a TR Base de Datos

Scoring Manual

RNAi Bacterias 2 Screening

Screening para estudiar Interacciones Génicas (IG)

Doble mutante Cuantificacion Redes de Interacciones Genicas

del fenotipo

iRNA 2
iRNA 1

iRNA 3
iRNA 4
iRNA 5
Mut 1 2
Mut 2
3
Mut 3
Mut 4 4
Mut 5

IG

No IG
Exploracion del
Modulo
Red de Interacciones Génicas en la embriogénesis

Enhancers Supresores
IDENTIFICACION DE INTERACCIONES GENICAS A NIVEL GENOMICO

Resultados generales:
-Muchos genes con pocas interacciones y pocos con muchas (~36/gen)
-Genes + conectados son los + importantes para el fitness
-Genes + conectados son los + conservados evolutivamente
-Las redes muestran gran homologia evolutiva y “funcional”
-Las redes de interacciones genicas incluyen a las redes de interacciones proteicas