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SUBDIRECCIÓN NACIONAL DE VIGILANCIA

EPIDEMIOLÓGICA Y GESTIÓN DE LA INFORMACIÓN

INSTRUCTIVO PARA LA TOMA, CONSERVACION Y ENVÍO DE MUESTRAS


PARA EL DIAGNÓSTICO DE INFECCIÓN POR COVID 19.

COORDINACIÓN NACIONAL DE VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA

COORDINACIÓN PROVINCIAL DE PRESTACIONES DEL SEGURO DE SALUD PICHINCHA

05 DE ABRIL DE 2020

DIRECCIÓN DEL SEGURO DE SALUD GENERAL INDIVIDUAL Y FAMILIAR


[INSTRUCTIVO PARA LA TOMA, CONSERVACION Y ENVÍO DE MUESTRAS PARA
05 de ABRIL de 2020
EL DIAGNÓSTICO DE INFECCIÓN POR COVID 19.]

Contenido
1. Antecedentes .........................................................................................................................................................................3
2. Objetivo ....................................................................................................................................................................................4
3. Alcance ......................................................................................................................................................................................4
3.1. Notificación de casos sospechosos. ...................................................................................................................6
3.2. Obtención de muestras. ............................................................................................................................................6
3.3. Tipo de muestra.............................................................................................................................................................6
3.4. Conservación de muestras.......................................................................................................................................7
3.5. Envío de muestras ........................................................................................................................................................7
3.6. Recolección y manipulación de muestras de laboratorio. .....................................................................8
4. Procedimiento administrativo ......................................................................................................................................8
5. Insumos Necesarios ...........................................................................................................................................................9
6. Documentación habilitante y horario para el transporte de muestras ..................................................9
Referencias ..................................................................................................................................................................................... 10
Anexo ................................................................................................................................................................................................ 11

Dirección del Seguro de Salud General Individual y Familiar 2


[INSTRUCTIVO PARA LA TOMA, CONSERVACION Y ENVÍO DE MUESTRAS PARA
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EL DIAGNÓSTICO DE INFECCIÓN POR COVID 19.]

INSTRUCTIVO PARA LA TOMA, CONSERVACION Y ENVÍO DE MUESTRAS PARA EL


DIAGNÓSTICO DE INFECCIÓN POR COVID 19.

1. Antecedentes
El 31 de diciembre de 2019, la Comisión Municipal de Salud y Sanidad de Wuhan (provincia de Hubei,
China) informó sobre un agrupamiento de 27 casos de neumonía de etiología desconocida con inicio
de síntomas el 8 de diciembre, incluyendo siete casos graves, con una exposición común a un
mercado mayorista de mariscos, pescado y animales vivos en la ciudad de Wuhan, sin identificar la
fuente del brote. El 7 de enero de 2020, las autoridades chinas identificaron como agente causante
del brote un nuevo tipo de virus de la familia Coronaviridae, que fue denominado “nuevo
coronavirus”, 2019- nCoV.

El 16 de enero la Organización Panamericana de la Salud / Organización Mundial de la Salud (OPS /


OMS), emite la alerta internacional por eventos relacionados con el nuevo coronavirus (nCoV), y cita:

“La Organización Panamericana de la Salud / Organización Mundial de la Salud (OPS /


OMS) recomienda que los Estados Miembros, a la luz de la posible ocurrencia de eventos
relacionados con el nuevo coronavirus (nCoV), garanticen que los trabajadores de la salud
tengan acceso a información actualizada sobre esta enfermedad, que estén familiarizados
con los principios y procedimientos para manejar las infecciones por nCoV y estar
capacitados para consultar sobre el historial de viajes de un paciente para vincular esta
información con datos clínicos. (…)”

Al 27 de febrero de 2020 en la Región de las Américas, se han notificado hasta la fecha un total de
29 casos de COVID-19 provenientes de tres (3) países: Brasil (1), Canadá (13) y los Estados Unidos de
América (15). Adicionalmente, los Estados Unidos informó que 45 personas resultaron positivas para
COVID-19 entre los individuos repatriados desde Wuhan, China (3) y el crucero Diamond Princess
(42).

El 29 de febrero de 2020 el Gobierno del Ecuador confirmó su primer caso de coronavirus, en una
persona mayor que llegó de España el 14 de febrero de 2020, la Ministra de Salud tras confirmar el
caso en una rueda de prensa en Guayaquil, aseguró que se ha activado un plan nacional para
proteger a la población ante esta enfermedad catalogada de "muy alto" riesgo de contagio por la
Organización Mundial de la Salud (OMS). Las autoridades realizaron un cerco epidemiológico con
todas las personas que han tenido algún tipo de contacto con la paciente y se realizó un censo y
seguimiento a estas personas.

El 1 de marzo de 2020 autoridades del Ministerio de Salud Pública (MSP) confirmaron la existencia
de cinco nuevos casos de COVID-19 en Ecuador. Se trata de cinco personas del núcleo familiar de la
paciente ecuatoriana, que dio positivo para la nueva cepa. En los cinco casos presentan síntomas
leves y se encuentran en aislamiento en su domicilio, con los nuevos casos, en total ya se registran
seis personas con coronavirus en el Ecuador. Inicialmente, el número de personas que se dijo
estuvieron en contacto con la mujer fue de 89. Pero las autoridades confirmaron el seguimiento a
149 individuos.

Para el 17 de marzo de 2020 autoridades del Ministerio de Salud Pública (MSP) confirmaron 116
nuevos casos de COVID-19 en Ecuador, que dio positivo para la nueva cepa. En la mayoría de casos

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presentan síntomas leves y se encuentran en aislamiento en su domicilio, el número de personas que


está bajo vigilancia epidemiológica es aproximadamente 350 con cerco epidemiológico.

Para el 19 de marzo de 2020 autoridades del Ministerio de Salud Pública (MSP) confirmaron 199
nuevos casos de COVID-19 en Ecuador. Presentan sintomatología respiratoria y se encuentran
hospitalizados o en aislamiento en sus domicilios, con 3 fallecidos los cuales pertenecen al caso 0, el
número de personas que está bajo vigilancia epidemiológica es aproximadamente 575 con cerco
epidemiológico.

Para el 20 de marzo de 2020 el Ministerio de Salud Pública (MSP), pasa la responsabilidad de informar
a la Secretaria Nacional de Gestión de Riesgo, quienes informan y confirman 365 nuevos casos de
COVID-19 en Ecuador. Presentan sintomatología respiratoria y se encuentran hospitalizados o en
aislamiento en sus domicilios, con 5 fallecidos, el número de personas que está bajo vigilancia
epidemiológica es aproximadamente 746 con cerco epidemiológico.

Para el 22 de marzo de 2020 autoridades de la Secretaria Nacional de Gestión de Riesgo, confirmaron


789 casos confirmados de COVID-19 en Ecuador. Presentan sintomatología respiratoria y se
encuentran hospitalizados o en aislamiento en sus domicilios, con 14 fallecidos, el número de
personas que está bajo vigilancia epidemiológica es aproximadamente 1347 con cerco
epidemiológico.

Para el 24 de marzo de 2020 autoridades de la Secretaria Nacional de Gestión de Riesgo, confirmaron


1049 casos confirmados de COVID-19 en Ecuador. Presentan sintomatología respiratoria y se
encuentran hospitalizados o en aislamiento en sus domicilios, con 27 fallecidos, el número de
personas que está bajo vigilancia epidemiológica es aproximadamente 1347 con cerco
epidemiológico.

Para el 25 de marzo de 2020 autoridades de la Secretaria Nacional de Gestión de Riesgo, confirmaron


1173 casos confirmados de COVID-19 en Ecuador. Presentan sintomatología respiratoria y se
encuentran hospitalizados o en aislamiento en sus domicilios, con 27 fallecidos, el número de
personas que está bajo vigilancia epidemiológica es aproximadamente 1347 con cerco
epidemiológico.

2. Objetivo
El presente instructivo tiene por objetivo establecer las condiciones adecuadas para la toma,
conservación y transporte de las muestras orofaríngeas y nasofaríngeas recolectadas en las Unidades
Médicas del IESS correspondientes a la Zona 1,2,3 y las provincias de Santo Domingo de los Tsáchilas
y Bolívar, previo al envío al Hospital de Especialidades Carlos Andrade Marín.

3. Alcance
El instructivo aplica en todas las Unidades Médicas del IESS correspondiente a la Zona 1: Esmeraldas,
Carchi, Imbabura y Sucumbíos Zona 2: Pichincha, Napo y Orellana Zona 3: Cotopaxi, Tungurahua,
Chimborazo y Pastaza, acorde a la Resolución 535 (División Geográfica y Circunscripción Territorial).

Además de las provincias de: Santo Domingo de los Tsáchilas y Bolívar.

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De conformidad con las directrices del Seguro General de Salud Individual y Familiar, frente a la alerta
epidemiológica de COVID-19 remitidos por esta Coordinación mediante memorando Nro. IESS-
CPPSSP-2020-2796-M, del 06 de marzo de 2020, en el cual se establece las unidades médicas que
tendrán la responsabilidad de tomar muestras y el debido transporte para el diagnóstico de
infecciones por COVID19, y considerando el Memorando Nro. IESS-DSGSIF-2020-2685-M, de 04 de
Abril de 2020, en el cual se designa como laboratorio de referencia para la zona centro norte –
procesamiento de pruebas covid19.

UNIDADES MÉDICAS QUE TOMAN MUESTRAS


UNIDADES MÉDICAS QUE TOMAN MUESTRAS
A PACIENTES AMBULATORIOS Y
A PACIENTES AMBULATORIOS:
HOSPITALIZADOS:

Zona 2 • Hospital del Día Cotocollao

• Hospital de Especialidades Carlos • Hospital del Día Chimbacalle


Andrade Marín
• Hospital del Día Sangolquí
• Hospital General San Francisco
• Hospital del Día Tena
• Hospital General Quito Sur
• Hospital del día Coca

Zona 1: Esmeraldas, Carchi, Imbabura y


Sucumbíos

Zona 3: Cotopaxi, Tungurahua, Chimborazo y


Pastaza

Santo Domingo de los Tsáchilas

Bolívar

La captación de casos deberá́ mantenerse de acuerdo a lo establecido en los lineamientos de


vigilancia de infecciones respiratorias agudas graves (IRAG) inusitados; se aplicará además los
criterios de definición de casos sospechosos de coronavirus (COVID-19). Una vez que se haya
realizado el reconocimiento del caso sospechoso de coronavirus (COVID-19), se procederá́ a realizar
la notificación de manera inmediata al responsable de epidemiología de su unidad de salud y por la
vía más rápida, la misma que debe ser confirmada su recepción por el inmediato superior.

En la unidad de salud médica donde se capte el caso con definición de sospecha, se procederá a
llenar los instrumentos de notificación correspondientes (Epi 1 Individual y Ficha clínica
epidemiológica firmados y sellados por el médico/a de atención directa).

En las unidades que cuenten con panel viral, de acuerdo al análisis respectivo de forma paralela se
aplicará un proceso de descarte de otro tipo de patologías respiratorias como: Influenza,
parainfluenza, adenovirus, virus sincitial respiratorio, metapneumovirus. Conforme se actualicen los
criterios se desarrollará las actualizaciones al respecto de este punto.

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3.1. Notificación de casos sospechosos.


- Si el caso con definición de sospechoso es captado en establecimientos de salud del
IESS - Dirección del Seguro General de Salud Individual y Familiar (primero, segundo y
tercer nivel de atención): el epidemiólogo del establecimiento de salud o quien cumpla sus
funciones, deberá solicitar la toma de muestra al responsable de laboratorio capacitado.
- Además, debe notificar paralelamente al epidemiólogo provincial del IESS Zona 2 y al
epidemiólogo distrital / zonal de salud del Ministerio de Salud Pública.

3.2. Obtención de muestras.


Las muestras deben ser tomadas por personal capacitado y teniendo en cuenta todas las
instrucciones de bioseguridad, incluyendo el uso de los equipos de protección personal adecuados
para las precauciones estándar, de contacto y de transmisión aérea. En particular, el personal debe
usar higiene de manos adecuada, bata, respirador (N95 o FFP2), protección para los ojos (gafas) o
faciales (protector facial) y guantes.

3.3. Tipo de muestra


Hisopado nasofaríngeo e hisopado orofaríngeo: se debe tomar un hisopado nasofaríngeo (ambas
narinas) y un hisopado orofaríngeo (los hisopos y medios de transporte viral serán los específicos
entregados para esta vigilancia), los cuales deben colocarse y transportarse en el mismo tubo con
medio de transporte viral de acuerdo a las “Directrices de Laboratorio para la Detección y el
Diagnóstico de la Infección con el Virus COVID-19” actualizado al 30 de marzo de 2020. PAHO

No se recomienda muestreo de contactos asintomáticos de forma rutinaria

Imagen tomada de: https://epidemiologiamolecular.com/diagnstico-gripe-laboratorio/

Posterior a la toma de la muestra, coloque los hisopos inmediatamente en los tubos de medio de
transporte viral o en los tubos estériles que contengan solución estéril de cloruro de sodio al 0,9% o
fosfato buffer salino (PBS) a una temperatura de 2 a 8°C y debe conservarse o enviarse al laboratorio
respetando la cadena de frío.

Los hisopos y medio de transporte viral (MTV) serán proporcionados por el Hospital de
Especialidades Carlos Andrade Marín (Unidad Técnica de Genética y Molecular).

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Lavado broncoalveolar: Recoja 2-3 ml en un envase de recolección de esputo con tapa de rosca,
estéril y a prueba de fugas, o en un recipiente seco estéril. Refrigere la muestra a 2-8 ° C. En el caso
de hospitalización y Unidad de Cuidado Intensivo.

3.4. Conservación de muestras


Las muestras respiratorias deben mantenerse refrigeradas (4-8 °C) y enviarse al laboratorio donde se
procesarán dentro de las 24-72 horas de la toma.

Si se utiliza la muestra de transporte en solución salina, se debe conservar en cadena de frío hasta
las 48 horas. El envío de estas debe ser priorizado; sin embargo, en casos excepcionales en donde
no se puedan enviar las muestras dentro de este período, se recomienda congelarlas a -70 °C (o
menos) hasta que se envíen de manera urgente (asegurando que se mantenga la cadena de frío).

3.5. Envío de muestras


Para el transporte de muestras debe usarse el sistema básico de triple empaque de acuerdo al sistema
de la IATA, según lo recomendado por la Organización Mundial de la Salud para el transporte de
muestras biológicas infecciosas; IATA Dangerous Goods Regulations (DGR) 58th Edition 2017, ver
figura; así como seguir las recomendaciones del manual de transporte de las sustancias infecciosas
del INS. El embalaje debe constar de tres componentes:

• Recipiente principal o primario hermético: es el que contiene la muestra


• Embalaje secundario/contenedor secundario hermético: debe ser resistente y antifugas
• Embalaje exterior rígido adecuado: cuenta con una superficie de una dimensión de al menos
10 cm x 10 cm.

Imagen tomada de: Lineamientos para la vigilancia por Laboratorio de virus respiratorios. Ministerio de Salud de
Colombia.

Las unidades adaptarán de acuerdo a su realidad y asegurarán el envío de muestra adecuada


en triple empaque, de no ser así se convertirá en un criterio de rechazo de la misma.

Para realizar una descontaminación o desinfección del exterior del contenedor primario, se puede
utilizar hipoclorito de sodio al 1%, alcohol al 70% o algún otro desinfectante según disponibilidad.

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3.6. Recolección y manipulación de muestras de laboratorio.


Todas las muestras recolectadas para las pruebas analíticas deben considerarse potencialmente
infecciosas, y el personal sanitario encargado de recoger o transportar las muestras clínicas debe
observar y cumplir rigurosamente las precauciones estándares y precauciones específicas, para
reducir al mínimo la posibilidad de exposición a los virus patógenos, entre las principales medidas
tenemos:

• Asegurar que el personal sanitario que recolecte las muestras biológicas use el Equipo de
Protección Personal apropiado (EPP: nivel dependiendo del procedimiento)
• Asegurar que el personal encargado de transportar las muestras reciba capacitación sobre
prácticas seguras de manipulación y procedimientos de descontaminación de derrames.
• Asegurar que el talento humano de los laboratorios de las instalaciones de atención médica
se adhiera a las normas de bioseguridad para manejo y procesamiento de muestras

4. Procedimiento administrativo
- Las unidades médicas antes mencionadas por medio de su representante de epidemiología
será el encargado de coordinar con el responsable de laboratorio clínico o microbiológico la
solicitud del requerimiento por escrito y este último será el responsable de retirar las pruebas
de detección molecular COVID-19, de acuerdo al consumo diario que se presente según la
fase y con los documentos de respaldo legalmente vigentes.
- Se realizará el registro respectivo en los sistemas MIS/AS400 el médico de atención directa
y sistema VIEPI de los casos el responsable de epidemiología.
- Se define que las muestras respiratorias adecuadas para la detección molecular COVID-19
será:
o Hisopado nasofaríngeo y orofaríngeo.
o Lavado broncoalveolar en los casos pertinentes.
- Los profesionales de salud asignados a la toma de muestra (Laboratorio Clínico o
Microbiológico), serán capacitados de acuerdo a los protocolos establecidos para la toma de
muestras según la normativa vigente del MSP y procederán al registro de la misma en una
hoja de trabajo que crearán para el efecto. Además, donde se cuente con profesionales de
salud entrenados podrían ejecutar la toma de muestra en servicios como por ejemplo Unidad
de Cuidados Intensivos.
- La rotulación del envase deberá ser completo legible y sin correcciones o alteraciones en el
que deberá constar nombre CODIFICADO (utilizando las dos iniciales de los nombres y
apellidos en el siguiente orden: PRIMER NOMBRE SEGUNDO NOMBRE - PRIMER APELLIDO
- SEGUNDO APELLIDO.
Por ejemplo: Luis Mario Cedeño Macías, se procederá a codificar LUMACEMA),
el número de cédula, fecha y hora de la toma de muestra. Se deberá garantizar
que el formulario de solicitud de la toma de muestra conste la misma
información, además del nombre del profesional que efectúa la toma de la
muestra.
- Una vez que sea trasladada la muestra al Hospital de Especialidades Carlos Andrade Marín
será el personal de Biología Molecular (Unidad Técnica de Genética y Molecular) quién reciba
la muestra correctamente empacada y los documentos habilitantes respectivos.
- Las muestras serán recibidas en el servicio antes mencionado del HECAM en horario de 7:00
hasta las 18:00 de LUNES A DOMINGO. Las muestras que fueren recogidas fuera de este
horario deberán ser almacenadas en refrigeración.

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- El resultado será emitido dentro de las 24 - 72 horas después de la recepción de muestras, y


reportados en el sistema MIS/AS400 Y VIEPI MSP.
- Luego del seguimiento del caso sospechoso catalogado para covid19, se procederá a llamar
y notificar al paciente del resultado del laboratorio.

5. Insumos Necesarios
EQUIPO DE PROTECCIÓN PARA LA TOMA DE MUESTRAS
PERSONAL
- Bata - Medio de transporte viral con hisopos (provisto por el
- Respirador N95 o FFP2 HECAM)
- Protector facial o gafas - Cápsulas de empaque o triple empaque de acuerdo a
- Guantes. la realidad de las unidades de salud. (provisto por
- Gorro cada unidad médica)
- Cooler de transporte (provisto por cada unidad
médica)
- Gel refrigerante (provisto por cada unidad médica)
- Termómetro para control de temperatura (provisto
por cada unidad médica). De ser posible.

El personal de salud de cualquier servicio hospitalario debe establecer la notificación de


forma inmediata hacia el responsable de epidemiología, si un paciente con infección
respiratoria aguda cumple con la definición de caso sospechoso para investigación de
COVID-19.
6. Documentación habilitante y horario para el transporte de muestras
DOCUMENTOS HABILITANTES HORARIO DE RECEPCION DE MUESTRAS

1.- Formulario 010: examen de laboratorio CIE


10: U071 Enfermedad Respiratoria Aguda
debido a CoVid19 firmado y sellado.
- 07:00 a 18:00
2.- Formulario de Notificación y cierre de caso
EPI 1 Individual, firmado y sellado por el
médico de atención directa.

3.- Ficha de Investigación clínico-


epidemiológica, firmado y sellado por el
médico de atención directa.

4.- Búsqueda Activa Institucional (BAI) y


Levantamiento de contactos de acuerdo a
clasificación de riesgo.

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Referencias

- Ministerio de Salud Pública. (2019). Procedimientos Operativos para el Manejo de Casos


Sospechosos y Confimados por el Virus Ébola (2 ed.). Quito.
- NAEMSP. (2020). Consideraciones para coronavirus en servicios de emergencias médicas. Estados
Unidos.
- OMS. (2020). Boletín de Actualización Epimidemiológica nuevo coronavirus Covid-19. Ginebra
- OMS. (2020). Global Surveillance for human infection with novel coronavirus Covid-19. Ginebra.
- https://www.who.int/es/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/advice-for- public/q-a-on-
infection-prevention-and-control-for-health-care-workers-caring-for- patients-with-suspected-or-
confirmed-2019-ncov.
- https://www.paho.org/hq/index.php?option=com_docman&view=download&category_slu g=guias-
5603&alias=47902-recomendaciones-basicas-para-la-prevencion-y-control-de- infecciones-
asociadas-a-la-atencion-de-la-salud-1&Itemid=270&lang=es
- https://www.paho.org/hq/index.php?option=com_docman&view=download&slug=directrices-
provisionales-de-bioseguridad-de-laboratorio-para-el-manejo-y-transporte-de-muestras-asociadas-
al-nuevo-coronavirus-20191-2019-ncov&Itemid=270&lang=es
- Directrices de Laboratorio para la Detección y el Diagnóstico de la Infección con el Virus COVID-19
Actualización 30 de Marzo de 20202.

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Anexo

Sra. Mgs. Lizbeth Geovanna Silva Guayasamín.


Líder de Epidemiología - Coordinación Provincial de Prestaciones del Seguro de Salud Pichincha

Sr. Mgs. Juan Miguel Galarza Guamán. 05/04/2020


Jefe de la Unidad Técnica de Genética y Molecular - Hospital de Especialidades Carlos Andrade Marín

Elaborado por:
Sr. Dr. Lenin Fernando Chachapoya Rivas.
Líder de Provisión - Coordinación Provincial de Prestaciones del Seguro de Salud Pichincha
Sr. Mgs. Felipe Alexander Andrade Cóndor
Subdirector Nacional de Vigilancia y Gestión de la Información del Seguro Salud

Sra. Mgs. Mayling Desiree Encalada Diaz


Coordinadora Nacional de Vigilancia Epidemiológica de Seguro Salud
Validado por: 05/04/2020

Srta. Mgs. Jenny Elizabeth Ojeda García


Epidemióloga. Coordinación Nacional de Vigilancia Epidemiológica de Seguro Salud

Sra. Mgs. Sandra Elizabeth Salazar Obando


Coordinadora Provincial de Prestaciones del Seguro de Salud Pichincha

Aprobado por:
Sr. Dr. phD Eduardo Mauricio Espinel Lalama 05/04/2020
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