BIOTECNOLOGÍA

MICROBIANA
LICENCIATURA EN BIOTECNOLOGÍA
4º CURSO. Asignatura Cuatrimestral.
PROGRAMA DE LA ASIGNATURA
6 créditos: 4.5 Teóricos+1.5 Prácticos
CURSO 2006 / 2007

DEPARTAMENTO: BIOLOGÍA MOLECULAR E INGENIERÍA

BIOQUÍMICA
ÁREA ACADÉMICA: MICROBIOLOGÍA
PROFESORES:
Teoría: Dr. Eduardo Santero Santurino
(esansan@upo.es; extensión 49386)

Prácticas: Dr. Aroa López Sánchez

(arlopsan@upo.es; extensión 49053)
 UNIVERSIDAD PABLO DE OLAVIDE
Facultad de Ciencias Experimentales
Licenciatura en Biotecnología
BIOTECNOLOGÍA MICROBIANA. CURSO 2008-2009.

OBJETIVOS
Los microorganismos tienen una extraordinaria importancia en Biotecnología. En primer lugar, muchas enzimas y
productos microbianos son de interés en la industria. En segundo lugar, los microorganismos son utilizados muy
abundantemente como agentes productores, tanto de productos de origen microbiano como de otros orígenes. Por último, la
extraordinaria diversidad de actividades microbianas que puede ser utilizada en procesos biotecnológicos de interés con
distintas finalidades. Con esta asignatura se pretende que el alumno se familiarice con la importancia real de los
microorganismos en los procesos biotecnológicos, así como el extraordinario potencial que aún queda por desarrollar. Se
presentan las herramientas básicas que posibilitan la manipulación genética de microorganismos enfocadas hacia su
utilización en la producción de sustancias de interés biotecnológico, así como los diferentes sistemas de expresión génica,
tanto en procariotas como en eucariotas, su potencialidad y limitaciones, y los productos o actividades microbianas de
interés en procesos biotecnológicos. Estos conocimientos se desarrollarán desde un punto de vista aplicado concretándose
en procesos de interés actual que tengan utilidad biomédica, interés industrial o para la agricultura o el medio ambiente.

ORGANIZACIÓN DEL CURSO

El curso está basado fundamentalmente en la impartición de clases teóricas, la realización de prácticas y
actividades complementarias. Las actividades complementarias incluyen la presentación oral en forma de seminario de una
parte del temario de la asignatura por parte de los estudiantes, la realización de un trabajo escrito y la elaboración y
resolución de cuestiones y problemas, que tendrán carácter voluntario.

CLASES TEÓRICAS
La asignatura Biotecnología Microbiana presenta inicialmente a los microorganismos como seres vivos
enormemente diversos y peculiares desde todos los puntos de vista en comparación con los seres macroscópicos. El primer
bloque temático, Principios de Biotecnología Microbiana, utiliza la diversidad y peculiaridad de los microorganismos
como hilo conductor para presentar los diversos aspectos de interés biotecnológico en bloques temáticos posteriores. A su
vez, en este primer bloque se presentan otras características de interés de los microorganismos como la facilidad de su
cultivo y manipulación, que los hace agentes de producción biotecnológica ejemplares.

Las aplicaciones biotecnológicas concretas tanto de los productos como de las actividades de los microorganismos,
son el objeto de estudio de los siguientes bloques temáticos. En el segundo bloque, Productos microbianos de interés
industrial, se presentan una selección de estos productos, empezando por la propia biomasa microbiana en sí y pasando por
varios polímeros bacterianos, diversos metabolitos primarios, y finalizando con la producción de biocombustible de origen
microbiano. El tercer bloque se centra en la Biotecnología de los alimentos, de importancia vital en el desarrollo histórico
de la humanidad, en el que se incluyen también las bebidas fermentadas como el vino o la cerveza, así como el control
microbiológico de los alimentos. En el cuarto bloque, Agrobiotecnología, se tratan los aspectos beneficiosos que pueden
tener tanto las bacterias como los hongos, particularmente las micorrizas, en el crecimiento y producción de cultivos
comerciales, así como la utilización de bacterias como vector en ingeniería genética de plantas y diversos microorganismos
o sus productos en el control microbiológico de plagas en cultivos comerciales. En el quinto bloque, denominado
Biotecnología Ambiental se tratan temas de depuración biológica de aguas residuales urbanas, el potencial de los
microorganismos en la eliminación de contaminantes y en biominería. El sexto bloque denominado Biotecnología
microbiana en medicina, se centra en la utilización de microorganismos para la formulación de distintos tipos de vacunas,
así como para la producción industrial de antibióticos generados de forma natural por hongos y bacterias, así como la
producción heteróloga de otros medicamentos como insulina, interleukinas, etc. Finalmente, el bloque temático denominado
Biocatálisis, se dedica a describir los procesos de biotransformación industriales en los que bien los microorganismos
completos o algunas de sus enzimas son los biocatalizadores, poniendo de manifiesto el interés industrial por actividades
enzimáticas con características particulares, y la importancia de la regio- o enantio- selectividad de las enzimas en la síntesis
de determinados compuestos orgánicos.

2
PRÁCTICAS
Las clases prácticas están pensadas como complemento a la docencia teórica. Las prácticas se centrarán en un
aspecto concreto: la producción heteróloga por parte de bacterias. Los estudiantes utilizarán estirpes de E. coli para producir
un colorante textil, el índigo, y en la práctica se enfrentarán con uno de los problemas más frecuentes en la producción
heteróloga de proteínas: la estabilidad del fenotipo productor.

ACTIVIDADES COMPLEMENTARIAS
SEMINARIOS

Los alumnos/as participarán de forma voluntaria en la presentación de algunos de los temas del temario teórico
al resto de sus compañeros/as. Ello incluye la búsqueda bibliográfica orientada por el profesor, la lectura de ella, la
discusión de las cuestiones que surjan, aclaración de dudas con el profesor, etc. Finalmente, cada alumno/a realizará
individualmente una presentación oral en formato seminario de un aspecto concreto de uno de los temas del bloque temático
correspondiente. Los seminarios estarán apoyados por una presentación en formato PowerPoint o similar, compatible con
los ordenadores disponibles. La duración de esta presentación será de 20 minutos máximo y se realizarán dos seminarios en
una misma hora de clase teórica. En la misma semana que imparta un seminario el estudiante ha de facilitar al profesor un
extracto del seminario que va a impartir en formato electrónico (4 páginas máximo a espacio y medio en letra Times 12), en
el que incluya los libros y referencias adicionales, así como el documento de presentación de las figuras utilizadas durante la
exposición. El profesor hará este material accesible al resto de los compañeros/as. Tras la presentación oral, los estudiantes
puntuarán de forma anónima la actividad complementaria de cada uno de sus compañero/as en función de la organización
del seminario, adecuación de la cantidad de información al tiempo de exposición disponible, claridad en la exposición de los
aspectos importantes, etc.

TRABAJOS ESCRITOS

Los estudiantes podrán realizar de forma voluntaria un trabajo escrito sobre algún tema concreto de interés
relacionado con los contenidos de la asignatura. Tanto la elección del tema como la bibliografía seleccionada por el propio
estudiante deberán estar supervisados por el profesor antes de realizar el trabajo. Las referencias empleadas deberán ser
citadas al final del trabajo. La extensión máxima del trabajo será de 7 páginas mecanografiadas a espacio y medio con letra
tipo Times o Times New Roman, tamaño 12 (referencias aparte). Cualquier intento de plagio detectado en dichos trabajos
significará el suspenso inmediato en la asignatura. Los trabajos escritos se entregarán al profesor de teoría de la asignatura
antes de la fecha del examen.

CUESTIONES

Cada estudiante podrá redactar de forma voluntaria el enunciado de hasta 4 cuestiones/problemas, a los que debe
acompañar la respuesta que considere correcta de forma argumentada y la razón por la que considera de interés esa cuestión
que ha enunciado. En su caso, dicha cuestión/ problema NO PUEDE ESTAR RELACIONADA con el seminario que haya
impartido o vaya a impartir. Las cuestiones se presentarán por correo electrónico a través de la WebCT al menos dos
semanas antes de la fecha del examen teórico. El profesor se compromete a hacer estas cuestiones accesibles al resto de los
estudiantes y a incluir en el examen de teoría algunas de estas cuestiones que considere particularmente relevantes. Esta
actividad también es puntuable en función del interés de la cuestión presentada.

EVALUACIÓN
Evaluación de los exámenes de teoría, prácticas y actividades complementarias.

La evaluación de los conocimientos teóricos adquiridos por el alumno en cada cuatrimestre se llevará a cabo mediante un
examen final, calificado de 0 a 9, un seminario calificado de 0 a 1 punto, un trabajo escrito voluntario, calificado de 0 a 1
punto, y la presentación de cuestiones/problemas resueltos, calificada de 0 a 1 punto. Se considerarán aprobados los
contenidos teóricos cuando la calificación del examen teórico correspondiente sea mayor o igual a 4 y la suma de todas las
calificaciones sea mayor o igual que 5.

La asistencia a las clases prácticas es obligatoria, y las faltas de asistencia no justificadas se penalizarán en la calificación,
pudiendo conllevar incluso el suspenso en la asignatura. La evaluación de los conocimientos prácticos adquiridos se llevará
a cabo por medio de 1 cuestionario, calificados de 0 a 10, que el alumno contestará tras la realización de la práctica.

3
La calificación numérica de la asignatura (CN) será: CN = (CP+3CT)/4, siempre que CT sea ≥ 5 y CP sea ≥ 3,5. En caso
contrario, la calificación global será Suspenso. Las calificaciones de Aprobado, Notable y Sobresaliente se asignarán de
acuerdo con la normativa vigente. Se adjudicará la calificación de Matrículas de honor a aquellos alumnos que, habiendo
obtenido Sobresaliente, presenten la mayor calificación numérica.

Convocatorias de septiembre y diciembre.

Aquellos alumnos que no hayan aprobado la teoría o la práctica en la primera convocatoria podrán presentarse en las
convocatorias de septiembre o diciembre, con las limitaciones que recoge la normativa universitaria. Las calificaciones de
teoría y de las actividades complementarias se mantendrán hasta la convocatoria de diciembre (inclusive). Una vez
aprobadas, las calificaciones de las prácticas se mantendrán de forma indefinida. Aquellos alumnos que no hayan aprobado
las prácticas en la convocatoria de diciembre tendrán que repetir las sesiones para poderse examinar de nuevo.

PROGRAMA DE CLASES TEÓRICAS

Bloque I.- Principios de Biotecnología Microbiana.
1. Diversidad Microbiana.
2. Metagenómica.
3. Microorganismos de interés industrial.
4. Producción heteróloga de proteínas.

Bloque II.- Productos microbianos de interés industrial:

5. Biomasa.
6. Polímeros.
7. Metabolitos primarios
8. Energía.

Bloque III.- Biotecnología de los alimentos.

9. Bebidas
10. Productos lácteos
11. Otros alimentos fermentados.
12. Control microbiológico de los alimentos

Bloque IV.- Agrobiotecnología.

13. Rhizobium y PGPRs.
14. Agrobacterium.
15. Micorrhizas.
16. Plaguicidas naturales.

Bloque V.- Biotecnología Ambiental.

17. Depuración de residuos urbanos.
18. Biodegradación de contaminantes orgánicos.
19. Biorremediación.
20. Biominería

Bloque VI.- Biotecnología Microbiana en Medicina.

21. Fundamentos de inmunología.
22. Vacunas.
23. Antibióticos.

Bloque VII.- Biocatálisis.

24. Enzimas microbianas de interés.
25. Optimización del biocatalizador y del proceso.

4
PROGRAMA DE PRÁCTICAS:
PRODUCCIÓN DE METABOLITOS POR MICROORGANISMOS MODIFICADOS
GENÉTICAMENTE

OBJETIVOS

Iniciar al alumno en el manejo y modificación genética de microorganismos para la producción de metabolitos con un
posible uso industrial.

CONTENIDOS

1. Adquisición de nuevos fenotipos mediante transferencia de información genética por transformación.

2. Análisis de los microorganismos modificados mediante técnicas de biología molecular
3. Comparación de la eficiencia de distintas opciones para la superproducción de proteínas con actividades
enzimáticas de interés
4. Aislamiento y cuantificación del metabolito producido

BIBLIOGRAFÍA Y PÁGINAS WEB DE INTERÉS.

BIBLIOGRAFÍA BÁSICA
- Fermentation, Microbiology and Biotechnology. 2007. El-Mansi et al. 2ª Edición.CRC Taylor & Francis.
ISBN-10: 0-8493-5334-3. ISBN-13: 978-0-8493-5334-5.
- Microbial Biotechnology: Fundamentals of Applied Microbiology. 2007. A. Glazer & H. Nikaido. ISBN-10:
0521842107. ISBN-13: 978-0521842105
- Microbial Biotechnology. 2006. A. R. Alagawadi, P. U. Krishnaraj, K. S. Jagadeesh, S. Kannaiyan. Alpha
Science Intl Ltd; 1 edition. ISBN-10: 8173197253. ISBN-13: 978-8173197253
- Microbial Biotechnology: Principles and Applications. 2006. Lee Yuan Kun. World Scientific Publishing
Company; 2ª edición. ISBN-10: 9812566767. ISBN-13: 978-9812566768- Microbiología. 2005. L. Prescott, J.
Harley, D. Klein. ISBN: 844860525XX. McGraw-Hill Interamericana
- Industrial Microbiology. An introduction. 2001. M.J. Waites, N.L. Morgan, J.S. Rockey, G. Hington.
Blackwell Science, Oxford. ISBN: 0-632-05307-0
- Brock Biología de los Microorganismos, 10ª Edición. 2003. M. Madigan, J. Martinko, J. Parker
ISBN: 8420536792. Prentice-Hall.

BIBLIOGRAFÍA COMPLEMENTARIA
- Production of Recombinant Proteins-Novel Microbial and Eukaryotic Expression Systems. 2004.
G. Gellissen.Wiley-VCH. ISBN 3527310363
- Agrobacterium tumefaciens: From Plant Pathology to Biotechnology. 2004. E. Nester, M. P. Gordon & A.
Kerr. APS Press. ISBN 0890543224
- Mycorrhizal Technology in Agriculture - From Genes to Bioproducts. 2002. S Gianinazzi, H Schuepp, K
Haselwandter and J M Barea. Springer. ISBN 3764364858

5
 - Industrial Biotransformations. 2006. A. Liese, K. Seelbach & C Wandrey. Wiley-VCH Verlag GmbH & Co.
ISBN: 9783527310012
- Pharmaceutical Biotechnology. 2004. O. Kayser & R. H. Müller. Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. ISBN:
9783527305544
- Biocatalysis. 2004. A.S. Bommarius& B.R. Riebel. Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. ISBN: 9783527303441

- Physiology and Biochemistry of Prokaryotes. 2000. D. White. ISBN: 0195125797. Oxford University Press.

- Microbial Physiology and Metabolism. 2000. D. R. Caldwell. ISBN: 0898632080. Star Pub. Co..

- Foundations in Microbiology, 5th Ed. 2005. K. P. Talaro. ISBN: 0072552980. McGraw-Hill.

- Molecular Biotechnology: Principles and Applications of Recombinant DNA. 2003. B R. Glick & J.
Pasternak. ASM Press. ISBN: 1555812244
- Microbiología industrial: Los microorganismos de interés industrial. 2000. J. Y. Leveau & M. Bouix.
Acribia. ISBN: 84-200-0920-2
- Metabolic engineering in the post genomic era. 2004. B. N. Kholodenko and H. V. Westerhoff (Editores).
Horizon Bioscience, cop.
- Environmental Microbiology. 2000. Raina M. Maier, C. P. Gerba, I. L. Pepper. ISBN: 0124975704. Academic
Press, Inc.
- Microbial Ecology: Fundamentals and Applications. 1997. R. M. Atlas, R. Bartha. ISBN: 0805306552.
Addison Wesley Longman, Inc.
- Modern Food Microbiology. 2005. J.M. Jay y otros. Springer Science+Business Media. ISBN: 0-387-23180-3
- Microbiology and Technology of fermented food. 2006. R. H. Hutkins. Blackwell Publishing. ISBN:0-8138-
0018-8.
- Introducción a la Inmunología Humana. 2005. L. Fainboin y J. Geffner. Editorial Médica Panamericana.
ISBN: 950-06-0797-2.

- Biotecnología Ambiental. 2005. F. Castillo y otros. ISBN: 8473602110. Editorial Tébar.

- Biology of wastewater treatment. 2004. N F Gray. Imperial College Press. ISBN 1860943322
- Introduction to biocatalysis using enzymes and micro-organisms. 1995. Stanley M.Roberts y otros.
Cambridge University Press

DIRECCIONES DE INTERÉS EN INTERNET (son direcciones generales desde las cuales se puede seguir
buscando. Si te interesa navega desde ellas)

http://www.asmusa.org/

La página de la Sociedad Americana de Microbiología (ASM). Se puede encontrar información interesante y

buenas fotos y videos sobre temas de microbiología. Pulsa “MicrobeLibrary”. Son editores de algunas de las
revistas más prestigiosas de Microbiología, con acceso gratuito online a todos los artículos con antigüedad mayor
de un año.

http://www.socgenmicrobiol.org.uk/links.htm

Lista de enlaces a fuentes de información de microbiología de la página de la Sociedad de Microbiología General

del Reino Unido. Desde aquí se puede llegar a muchísima información de microbiología en internet.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

La página principal del National Centre for Biotecnology Information. Desde aquí se puede llegar a mucha
información e incluye enlaces a búsquedas bibliográficas y otras bases de datos.

6
 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/

Lugar de acceso gratuito a Medline, la mayor base de datos de trabajos científicos de contenido biológico o
biomédico. El primer lugar donde uno debe acudir si quiere buscar bibliografía científica sobre cualquier tema.

http://www.labmed.umn.edu/umbbd/

La base de datos sobre rutas de biodegradación de distintos compuestos xenobióticos de la Universidad de

Minnesota (UM-BBD). 100 rutas de degradación de compuestos. Estupendos enlaces con bases de datos de gran
interés en biodegradación y metabolismo global: microorganismos degradadores, rutas metabólicas generales,
compuestos químicos, etc. Pulsa “Useful Internet Resources”.

http://metacyc.org/

Base de datos no redundante de rutas metabólicas caracterizadas experimentalmente. 900 rutas metabólicas de
otros tantos organismos, junto con información de los compuestos asociados, enzimas y sus genes.

http://www.cib.csic.es/~sem/

Página de la Sociedad Española de Microbiología. Tiene enlaces con otros muchos sitios con información
interesante de temas microbiológicos.

http://www.cica.es/

Página del Centro de Informática Científica de Andalucía. Incluye acceso a numerosas bases de datos, Medline
entre ellas y otros muchos servicios para la comunidad universitaria andaluza.

RECURSOS EN EL SERVIDOR DE LA UPO

Toda la información relativa a la asignatura se publicará en el servidor WebCT de la UPO, incluyendo las presentaciones
Powerpoint de los temas, bibliografía adicional, los protocolos y calendarios de las prácticas, las convocatorias de examen y
las calificaciones obtenidas.

TUTORÍAS

Las tutorías se llevarán a cabo a demanda, sin horario preestablecido y previa cita. El profesorado de la asignatura entiende
que las tutorías son una herramienta fundamental de aprendizaje y de comunicación y recomienda a los alumnos que no se
cohíban a la hora de hacer uso de las mismas. No se darán cita para tutorías en las 24 horas anteriores a la realización de
ningún examen de la asignatura. Los teléfonos y e-mails de contacto de los profesores se indican en la primera página.