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Biología Celular y Molecular

Propiedades del Material genético

• Replicación
• Guarda información
• Expresión de información
• Variar información
Dogma Central de la Biología Molecular

Ø Dogma central de la biología molecular, hipótesis formulada por Crick en 1953


Ø “ADN solo puede convertirse en ARN y en ARN en proteínas”
Ø La información no va siempre ADN a ARN, en algunos casos la información puede ir de
ARN a ADN
Ø Transcripción inversa.
Ø Transcripción: Construcción de una secuencia de aminoácidos con la información
proporcionada por moléculas de ADN.
Ø Traducción: Construcción de una secuencia de aminoácidos con informcion porporcionada por
moléculas de ARN
Ø Los 20 aminoácidos representados en el código genetico por tripletes
Ø 64 codones que codifican para un aminoácido especifico
Ø 61 para aminoácidos y 3 de terminación de traducción
Ø Sintesis de proteína ocurre en el ribosoma. 2 subunidades de liviana para el ARNm y
otra pesada, con 2 sitios para el ARNt
ADN
Ø El ácido desoxirribonucleico (ADN) y moléculas de proteínas asociados
las cuales están organizados en estructuras llamadas cromosomas.

Ø El ADN contiene toda la información genética de la célula.



ADN Como Material Genético
Ø Durante el siglo veinte la estructura que contenía la información
hereditaria que pasaba de generación en generación fue generalmente
atribuida a la proteína.
Ø La diversidad y especificidad de las proteínas parecía apropiada para el
material genético.
Ø El ADN parecía muy simple para llevar información tan compleja.
Evidencia circunstancial que soporta el ADN como
el material genetico
Ø En el ADN fue encontrado en el núcleo, del cual ahora se conoce que
lleva genes.
Ø Un tinte que ataba al ADN mostraba que la cantidad de ADN en la célula
somática fue 20 veces mas que en los huevos de gallina o esperma,
como era la expectativa de Mendel en sus descubrimientos.
Experimentos de Griffith Streptococcus pneumoniae R
Streptococcus pneumoniae S
1920
Ø Inocular bacterias de la cepa S en ratones de laboratorio sanos, los cuales contraen neumonía
y, de acuerdo a lo previsto por Griffith, mueren.
Ø Inocular bacterias de la cepa R en ratones de laboratorio sanos, los cuales no contraen
neumonía y, de acuerdo a lo previsto por Griffith, viven.
Ø Hervir un cultivo de bacterias de la cepa S, matándolas por calor y luego inocular el fluido
resultante en ratones de laboratorio, los cuales viven.
Ø Mezclar bacterias de la cepa S muertas por calor con bacterias vivas de la cepa R, luego
inyectar la mezcla en ratones de laboratorio. Estos contraen neumonía y mueren.
Griffith notó que al mezclar la cepa R, inocua, con el precipitado de la cepa S muerta por calor,
“algo” transforma a la cepa R en cepa S, provocando la muerte del ratón y proliferación de cepa
S en los tejidos del animal. Griffith no pudo explicar que era el “algo” que volvía a la cepa R en
cepa S, y llamó al fenómeno observado “transformación bacteriana”.
Experimento de Hershey y Chase. 1952
Experimento de Hershey y Chase. 1952

Ø Para ello marcaron radiac,vamente los dos componentes químicos del fago, con
35S (que se incorpora a la proteína) y 32P (que se incorpora al ADN).
Ø A con,nuación se realizó una centrifugación para separar los fagos de las
bacterias, de modo que las bacterias, más grande y más pesadas, quedan en el
sedimento, mientras que los fagos se quedan en el sobrenadante.
Ø Encontraron que la radiac,vidad del 35S aparecía en el sobrenadante mientras
que la del 32P aparecía en el sedimento, a par,r del cual aparecieron nuevas
parGculas víricas marcadas radiac,vamente, lo que demostraba que el ADN era el
material gené,co.
Otras características del ADN de doble cadena

Ø El agua se asocia con el ADN e influencia su estructura. En la vida real, la columna


de azúcar-fosfato de la forma “B” del ADN está completamente hidratada, y el agua
ocupa tanto el “major groove” como el “minor groove”. En el caso del agua
localizada en el minor groove, sirve para estabilizar la hélice.
Ø El ADN como lo hemos descrito en esta diapositiva se encuentra en un estado
“relajado” porque no tiene giros extra. El ADN en este estado es rígido, el círculo de
ADN más pequeño posible en este estado contiene al menos 170 pares de
nucleótidos.
Ø Existen proteínas presentes en todos los organismos encargados de doblar el ADN y
estas provocan que la molécula presente giros estrechos.
Evidencia indirecta favoreciendo al ADN como
material genético en Eucariotas
Ø Distribución del ADN:
Ø Las proteínas son abundantes en el citoplasma, mientras el ADN se encuentra solo en el
núcleo, donde la información genética es almacenada.
Ø Relación entre la cantidad de ADN y niveles de policía:
Ø Funciona para ADN, pero no para proteínas.
Ø Mutagénesis:
Ø La luz UV es mayormente mutagénica a una honda de 260 nm. Ambos, el ADN y el ARN
absorben gran cantidad de luz UV, pero las proteínas la absorben a 280 nm, y sin un
efecto mutagénico.
Evidencia directa favoreciendo el ADN como
material genético en eucariotas
Ø Análisis molecular utilizando tecnología de ADN recombinante.
Ø Plantas y animales transgénicos
Estructura del ADN

Ø Esta compuesto por polimeros llamados


nucleo1dos
Ø Cuatro nucleo1dos hace diferente al
ADN
Ø Dos purinas (Adenina y Guanina)
Ø Dos pirimidinas (Citosina y Tiamina)
Erwin Chargaff (1950)

Ø A = T y G = C en el ADN (en todas las especies analizadas)


Ø La cantidad de purinas = a la cantidad de pirimidinas
Ø Las proporciones actuales de cada base varia en diferentes
especies
Estructura molecular de la Pentosa presente en los
ácidos nucleicos
• Son monosacáridos que tiene 5 carbonos en su estructura, la
pentosa que forma parte de la estructura de ADN es la
desoxirribosa, su formula es C5H10O4
Estructura de las principals bases en los acidos
nucleicos
Estructura del deoxyadenosine-5’-fosfato
Base Nitrogenada Nucleósido Nucleótido
Adenina Adenosina Ácido Adenílico
Guanina Guanidina Ácido Guanílico
Citosina Citidina Ácido Citidílico
Timina Timidina Ácido Timidílico
Uracilo Uridina Ácido Uridílico
Enlaces de hidrogeno de las bases
Estructura del AND (Watson – Crick 1953)

Ø El ADN es una doble hélice enrollada helicoidalmente “a derechas” (sentido dextrorso).


Algo parecido a dos muelles entrelazados.
Ø Enrollamiento de tipo plectonémico: para separar las dos hélices es necesario girarlas
como si fuera un sacacorchos
Ø Cada hélice es una serie de nucleótidos unidos por enlaces fosfodiéster en los que un
grupo fosfato forma un puente entre grupos OH de dos azúcares sucesivos (posiciones
3’ de un azúcar y 5’ del siguiente)
Ø Las dos hélices se mantienen unidas mediante puentes o enlaces de hidrogeno
producidos entre las bases nitrogenadas de cada hélice. Siguiendo los datos de Chargaff
(1959), la Adenina de una hélice aparea con la Timina de la hélice complementaria
mediante dos puentes de hidrógeno. Igualmente, la Guanina de una hélice aparea con
la Citosina de la complementaria mediante tres puentes de hidrógeno.
Estructura del AND (Watson – Crick 1953)

Ø Las dos hélices por razones de complementaridad de las bases nitrogenadas son
antiparalelas, teniendo secuencias de átomos inversas. Una hélice lleva la secuencia
5’P → 3’ OH , mientras que la hélice complementaria sigue la secuencia de átomos
3’OH → 5’P.
Ø El diámetro de la doble hélice es de 20 Å.
Ø Las bases nitrogenadas son estructuras planas perpendiculares al eje de la doble
hélice y están apiladas unas sobre otras a una distancia de 3,4 Å. Cada 10 bases, cada
34 Å se produce una vuelta completa de la doble hélice (360º).
Ø Las bases se encuentran en sus configuraciones cetónicas, cumpliendo así las reglas
de apareamiento A-T y G-C.
Ø La secuencia de bases nitrogenadas puede ser cualquiera, no existe ninguna
restricción
Síntesis del ADN
Diferencia entre el ADN y el ARN
Ø ARN es de una sola hebra
Ø El azúcar del ARN es la ribosa
Ø Tiamina es reemplazada por Uracil en el RNA
ADN ARN
Es un ácido nucleico que contiene las La información contenida en el ADN
instrucciones genéticas usadas en el determina qué características se
desarrollo y funciones de todos los van a desarrollar o desactivar,
organismos vivientes. Los genes del ADN se mientras que los tipos variados de
expresan, o manifiestan, por medio de ARN hacen el trabajo.
proteínas que se producen con la ayuda del
ARN.

La guía de instrucciones que un organismo Ayuda a llevar a cabo las


viviente debe seguir para existir y instrucciones del ADN al transferir
mantenerse funcionando. Retiene el código genético necesario para la
información de mediano a largo plazo, creación de proteínas desde el
almacenada de forma estable y transmite núcleo hasta los ribosomas.
información genética.
ADN ARN
Doble hebra. Tiene dos hilos de Hebra sencilla. Como el ADN, el ARN
nucleótidos que consisten de un grupo se compone de un grupo fosfato, un
fosfato, un azúcar de 5 carbonos (el 2- azúcar de 5 carbonos (la ribosa,
deoxiriboso estable) y 4 bases con menos estable) y 4 bases con
nitrógeno: adenina, tiamina, citosina y nitrógeno: adenina, uracilo, citosina
guanina. y guanina

Adenina con Uracilo (A-U) y Citosina


Adenina con Tiamina (A-T) y Citosina
con Guanina (C-G)
con Guanina (C-G)

Dependiendo del tipo de ARN, la


El ADN se encuentra en el núcleo de la molécula se puede encontrar en el
célula y en los mitocondrias núcleo de la célula, el citoplasma y
en los ribosomas
ADN ARN
El azúcar ribosa es más reactiva
El azúcar deoxiribosa en ADN es
pro el enlace C-OH. No es estable
menos reactiva por los enlaces C-H.
en condiciones alcalinas. ARN
Estable en condiciones alcalinas. El
tiene brechas más grandes, que
ADN tiene brechas más pequeñas,
lo hace más vulnerable a virus y a
creando mejor defensa contra
enzimas.
ataques externos (virus).

El ADN se auto-replica El ARN se sintetiza del ADN


cuando se necesita.
La geometría helical del ADN es La geometría helical del ARN es
de forma-B. El ADN se protege en de forma-A. Las hebras de ARN se
el núcleo porque está hacen, rompen y se reúsan. El
compactado densamente. El ADN ARN es más resistente a los
se puede dañar con exposición a daños de rayos ultravioletas.
rayos ultravioletas.
ADN ARN

Significa Ácido deoxiribonucleico Ácido ribonucleico


Definición Es un ácido nucleico que contiene las instrucciones genéticas La información contenida en el ADN determina qué características se van a
usadas en el desarrollo y funciones de todos los organismos desarrollar o desactivar, mientras que los tipos variados de ARN hacen el trabajo.
vivientes. Los genes del ADN se expresan, o manifiestan, por medio
de proteínas que se producen con la ayuda del ARN.
Función La guía de instrucciones que un organismo viviente debe seguir Ayuda a llevar a cabo las instrucciones del ADN al transferir el código genético
para existir y mantenerse funcionando. Retiene información de necesario para la creación de proteínas desde el núcleo hasta los ribosomas.
mediano a largo plazo, almacenada de forma estable y transmite
información genética.
Estructura Doble hebra. Tiene dos hilos de nucleótidos que consisten de un Hebra sencilla. Como el ADN, el ARN se compone de un grupo fosfato, un azúcar
grupo fosfato, un azúcar de 5 carbonos (el 2-deoxiriboso estable) y de 5 carbonos (la ribosa, menos estable) y 4 bases con nitrógeno: adenina,
4 bases con nitrógeno: adenina, tiamina, citosina y guanina. uracila, citosina y guanina

Pareo de Adenina con Tiamina (A-T) y Citosina con Guanina (C-G) Adenina con Uracila (A-U) y Citosina con Guanina (C-G)
bases
Localización El ADN se encuentra en el núcleo de la célula y en los mitocondrios Dependiendo del tipo de ARN, la molécula se puede encontrar en el núcleo de la
célula, el citoplasma y en los ribosomas
Estabilidad El azúcar deoxiribosa en ADN es menos reactiva por los enlaces C-H. El azúcar ribosa es más reactiva pro el enlace C-OH. No es estable en condiciones
Estable en condiciones alcalinas. El ADN tiene brechas más alcalinas. ARN tiene brechas más grandes, que lo hace más vulnerable a virus y a
pequeñas, creando mejor defensa contra ataques externos (virus). enzimas.

Propagación El ADN se auto-replica El ARN se sintetiza del ADN cuando se necesita.


Características La geometría helical del ADN es de forma-B. El ADN se protege en el La geometría helical del ARN es de forma-A. Las hebras de ARN se hacen, rompen
únicas núcleo porque está compactado densamente. El ADN se puede y se reúsan. El ARN es más resistente a los daños de rayos ultravioletas.
dañar con exposición a rayos ultravioletas.
• Estas proteínas pueden provocar otras variantes en la forma
“B” del ADN como son:
1. Secciones de cadena simple
2. Loops
3. Hairpins
4. Supercoiling

Luis Eduardo Sanchez Timm PhD


Luis Eduardo Sanchez Timm PhD
• Todos los cromosomas (ADN) contienen regiones
“supercoiled”, ejemplos cotidianos que podemos tener son las
piolas, las ligas, cables de teléfono (antiguos), mangueras de
jardín, etc.

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• El ADN cromosómico puede tomar fácilmente la forma
“supercoiled”. En las células, el ADN esta estrechamente
enrollado a través de DNA-binding proteínas, lo que hace que
el numero de nucleótidos presentes en cada giro, se
incremente en un ~6%. Aun mas, cuando el ADN de doble
cadena se desenrolla, lo que debe ocurrir cada vez que se
sintetiza ARN, y cuando el ADN es replicado.

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Proteínas

• Las proteínas son polímeros lineales de


aminoácidos. Los genes codifican las proteínas,
y las proteínas llevan a cabo roles esenciales en
todo proceso genético, incluyendo la síntesis
de ADN y ARN y otras proteínas.

• Algunas proteínas se pegan al ADN o ARN y


otras son enzimas que actúan sobre ácidos
nucleicos, donde ciertas se unen a secuencias
específicas de ácidos nucleicos (otras no son
específicas).

Ringo, J. (2004). Fundamental genetics. Cambridge University Press.


Luis Eduardo Sánchez Timm Ph.D.
Aminoácidos
• Las proteínas son un tipo de polímero lineal conformado por
aminoácidos.
• Un aminoácido es un ácido carboxílico pequeño con un grupo
amino. Existen cientos de aminoácidos diferentes, pero solo 22 son
conocidos por ser codificados genéticamente, y dos de estos
(selenocisteina y pirrolisina) se encuentran solo en pocas proteínas.

Las masas moleculares de los 20 aminoácidos comunes que son


codificados genéticamente, tiene un rango de entre 75 a 204 Da.
Luis Eduardo Sánchez Timm Ph.D.
Luis Eduardo Sánchez Timm Ph.D.
Péptidos
• Es un polímero corto de aminoácidos, usualmente compuesto
por 30 (o menos) aminoácidos. Los aminoácidos en los
péptidos están unidos por puentes peptídicos, un Puente
covalente entre el átomo de carbono del carboxilo de un
aminoácido y el átomo de nitrógeno del núcleo amino del otro.
• Un polipéptido es polímero más grande de aminoácidos,
generalmente 100 o más.

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• No hay un estándar convencional para delinear los péptidos y
polipéptidos. Una proteína puede ser un polipéptido simple, o
puede componerse de varios polipéptidos unidos por puentes
débiles (ej. Puentes de hidrógeno).

• Según su estructura, las proteínas tienen varios niveles de


organización: primario, secundario, terciario y cuaternario.

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Estructura primaria
• Es la secuencia de aminoácidos. El hilo de
aminoácidos es considerablemente más
fino en comparación a una cadena de ARN
o ADN, esto porque los aminoácidos son
mucho más pequeños que los nucleótidos.

• La sección final del polipéptido con el


grupo amino libre, es llamado el terminal
N (N-terminus), y el final con el grupo del
ácido carboxil libre es llamado terminal C
(C-terminus).

Luis Eduardo Sánchez Timm Ph.D.


Estructura secundaria
• Es la forma asumida espontáneamente por
cada segmento de un polipéptido; Las más
comunes son la alfa (α) y la beta (β).
• La hélice alfa tiene alrededor de 0.3 nm de
grosor, con un promedio de 3.6 aminoácidos
por vuelta, y el largo de cada vuelta tiene
cerca de 0.6nm.
• La “cinta” beta es una sección plana de
aminoácidos; dos o más de estas Cintas
pueden asociarse en una “hoja beta” (β-
sheet), formada por puentes de hidrógeno
entre las Cintas. Las hojas beta le dan fuerza
a la proteína, y generalmente se encuentran
en proteínas con roles estructurales.

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Estructura terciaria
• Es el patrón de doblado de la estructura
secundaria, tal como la hélice alfa, en
conformaciones tridimensionales.
• Las proteínas llamadas chaperones ayudan
en la formación de estructuras terciarias.
• En los diagramas de estructuras terciarias,
las cadenas de hélices alfa u hojas beta son
mostradas como secciones aplanadas,
mientras que las regiones que las conectan
se grafican como cuerdas finas.

Luis Eduardo Sánchez Timm Ph.D.


Estructura cuaternaria

• Es la asociación de dos o más


polipéptidos a través de enlaces
químicos débiles. Cada polipéptido es
considerado como una sub-unidad de la
proteína total, y las sub-unidades son
nombradas con letras griegas, un
ejemplo de esto es la RNA polimerasa
en E. coli que es un pentámero =
α2ββ’σ.

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• El número de subunidades en una proteína u otra molécula están
designados por prefijos. Un ejemplo de esto es la RNA polimerasa de E.
coli que es un pentámero (5 polipéptidos asociados).
• Si la subunidad de una proteína es idéntica, se usa el prefijo “homo”, si
no lo es, se usa el prefijo “hetero”.
• Cada polipéptido es codificado por una molécula de RNA. Luego de que
un polipéptido es sintetizado, puede ser cortado o incluso tener un
“splicing” y algunos de sus aminoácidos pueden ser modificados
enzimáticamente, por ejemplo, por la adición de un grupo acetilo o una
azúcar. Número de subunidades
1
nombre
monómero
Número de subunidades
11
nombre
undecamero

• Los péptidos son3 generados


2
al cortar un
dímero
trimero 13 polipéptido
12 dodecamero
en pedazos.
tridecamero
4 tetramero 14 tetradecamero
5 pentamero 15 pentadecamero
6 hexamero 20 eicomero
7 heptamero 21 uneicomero
8 octamero 22 doeicomero
9 nonamero 30 tricomero
10 decamero

Luis Eduardo Sánchez Timm Ph.D.


Dominios de las proteínas
• Una proteína, incluso un polipéptido simple, puede tener
algunas regiones estructural y funcionalmente distintas
llamadas dominios. Un dominio contiene varias estructuras
secundarias (hélice alfa, cinta beta).
• Los dominios están conectados de tal manera que se pueden
mover independientes entre ellos. Una función puede ser
llevada a cabo por uno o varios dominios cooperando entre sí.

Luis Eduardo Sánchez Timm Ph.D.


Dominio

• Los Dominios
estructurales son
estructuras terciarias
estables e
independientes. Pueden
variar en función o
unidades de estructura y
pueden evolucionar,
existen y funcionan de
forma independiente.
• Por lo tanto, el mismo
dominio puede ser parte
de diferentes proteínas,

Three domains of Thermus aquaticus elongation factor EF-Tu: in blue (all-β),


red (α/β) and green (all-β).

Luis Eduardo Sanchez Timm PhD


Motif
• Son super-estructuras secundarias, Su rol puede ser estructural
Estructural o funcional. Funcional

Beta turn structural motif. The four residues are shown in stick
representation, the strands are as cartoon arrows. Nitrogen is The transcription factor SATB1 (right: green and blue)
shown in blue, oxygen in red and the chiral carbon of Glycine contains a helix-turn-helix motif (blue) that can to bind
residue in yellow. DNA (left).
Luis Eduardo Sanchez Timm PhD
Las proteínas ayudan en los procesos genéticos

• Ni el RNA o el DNA trabajan por cuenta propia. Las proteínas participan en cada
proceso genético, por ejemplo, la síntesis y degradación de RNA, transporte de
ácidos nucleicos, síntesis de proteínas, posicionamiento y movimiento de los
cromosomas, división nuclear, y división celular.
• Las proteínas también forman parte del cromosoma de los organismos. Mientras
realizan estas funciones, las proteínas deben estar unidas específicamente a otras
proteínas, o a ácidos nucleicos, y en algunos casos, catalizan reacciones químicas.

Luis Eduardo Sánchez Timm Ph.D.


Unión entre
proteínas

Unión a secuencas
Unión inespecífica
Proteína-proteína específicas de Unión a RNA
al DNA
DNA

Luis Eduardo Sánchez Timm Ph.D.


https://www.youtube.com/watch?v=kTbeC7e2kKA
Luis Eduardo Sanchez Timm PhD

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