Aconitasa citosólica

La cAcn interconvierte el citrato e 2 en el citoplasma, lo cual permite equilibrar la cantidad

de NADPH obtenido por la deshidratación de isocitrato y la cantidad de acetil-
coA generado a partir de citrato. Estos dos productos son necesarios para la síntesis
de ácidos grasos y numerosos procesos metabólicos, como la glucólisis o
la gluconeogénesis.
A su vez, la actividad enzimática del cAcn parece contribuir en la defensa celular contra el
estrés oxidativo al proporcionar una fuente de isocitrato para la producción de
NADPH. Glutatión reductasa utiliza el NADPH para regenerar glutatión tras ser oxidada
por glutatión peroxidasa, lo cual permite retirar el peróxido creado por el estrés oxidativo.15
Contiene un clúster de hierro-azufre [4Fe-4S] con el que la aconitasa adopta una
conformación cerrada al rededor del centro activo que le permite enlazarse con el citrato y
catalizar la conversión a isocitrato. Sin embargo, la aconitasa solo tiene actividad catalítica
cuando las concentraciones de hierro son altas (en niveles normales). Si las
concentraciones de hierro bajan demasiado, entonces la cAcn pierde el [4Fe-4S] -clúster y
su actividad enzimática, y asume un nuevo papel en la regulación de los niveles de hierro
dentro de la célula.15 De este modo, se obtiene la proteína IRP-1, con la capacidad de
unirse a secuencias específicas no codificantes del mRNA, relacionada con la captación,
el almacenamiento y la utilización de hierro, y conocidas como elementos de respuesta de
hierro (Iron-responsive element (IRE)). Una vez vinculado a estas secuencias, el IRP-1
ejerce una regulación postranscripcional, ya sea promoviendo o impidiendo su traducción.
Estos sitios de unión generalmente coinciden con los sitios de unión al clúster de hierro y
azufre.La fuerte interacción asegura la homeostasis de hierro en células mamíferas ante
una escasez de hierro.
La cAc en mamíferos ha desarrollado una función secundaria como inhibidor de esos
mRNA que transportan elementos de respuesta o reguladores de hierro (IRE).
Otra proteína reguladora del hierro, el IRP2, carece de actividad enzimática como
aconitasa, pero es el principal regulador metabólico del hierro, uniéndose a los mismos
ARNm que el IRP-1. Por el contrario, el IRP1 actúa predominantemente como aconitasa,
cambiando a IRP1 en niveles altos de oxígeno, posiblemente en condiciones de infección
o inflamación, donde la producción de especies reactivas de oxígeno y óxido nítrico podría
desestabilizar el cúmulo del clúster hierro-azufre.
Aconitasa mitocondrial
La mAcn juega un papel fundamental en el metabolismo de los carbohidratos,
pues cataliza el segundo paso del ciclo de Krebs para producir isocitrato a partir de citrato.
También cumple una función estructural y reguladora en el mantenimiento del ADN
mitocondrial (mtDNA):18 actúa en la estabilización del mtDNA, formando parte de los
complejos proteicos de este, conocidos como nucloides. El mtDNA modela los nucloides
para influir directamente en la expresión genética mitocondrial ante cambios en el entorno
celular.
Estas dos funciones están vinculadas. La función en el ciclo de Krebs es proporcionar
electrones de alta energía en forma de NADH y FADH2 a la vía de fosforilación
oxidativa mitocondrial, mientras que el mtDNA codifica componentes de la vía de
fosforilación oxidativa. Como tal, mAcn podría actuar como un regulador metabólico para
acoplar el metabolismo energético con la expresión del gen mitocondrial.
Es una proteína muy conservada y presenta una gran homología entre mamíferos.
Además es susceptible a la acetilación no enzimática por metabolitos como el acetil-CoA,
por lo que funcionaría como sensor de la disponibilidad de nutrientes.
A pesar de presentar numerosas similitudes estructurales con la aconitasa citosólica, los
dominios poseen una configuración diferente. En el dominio 1, se observa un plegamiento
diferente para la región N-terminal (residuos del 1 al 33) al comparar las dos proteínas y, a
su vez,el linker joining en la aconitasa citosólica (593 a 654) es más largo que en la
mitocondrial (513 a 536), y además se encuentra más estructurado. Además, cuando se
compara con la aconitasa mitocondrial, en la aconitasa citosólica aparecen inserciones en
diferentes dominios: tres en el dominio 1, dos en el dominio 3 y una en el dominio 4 otra
más es. Por lo tanto, las estructuras tridimensionales de estas dos isoenzimas son
significativamente distintas.19
Aconitasa bacterial
Al igual que la mAcn, la aconitasa bacteria (AcnB) es una enzima principal en el ciclo de
Krebs que posee una función secundaria. En la bacteria Escherichia coli, se demostró que
la AcnB es un regulador de la expresión genética. En Salmonella enterica, la AcnB inicia
un proceso regulador para controlar la biosíntesis de flagelos mediante una interacción del
ftsH transcript, un factor sigma alternativo de la RNA polimerasa.
Esta unión disminuye la concentración intracelular de ftsH proteasa y, consecuentemente,
aumenta la cantidad del factor sigma 32 de la RNA polimerasa, el cual en la mayoría de
los casos es degradado por la ftsH proteasa. Dicho factor aumenta la síntesis del
chaperón Dnak, lo cual fomenta la síntesis de la proteína flagelar FliC.
Asimismo regula la síntesis de otras proteínas , como el superóxido dismutasa (SodA) y
otras enzimas involucradas en el estrés oxidativo. Tiene una estrutura de dominio
diferente a la de cAcn o mAcn, y difiere de otras aconitasas al contener un dominio similar
a HEAT. Se cree que los dominios de tipo HEAT están involucrados en las interacciones
proteína-proteína. La región N-terminal, que contiene tanto el dominio tipo HEAT como el
dominio "giratorio", son responsables de la dimerización y la unión de AcnB al ARNm.
Un mecanismo de dimerización mediado por hierro puede ser responsable de cambiar
AcnB entre sus funciones catalíticas y reguladoras, ya que la dimerización requiere hierro,
mientras que la unión del ARNm es inhibida por el hierro.
Escherichia coli también posee aconitasa A (AcnA), que es una enzima inducida por el
estrés sintetizada durante la fase estacionaria de crecimiento. La AcnA es similar en la
conformación de dominios a la mAcn eucariota.