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Laboratorio 3
Autor o autores:
Dr. Carlos Vera
Dra. Diana Bueno
Dr. Horacio Almanza
GC-FR-012 Rev. 3
Cdigo
Universidad Autnoma de Baja California L3-ML-001
NDICE
6 Manejo de Micropipetas 29
7 Purificacin de DNA 36
8 Enzimas de restriccin 39
12 Electroforesis de Protenas 48
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PRLOGO
El principal motivo de publicar este manual es proveer a los estudiantes de la Facultad de
Medicina y Psicologa de la Universidad Autnoma de Baja California campus Tijuana, con
una gua til sobre los protocolos que actualmente se aplican en el Laboratorio de Biologa
Celular. En esta edicin del manual se incorporan las diferentes competencias de forma
clara, a la vez que proporciona informacin experimental esencial.
I. Introduccin.
Este Manual de Laboratorio de Biologa Celular est destinado a los estudiantes del curso
de Biologa Celular y est escrito en un estilo interesante y expresivo. Presenta, de modo
condensado y claro, una descripcin de las relaciones estructurales y funcionales ms
importantes entre los procesos celulares. Cubre un amplio espectro: desde las bacterias
hasta las formas especializadas de las clulas de los animales y las plantas superiores, y
desde los componentes de las biomembranas hasta las complejas estructuras implicadas
en las interacciones entre las clulas. Proporciona informacin sobre las bases qumicas,
fsicas, metodolgicas y posibilidades de la biologa celular. Incluye numerosos esquemas
y en algunas sesiones figuras originales, a dos colores, que contribuyen a dar mayor
claridad al texto.
Tpico a
Evaluacin Valor Descripcin del tpico a evaluar
evaluar
Puntualidad y El alumno se presenta oportunamente a la prctica y con la indumentaria
Asistencia 5%
asistencia y los requerimientos solicitados.
El alumno identificara y dispondr de los residuos peligrosos biolgico-
Evaluacin de
infecciosos (RPBI) en la estacin de destreza y evaluacin de RPBI con
destrezas
una eficiencia del 100%.
Exposicin de Se asignara a los alumnos un artculo (en ingles) de investigacin en un
articulo de tema relevante a biologa celular. Se evaluara a travs de la traduccin
Participacin investigacin del artculo y la exposicin.
65%
en la sesin
El alumno interpretara los resultados de las diferentes sesiones con
Cuestionario
responsabilidad y tica.
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Normatividad en el laboratorio
Responsabilidades ante el SGC
Buenas prcticas de laboratorio
Criterios de evaluacin del laboratorio
Caractersticas del reporte de prcticas
Uso del manual de prcticas
Sanciones
Para primero y segundo semestre realizar la sesin de RPBI dando a conocer la
NOM-087-SSA-SEMARNAT-2002 en estaciones y descripcin de su aplicacin.
Para tercer, cuarto y quinto semestre hablar sobre la importancia de manejo
adecuado de RPBI y su aplicacin en hospitales, consultorio y casa; adems de
sealar los que se generan en el laboratorio especfico (Nota: hay libre practica
para cada maestro adapte le sesin a su semestre).
En la realizacin de las prcticas del Laboratorio de Biologa Celular, se generan RPBI por
lo que es importante conocer y aplicar las Normas Oficiales Mexicanas en especial la
NOM-087-SEMARNAT-SSA1-2002 y la gua de cumplimiento de la Norma Oficial
Mexicana. Los generadores de RPBI son los lugares pblicos, sociales o privados, fijos o
mviles cualquiera que sea su denominacin, que estn relacionados con servicios de
salud y que presten servicios de atencin mdica ya sea ambulatoria o para internamiento
de seres humanos y utilizacin de animales de bioterio o zooterio. En las reas de
generacin de los establecimientos generadores, se debern separar y envasar todos los
residuos peligrosos biolgico-infecciosos, de acuerdo con sus caractersticas fsicas y
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c) Almacenamiento temporal.
e) Tratamiento.
f) Disposicin final.
En esta prctica se dar disposicin a los residuos biolgicos peligrosos basndonos como
lo menciona la NOM-087-SEMARNAT-SSA1-2002 segn corresponda al tipo de
contenedor y color. Los RPBI que se generan en el desarrollo de una prctica de los
laboratorios (Microbiologa, Parasitologa, Biologa Celular, Patologa, Histologa) pueden
ser los siguientes: tubos con sangre, jeringas, algodones, como se realiza el envasado de
los residuos segn la clasificacin.
Los tubos con las muestras de sangre en recipiente hermtico Rojo, si los tubos son de
plstico se pueden envasar en una bolsa Roja y depositar en el rea de RPBI en trancito
dentro del laboratorio para que posteriormente pase al rea de almacn temporal general
de la Facultad.
Residuos no anatmicos se generan guantes gasas, abate lenguas, cubre bocas, etc.,
los cuales se envasan en bolsa roja en la rea de almacn temporal del laboratorio.
Slido y
lquidos en Cogulo, suero y plasma en tubo de plstico con
recipientes tapadera.
con tapa
Bolsa roja
Bolsa roja
Cultivos y
cepas de
agentes
infecciosos Solid Cultivos en Tubos de vidrio
Recipiente hermtico
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Bolsa roja
Recipiente hermtico
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Una vez realizada la recoleccin interna por el personal encargado, se debern transportar
los residuos al rea especfica denominada almacn temporal, (menos los generadores de
RPBI clasificados en el nivel I de acuerdo con la NOM-087-SEMARNATSSA1-2002). Esta
rea sirve para el acopio y almacenamiento de los residuos, mismos que sern
almacenados dentro de los carros de recoleccin y debern estar rotulados con el smbolo
universal de riesgo biolgico, con la leyenda RESIDUOS PELIGROSOS BIOLGICO-
INFECCIOSOS.
Existen tres niveles de generacin de residuos segn la Norma Oficial Mexicana NOM-087-
SEMARNAT-SSA1-2002 y los periodos de almacenamiento temporal estn sujetos al nivel
de generacin de los R.P.B.I. como se muestra a continuacin.
1. Slo podrn recolectarse los residuos que cumplan con el envasado, embalado y
etiquetado o rotulado como se establece en la Norma.
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4. Los vehculos recolectores deben ser de caja cerrada y hermtica, contar con sistemas
de captacin de escurrimientos, y debern contar con sistemas de refrigeracin para
mantener los residuos a una temperatura mxima de 4 C.
5. Adems los vehculos con capacidad de carga til de 1,000 kg o ms debern operar
con sistemas mecanizados de carga y descarga.
6. Durante su transporte, los RPBI sin tratamiento no debern mezclarse con ningn otro
tipo de residuos.
6. Metodologa de la sesin.
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7. Bibliografa.
Ver al final del manual.
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Tincin de hematoxilina
10x 40x
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100x
Figura 2: Microscopio ptico: Se muestran tres cortes de crvix observados con diferentes
lentes (10X, 40X y 100X) teidos con hematoxilina.
Inmuno-histoqumica
10x 40x
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100x
Figura 3: Microscopio ptico: Se muestran tres cortes de crvix observados con diferentes
lentes (10X, 40X y 100X) teidos por inmuno-histoqumica.
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Lentes protectores
6. Metodologa de la sesin.
A. El alumno (a) deber dominar los siguientes temas antes de iniciar la prctica:
1. Unidades y equivalencias correspondientes a micrmetros (m) y nanmetros (nm)
2. Cuanto miden generalmente las clulas procariotas y las eucariotas
3. Cul es la longitud de onda del espectro visible en humanos
7. Bibliografa.
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a) Balanza
b) Esptula
c) Vaso de precipitados de 500 ml
d) Agitador magntico
e) Mosca para agitacin
f) Cilindro graduado de 500 mL
g) Matraz aforado de 250 mL
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h) pHmetro electrnico
i) Soluciones de calibracin para pHmetro (pH 4, pH 7 y pH 10)
j) Agua desionizada
k) Solucin de hidrxido de sodio 1M y 100 mM
l) HCl concentrado
m) NaCl
n) NaHCO3
o) KCl
p) CaCl2
q) MgSO4
r) KH2PO4
s) Acetato de Sodio
t) Glucosa
6. Metodologa de la sesin.
1. El alumno (a) deber dominar los siguientes conceptos antes de iniciar la prctica:
a) Moles y soluciones molares
b) Nmero de Avogrado
c) pH
d) Amortiguadores (Buffers)
Para la elaboracin de las soluciones se harn los clculos correspondientes para cada sal
y as pesar la cantidad requerida. Una vez hechos los clculos se proceder a pesar cada
sal. Estas sales se colocarn en el vaso de precipitado. Se agregar agua desionizada y
con un agitador magntico se agitar la solucin hasta disolver las sales. Una vez disueltas
las sales se proceder a la lectura de pH y se ajustar al volumen final. La solucin se
llevar a un pH final de 7.4 con HCl y/o hidrxido de sodio.
7. Bibliografa.
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Material:
a) Laminillas portaobjetos
b) Cubreobjetos
c) Papel y lquido para limpieza de lentes de microscopio.
d) 4 tubos de microcentrifuga de 1.6 mL
e) 1 Jeringa de 10 mL con aguja
f) Torniquete para venoclisis
g) 1 tubo recolector de sangre con EDTA o heparina
h) Recipiente hermetico rojo para productos contaminados con sangre
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Insumo:
a) Aceite de inmersin.
b) 500 ml de Solucin estril de NaCl al 1.8%
c) Agua destilada
d) 20 ml de solucin de sodio-dodecil-sulfato (SDS) al 0.1%
e) Antisptico para limpieza de piel antes de la venopuncin
6. Metodologa de la sesin.
7. Bibliografa.
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Las ciencias de la salud han experimentado un gran desarrollo en las dos ltimas dcadas;
la aplicacin de la biotecnologa y la biologa molecular ha abierto un prometedor panorama
en el que las posibilidades de desarrollar nuevas estrategias diagnsticas y teraputicas se
incrementan da a da. La decodificacin del genoma humano y de otros organismos, ha
incrementado el entendimiento (incluso hasta el nivel molecular) de diferentes procesos
fisiolgicos y pato-fisiolgicos. Mxico no se puede dar el lujo de ser indiferente y pasivo en
el umbral de esta revolucin cientfica; son muy grandes las posibilidades que ofrece en
cuanto al cuidado de la salud y es absolutamente indispensable aprovecharlas. Las
consecuencias de invertir ahora en la formacin de recursos humanos calificados no solo
se reflejarn en un mejor estado de salud de la poblacin, sino que adems tendrn un
impacto financiero enorme, ya que al comparar los costos de prevencin de enfermedades
frecuentes, frente a los costos de tratamiento crnico y de rehabilitacin de sus secuelas y
las bajas en la fuerza productiva del pas, resulta en un balance econmico muy favorable.
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1) Extraccin y fragmentacin especfica del DNA del organismo que nos interesa.
2) Unin de los fragmentos de DNA: fragmento del DNA que nos interesa + vector de
transformacin y replicacin.
3) Introduccin en las clulas receptoras del DNA recombinante.
4) Seleccin de colonias aisladas que porten molculas de DNA recombinante.
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La reaccin en cadena de la polimerasa, conocida como PCR por sus siglas en ingls
(Polymerase Chain Reaction), es una tcnica de biologa molecular desarrollada en 1986
por Kary Mullis, cuyo objetivo es obtener un gran nmero de copias de un fragmento de
ADN particular, partiendo de un mnimo; en teora basta partir de una nica copia de ese
fragmento original, o molde.Esta tcnica sirve para amplificar un fragmento de ADN; su
utilidad es que tras la amplificacin resulta mucho ms fcil identificar con una muy alta
probabilidad virus o bacterias causantes de una enfermedad, identificar personas
(cadveres) o hacer investigacin cientfica sobre el ADN amplificado. Estos usos
derivados de la amplificacin han hecho que se convierta en una tcnica muy extendida,
con el consiguiente abaratamiento del equipo necesario para llevarla a cabo.
El Western blot, o inmunoblot, es una tcnica analtica usada para detectar protenas
especficas en una muestra determinada (una mezcla compleja de protenas, como un
extracto tisular). Mediante una electroforesis en gel se separan las protenas atendiendo al
criterio que se desee: peso molecular, estructura, hidrofobicidad, etc. Hay casi tantas
posibilidades como tipos de electroforesis existen. Luego son transferidas a una membrana
adsorbente (tpicamente de nitrocelulosa o de PVDF) para poder buscar la protena de
inters con anticuerpos especficos contra ella. Finalmente, se detecta la unin antgeno-
anticuerpo por actividad enzimtica, fluorescencia... De esta forma se puede estudiar la
presencia de la protena en el extracto y analizar su cantidad relativa respecto a otras
protenas. Esta tcnica es hoy en da imprescindible en varios campos de la biologa, como
la biologa molecular, la bioqumica, la biotecnologa o la inmunologa. Existe toda una
industria especializada en la venta de anticuerpos (monoclonales y policlonales) contra
decenas de miles de protenas diferentes.
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Terapia gnica germinal: se realizara sobre las clulas germinales del paciente,
por lo que los cambios generados por los genes teraputicos seran hereditarios.
No obstante, por cuestiones ticas y jurdicas, sta clase de terapia gnica no se
lleva a cabo hoy en da.
6. Metodologa de la sesin.
El instructor (a) expondr la clase terica sobre las tcnicas ms importantes en
biologa celular.
7. Bibliografa.
Ver al final del manual.
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Las micropipetas automticas nos han aportado mayor practicidad y bioseguridad. Una
mayor velocidad para dispensar muestras y reactivos con excelente precisin y sin
posibilidad de contaminacin entre ellos; en tcnicas donde el tiempo operativo resultaba
crtico, como ser en reacciones enzimticas. Tiempo despus, la gran mayora de estas
pruebas de laboratorio fueron automatizadas.
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Fue tambin, con el nacimiento del inmunoanlisis en la dcada de los aos 60, con
tcnicas isotpicas y posteriormente con las tcnicas no isotpicas en la dcada de los
aos 80, la necesidad de dispensar los reactivos tales como soluciones radiactivas en el
caso de las isotpicas (RIA e IRMA), cumpliendo con las medidas de radioproteccin y las
no isotpicas (EIA y ELISA) para manipular reactivos altamente cancergenos, hicieron que
su utilizacin se transforme en una necesidad imprescindible. Tampoco podemos dejar de
lado la necesidad de una alta precisin requerida para dispensar las muestras, calibradores
y controles de calidad, donde el volumen de los mismos es una consecuencia de las masas
que entran en juego en una inmunoreaccin primaria en el inmunoanlisis; podemos
mencionar a modo de ejemplo que en un ensayo de Estradiol por alguna de las tcnicas
inmunoanalticas, el clculo de la concentracin en una muestra biolgica depender de la
interpolacin de una curva de calibracin comprendida entre menos y ms 2 veces la Kd.
del anticuerpo involucrado en el ensayo. Los volmenes utilizados de los calibradores,
muestras y estndares de ese ensayo son constantes y oscilan entre 50 y 100 L, segn
sea el desarrollo del sistema inmunoanaltico de una empresa productora de reactivos, el
rango de masas de Estradiol en los calibradores estarn comprendidos entre 2 y 200
picogramos contenidos en dichos volmenes.
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Figura numer 1.
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permitido segn el caso. En las micropipetas de 2 hasta 200 l, los dgitos negros indican
microlitros y los dgitos rojos representan dcimas de microlitro.
3. Ajustar el volumen de la pipeta con el tornillo del botn pulsador (figura 1, A2) o la rueda
de graduacin del volumen (Figura 1, B), hasta llegar a 1/3 por encima del valor deseado.
Luego, lentamente, girando el tornillo o la rueda, disminuir el ajuste hasta el valor deseado
prestando atencin para no excederlo. Si se excede, es aconsejable repetir el
procedimiento de ajuste. Siempre se debe ajustar el volumen deseado desde un volumen
ms alto disminuyendo las indicaciones del indicador.
4. Seleccionar la punta o tip plstico apropiado para la micropipeta: la punta debe ajustarse
al cono de la micropipeta (figura 1). Al insertar la punta en el cuerpo de la pipeta hay que
aplicar una fuerte presin con movimiento giratorio para asegurar la hermeticidad. Nunca
usar la pipeta con lquidos sin la punta colocada. Es posible que la punta plstica se
encuentre en una caja tambin plstica que facilita su uso. Si la punta no queda bien
ajustada o no est en caja, deber ajustarse con la mano sin tocar la superficie que estar
en contacto con la solucin a extraer.
7. Lentamente se aspira el lquido al relajar la presin del dedo sobre el botn pulsador
(figura 2, B). Si este paso no se realiza con atencin, puede entrar
aire en la punta y la cantidad de muestra aspirada no es la adecuada.
9. Dosificacin: colocar la parte inferior de la punta contra la pared interior del recipiente
donde se depositar el lquido, con un ngulo entre 10o y 40 o.
10. Apretar el botn pulsador suavemente hasta el primer tope (figura 2, C) y esperar un
segundo.
11. Apretar el botn pulsador hasta el segundo tope para vaciar el resto del lquido (figura
2, D).
13. Expulsar la punta apretando el botn del expulsor (figura 2, F y figura 2, D).
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Figura numer 2.
Con respecto a la micropipeta multicanal, stas tienen la ventaja de que se puede pipetear
el mismo volumen al mismo tiempo en varios recipientes a la vez.
Estas micropipetas fueron diseadas principalmente para los ensayos en formato micro,
donde se utiliza tambin un plato de plstico de 96 pozos para trabajar esa cantidad de
ensayos de forma simultnea. Las micropipetas multicanal son dispositivos ms complejos
que las micropipetas unicanal ya que bsicamente pueden repetir varias veces la funcin
que realiza esta ltima en un solo momento. Para ello, poseen un solo mango, botn
pulsador, etc pero un cono que permite la insercin de 4 hasta 12 puntas al mismo tiempo.
En el curso se utilizarn micropipetas multicanales (12 canales) con un rango de volumen
de 50 l a 300 l similares a las de la figura 3. Para su uso, se deben tener los mismos
cuidados que con las micropipetas unicanal, adems de cerciorarse que todas las puntas
estn bien colocadas, extrayendo la misma cantidad de solucin y que no se observen
burbujas de aire en ninguna.
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a) Balanza
b) Micropipetas y puntillas de 100 L y 1000 L.
c) Vasos de precipitado 100 mL
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6. Metodologa de la sesin.
1.- El alumno deber dominar las unidades y equivalencias correspondientes a mililitros
(mL) y microlitos (L) antes de iniciar la prctica.
3.- Cada alumno (a) utilizar las pipetas para cargar diferentes volmenes en un vaso de
precipitado y pesarlo en la balanza. Se proceder a agregar la cantidad referida por el
instructor (a) hasta completar el volumen establecido y posteriormente retirarlo hasta vaciar
el vaso de precipitado. Se deber consignar el peso obtenido cada vez que se agregue o
retire el volumen tanto durante la carga como durante la descarga del volumen.
7. Bibliografa.
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El kit DNeasy utiliza tecnologa avanzada con membranas-geles de silicn para una
purificacin rpida y eficiente de DNA celular. El sistema buffer esta optimizado para
permitir la lisis celular seguida de unin selectiva de DNA a la membrana DNeasy. La
centrifugacin remueve completamente a los contaminantes e inhibidores enzimticos
como las protenas y cationes divalentes.
Equipo:
a) Micro centrfuga
Material:
a) Buffers necesarios para purificacin de DNA de una muestra de sangre venosa,
segn el kit DNeasy de Qiagen
b) Buffer PBS
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Insumo:
a) Proteinasa K
c) Bao mara a 37 C
6. Metodologa de la sesin.
1.-Se obtendr sangre fresca (aprox. 5 ml) de uno de los alumnos del subgrupo, utilizando
la tcnica apropiada de venopuncin y se transferir la sangre a un tubo conteniendo EDTA
o heparina.
2.- Agregar 20 L de proteinasa K a un tubo de micro centrfuga de 1.5mL con CTAB 10%.
4.- Agregar 200 L de buffer AL. Mezcle por medio de vrtex por pulso por 15 s.
7.-Aadir 200 L de etanol (96-100%) a la muestra y mezclar por vrtex de pulso por 15s.
Despus de mezclar, centrifugar brevemente.
8.- Agregar el contenido de la muestra a una columna con membrana (en un tubo de 2mL),
cierre la tapadera y centrifugue a 8000 rpm por 1min. Coloque la columna en un tubo nuevo
de 2mL y elimine el tubo con el filtrado.
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9.- Cuidadosamente abra la tapadera de la columna y aada 500 L de buffer AW1. Cierre
la tapadera y centrifugue a 8000 rpm por 1 min. Coloque la columna en un tubo nuevo y
elimine el filtrado.
10.- Abra cuidadosamente la tapadera de la columna y aada 500 l de buffer AW2. Cierre
la tapadera y centrifugue a mxima velocidad por 3 min. Si no hay problemas de AW2
residual, continu con el paso 11, si hay problemas realizar el paso 10.1.
10.1) Opcional. Si hay problemas de buffer AW2 residual, colocar la columna en un tubo
nuevo y eliminar el filtrado. Centrifugar a mxima velocidad por 1 min.
Precauciones especiales:
El buffer AL y AW1 contienen una sal caotrpica (hidrocloruro de guanidina), que puede ser
irritante. El buffer AW2 contiene cido de sodio como preservativo. Este es altamente
txico y puede reaccionar explosivamente con el plomo o cobre de las tuberas.
7. Bibliografa.
Ver al final del manual.
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Las tcnicas que se introducen en esta prctica son las bases de las tcnicas de huellas de
DNA (fingerprinting) y anlisis forense de DNA. Pruebas de ADN, utilizacin de restos
orgnicos para identificar el cido desoxirribonucleico (ADN) de una persona. Se ha
realizado un buen nmero de pruebas cientficas que prueban que el ADN es la base de la
herencia, entre las que se pueden destacar: a) en el proceso normal de reproduccin
celular, los cromosomas (estructuras con ADN) se duplican para proporcionar a los ncleos
hijos los mismos genes que la clula madre; b) las mutaciones provocadas se producen por
una alteracin de la estructura del ADN que tienen como efecto una grave alteracin de la
descendencia de las clulas afectadas; c) el ADN extrado de un virus basta por s mismo
para reproducir el virus entero, por lo que parece claro que, en la esfera jurdica y a efectos
legales, tiene toda la informacin gentica para ello. Por todo ello, el ADN puede llegar a
ser muy til en Derecho, no slo para identificar a una persona gracias a los restos
orgnicos encontrados donde se haya cometido un crimen (en especial en delitos contra la
libertad sexual o en los que se ha ejercido violencia), sino tambin para determinar la
filiacin biolgica de una persona.
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ESTRUCTURA
Cada molcula de ADN est constituida por dos cadenas o bandas formadas por un
elevado nmero de compuestos qumicos llamados nucletidos. Estas cadenas forman una
especie de escalera retorcida que se llama doble hlice. Cada nucletido est formado por
tres unidades: una molcula de azcar llamada desoxirribosa, un grupo fosfato y uno de
cuatro posibles compuestos nitrogenados llamados bases: adenina (abreviada como A),
guanina (G), timina (T) y citosina (C). La molcula de desoxirribosa ocupa el centro del
nucletido y est flanqueada por un grupo fosfato a un lado y una base al otro. El grupo
fosfato est a su vez unido a la desoxirribosa del nucletido adyacente de la cadena. Estas
subunidades enlazadas desoxirribosa-fosfato forman los lados de la escalera; las bases
estn enfrentadas por parejas, mirando hacia el interior, y forman los travesaos.
Los nucletidos de cada una de las dos cadenas que forman el ADN establecen una
asociacin especfica con los correspondientes de la otra cadena. Debido a la afinidad
qumica entre las bases, los nucletidos que contienen adenina se acoplan siempre con los
que contienen timina, y los que contienen citosina con los que contienen guanina. Las
bases complementarias se unen entre s por enlaces qumicos dbiles llamados enlaces de
hidrgeno. En 1953, el bioqumico estadounidense James Watson y el biofsico britnico
Francis Crick publicaron la primera descripcin de la estructura del ADN. Su modelo
adquiri tal importancia para comprender la sntesis proteica, la replicacin del ADN y las
mutaciones, que los cientficos obtuvieron en 1962 el Premio Nobel de Medicina por su
trabajo.
Equipo:
a) Microcentrfuga
Material:
a) Buffer de restriccin.
b) Tubos de micro centrfugo
c) Marcador permanente de laboratorio (sharpie)
Insumo:
a) Fago Lambda DNA
b) Enzimas de restriccin (Eco RI, Pst I, Hind III, RNApolimerasa)
c) DNA Lambda
d) Bao mara a 37 C
e) Hielo.
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6. Metodologa de la sesin.
El alumno (a) deber dominar antes de la prctica los temas relacionados con enzimas de
restriccin, funcionamiento y aplicaciones, previamente discutidos en la prctica 6.
1) Tome los eppendorf que contienen la solucin stock de enzimas, DNA lambda y buffer
de restriccin. Mantenga todas las enzimas de restriccin en hielo.
P 4 l 5 l 1l ------ --------
E 4 l 5l ---- 1 l -------
H 4 l 5 l ---- ------ 1 l
7. Bibliografa.
Ver al final del manual.
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Ser competente para realizar, monta y correr geles de agarosa por electroforesis, para
que en la prctica mdica pueda realizar un buen uso de diferente instrumental de
laboratorio para investigacin o diagnstico.
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6. Metodologa de la sesin.
El alumno (a) deber dominar antes de la prctica, el tema de electroforesis de DNA,
previamente discutido en prctica 6. Se prepara un gel de agarosa al 0.8% con un grosor
de 0.75 a 1.0 cm. Esto se logra agregando 0.8 g de agarosa a 100 mL de TAE 1X. La
agarosa debe ser disuelta utilizando un buffer de electroforesis, no agua. Cuando el gel de
agarosa ha solidificado, se inicia el cargado de la muestra de DNA para electroforesis.
2.- Prepare el volumen requerido de buffer de electroforesis 1X (el buffer utilizado para la
electroforesis ser idntico al utilizado para la preparacin del gel).
7.- Realice la electroforesis a 120 volts. Poco tiempo despus de que se aplica la corriente,
el colorante de cargado se ve cmo migra a travs del gel hacia el lado positivo de la
cmara.
7. Bibliografa.
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Ser capaz de analizar los resultados obtenidos mediante la electroforesis de ADN para
estimar el valor aproximado del peso molecular de las diferentes bandas observadas de
DNA, para que en la prctica mdica pueda entender los resultados de biologa celular y
molecular para diagnostico o investigacin.
La concentracin de agarosa y el voltaje con los que se debe trabajar depende del tamao
del segmento de ADN que se quiera visualizar. Los segmentos de gran tamao, el del ADN
total 2 (proveniente de una extraccin de ADN), deben trabajarse con concentraciones del
0.8% y a voltajes de 60V para evitar la fragmentacin del mismo. Los segmentos de
1500pb en adelante con geles al 1%, los segmentos de 500pb a 1500pb en geles 1,5% o
2% y los pequeos segmentos de de 100pb a 500pb (los microsatlites por ejemplo) en
geles al 4% o 6%. Para estos el voltaje puede variar de 20V a 120V de pendiendo de la
velocidad a la que quiera que migre el ADN, a voltajes elevados ms rpido corren las
muestras.
Equipo:
a) Transiluminador de BioRad.
d) El alumno (a) deber traer una regla graduada para esta prctica.
6. Metodologa de la sesin.
- Los alumnos medirn la distancia de cada banda observada con respecto al borde del gel.
Esto se realizar en cada banda para cada una de las enzimas de restriccin utilizadas.
7. Bibliografa.
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Las protenas presentan una carga elctrica neta si se encuentran en un medio que tenga
un pH diferente al de su punto isoelctrico y por eso tienen la propiedad de desplazarse
cuando se someten a un campo elctrico. La velocidad de migracin es proporcional a la
relacin entre las cargas de la protena y su masa. Cuanto mayor carga por unidad de
masa ms rpida ser la migracin. Empleando geles de slice o de acetato de celulosa y
aplicando las protenas en una zona estrecha en torno a los electrodos se pueden
determinar diferencias de carga neta (carga total/masa) entre protenas. Este mtodo se
denomina electroforesis zonal. La matriz de poliacrilamida no es un buen soporte para
este mtodo pues la migracin de las protenas en su seno no slo es proporcional a la
carga neta sino tambin al tamao y forma de las protenas. Una ventaja importante de
los geles de poliacrilamida es que son qumicamente inertes, transparentes y estables en
un amplio rango de pHs, temperatura y fuerza inica.
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6. Metodologa de la sesin.
Definiciones bsicas
Aspectos
Velocidad de movimiento
Movilidad electrofortica
Factores que afectan a la electroforesis
Campo elctrico
Temperatura
Caractersticas de la muestra
Propiedades del medio
Propiedades del soporte
Modalidad de electroforesis
Orientacin
Gel de poliacrilamida
Grupos de soportes
Funciones
Electroforesis de protenas
La carga neta de las protenas
Etapa de tincin
7. Bibliografa.
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Ser competente para realizar, montar y correr el gel de las protenas y conocer los
principios bsicos de la tcnica de electroforesis, para que en la prctica mdica pueda
realizar un buen uso de diferente instrumental de laboratorio para investigacin o
diagnstico.
Cuestionario
Defina las propiedades de las protenas para separarse en una electroforesis?
Con que solucin se tie un gel para protenas?
Calidad de las notas de su cuaderno de prcticas.
Exposicin y discusin del artculo por los alumnos.
Elaboracin de una conclusin sobre la competencia aprendida.
capacidad de una protena de determinado tamao para desplazarse a travs del gel
depende de la concentracin de la poliacrilamida empleada para constituir la criba. Cuanto
menor sea la concentracin (hasta un mnimo cercano a 2 %) de acrilamida, menor ser el
nmero de enlaces cruzados y determinada molcula de protena se desplazar con mayor
rapidez. La forma tambin es un factor, puesto que protenas globulares compactas se
mueven con mayor rapidez en comparacin con protenas fibrosas, alargadas, de peso
molecular comparable.
Equipo:
a) Cmara de electroforesis MiniProtean 3 (BioRad).
Material:
a) Buffer de carga para EGP-DSS.
b) Buffer 1.5 M Tris pH 8.8.
c) Pipetas desechables de 10 mL.
d) Pipetas de transferencia.
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Insumo:
a) Sodio-dodecilsulfato (SDS) al 10%.
b) Agua destilada.
c) TEMED.
d) Solucin de acrilamida al 30%
e) SDS-PAGE Running Buffer.
6. Metodologa de la sesin.
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Procedimiento
1) Limpie ambas caras de cada uno de los vidrios con alcohol etlico.
2) Coloque dos tiras de papel parafilm en el dispositivo de ensamblado de los vidrios
teniendo cuidado de no producir arrugas ni bordes.
3) Coloque el vidrio pequeo encima del vidrio grande de tal manera que el espaciador
quede en medio de los dos (4a).
4) Deslice ambos vidrios en el dispositivo de fijacin (4b).
5) Deslice hacia afuera ambas palancas de fijacin para asegurar los vidrios (4c).
6) Asegure la parte superior de los vidrios utilizando la manivela con resorte que est en la
parte superior del dispositivo de fijacin (4d).
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7) Llene el espacio formado por ambos vidrios con agua y verifique que no existan fugas.
Si existen fugas vuelva a ensamblar los vidrios en el dispositivo de fijacin.
8) Introduzca el cepillo en la parte superior de las placas de vidrio y trace una lnea
horizontal a aproximadamente un centmetro por debajo de los dientes del cepillo. Este
ser el lmite entre el gel de resolucin (resolving gel) y el gel de agrupamiento (stacking
gel). Retire el cepillo.
9) Tire el agua y asegure de secar la parte interna de las placas de vidrio utilizando un
papel absorbente que no libere partculas (Kim-wipe o similar).
10) Prepare el gel de resolucin de acuerdo a la siguiente tabla:
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11) Antes de agregar el agente polimerizante (TEMED) asegrese de contar con una
pipeta de transferencia pues una vez agregado el TEMED la polimerizacin ocurre
rpidamente.
12) Agregue el TEMED: 0.002 mL Cierre el tubo y mezcle con cuidado. Absorba la
solucin utilizando la pipeta de transferencia. Agregue el gel en medio de las placas de
vidrio hasta 2 mm por arriba de la marca que realiz en el paso 8. La solucin restante
regrsela al tubo, pues le servir de indicador para la polimerizacin. La polimerizacin
debe ocurrir en aproximadamente 20 minutos.
13) Agregue cuidadosamente agua bidestilada por encima del gel de resolucin.
14) Mientras se polimeriza el gel de resolucin, proceda a preparar las muestras a
analizar.
15) Marque con su plumn permanente la tapa de cada uno de los microtubos de
centrifugacin (1.6 mL.) con las leyendas de las protenas correspondientes. Prepare el
volumen requerido segn las instrucciones del profesor (a). Mantenga las muestras
originales en hielo.
16) Transfiera sus muestras a un flotador y desnaturalice las protenas en agua hirviendo
por 5 minutos. Verifique que cada uno de los tubos est completamente cerrado, pues
existe la posibilidad de que estos se abran durante el calentamiento.
18) Antes de agregar el agente polimerizante (TEMED) asegrese de contar con una
pipeta de transferencia, pues una vez agregado el TEMED la polimerizacin ocurre
rpidamente.
19) Agregue el TEMED: 0.002ml. Cierre el tubo y mezcle con cuidado. Absorba la solucin
utilizando la pipeta de transferencia. Agregue el gel de agrupamiento hasta unos 4 mm por
debajo del borde superior de los vidrios. Coloque cuidadosamente el cepillo en la parte
superior de las placas de vidrio, teniendo precaucin de no producir salpicaduras (el
alumno que realice esta operacin deber contar con lentes protectores, guantes y
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25) Llene la parte central del cuadro interno de fijacin con solucin SDS-Running Buffer
hasta unos 3 mm por arriba del borde superior de las placas de vidrio.
26) Vierta solucin SDS-Running Buffer en el tanque acrlico.
27) Retire cuidadosamente el cepillo. Limpie cuidadosamente cada una de las hendiduras
producidas por el cepillo con una pipeta de vidrio. Utilice una pipeta de vidrio para retirar las
burbujas de aire que se formen en la parte inferior de las placas de vidrio.
28) Aplique las muestras de protenas utilizando la gua para cargar muestras.
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29) Retire la gua para cargar muestras. Coloque la tapa superior del sistema verificando la
polaridad correcta de los electrodos.
30) Aplique 50V a la cmara de electroforesis utilizando la fuente de alimentacin.
Mantenga este voltaje hasta que la tinta azul alcance el lmite entre el gel de resolucin y el
de agrupamiento, cuando esto ocurra incremente el voltaje a 100 volts. Mantenga este
voltaje hasta que la tinta azul alcance el borde inferior de los vidrios.
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7. Bibliografa.
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Los genes pueden ser adquiridos de humanos, animales, o DNA de plantas y colocados
dentro de la bacteria. Por ejemplo, un gen de un humano sano para la hormona insulina
puede ser colocado en una bacteria. Bajo las condiciones correctas, esta bacteria puede
crear insulina humana autntica. Cuando se les permite que se multipliquen en
fermentadores esta bacteria puede ser usada para produccin masiva de la protena
humana insulina. Esta insulina genticamente creada es purificada usando cromatografa
de protenas y puede ser usada para tratar pacientes con diabetes, donde los genes de la
insulina no funcionan normalmente. Un problema comn en la purificacin de protenas
genticamente diseadas de bacterias transformadoras es la contaminacin de protenas
bacterianas endgenas. La cromatografa es un mtodo poderoso usado en la
biotecnologa para separar y purificar protenas de inters de las protenas bacterianas. Las
protenas purificadas de esta manera, pueden ser usadas, por ejemplo, como medicinas
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para tratar enfermedades humanas, o agentes de casa como enzimas naturales para
realizar mejores detergentes. La clonacin y expresin del gen GFP es completamente
anlogo a los procesos usados en la industria de la biotecnologa para producir protenas
con valor comercial. La fuente real de la protena fluorescente verde es un gel de la alga
bioluminiscente Aequoria Victoria. En este ejercicio se podr sugerir un escenario
hipottico a los estudiantes en el cual la GFP tenga algn valor comercial especial y su gen
proviene de una fuente natural diferente, planta o animal. En cualquier caso, el principio es
exactamente el mismo, el gen codifica la protena fluorescente verde.
Medio de Cultivo: El medio lquido y slido de agar son referidos como LB (por Luisa
Bertani) y estn hechos de extracto de levadura y una enzima digestiva de carne, ambos
productos proporcionan una mezcla de carbohidratos, aminocidos, nucletidos, sales y
vitaminas, los cuales son necesarios como nutrientes para el crecimiento bacteriano. El
agar, que es derivado de un alga, se derrite cuando se calienta, y fro forma un gel slido
(muy parecido a la gelatina), funciona para proveer un soporte slido en el cual cultivar
bacterias.
Seleccin del antibitico: El plsmido pGLO el cual contiene el gen GFP tambin contiene
el gen de la beta-lactaminasa, una protena que provee a la bacteria con una resistencia al
antibitico ampicilina. La protena beta-lactaminasa es producida y secretada por las
bacterias, las cuales contienen el plsmido. La beta-lactaminasa secretada inactiva la
ampicilina, permitiendo que solo las clulas transformadas crezcan en su presencia. Solo
las bacterias transformadas las cuales contienen el plsmido pGLO y producen beta-
lactaminasa pueden sobrevivir en la presencia de ampicilina.
Equipo:
a) Estufa a 37C 1
Material:
a) Asas de inoculacin paquetes de 10 asas 2
b) Platos de cultivo 6
c) Marcadores 1
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Insumo:
a) Bacteria E. coli K12 transformada con el plsmido pGLO 1 cepa en tubo
a) Bacteria E. coli K12 sin transformar 1 cepa en tubo
6. Metodologa de la sesin.
1.- Tome la cepa en tubo cerrado (bacteria E. coli K12+pGLO y solo E. coli K12) y
proceda a realizar el procedimiento para un cultivo:
a) Abra el tubo que contiene la cepa de la bacteria E. coli K12+pGLO, cerca del
mechero.
b) Utilizando un asa estril recolecte una colonia de bacterias y depostela en el
plato
correspondiente.
c) Cierre el tubo.
d) Anote su nombre en el plato cerrado.
e) Utilizando un asa estril realice el mismo procedimiento en el tubo marcado
como
E. coli K12.
2.- Coloque los platos boca abajo en la incubadora a 37C hasta el da siguiente.
7. Bibliografa.
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Equipo:
a) Estufa a 37C 1
Material:
a) Asas de inoculacin paquetes de 10 asas 2
b) Platos de transformacin (LB, LB/amp y LB/amp/ara) 6
c) Lmpara UV de onda larga* 1
Insumo:
a) Ampicilina liofilizada 1 vial
b) Tableta de LB Broth (para hacer 50 mL) 1 tableta
c) Agua destilada
d) Cloro 10 ml
6. Metodologa de la sesin.
Los alumnos observaran las diferencias fenotpicas que presentan cada bacteria.
7. Bibliografa.
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Aislamiento de clulas
Las clulas pueden ser aisladas de los tejidos para cultivos in vitro de muchas maneras.
Las clulas pueden ser purificadas con facilidad de la sangre, sin embargo slo los
leucocitos son capaces de crecer en cultivo. Las clulas mononucleares se pueden liberar
de los tejidos blandos mediante hidrlisis enzimtica con enzimas como la colagenasa,
tripsina o pronasa, que degradan la matriz extracelular. Como alternativa se pueden
colocar trozos de tejido en medio de crecimiento, y las clulas que crecen son aptas para el
cultivo. Este mtodo es el conocido como cultivo de explantos. Las clulas que se cultivan
directamente desde un sujeto se conocen como clulas primarias. A excepcin de algunos
derivados de tumores, la mayora de los cultivos celulares primarios tienen un periodo de
vida limitado. Despus de un cierto nmero de divisiones las clulas entran en el proceso
de senescencia y dejan de dividirse, generalmente manteniendo la viabilidad.
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cultivo es el medio de crecimiento. Las recetas para los medios de crecimiento pueden
variar en pH, concentracin de glucosa, factores de crecimiento y la presencia de otros
componentes nutritivos. Los factores de crecimiento usados para suplementar a los medios
derivan a menudo de sangre animal, como el suero bovino. Estos ingredientes derivados
de la sangre plantean una potencial contaminacin con virus o priones de los productos
farmacuticos derivados. En la actualidad se tiende a minimizar o eliminar el uso de estos
ingredientes cuando sea posible. Estrategias alternativas de abastecimiento involucran la
sangre de los animales procedentes de pases con un riesgo mnimo de encefalopata
espongiforme bovina, como Australia y Nueva Zelanda, y el uso de nutrientes concentrados
derivados de suero en lugar de suero animal entero para el cultivo de clulas. Las clulas
pueden crecer en suspensin o de manera adherente. Algunas clulas viven de forma
natural sin adherirse a una superficie, como las que existen en el torrente sanguneo. Otras
necesitan una superficie, como la mayora de clulas derivadas de tejidos slidos. A las
clulas que crecen sin unirse a una superficie se las llama cultivos en suspensin. Algunos
cultivos celulares adherentes pueden crecer en plstico para el cultivo de tejidos, que
puede estar recubierto con componentes de la matriz extracelular para aumentar sus
propiedades de adhesin y proporcionar otras seales necesarias para el crecimiento y
diferenciacin. Otro tipo de cultivo adherente es el cultivo organotpico que consiste en
cultivar las clulas en un ambiente tridimensional a diferencia de las placas de cultivo
bidimensionales. Este tipo de cultivo 3D es bioqumica y fisiolgicamente similar al tejido
vivo. Sin embargo presenta dificultades tcnicas debido a varios factores (por ejemplo:
difusin).
Equipo:
a) Estufa a 37C de CO2 1
b) Cabina de flujo laminar 1
c) Mao Mara 1
d) Refrigerador 1
Material:
a) Pipetas de plstico para cultivos de 5mL 10
Insumo:
a) Trypsona bovina pncreas 1
d) L-Glutamine, 200 mM 1
g) Colchicina 1/g 1
h) Fitohemaglutinina/ Gibco 1
m) Cloro 10 ml 1
6. Metodologa de la sesin.
Magdem (agitadores)
Contador electrnico de clulas
14.- reas de investigacin en las que son tiles los cultivos celulares
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Los cultivos celulares se han convertido hoy da en una herramienta de amplio uso en
investigacin bsica biomdica, para el diagnstico en salud humana as como en sus
aplicaciones para la elaboracin de productos biotecnolgicos y en la realizacin de
pruebas de control de calidad, impartiendo una formacin especializada en el campo de los
cultivos celulares utilizando tcnicas que estn a la vanguardia de la investigacin y los
recursos materiales para optimizar el proceso de enseanza-aprendizaje, impartiendo as
una enseanza de calidad.
Equipo:
a) Estufa a 37C de CO2 1
b) Cabina de flujo laminar 1
c) Mao Mara 1
d) Refrigerador 1
Material:
a) Pipetas de plstico para cultivos de 5mL 10
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Insumo:
a) Trypsona bovina pncreas 1
d) L-Glutamine, 200 mM 1
g) Colchicina 1/g 1
h) Fitohemaglutinina/ Gibco 1
m) Cloro 10 ml 1
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V. ANEXOS
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Tabla de Cambios
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