Anhidrasa carbnica

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Anhidrasa carbnica
Anhidrasa carbnica
Diagrama de Richardson de la anhhidrasa carbnica humana II, con el ion de Zinc visible en el centro
Estructuras enzimticas (PDB)
RCSBPDB
[1]
, PDBe
[2]
, PDBsum
[3]
Identificadores
Identificadores
externos
IntEnz: 4.2.1.1
[4]
BRENDA: 4.2.1.1
[5]
ExPASy: NiceZyme view
[6]
MetaCyc: vametablica
[7]
PRIAM: perfil
[8]
KEGG: enzima:4.2.1.1
[9]
Nmero EC
4.2.1.1
[9]
Nmero CAS
9001-03-0
[10]
Ontologa Gnica
Referencias: AmiGO
[11]
/ EGO
[12]
Ortologa
PubMed (bsqueda)
[13]
PMC (bsqueda)
[14]
La anhidrasa carbnica (AC, carbonato dehidratasa: EC 4.2.1.1
[15]
) es una enzima que pertenece a una familia de
metaloenzimas (enzimas que contienen uno o ms tomos metlicos como componente funcional de la enzima) y
que catalizan la conversin rpida de dixido de carbono y agua a bicarbonato y protones, una reaccin que ocurre
ms lenta en ausencia del catalizador. La anhidrasa carbnica incrementa significativamente la tasa de reaccin,
donde las tpicas tasas catalticas de las diferentes formas de esta enzima tienen valores que alternan entre 10
4
y 10
6
reacciones por segundo. El centro activo de la mayora de las anhidrasas carbnicas contiene un ion de zinc (Zn).
Estructura y funcin de la anhidrasa carbnica
En la naturaleza se encuentran varias formas de anhidrasa carbnica. En la ms estudiada, anhidrasa carbnica-tipo
, presente en animales, el ion de zinc est coordinado por los anillos de imidazol de 3 residuos de histidina, His94,
His 96 e His119. La funcin primaria de la enzima en animales es interconvertir el dixido de carbono y el
bicarbonato para mantener el equilibrio cido-base en la sangre y otros tejidos, y ayudar al transporte de dixido de
carbono fuera de los tejidos.
Anhidrasa carbnica
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Las plantas contienen una forma diferente llamada anhidrasa carbnica-tipo , la cual, desde un punto inicial
evolutivo, an siendo una enzima distinta participa en la misma reaccin y tambin usa un ion de zinc en su sitio
activo. En plantas, la anhidrasa carbnica ayuda a elevar la concentracin de CO
2
dentro del cloroplasto para
incrementar la tasa de carboxilacin de la enzima Rubisco. Esta es la reaccin que integra el CO
2
en carbohidratos
durante la fotosntesis, y puede usar nicamente la forma del carbono en el CO
2
, y no el cido carbnico o el
bicarbonato.
En el 2000 se encontr una anhidrasa carbnica que contiene Cadmio, que es expresada en diatomeas marinas al
haber limitacin de zinc. En el ocano abierto, el zinc se encuentra frecuentemente en baja concentracin y puede ser
un elemento limitante en el crecimiento de fitoplancton tales como diatomeas; as la existencia de una anhidrasa
carbnica que usa un ion metlico diferente podra ser beneficiosa en esos ambientes. Antes de este descubrimiento,
el cadmio se haba considerado como un elemento metlico pesado txico sin funcin biolgica. En el 2005, esta
particular anhidrasa carbnica constituye la nica reaccin biolgica conocida que depende de cadmio.
Reaccin catalizada por la anhidrasa carbnica:
CO
2
+ H
2
0 ---> H
2
CO
3
---> HCO
3
-
+ (H
+
):
[16]
en tejidos - alta concentracin de CO
2
La tasa de accin de la anhidrasa carbnica es una de las ms rpidas de todas en las que participan enzimas, y su
tasa est limitada tpicamente por la tasa de difusin de sus sus platos.
La reaccin reversa es relativamente lenta (cintica en el rango de 15 segundos), lo que explica por qu una bebida
carbonatada no hace un efecto instantneo liberador de gas cuando se abre el contenedor, pero rpidamente
degasificar en la boca cuando la anhidrasa carbnica se adiciona con la saliva.
(HCO
3
-) + (H+) ---> CO
2
+ H
2
0 ---> H
2
CO
3
: en los pulmones y las nefronas del rin - alta concentracin de
CO
2
, en clulas vegetales.
Mecanismo
Un grupo prosttico de zinc en la enzima est coordinado en tres posiciones por las cadenas laterales de histidina. La
cuarta posicin de coordinacin est ocupada por agua. Esto causa la polarizacin del enlace hidrgeno-oxgeno,
haciendo que el oxgeno sea ligeramente negativo, debilitndolo.
Una cuarta histidina est ubicada cerca al sustrato de agua y acepta un protn, en un ejemplo de catlisis cido-base.
Esto deja un hidrxido unido al zinc.
El sitio activo tambin contiene un bolsillo con especificidad por el dixido de carbono, llevndolo cerca al grupo
hidrxido. Esto permite al hidrxido rico en electrones reaccionar con el dixido de carbono, formando bicarbonato.
Familias de la anhidrasa carbnica
Hay al menos cinco familias distintas de anhidrasa carbnica (, , , y ). Estas familias no tienen una secuencia
aminoacdica significativa y, en la mayora de los casos, se piensa que son un ejemplo de evolucin convergente. Las
AC- se encuentran en seres humanos.
AC-
Las enzimas AC encontradas en mamferos se dividen cuatro amplios subgrupos, los cuales, a su vez se dividen en
varias isoformas:
las AC citoslicas (AC-I, AC-II, AC-III, AC-VII y AC-XIII) (AC1, AC2, AC3, AC7, AC13)
AC mitocondriales (AC-A y AC-B) (AC5A, AC5B)
AC secretadas (AC-VI) (AC6)
AC asociadas a membranas (AC-IV, AC-IX, AC-XII, AC-XIV y AC-XV) (AC4, AC9, AC12, AC14)
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Hay tres isoformas "acatalticas" de anhidrasa carbnica (AC-VIII, AC-X, y AC-XI) (AC8, AC10, AC11) cuyas
funciones permanecen desconocidas.
Isoforma Gen
Masa
molecular
[17]
Localizacin (celular) Localizacin (tisular) Actividad
relativa
Sensibilidad a
sulfonamidas
AC-I AC1|1368 29 kDa citoplasma RBCs y tracto GI 15% alta
AC-II AC2|1373 29 kDa citoplasma ACsi ubicua 100% alta
AC-III AC3|1374 29 kDa citoplasma 8% de protena soluble tipo I en
msculo
1% baja
AC-IV AC4|1375 35 kDa extracelularmente unida a
GPI
Ampliamente distribuida, p.ej.
epitelio transportador de cido
~100% moderada
AC-VA AC5A mitocondria
AC-VB AC5B mitocondria clulas secretantes
AC-VI AC6|1380
AC-VII AC7|1381 citoplasma
AC-IX AC9|1383 asociada a membrana
celular
AC-XII AC12|1371 44 kDa sitio activo localizado
extracelularmente
ciertos cnceres ~30%
AC XIII AC13|14914 citoplasma
AC-XIV AC14|1372 54 kDa sitio activo localizado
extracelularmente
rin, corazn, msculo estriado,
cerebro
y
AC-XV
|+ Comparacin de las anhidrasas carbnicas en el ser humano
AC-
La mayora de los procariotas y los cloroplastos en vegetales pertenecen a la familia beta. Dos modelos de esta
familia han sido identificados:
C-[SA]-D-S-R-[LIVM]-x-[AP]
[EQ]-[YF]-A-[LIVM]-x(2)-[LIVM]-x(4)-[LIVMF](3)-x-G-H-x(2)-C-G
AC-
La clase gamma de las AC viene de las bacterias productoras de metano que crecen en primaveras calurosas.
AC-
La clase delta de AC ha sido descrita en ditomos. No obstante, la distincin de esta clase de AC se ha convertido
recientemente en un interrogante.
AC-
La clase psilon de las Ac ocurre exclusivamente en bacterias en unos pocos quimiolitotrofos y cianobacterias
marinas que contienen cso-carboxisomas. Anlisis recientes tridimensionales sugieren que las AC- tienen alguna
semejanza estructural con las AC- cerca del sitio del ion metlico. As, las dos formas podran ser distntemente
relacionadas, incluso cuando la secuencia aminoacdica subyacente haya divergido desde entonces
Anhidrasa carbnica
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considerablemente.
Efectos fisiolgicos
La anhidrasa carbnica es diana de frmacos con efecto diurtico de baja potencia como la acetazolamida y la
dorzolamida, empleados en el tratamiento de la hipertensin intracraneal y el glaucoma. Tambin es usado como
beta bloqueador de receptores m 2.
Referencias
[1] http:/ / www. rcsb.org/ pdb/ search/ smartSubquery. do?smartSearchSubtype=EnzymeClassificationQuery& Enzyme_Classification=4. 2. 1.
1
[2] http:/ / www. pdbe. org/ ec/ ?ec=4.2.1.1
[3] http:/ / www. ebi. ac. uk/ thornton-srv/ databases/ cgi-bin/ enzymes/ GetPage. pl?ec_number=4. 2. 1. 1
[4] http:/ / www. ebi. ac. uk/ intenz/ query?cmd=SearchEC& ec=4. 2. 1. 1
[5] http:/ / www. brenda-enzymes. org/ php/ result_flat.php4?ecno=4. 2. 1. 1
[6] http:/ / www. expasy. org/ enzyme/ 4. 2.1.1
[7] http:/ / biocyc. org/ META/ substring-search?type=NIL& object=4. 2. 1. 1
[8] http:/ / bioinfo.genopole-toulouse. prd.fr/ priam/ cgi-bin/ PRIAM_profiles_CurrentRelease. pl?EC=4. 2. 1. 1
[9] http:/ / www. genome. jp/ dbget-bin/ www_bget?enzyme+ 4. 2. 1. 1
[10] http:/ / www.nlm.nih. gov/ cgi/ mesh/ 2006/ MB_cgi?term=9001-03-0& rn=1
[11] http:/ / amigo. geneontology.org/ amigo/ term/ GO:0004089
[12] http:/ / www.ebi. ac.uk/ ego/ DisplayGoTerm?id=GO:0004089& format=normal
[13] http:/ / www.ncbi. nlm.nih. gov/ entrez/ query. fcgi?db=pubmed& term=4. 2. 1. 1%5BEC/ RN%20Number%5D
[14] http:/ / www.ncbi. nlm.nih. gov/ entrez/ query. fcgi?db=pubmed& term=4. 2. 1. 1%5BEC/
RN%20Number%5D%20AND%20pubmed%20pmc%20local%5Bsb%5D
[15] http:/ / enzyme. expasy. org/ EC/ 4.2.1.1
[16] El cido carbnico tiene un pK
a
de alrededor de 6.36 (el valor exacto depende de una media), luego, a un pH de 7 un pequeo porcentaje de
bicarbonato est protonado. Ver cido carbnico para obtener detalles concernientes al equilibrio de HCO
3
-
+ H
+
UNIQ-math-0-7f7f9ab8047b295d-QINU H
2
CO
3
y H
2
CO
3
UNIQ-math-1-7f7f9ab8047b295d-QINU CO
2
+ H
2
O
[17] [17] Unless else specified: Page 638
Fuentes y contribuyentes del artculo
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Fuentes y contribuyentes del artculo
Anhidrasa carbnica Fuente: http://es.wikipedia.org/w/index.php?oldid=74814459 Contribuyentes: Afap123, Aguitarte, BiobulletM, Diegusjaimes, Edufelix, Eloy, Gonzalo.villarreal,
Heisenberg28, J3D3, Jmvgpartner, MapachitoMD, Rjgalindo, RoRo, Romensul, Tarawa1943, Un diletente mas, Varano, 16 ediciones annimas
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