Alineamiento de secuencias

Escribir la secuencia de un gen junto con las de los candidatos homólogos como cadenas de caracteres, una debajo de la
otra y determinar en que posiciones coinciden o no.

Identificar secuencias de ADN y proteínas con la finalidad de encontrar homologías entre una lista de secuencias
similares.
Distancia genética
Medida de la relación que existe entre las secuencias de dos organismos.

Caracteres cualitativos: aquellos que difieren en el tipo (A, C, T, G, U)

Caracteres cuantitativos: medidos en una escala numérica (discretos o continuos).
Caracteres dicotómicos: pueden tomar uno o dos valores posibles, o estados
(presente/ausente).

Matriz de similitudes

OTU: Operational Taxonomic Units

Distancia de Levenshtein
Número mínimo de indels (inserciones/deleciones) o substituciones para transformar una
secuencia en otra.

Hy Hlobates (gibón)
Pa Pan (chimpancé)
Go Gorilla (gorila)
Ho Homo (humano)
Po Pongo (orangután)

Las diferencias entre las secuencias de ADN y

los aminoácidos, nos hablará de que tan
distantes están realmente.
Modificaciones de las secuencias
Substituciones (mutaciones puntuales)
Inserción de segmentos cortos
Deleción de segmentos cortos
Duplicación de segmentos
Inversiones
Inserción de elementos transponibles
Translocaciones