ocasiones esto no ocurre debido a varias

razones :
GENÉTICA DE POBLACIONES
1. El muestreo de tipo mendeliano que
Transcri: Gabriel Riveras y Francisca Vera
ocurre al momento de reproducirse
genera la posibilidad de que alguno de los
Población: “grupo de organismos de la misma
gametos con alguna mutación o alelo
especie que viven en un área geográfica
particular no llegue a ser parte de la
suficientemente restringida para cualquier
fecundación. En consecuencia, las
miembro tenga la posibilidad de aparearse con
mutaciones se pierden.
cualquier miembro del sexo opuesto”. Población
2. Mutaciones letales que genera
es una subdivisión de la especie. Que todos
inviabilidad en los individuos, por lo que
tenga la posibilidad de aparearse con cualquier
las mutaciones no logran pasar a la
miembro del sexo opuesto implica que no exista
siguiente generación.
un sesgo en el apareamiento (todos con la
3. Desventaja evolutiva (desventaja en el
misma probabilidad de apareamiento).
fitness) producida por alguna mutación,
por lo que el alero es traspasado con
menor frecuencia a la siguiente población,
por lo que después de varias
generaciones está mutación se pierde.
Las mutaciones que logran pasar a la siguiente
La población se define en términos evolutivos generación y alcanzan una frecuencia mayor al
como la unidad mínima o fundamental, porque 1% se genera un poliformismo genético.
son las poblaciones las que evolucionan (no la Variabilidad genética: variabilidad fenotípica
especie o el individuo). debida a diferencia entre los genotipos.
Una manera de caracterizar las poblaciones es
entender su variabilidad genética. De esta
manera, si una población cambia su estructura
genética o la frecuencia de sus alelos, se dice
que está evolucionando. En cambio, si no hay
evolución quiere decir que está en equilibrio
evolutivo.

Mecanismos que alteran el equilibrio

evolutivo:
- Selección natural
- Deriva génica
- Migraciones
- Mutaciones

Mutaciones:

La imagen muestra una especie de árbol

Es la principal fuente de variación genética.
Algunas las mutaciones que ocurren en la línea
germinal de los organismos pueden heredarse de
una generación a otra, pero en algunas
filogenético donde se representan las
asociaciones o cercanías genéticas entre
distintos grupos étnicos. (De arriba a abajo)
origen africano, caucásico, noreste de Asia,
ártico, América, sudeste asiatico, pacífico y
Oceanía. Mientras más separados los grupos
hay mayor distancia genética y por lo tanto
mayor diferencia genética.
Lo que se ve es que ciertas características
fenotípicas se asocian a ciertas características
genéticas y además se asociación en términos
geográficos.
Conclusión: hay similitudes fenotípicas que tiene
correlato en términos genéticos.
Funge de variación:
Existen diferentes fuentes de variación, todas
ellas a nivel genético.
→ Cambios estructural (profe señala fila B y C
haciendo referencia a regiones grandes como los
genes):
- Deleción
- Inserción
- Translocación
- Inversiones
- Duplicaciones
→ Cambios en la información que se procesa
(profe señala la fila A que son cambios a nivel los
núcleos idos):
- Sustituciones
- Inserción
- Deleción
- Indel (deleción e inserción que ocurren
simultáneamente) (lo característicos es
que estos no generan un cambio en el
marco de lectura antes o después de la
alteración)
- SNP (cambios únicos a nivel del
nucleótido)
Variación en el número de copias (CNV)
● Incrementa o disminuye parte del
genoma.
● Puede deberse a inserciones,
duplicaciones o deleciones.
● Abarcan entre 200-300 kbp
● Se estima que existen 1447 CNVs que
cubren alrededor de un 12% del genoma
humano.
● La mayoría de estos deletreas (producen
un exceso o falta de dosis génicas) aunque hay
excepciones.
(Profesor da un ejemplo desde el 14:47 al 17:03
Resumen express: hay un gen de la amilasa
cuyas copias varían entre las poblaciones, y esto
se asocia mucho a las alimentaciones que
existen en cada región, de manera qué hay
poblaciones con más copias y otras con menos
copias).
Poliformismos por deleción-inserción:
● Implica deleciones e inserciones pero no
a nivel de copias o genes entero sino a nivel de
fragmentos más restringidos dentro de los genes
● Tamaños de 1-5 kpb
● Representan un 20% de los polimorfismo
conocidos para la especie humana
● Pueden provocar o no cambios en los
marcos de lectura. Si se inserta nucleótidos en
múltiples de 3 (inserción de un triplete) no
cambia el marco lectura, solo alarga la
secuencia.
● Estos se asocian raramente a exones
codificantes de proteínas, probablemente debido
a una fuerte selección purificadora (células o
organismos que presentan mutaciones
deletéreas presenta desventaja en el fitness o
son tan letales que son rápidamente eliminados
de la población).
Elementos repetidos en tándem:
● Minisatélites (VNTR): conglomerados de
0,1-20 kpb de largo, formateos por repeticiones
en tándem de secuencias conservadas de
cientos de nucleótidos.
● Microsatélites (STR): secuencias de no
más de 10 nucleótidos, repetidas en tándem
entre 5-50 veces. Cada STR tiene el potencial de
exhibir múltiples alelos en la población, donde
cada alelo difiere en el número de copias. El
número de repeticiones que tenga el
microsatélite va a corresponder a un determinado
alelo.
 ● Haplotipo es la agrupación que se hace a los
nucleótidos que varían en la secuencia. Ej: en
la primera fila los nucleótidos que varían son
A, G y T y los demás son iguales a las otras
secuencias, de manera que el haplotipo es
AGT.

Polimorfismo de nucleótido único (SNP):

● Representan el 80% de los polimorfismos,
por lo que son la fuente de variación PARTE 2
genética más importante en el ser
humano. Equilibrio Evolutivo
● Se estima qué hay más de 1 millón de
SNP en los genes que codifican
proteínas, y ⅔ de estos aproximadamente
se encuentran en los intrones, por lo que
se piensan muchos SNP tienen función en
la regulación de los niveles de expresión
(Ej: regiones promotoras) más que en la
codificación de la proteína. → Selección natural: proceso por el cual un
● La mayoría tiene 2 alelos individuo tiende a reproducirse o a sobrevivir más
● Si la frecuencia es menor al 1% se que otro individuo dentro de una población, ya
denomina variante de nucleótido único que posee una característica que lo hacen más
(SNV). ventajoso.
Ej: adaptación al consumo de lactosa y la
● En casos en que los SNP caigan en las
persistencia de la producción de lactasa durante
regiones de los exones pueden ser la vida adulta.
polimorfismos no sinónimos (mutaciones
sin sentido) o sinónimos (mutaciones En la imagen inferior se pueden ver los distintos
sinónimas). SNPs, algunos asociados con poblaciones
● Un humano promedio es heterocigoto africanas (G/C, T/G y C/G en el intrón 13 y G/A
para 600 poliformismo de aminoácidos y en el intrón 9) y el que está asociado a
poblaciones europeas (C/T). Cómo pueden ver
en el genoma humano hay cerca de 7000
estos SNPs están ubicados en los intrones y no
sitios de nucleótidos sinónimos. necesariamente modifican el producto proteico
● Si bien una mutación sinónima genera un de este gen, sino la cantidad de los niveles de
codón que codifica para el mismo expresión que finalmente van a afectar los
aminoácido que el codón sin la mutación, niveles de expresión del gen de la lactasa.
hoy se sabe que no da lo mismo que
codón utilizado para codificar un cierto
aminoácido. Esto es debido a que entre
codones sinónimos existen variaciones en
la velocidad, en los niveles de
transcripción, en la estabilidad del RNA y
en la estructura la proteína. En
conclusión, los condones sinónimos
pueden tener consecuencias en la
expresión génica.
 → Deriva Genética: cambio en las frecuencias
alélicas que ocurren por proceso aleatorios.

En la imagen inferior se pueden ver bolitas (cada

Si tenemos una población de un tamaño
relativamente grande y simulamos la frecuencia
alélica a lo largo de 100 generaciones, lo que
vamos a ver en función de los parámetros que se
van a alterar:
La frecuencia inicial del alelo rojo → en este caso
el alelo rojo está a muy baja frecuencia (pero es
un polimorfismo porque ya está en el 1% en la
población). Lo que va a permitir este alelo rojo,
es que se siga expresando la lactasa en la vida
adulta de los individuos que lo portan.
una un individuo o la frecuencia de un alelo),
entonces al principio todos los individuos portan
ambos alelos (rojo y amarillo). Debido a un
muestreo aleatorio y de bajo tamaño poblacional,
que en este caso corresponde a un muestreo
aleatorio de 10 bolitas (6 amarillas y 4 rojas),
estas se reproducen y cambian las frecuencias
fenotípicas (en este caso alélicas) entre
generaciones y así sucesivamente.

Tanto en individuos homocigotos como

heterocigotos que portan el alelo rojo van a tener
una ventaja selectiva con respecto a los
Como podemos ver, el efecto de la deriva génica
individuos que no lo portan. Entonces el alelo
siempre está presente, ya que no es algo que no
rojo homocigoto y heterocigoto tienen un fitness
exista o no ocurra, sino que el efecto de la deriva
relativo de 1, y el homocigoto azul (que no aporta
es menos importante cuando la poblaciones de
ninguna copia del alelo que confiere una mayor
gran tamaño poblacional porque no hay un gran
producción o una mantención de la producción
cambio alélico (promediado debería estar
de la lactasa durante la vida adulta, va a tener un
alrededor de 0,5), pero cuando disminuimos el
fitness menor, en este caso 0.93.
tamaño de la población vemos que es más
probable que un alelo se pierda debido al
En el gráfico se puede ver como la frecuencia muestreo aleatorio.
del alelo rojo (línea roja continua), va
aumentado en el tiempo. Con el alelo azul
pasa lo inverso, disminuye la frecuencia. En las
líneas punteadas, vemos que la frecuencia de
cada uno de los genotipos homocigotos y
heterocigotos rojos corresponden a un 90% de
los individuos de la población, en cambio en
homocigoto azul (lactasa no persistente) la
población solamente alcanza alrededor del
10%.

Es decir, un cambio en un SNPs, hace que los

individuos que porten este alelo (rojos), tengan
una ventaja 7% mayor que los individuos que
no portan este alelo (azules), puede después
de 100 generaciones un 90% de los individuos
portan el alelo rojo entonces en este caso el
90% de los individuos son lactasa persistente
y solamente un 10% sería lactasa no
persistente (términos fenotípicos).
→ Migraciones: movimiento de personas, que
tienen una cierta identidad, historia y cultura.
Pero puede pasar que la población original es
genéticamente igual a la población receptora, a
pesar de que exista migración, no producirá
cambios en la frecuencia alélica.
Por eso, mejor nos referimos a flujo génico, que
se define como: intercambio de genes o alelos
entre dos o más poblaciones,.

Por ejemplo, en la imagen inferior a tiempo 0 se
ve una población de individuos con ciertas
características genéticas y fenotípicas, donde
todos son homocigotos aa, por lo tanto, la
frecuencia de aa es 1. En la otra población se
ven otros individuos con otras características
homocigotos AA (frecuencia= 1) y se ve el pájaro
aa moviéndose hacia AA, entonces para que
haya un cambio genético el individuo aa se tiene
que reproducir y aparecer heterocigotos, al
reproducirse, la frecuencia alélica en tiempo 0 la
frecuencia alélica de la población receptora es 0
y el de la población original (izquierda) es 1.
Pero como hay un movimiento de individuos
entre poblaciones, se puede volver a calcular la
frecuencia alélica y vemos que ha cambiado
porque tenemos una frecuencia de aa que es
igual a 1, pero en AA antes era 0 y ahora es 0,2
porque un quinto de los individuos va a aportar el
alelo aa.
¿Cómo podemos evaluar si una población
está evolucionando o no?
Variabilidad genética: un locus posee varios
alelos en una población, es polimórfico.
En la imagen inferior se pueden ver ratones
amarillos (A1A1), verdes (A1A2) y azules (A2A2),
y el tamaño de la poblacion es = 8
Entonces se puede calcular las frecuencias
fenotipicas de amarillo (0,5), verde (0,25) y azul
(0,25), la constitución genética de estos
individuos vemos que 50% son homocigotos
A1A1, 25% son heterociotos y 25% son
homocigotos A2A2.
Las frecuencias alélicas, es decir, cuánto hay
de A1A1 y A2A2. Para eso tomamos el número
de individuos homocigotos A1A1x2 (porque cada
individuo homocigoto porta dos copias del alelo
A1A1) + el número de individuos heterocigotos
(porque cada individuo heterocigotos aporta una
copia del alelo A1A1 y lo dividimos por el total de
alelos (16) y eso nos da que la frecuencia del
alelo A1A1 es 0.625. Se hace lo mismo para el
alelo A2A2 y eso nos da 0.375.
¿Cómo se transmite la variación de una
generación a otra?
La variabilidad se transmite a través de los
alelos, los cuales llevan un alelo perteneciente a
cada uno de los progenitores. Luego durante la
reproducción sexual se generan nuevos
genotipos distintos a los parentales.
Ej: En la generación 1 se parte con individuos
homocigotos para A1A1 (50%) Y A2A2 (50%). Si
estos individuos se cruzan, las frecuencias de los
gametos es 50% y el otro va a corresponder al
otro 50%, entonces cuando estos gametos se
unen van a generar ¼.
Calculando la frecuencia genotípica de f1:
- ¼ son homocigotos A1A1
-½ son heterocigotos
-1/$ son homocigotos A2A2
Calculando la frecuencia alélica:
-½ es A1
-½ es A2
Luego al volver hacer el cruce, se puede ver que
las frecuencias genotípicas se van a mantener en
el tiempo. Entonces se dice que la población
está en equilibrio evolutivo porque las
frecuencias genotípicas no cambian de una
población a otra.
Equilibrio de Hardy-Weinberg
Representa un modelo nulo donde no pasa nada
en términos evolutivos para analizar la frecuencia
genotípica en una población, entonces lo
primero tenemos que en términos de frecuencias
alélicas vamos a llamar P a la frecuencia del
alelo A1 y Q a la frecuencia del alelo A2, la
suma de ambas frecuencias (asumiendo un
modelo de un locus bialélico) tenemos que
P+Q=1, por lo tanto, si conocemos la frecuencia
de P, automáticamente podemos calcular la
frecuencia de Q.
Entonces, si la frecuencia de A1 es P, y cada
homocigoto lleva dos alelos P, la realidad de que
esto ocurra es PxP, por lo tanto la frecuencia
esperada del homocigoto A1 es P^2, lo mismo
pasa con A2A2, en el caso de heterocigotos,
como ocurre de forma no excluyente se suman,
entonces es 2PQ. Si uno suma las frecuencias
de los genotipos esperados nos debería producir
un valor de 1.
Esto nos permite calcular las frecuencias
genotípicas esperadas de una población en
equilibrio.
(revisar gráfico de abajo)
Cuando la mitad de los individuos de la población
son heterocigotos alcanzamos el máximo nivel
de diversidad alélica (ambos alelos están
representados en igual frecuencia), al disminuir
el punto de equilibrio aumentando la frecuencia
de un alelo o del otro, vemos que aumentan el
número de homocigotos y disminuye su
diversidad genética.
Condiciones para que la Población esté en
Equilibrio
➢ Población de tamaño infinito o lo
suficientemente grande
➢ No debe haber selección natural (ningún
alelo o genotipo puede tener una ventaja
respecto a otro)
➢ No tienen que haber mutaciones (no
tienen que generarse o aparecer nuevos alelos)
➢ Sin movimiento entre poblaciones
➢ Apareamiento al azar (panmixia), es decir,
no hay sesgo que involucre que un alelo tenga
una mayor ventaja por sobre otro.
El equilibrio de Hardy-Weinberg representa
una condición de equilibrio evolutivo, donde
las frecuencias genotípicas no cambian en el
tiempo.
¿Por qué decimos que este modelo es nulo?
Porque estamos diciendo que nada de lo
mencionado anteriormente debería ocurrir, lo
cual es una condición que no se da normalmente
en las poblaciones.
Ej: Anemia falciforme
El alelo S es el que está asociado a la
enfermedad y los individuos homocigotos A/A y
A/S producen un eritrocito normal, por lo tanto
tienen niveles de normales de de glóbulos rojos,
en cambio los cigotos S/S producen un glóbulo
rojo deforme que tiene menor capacidad de
transportar oxígeno.
En una población de África se hizo una
ejemplificación donde 400 individuos
homocigotos A/A, 249 eran heterocigotos A/S y
solo cinco individuos eran homocigotos S/S. A
partir de esto se puede calcular la frecuencia
genotípicas observadas (en la tabla de abajo).
Según el equilibrio de Hardy-Weinberg se puede
ver las frecuencias de los alelos y calcular la
frecuencia esperada, en este caso la frecuencia
del alelo P es 0,198 y del alelo Q es 0,802. Con
esta información se reemplazo los valores que se
encuentran acá y tengo una frecuencia relativa
esperada (ver tabla de abajo).
Para poder decir que está en equilibrio hay que
comparar las frecuencias observadas. La
frecuencia esperada relativa la podemos calcular
a través de la multiplicación de los valores
mostrados abajo por el número total de
individuos.
Entonces comparamos las frecuencias
observadas versus las frecuencias esperadas y
esto se puede hacer con el chi-cuadrado, el cual
permite comparar las frecuencias observadas de
una muestra respecto a las frecuencias
esperadas de una población (términos
estadísticos). Se calcula como la sumatoria de
las frecuencias observadas menos la esperada al
cuadrado, partido por las frecuencias esperadas
para cada una de las clases que vamos a estar
evaluando.
En este caso, como hay tres clases (tres
genotipos), necesito calcular de i=1 hasta k=3 chi
cuadrados parciales, me da un valor 25.58
(chi-cuadrado calculado).
Para saber si está en equilibrio necesito hacer
una prueba estadística con el chi-cuadrado.
Sabemos que cuando se hace una prueba
estadística, se tienen dos hipótesis:
1. Nula: no efecto o no diferencia
2. Alternativa: efecto/diferencia
En este caso, en que estamos poniendo a
prueba el equilibrio de Hardy-Weinberg, la
hipótesis nula es que la población si se
encuentra en equilibrio, por lo tanto quiere decir
que las frecuencias esperadas son iguales a las
frecuencias observadas. En cambio, cuando
hablamos de hipótesis alternativa, esto quiere
decir que la población no está en equilibrio de
Hardy-Weinberg. Por lo tanto las frecuencias
esperadas son distintas a las frecuencias
observadas.
Para hacer eso yo tengo que calcular una
probabilidad, que es una forma de que puedo
rechazar o aceptar mi hipótesis. Para eso, tengo
que definir la probabilidad de rechazar mi
hipótesis nula cuando es verdadera, y esto lo
llamamos estadística alfa. Normalmente en
ciencias nosotros ocupamos un alfa de 0.05, esto
quiere decir que de cada 100 ensayos en cinco
de ellos puede que rechacemos la hipótesis nula
cuando es verdadera.
Lo otro que necesitamos calcular son los grados
de libertad, como el diseño o el cálculo nos
permite modificar características o mover? (no le
entendi al profe) respecto a la prueba de estadística.
En el caso de chi-cuadrado necesitamos
conocer el número de genotipos, en este caso
son 3, luego tenemos un grado de libertad dado
que tengo una restricción: el n de los observados
es igual al de n de esperados, que en este caso
es 654, este parámetro no varía.
Luego tenemos cuantos parámetros necesitamos
calcular para poner a prueba esta hipótesis y
necesitamos conocer al menos una frecuencia
alélica, por ejemplo la frecuencia P,
automáticamente Q sale de 1-P entonces no es
algo que se estime a través del cálculo. Entonces
tenemos que lograr la libertad que son 3-1-1= 1
Tenemos chi-cuadrado calculado, alfa: 0.05 y los
grados de libertad en este caso es 1
¿Cómo calculamos la probabilidad?
En el calculador de chi-cuadrado y probabilidad,
(5.58 y 1) y podemos definir el nivel de
significancia, por convención vamos a usar un
alfa un nivel de significancia igual a 0.05.
Calculamos y nos dice que el valor de
probabilidad es menor a 0.00001. Cuando el
valor de probabilidad asociado a una prueba de
estadística es menor a 0.05 nosotros
rechazamos la hipótesis nula y aceptamos la
hipótesis alternativa.

Como el valor de probabilidad calculado es mucho

mucho menor a 0.05, quiere decir que nuestra
población es estadísticamente distinta o se desvía
de el equilibrio de Hardy-Weinberg, por lo tanto
algunos de los mecanismos que son necesarios
para que el equilibrio de Hardy-Weinberg ocurra,
no está operando. Si nosotros vamos a mirar
principalmente las frecuencias esperadas y
observadas, vemos que la mayor diferencia entre
los valores observados y esperados se dan para
los homocigotos S/S y en este caso se espera una
frecuencia de genotipo S/S de 25.5 pero sólo hay
cinco individuos en la población, por tanto hay un
déficit de individuos homocigotos S/S en esta
población, debido a que hay selección negativa
sobre estos individuos que sufren anemia
falciforme, por lo tanto tienen menor capacidad de
transportar oxígeno en la sangre y eso finalmente
tiene consecuencias sobre su fitness y por lo tanto
el número de individuos que hay esta población es
muy bajo con respecto a lo esperado