TEMA 8: NATURALEZA MOLECULAR DEL GEN Y DEL GENOMA

Herencia, variación y genética:

Herencia: Transmisión de rasgos de una generación a otra
Variación: En la herencia hay variación, ya que los hijos no son copias exactas
de sus predecesores.
Genética: Es el estudio de la herencia y la variación heredada.

El inicio de la genética moderna:

En 1865 Mendel descubre los principios fundamentales de la herencia. Mendel
demostró que las características heredadas se distribuyen en unidades
discretas que hoy en día conocemos como genes.

¿Qué es un gen?
Un gen es una unidad informativa discreta, la cual es responsable de transmitir
una característica. Hoy en día esa unidad de información la identificamos con
un fragmento de ADN en un lugar de un cromosoma.
El ADN es una molécula incapaz de expresar información, por eso su
información se expresa mediante otras moléculas. El ADN dirige la síntesis de
proteínas y estas determinan las características físicas y químicas de la célula.

Como se expresa el ADN:

- Transcripción: es la síntesis de ARN a partir del ADN, el ARN contiene
toda la información de la secuencia de bases del ADN
- Traducción: cuando el ARN ejecuta las instrucciones cristalizándolas en
la síntesis de una proteína especifica.

El genoma:
Es un conjunto de genes de una especie. Los genomas utilizan el ADN como
depositario de la información genética.

Dogma central de la biología molecular:

Los genes programan la síntesis de proteína mediante el ARN mensajero, así
las
células se rigen por una cadena de mando molecular con un flujo direccional de
información genética. Ese flujo es el dogma central de la biología molecular.

El código genético:
La información esta en la secuencia de bases y esta escrita en un código
propio conocido como código genético.
El código genético son 64 combinaciones de tripletes y sus aminoácidos
correspondientes: 61 codones codifican aa y 3 codones(UGA, UAG y UAA)
actúan como señales de terminación en la traducción o síntesis de proteínas.
En los seres vivos hay 20 aminoácidos a partir de los cuales se forman las
proteínas. Los codones se forman con tres bases porque se pueden obtener 64
codones diferentes que son más que suficientes para nombrar los 20
aminoácidos.
El código genético es similar en la mayoría de los seres vivos, pero hay
excepciones como la reasignación de codones de terminación o cambios en el
significado de codones.
Muchos aminoácidos son codificados por varios codones, son conocidos como
codones sinónimos. Esta redundancia reduce el impacto de mutaciones, facilita
la regulación de la expresión génica y optimiza la traducción. A pesar de la
redundancia, cada codón especifica un único aminoácido. El código no es
ambiguo y no hay errores durante la traducción.

Lectura del código genético: (Consultar la práctica de aula)

Los ARNm portan un codón AUG que es interpretado por los ribosomas como
el codón de iniciación, de ahí en adelante el ribosoma se desplazara en
bloques de tres. El código se lee sin solapamiento, es decir cada nucleótido del
mensaje es componente de un único codón.

Organización del genoma:

En las células eucariotas los cromosomas están en el compartimento nuclear,
ahí se da la transcripción; la traducción sucede en el citoplasma, por lo tanto,
los procesos no suceden en el mismo sitio ni en el mismo momento. Esto
produce que los transcriptos de ARN experimenten una maduración antes de la
traducción.
En las células procariotas no hay envoltura nuclear, por lo que la transcripción y
traducción ocurren a la vez.

Transcripción:
La transcripción es la síntesis de ARN a partir de un molde de ADN.
En la transcripción participa una enzima ARN polimerasa ADN dependiente,
esta polimerasa sintetiza una cadena de ARN que viene determinada por el
propio gen.

Procesos de la transcripción:
- Iniciación: los factores de transcripción generales se unen al promotor
del gen que permiten la unión de la ARN polimerasa II al promotor e
inician la transcripción del gen. La transcripción es asimétrica ya que
solo se transcribe una de las dos cadenas que forman cada gen, una
actúa como plantilla y la no transcrita es complementaria de la anterior.
- Elongación: los nucleótidos incorporados al ARN forman una hélice
ARN-ADN con su plantilla. Esta hélice es transitoria, pues conforme el
polímero alarga el extremo 3’, el extremo 5’ se separa del molde y se
vuelve a emparejar con su hebra de ADN complementaria.
- Terminación: la transcripción termina cuando la ARN polimerasa alcanza
la señal de terminación. Se obtiene un ARN transcrito primario, este
repite la dirección y la secuencia de la hebra no copiada y es la cadena
elegida para representar un gen.

Estructura del ARNm eucariota:

El producto inicial de la transcripción de un gen codificante de proteínas es el
pre-ARNm y después de que haya sido procesado se le llama ARNm maduro.
Una vez transcritos, cada ARN sufre unas modificaciones dependientes de ser
células procariotas o eucariotas.
Los ARNm eucariotas presentan la secuencia del mensaje interrumpida,
coexisten sectores que codifican la proteína llamados exones y secuencias sin
información llamadas intrones.

ARNt:
Los ARNt son moléculas que interactúan por un lado con la cadena
polinucleótida y por el otro con los aminoácidos que formaran la cadena
polipeptídica.
El ARNt debe de ser reconocido por un aminoacil ARNt sintetasa que lo una al
aminoácido correcto, debe de tener una región que actúe como unión para
dicho aminoácido y debe de tener una secuencia complementaria para el
codón ARNm correcto.
Ribosomas:
Los ARNr junto a las proteínas son los componentes de los ribosomas. Los
ribosomas y los ARNt intervienen en la traducción de la información codificada
en el ARNm. Los ribosomas tienen dos subunidades, la mayor y la menor.
Las subunidades se localizan alrededor del nucleolo. Las subunidades antes de
completar sus ensambles son exportadas por separado al citoplasma,
concluyendo el procesamiento de cada subunidad en el citosol. Ambas
subunidades trabajan para la síntesis proteica. La subunidad menor aloja al
ARNm donde se acomodan los ARNt para que puedan unirse los aminoácidos
que transportan; la mayor cataliza la unión peptídica de los aminoácidos.

Síntesis proteica:
Consiste en la traducción de la información codificada en la secuencia de
nucleótidos del ARNm. Se lleva a cabo en los ribosomas y es un proceso mas
complejo en las eucariotas. Además, se pueden distinguir dos etapas: la
activación de los aminoácidos y la traducción del ARNm.

Activación de los aminoácidos:

Antes de la traducción cada ARNt se engancha a su aminoácido. Esta
aminoacilación es catalizada por las enzimas aminoacil ARNt sintetasas.
El proceso de aminoacilación ocurre en dos etapas:
- En la primera fase se utiliza la energía de la hidrolisis del ATP para unir
cada aminoácido a un AMP.
- En la segunda, sin abandonar la enzima se transfiere el aminoácido al
ARNt especifico y se origina la molécula final AMINOACIL-ARNt.
La aminoacilación tiene dos funciones:
- Proporcionar el primer paso en la traducción del mensaje genético a una
secuencia de aminoácidos
- Activar al aminoácido antes de incorporarlo a la proteína.

Traducción del ARNm:

La traducción del ARNm tiene tres etapas: iniciación, elongación y terminación.
En todas las fases se requiere un sistema de proteínas citoplasmáticas,
conocidas como factores de iniciación, factores de elongación y factores de
terminación.

Tres interacciones determinan el inicio de la síntesis proteica:

 - Reconocimiento del codón de iniciación AUG en la subunidad menor del
ribosoma
- Acoplamiento de bases del codón AUG con el ARNt iniciador
- Acoplamiento de la subunidad mayor del ribosoma cerrando el complejo
de iniciación

Fases de la traducción del ARNm:

- Iniciación: se reúnen los componentes necesarios para la traducción,
una molécula de ARNm una subunidad mayor, una subunidad menor, el
ARNt iniciador y factores proteicos de iniciación. El complejo se
comienza a formar cuando se acopla la subunidad menor del ribosoma
al ARNm en la posición cap, el ARNt iniciador ingresa al sitio P
uniéndose al codón AUG, finalmente se incorpora la subunidad mayor
que cierra el complejo de iniciación, originando un ribosoma completo.
- Elongación: se une el aminoacil-ARNt, se forma el enlace peptídico y
ocurre la translocación del ribosoma.
- Terminación: se reconoce el codón stop que indica el final y ocurre la
disociación de las subunidades ribosómicas, el ARNm y la cadena
polipeptídica.

Fidelidad de la traducción del ARNm:

La síntesis proteica depende de dos mecanismos:
- Aminoacilación: las enzimas aminoacil-ARNt sintetasas minimizan
errores; además muchas enzimas tienen dos sitios activos uno para la
reacción de carga y otro que reconoce un aminoácido mal colocado en
el ARNt y lo libera por hidrolisis.
- Apareamiento codon-anticodon: en este punto participa un factor de
elongación que forma un complejo con el aminoacil ARNt y el GPT, este
complejo es el que une al codón en el ARNm. Después del correcto
apareamiento el factor se disocia haciendo posible la unión del
aminoácido a la cadena polipeptídica, este retraso en la unión hace
posible que se elimine el ARNt incorrecto.

Coste energético de la traducción de ARNm:

Para formar cada enlace peptídico se consumen 1 ATP y 2 GTP que aportan
cuatro enlaces de alta energía: dos en la activación del aminoácido, uno en la
unión del aminoacil-ARNt a la subunidad menor y el ultimo en la translocación
del ribosoma.

Los polirribosomas en la traducción:

Un ARNm dirige la síntesis de copias de la misma proteína. Cuando un
ribosoma ha traducido una secuencia de aminoácidos suficientemente larga un
nuevo ribosoma puede iniciar la traducción.
El grupo de ribosomas que traducen simultáneamente el mismo mensaje se
conoce como polirribosoma. Cada ribosoma en un polirribosoma sintetiza una
copia independiente de la proteína.

La traducción en eucariotas y procariotas:

En las eucariotas la traducción es postranscripcional, ya que debido a la
envoltura nuclear y a la maduración de los ARNm la traducción no puede ser
instantánea y el ARNm es leído a través de los poros nucleares cundo
abandona el núcleo. En cambio, en procariotas la traducción es simultánea a la
transcripción y cuando ARNm es leído otro se asocia a un ribosoma y al ARNt
iniciador y comienza la traducción.

Lugar de síntesis:
Las proteínas sintetizadas en la célula son iniciadas por ribosomas libres.
Muchas de esas proteínas concluyen su síntesis en esos ribosomas para luego
dirigirse a sus compartimentos diana, otras en cambio terminan su síntesis en
el REG.
Blobel y Sabatini propusieron en 1971 la hipótesis de la señal. Esta hipótesis se
basa en lo siguiente, las proteínas que se sintetizan en el REG tienen un primer
fragmento de proteínas conocido como péptido guía, cuando aparece este
péptido guía es reconocida por la PRS(partícula de reconocimiento de la señal)
situada en el citosol.

Niveles de control de la expresión genética:

El genoma eucariota es mas complejo que el procariota porque existen mas
niveles donde ejercer el control de la expresión génica.
Los mecanismos de control más importantes son los de nivel transcripcional
pero también puede haber regulaciones durante el procesamiento o
maduración del ARNm. En algunos casos los controles también actúan a nivel
traduccional o regulando la actividad de la proteína.
Regulación de la expresión génica eucariota:
Hay cuatro requisitos para la transcripción de un gen eucariota:
- Una secuencia promotora de nucleótidos para fijar la ARN polimerasa
- Secuencias reguladoras (existen dos tipos):
o Intensificadoras: secuencias que estimulan la transcripción
o Silenciadoras: secuencias que inhiben la transcripción
 - Factores basales de transcripción que son complejos proteicos que
interaccionan con el sitio promotor
- Factores específicos de transcripción que son complejos de proteínas
que pueden ser activadoras (interactúan con secuencias
intensificadoras) o represoras (interactúan con secuencias silenciadoras)

Control transcripcional:
- Los factores de transcripción y la expresión genética: la diferencia entre
distintos tipos celulares con el mismo genoma es que cada célula
transcribe y expresa distintas proteínas.
- La estructura de la cromatina y la expresión genética: las regiones de
cromatina condensada y dispersa varían según el tipo celular, reflejando
la síntesis de proteínas diferentes por distintos tipos celulares.
- El grado de metilación y la expresión genética: la mayoría de los genes
que no se expresan están metilados, mientras que en otra célula donde
esos genes se expresan hay menores niveles de metilación.

Control postranscripcional:
Hay formas de regulación que implican un procesamiento del ARNm. El
proceso para obtener dos proteínas de un mismo gen es conocido como
splicing alternativo, en este proceso se unen diferentes combinaciones de
exones de pre-ARNm y se obtienen dos ARNm maduros con distinta
información.

Control traduccional:
Hay dos mecanismos para el control traduccional:
- Modificar la tasa de traducción del ARNm
- Controlar la estabilidad del ARNm

Control postraduccional:
Cuando una proteína emerge del ribosoma citosólico chaperonas moleculares
se
unen a la cadena, en síntesis, esta unión evita que las proteínas alcancen un
estado de agregación irreversible. Las proteínas mal plegadas son conducidas
hasta una chaperona oligomérica que pueden recuperar el plegamiento natural
de la proteína, en caso de no conseguirlo la proteína será captada por un
complejo enzimático y será degradada.
En la vida de una proteína hay dos factores determinantes, un correcto
plegamiento y la secuencia aminoacídica de su extremo amino terminal. Si uno
de los dos factores no se cumple la proteína es marcada y degradada.